CM024296.1 AUGUSTUS transcript 1022 1200 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_100005000.1"; gene_id "LTnewLTref_100005000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 1022 1200 0.55 + 2 transcript_id "LTnewLTref_100005000.1"; gene_id "LTnewLTref_100005000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 7565 8749 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100005100.1"; gene_id "LTnewLTref_100005100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 7565 8749 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100005100.1"; gene_id "LTnewLTref_100005100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 11698 13677 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100005200.1"; gene_id "LTnewLTref_100005200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 11698 13677 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100005200.1"; gene_id "LTnewLTref_100005200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 15686 17167 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100005300.1"; gene_id "LTnewLTref_100005300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 15686 17167 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100005300.1"; gene_id "LTnewLTref_100005300"; CM024296.1 . transcript 18020 19356 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene" CM024296.1 . exon 18020 18049 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18052 18192 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18194 18259 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18262 18384 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18386 18541 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18549 18677 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18679 18684 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 18686 19027 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . exon 19030 19356 . - . transcript_id "LTnewLTref_100005400.1"; gene_id "LTnewLTref_100005400:pseudogene"; CM024296.1 . transcript 26097 29294 . + . transcript_id "LTnewLTref_100005500.1"; gene_id "LTnewLTref_100005500:pseudogene" CM024296.1 . exon 26097 29294 . + . transcript_id "LTnewLTref_100005500.1"; gene_id "LTnewLTref_100005500:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 30029 32896 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100005600.1"; gene_id "LTnewLTref_100005600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 30029 32896 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100005600.1"; gene_id "LTnewLTref_100005600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 33725 34816 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100005700.1"; gene_id "LTnewLTref_100005700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 33725 34816 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100005700.1"; gene_id "LTnewLTref_100005700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 36503 36937 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100005800.1"; gene_id "LTnewLTref_100005800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 36503 36937 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100005800.1"; gene_id "LTnewLTref_100005800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 37534 38565 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100005900.1"; gene_id "LTnewLTref_100005900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 37534 38565 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100005900.1"; gene_id "LTnewLTref_100005900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 42618 43856 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006000.1"; gene_id "LTnewLTref_100006000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 42618 43856 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006000.1"; gene_id "LTnewLTref_100006000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 45103 45876 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006100.1"; gene_id "LTnewLTref_100006100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 45103 45876 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006100.1"; gene_id "LTnewLTref_100006100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 46929 48116 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006200.1"; gene_id "LTnewLTref_100006200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 46929 48116 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006200.1"; gene_id "LTnewLTref_100006200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 49423 50562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006300.1"; gene_id "LTnewLTref_100006300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 49423 50562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006300.1"; gene_id "LTnewLTref_100006300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 56189 58405 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006400.1"; gene_id "LTnewLTref_100006400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 56189 58405 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006400.1"; gene_id "LTnewLTref_100006400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 60019 62361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006500.1"; gene_id "LTnewLTref_100006500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 60019 62361 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006500.1"; gene_id "LTnewLTref_100006500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 65895 67013 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006600.1"; gene_id "LTnewLTref_100006600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 65895 67013 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006600.1"; gene_id "LTnewLTref_100006600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 71048 72318 0.75 + . transcript_id "LTnewLTref_100006700.1"; gene_id "LTnewLTref_100006700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 71048 72166 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006700.1"; gene_id "LTnewLTref_100006700"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 72229 72318 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006700.1"; gene_id "LTnewLTref_100006700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 71048 73168 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006700.2"; gene_id "LTnewLTref_100006700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 71048 73168 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006700.2"; gene_id "LTnewLTref_100006700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 76843 78924 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006800.1"; gene_id "LTnewLTref_100006800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 76843 78924 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006800.1"; gene_id "LTnewLTref_100006800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 80758 81474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100006900.1"; gene_id "LTnewLTref_100006900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 80758 81474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100006900.1"; gene_id "LTnewLTref_100006900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 83599 85554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007000.1"; gene_id "LTnewLTref_100007000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 83599 85554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007000.1"; gene_id "LTnewLTref_100007000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 86561 87226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007100.1"; gene_id "LTnewLTref_100007100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 86561 87226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007100.1"; gene_id "LTnewLTref_100007100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 88576 89799 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007200.1"; gene_id "LTnewLTref_100007200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 88576 89799 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007200.1"; gene_id "LTnewLTref_100007200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 92586 92969 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_100007300.1"; gene_id "LTnewLTref_100007300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 92586 92969 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007300.1"; gene_id "LTnewLTref_100007300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 93330 93705 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_100007400.1"; gene_id "LTnewLTref_100007400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 93330 93467 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007400.1"; gene_id "LTnewLTref_100007400"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 93514 93705 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007400.1"; gene_id "LTnewLTref_100007400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 96097 97518 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007500.1"; gene_id "LTnewLTref_100007500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 96097 97518 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007500.1"; gene_id "LTnewLTref_100007500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 98744 100891 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007600.1"; gene_id "LTnewLTref_100007600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 98744 100891 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007600.1"; gene_id "LTnewLTref_100007600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 101650 102486 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007700.1"; gene_id "LTnewLTref_100007700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 101650 102486 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007700.1"; gene_id "LTnewLTref_100007700"; CM024296.1 Liftoff transcript 105914 107389 . + . transcript_id "LTnewLTref_100007800.1"; gene_id "LTnewLTref_100007800" CM024296.1 Liftoff CDS 105914 107389 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007800.1"; gene_id "LTnewLTref_100007800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 110408 111664 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100007900.1"; gene_id "LTnewLTref_100007900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 110408 111664 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100007900.1"; gene_id "LTnewLTref_100007900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 113581 115784 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_100008000.1"; gene_id "LTnewLTref_100008000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 113581 114776 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008000.1"; gene_id "LTnewLTref_100008000"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 114857 115784 0.67 + 1 transcript_id "LTnewLTref_100008000.1"; gene_id "LTnewLTref_100008000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 116772 117626 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008100.1"; gene_id "LTnewLTref_100008100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 116772 117626 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008100.1"; gene_id "LTnewLTref_100008100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 118382 118771 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008200.1"; gene_id "LTnewLTref_100008200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 118382 118771 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008200.1"; gene_id "LTnewLTref_100008200"; CM024296.1 Liftoff transcript 120627 123563 . + . transcript_id "LTnewLTref_100008300.1"; gene_id "LTnewLTref_100008300" CM024296.1 Liftoff CDS 120627 123563 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008300.1"; gene_id "LTnewLTref_100008300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 124536 131576 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008400.1"; gene_id "LTnewLTref_100008400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 124536 131576 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008400.1"; gene_id "LTnewLTref_100008400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 132686 133993 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008500.1"; gene_id "LTnewLTref_100008500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 132686 133993 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008500.1"; gene_id "LTnewLTref_100008500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 137227 139524 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008600.1"; gene_id "LTnewLTref_100008600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 137227 139524 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008600.1"; gene_id "LTnewLTref_100008600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 141561 144662 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008700.1"; gene_id "LTnewLTref_100008700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 141561 144662 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008700.1"; gene_id "LTnewLTref_100008700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 146307 152180 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008800.1"; gene_id "LTnewLTref_100008800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 146307 152180 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008800.1"; gene_id "LTnewLTref_100008800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 154218 154588 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008900.1"; gene_id "LTnewLTref_100008900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 154218 154518 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008900.1"; gene_id "LTnewLTref_100008900"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 154584 154588 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_100008900.1"; gene_id "LTnewLTref_100008900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 154218 155696 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100008900.2"; gene_id "LTnewLTref_100008900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 154218 155696 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100008900.2"; gene_id "LTnewLTref_100008900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 157405 159480 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009000.1"; gene_id "LTnewLTref_100009000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 157405 159480 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009000.1"; gene_id "LTnewLTref_100009000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 163644 165704 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009100.1"; gene_id "LTnewLTref_100009100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 163644 165704 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009100.1"; gene_id "LTnewLTref_100009100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 168925 171027 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009200.1"; gene_id "LTnewLTref_100009200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 168925 171027 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009200.1"; gene_id "LTnewLTref_100009200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 176729 178843 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009300.1"; gene_id "LTnewLTref_100009300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 176729 178843 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009300.1"; gene_id "LTnewLTref_100009300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 182806 184904 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_100009400.1"; gene_id "LTnewLTref_100009400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 182806 183504 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009400.1"; gene_id "LTnewLTref_100009400"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 183564 184904 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009400.1"; gene_id "LTnewLTref_100009400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 186827 188995 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009500.1"; gene_id "LTnewLTref_100009500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 186827 188995 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009500.1"; gene_id "LTnewLTref_100009500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 191019 192788 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009600.1"; gene_id "LTnewLTref_100009600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 191019 192788 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009600.1"; gene_id "LTnewLTref_100009600"; CM024296.1 . transcript 194732 196631 . + . transcript_id "LTnewLTref_100009700.1"; gene_id "LTnewLTref_100009700:pseudogene" CM024296.1 . exon 194732 196631 . + . transcript_id "LTnewLTref_100009700.1"; gene_id "LTnewLTref_100009700:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 197885 198370 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009800.1"; gene_id "LTnewLTref_100009800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 197885 198370 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009800.1"; gene_id "LTnewLTref_100009800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 201605 202216 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100009900.1"; gene_id "LTnewLTref_100009900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 201605 202216 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100009900.1"; gene_id "LTnewLTref_100009900"; CM024296.1 . transcript 204736 205263 . + . transcript_id "LTnewLTref_100010000.1"; gene_id "LTnewLTref_100010000:pseudogene" CM024296.1 . exon 204736 205263 . + . transcript_id "LTnewLTref_100010000.1"; gene_id "LTnewLTref_100010000:pseudogene"; CM024296.1 Liftoff transcript 205360 205714 . + . transcript_id "LTnewLTref_100010100.1"; gene_id "LTnewLTref_100010100" CM024296.1 Liftoff CDS 205360 205714 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010100.1"; gene_id "LTnewLTref_100010100"; CM024296.1 . transcript 205841 206174 . + . transcript_id "LTnewLTref_100010200.1"; gene_id "LTnewLTref_100010200:pseudogene" CM024296.1 . exon 205841 206174 . + . transcript_id "LTnewLTref_100010200.1"; gene_id "LTnewLTref_100010200:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 206478 207168 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_100010300.1"; gene_id "LTnewLTref_100010300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 206478 206996 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010300.1"; gene_id "LTnewLTref_100010300"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 207043 207168 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010300.1"; gene_id "LTnewLTref_100010300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 208140 208391 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100010400.1"; gene_id "LTnewLTref_100010400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 208140 208391 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010400.1"; gene_id "LTnewLTref_100010400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 211466 213279 0.83 + . transcript_id "LTnewLTref_100010500.1"; gene_id "LTnewLTref_100010500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 211466 211858 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010500.1"; gene_id "LTnewLTref_100010500"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 211909 213279 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010500.1"; gene_id "LTnewLTref_100010500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 214530 216344 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100010600.1"; gene_id "LTnewLTref_100010600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 214530 216344 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010600.1"; gene_id "LTnewLTref_100010600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 217656 219411 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_100010700.1"; gene_id "LTnewLTref_100010700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 217656 218536 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010700.1"; gene_id "LTnewLTref_100010700"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 218580 219411 0.99 + 1 transcript_id "LTnewLTref_100010700.1"; gene_id "LTnewLTref_100010700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 220663 222480 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100010800.1"; gene_id "LTnewLTref_100010800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 220663 222480 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010800.1"; gene_id "LTnewLTref_100010800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 223729 225663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100010900.1"; gene_id "LTnewLTref_100010900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 223729 225663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100010900.1"; gene_id "LTnewLTref_100010900"; CM024296.1 . transcript 227971 229454 . + . transcript_id "LTnewLTref_100011000.1"; gene_id "LTnewLTref_100011000:pseudogene" CM024296.1 . exon 227971 228594 . + . transcript_id "LTnewLTref_100011000.1"; gene_id "LTnewLTref_100011000:pseudogene"; CM024296.1 . exon 228597 229454 . + . transcript_id "LTnewLTref_100011000.1"; gene_id "LTnewLTref_100011000:pseudogene"; CM024296.1 . transcript 231996 232673 . - . transcript_id "LTnewLTref_100011100.1"; gene_id "LTnewLTref_100011100:pseudogene" CM024296.1 . exon 231996 232673 . - . transcript_id "LTnewLTref_100011100.1"; gene_id "LTnewLTref_100011100:pseudogene"; CM024296.1 . transcript 233011 233645 . + . transcript_id "LTnewLTref_100011200.1"; gene_id "LTnewLTref_100011200:pseudogene" CM024296.1 . exon 233011 233645 . + . transcript_id "LTnewLTref_100011200.1"; gene_id "LTnewLTref_100011200:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 234322 234735 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_100011300.1"; gene_id "LTnewLTref_100011300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 234322 234735 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011300.1"; gene_id "LTnewLTref_100011300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 234322 234755 0.78 + . transcript_id "LTnewLTref_100011300.2"; gene_id "LTnewLTref_100011300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 234322 234656 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011300.2"; gene_id "LTnewLTref_100011300"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 234713 234755 0.78 + 1 transcript_id "LTnewLTref_100011300.2"; gene_id "LTnewLTref_100011300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 234843 235346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100011400.1"; gene_id "LTnewLTref_100011400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 234843 235346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011400.1"; gene_id "LTnewLTref_100011400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 236629 236964 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100011500.1"; gene_id "LTnewLTref_100011500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 236629 236964 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011500.1"; gene_id "LTnewLTref_100011500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 237339 238739 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_100011600.1"; gene_id "LTnewLTref_100011600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 237339 237546 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011600.1"; gene_id "LTnewLTref_100011600"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 238717 238739 0.69 + 2 transcript_id "LTnewLTref_100011600.1"; gene_id "LTnewLTref_100011600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 240923 242089 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100011700.1"; gene_id "LTnewLTref_100011700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 240923 242089 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011700.1"; gene_id "LTnewLTref_100011700"; CM024296.1 Liftoff transcript 247169 267421 . + . transcript_id "LTnewLTref_100011800.1"; gene_id "LTnewLTref_100011800" CM024296.1 Liftoff CDS 247169 267421 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011800.1"; gene_id "LTnewLTref_100011800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 269376 270479 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100011900.1"; gene_id "LTnewLTref_100011900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 269376 270479 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100011900.1"; gene_id "LTnewLTref_100011900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 273121 273453 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012000.1"; gene_id "LTnewLTref_100012000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 273121 273453 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012000.1"; gene_id "LTnewLTref_100012000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 274394 277114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012100.1"; gene_id "LTnewLTref_100012100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 274394 277114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012100.1"; gene_id "LTnewLTref_100012100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 277932 281498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012200.1"; gene_id "LTnewLTref_100012200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 277932 281498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012200.1"; gene_id "LTnewLTref_100012200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 282670 285936 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012300.1"; gene_id "LTnewLTref_100012300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 282670 285936 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012300.1"; gene_id "LTnewLTref_100012300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 286758 288053 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012400.1"; gene_id "LTnewLTref_100012400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 286758 288053 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012400.1"; gene_id "LTnewLTref_100012400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 288662 289777 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012500.1"; gene_id "LTnewLTref_100012500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 288662 289777 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012500.1"; gene_id "LTnewLTref_100012500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 290604 292040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012600.1"; gene_id "LTnewLTref_100012600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 290604 292040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012600.1"; gene_id "LTnewLTref_100012600"; CM024296.1 . transcript 293028 295458 . - . transcript_id "LTnewLTref_100012700.1"; gene_id "LTnewLTref_100012700:pseudogene" CM024296.1 . exon 293028 295458 . - . transcript_id "LTnewLTref_100012700.1"; gene_id "LTnewLTref_100012700:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 295700 296503 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012800.1"; gene_id "LTnewLTref_100012800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 295700 296503 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012800.1"; gene_id "LTnewLTref_100012800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 296804 298591 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100012900.1"; gene_id "LTnewLTref_100012900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 296804 298591 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100012900.1"; gene_id "LTnewLTref_100012900"; CM024296.1 Liftoff transcript 304246 304533 . - . transcript_id "LTnewLTref_100013000.1"; gene_id "LTnewLTref_100013000" CM024296.1 Liftoff CDS 304246 304533 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013000.1"; gene_id "LTnewLTref_100013000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 304856 306379 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100013100.1"; gene_id "LTnewLTref_100013100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 304856 306379 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013100.1"; gene_id "LTnewLTref_100013100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 308164 310434 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100013200.1"; gene_id "LTnewLTref_100013200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 308164 310434 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013200.1"; gene_id "LTnewLTref_100013200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 312576 314336 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100013300.1"; gene_id "LTnewLTref_100013300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 312576 314336 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013300.1"; gene_id "LTnewLTref_100013300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 315930 316661 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100013400.1"; gene_id "LTnewLTref_100013400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 315930 316661 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013400.1"; gene_id "LTnewLTref_100013400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 317622 319334 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_100013500.1"; gene_id "LTnewLTref_100013500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 317622 319334 0.48 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013500.1"; gene_id "LTnewLTref_100013500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 320307 325268 0.85 - . transcript_id "LTnewLTref_100013600.1"; gene_id "LTnewLTref_100013600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 320307 325268 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013600.1"; gene_id "LTnewLTref_100013600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 320307 326217 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_100013600.2"; gene_id "LTnewLTref_100013600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 320307 325201 0.88 - 2 transcript_id "LTnewLTref_100013600.2"; gene_id "LTnewLTref_100013600"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 325428 326217 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013600.2"; gene_id "LTnewLTref_100013600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 325436 326217 0.78 - . transcript_id "LTnewLTref_100013600.3"; gene_id "LTnewLTref_100013600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 325436 325482 0.78 - 2 transcript_id "LTnewLTref_100013600.3"; gene_id "LTnewLTref_100013600"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 325539 326217 0.84 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013600.3"; gene_id "LTnewLTref_100013600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 328822 329946 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100013700.1"; gene_id "LTnewLTref_100013700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 328822 329946 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013700.1"; gene_id "LTnewLTref_100013700"; CM024296.1 Liftoff transcript 331007 332947 . - . transcript_id "LTnewLTref_100013800.1"; gene_id "LTnewLTref_100013800" CM024296.1 Liftoff CDS 331007 332947 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013800.1"; gene_id "LTnewLTref_100013800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 333458 338485 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100013900.1"; gene_id "LTnewLTref_100013900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 333458 338485 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100013900.1"; gene_id "LTnewLTref_100013900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 339348 342208 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_100014000.1"; gene_id "LTnewLTref_100014000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 339348 341711 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014000.1"; gene_id "LTnewLTref_100014000"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 341756 342208 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014000.1"; gene_id "LTnewLTref_100014000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 343495 344960 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_100014100.1"; gene_id "LTnewLTref_100014100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 343495 344388 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014100.1"; gene_id "LTnewLTref_100014100"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 344493 344960 0.52 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014100.1"; gene_id "LTnewLTref_100014100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 346539 348005 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_100014200.1"; gene_id "LTnewLTref_100014200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 346539 347432 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014200.1"; gene_id "LTnewLTref_100014200"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 347742 348005 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014200.1"; gene_id "LTnewLTref_100014200"; CM024296.1 Liftoff transcript 349469 349657 . - . transcript_id "LTnewLTref_100014300.1"; gene_id "LTnewLTref_100014300" CM024296.1 Liftoff CDS 349469 349657 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014300.1"; gene_id "LTnewLTref_100014300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 350195 351040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100014400.1"; gene_id "LTnewLTref_100014400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 350195 351040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014400.1"; gene_id "LTnewLTref_100014400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 353014 353391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100014500.1"; gene_id "LTnewLTref_100014500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 353014 353391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014500.1"; gene_id "LTnewLTref_100014500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 356432 362431 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100014600.1"; gene_id "LTnewLTref_100014600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 356432 359943 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_100014600.1"; gene_id "LTnewLTref_100014600"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 359992 362431 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014600.1"; gene_id "LTnewLTref_100014600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 364420 366345 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100014700.1"; gene_id "LTnewLTref_100014700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 364420 366345 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014700.1"; gene_id "LTnewLTref_100014700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 366990 369371 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100014800.1"; gene_id "LTnewLTref_100014800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 366990 369371 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014800.1"; gene_id "LTnewLTref_100014800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 370853 372112 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100014900.1"; gene_id "LTnewLTref_100014900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 370853 372112 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100014900.1"; gene_id "LTnewLTref_100014900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 374048 374713 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015000.1"; gene_id "LTnewLTref_100015000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 374048 374713 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015000.1"; gene_id "LTnewLTref_100015000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 375663 379487 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015100.1"; gene_id "LTnewLTref_100015100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 375663 379487 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015100.1"; gene_id "LTnewLTref_100015100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 381095 387316 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015200.1"; gene_id "LTnewLTref_100015200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 381095 387316 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015200.1"; gene_id "LTnewLTref_100015200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 388853 390421 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015300.1"; gene_id "LTnewLTref_100015300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 388853 390421 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015300.1"; gene_id "LTnewLTref_100015300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 391044 396283 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015400.1"; gene_id "LTnewLTref_100015400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 391044 395909 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015400.1"; gene_id "LTnewLTref_100015400"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 395966 396283 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015400.1"; gene_id "LTnewLTref_100015400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 397798 399996 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015500.1"; gene_id "LTnewLTref_100015500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 397798 399996 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015500.1"; gene_id "LTnewLTref_100015500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 400729 401103 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015600.1"; gene_id "LTnewLTref_100015600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 400729 401103 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015600.1"; gene_id "LTnewLTref_100015600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 402221 402811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015700.1"; gene_id "LTnewLTref_100015700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 402221 402811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015700.1"; gene_id "LTnewLTref_100015700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 403781 404173 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015800.1"; gene_id "LTnewLTref_100015800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 403781 404173 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015800.1"; gene_id "LTnewLTref_100015800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 404920 408423 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100015900.1"; gene_id "LTnewLTref_100015900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 404920 408423 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100015900.1"; gene_id "LTnewLTref_100015900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 409332 409811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016000.1"; gene_id "LTnewLTref_100016000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 409332 409811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016000.1"; gene_id "LTnewLTref_100016000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 410673 415388 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016100.1"; gene_id "LTnewLTref_100016100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 410673 415388 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016100.1"; gene_id "LTnewLTref_100016100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 416746 417372 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016200.1"; gene_id "LTnewLTref_100016200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 416746 417372 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016200.1"; gene_id "LTnewLTref_100016200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 419404 420003 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016300.1"; gene_id "LTnewLTref_100016300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 419404 420003 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016300.1"; gene_id "LTnewLTref_100016300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 420768 421139 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016400.1"; gene_id "LTnewLTref_100016400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 420768 421139 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016400.1"; gene_id "LTnewLTref_100016400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 420768 421307 0.63 - . transcript_id "LTnewLTref_100016400.2"; gene_id "LTnewLTref_100016400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 420768 421307 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016400.2"; gene_id "LTnewLTref_100016400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 421384 422813 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016500.1"; gene_id "LTnewLTref_100016500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 421384 421897 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_100016500.1"; gene_id "LTnewLTref_100016500"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 422311 422813 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016500.1"; gene_id "LTnewLTref_100016500"; CM024296.1 . transcript 422838 424504 . - . transcript_id "LTnewLTref_100016600.1"; gene_id "LTnewLTref_100016600:pseudogene" CM024296.1 . exon 422838 424504 . - . transcript_id "LTnewLTref_100016600.1"; gene_id "LTnewLTref_100016600:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 424569 425158 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_100016700.1"; gene_id "LTnewLTref_100016700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 424569 424656 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_100016700.1"; gene_id "LTnewLTref_100016700"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 424713 425158 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016700.1"; gene_id "LTnewLTref_100016700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 424569 425404 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_100016700.2"; gene_id "LTnewLTref_100016700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 424569 424656 0.99 - 1 transcript_id "LTnewLTref_100016700.2"; gene_id "LTnewLTref_100016700"; CM024296.1 AUGUSTUS CDS 424713 425404 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016700.2"; gene_id "LTnewLTref_100016700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 428161 432162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016800.1"; gene_id "LTnewLTref_100016800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 428161 432162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016800.1"; gene_id "LTnewLTref_100016800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 433412 433735 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100016900.1"; gene_id "LTnewLTref_100016900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 433412 433735 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100016900.1"; gene_id "LTnewLTref_100016900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 434695 436296 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017000.1"; gene_id "LTnewLTref_100017000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 434695 436296 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017000.1"; gene_id "LTnewLTref_100017000"; CM024296.1 Liftoff transcript 437673 440240 . - . transcript_id "LTnewLTref_100017100.1"; gene_id "LTnewLTref_100017100" CM024296.1 Liftoff CDS 437673 440240 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017100.1"; gene_id "LTnewLTref_100017100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 441631 442023 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017200.1"; gene_id "LTnewLTref_100017200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 441631 442023 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017200.1"; gene_id "LTnewLTref_100017200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 443901 445751 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017300.1"; gene_id "LTnewLTref_100017300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 443901 445751 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017300.1"; gene_id "LTnewLTref_100017300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 447052 447444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017400.1"; gene_id "LTnewLTref_100017400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 447052 447444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017400.1"; gene_id "LTnewLTref_100017400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 447919 449178 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017500.1"; gene_id "LTnewLTref_100017500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 447919 449178 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017500.1"; gene_id "LTnewLTref_100017500"; CM024296.1 . transcript 450454 451478 . - . transcript_id "LTnewLTref_100017600.1"; gene_id "LTnewLTref_100017600:pseudogene" CM024296.1 . exon 450454 451478 . - . transcript_id "LTnewLTref_100017600.1"; gene_id "LTnewLTref_100017600:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 452807 453985 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017700.1"; gene_id "LTnewLTref_100017700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 452807 453985 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017700.1"; gene_id "LTnewLTref_100017700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 455852 456991 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017800.1"; gene_id "LTnewLTref_100017800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 455852 456991 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017800.1"; gene_id "LTnewLTref_100017800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 458142 461813 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100017900.1"; gene_id "LTnewLTref_100017900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 458142 461813 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100017900.1"; gene_id "LTnewLTref_100017900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 462360 463187 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018000.1"; gene_id "LTnewLTref_100018000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 462360 463187 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018000.1"; gene_id "LTnewLTref_100018000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 463851 464819 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018100.1"; gene_id "LTnewLTref_100018100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 463851 464819 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018100.1"; gene_id "LTnewLTref_100018100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 465452 467230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018200.1"; gene_id "LTnewLTref_100018200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 465452 467230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018200.1"; gene_id "LTnewLTref_100018200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 470054 472402 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018300.1"; gene_id "LTnewLTref_100018300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 470054 472402 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018300.1"; gene_id "LTnewLTref_100018300"; CM024296.1 . transcript 473931 474488 . - . transcript_id "LTnewLTref_100018400.1"; gene_id "LTnewLTref_100018400:pseudogene" CM024296.1 . exon 473931 474488 . - . transcript_id "LTnewLTref_100018400.1"; gene_id "LTnewLTref_100018400:pseudogene"; CM024296.1 Liftoff transcript 474698 475187 . - . transcript_id "LTnewLTref_100018500.1"; gene_id "LTnewLTref_100018500" CM024296.1 Liftoff CDS 474698 475187 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018500.1"; gene_id "LTnewLTref_100018500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 476473 477006 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018600.1"; gene_id "LTnewLTref_100018600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 476473 477006 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018600.1"; gene_id "LTnewLTref_100018600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 478634 479908 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018700.1"; gene_id "LTnewLTref_100018700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 478634 479908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018700.1"; gene_id "LTnewLTref_100018700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 480784 481101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018800.1"; gene_id "LTnewLTref_100018800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 480784 481101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018800.1"; gene_id "LTnewLTref_100018800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 482467 484032 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100018900.1"; gene_id "LTnewLTref_100018900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 482467 484032 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100018900.1"; gene_id "LTnewLTref_100018900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 485132 485710 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019000.1"; gene_id "LTnewLTref_100019000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 485132 485710 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019000.1"; gene_id "LTnewLTref_100019000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 486676 491259 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019100.1"; gene_id "LTnewLTref_100019100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 486676 491259 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019100.1"; gene_id "LTnewLTref_100019100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 493450 494532 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019200.1"; gene_id "LTnewLTref_100019200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 493450 494532 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019200.1"; gene_id "LTnewLTref_100019200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 495592 497034 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019300.1"; gene_id "LTnewLTref_100019300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 495592 497034 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019300.1"; gene_id "LTnewLTref_100019300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 499537 500187 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019400.1"; gene_id "LTnewLTref_100019400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 499537 500187 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019400.1"; gene_id "LTnewLTref_100019400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 501908 502579 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019500.1"; gene_id "LTnewLTref_100019500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 501908 502579 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019500.1"; gene_id "LTnewLTref_100019500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 504583 505005 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019600.1"; gene_id "LTnewLTref_100019600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 504583 505005 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019600.1"; gene_id "LTnewLTref_100019600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 506238 506651 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_100019700.1"; gene_id "LTnewLTref_100019700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 506238 506651 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019700.1"; gene_id "LTnewLTref_100019700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 507017 508210 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019800.1"; gene_id "LTnewLTref_100019800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 507017 508210 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019800.1"; gene_id "LTnewLTref_100019800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 509460 510029 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100019900.1"; gene_id "LTnewLTref_100019900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 509460 510029 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100019900.1"; gene_id "LTnewLTref_100019900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 511434 514757 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020000.1"; gene_id "LTnewLTref_100020000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 511434 514757 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020000.1"; gene_id "LTnewLTref_100020000"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 516226 517929 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020100.1"; gene_id "LTnewLTref_100020100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 516226 517929 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020100.1"; gene_id "LTnewLTref_100020100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 519025 519945 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020200.1"; gene_id "LTnewLTref_100020200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 519025 519945 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020200.1"; gene_id "LTnewLTref_100020200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 520603 521004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020300.1"; gene_id "LTnewLTref_100020300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 520603 521004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020300.1"; gene_id "LTnewLTref_100020300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 521874 522077 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020400.1"; gene_id "LTnewLTref_100020400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 521874 522077 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020400.1"; gene_id "LTnewLTref_100020400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 522580 522984 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020500.1"; gene_id "LTnewLTref_100020500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 522580 522984 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020500.1"; gene_id "LTnewLTref_100020500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 523424 524161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_100020600.1"; gene_id "LTnewLTref_100020600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 523424 524161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_100020600.1"; gene_id "LTnewLTref_100020600"; CM024296.1 Aragorn_1.2.36 transcript 524761 524834 . + . transcript_id "LTnewLTref_100020700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_100020700" CM024296.1 Aragorn_1.2.36 exon 524761 524834 . + . transcript_id "LTnewLTref_100020700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_100020700"; CM024296.1 Aragorn_1.2.36 transcript 524891 524961 . - . transcript_id "LTnewLTref_100020800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_100020800" CM024296.1 Aragorn_1.2.36 exon 524891 524961 . - . transcript_id "LTnewLTref_100020800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_100020800"; CM024296.1 Aragorn_1.2.36 transcript 525021 525093 . - . transcript_id "LTnewLTref_100020900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_100020900" CM024296.1 Aragorn_1.2.36 exon 525021 525093 . - . transcript_id "LTnewLTref_100020900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_100020900"; CM024296.1 . transcript 525381 526112 . + . transcript_id "LTnewLTref_100021000.1"; gene_id "LTnewLTref_100021000:pseudogene" CM024296.1 . exon 525381 526112 . + . transcript_id "LTnewLTref_100021000.1"; gene_id "LTnewLTref_100021000:pseudogene"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 526867 527853 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021100.1"; gene_id "LTnewLTref_100021100" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 526867 527853 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021100.1"; gene_id "LTnewLTref_100021100"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 529546 530511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021200.1"; gene_id "LTnewLTref_100021200" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 529546 530511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021200.1"; gene_id "LTnewLTref_100021200"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 532296 533252 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021300.1"; gene_id "LTnewLTref_100021300" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 532296 533252 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021300.1"; gene_id "LTnewLTref_100021300"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 537573 538520 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021400.1"; gene_id "LTnewLTref_100021400" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 537573 538520 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021400.1"; gene_id "LTnewLTref_100021400"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 539714 540655 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021500.1"; gene_id "LTnewLTref_100021500" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 539714 540655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021500.1"; gene_id "LTnewLTref_100021500"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 541666 542616 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021600.1"; gene_id "LTnewLTref_100021600" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 541666 542616 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021600.1"; gene_id "LTnewLTref_100021600"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 544959 545894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021700.1"; gene_id "LTnewLTref_100021700" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 544959 545894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021700.1"; gene_id "LTnewLTref_100021700"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 547966 549447 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021800.1"; gene_id "LTnewLTref_100021800" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 547966 549447 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021800.1"; gene_id "LTnewLTref_100021800"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 551447 553426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100021900.1"; gene_id "LTnewLTref_100021900" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 551447 553426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100021900.1"; gene_id "LTnewLTref_100021900"; CM024296.1 AUGUSTUS transcript 556363 557547 1 + . transcript_id "LTnewLTref_100022000.1"; gene_id "LTnewLTref_100022000" CM024296.1 AUGUSTUS CDS 556363 557547 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_100022000.1"; gene_id "LTnewLTref_100022000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 871 998 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_110005000.1"; gene_id "LTnewLTref_110005000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 871 998 0.61 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110005000.1"; gene_id "LTnewLTref_110005000"; CM024297.1 Liftoff transcript 3145 4979 . + . transcript_id "LTnewLTref_110005100.1"; gene_id "LTnewLTref_110005100" CM024297.1 Liftoff CDS 3145 3410 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005100.1"; gene_id "LTnewLTref_110005100"; CM024297.1 Liftoff CDS 3803 4979 . + 1 transcript_id "LTnewLTref_110005100.1"; gene_id "LTnewLTref_110005100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 5501 6424 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110005200.1"; gene_id "LTnewLTref_110005200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 5501 6424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005200.1"; gene_id "LTnewLTref_110005200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 7110 8015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110005300.1"; gene_id "LTnewLTref_110005300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 7110 8015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005300.1"; gene_id "LTnewLTref_110005300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 8583 11459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110005400.1"; gene_id "LTnewLTref_110005400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 8583 11459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005400.1"; gene_id "LTnewLTref_110005400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 12091 15777 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_110005500.1"; gene_id "LTnewLTref_110005500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 12091 15777 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005500.1"; gene_id "LTnewLTref_110005500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 17177 20024 0.88 + . transcript_id "LTnewLTref_110005600.1"; gene_id "LTnewLTref_110005600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 17177 19002 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005600.1"; gene_id "LTnewLTref_110005600"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 19073 20024 0.88 + 1 transcript_id "LTnewLTref_110005600.1"; gene_id "LTnewLTref_110005600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 18248 20024 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_110005600.2"; gene_id "LTnewLTref_110005600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 18248 19002 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005600.2"; gene_id "LTnewLTref_110005600"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 19073 20024 0.98 + 1 transcript_id "LTnewLTref_110005600.2"; gene_id "LTnewLTref_110005600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 20159 21028 0.7 + . transcript_id "LTnewLTref_110005700.1"; gene_id "LTnewLTref_110005700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 20159 21028 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005700.1"; gene_id "LTnewLTref_110005700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 21129 23103 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_110005800.1"; gene_id "LTnewLTref_110005800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 21129 21315 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005800.1"; gene_id "LTnewLTref_110005800"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 21386 23103 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110005800.1"; gene_id "LTnewLTref_110005800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 24073 24750 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110005900.1"; gene_id "LTnewLTref_110005900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 24073 24750 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110005900.1"; gene_id "LTnewLTref_110005900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 25457 25911 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_110006000.1"; gene_id "LTnewLTref_110006000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 25457 25851 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006000.1"; gene_id "LTnewLTref_110006000"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 25902 25911 0.5 + 1 transcript_id "LTnewLTref_110006000.1"; gene_id "LTnewLTref_110006000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 25457 27457 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_110006000.2"; gene_id "LTnewLTref_110006000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 25457 27457 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006000.2"; gene_id "LTnewLTref_110006000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 28388 29812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006100.1"; gene_id "LTnewLTref_110006100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 28388 29812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006100.1"; gene_id "LTnewLTref_110006100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 31316 32509 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006200.1"; gene_id "LTnewLTref_110006200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 31316 32509 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006200.1"; gene_id "LTnewLTref_110006200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 33522 34091 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006300.1"; gene_id "LTnewLTref_110006300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 33522 34091 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006300.1"; gene_id "LTnewLTref_110006300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 36008 36847 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006400.1"; gene_id "LTnewLTref_110006400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 36008 36847 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006400.1"; gene_id "LTnewLTref_110006400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 37901 38779 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006500.1"; gene_id "LTnewLTref_110006500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 37901 38779 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006500.1"; gene_id "LTnewLTref_110006500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 39581 42223 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006600.1"; gene_id "LTnewLTref_110006600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 39581 42223 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006600.1"; gene_id "LTnewLTref_110006600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 44522 47605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006700.1"; gene_id "LTnewLTref_110006700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 44522 47605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006700.1"; gene_id "LTnewLTref_110006700"; CM024297.1 . transcript 48233 50398 . + . transcript_id "LTnewLTref_110006800.1"; gene_id "LTnewLTref_110006800:pseudogene" CM024297.1 . exon 48233 50398 . + . transcript_id "LTnewLTref_110006800.1"; gene_id "LTnewLTref_110006800:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 51036 51626 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110006900.1"; gene_id "LTnewLTref_110006900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 51036 51626 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110006900.1"; gene_id "LTnewLTref_110006900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 52427 54256 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007000.1"; gene_id "LTnewLTref_110007000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 52427 54256 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007000.1"; gene_id "LTnewLTref_110007000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 55010 55564 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007100.1"; gene_id "LTnewLTref_110007100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 55010 55564 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007100.1"; gene_id "LTnewLTref_110007100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 56501 57832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007200.1"; gene_id "LTnewLTref_110007200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 56501 57832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007200.1"; gene_id "LTnewLTref_110007200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 60841 61047 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007300.1"; gene_id "LTnewLTref_110007300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 60841 61047 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007300.1"; gene_id "LTnewLTref_110007300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 61731 62066 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007400.1"; gene_id "LTnewLTref_110007400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 61731 62066 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007400.1"; gene_id "LTnewLTref_110007400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 62508 64268 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007500.1"; gene_id "LTnewLTref_110007500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 62508 64268 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007500.1"; gene_id "LTnewLTref_110007500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 65206 65949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007600.1"; gene_id "LTnewLTref_110007600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 65206 65949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007600.1"; gene_id "LTnewLTref_110007600"; CM024297.1 . transcript 67216 67641 . - . transcript_id "LTnewLTref_110007700.1"; gene_id "LTnewLTref_110007700:pseudogene" CM024297.1 . exon 67216 67641 . - . transcript_id "LTnewLTref_110007700.1"; gene_id "LTnewLTref_110007700:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 67289 70345 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007800.1"; gene_id "LTnewLTref_110007800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 67289 70345 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007800.1"; gene_id "LTnewLTref_110007800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 72289 74073 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110007900.1"; gene_id "LTnewLTref_110007900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 72289 74073 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110007900.1"; gene_id "LTnewLTref_110007900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 74813 76069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110008000.1"; gene_id "LTnewLTref_110008000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 74813 76069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008000.1"; gene_id "LTnewLTref_110008000"; CM024297.1 . transcript 77376 77717 . + . transcript_id "LTnewLTref_110008100.1"; gene_id "LTnewLTref_110008100:pseudogene" CM024297.1 . exon 77376 77717 . + . transcript_id "LTnewLTref_110008100.1"; gene_id "LTnewLTref_110008100:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 78440 79230 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_110008200.1"; gene_id "LTnewLTref_110008200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 78440 78500 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008200.1"; gene_id "LTnewLTref_110008200"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 78593 79230 0.78 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110008200.1"; gene_id "LTnewLTref_110008200"; CM024297.1 . transcript 79238 79529 . + . transcript_id "LTnewLTref_110008300.1"; gene_id "LTnewLTref_110008300:pseudogene" CM024297.1 . exon 79238 79529 . + . transcript_id "LTnewLTref_110008300.1"; gene_id "LTnewLTref_110008300:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 79632 80294 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_110008400.1"; gene_id "LTnewLTref_110008400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 79632 79684 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008400.1"; gene_id "LTnewLTref_110008400"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 79733 80294 0.5 + 1 transcript_id "LTnewLTref_110008400.1"; gene_id "LTnewLTref_110008400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 79716 80294 0.37 + . transcript_id "LTnewLTref_110008400.2"; gene_id "LTnewLTref_110008400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 79716 80294 0.37 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008400.2"; gene_id "LTnewLTref_110008400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 80519 80722 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110008500.1"; gene_id "LTnewLTref_110008500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 80519 80722 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008500.1"; gene_id "LTnewLTref_110008500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 80519 81055 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_110008500.2"; gene_id "LTnewLTref_110008500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 80519 80714 0.79 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008500.2"; gene_id "LTnewLTref_110008500"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 80877 81055 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110008500.2"; gene_id "LTnewLTref_110008500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 81890 83299 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110008600.1"; gene_id "LTnewLTref_110008600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 81890 83299 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008600.1"; gene_id "LTnewLTref_110008600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 84104 84928 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110008700.1"; gene_id "LTnewLTref_110008700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 84104 84928 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008700.1"; gene_id "LTnewLTref_110008700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 85420 86176 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_110008800.1"; gene_id "LTnewLTref_110008800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 85420 86115 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008800.1"; gene_id "LTnewLTref_110008800"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 86159 86176 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008800.1"; gene_id "LTnewLTref_110008800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 85420 91500 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110008800.2"; gene_id "LTnewLTref_110008800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 85420 91500 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008800.2"; gene_id "LTnewLTref_110008800"; CM024297.1 Liftoff transcript 95456 100000 . + . transcript_id "LTnewLTref_110008900.1"; gene_id "LTnewLTref_110008900" CM024297.1 Liftoff CDS 95456 100000 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110008900.1"; gene_id "LTnewLTref_110008900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 102299 105943 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009000.1"; gene_id "LTnewLTref_110009000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 102299 105943 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009000.1"; gene_id "LTnewLTref_110009000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 107805 109304 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009100.1"; gene_id "LTnewLTref_110009100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 107805 109304 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009100.1"; gene_id "LTnewLTref_110009100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 110162 110923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009200.1"; gene_id "LTnewLTref_110009200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 110162 110923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009200.1"; gene_id "LTnewLTref_110009200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 112853 114049 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009300.1"; gene_id "LTnewLTref_110009300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 112853 114049 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009300.1"; gene_id "LTnewLTref_110009300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 115294 117321 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009400.1"; gene_id "LTnewLTref_110009400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 115294 117321 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009400.1"; gene_id "LTnewLTref_110009400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 119229 122600 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009500.1"; gene_id "LTnewLTref_110009500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 119229 122600 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009500.1"; gene_id "LTnewLTref_110009500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 123935 125647 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009600.1"; gene_id "LTnewLTref_110009600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 123935 125647 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009600.1"; gene_id "LTnewLTref_110009600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 129281 133336 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009700.1"; gene_id "LTnewLTref_110009700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 129281 133336 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009700.1"; gene_id "LTnewLTref_110009700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 135183 137732 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009800.1"; gene_id "LTnewLTref_110009800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 135183 137732 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009800.1"; gene_id "LTnewLTref_110009800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 138940 141270 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110009900.1"; gene_id "LTnewLTref_110009900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 138940 141270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110009900.1"; gene_id "LTnewLTref_110009900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 142129 142475 0.49 + . transcript_id "LTnewLTref_110010000.1"; gene_id "LTnewLTref_110010000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 142129 142282 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110010000.1"; gene_id "LTnewLTref_110010000"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 142393 142475 0.88 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110010000.1"; gene_id "LTnewLTref_110010000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 142753 144687 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110010100.1"; gene_id "LTnewLTref_110010100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 142753 144687 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110010100.1"; gene_id "LTnewLTref_110010100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 145845 147587 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110010200.1"; gene_id "LTnewLTref_110010200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 145845 147587 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110010200.1"; gene_id "LTnewLTref_110010200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 148364 150652 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110010300.1"; gene_id "LTnewLTref_110010300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 148364 150652 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110010300.1"; gene_id "LTnewLTref_110010300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 151140 153071 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110010400.1"; gene_id "LTnewLTref_110010400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 151140 153071 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110010400.1"; gene_id "LTnewLTref_110010400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 153684 155915 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110010500.1"; gene_id "LTnewLTref_110010500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 153684 155915 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110010500.1"; gene_id "LTnewLTref_110010500"; CM024297.1 . transcript 156716 157103 . + . transcript_id "LTnewLTref_110010600.1"; gene_id "LTnewLTref_110010600:pseudogene" CM024297.1 . exon 156716 157103 . + . transcript_id "LTnewLTref_110010600.1"; gene_id "LTnewLTref_110010600:pseudogene"; CM024297.1 . transcript 157315 158707 . + . transcript_id "LTnewLTref_110010700.1"; gene_id "LTnewLTref_110010700:pseudogene" CM024297.1 . exon 157315 158707 . + . transcript_id "LTnewLTref_110010700.1"; gene_id "LTnewLTref_110010700:pseudogene"; CM024297.1 INFERNAL transcript 159207 159325 93 - . transcript_id "LTnewLTref_110010800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110010800" CM024297.1 INFERNAL exon 159207 159325 . - . transcript_id "LTnewLTref_110010800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110010800"; CM024297.1 Liftoff transcript 159207 159325 . - . transcript_id "LTnewLTref_110010900:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110010900" CM024297.1 Liftoff exon 159207 159325 . - . transcript_id "LTnewLTref_110010900:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110010900"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 159375 159457 . - . transcript_id "LTnewLTref_110011000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011000" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 159375 159457 . - . transcript_id "LTnewLTref_110011000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011000"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 159531 159603 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011100" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 159531 159603 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011100"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 165050 165121 . - . transcript_id "LTnewLTref_110011200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011200" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 165050 165121 . - . transcript_id "LTnewLTref_110011200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011200"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 165179 165251 . - . transcript_id "LTnewLTref_110011300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011300" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 165179 165251 . - . transcript_id "LTnewLTref_110011300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011300"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 165325 165406 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011400" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 165325 165406 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011400"; CM024297.1 INFERNAL transcript 165457 165575 93 + . transcript_id "LTnewLTref_110011500:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011500" CM024297.1 INFERNAL exon 165457 165575 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011500:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011500"; CM024297.1 Liftoff transcript 165457 165575 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011600" CM024297.1 Liftoff exon 165457 165575 . + . transcript_id "LTnewLTref_110011600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110011600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 167629 170811 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110011700.1"; gene_id "LTnewLTref_110011700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 167629 170811 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110011700.1"; gene_id "LTnewLTref_110011700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 171780 173003 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110011800.1"; gene_id "LTnewLTref_110011800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 171780 173003 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110011800.1"; gene_id "LTnewLTref_110011800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 173617 174015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110011900.1"; gene_id "LTnewLTref_110011900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 173617 174015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110011900.1"; gene_id "LTnewLTref_110011900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 176949 178685 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110012000.1"; gene_id "LTnewLTref_110012000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 176949 178685 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012000.1"; gene_id "LTnewLTref_110012000"; CM024297.1 . transcript 182552 183910 . + . transcript_id "LTnewLTref_110012100.1"; gene_id "LTnewLTref_110012100:pseudogene" CM024297.1 . exon 182552 183910 . + . transcript_id "LTnewLTref_110012100.1"; gene_id "LTnewLTref_110012100:pseudogene"; CM024297.1 . transcript 185576 187765 . + . transcript_id "LTnewLTref_110012200.1"; gene_id "LTnewLTref_110012200:pseudogene" CM024297.1 . exon 185576 187765 . + . transcript_id "LTnewLTref_110012200.1"; gene_id "LTnewLTref_110012200:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 188516 190459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110012300.1"; gene_id "LTnewLTref_110012300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 188516 190459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012300.1"; gene_id "LTnewLTref_110012300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 191986 193638 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110012400.1"; gene_id "LTnewLTref_110012400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 191986 193638 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012400.1"; gene_id "LTnewLTref_110012400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 195959 196183 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110012500.1"; gene_id "LTnewLTref_110012500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 195959 196183 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012500.1"; gene_id "LTnewLTref_110012500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 199789 200147 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_110012600.1"; gene_id "LTnewLTref_110012600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 199789 199822 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012600.1"; gene_id "LTnewLTref_110012600"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 199930 200147 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110012600.1"; gene_id "LTnewLTref_110012600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 200299 203547 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110012700.1"; gene_id "LTnewLTref_110012700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 200299 203547 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012700.1"; gene_id "LTnewLTref_110012700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 204652 205334 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_110012800.1"; gene_id "LTnewLTref_110012800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 204652 204773 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012800.1"; gene_id "LTnewLTref_110012800"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 205127 205334 0.67 + 1 transcript_id "LTnewLTref_110012800.1"; gene_id "LTnewLTref_110012800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 205375 205752 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110012900.1"; gene_id "LTnewLTref_110012900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 205375 205752 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110012900.1"; gene_id "LTnewLTref_110012900"; CM024297.1 Liftoff transcript 205772 206075 . + . transcript_id "LTnewLTref_110013000.1"; gene_id "LTnewLTref_110013000" CM024297.1 Liftoff CDS 205772 206075 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013000.1"; gene_id "LTnewLTref_110013000"; CM024297.1 . transcript 206085 206324 . + . transcript_id "LTnewLTref_110013100.1"; gene_id "LTnewLTref_110013100:pseudogene" CM024297.1 . exon 206085 206324 . + . transcript_id "LTnewLTref_110013100.1"; gene_id "LTnewLTref_110013100:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 208518 208946 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013200.1"; gene_id "LTnewLTref_110013200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 208518 208946 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013200.1"; gene_id "LTnewLTref_110013200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 214372 216438 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013300.1"; gene_id "LTnewLTref_110013300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 214372 216438 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013300.1"; gene_id "LTnewLTref_110013300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 217402 219198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013400.1"; gene_id "LTnewLTref_110013400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 217402 219198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013400.1"; gene_id "LTnewLTref_110013400"; CM024297.1 . transcript 228431 231829 . + . transcript_id "LTnewLTref_110013500.1"; gene_id "LTnewLTref_110013500:pseudogene" CM024297.1 . exon 228431 231829 . + . transcript_id "LTnewLTref_110013500.1"; gene_id "LTnewLTref_110013500:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 236080 236958 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013600.1"; gene_id "LTnewLTref_110013600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 236080 236958 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013600.1"; gene_id "LTnewLTref_110013600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 239365 240972 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013700.1"; gene_id "LTnewLTref_110013700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 239365 240972 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013700.1"; gene_id "LTnewLTref_110013700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 243371 244978 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013800.1"; gene_id "LTnewLTref_110013800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 243371 244978 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013800.1"; gene_id "LTnewLTref_110013800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 247382 248989 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110013900.1"; gene_id "LTnewLTref_110013900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 247382 248989 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110013900.1"; gene_id "LTnewLTref_110013900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 251217 257042 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014000.1"; gene_id "LTnewLTref_110014000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 251217 257042 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014000.1"; gene_id "LTnewLTref_110014000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 258893 260818 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014100.1"; gene_id "LTnewLTref_110014100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 258893 260818 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014100.1"; gene_id "LTnewLTref_110014100"; CM024297.1 . transcript 264330 265844 . + . transcript_id "LTnewLTref_110014200.1"; gene_id "LTnewLTref_110014200:pseudogene" CM024297.1 . exon 264330 265844 . + . transcript_id "LTnewLTref_110014200.1"; gene_id "LTnewLTref_110014200:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 268389 270257 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014300.1"; gene_id "LTnewLTref_110014300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 268389 270257 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014300.1"; gene_id "LTnewLTref_110014300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 276726 277538 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014400.1"; gene_id "LTnewLTref_110014400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 276726 277538 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014400.1"; gene_id "LTnewLTref_110014400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 276939 277538 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_110014400.2"; gene_id "LTnewLTref_110014400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 276939 277538 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014400.2"; gene_id "LTnewLTref_110014400"; CM024297.1 Liftoff transcript 278423 278787 . + . transcript_id "LTnewLTref_110014500.1"; gene_id "LTnewLTref_110014500" CM024297.1 Liftoff exon 278423 278787 . + . transcript_id "LTnewLTref_110014500.1"; gene_id "LTnewLTref_110014500"; CM024297.1 Liftoff CDS 278424 278787 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014500.1"; gene_id "LTnewLTref_110014500"; CM024297.1 Liftoff transcript 279002 279403 . + . transcript_id "LTnewLTref_110014600.1"; gene_id "LTnewLTref_110014600" CM024297.1 Liftoff CDS 279002 279403 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014600.1"; gene_id "LTnewLTref_110014600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 281157 282386 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014700.1"; gene_id "LTnewLTref_110014700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 281157 282386 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014700.1"; gene_id "LTnewLTref_110014700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 284178 285848 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014800.1"; gene_id "LTnewLTref_110014800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 284178 285848 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014800.1"; gene_id "LTnewLTref_110014800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 288792 290753 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110014900.1"; gene_id "LTnewLTref_110014900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 288792 290753 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110014900.1"; gene_id "LTnewLTref_110014900"; CM024297.1 Liftoff transcript 293356 297516 . + . transcript_id "LTnewLTref_110015000.1"; gene_id "LTnewLTref_110015000" CM024297.1 Liftoff CDS 293356 297516 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015000.1"; gene_id "LTnewLTref_110015000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 298489 299823 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015100.1"; gene_id "LTnewLTref_110015100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 298489 299823 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015100.1"; gene_id "LTnewLTref_110015100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 301590 302207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015200.1"; gene_id "LTnewLTref_110015200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 301590 302207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015200.1"; gene_id "LTnewLTref_110015200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 303797 304291 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015300.1"; gene_id "LTnewLTref_110015300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 303797 304291 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015300.1"; gene_id "LTnewLTref_110015300"; CM024297.1 . transcript 305521 306012 . + . transcript_id "LTnewLTref_110015400.1"; gene_id "LTnewLTref_110015400:pseudogene" CM024297.1 . exon 305521 306012 . + . transcript_id "LTnewLTref_110015400.1"; gene_id "LTnewLTref_110015400:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 308442 309212 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015500.1"; gene_id "LTnewLTref_110015500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 308442 309212 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015500.1"; gene_id "LTnewLTref_110015500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 310675 311118 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015600.1"; gene_id "LTnewLTref_110015600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 310675 311118 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015600.1"; gene_id "LTnewLTref_110015600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 311817 314744 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015700.1"; gene_id "LTnewLTref_110015700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 311817 314744 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015700.1"; gene_id "LTnewLTref_110015700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 316994 318418 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015800.1"; gene_id "LTnewLTref_110015800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 316994 318418 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015800.1"; gene_id "LTnewLTref_110015800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 324595 328809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110015900.1"; gene_id "LTnewLTref_110015900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 324595 328809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110015900.1"; gene_id "LTnewLTref_110015900"; CM024297.1 . transcript 331263 332724 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016000.1"; gene_id "LTnewLTref_110016000:pseudogene" CM024297.1 . exon 331263 332724 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016000.1"; gene_id "LTnewLTref_110016000:pseudogene"; CM024297.1 . transcript 335286 336713 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016100.1"; gene_id "LTnewLTref_110016100:pseudogene" CM024297.1 . exon 335286 336713 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016100.1"; gene_id "LTnewLTref_110016100:pseudogene"; CM024297.1 . transcript 338078 343563 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016200.1"; gene_id "LTnewLTref_110016200:pseudogene" CM024297.1 . exon 338078 343563 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016200.1"; gene_id "LTnewLTref_110016200:pseudogene"; CM024297.1 Liftoff transcript 345290 349741 . + . transcript_id "LTnewLTref_110016300.1"; gene_id "LTnewLTref_110016300" CM024297.1 Liftoff CDS 345290 349741 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016300.1"; gene_id "LTnewLTref_110016300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 356131 357105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110016400.1"; gene_id "LTnewLTref_110016400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 356131 357105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016400.1"; gene_id "LTnewLTref_110016400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 358517 359728 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110016500.1"; gene_id "LTnewLTref_110016500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 358517 359728 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016500.1"; gene_id "LTnewLTref_110016500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 361356 364388 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110016600.1"; gene_id "LTnewLTref_110016600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 361356 364388 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016600.1"; gene_id "LTnewLTref_110016600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 365730 366302 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110016700.1"; gene_id "LTnewLTref_110016700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 365730 366302 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016700.1"; gene_id "LTnewLTref_110016700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 368099 372742 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110016800.1"; gene_id "LTnewLTref_110016800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 368099 372742 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016800.1"; gene_id "LTnewLTref_110016800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 373391 375244 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110016900.1"; gene_id "LTnewLTref_110016900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 373391 375244 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110016900.1"; gene_id "LTnewLTref_110016900"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 376688 376762 . - . transcript_id "LTnewLTref_110017000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017000" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 376688 376762 . - . transcript_id "LTnewLTref_110017000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017000"; CM024297.1 Aragorn_1.2.36 transcript 376836 376909 . + . transcript_id "LTnewLTref_110017100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017100" CM024297.1 Aragorn_1.2.36 exon 376836 376909 . + . transcript_id "LTnewLTref_110017100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017100"; CM024297.1 INFERNAL transcript 376971 377089 90.7 + . transcript_id "LTnewLTref_110017200:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017200" CM024297.1 INFERNAL exon 376971 377089 . + . transcript_id "LTnewLTref_110017200:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017200"; CM024297.1 Liftoff transcript 376971 377089 . + . transcript_id "LTnewLTref_110017300:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017300" CM024297.1 Liftoff exon 376971 377089 . + . transcript_id "LTnewLTref_110017300:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_110017300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 378057 379403 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110017400.1"; gene_id "LTnewLTref_110017400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 378057 379403 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017400.1"; gene_id "LTnewLTref_110017400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 380638 381325 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_110017500.1"; gene_id "LTnewLTref_110017500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 380638 381117 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017500.1"; gene_id "LTnewLTref_110017500"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 381185 381325 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017500.1"; gene_id "LTnewLTref_110017500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 382879 384972 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110017600.1"; gene_id "LTnewLTref_110017600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 382879 384972 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017600.1"; gene_id "LTnewLTref_110017600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 387491 387969 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_110017700.1"; gene_id "LTnewLTref_110017700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 387491 387887 0.4 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017700.1"; gene_id "LTnewLTref_110017700"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 387959 387969 0.4 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110017700.1"; gene_id "LTnewLTref_110017700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 387491 389032 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110017700.2"; gene_id "LTnewLTref_110017700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 387491 389032 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017700.2"; gene_id "LTnewLTref_110017700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 390621 391193 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110017800.1"; gene_id "LTnewLTref_110017800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 390621 391193 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017800.1"; gene_id "LTnewLTref_110017800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 392569 393141 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110017900.1"; gene_id "LTnewLTref_110017900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 392569 393141 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110017900.1"; gene_id "LTnewLTref_110017900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 394445 395899 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110018000.1"; gene_id "LTnewLTref_110018000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 394445 395899 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018000.1"; gene_id "LTnewLTref_110018000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 397678 400653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110018100.1"; gene_id "LTnewLTref_110018100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 397678 400653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018100.1"; gene_id "LTnewLTref_110018100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 403300 406045 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_110018200.1"; gene_id "LTnewLTref_110018200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 403300 404499 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018200.1"; gene_id "LTnewLTref_110018200"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 404546 406045 0.58 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018200.1"; gene_id "LTnewLTref_110018200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 408105 410171 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110018300.1"; gene_id "LTnewLTref_110018300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 408105 410171 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018300.1"; gene_id "LTnewLTref_110018300"; CM024297.1 . transcript 414095 419601 . + . transcript_id "LTnewLTref_110018400.1"; gene_id "LTnewLTref_110018400:pseudogene" CM024297.1 . exon 414095 419601 . + . transcript_id "LTnewLTref_110018400.1"; gene_id "LTnewLTref_110018400:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 420363 421169 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110018500.1"; gene_id "LTnewLTref_110018500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 420363 421169 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018500.1"; gene_id "LTnewLTref_110018500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 430848 433631 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110018600.1"; gene_id "LTnewLTref_110018600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 430848 433631 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018600.1"; gene_id "LTnewLTref_110018600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 437684 439144 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110018700.1"; gene_id "LTnewLTref_110018700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 437684 439144 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110018700.1"; gene_id "LTnewLTref_110018700"; CM024297.1 . transcript 442898 443853 . + . transcript_id "LTnewLTref_110018800.1"; gene_id "LTnewLTref_110018800:pseudogene" CM024297.1 . exon 442898 443853 . + . transcript_id "LTnewLTref_110018800.1"; gene_id "LTnewLTref_110018800:pseudogene"; CM024297.1 . transcript 443866 447069 . + . transcript_id "LTnewLTref_110018900.1"; gene_id "LTnewLTref_110018900:pseudogene" CM024297.1 . exon 443866 447069 . + . transcript_id "LTnewLTref_110018900.1"; gene_id "LTnewLTref_110018900:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 445138 445389 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_110019000.1"; gene_id "LTnewLTref_110019000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 445138 445389 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019000.1"; gene_id "LTnewLTref_110019000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 445549 446270 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_110019100.1"; gene_id "LTnewLTref_110019100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 445549 446146 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019100.1"; gene_id "LTnewLTref_110019100"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 446215 446270 0.77 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110019100.1"; gene_id "LTnewLTref_110019100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 446353 447069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019200.1"; gene_id "LTnewLTref_110019200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 446353 447069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019200.1"; gene_id "LTnewLTref_110019200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 446593 447069 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_110019200.2"; gene_id "LTnewLTref_110019200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 446593 447069 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019200.2"; gene_id "LTnewLTref_110019200"; CM024297.1 Liftoff transcript 449055 450935 . + . transcript_id "LTnewLTref_110019300.1"; gene_id "LTnewLTref_110019300" CM024297.1 Liftoff CDS 449055 450935 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019300.1"; gene_id "LTnewLTref_110019300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 453199 454596 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019400.1"; gene_id "LTnewLTref_110019400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 453199 454596 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019400.1"; gene_id "LTnewLTref_110019400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 456978 458420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019500.1"; gene_id "LTnewLTref_110019500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 456978 458420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019500.1"; gene_id "LTnewLTref_110019500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 461240 461683 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019600.1"; gene_id "LTnewLTref_110019600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 461240 461683 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019600.1"; gene_id "LTnewLTref_110019600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 462936 463949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019700.1"; gene_id "LTnewLTref_110019700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 462936 463949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019700.1"; gene_id "LTnewLTref_110019700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 464982 465425 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019800.1"; gene_id "LTnewLTref_110019800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 464982 465425 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019800.1"; gene_id "LTnewLTref_110019800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 466919 470392 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110019900.1"; gene_id "LTnewLTref_110019900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 466919 470392 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110019900.1"; gene_id "LTnewLTref_110019900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 472827 475097 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110020000.1"; gene_id "LTnewLTref_110020000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 472827 475097 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020000.1"; gene_id "LTnewLTref_110020000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 476973 478298 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110020100.1"; gene_id "LTnewLTref_110020100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 476973 478298 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020100.1"; gene_id "LTnewLTref_110020100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 480763 481155 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110020200.1"; gene_id "LTnewLTref_110020200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 480763 481155 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020200.1"; gene_id "LTnewLTref_110020200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 482804 484882 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110020300.1"; gene_id "LTnewLTref_110020300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 482804 484882 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020300.1"; gene_id "LTnewLTref_110020300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 486219 486770 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110020400.1"; gene_id "LTnewLTref_110020400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 486219 486770 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020400.1"; gene_id "LTnewLTref_110020400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 492781 493120 0.87 + . transcript_id "LTnewLTref_110020500.1"; gene_id "LTnewLTref_110020500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 492781 492961 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020500.1"; gene_id "LTnewLTref_110020500"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 493050 493120 0.97 + 2 transcript_id "LTnewLTref_110020500.1"; gene_id "LTnewLTref_110020500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 493150 498476 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_110020600.1"; gene_id "LTnewLTref_110020600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 493150 494097 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020600.1"; gene_id "LTnewLTref_110020600"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 494148 498476 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020600.1"; gene_id "LTnewLTref_110020600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 501362 501820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110020700.1"; gene_id "LTnewLTref_110020700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 501362 501820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020700.1"; gene_id "LTnewLTref_110020700"; CM024297.1 . transcript 503960 505850 . + . transcript_id "LTnewLTref_110020800.1"; gene_id "LTnewLTref_110020800:pseudogene" CM024297.1 . exon 503960 505850 . + . transcript_id "LTnewLTref_110020800.1"; gene_id "LTnewLTref_110020800:pseudogene"; CM024297.1 Liftoff transcript 507306 508817 . + . transcript_id "LTnewLTref_110020900.1"; gene_id "LTnewLTref_110020900" CM024297.1 Liftoff CDS 507306 508817 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110020900.1"; gene_id "LTnewLTref_110020900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 514362 520053 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_110021000.1"; gene_id "LTnewLTref_110021000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 514362 519359 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021000.1"; gene_id "LTnewLTref_110021000"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 519424 520053 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021000.1"; gene_id "LTnewLTref_110021000"; CM024297.1 . transcript 522436 522688 . + . transcript_id "LTnewLTref_110021100.1"; gene_id "LTnewLTref_110021100:pseudogene" CM024297.1 . exon 522436 522688 . + . transcript_id "LTnewLTref_110021100.1"; gene_id "LTnewLTref_110021100:pseudogene"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 522970 523593 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_110021200.1"; gene_id "LTnewLTref_110021200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 522970 523370 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021200.1"; gene_id "LTnewLTref_110021200"; CM024297.1 AUGUSTUS CDS 523482 523593 0.9 + 1 transcript_id "LTnewLTref_110021200.1"; gene_id "LTnewLTref_110021200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 524867 530221 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110021300.1"; gene_id "LTnewLTref_110021300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 524867 530221 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021300.1"; gene_id "LTnewLTref_110021300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 536133 537143 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110021400.1"; gene_id "LTnewLTref_110021400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 536133 537143 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021400.1"; gene_id "LTnewLTref_110021400"; CM024297.1 Liftoff transcript 538959 544904 . + . transcript_id "LTnewLTref_110021500.1"; gene_id "LTnewLTref_110021500" CM024297.1 Liftoff CDS 538959 544904 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021500.1"; gene_id "LTnewLTref_110021500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 547459 548019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110021600.1"; gene_id "LTnewLTref_110021600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 547459 548019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021600.1"; gene_id "LTnewLTref_110021600"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 548948 550156 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110021700.1"; gene_id "LTnewLTref_110021700" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 548948 550156 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021700.1"; gene_id "LTnewLTref_110021700"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 550991 552325 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110021800.1"; gene_id "LTnewLTref_110021800" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 550991 552325 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021800.1"; gene_id "LTnewLTref_110021800"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 553682 559009 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110021900.1"; gene_id "LTnewLTref_110021900" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 553682 559009 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110021900.1"; gene_id "LTnewLTref_110021900"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 559955 561838 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110022000.1"; gene_id "LTnewLTref_110022000" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 559955 561838 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110022000.1"; gene_id "LTnewLTref_110022000"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 563973 564575 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110022100.1"; gene_id "LTnewLTref_110022100" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 563973 564575 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110022100.1"; gene_id "LTnewLTref_110022100"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 565786 567162 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110022200.1"; gene_id "LTnewLTref_110022200" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 565786 567162 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110022200.1"; gene_id "LTnewLTref_110022200"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 569281 571137 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110022300.1"; gene_id "LTnewLTref_110022300" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 569281 571137 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110022300.1"; gene_id "LTnewLTref_110022300"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 571741 571962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110022400.1"; gene_id "LTnewLTref_110022400" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 571741 571962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110022400.1"; gene_id "LTnewLTref_110022400"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 572372 573532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_110022500.1"; gene_id "LTnewLTref_110022500" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 572372 573532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_110022500.1"; gene_id "LTnewLTref_110022500"; CM024297.1 AUGUSTUS transcript 574317 574688 1 - . transcript_id "LTnewLTref_110022600.1"; gene_id "LTnewLTref_110022600" CM024297.1 AUGUSTUS CDS 574317 574688 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_110022600.1"; gene_id "LTnewLTref_110022600"; CM024298.1 . transcript 1726 3176 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene" CM024298.1 . exon 1726 1734 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1737 1754 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1756 1788 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1790 1819 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1822 1860 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1866 1943 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1945 1971 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 1973 2008 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2011 2040 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2043 2075 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2077 2154 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2157 2225 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2227 2247 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2249 2320 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2322 2435 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2437 2478 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2480 2485 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2487 2663 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2665 2691 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2693 2779 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2781 2804 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2807 2851 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2853 2882 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2884 2949 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2951 2962 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 2964 3065 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 3067 3084 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 3086 3094 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 . exon 3096 3176 . - . transcript_id "LTnewLTref_120005000.1"; gene_id "LTnewLTref_120005000:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 7493 8331 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_120005100.1"; gene_id "LTnewLTref_120005100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 7493 7743 0.97 - 2 transcript_id "LTnewLTref_120005100.1"; gene_id "LTnewLTref_120005100"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 8037 8331 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120005100.1"; gene_id "LTnewLTref_120005100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 8641 9115 0.59 - . transcript_id "LTnewLTref_120005200.1"; gene_id "LTnewLTref_120005200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 8641 8908 0.84 - 1 transcript_id "LTnewLTref_120005200.1"; gene_id "LTnewLTref_120005200"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 9054 9115 0.62 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120005200.1"; gene_id "LTnewLTref_120005200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 10333 11238 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005300.1"; gene_id "LTnewLTref_120005300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 10333 11238 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005300.1"; gene_id "LTnewLTref_120005300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 11657 12304 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005400.1"; gene_id "LTnewLTref_120005400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 11657 12304 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005400.1"; gene_id "LTnewLTref_120005400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 12705 13556 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005500.1"; gene_id "LTnewLTref_120005500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 12705 13556 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005500.1"; gene_id "LTnewLTref_120005500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 14093 15589 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005600.1"; gene_id "LTnewLTref_120005600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 14093 15589 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005600.1"; gene_id "LTnewLTref_120005600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 16185 16508 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005700.1"; gene_id "LTnewLTref_120005700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 16185 16508 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005700.1"; gene_id "LTnewLTref_120005700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 16862 18133 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005800.1"; gene_id "LTnewLTref_120005800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 16862 18133 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005800.1"; gene_id "LTnewLTref_120005800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 18936 19514 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120005900.1"; gene_id "LTnewLTref_120005900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 18936 19514 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120005900.1"; gene_id "LTnewLTref_120005900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 20402 22132 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006000.1"; gene_id "LTnewLTref_120006000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 20402 22132 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006000.1"; gene_id "LTnewLTref_120006000"; CM024298.1 Liftoff transcript 22879 23151 . + . transcript_id "LTnewLTref_120006100.1"; gene_id "LTnewLTref_120006100" CM024298.1 Liftoff CDS 22879 23151 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006100.1"; gene_id "LTnewLTref_120006100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 23645 24262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006200.1"; gene_id "LTnewLTref_120006200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 23645 24262 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006200.1"; gene_id "LTnewLTref_120006200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 24822 26267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006300.1"; gene_id "LTnewLTref_120006300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 24822 26267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006300.1"; gene_id "LTnewLTref_120006300"; CM024298.1 Liftoff transcript 28919 29179 . + . transcript_id "LTnewLTref_120006400.1"; gene_id "LTnewLTref_120006400" CM024298.1 Liftoff CDS 28919 29179 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006400.1"; gene_id "LTnewLTref_120006400"; CM024298.1 . transcript 30273 30572 . + . transcript_id "LTnewLTref_120006500.1"; gene_id "LTnewLTref_120006500:pseudogene" CM024298.1 . exon 30273 30572 . + . transcript_id "LTnewLTref_120006500.1"; gene_id "LTnewLTref_120006500:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 31478 32350 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006600.1"; gene_id "LTnewLTref_120006600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 31478 32350 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006600.1"; gene_id "LTnewLTref_120006600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 34119 36821 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006700.1"; gene_id "LTnewLTref_120006700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 34119 36821 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006700.1"; gene_id "LTnewLTref_120006700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 37950 42065 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006800.1"; gene_id "LTnewLTref_120006800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 37950 42065 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006800.1"; gene_id "LTnewLTref_120006800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 45748 47496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120006900.1"; gene_id "LTnewLTref_120006900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 45748 47496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120006900.1"; gene_id "LTnewLTref_120006900"; CM024298.1 . transcript 50411 51793 . + . transcript_id "LTnewLTref_120007000.1"; gene_id "LTnewLTref_120007000:pseudogene" CM024298.1 . exon 50411 51793 . + . transcript_id "LTnewLTref_120007000.1"; gene_id "LTnewLTref_120007000:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 53331 57305 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007100.1"; gene_id "LTnewLTref_120007100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 53331 57305 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007100.1"; gene_id "LTnewLTref_120007100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 58200 60686 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007200.1"; gene_id "LTnewLTref_120007200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 58200 60686 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007200.1"; gene_id "LTnewLTref_120007200"; CM024298.1 . transcript 62233 63484 . + . transcript_id "LTnewLTref_120007300.1"; gene_id "LTnewLTref_120007300:pseudogene" CM024298.1 . exon 62233 63484 . + . transcript_id "LTnewLTref_120007300.1"; gene_id "LTnewLTref_120007300:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 64155 66878 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007400.1"; gene_id "LTnewLTref_120007400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 64155 66878 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007400.1"; gene_id "LTnewLTref_120007400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 67856 72661 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007500.1"; gene_id "LTnewLTref_120007500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 67856 72661 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007500.1"; gene_id "LTnewLTref_120007500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 75734 78994 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007600.1"; gene_id "LTnewLTref_120007600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 75734 78994 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007600.1"; gene_id "LTnewLTref_120007600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 80718 81953 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007700.1"; gene_id "LTnewLTref_120007700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 80718 81953 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007700.1"; gene_id "LTnewLTref_120007700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 82722 83609 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007800.1"; gene_id "LTnewLTref_120007800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 82722 83609 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007800.1"; gene_id "LTnewLTref_120007800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 84882 89636 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120007900.1"; gene_id "LTnewLTref_120007900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 84882 89636 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120007900.1"; gene_id "LTnewLTref_120007900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 90072 92150 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120008000.1"; gene_id "LTnewLTref_120008000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 90072 92150 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008000.1"; gene_id "LTnewLTref_120008000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 94647 97001 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120008100.1"; gene_id "LTnewLTref_120008100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 94647 97001 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008100.1"; gene_id "LTnewLTref_120008100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 98427 99190 0.86 + . transcript_id "LTnewLTref_120008200.1"; gene_id "LTnewLTref_120008200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 98427 98530 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008200.1"; gene_id "LTnewLTref_120008200"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 99073 99190 0.87 + 1 transcript_id "LTnewLTref_120008200.1"; gene_id "LTnewLTref_120008200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 100367 109135 0.78 + . transcript_id "LTnewLTref_120008300.1"; gene_id "LTnewLTref_120008300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 100367 109135 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008300.1"; gene_id "LTnewLTref_120008300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 109714 111543 0.84 + . transcript_id "LTnewLTref_120008400.1"; gene_id "LTnewLTref_120008400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 109714 111543 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008400.1"; gene_id "LTnewLTref_120008400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 112506 114620 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120008500.1"; gene_id "LTnewLTref_120008500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 112506 114620 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008500.1"; gene_id "LTnewLTref_120008500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 119116 123962 0.32 + . transcript_id "LTnewLTref_120008600.1"; gene_id "LTnewLTref_120008600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 119116 123578 0.33 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008600.1"; gene_id "LTnewLTref_120008600"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 123731 123962 0.34 + 1 transcript_id "LTnewLTref_120008600.1"; gene_id "LTnewLTref_120008600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 119788 123962 0.34 + . transcript_id "LTnewLTref_120008600.2"; gene_id "LTnewLTref_120008600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 119788 123578 0.36 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008600.2"; gene_id "LTnewLTref_120008600"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 123731 123962 0.35 + 1 transcript_id "LTnewLTref_120008600.2"; gene_id "LTnewLTref_120008600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 124371 130067 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120008700.1"; gene_id "LTnewLTref_120008700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 124371 130067 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008700.1"; gene_id "LTnewLTref_120008700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 130533 132407 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120008800.1"; gene_id "LTnewLTref_120008800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 130533 132407 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008800.1"; gene_id "LTnewLTref_120008800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 134208 134676 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120008900.1"; gene_id "LTnewLTref_120008900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 134208 134584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008900.1"; gene_id "LTnewLTref_120008900"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 134640 134676 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_120008900.1"; gene_id "LTnewLTref_120008900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 134208 143899 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_120008900.2"; gene_id "LTnewLTref_120008900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 134208 134651 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008900.2"; gene_id "LTnewLTref_120008900"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 134708 143899 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120008900.2"; gene_id "LTnewLTref_120008900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 145098 149057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009000.1"; gene_id "LTnewLTref_120009000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 145098 149057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009000.1"; gene_id "LTnewLTref_120009000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 150499 156618 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009100.1"; gene_id "LTnewLTref_120009100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 150499 156618 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009100.1"; gene_id "LTnewLTref_120009100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 159309 161039 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009200.1"; gene_id "LTnewLTref_120009200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 159309 161039 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009200.1"; gene_id "LTnewLTref_120009200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 162991 164103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009300.1"; gene_id "LTnewLTref_120009300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 162991 164103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009300.1"; gene_id "LTnewLTref_120009300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 166063 167016 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009400.1"; gene_id "LTnewLTref_120009400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 166063 167016 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009400.1"; gene_id "LTnewLTref_120009400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 173791 178189 0.32 + . transcript_id "LTnewLTref_120009500.1"; gene_id "LTnewLTref_120009500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 173791 176675 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009500.1"; gene_id "LTnewLTref_120009500"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 176719 178189 0.65 + 1 transcript_id "LTnewLTref_120009500.1"; gene_id "LTnewLTref_120009500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 176912 178189 0.92 + . transcript_id "LTnewLTref_120009500.2"; gene_id "LTnewLTref_120009500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 176912 178189 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009500.2"; gene_id "LTnewLTref_120009500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 179290 180540 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009600.1"; gene_id "LTnewLTref_120009600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 179290 180540 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009600.1"; gene_id "LTnewLTref_120009600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 182185 183330 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120009700.1"; gene_id "LTnewLTref_120009700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 182185 183330 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120009700.1"; gene_id "LTnewLTref_120009700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 185926 187155 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120009800.1"; gene_id "LTnewLTref_120009800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 185926 187155 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120009800.1"; gene_id "LTnewLTref_120009800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 188740 189225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120009900.1"; gene_id "LTnewLTref_120009900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 188740 189225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120009900.1"; gene_id "LTnewLTref_120009900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 191096 191305 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010000.1"; gene_id "LTnewLTref_120010000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 191096 191305 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010000.1"; gene_id "LTnewLTref_120010000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 191096 191517 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_120010000.2"; gene_id "LTnewLTref_120010000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 191096 191461 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010000.2"; gene_id "LTnewLTref_120010000"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 191512 191517 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010000.2"; gene_id "LTnewLTref_120010000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 192149 194275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010100.1"; gene_id "LTnewLTref_120010100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 192149 194275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010100.1"; gene_id "LTnewLTref_120010100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 195213 197168 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010200.1"; gene_id "LTnewLTref_120010200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 195213 197168 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010200.1"; gene_id "LTnewLTref_120010200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 198718 202170 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010300.1"; gene_id "LTnewLTref_120010300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 198718 202170 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010300.1"; gene_id "LTnewLTref_120010300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 208698 211052 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010400.1"; gene_id "LTnewLTref_120010400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 208698 211052 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010400.1"; gene_id "LTnewLTref_120010400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 223520 225769 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010500.1"; gene_id "LTnewLTref_120010500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 223520 225769 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010500.1"; gene_id "LTnewLTref_120010500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 233888 235717 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010600.1"; gene_id "LTnewLTref_120010600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 233888 235717 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010600.1"; gene_id "LTnewLTref_120010600"; CM024298.1 Liftoff transcript 240944 241210 . - . transcript_id "LTnewLTref_120010700.1"; gene_id "LTnewLTref_120010700" CM024298.1 Liftoff CDS 240944 241210 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010700.1"; gene_id "LTnewLTref_120010700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 241625 242113 0.87 - . transcript_id "LTnewLTref_120010800.1"; gene_id "LTnewLTref_120010800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 241625 242113 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010800.1"; gene_id "LTnewLTref_120010800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 261313 262266 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120010900.1"; gene_id "LTnewLTref_120010900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 261313 262266 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120010900.1"; gene_id "LTnewLTref_120010900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 268038 272459 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120011000.1"; gene_id "LTnewLTref_120011000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 268038 272459 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120011000.1"; gene_id "LTnewLTref_120011000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 283457 284023 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120011100.1"; gene_id "LTnewLTref_120011100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 283457 284023 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120011100.1"; gene_id "LTnewLTref_120011100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 288730 291696 1 - . transcript_id "LTnewLTref_120011200.1"; gene_id "LTnewLTref_120011200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 288730 291696 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_120011200.1"; gene_id "LTnewLTref_120011200"; CM024298.1 Liftoff transcript 295001 295267 . - . transcript_id "LTnewLTref_120011300.1"; gene_id "LTnewLTref_120011300" CM024298.1 Liftoff CDS 295001 295267 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_120011300.1"; gene_id "LTnewLTref_120011300"; CM024298.1 Liftoff transcript 301509 301799 . + . transcript_id "LTnewLTref_120011400.1"; gene_id "LTnewLTref_120011400" CM024298.1 Liftoff CDS 301509 301799 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_120011400.1"; gene_id "LTnewLTref_120011400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 302106 302519 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120011500.1"; gene_id "LTnewLTref_120011500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 302106 302519 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120011500.1"; gene_id "LTnewLTref_120011500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 303069 304886 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120011600.1"; gene_id "LTnewLTref_120011600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 303069 304886 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120011600.1"; gene_id "LTnewLTref_120011600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 305921 306424 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120011700.1"; gene_id "LTnewLTref_120011700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 305921 306424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120011700.1"; gene_id "LTnewLTref_120011700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 308894 311392 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120011800.1"; gene_id "LTnewLTref_120011800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 308894 311392 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120011800.1"; gene_id "LTnewLTref_120011800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 314662 318771 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120011900.1"; gene_id "LTnewLTref_120011900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 314662 318771 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120011900.1"; gene_id "LTnewLTref_120011900"; CM024298.1 . transcript 320091 327052 . + . transcript_id "LTnewLTref_120012000.1"; gene_id "LTnewLTref_120012000:pseudogene" CM024298.1 . exon 320091 327052 . + . transcript_id "LTnewLTref_120012000.1"; gene_id "LTnewLTref_120012000:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 332912 338659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012100.1"; gene_id "LTnewLTref_120012100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 332912 338659 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012100.1"; gene_id "LTnewLTref_120012100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 340364 341920 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012200.1"; gene_id "LTnewLTref_120012200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 340364 341920 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012200.1"; gene_id "LTnewLTref_120012200"; CM024298.1 Liftoff transcript 343149 346382 . + . transcript_id "LTnewLTref_120012300.1"; gene_id "LTnewLTref_120012300" CM024298.1 Liftoff CDS 343149 346382 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012300.1"; gene_id "LTnewLTref_120012300"; CM024298.1 Liftoff transcript 347447 351820 . + . transcript_id "LTnewLTref_120012400.1"; gene_id "LTnewLTref_120012400" CM024298.1 Liftoff CDS 347447 351820 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012400.1"; gene_id "LTnewLTref_120012400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 353083 354576 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012500.1"; gene_id "LTnewLTref_120012500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 353083 354576 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012500.1"; gene_id "LTnewLTref_120012500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 356305 358554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012600.1"; gene_id "LTnewLTref_120012600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 356305 358554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012600.1"; gene_id "LTnewLTref_120012600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 361456 363273 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012700.1"; gene_id "LTnewLTref_120012700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 361456 363273 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012700.1"; gene_id "LTnewLTref_120012700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 365325 368210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012800.1"; gene_id "LTnewLTref_120012800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 365325 368210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012800.1"; gene_id "LTnewLTref_120012800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 370952 371374 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120012900.1"; gene_id "LTnewLTref_120012900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 370952 371374 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120012900.1"; gene_id "LTnewLTref_120012900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 373664 374695 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120013000.1"; gene_id "LTnewLTref_120013000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 373664 374695 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013000.1"; gene_id "LTnewLTref_120013000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 377071 378369 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120013100.1"; gene_id "LTnewLTref_120013100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 377071 378369 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013100.1"; gene_id "LTnewLTref_120013100"; CM024298.1 . transcript 379564 380064 . + . transcript_id "LTnewLTref_120013200.1"; gene_id "LTnewLTref_120013200:pseudogene" CM024298.1 . exon 379564 380064 . + . transcript_id "LTnewLTref_120013200.1"; gene_id "LTnewLTref_120013200:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 381123 383675 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120013300.1"; gene_id "LTnewLTref_120013300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 381123 383675 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013300.1"; gene_id "LTnewLTref_120013300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 385018 385344 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120013400.1"; gene_id "LTnewLTref_120013400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 385018 385344 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013400.1"; gene_id "LTnewLTref_120013400"; CM024298.1 . transcript 387227 387811 . + . transcript_id "LTnewLTref_120013500.1"; gene_id "LTnewLTref_120013500:pseudogene" CM024298.1 . exon 387227 387811 . + . transcript_id "LTnewLTref_120013500.1"; gene_id "LTnewLTref_120013500:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 390422 391107 0.65 + . transcript_id "LTnewLTref_120013600.1"; gene_id "LTnewLTref_120013600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 390422 390896 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013600.1"; gene_id "LTnewLTref_120013600"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 390974 391107 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_120013600.1"; gene_id "LTnewLTref_120013600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 391478 391972 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120013700.1"; gene_id "LTnewLTref_120013700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 391478 391516 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013700.1"; gene_id "LTnewLTref_120013700"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 391592 391972 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013700.1"; gene_id "LTnewLTref_120013700"; CM024298.1 . transcript 398508 399929 . + . transcript_id "LTnewLTref_120013800.1"; gene_id "LTnewLTref_120013800:pseudogene" CM024298.1 . exon 398508 399929 . + . transcript_id "LTnewLTref_120013800.1"; gene_id "LTnewLTref_120013800:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 403272 404451 0.6 + . transcript_id "LTnewLTref_120013900.1"; gene_id "LTnewLTref_120013900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 403272 403451 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013900.1"; gene_id "LTnewLTref_120013900"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 403504 404451 0.71 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120013900.1"; gene_id "LTnewLTref_120013900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 408584 413665 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120014000.1"; gene_id "LTnewLTref_120014000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 408584 413665 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014000.1"; gene_id "LTnewLTref_120014000"; CM024298.1 . transcript 414321 416262 . + . transcript_id "LTnewLTref_120014100.1"; gene_id "LTnewLTref_120014100:pseudogene" CM024298.1 . exon 414321 416262 . + . transcript_id "LTnewLTref_120014100.1"; gene_id "LTnewLTref_120014100:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 419030 422902 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120014200.1"; gene_id "LTnewLTref_120014200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 419030 422902 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014200.1"; gene_id "LTnewLTref_120014200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 426054 426543 0.6 + . transcript_id "LTnewLTref_120014300.1"; gene_id "LTnewLTref_120014300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 426054 426327 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014300.1"; gene_id "LTnewLTref_120014300"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 426425 426543 0.96 + 2 transcript_id "LTnewLTref_120014300.1"; gene_id "LTnewLTref_120014300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 427321 428475 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120014400.1"; gene_id "LTnewLTref_120014400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 427321 428475 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014400.1"; gene_id "LTnewLTref_120014400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 432751 435237 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120014500.1"; gene_id "LTnewLTref_120014500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 432751 435237 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014500.1"; gene_id "LTnewLTref_120014500"; CM024298.1 . transcript 440091 443878 . + . transcript_id "LTnewLTref_120014600.1"; gene_id "LTnewLTref_120014600:pseudogene" CM024298.1 . exon 440091 443878 . + . transcript_id "LTnewLTref_120014600.1"; gene_id "LTnewLTref_120014600:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 445811 448656 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_120014700.1"; gene_id "LTnewLTref_120014700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 445811 446015 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014700.1"; gene_id "LTnewLTref_120014700"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 446078 448656 0.51 + 2 transcript_id "LTnewLTref_120014700.1"; gene_id "LTnewLTref_120014700"; CM024298.1 . transcript 450832 453006 . + . transcript_id "LTnewLTref_120014800.1"; gene_id "LTnewLTref_120014800:pseudogene" CM024298.1 . exon 450832 453006 . + . transcript_id "LTnewLTref_120014800.1"; gene_id "LTnewLTref_120014800:pseudogene"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 453935 456568 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120014900.1"; gene_id "LTnewLTref_120014900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 453935 456568 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120014900.1"; gene_id "LTnewLTref_120014900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 458270 463096 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015000.1"; gene_id "LTnewLTref_120015000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 458270 463096 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015000.1"; gene_id "LTnewLTref_120015000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 464608 466248 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015100.1"; gene_id "LTnewLTref_120015100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 464608 466248 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015100.1"; gene_id "LTnewLTref_120015100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 471690 474719 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015200.1"; gene_id "LTnewLTref_120015200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 471690 474719 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015200.1"; gene_id "LTnewLTref_120015200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 476450 480682 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015300.1"; gene_id "LTnewLTref_120015300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 476450 480682 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015300.1"; gene_id "LTnewLTref_120015300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 483798 484787 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015400.1"; gene_id "LTnewLTref_120015400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 483798 484787 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015400.1"; gene_id "LTnewLTref_120015400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 485287 487914 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015500.1"; gene_id "LTnewLTref_120015500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 485287 487914 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015500.1"; gene_id "LTnewLTref_120015500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 489893 494011 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015600.1"; gene_id "LTnewLTref_120015600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 489893 494011 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015600.1"; gene_id "LTnewLTref_120015600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 495234 496553 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015700.1"; gene_id "LTnewLTref_120015700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 495234 496553 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015700.1"; gene_id "LTnewLTref_120015700"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 499291 500397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015800.1"; gene_id "LTnewLTref_120015800" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 499291 500397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015800.1"; gene_id "LTnewLTref_120015800"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 501887 503806 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120015900.1"; gene_id "LTnewLTref_120015900" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 501887 503806 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120015900.1"; gene_id "LTnewLTref_120015900"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 504842 505483 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016000.1"; gene_id "LTnewLTref_120016000" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 504842 505483 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016000.1"; gene_id "LTnewLTref_120016000"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 505942 507810 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016100.1"; gene_id "LTnewLTref_120016100" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 505942 507810 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016100.1"; gene_id "LTnewLTref_120016100"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 508736 509180 0.71 + . transcript_id "LTnewLTref_120016200.1"; gene_id "LTnewLTref_120016200" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 508736 508761 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016200.1"; gene_id "LTnewLTref_120016200"; CM024298.1 AUGUSTUS CDS 508856 509180 0.83 + 1 transcript_id "LTnewLTref_120016200.1"; gene_id "LTnewLTref_120016200"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 510009 512621 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016300.1"; gene_id "LTnewLTref_120016300" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 510009 512621 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016300.1"; gene_id "LTnewLTref_120016300"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 513296 516211 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016400.1"; gene_id "LTnewLTref_120016400" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 513296 516211 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016400.1"; gene_id "LTnewLTref_120016400"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 517118 518980 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016500.1"; gene_id "LTnewLTref_120016500" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 517118 518980 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016500.1"; gene_id "LTnewLTref_120016500"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 523878 525194 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016600.1"; gene_id "LTnewLTref_120016600" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 523878 525194 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016600.1"; gene_id "LTnewLTref_120016600"; CM024298.1 AUGUSTUS transcript 525847 526809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_120016700.1"; gene_id "LTnewLTref_120016700" CM024298.1 AUGUSTUS CDS 525847 526809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_120016700.1"; gene_id "LTnewLTref_120016700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 2582 4534 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005000.1"; gene_id "LTnewLTref_130005000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 2582 4534 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005000.1"; gene_id "LTnewLTref_130005000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 6109 7284 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005100.1"; gene_id "LTnewLTref_130005100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 6109 7284 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005100.1"; gene_id "LTnewLTref_130005100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 7902 8507 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005200.1"; gene_id "LTnewLTref_130005200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 7902 8507 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005200.1"; gene_id "LTnewLTref_130005200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 9331 10377 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005300.1"; gene_id "LTnewLTref_130005300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 9331 10377 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005300.1"; gene_id "LTnewLTref_130005300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 10941 11831 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005400.1"; gene_id "LTnewLTref_130005400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 10941 11831 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005400.1"; gene_id "LTnewLTref_130005400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 12585 13970 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005500.1"; gene_id "LTnewLTref_130005500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 12585 13970 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005500.1"; gene_id "LTnewLTref_130005500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 14842 15432 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005600.1"; gene_id "LTnewLTref_130005600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 14842 15432 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005600.1"; gene_id "LTnewLTref_130005600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 16218 20510 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005700.1"; gene_id "LTnewLTref_130005700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 16218 20510 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005700.1"; gene_id "LTnewLTref_130005700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 24047 25558 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005800.1"; gene_id "LTnewLTref_130005800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 24047 25558 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005800.1"; gene_id "LTnewLTref_130005800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 29528 30835 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130005900.1"; gene_id "LTnewLTref_130005900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 29528 30835 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130005900.1"; gene_id "LTnewLTref_130005900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 31993 33051 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006000.1"; gene_id "LTnewLTref_130006000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 31993 33051 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006000.1"; gene_id "LTnewLTref_130006000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 34238 34708 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006100.1"; gene_id "LTnewLTref_130006100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 34238 34708 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006100.1"; gene_id "LTnewLTref_130006100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 38756 40936 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006200.1"; gene_id "LTnewLTref_130006200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 38756 40936 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006200.1"; gene_id "LTnewLTref_130006200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 42084 42848 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006300.1"; gene_id "LTnewLTref_130006300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 42084 42848 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006300.1"; gene_id "LTnewLTref_130006300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 43480 44901 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006400.1"; gene_id "LTnewLTref_130006400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 43480 44901 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006400.1"; gene_id "LTnewLTref_130006400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 46874 48382 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006500.1"; gene_id "LTnewLTref_130006500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 46874 48382 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006500.1"; gene_id "LTnewLTref_130006500"; CM024299.1 . transcript 49331 51256 . - . transcript_id "LTnewLTref_130006600.1"; gene_id "LTnewLTref_130006600:pseudogene" CM024299.1 . exon 49331 51256 . - . transcript_id "LTnewLTref_130006600.1"; gene_id "LTnewLTref_130006600:pseudogene"; CM024299.1 . transcript 51681 53064 . - . transcript_id "LTnewLTref_130006700.1"; gene_id "LTnewLTref_130006700:pseudogene" CM024299.1 . exon 51681 53064 . - . transcript_id "LTnewLTref_130006700.1"; gene_id "LTnewLTref_130006700:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 57956 58702 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006800.1"; gene_id "LTnewLTref_130006800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 57956 58702 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006800.1"; gene_id "LTnewLTref_130006800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 62096 64525 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130006900.1"; gene_id "LTnewLTref_130006900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 62096 64525 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130006900.1"; gene_id "LTnewLTref_130006900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 66948 69365 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007000.1"; gene_id "LTnewLTref_130007000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 66948 69365 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007000.1"; gene_id "LTnewLTref_130007000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 70584 71219 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007100.1"; gene_id "LTnewLTref_130007100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 70584 71219 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007100.1"; gene_id "LTnewLTref_130007100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 72902 74161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007200.1"; gene_id "LTnewLTref_130007200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 72902 74161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007200.1"; gene_id "LTnewLTref_130007200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 75865 76788 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007300.1"; gene_id "LTnewLTref_130007300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 75865 76788 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007300.1"; gene_id "LTnewLTref_130007300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 79247 80848 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007400.1"; gene_id "LTnewLTref_130007400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 79247 80848 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007400.1"; gene_id "LTnewLTref_130007400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 81345 82127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007500.1"; gene_id "LTnewLTref_130007500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 81345 82127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007500.1"; gene_id "LTnewLTref_130007500"; CM024299.1 Liftoff transcript 84945 90563 . - . transcript_id "LTnewLTref_130007600.1"; gene_id "LTnewLTref_130007600" CM024299.1 Liftoff CDS 84945 90563 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007600.1"; gene_id "LTnewLTref_130007600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 91384 92739 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007700.1"; gene_id "LTnewLTref_130007700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 91384 92739 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007700.1"; gene_id "LTnewLTref_130007700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 93603 94058 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007800.1"; gene_id "LTnewLTref_130007800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 93603 94058 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007800.1"; gene_id "LTnewLTref_130007800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 93603 94958 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007800.2"; gene_id "LTnewLTref_130007800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 93603 94958 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007800.2"; gene_id "LTnewLTref_130007800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 95818 97173 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130007900.1"; gene_id "LTnewLTref_130007900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 95818 97173 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130007900.1"; gene_id "LTnewLTref_130007900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 98033 99388 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008000.1"; gene_id "LTnewLTref_130008000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 98033 99388 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008000.1"; gene_id "LTnewLTref_130008000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 100250 101605 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008100.1"; gene_id "LTnewLTref_130008100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 100250 101605 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008100.1"; gene_id "LTnewLTref_130008100"; CM024299.1 . transcript 102474 103823 . - . transcript_id "LTnewLTref_130008200.1"; gene_id "LTnewLTref_130008200:pseudogene" CM024299.1 . exon 102474 103823 . - . transcript_id "LTnewLTref_130008200.1"; gene_id "LTnewLTref_130008200:pseudogene"; CM024299.1 Liftoff transcript 104436 110529 . - . transcript_id "LTnewLTref_130008300.1"; gene_id "LTnewLTref_130008300" CM024299.1 Liftoff CDS 104436 110529 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008300.1"; gene_id "LTnewLTref_130008300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 111535 114828 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008400.1"; gene_id "LTnewLTref_130008400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 111535 114828 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008400.1"; gene_id "LTnewLTref_130008400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 115491 117500 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008500.1"; gene_id "LTnewLTref_130008500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 115491 117500 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008500.1"; gene_id "LTnewLTref_130008500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 118519 120306 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008600.1"; gene_id "LTnewLTref_130008600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 118519 120306 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008600.1"; gene_id "LTnewLTref_130008600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 122397 125669 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008700.1"; gene_id "LTnewLTref_130008700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 122397 125669 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008700.1"; gene_id "LTnewLTref_130008700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 126528 126809 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_130008800.1"; gene_id "LTnewLTref_130008800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 126528 126731 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008800.1"; gene_id "LTnewLTref_130008800"; CM024299.1 AUGUSTUS CDS 126777 126809 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008800.1"; gene_id "LTnewLTref_130008800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 127556 127921 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130008900.1"; gene_id "LTnewLTref_130008900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 127556 127921 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130008900.1"; gene_id "LTnewLTref_130008900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 133656 135149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009000.1"; gene_id "LTnewLTref_130009000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 133656 135149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009000.1"; gene_id "LTnewLTref_130009000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 136354 138219 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_130009100.1"; gene_id "LTnewLTref_130009100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 136354 137019 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009100.1"; gene_id "LTnewLTref_130009100"; CM024299.1 AUGUSTUS CDS 137416 138219 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009100.1"; gene_id "LTnewLTref_130009100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 138935 141217 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009200.1"; gene_id "LTnewLTref_130009200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 138935 141217 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009200.1"; gene_id "LTnewLTref_130009200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 142606 144144 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009300.1"; gene_id "LTnewLTref_130009300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 142606 144144 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009300.1"; gene_id "LTnewLTref_130009300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 146103 152606 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009400.1"; gene_id "LTnewLTref_130009400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 146103 152606 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009400.1"; gene_id "LTnewLTref_130009400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 153270 154169 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009500.1"; gene_id "LTnewLTref_130009500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 153270 154169 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009500.1"; gene_id "LTnewLTref_130009500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 155066 155902 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009600.1"; gene_id "LTnewLTref_130009600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 155066 155902 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009600.1"; gene_id "LTnewLTref_130009600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 158505 162212 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009700.1"; gene_id "LTnewLTref_130009700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 158505 162212 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009700.1"; gene_id "LTnewLTref_130009700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 163063 163659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009800.1"; gene_id "LTnewLTref_130009800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 163063 163659 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009800.1"; gene_id "LTnewLTref_130009800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 164526 166529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130009900.1"; gene_id "LTnewLTref_130009900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 164526 166529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130009900.1"; gene_id "LTnewLTref_130009900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 167683 168279 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010000.1"; gene_id "LTnewLTref_130010000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 167683 168279 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010000.1"; gene_id "LTnewLTref_130010000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 169510 169935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010100.1"; gene_id "LTnewLTref_130010100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 169510 169935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010100.1"; gene_id "LTnewLTref_130010100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 172533 178103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010200.1"; gene_id "LTnewLTref_130010200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 172533 178103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010200.1"; gene_id "LTnewLTref_130010200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 179139 180116 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010300.1"; gene_id "LTnewLTref_130010300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 179139 180116 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010300.1"; gene_id "LTnewLTref_130010300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 180831 181796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010400.1"; gene_id "LTnewLTref_130010400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 180831 181796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010400.1"; gene_id "LTnewLTref_130010400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 182816 183640 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010500.1"; gene_id "LTnewLTref_130010500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 182816 183640 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010500.1"; gene_id "LTnewLTref_130010500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 185785 187062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010600.1"; gene_id "LTnewLTref_130010600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 185785 187062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010600.1"; gene_id "LTnewLTref_130010600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 188551 189459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010700.1"; gene_id "LTnewLTref_130010700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 188551 189459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010700.1"; gene_id "LTnewLTref_130010700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 189935 193939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010800.1"; gene_id "LTnewLTref_130010800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 189935 193939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010800.1"; gene_id "LTnewLTref_130010800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 194959 196782 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130010900.1"; gene_id "LTnewLTref_130010900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 194959 196782 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130010900.1"; gene_id "LTnewLTref_130010900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 198706 200820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130011000.1"; gene_id "LTnewLTref_130011000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 198706 200820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130011000.1"; gene_id "LTnewLTref_130011000"; CM024299.1 . transcript 202731 204076 . + . transcript_id "LTnewLTref_130011100.1"; gene_id "LTnewLTref_130011100:pseudogene" CM024299.1 . exon 202731 204076 . + . transcript_id "LTnewLTref_130011100.1"; gene_id "LTnewLTref_130011100:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 204716 206440 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130011200.1"; gene_id "LTnewLTref_130011200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 204716 206440 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130011200.1"; gene_id "LTnewLTref_130011200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 208524 211664 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130011300.1"; gene_id "LTnewLTref_130011300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 208524 211664 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130011300.1"; gene_id "LTnewLTref_130011300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 214610 218884 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130011400.1"; gene_id "LTnewLTref_130011400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 214610 218884 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130011400.1"; gene_id "LTnewLTref_130011400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 220226 221554 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130011500.1"; gene_id "LTnewLTref_130011500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 220226 221554 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130011500.1"; gene_id "LTnewLTref_130011500"; CM024299.1 Liftoff transcript 222570 223607 . - . transcript_id "LTnewLTref_130011600.1"; gene_id "LTnewLTref_130011600" CM024299.1 Liftoff CDS 222570 223607 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130011600.1"; gene_id "LTnewLTref_130011600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 224550 227075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130011700.1"; gene_id "LTnewLTref_130011700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 224550 227075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130011700.1"; gene_id "LTnewLTref_130011700"; CM024299.1 Liftoff transcript 228143 231352 . - . transcript_id "LTnewLTref_130011800.1"; gene_id "LTnewLTref_130011800" CM024299.1 Liftoff CDS 228143 231352 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130011800.1"; gene_id "LTnewLTref_130011800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 232801 233676 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130011900.1"; gene_id "LTnewLTref_130011900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 232801 233676 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130011900.1"; gene_id "LTnewLTref_130011900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 234336 240515 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012000.1"; gene_id "LTnewLTref_130012000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 234336 240515 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012000.1"; gene_id "LTnewLTref_130012000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 241375 243030 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012100.1"; gene_id "LTnewLTref_130012100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 241375 243030 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012100.1"; gene_id "LTnewLTref_130012100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 244414 246240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012200.1"; gene_id "LTnewLTref_130012200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 244414 246240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012200.1"; gene_id "LTnewLTref_130012200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 246975 249059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012300.1"; gene_id "LTnewLTref_130012300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 246975 249059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012300.1"; gene_id "LTnewLTref_130012300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 249800 250471 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012400.1"; gene_id "LTnewLTref_130012400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 249800 250471 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012400.1"; gene_id "LTnewLTref_130012400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 253116 261065 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012500.1"; gene_id "LTnewLTref_130012500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 253116 261065 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012500.1"; gene_id "LTnewLTref_130012500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 263636 264517 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012600.1"; gene_id "LTnewLTref_130012600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 263636 264517 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012600.1"; gene_id "LTnewLTref_130012600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 265396 269106 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012700.1"; gene_id "LTnewLTref_130012700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 265396 269106 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012700.1"; gene_id "LTnewLTref_130012700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 269689 273102 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012800.1"; gene_id "LTnewLTref_130012800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 269689 273102 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012800.1"; gene_id "LTnewLTref_130012800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 275547 277028 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012900.1"; gene_id "LTnewLTref_130012900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 275547 277028 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012900.1"; gene_id "LTnewLTref_130012900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 275547 277730 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130012900.2"; gene_id "LTnewLTref_130012900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 275547 277730 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130012900.2"; gene_id "LTnewLTref_130012900"; CM024299.1 Liftoff transcript 277736 277957 . - . transcript_id "LTnewLTref_130013000.1"; gene_id "LTnewLTref_130013000" CM024299.1 Liftoff CDS 277736 277957 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013000.1"; gene_id "LTnewLTref_130013000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 278188 280873 0.85 - . transcript_id "LTnewLTref_130013100.1"; gene_id "LTnewLTref_130013100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 278188 279834 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013100.1"; gene_id "LTnewLTref_130013100"; CM024299.1 AUGUSTUS CDS 279881 280873 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013100.1"; gene_id "LTnewLTref_130013100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 282155 283198 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013200.1"; gene_id "LTnewLTref_130013200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 282155 283198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013200.1"; gene_id "LTnewLTref_130013200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 284574 286160 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013300.1"; gene_id "LTnewLTref_130013300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 284574 286160 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013300.1"; gene_id "LTnewLTref_130013300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 290191 292269 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013400.1"; gene_id "LTnewLTref_130013400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 290191 292269 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013400.1"; gene_id "LTnewLTref_130013400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 293197 294231 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013500.1"; gene_id "LTnewLTref_130013500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 293197 294231 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013500.1"; gene_id "LTnewLTref_130013500"; CM024299.1 . transcript 294921 296761 . - . transcript_id "LTnewLTref_130013600.1"; gene_id "LTnewLTref_130013600:pseudogene" CM024299.1 . exon 294921 296761 . - . transcript_id "LTnewLTref_130013600.1"; gene_id "LTnewLTref_130013600:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 298332 300800 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013700.1"; gene_id "LTnewLTref_130013700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 298332 300800 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013700.1"; gene_id "LTnewLTref_130013700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 302547 307115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013800.1"; gene_id "LTnewLTref_130013800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 302547 307115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013800.1"; gene_id "LTnewLTref_130013800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 307904 308731 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130013900.1"; gene_id "LTnewLTref_130013900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 307904 308731 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130013900.1"; gene_id "LTnewLTref_130013900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 309504 311657 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014000.1"; gene_id "LTnewLTref_130014000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 309504 311657 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014000.1"; gene_id "LTnewLTref_130014000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 312508 313959 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014100.1"; gene_id "LTnewLTref_130014100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 312508 313959 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014100.1"; gene_id "LTnewLTref_130014100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 314808 316505 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014200.1"; gene_id "LTnewLTref_130014200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 314808 316505 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014200.1"; gene_id "LTnewLTref_130014200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 317823 319763 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014300.1"; gene_id "LTnewLTref_130014300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 317823 319763 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014300.1"; gene_id "LTnewLTref_130014300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 320682 325640 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014400.1"; gene_id "LTnewLTref_130014400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 320682 325640 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014400.1"; gene_id "LTnewLTref_130014400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 326596 328068 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014500.1"; gene_id "LTnewLTref_130014500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 326596 328068 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014500.1"; gene_id "LTnewLTref_130014500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 328896 330284 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014600.1"; gene_id "LTnewLTref_130014600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 328896 330284 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014600.1"; gene_id "LTnewLTref_130014600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 331135 332118 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014700.1"; gene_id "LTnewLTref_130014700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 331135 332118 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014700.1"; gene_id "LTnewLTref_130014700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 333176 337096 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014800.1"; gene_id "LTnewLTref_130014800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 333176 337096 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014800.1"; gene_id "LTnewLTref_130014800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 338044 339144 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130014900.1"; gene_id "LTnewLTref_130014900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 338044 339144 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130014900.1"; gene_id "LTnewLTref_130014900"; CM024299.1 . transcript 339985 345233 . - . transcript_id "LTnewLTref_130015000.1"; gene_id "LTnewLTref_130015000:pseudogene" CM024299.1 . exon 339985 345233 . - . transcript_id "LTnewLTref_130015000.1"; gene_id "LTnewLTref_130015000:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 346080 346460 0.74 - . transcript_id "LTnewLTref_130015100.1"; gene_id "LTnewLTref_130015100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 346080 346460 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015100.1"; gene_id "LTnewLTref_130015100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 346501 347025 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015200.1"; gene_id "LTnewLTref_130015200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 346501 347025 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015200.1"; gene_id "LTnewLTref_130015200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 347780 348499 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015300.1"; gene_id "LTnewLTref_130015300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 347780 348499 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015300.1"; gene_id "LTnewLTref_130015300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 350512 351438 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015400.1"; gene_id "LTnewLTref_130015400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 350512 351438 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015400.1"; gene_id "LTnewLTref_130015400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 355006 362070 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015500.1"; gene_id "LTnewLTref_130015500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 355006 362070 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015500.1"; gene_id "LTnewLTref_130015500"; CM024299.1 Liftoff transcript 362621 367390 . - . transcript_id "LTnewLTref_130015600.1"; gene_id "LTnewLTref_130015600" CM024299.1 Liftoff CDS 362621 367390 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015600.1"; gene_id "LTnewLTref_130015600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 371288 372604 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015700.1"; gene_id "LTnewLTref_130015700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 371288 372604 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015700.1"; gene_id "LTnewLTref_130015700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 374696 377923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015800.1"; gene_id "LTnewLTref_130015800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 374696 377923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015800.1"; gene_id "LTnewLTref_130015800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 379549 381144 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130015900.1"; gene_id "LTnewLTref_130015900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 379549 381144 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130015900.1"; gene_id "LTnewLTref_130015900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 382267 382536 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016000.1"; gene_id "LTnewLTref_130016000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 382267 382536 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016000.1"; gene_id "LTnewLTref_130016000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 383808 385586 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016100.1"; gene_id "LTnewLTref_130016100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 383808 385586 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016100.1"; gene_id "LTnewLTref_130016100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 386704 387915 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016200.1"; gene_id "LTnewLTref_130016200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 386704 387915 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016200.1"; gene_id "LTnewLTref_130016200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 389200 390162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016300.1"; gene_id "LTnewLTref_130016300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 389200 390162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016300.1"; gene_id "LTnewLTref_130016300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 390910 391518 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016400.1"; gene_id "LTnewLTref_130016400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 390910 391518 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016400.1"; gene_id "LTnewLTref_130016400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 392258 393886 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016500.1"; gene_id "LTnewLTref_130016500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 392258 393886 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016500.1"; gene_id "LTnewLTref_130016500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 395349 395705 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016600.1"; gene_id "LTnewLTref_130016600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 395349 395705 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016600.1"; gene_id "LTnewLTref_130016600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 398260 400392 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016700.1"; gene_id "LTnewLTref_130016700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 398260 400392 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016700.1"; gene_id "LTnewLTref_130016700"; CM024299.1 Liftoff transcript 402771 403334 . - . transcript_id "LTnewLTref_130016800.1"; gene_id "LTnewLTref_130016800" CM024299.1 Liftoff CDS 402771 403334 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016800.1"; gene_id "LTnewLTref_130016800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 408173 409678 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130016900.1"; gene_id "LTnewLTref_130016900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 408173 409678 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130016900.1"; gene_id "LTnewLTref_130016900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 411200 412021 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017000.1"; gene_id "LTnewLTref_130017000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 411200 412021 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017000.1"; gene_id "LTnewLTref_130017000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 413848 414669 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017100.1"; gene_id "LTnewLTref_130017100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 413848 414669 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017100.1"; gene_id "LTnewLTref_130017100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 416450 418075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017200.1"; gene_id "LTnewLTref_130017200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 416450 418075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017200.1"; gene_id "LTnewLTref_130017200"; CM024299.1 Aragorn_1.2.36 transcript 417374 417451 . + . transcript_id "LTnewLTref_130017300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_130017300" CM024299.1 Aragorn_1.2.36 exon 417374 417451 . + . transcript_id "LTnewLTref_130017300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_130017300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 419106 419558 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017400.1"; gene_id "LTnewLTref_130017400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 419106 419558 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017400.1"; gene_id "LTnewLTref_130017400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 421906 422484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017500.1"; gene_id "LTnewLTref_130017500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 421906 422484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017500.1"; gene_id "LTnewLTref_130017500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 425265 425708 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017600.1"; gene_id "LTnewLTref_130017600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 425265 425708 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017600.1"; gene_id "LTnewLTref_130017600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 427429 429870 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_130017700.1"; gene_id "LTnewLTref_130017700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 427429 429870 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017700.1"; gene_id "LTnewLTref_130017700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 432702 433685 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130017800.1"; gene_id "LTnewLTref_130017800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 432702 433685 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017800.1"; gene_id "LTnewLTref_130017800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 435096 438185 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_130017900.1"; gene_id "LTnewLTref_130017900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 435096 438185 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130017900.1"; gene_id "LTnewLTref_130017900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 439540 440130 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018000.1"; gene_id "LTnewLTref_130018000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 439540 440130 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018000.1"; gene_id "LTnewLTref_130018000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 443363 444625 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018100.1"; gene_id "LTnewLTref_130018100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 443363 444625 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018100.1"; gene_id "LTnewLTref_130018100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 448122 449519 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018200.1"; gene_id "LTnewLTref_130018200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 448122 449519 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018200.1"; gene_id "LTnewLTref_130018200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 451477 452949 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018300.1"; gene_id "LTnewLTref_130018300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 451477 452949 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018300.1"; gene_id "LTnewLTref_130018300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 454093 458262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018400.1"; gene_id "LTnewLTref_130018400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 454093 458262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018400.1"; gene_id "LTnewLTref_130018400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 459846 463280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018500.1"; gene_id "LTnewLTref_130018500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 459846 463280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018500.1"; gene_id "LTnewLTref_130018500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 464856 467369 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018600.1"; gene_id "LTnewLTref_130018600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 464856 467369 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018600.1"; gene_id "LTnewLTref_130018600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 469624 471717 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018700.1"; gene_id "LTnewLTref_130018700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 469624 471717 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018700.1"; gene_id "LTnewLTref_130018700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 472729 474498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018800.1"; gene_id "LTnewLTref_130018800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 472729 474498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018800.1"; gene_id "LTnewLTref_130018800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 475698 476912 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130018900.1"; gene_id "LTnewLTref_130018900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 475698 476912 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130018900.1"; gene_id "LTnewLTref_130018900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 477399 479744 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130019000.1"; gene_id "LTnewLTref_130019000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 477399 479744 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019000.1"; gene_id "LTnewLTref_130019000"; CM024299.1 . transcript 483641 487750 . - . transcript_id "LTnewLTref_130019100.1"; gene_id "LTnewLTref_130019100:pseudogene" CM024299.1 . exon 483641 484819 . - . transcript_id "LTnewLTref_130019100.1"; gene_id "LTnewLTref_130019100:pseudogene"; CM024299.1 . exon 484821 486701 . - . transcript_id "LTnewLTref_130019100.1"; gene_id "LTnewLTref_130019100:pseudogene"; CM024299.1 . exon 486704 487750 . - . transcript_id "LTnewLTref_130019100.1"; gene_id "LTnewLTref_130019100:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 491387 491686 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_130019200.1"; gene_id "LTnewLTref_130019200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 491387 491686 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019200.1"; gene_id "LTnewLTref_130019200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 492823 493563 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130019300.1"; gene_id "LTnewLTref_130019300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 492823 493563 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019300.1"; gene_id "LTnewLTref_130019300"; CM024299.1 . transcript 495124 495582 . - . transcript_id "LTnewLTref_130019400.1"; gene_id "LTnewLTref_130019400:pseudogene" CM024299.1 . exon 495124 495582 . - . transcript_id "LTnewLTref_130019400.1"; gene_id "LTnewLTref_130019400:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 496691 498568 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130019500.1"; gene_id "LTnewLTref_130019500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 496691 498568 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019500.1"; gene_id "LTnewLTref_130019500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 499131 503897 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130019600.1"; gene_id "LTnewLTref_130019600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 499131 503897 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019600.1"; gene_id "LTnewLTref_130019600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 504808 505442 0.61 - . transcript_id "LTnewLTref_130019700.1"; gene_id "LTnewLTref_130019700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 504808 505291 0.91 - 1 transcript_id "LTnewLTref_130019700.1"; gene_id "LTnewLTref_130019700"; CM024299.1 AUGUSTUS CDS 505378 505442 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019700.1"; gene_id "LTnewLTref_130019700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 506740 507444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130019800.1"; gene_id "LTnewLTref_130019800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 506740 507444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019800.1"; gene_id "LTnewLTref_130019800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 508399 525315 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_130019900.1"; gene_id "LTnewLTref_130019900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 508399 518780 0.41 - 2 transcript_id "LTnewLTref_130019900.1"; gene_id "LTnewLTref_130019900"; CM024299.1 AUGUSTUS CDS 518838 525315 0.4 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130019900.1"; gene_id "LTnewLTref_130019900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 528752 529228 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020000.1"; gene_id "LTnewLTref_130020000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 528752 529228 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020000.1"; gene_id "LTnewLTref_130020000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 530071 532386 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020100.1"; gene_id "LTnewLTref_130020100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 530071 532386 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020100.1"; gene_id "LTnewLTref_130020100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 533814 536987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020200.1"; gene_id "LTnewLTref_130020200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 533814 536987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020200.1"; gene_id "LTnewLTref_130020200"; CM024299.1 Liftoff transcript 540398 540589 . - . transcript_id "LTnewLTref_130020300.1"; gene_id "LTnewLTref_130020300" CM024299.1 Liftoff CDS 540398 540589 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020300.1"; gene_id "LTnewLTref_130020300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 542664 544748 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020400.1"; gene_id "LTnewLTref_130020400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 542664 544748 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020400.1"; gene_id "LTnewLTref_130020400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 546368 546769 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020500.1"; gene_id "LTnewLTref_130020500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 546368 546769 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020500.1"; gene_id "LTnewLTref_130020500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 547866 550703 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020600.1"; gene_id "LTnewLTref_130020600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 547866 550703 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020600.1"; gene_id "LTnewLTref_130020600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 553775 557068 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020700.1"; gene_id "LTnewLTref_130020700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 553775 557068 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020700.1"; gene_id "LTnewLTref_130020700"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 558976 560439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020800.1"; gene_id "LTnewLTref_130020800" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 558976 560439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020800.1"; gene_id "LTnewLTref_130020800"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 562335 565880 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130020900.1"; gene_id "LTnewLTref_130020900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 562335 565880 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130020900.1"; gene_id "LTnewLTref_130020900"; CM024299.1 Liftoff transcript 567029 568090 . - . transcript_id "LTnewLTref_130021000.1"; gene_id "LTnewLTref_130021000" CM024299.1 Liftoff CDS 567029 568090 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021000.1"; gene_id "LTnewLTref_130021000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 569562 571325 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021100.1"; gene_id "LTnewLTref_130021100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 569562 571325 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021100.1"; gene_id "LTnewLTref_130021100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 579664 580080 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021200.1"; gene_id "LTnewLTref_130021200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 579664 580080 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021200.1"; gene_id "LTnewLTref_130021200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 582711 584963 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021300.1"; gene_id "LTnewLTref_130021300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 582711 584963 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021300.1"; gene_id "LTnewLTref_130021300"; CM024299.1 Liftoff transcript 586414 590316 . - . transcript_id "LTnewLTref_130021400.1"; gene_id "LTnewLTref_130021400" CM024299.1 Liftoff CDS 586414 590316 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021400.1"; gene_id "LTnewLTref_130021400"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 593657 595843 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021500.1"; gene_id "LTnewLTref_130021500" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 593657 595843 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021500.1"; gene_id "LTnewLTref_130021500"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 597753 599462 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021600.1"; gene_id "LTnewLTref_130021600" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 597753 599462 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021600.1"; gene_id "LTnewLTref_130021600"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 601594 606540 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021700.1"; gene_id "LTnewLTref_130021700" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 601594 606540 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021700.1"; gene_id "LTnewLTref_130021700"; CM024299.1 . transcript 607763 609502 . - . transcript_id "LTnewLTref_130021800.1"; gene_id "LTnewLTref_130021800:pseudogene" CM024299.1 . exon 607763 609502 . - . transcript_id "LTnewLTref_130021800.1"; gene_id "LTnewLTref_130021800:pseudogene"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 611194 625191 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130021900.1"; gene_id "LTnewLTref_130021900" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 611194 625191 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130021900.1"; gene_id "LTnewLTref_130021900"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 626292 627908 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130022000.1"; gene_id "LTnewLTref_130022000" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 626292 627908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130022000.1"; gene_id "LTnewLTref_130022000"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 628401 628721 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130022100.1"; gene_id "LTnewLTref_130022100" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 628401 628721 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130022100.1"; gene_id "LTnewLTref_130022100"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 629449 630267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_130022200.1"; gene_id "LTnewLTref_130022200" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 629449 630267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_130022200.1"; gene_id "LTnewLTref_130022200"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 632119 633942 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130022300.1"; gene_id "LTnewLTref_130022300" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 632119 633942 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130022300.1"; gene_id "LTnewLTref_130022300"; CM024299.1 AUGUSTUS transcript 635618 636991 1 + . transcript_id "LTnewLTref_130022400.1"; gene_id "LTnewLTref_130022400" CM024299.1 AUGUSTUS CDS 635618 636991 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_130022400.1"; gene_id "LTnewLTref_130022400"; CM024299.1 . transcript 640159 640465 . + . transcript_id "LTnewLTref_130022500.1"; gene_id "LTnewLTref_130022500:pseudogene" CM024299.1 . exon 640159 640465 . + . transcript_id "LTnewLTref_130022500.1"; gene_id "LTnewLTref_130022500:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 684 1504 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_140005000.1"; gene_id "LTnewLTref_140005000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 684 1321 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005000.1"; gene_id "LTnewLTref_140005000"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 1369 1504 0.64 + 1 transcript_id "LTnewLTref_140005000.1"; gene_id "LTnewLTref_140005000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 4866 5789 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005100.1"; gene_id "LTnewLTref_140005100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 4866 5789 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005100.1"; gene_id "LTnewLTref_140005100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 6250 9393 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005200.1"; gene_id "LTnewLTref_140005200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 6250 9393 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005200.1"; gene_id "LTnewLTref_140005200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 9900 10712 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005300.1"; gene_id "LTnewLTref_140005300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 9900 10712 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005300.1"; gene_id "LTnewLTref_140005300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 11359 14655 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005400.1"; gene_id "LTnewLTref_140005400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 11359 14655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005400.1"; gene_id "LTnewLTref_140005400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 15923 18124 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005500.1"; gene_id "LTnewLTref_140005500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 15923 18124 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005500.1"; gene_id "LTnewLTref_140005500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 18674 19249 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005600.1"; gene_id "LTnewLTref_140005600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 18674 19249 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005600.1"; gene_id "LTnewLTref_140005600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 19918 20757 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005700.1"; gene_id "LTnewLTref_140005700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 19918 20757 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005700.1"; gene_id "LTnewLTref_140005700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 21764 22627 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005800.1"; gene_id "LTnewLTref_140005800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 21764 22627 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005800.1"; gene_id "LTnewLTref_140005800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 23244 24398 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140005900.1"; gene_id "LTnewLTref_140005900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 23244 24398 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140005900.1"; gene_id "LTnewLTref_140005900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 25571 28669 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006000.1"; gene_id "LTnewLTref_140006000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 25571 28669 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006000.1"; gene_id "LTnewLTref_140006000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 29632 31203 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006100.1"; gene_id "LTnewLTref_140006100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 29632 31203 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006100.1"; gene_id "LTnewLTref_140006100"; CM024300.1 Liftoff transcript 31980 33065 . + . transcript_id "LTnewLTref_140006200.1"; gene_id "LTnewLTref_140006200" CM024300.1 Liftoff CDS 31980 33065 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006200.1"; gene_id "LTnewLTref_140006200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 33946 35004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006300.1"; gene_id "LTnewLTref_140006300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 33946 35004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006300.1"; gene_id "LTnewLTref_140006300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 37080 38657 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006400.1"; gene_id "LTnewLTref_140006400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 37080 38657 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006400.1"; gene_id "LTnewLTref_140006400"; CM024300.1 . transcript 39597 40205 . + . transcript_id "LTnewLTref_140006500.1"; gene_id "LTnewLTref_140006500:pseudogene" CM024300.1 . exon 39597 40205 . + . transcript_id "LTnewLTref_140006500.1"; gene_id "LTnewLTref_140006500:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 41004 42086 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006600.1"; gene_id "LTnewLTref_140006600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 41004 42086 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006600.1"; gene_id "LTnewLTref_140006600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 45567 47624 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006700.1"; gene_id "LTnewLTref_140006700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 45567 47624 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006700.1"; gene_id "LTnewLTref_140006700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 48704 50218 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006800.1"; gene_id "LTnewLTref_140006800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 48704 50218 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006800.1"; gene_id "LTnewLTref_140006800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 51392 51991 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140006900.1"; gene_id "LTnewLTref_140006900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 51392 51991 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140006900.1"; gene_id "LTnewLTref_140006900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 53571 54092 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007000.1"; gene_id "LTnewLTref_140007000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 53571 54092 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007000.1"; gene_id "LTnewLTref_140007000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 55887 57218 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007100.1"; gene_id "LTnewLTref_140007100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 55887 57218 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007100.1"; gene_id "LTnewLTref_140007100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 58715 60430 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007200.1"; gene_id "LTnewLTref_140007200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 58715 60430 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007200.1"; gene_id "LTnewLTref_140007200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 62561 63009 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_140007300.1"; gene_id "LTnewLTref_140007300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 62561 62622 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007300.1"; gene_id "LTnewLTref_140007300"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 62679 63009 0.94 + 1 transcript_id "LTnewLTref_140007300.1"; gene_id "LTnewLTref_140007300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 64708 70230 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007400.1"; gene_id "LTnewLTref_140007400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 64708 70230 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007400.1"; gene_id "LTnewLTref_140007400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 71192 71620 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007500.1"; gene_id "LTnewLTref_140007500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 71192 71620 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007500.1"; gene_id "LTnewLTref_140007500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 72276 72794 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007600.1"; gene_id "LTnewLTref_140007600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 72276 72794 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007600.1"; gene_id "LTnewLTref_140007600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 75069 77237 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007700.1"; gene_id "LTnewLTref_140007700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 75069 77237 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007700.1"; gene_id "LTnewLTref_140007700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 78373 79821 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140007800.1"; gene_id "LTnewLTref_140007800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 78373 79821 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007800.1"; gene_id "LTnewLTref_140007800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 80863 83759 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_140007900.1"; gene_id "LTnewLTref_140007900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 80863 83544 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007900.1"; gene_id "LTnewLTref_140007900"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 83685 83759 0.46 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140007900.1"; gene_id "LTnewLTref_140007900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 84744 85775 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008000.1"; gene_id "LTnewLTref_140008000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 84744 85775 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008000.1"; gene_id "LTnewLTref_140008000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 86397 87323 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_140008100.1"; gene_id "LTnewLTref_140008100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 86397 87323 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008100.1"; gene_id "LTnewLTref_140008100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 88087 88944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008200.1"; gene_id "LTnewLTref_140008200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 88087 88944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008200.1"; gene_id "LTnewLTref_140008200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 91925 94336 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008300.1"; gene_id "LTnewLTref_140008300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 91925 94336 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008300.1"; gene_id "LTnewLTref_140008300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 95846 97981 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008400.1"; gene_id "LTnewLTref_140008400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 95846 97981 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008400.1"; gene_id "LTnewLTref_140008400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 102555 105836 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008500.1"; gene_id "LTnewLTref_140008500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 102555 105836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008500.1"; gene_id "LTnewLTref_140008500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 108504 110534 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008600.1"; gene_id "LTnewLTref_140008600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 108504 110534 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008600.1"; gene_id "LTnewLTref_140008600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 112498 115635 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008700.1"; gene_id "LTnewLTref_140008700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 112498 115635 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008700.1"; gene_id "LTnewLTref_140008700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 116981 121758 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_140008800.1"; gene_id "LTnewLTref_140008800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 116981 121666 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008800.1"; gene_id "LTnewLTref_140008800"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 121753 121758 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008800.1"; gene_id "LTnewLTref_140008800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 116981 126969 0.19 + . transcript_id "LTnewLTref_140008800.2"; gene_id "LTnewLTref_140008800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 116981 125837 0.28 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008800.2"; gene_id "LTnewLTref_140008800"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 125927 126969 0.23 + 2 transcript_id "LTnewLTref_140008800.2"; gene_id "LTnewLTref_140008800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 128375 130198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140008900.1"; gene_id "LTnewLTref_140008900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 128375 130198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140008900.1"; gene_id "LTnewLTref_140008900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 132847 133779 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009000.1"; gene_id "LTnewLTref_140009000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 132847 133779 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009000.1"; gene_id "LTnewLTref_140009000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 136514 137446 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009100.1"; gene_id "LTnewLTref_140009100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 136514 137446 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009100.1"; gene_id "LTnewLTref_140009100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 140291 140875 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009200.1"; gene_id "LTnewLTref_140009200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 140291 140875 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009200.1"; gene_id "LTnewLTref_140009200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 141499 144708 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009300.1"; gene_id "LTnewLTref_140009300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 141499 144708 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009300.1"; gene_id "LTnewLTref_140009300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 145879 148338 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009400.1"; gene_id "LTnewLTref_140009400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 145879 148338 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009400.1"; gene_id "LTnewLTref_140009400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 149542 150744 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009500.1"; gene_id "LTnewLTref_140009500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 149542 150744 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009500.1"; gene_id "LTnewLTref_140009500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 151480 153132 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009600.1"; gene_id "LTnewLTref_140009600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 151480 153132 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009600.1"; gene_id "LTnewLTref_140009600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 154008 154529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009700.1"; gene_id "LTnewLTref_140009700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 154008 154529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009700.1"; gene_id "LTnewLTref_140009700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 155762 156730 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009800.1"; gene_id "LTnewLTref_140009800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 155762 156730 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009800.1"; gene_id "LTnewLTref_140009800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 157464 159023 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140009900.1"; gene_id "LTnewLTref_140009900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 157464 159023 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140009900.1"; gene_id "LTnewLTref_140009900"; CM024300.1 . transcript 161516 162748 . + . transcript_id "LTnewLTref_140010000.1"; gene_id "LTnewLTref_140010000:pseudogene" CM024300.1 . exon 161516 162748 . + . transcript_id "LTnewLTref_140010000.1"; gene_id "LTnewLTref_140010000:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 172350 173174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010100.1"; gene_id "LTnewLTref_140010100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 172350 173174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010100.1"; gene_id "LTnewLTref_140010100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 177885 178712 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010200.1"; gene_id "LTnewLTref_140010200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 177885 178712 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010200.1"; gene_id "LTnewLTref_140010200"; CM024300.1 Liftoff transcript 181342 181530 . - . transcript_id "LTnewLTref_140010300.1"; gene_id "LTnewLTref_140010300" CM024300.1 Liftoff CDS 181342 181530 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010300.1"; gene_id "LTnewLTref_140010300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 181840 182064 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010400.1"; gene_id "LTnewLTref_140010400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 181840 182064 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010400.1"; gene_id "LTnewLTref_140010400"; CM024300.1 Liftoff transcript 183430 185232 . - . transcript_id "LTnewLTref_140010500.1"; gene_id "LTnewLTref_140010500" CM024300.1 Liftoff CDS 183430 185232 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010500.1"; gene_id "LTnewLTref_140010500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 189461 190864 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010600.1"; gene_id "LTnewLTref_140010600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 189461 190864 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010600.1"; gene_id "LTnewLTref_140010600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 192734 193063 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010700.1"; gene_id "LTnewLTref_140010700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 192734 193063 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010700.1"; gene_id "LTnewLTref_140010700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 193808 195322 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010800.1"; gene_id "LTnewLTref_140010800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 193808 195322 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010800.1"; gene_id "LTnewLTref_140010800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 196749 198410 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140010900.1"; gene_id "LTnewLTref_140010900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 196749 198410 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140010900.1"; gene_id "LTnewLTref_140010900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 201175 202266 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011000.1"; gene_id "LTnewLTref_140011000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 201175 202266 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011000.1"; gene_id "LTnewLTref_140011000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 206768 208234 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011100.1"; gene_id "LTnewLTref_140011100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 206768 208234 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011100.1"; gene_id "LTnewLTref_140011100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 209209 209991 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011200.1"; gene_id "LTnewLTref_140011200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 209209 209991 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011200.1"; gene_id "LTnewLTref_140011200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 211184 214708 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011300.1"; gene_id "LTnewLTref_140011300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 211184 214708 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011300.1"; gene_id "LTnewLTref_140011300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 215974 216354 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011400.1"; gene_id "LTnewLTref_140011400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 215974 216354 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011400.1"; gene_id "LTnewLTref_140011400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 216941 221092 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011500.1"; gene_id "LTnewLTref_140011500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 216941 221092 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011500.1"; gene_id "LTnewLTref_140011500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 216941 221635 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_140011500.2"; gene_id "LTnewLTref_140011500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 216941 221635 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011500.2"; gene_id "LTnewLTref_140011500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 222609 224138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011600.1"; gene_id "LTnewLTref_140011600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 222609 224138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011600.1"; gene_id "LTnewLTref_140011600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 224781 226169 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011700.1"; gene_id "LTnewLTref_140011700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 224781 226169 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011700.1"; gene_id "LTnewLTref_140011700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 226902 227222 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011800.1"; gene_id "LTnewLTref_140011800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 226902 227222 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011800.1"; gene_id "LTnewLTref_140011800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 226902 227756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011800.2"; gene_id "LTnewLTref_140011800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 226902 227756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011800.2"; gene_id "LTnewLTref_140011800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 226902 228296 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011800.3"; gene_id "LTnewLTref_140011800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 226902 228296 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011800.3"; gene_id "LTnewLTref_140011800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 229538 230218 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140011900.1"; gene_id "LTnewLTref_140011900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 229538 230218 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140011900.1"; gene_id "LTnewLTref_140011900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 233781 234698 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012000.1"; gene_id "LTnewLTref_140012000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 233781 234698 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012000.1"; gene_id "LTnewLTref_140012000"; CM024300.1 . transcript 236862 237707 . - . transcript_id "LTnewLTref_140012100.1"; gene_id "LTnewLTref_140012100:pseudogene" CM024300.1 . exon 236862 237707 . - . transcript_id "LTnewLTref_140012100.1"; gene_id "LTnewLTref_140012100:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 240868 241725 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012200.1"; gene_id "LTnewLTref_140012200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 240868 241725 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012200.1"; gene_id "LTnewLTref_140012200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 243332 244186 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012300.1"; gene_id "LTnewLTref_140012300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 243332 244186 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012300.1"; gene_id "LTnewLTref_140012300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 249310 250194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012400.1"; gene_id "LTnewLTref_140012400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 249310 250194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012400.1"; gene_id "LTnewLTref_140012400"; CM024300.1 . transcript 254527 255303 . - . transcript_id "LTnewLTref_140012500.1"; gene_id "LTnewLTref_140012500:pseudogene" CM024300.1 . exon 254527 255303 . - . transcript_id "LTnewLTref_140012500.1"; gene_id "LTnewLTref_140012500:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 259268 260168 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_140012600.1"; gene_id "LTnewLTref_140012600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 259268 259940 0.97 - 1 transcript_id "LTnewLTref_140012600.1"; gene_id "LTnewLTref_140012600"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 259999 260168 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012600.1"; gene_id "LTnewLTref_140012600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 262149 263048 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012700.1"; gene_id "LTnewLTref_140012700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 262149 263048 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012700.1"; gene_id "LTnewLTref_140012700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 264546 265553 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012800.1"; gene_id "LTnewLTref_140012800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 264546 265553 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012800.1"; gene_id "LTnewLTref_140012800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 270021 271001 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140012900.1"; gene_id "LTnewLTref_140012900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 270021 271001 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140012900.1"; gene_id "LTnewLTref_140012900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 276680 277651 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013000.1"; gene_id "LTnewLTref_140013000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 276680 277651 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013000.1"; gene_id "LTnewLTref_140013000"; CM024300.1 Liftoff transcript 282162 283311 . - . transcript_id "LTnewLTref_140013100.1"; gene_id "LTnewLTref_140013100" CM024300.1 Liftoff CDS 282162 282301 . - 2 transcript_id "LTnewLTref_140013100.1"; gene_id "LTnewLTref_140013100"; CM024300.1 Liftoff CDS 282486 283311 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013100.1"; gene_id "LTnewLTref_140013100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 285591 286715 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013200.1"; gene_id "LTnewLTref_140013200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 285591 286715 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013200.1"; gene_id "LTnewLTref_140013200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 289621 290824 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_140013300.1"; gene_id "LTnewLTref_140013300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 289621 289996 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_140013300.1"; gene_id "LTnewLTref_140013300"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 290043 290824 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013300.1"; gene_id "LTnewLTref_140013300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 297234 298145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013400.1"; gene_id "LTnewLTref_140013400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 297234 298145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013400.1"; gene_id "LTnewLTref_140013400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 299860 305727 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013500.1"; gene_id "LTnewLTref_140013500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 299860 305727 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013500.1"; gene_id "LTnewLTref_140013500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 306605 307771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013600.1"; gene_id "LTnewLTref_140013600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 306605 307771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013600.1"; gene_id "LTnewLTref_140013600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 310477 311763 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013700.1"; gene_id "LTnewLTref_140013700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 310477 311763 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013700.1"; gene_id "LTnewLTref_140013700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 312649 313209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013800.1"; gene_id "LTnewLTref_140013800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 312649 313209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013800.1"; gene_id "LTnewLTref_140013800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 313861 326508 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140013900.1"; gene_id "LTnewLTref_140013900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 313861 326508 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140013900.1"; gene_id "LTnewLTref_140013900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 329211 330500 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014000.1"; gene_id "LTnewLTref_140014000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 329211 330500 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014000.1"; gene_id "LTnewLTref_140014000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 332867 336790 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014100.1"; gene_id "LTnewLTref_140014100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 332867 336790 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014100.1"; gene_id "LTnewLTref_140014100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 338017 339750 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014200.1"; gene_id "LTnewLTref_140014200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 338017 339750 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014200.1"; gene_id "LTnewLTref_140014200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 341073 344051 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014300.1"; gene_id "LTnewLTref_140014300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 341073 344051 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014300.1"; gene_id "LTnewLTref_140014300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 346142 349927 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014400.1"; gene_id "LTnewLTref_140014400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 346142 349927 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014400.1"; gene_id "LTnewLTref_140014400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 352889 353236 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014500.1"; gene_id "LTnewLTref_140014500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 352889 353236 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014500.1"; gene_id "LTnewLTref_140014500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 355566 355913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014600.1"; gene_id "LTnewLTref_140014600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 355566 355913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014600.1"; gene_id "LTnewLTref_140014600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 356416 356616 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014700.1"; gene_id "LTnewLTref_140014700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 356416 356616 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014700.1"; gene_id "LTnewLTref_140014700"; CM024300.1 . transcript 357654 360753 . - . transcript_id "LTnewLTref_140014800.1"; gene_id "LTnewLTref_140014800:pseudogene" CM024300.1 . exon 357654 360753 . - . transcript_id "LTnewLTref_140014800.1"; gene_id "LTnewLTref_140014800:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 361561 364764 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140014900.1"; gene_id "LTnewLTref_140014900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 361561 364764 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140014900.1"; gene_id "LTnewLTref_140014900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 365818 367791 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015000.1"; gene_id "LTnewLTref_140015000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 365818 367791 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015000.1"; gene_id "LTnewLTref_140015000"; CM024300.1 . transcript 368677 369091 . - . transcript_id "LTnewLTref_140015100.1"; gene_id "LTnewLTref_140015100:pseudogene" CM024300.1 . exon 368677 369091 . - . transcript_id "LTnewLTref_140015100.1"; gene_id "LTnewLTref_140015100:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 371227 374139 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015200.1"; gene_id "LTnewLTref_140015200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 371227 374139 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015200.1"; gene_id "LTnewLTref_140015200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 377025 377249 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015300.1"; gene_id "LTnewLTref_140015300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 377025 377249 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015300.1"; gene_id "LTnewLTref_140015300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 381287 383107 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015400.1"; gene_id "LTnewLTref_140015400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 381287 383107 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015400.1"; gene_id "LTnewLTref_140015400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 384012 389321 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015500.1"; gene_id "LTnewLTref_140015500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 384012 389321 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015500.1"; gene_id "LTnewLTref_140015500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 391716 394301 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015600.1"; gene_id "LTnewLTref_140015600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 391716 394301 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015600.1"; gene_id "LTnewLTref_140015600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 396933 400301 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_140015700.1"; gene_id "LTnewLTref_140015700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 396933 400301 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015700.1"; gene_id "LTnewLTref_140015700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 402020 402526 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015800.1"; gene_id "LTnewLTref_140015800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 402020 402526 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015800.1"; gene_id "LTnewLTref_140015800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 403796 407140 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140015900.1"; gene_id "LTnewLTref_140015900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 403796 407140 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140015900.1"; gene_id "LTnewLTref_140015900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 409330 410193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016000.1"; gene_id "LTnewLTref_140016000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 409330 410193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016000.1"; gene_id "LTnewLTref_140016000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 415370 418015 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_140016100.1"; gene_id "LTnewLTref_140016100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 415370 418015 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016100.1"; gene_id "LTnewLTref_140016100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 415669 418015 0.92 - . transcript_id "LTnewLTref_140016100.2"; gene_id "LTnewLTref_140016100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 415669 415677 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016100.2"; gene_id "LTnewLTref_140016100"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 415730 418015 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016100.2"; gene_id "LTnewLTref_140016100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 419237 420367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016200.1"; gene_id "LTnewLTref_140016200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 419237 420367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016200.1"; gene_id "LTnewLTref_140016200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 421786 422070 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016300.1"; gene_id "LTnewLTref_140016300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 421786 422070 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016300.1"; gene_id "LTnewLTref_140016300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 422484 423794 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016400.1"; gene_id "LTnewLTref_140016400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 422484 423794 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016400.1"; gene_id "LTnewLTref_140016400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 424210 427353 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016500.1"; gene_id "LTnewLTref_140016500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 424210 427353 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016500.1"; gene_id "LTnewLTref_140016500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 428706 429650 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016600.1"; gene_id "LTnewLTref_140016600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 428706 429650 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016600.1"; gene_id "LTnewLTref_140016600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 430338 431855 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016700.1"; gene_id "LTnewLTref_140016700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 430338 431855 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016700.1"; gene_id "LTnewLTref_140016700"; CM024300.1 . transcript 434718 435263 . - . transcript_id "LTnewLTref_140016800.1"; gene_id "LTnewLTref_140016800:pseudogene" CM024300.1 . exon 434718 435263 . - . transcript_id "LTnewLTref_140016800.1"; gene_id "LTnewLTref_140016800:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 435907 436530 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140016900.1"; gene_id "LTnewLTref_140016900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 435907 436530 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140016900.1"; gene_id "LTnewLTref_140016900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 438668 439480 1 - . transcript_id "LTnewLTref_140017000.1"; gene_id "LTnewLTref_140017000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 438668 439480 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_140017000.1"; gene_id "LTnewLTref_140017000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 441686 454492 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140017100.1"; gene_id "LTnewLTref_140017100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 441686 454492 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140017100.1"; gene_id "LTnewLTref_140017100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 457341 460457 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140017200.1"; gene_id "LTnewLTref_140017200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 457341 460457 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140017200.1"; gene_id "LTnewLTref_140017200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 462730 463926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140017300.1"; gene_id "LTnewLTref_140017300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 462730 463926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140017300.1"; gene_id "LTnewLTref_140017300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 464812 465504 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140017400.1"; gene_id "LTnewLTref_140017400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 464812 465504 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140017400.1"; gene_id "LTnewLTref_140017400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 466514 466894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140017500.1"; gene_id "LTnewLTref_140017500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 466514 466894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140017500.1"; gene_id "LTnewLTref_140017500"; CM024300.1 . transcript 466989 468550 . + . transcript_id "LTnewLTref_140017600.1"; gene_id "LTnewLTref_140017600:pseudogene" CM024300.1 . exon 466989 468550 . + . transcript_id "LTnewLTref_140017600.1"; gene_id "LTnewLTref_140017600:pseudogene"; CM024300.1 . transcript 468689 470802 . + . transcript_id "LTnewLTref_140017700.1"; gene_id "LTnewLTref_140017700:pseudogene" CM024300.1 . exon 468689 470802 . + . transcript_id "LTnewLTref_140017700.1"; gene_id "LTnewLTref_140017700:pseudogene"; CM024300.1 . transcript 470879 471661 . + . transcript_id "LTnewLTref_140017800.1"; gene_id "LTnewLTref_140017800:pseudogene" CM024300.1 . exon 470879 471661 . + . transcript_id "LTnewLTref_140017800.1"; gene_id "LTnewLTref_140017800:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 472508 476059 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140017900.1"; gene_id "LTnewLTref_140017900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 472508 476059 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140017900.1"; gene_id "LTnewLTref_140017900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 476127 477228 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_140018000.1"; gene_id "LTnewLTref_140018000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 476127 476586 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018000.1"; gene_id "LTnewLTref_140018000"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 476645 477228 0.48 + 2 transcript_id "LTnewLTref_140018000.1"; gene_id "LTnewLTref_140018000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 477523 479407 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_140018100.1"; gene_id "LTnewLTref_140018100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 477523 479118 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018100.1"; gene_id "LTnewLTref_140018100"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 479165 479407 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018100.1"; gene_id "LTnewLTref_140018100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 479430 480614 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_140018200.1"; gene_id "LTnewLTref_140018200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 479430 480144 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018200.1"; gene_id "LTnewLTref_140018200"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 480223 480614 0.96 + 2 transcript_id "LTnewLTref_140018200.1"; gene_id "LTnewLTref_140018200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 480741 482169 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_140018300.1"; gene_id "LTnewLTref_140018300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 480741 481859 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018300.1"; gene_id "LTnewLTref_140018300"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 481903 482169 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018300.1"; gene_id "LTnewLTref_140018300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 482251 483326 0.3 + . transcript_id "LTnewLTref_140018400.1"; gene_id "LTnewLTref_140018400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 482251 482445 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018400.1"; gene_id "LTnewLTref_140018400"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 482541 483326 0.3 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018400.1"; gene_id "LTnewLTref_140018400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 482556 483326 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140018400.2"; gene_id "LTnewLTref_140018400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 482556 483326 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018400.2"; gene_id "LTnewLTref_140018400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 485110 488161 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140018500.1"; gene_id "LTnewLTref_140018500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 485110 487390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018500.1"; gene_id "LTnewLTref_140018500"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 487485 488161 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_140018500.1"; gene_id "LTnewLTref_140018500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 485617 488161 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_140018500.2"; gene_id "LTnewLTref_140018500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 485617 487390 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018500.2"; gene_id "LTnewLTref_140018500"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 487485 488161 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_140018500.2"; gene_id "LTnewLTref_140018500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 488200 488649 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_140018600.1"; gene_id "LTnewLTref_140018600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 488200 488649 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018600.1"; gene_id "LTnewLTref_140018600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 490314 491556 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_140018700.1"; gene_id "LTnewLTref_140018700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 490314 490972 0.51 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018700.1"; gene_id "LTnewLTref_140018700"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 491025 491556 0.62 + 1 transcript_id "LTnewLTref_140018700.1"; gene_id "LTnewLTref_140018700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 491729 492728 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_140018800.1"; gene_id "LTnewLTref_140018800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 491729 492100 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018800.1"; gene_id "LTnewLTref_140018800"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 492147 492728 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018800.1"; gene_id "LTnewLTref_140018800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 495377 499245 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_140018900.1"; gene_id "LTnewLTref_140018900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 495377 498782 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140018900.1"; gene_id "LTnewLTref_140018900"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 498845 499245 0.42 + 2 transcript_id "LTnewLTref_140018900.1"; gene_id "LTnewLTref_140018900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 500133 502485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140019000.1"; gene_id "LTnewLTref_140019000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 500133 501898 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019000.1"; gene_id "LTnewLTref_140019000"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 502014 502485 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_140019000.1"; gene_id "LTnewLTref_140019000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 501033 502485 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_140019000.2"; gene_id "LTnewLTref_140019000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 501033 501898 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019000.2"; gene_id "LTnewLTref_140019000"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 502014 502485 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_140019000.2"; gene_id "LTnewLTref_140019000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 503259 507108 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_140019100.1"; gene_id "LTnewLTref_140019100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 503259 506270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019100.1"; gene_id "LTnewLTref_140019100"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 507076 507108 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019100.1"; gene_id "LTnewLTref_140019100"; CM024300.1 Liftoff transcript 512679 513184 . + . transcript_id "LTnewLTref_140019200.1"; gene_id "LTnewLTref_140019200" CM024300.1 Liftoff CDS 512679 513184 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019200.1"; gene_id "LTnewLTref_140019200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 515308 518091 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140019300.1"; gene_id "LTnewLTref_140019300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 515308 518091 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019300.1"; gene_id "LTnewLTref_140019300"; CM024300.1 Liftoff transcript 520350 521897 . + . transcript_id "LTnewLTref_140019400.1"; gene_id "LTnewLTref_140019400" CM024300.1 Liftoff CDS 520350 521897 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019400.1"; gene_id "LTnewLTref_140019400"; CM024300.1 Liftoff transcript 523162 524724 . + . transcript_id "LTnewLTref_140019500.1"; gene_id "LTnewLTref_140019500" CM024300.1 Liftoff CDS 523162 524724 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019500.1"; gene_id "LTnewLTref_140019500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 527136 528176 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140019600.1"; gene_id "LTnewLTref_140019600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 527136 528176 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019600.1"; gene_id "LTnewLTref_140019600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 529112 530401 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140019700.1"; gene_id "LTnewLTref_140019700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 529112 530401 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019700.1"; gene_id "LTnewLTref_140019700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 532697 535285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140019800.1"; gene_id "LTnewLTref_140019800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 532697 535285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019800.1"; gene_id "LTnewLTref_140019800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 536679 538792 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_140019900.1"; gene_id "LTnewLTref_140019900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 536679 538325 0.52 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019900.1"; gene_id "LTnewLTref_140019900"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 538385 538792 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140019900.1"; gene_id "LTnewLTref_140019900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 539670 541352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020000.1"; gene_id "LTnewLTref_140020000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 539670 541352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020000.1"; gene_id "LTnewLTref_140020000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 542075 543670 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020100.1"; gene_id "LTnewLTref_140020100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 542075 543670 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020100.1"; gene_id "LTnewLTref_140020100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 544921 545706 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020200.1"; gene_id "LTnewLTref_140020200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 544921 545706 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020200.1"; gene_id "LTnewLTref_140020200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 546685 549480 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020300.1"; gene_id "LTnewLTref_140020300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 546685 549480 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020300.1"; gene_id "LTnewLTref_140020300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 551617 553323 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020400.1"; gene_id "LTnewLTref_140020400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 551617 553323 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020400.1"; gene_id "LTnewLTref_140020400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 554674 555582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020500.1"; gene_id "LTnewLTref_140020500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 554674 555582 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020500.1"; gene_id "LTnewLTref_140020500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 556462 557079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020600.1"; gene_id "LTnewLTref_140020600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 556462 557079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020600.1"; gene_id "LTnewLTref_140020600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 558997 559605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020700.1"; gene_id "LTnewLTref_140020700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 558997 559605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020700.1"; gene_id "LTnewLTref_140020700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 560887 561345 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020800.1"; gene_id "LTnewLTref_140020800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 560887 561345 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020800.1"; gene_id "LTnewLTref_140020800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 562098 563834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140020900.1"; gene_id "LTnewLTref_140020900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 562098 563834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140020900.1"; gene_id "LTnewLTref_140020900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 564759 567164 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021000.1"; gene_id "LTnewLTref_140021000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 564759 567164 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021000.1"; gene_id "LTnewLTref_140021000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 568698 571985 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021100.1"; gene_id "LTnewLTref_140021100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 568698 571985 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021100.1"; gene_id "LTnewLTref_140021100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 574844 575935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021200.1"; gene_id "LTnewLTref_140021200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 574844 575935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021200.1"; gene_id "LTnewLTref_140021200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 578065 579156 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021300.1"; gene_id "LTnewLTref_140021300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 578065 579156 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021300.1"; gene_id "LTnewLTref_140021300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 580904 582301 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021400.1"; gene_id "LTnewLTref_140021400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 580904 582301 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021400.1"; gene_id "LTnewLTref_140021400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 584904 586640 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021500.1"; gene_id "LTnewLTref_140021500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 584904 586640 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021500.1"; gene_id "LTnewLTref_140021500"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 588786 590030 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021600.1"; gene_id "LTnewLTref_140021600" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 588786 590030 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021600.1"; gene_id "LTnewLTref_140021600"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 591445 593313 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021700.1"; gene_id "LTnewLTref_140021700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 591445 593313 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021700.1"; gene_id "LTnewLTref_140021700"; CM024300.1 . transcript 594103 594388 . + . transcript_id "LTnewLTref_140021800.1"; gene_id "LTnewLTref_140021800:pseudogene" CM024300.1 . exon 594103 594388 . + . transcript_id "LTnewLTref_140021800.1"; gene_id "LTnewLTref_140021800:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 596030 597610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140021900.1"; gene_id "LTnewLTref_140021900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 596030 597610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140021900.1"; gene_id "LTnewLTref_140021900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 600579 602627 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022000.1"; gene_id "LTnewLTref_140022000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 600579 602627 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022000.1"; gene_id "LTnewLTref_140022000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 603521 604759 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022100.1"; gene_id "LTnewLTref_140022100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 603521 604759 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022100.1"; gene_id "LTnewLTref_140022100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 605585 606250 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022200.1"; gene_id "LTnewLTref_140022200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 605585 606250 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022200.1"; gene_id "LTnewLTref_140022200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 607065 607511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022300.1"; gene_id "LTnewLTref_140022300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 607065 607511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022300.1"; gene_id "LTnewLTref_140022300"; CM024300.1 . transcript 610386 610734 . + . transcript_id "LTnewLTref_140022400.1"; gene_id "LTnewLTref_140022400:pseudogene" CM024300.1 . exon 610386 610622 . + . transcript_id "LTnewLTref_140022400.1"; gene_id "LTnewLTref_140022400:pseudogene"; CM024300.1 . exon 610624 610734 . + . transcript_id "LTnewLTref_140022400.1"; gene_id "LTnewLTref_140022400:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 611645 615719 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_140022500.1"; gene_id "LTnewLTref_140022500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 611645 612510 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022500.1"; gene_id "LTnewLTref_140022500"; CM024300.1 AUGUSTUS CDS 612620 615719 0.64 + 1 transcript_id "LTnewLTref_140022500.1"; gene_id "LTnewLTref_140022500"; CM024300.1 . transcript 616915 617241 . + . transcript_id "LTnewLTref_140022600.1"; gene_id "LTnewLTref_140022600:pseudogene" CM024300.1 . exon 616915 617241 . + . transcript_id "LTnewLTref_140022600.1"; gene_id "LTnewLTref_140022600:pseudogene"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 618864 620531 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022700.1"; gene_id "LTnewLTref_140022700" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 618864 620531 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022700.1"; gene_id "LTnewLTref_140022700"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 622239 624251 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022800.1"; gene_id "LTnewLTref_140022800" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 622239 624251 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022800.1"; gene_id "LTnewLTref_140022800"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 625010 630271 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140022900.1"; gene_id "LTnewLTref_140022900" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 625010 630271 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140022900.1"; gene_id "LTnewLTref_140022900"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 632120 635143 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140023000.1"; gene_id "LTnewLTref_140023000" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 632120 635143 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140023000.1"; gene_id "LTnewLTref_140023000"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 637542 639599 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140023100.1"; gene_id "LTnewLTref_140023100" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 637542 639599 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140023100.1"; gene_id "LTnewLTref_140023100"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 640323 640745 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140023200.1"; gene_id "LTnewLTref_140023200" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 640323 640745 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140023200.1"; gene_id "LTnewLTref_140023200"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 642164 643618 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140023300.1"; gene_id "LTnewLTref_140023300" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 642164 643618 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140023300.1"; gene_id "LTnewLTref_140023300"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 644349 645284 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140023400.1"; gene_id "LTnewLTref_140023400" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 644349 645284 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140023400.1"; gene_id "LTnewLTref_140023400"; CM024300.1 AUGUSTUS transcript 646654 649191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_140023500.1"; gene_id "LTnewLTref_140023500" CM024300.1 AUGUSTUS CDS 646654 649191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_140023500.1"; gene_id "LTnewLTref_140023500"; CM024300.1 . transcript 650566 650915 . + . transcript_id "LTnewLTref_140023600.1"; gene_id "LTnewLTref_140023600:pseudogene" CM024300.1 . exon 650566 650619 . + . transcript_id "LTnewLTref_140023600.1"; gene_id "LTnewLTref_140023600:pseudogene"; CM024300.1 . exon 650621 650740 . + . transcript_id "LTnewLTref_140023600.1"; gene_id "LTnewLTref_140023600:pseudogene"; CM024300.1 . exon 650742 650915 . + . transcript_id "LTnewLTref_140023600.1"; gene_id "LTnewLTref_140023600:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 68 370 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005000.1"; gene_id "LTnewLTref_150005000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 68 370 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005000.1"; gene_id "LTnewLTref_150005000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 879 2741 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005100.1"; gene_id "LTnewLTref_150005100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 879 2741 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005100.1"; gene_id "LTnewLTref_150005100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 3579 4856 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005200.1"; gene_id "LTnewLTref_150005200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 3579 4856 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005200.1"; gene_id "LTnewLTref_150005200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 5704 6702 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005300.1"; gene_id "LTnewLTref_150005300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 5704 6702 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005300.1"; gene_id "LTnewLTref_150005300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 9135 10034 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005400.1"; gene_id "LTnewLTref_150005400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 9135 10034 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005400.1"; gene_id "LTnewLTref_150005400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 16696 19746 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005500.1"; gene_id "LTnewLTref_150005500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 16696 19746 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005500.1"; gene_id "LTnewLTref_150005500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 20967 22652 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_150005600.1"; gene_id "LTnewLTref_150005600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 20967 22652 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005600.1"; gene_id "LTnewLTref_150005600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 23544 24509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005700.1"; gene_id "LTnewLTref_150005700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 23544 24509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005700.1"; gene_id "LTnewLTref_150005700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 26305 27750 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005800.1"; gene_id "LTnewLTref_150005800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 26305 27750 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005800.1"; gene_id "LTnewLTref_150005800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 29188 30882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150005900.1"; gene_id "LTnewLTref_150005900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 29188 30882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150005900.1"; gene_id "LTnewLTref_150005900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 32006 34399 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006000.1"; gene_id "LTnewLTref_150006000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 32006 34399 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006000.1"; gene_id "LTnewLTref_150006000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 35481 36437 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006100.1"; gene_id "LTnewLTref_150006100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 35481 36437 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006100.1"; gene_id "LTnewLTref_150006100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 39883 42225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006200.1"; gene_id "LTnewLTref_150006200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 39883 42225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006200.1"; gene_id "LTnewLTref_150006200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 50286 50933 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006300.1"; gene_id "LTnewLTref_150006300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 50286 50933 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006300.1"; gene_id "LTnewLTref_150006300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 53872 54420 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006400.1"; gene_id "LTnewLTref_150006400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 53872 54420 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006400.1"; gene_id "LTnewLTref_150006400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 56439 58946 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006500.1"; gene_id "LTnewLTref_150006500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 56439 58946 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006500.1"; gene_id "LTnewLTref_150006500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 61688 62902 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006600.1"; gene_id "LTnewLTref_150006600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 61688 62902 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006600.1"; gene_id "LTnewLTref_150006600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 64440 66668 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006700.1"; gene_id "LTnewLTref_150006700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 64440 66668 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006700.1"; gene_id "LTnewLTref_150006700"; CM024301.1 Liftoff transcript 70214 71974 . - . transcript_id "LTnewLTref_150006800.1"; gene_id "LTnewLTref_150006800" CM024301.1 Liftoff CDS 70214 71974 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006800.1"; gene_id "LTnewLTref_150006800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 73126 73617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150006900.1"; gene_id "LTnewLTref_150006900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 73126 73617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150006900.1"; gene_id "LTnewLTref_150006900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 75377 76255 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150007000.1"; gene_id "LTnewLTref_150007000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 75377 76255 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150007000.1"; gene_id "LTnewLTref_150007000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 77093 77761 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150007100.1"; gene_id "LTnewLTref_150007100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 77093 77761 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150007100.1"; gene_id "LTnewLTref_150007100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 79034 79324 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150007200.1"; gene_id "LTnewLTref_150007200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 79034 79324 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150007200.1"; gene_id "LTnewLTref_150007200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 80528 82087 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150007300.1"; gene_id "LTnewLTref_150007300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 80528 82087 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150007300.1"; gene_id "LTnewLTref_150007300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 82684 83808 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150007400.1"; gene_id "LTnewLTref_150007400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 82684 83808 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150007400.1"; gene_id "LTnewLTref_150007400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 84669 85316 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150007500.1"; gene_id "LTnewLTref_150007500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 84669 85316 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150007500.1"; gene_id "LTnewLTref_150007500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 86370 87413 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150007600.1"; gene_id "LTnewLTref_150007600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 86370 87413 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150007600.1"; gene_id "LTnewLTref_150007600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 87995 89755 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150007700.1"; gene_id "LTnewLTref_150007700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 87995 89755 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150007700.1"; gene_id "LTnewLTref_150007700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 90821 92038 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150007800.1"; gene_id "LTnewLTref_150007800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 90821 92038 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150007800.1"; gene_id "LTnewLTref_150007800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 93046 98879 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_150007900.1"; gene_id "LTnewLTref_150007900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 93046 98078 0.82 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150007900.1"; gene_id "LTnewLTref_150007900"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 98135 98879 0.84 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150007900.1"; gene_id "LTnewLTref_150007900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 100422 101855 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008000.1"; gene_id "LTnewLTref_150008000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 100422 101855 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008000.1"; gene_id "LTnewLTref_150008000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 103609 104382 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008100.1"; gene_id "LTnewLTref_150008100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 103609 104382 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008100.1"; gene_id "LTnewLTref_150008100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 106159 106722 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008200.1"; gene_id "LTnewLTref_150008200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 106159 106722 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008200.1"; gene_id "LTnewLTref_150008200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 108320 108883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008300.1"; gene_id "LTnewLTref_150008300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 108320 108883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008300.1"; gene_id "LTnewLTref_150008300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 110766 113168 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008400.1"; gene_id "LTnewLTref_150008400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 110766 113168 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008400.1"; gene_id "LTnewLTref_150008400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 113732 114172 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008500.1"; gene_id "LTnewLTref_150008500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 113732 114172 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008500.1"; gene_id "LTnewLTref_150008500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 115983 117938 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008600.1"; gene_id "LTnewLTref_150008600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 115983 117938 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008600.1"; gene_id "LTnewLTref_150008600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 119329 121608 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008700.1"; gene_id "LTnewLTref_150008700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 119329 121608 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008700.1"; gene_id "LTnewLTref_150008700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 125428 128484 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008800.1"; gene_id "LTnewLTref_150008800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 125428 128484 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008800.1"; gene_id "LTnewLTref_150008800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 129532 131016 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150008900.1"; gene_id "LTnewLTref_150008900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 129532 131016 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150008900.1"; gene_id "LTnewLTref_150008900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 131643 133607 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009000.1"; gene_id "LTnewLTref_150009000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 131643 133607 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009000.1"; gene_id "LTnewLTref_150009000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 134053 137271 0.88 + . transcript_id "LTnewLTref_150009100.1"; gene_id "LTnewLTref_150009100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 134053 134060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009100.1"; gene_id "LTnewLTref_150009100"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 134268 137271 0.88 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150009100.1"; gene_id "LTnewLTref_150009100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 138035 138361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009200.1"; gene_id "LTnewLTref_150009200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 138035 138361 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009200.1"; gene_id "LTnewLTref_150009200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 139134 139460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009300.1"; gene_id "LTnewLTref_150009300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 139134 139460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009300.1"; gene_id "LTnewLTref_150009300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 140187 141383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009400.1"; gene_id "LTnewLTref_150009400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 140187 141383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009400.1"; gene_id "LTnewLTref_150009400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 142142 144184 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009500.1"; gene_id "LTnewLTref_150009500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 142142 144184 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009500.1"; gene_id "LTnewLTref_150009500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 144794 146878 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009600.1"; gene_id "LTnewLTref_150009600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 144794 146878 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009600.1"; gene_id "LTnewLTref_150009600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 147472 147912 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009700.1"; gene_id "LTnewLTref_150009700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 147472 147912 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009700.1"; gene_id "LTnewLTref_150009700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 149448 150485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009800.1"; gene_id "LTnewLTref_150009800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 149448 150485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009800.1"; gene_id "LTnewLTref_150009800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 153941 155608 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150009900.1"; gene_id "LTnewLTref_150009900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 153941 155608 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009900.1"; gene_id "LTnewLTref_150009900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 153941 156270 0.23 + . transcript_id "LTnewLTref_150009900.2"; gene_id "LTnewLTref_150009900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 153941 155555 0.46 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150009900.2"; gene_id "LTnewLTref_150009900"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 155615 156270 0.23 + 2 transcript_id "LTnewLTref_150009900.2"; gene_id "LTnewLTref_150009900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 156595 159461 0.72 + . transcript_id "LTnewLTref_150010000.1"; gene_id "LTnewLTref_150010000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 156595 158334 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010000.1"; gene_id "LTnewLTref_150010000"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 158382 159461 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010000.1"; gene_id "LTnewLTref_150010000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 159502 165383 0.68 + . transcript_id "LTnewLTref_150010100.1"; gene_id "LTnewLTref_150010100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 159502 160127 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010100.1"; gene_id "LTnewLTref_150010100"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 160175 165383 0.68 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010100.1"; gene_id "LTnewLTref_150010100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 165435 167494 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_150010200.1"; gene_id "LTnewLTref_150010200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 165435 167425 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010200.1"; gene_id "LTnewLTref_150010200"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 167485 167494 0.97 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010200.1"; gene_id "LTnewLTref_150010200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 165435 167599 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_150010200.2"; gene_id "LTnewLTref_150010200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 165435 167530 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010200.2"; gene_id "LTnewLTref_150010200"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 167590 167599 0.98 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010200.2"; gene_id "LTnewLTref_150010200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 165435 170007 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_150010200.3"; gene_id "LTnewLTref_150010200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 165435 169422 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010200.3"; gene_id "LTnewLTref_150010200"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 169598 170007 0.61 + 2 transcript_id "LTnewLTref_150010200.3"; gene_id "LTnewLTref_150010200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 170247 180856 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_150010300.1"; gene_id "LTnewLTref_150010300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 170247 177781 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010300.1"; gene_id "LTnewLTref_150010300"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 177847 180856 0.57 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010300.1"; gene_id "LTnewLTref_150010300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 177851 180856 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150010300.2"; gene_id "LTnewLTref_150010300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 177851 180856 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010300.2"; gene_id "LTnewLTref_150010300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 180883 183025 0.81 + . transcript_id "LTnewLTref_150010400.1"; gene_id "LTnewLTref_150010400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 180883 182924 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010400.1"; gene_id "LTnewLTref_150010400"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 183004 183025 0.89 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010400.1"; gene_id "LTnewLTref_150010400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 183077 188618 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_150010500.1"; gene_id "LTnewLTref_150010500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 183077 186255 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010500.1"; gene_id "LTnewLTref_150010500"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 186311 188618 0.84 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010500.1"; gene_id "LTnewLTref_150010500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 188690 189073 0.87 + . transcript_id "LTnewLTref_150010600.1"; gene_id "LTnewLTref_150010600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 188690 189073 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010600.1"; gene_id "LTnewLTref_150010600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 189208 190032 0.72 + . transcript_id "LTnewLTref_150010700.1"; gene_id "LTnewLTref_150010700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 189208 190032 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010700.1"; gene_id "LTnewLTref_150010700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 189499 190032 0.89 + . transcript_id "LTnewLTref_150010700.2"; gene_id "LTnewLTref_150010700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 189499 190032 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010700.2"; gene_id "LTnewLTref_150010700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 190083 190557 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_150010800.1"; gene_id "LTnewLTref_150010800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 190083 190292 0.82 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010800.1"; gene_id "LTnewLTref_150010800"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 190372 190557 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010800.1"; gene_id "LTnewLTref_150010800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 190083 191368 0.39 + . transcript_id "LTnewLTref_150010800.2"; gene_id "LTnewLTref_150010800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 190083 190375 0.39 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010800.2"; gene_id "LTnewLTref_150010800"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 190441 191368 0.46 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010800.2"; gene_id "LTnewLTref_150010800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 190712 195708 0.35 + . transcript_id "LTnewLTref_150010800.3"; gene_id "LTnewLTref_150010800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 190712 191195 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010800.3"; gene_id "LTnewLTref_150010800"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 191276 195708 0.6 + 2 transcript_id "LTnewLTref_150010800.3"; gene_id "LTnewLTref_150010800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 195726 203643 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_150010900.1"; gene_id "LTnewLTref_150010900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 195726 203488 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010900.1"; gene_id "LTnewLTref_150010900"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 203616 203643 0.55 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150010900.1"; gene_id "LTnewLTref_150010900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 195753 212444 0.13 + . transcript_id "LTnewLTref_150010900.2"; gene_id "LTnewLTref_150010900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 195753 209784 0.22 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150010900.2"; gene_id "LTnewLTref_150010900"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 209881 212444 0.19 + 2 transcript_id "LTnewLTref_150010900.2"; gene_id "LTnewLTref_150010900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 213131 215254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150011000.1"; gene_id "LTnewLTref_150011000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 213131 215254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150011000.1"; gene_id "LTnewLTref_150011000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 216164 219172 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150011100.1"; gene_id "LTnewLTref_150011100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 216164 219172 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150011100.1"; gene_id "LTnewLTref_150011100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 220118 220594 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150011200.1"; gene_id "LTnewLTref_150011200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 220118 220594 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150011200.1"; gene_id "LTnewLTref_150011200"; CM024301.1 . transcript 221772 222916 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011300.1"; gene_id "LTnewLTref_150011300:pseudogene" CM024301.1 . exon 221772 222916 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011300.1"; gene_id "LTnewLTref_150011300:pseudogene"; CM024301.1 . transcript 226230 231810 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011400.1"; gene_id "LTnewLTref_150011400:pseudogene" CM024301.1 . exon 226230 231810 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011400.1"; gene_id "LTnewLTref_150011400:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 233175 235199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150011500.1"; gene_id "LTnewLTref_150011500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 233175 235199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150011500.1"; gene_id "LTnewLTref_150011500"; CM024301.1 . transcript 236690 242018 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011600.1"; gene_id "LTnewLTref_150011600:pseudogene" CM024301.1 . exon 236690 242018 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011600.1"; gene_id "LTnewLTref_150011600:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 242856 244661 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150011700.1"; gene_id "LTnewLTref_150011700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 242856 244661 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150011700.1"; gene_id "LTnewLTref_150011700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 246615 247613 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150011800.1"; gene_id "LTnewLTref_150011800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 246615 247613 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150011800.1"; gene_id "LTnewLTref_150011800"; CM024301.1 . transcript 249536 250514 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011900.1"; gene_id "LTnewLTref_150011900:pseudogene" CM024301.1 . exon 249536 250514 . + . transcript_id "LTnewLTref_150011900.1"; gene_id "LTnewLTref_150011900:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 251199 251897 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012000.1"; gene_id "LTnewLTref_150012000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 251199 251897 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012000.1"; gene_id "LTnewLTref_150012000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 252731 257932 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_150012100.1"; gene_id "LTnewLTref_150012100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 252731 252995 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012100.1"; gene_id "LTnewLTref_150012100"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 253527 257932 0.48 + 2 transcript_id "LTnewLTref_150012100.1"; gene_id "LTnewLTref_150012100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 259826 263515 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012200.1"; gene_id "LTnewLTref_150012200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 259826 263515 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012200.1"; gene_id "LTnewLTref_150012200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 265968 267521 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012300.1"; gene_id "LTnewLTref_150012300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 265968 267521 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012300.1"; gene_id "LTnewLTref_150012300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 269945 271291 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012400.1"; gene_id "LTnewLTref_150012400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 269945 271291 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012400.1"; gene_id "LTnewLTref_150012400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 275749 278619 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012500.1"; gene_id "LTnewLTref_150012500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 275749 278619 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012500.1"; gene_id "LTnewLTref_150012500"; CM024301.1 Liftoff transcript 280924 281133 . + . transcript_id "LTnewLTref_150012600.1"; gene_id "LTnewLTref_150012600" CM024301.1 Liftoff CDS 280924 281133 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012600.1"; gene_id "LTnewLTref_150012600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 283850 287926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012700.1"; gene_id "LTnewLTref_150012700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 283850 287926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012700.1"; gene_id "LTnewLTref_150012700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 292478 294593 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150012800.1"; gene_id "LTnewLTref_150012800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 292478 293441 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012800.1"; gene_id "LTnewLTref_150012800"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 293542 294593 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_150012800.1"; gene_id "LTnewLTref_150012800"; CM024301.1 Liftoff transcript 299328 301073 . + . transcript_id "LTnewLTref_150012900.1"; gene_id "LTnewLTref_150012900" CM024301.1 Liftoff CDS 299328 301073 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_150012900.1"; gene_id "LTnewLTref_150012900"; CM024301.1 Liftoff transcript 302770 303140 . + . transcript_id "LTnewLTref_150013000.1"; gene_id "LTnewLTref_150013000" CM024301.1 Liftoff CDS 302770 303140 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013000.1"; gene_id "LTnewLTref_150013000"; CM024301.1 . transcript 303768 306868 . + . transcript_id "LTnewLTref_150013100.1"; gene_id "LTnewLTref_150013100:pseudogene" CM024301.1 . exon 303768 306868 . + . transcript_id "LTnewLTref_150013100.1"; gene_id "LTnewLTref_150013100:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 307583 308188 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013200.1"; gene_id "LTnewLTref_150013200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 307583 308188 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013200.1"; gene_id "LTnewLTref_150013200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 308937 310412 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013300.1"; gene_id "LTnewLTref_150013300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 308937 310412 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013300.1"; gene_id "LTnewLTref_150013300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 311614 314736 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013400.1"; gene_id "LTnewLTref_150013400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 311614 314736 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013400.1"; gene_id "LTnewLTref_150013400"; CM024301.1 . transcript 315655 325745 . + . transcript_id "LTnewLTref_150013500.1"; gene_id "LTnewLTref_150013500:pseudogene" CM024301.1 . exon 315655 325745 . + . transcript_id "LTnewLTref_150013500.1"; gene_id "LTnewLTref_150013500:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 326356 328323 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013600.1"; gene_id "LTnewLTref_150013600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 326356 328323 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013600.1"; gene_id "LTnewLTref_150013600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 329276 330400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013700.1"; gene_id "LTnewLTref_150013700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 329276 330400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013700.1"; gene_id "LTnewLTref_150013700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 330937 331362 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013800.1"; gene_id "LTnewLTref_150013800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 330937 331037 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013800.1"; gene_id "LTnewLTref_150013800"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 331191 331362 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_150013800.1"; gene_id "LTnewLTref_150013800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 331416 331913 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150013900.1"; gene_id "LTnewLTref_150013900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 331416 331913 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150013900.1"; gene_id "LTnewLTref_150013900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 333136 333588 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150014000.1"; gene_id "LTnewLTref_150014000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 333136 333588 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150014000.1"; gene_id "LTnewLTref_150014000"; CM024301.1 Aragorn_1.2.36 transcript 334341 334413 . + . transcript_id "LTnewLTref_150014100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014100" CM024301.1 Aragorn_1.2.36 exon 334341 334413 . + . transcript_id "LTnewLTref_150014100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014100"; CM024301.1 Aragorn_1.2.36 transcript 334452 334525 . - . transcript_id "LTnewLTref_150014200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014200" CM024301.1 Aragorn_1.2.36 exon 334452 334525 . - . transcript_id "LTnewLTref_150014200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014200"; CM024301.1 INFERNAL transcript 334600 334718 90.2 + . transcript_id "LTnewLTref_150014300:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014300" CM024301.1 INFERNAL exon 334600 334718 . + . transcript_id "LTnewLTref_150014300:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014300"; CM024301.1 Liftoff transcript 334600 334718 . + . transcript_id "LTnewLTref_150014400:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014400" CM024301.1 Liftoff exon 334600 334718 . + . transcript_id "LTnewLTref_150014400:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_150014400"; CM024301.1 Liftoff transcript 334915 335090 . + . transcript_id "LTnewLTref_150014500.1"; gene_id "LTnewLTref_150014500" CM024301.1 Liftoff CDS 334915 335090 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_150014500.1"; gene_id "LTnewLTref_150014500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 341697 343646 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150014600.1"; gene_id "LTnewLTref_150014600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 341697 343646 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150014600.1"; gene_id "LTnewLTref_150014600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 347103 355145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150014700.1"; gene_id "LTnewLTref_150014700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 347103 355145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150014700.1"; gene_id "LTnewLTref_150014700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 356574 356819 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150014800.1"; gene_id "LTnewLTref_150014800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 356574 356819 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150014800.1"; gene_id "LTnewLTref_150014800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 359741 361711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150014900.1"; gene_id "LTnewLTref_150014900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 359741 361711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150014900.1"; gene_id "LTnewLTref_150014900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 362852 363952 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015000.1"; gene_id "LTnewLTref_150015000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 362852 363952 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015000.1"; gene_id "LTnewLTref_150015000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 364713 366680 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015100.1"; gene_id "LTnewLTref_150015100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 364713 366680 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015100.1"; gene_id "LTnewLTref_150015100"; CM024301.1 . transcript 367414 373701 . - . transcript_id "LTnewLTref_150015200.1"; gene_id "LTnewLTref_150015200:pseudogene" CM024301.1 . exon 367414 373701 . - . transcript_id "LTnewLTref_150015200.1"; gene_id "LTnewLTref_150015200:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 374893 381135 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015300.1"; gene_id "LTnewLTref_150015300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 374893 381135 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015300.1"; gene_id "LTnewLTref_150015300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 382601 384292 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015400.1"; gene_id "LTnewLTref_150015400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 382601 384292 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015400.1"; gene_id "LTnewLTref_150015400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 385174 385509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015500.1"; gene_id "LTnewLTref_150015500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 385174 385509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015500.1"; gene_id "LTnewLTref_150015500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 386263 389397 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015600.1"; gene_id "LTnewLTref_150015600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 386263 389397 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015600.1"; gene_id "LTnewLTref_150015600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 390121 391431 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015700.1"; gene_id "LTnewLTref_150015700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 390121 391431 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015700.1"; gene_id "LTnewLTref_150015700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 392263 394743 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015800.1"; gene_id "LTnewLTref_150015800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 392263 394743 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015800.1"; gene_id "LTnewLTref_150015800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 395909 398803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150015900.1"; gene_id "LTnewLTref_150015900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 395909 398803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150015900.1"; gene_id "LTnewLTref_150015900"; CM024301.1 . transcript 399733 400056 . - . transcript_id "LTnewLTref_150016000.1"; gene_id "LTnewLTref_150016000:pseudogene" CM024301.1 . exon 399733 400056 . - . transcript_id "LTnewLTref_150016000.1"; gene_id "LTnewLTref_150016000:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 400386 400819 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_150016100.1"; gene_id "LTnewLTref_150016100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 400386 400416 0.49 - 1 transcript_id "LTnewLTref_150016100.1"; gene_id "LTnewLTref_150016100"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 400497 400819 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016100.1"; gene_id "LTnewLTref_150016100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 401161 402132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016200.1"; gene_id "LTnewLTref_150016200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 401161 402132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016200.1"; gene_id "LTnewLTref_150016200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 402591 404468 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016300.1"; gene_id "LTnewLTref_150016300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 402591 404468 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016300.1"; gene_id "LTnewLTref_150016300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 405566 406981 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016400.1"; gene_id "LTnewLTref_150016400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 405566 406981 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016400.1"; gene_id "LTnewLTref_150016400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 410612 412837 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016500.1"; gene_id "LTnewLTref_150016500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 410612 412837 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016500.1"; gene_id "LTnewLTref_150016500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 414223 415809 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016600.1"; gene_id "LTnewLTref_150016600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 414223 415809 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016600.1"; gene_id "LTnewLTref_150016600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 416616 424229 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016700.1"; gene_id "LTnewLTref_150016700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 416616 424229 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016700.1"; gene_id "LTnewLTref_150016700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 425425 428235 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016800.1"; gene_id "LTnewLTref_150016800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 425425 428235 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016800.1"; gene_id "LTnewLTref_150016800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 430272 430841 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150016900.1"; gene_id "LTnewLTref_150016900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 430272 430841 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150016900.1"; gene_id "LTnewLTref_150016900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 431737 435351 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017000.1"; gene_id "LTnewLTref_150017000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 431737 435351 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017000.1"; gene_id "LTnewLTref_150017000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 436581 437240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017100.1"; gene_id "LTnewLTref_150017100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 436581 437240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017100.1"; gene_id "LTnewLTref_150017100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 438380 438859 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_150017200.1"; gene_id "LTnewLTref_150017200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 438380 438859 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017200.1"; gene_id "LTnewLTref_150017200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 439817 440755 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017300.1"; gene_id "LTnewLTref_150017300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 439817 440755 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017300.1"; gene_id "LTnewLTref_150017300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 441346 442548 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017400.1"; gene_id "LTnewLTref_150017400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 441346 442548 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017400.1"; gene_id "LTnewLTref_150017400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 443265 445415 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017500.1"; gene_id "LTnewLTref_150017500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 443265 445415 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017500.1"; gene_id "LTnewLTref_150017500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 446870 447463 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017600.1"; gene_id "LTnewLTref_150017600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 446870 447463 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017600.1"; gene_id "LTnewLTref_150017600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 448023 448610 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017700.1"; gene_id "LTnewLTref_150017700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 448023 448610 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017700.1"; gene_id "LTnewLTref_150017700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 450514 453576 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017800.1"; gene_id "LTnewLTref_150017800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 450514 453576 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017800.1"; gene_id "LTnewLTref_150017800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 456631 457710 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150017900.1"; gene_id "LTnewLTref_150017900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 456631 457710 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150017900.1"; gene_id "LTnewLTref_150017900"; CM024301.1 Liftoff transcript 458863 460533 . - . transcript_id "LTnewLTref_150018000.1"; gene_id "LTnewLTref_150018000" CM024301.1 Liftoff CDS 458863 460533 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018000.1"; gene_id "LTnewLTref_150018000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 462526 463125 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018100.1"; gene_id "LTnewLTref_150018100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 462526 463125 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018100.1"; gene_id "LTnewLTref_150018100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 463768 464118 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018200.1"; gene_id "LTnewLTref_150018200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 463768 464118 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018200.1"; gene_id "LTnewLTref_150018200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 465330 465899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018300.1"; gene_id "LTnewLTref_150018300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 465330 465899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018300.1"; gene_id "LTnewLTref_150018300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 466543 466893 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018400.1"; gene_id "LTnewLTref_150018400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 466543 466893 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018400.1"; gene_id "LTnewLTref_150018400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 468132 468701 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018500.1"; gene_id "LTnewLTref_150018500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 468132 468701 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018500.1"; gene_id "LTnewLTref_150018500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 469345 469695 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018600.1"; gene_id "LTnewLTref_150018600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 469345 469695 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018600.1"; gene_id "LTnewLTref_150018600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 470935 471504 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018700.1"; gene_id "LTnewLTref_150018700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 470935 471504 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018700.1"; gene_id "LTnewLTref_150018700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 472151 472501 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018800.1"; gene_id "LTnewLTref_150018800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 472151 472501 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018800.1"; gene_id "LTnewLTref_150018800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 474417 475016 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150018900.1"; gene_id "LTnewLTref_150018900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 474417 475016 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150018900.1"; gene_id "LTnewLTref_150018900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 476048 477334 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019000.1"; gene_id "LTnewLTref_150019000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 476048 477334 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019000.1"; gene_id "LTnewLTref_150019000"; CM024301.1 . transcript 478272 487881 . - . transcript_id "LTnewLTref_150019100.1"; gene_id "LTnewLTref_150019100:pseudogene" CM024301.1 . exon 478272 487881 . - . transcript_id "LTnewLTref_150019100.1"; gene_id "LTnewLTref_150019100:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 489197 492958 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019200.1"; gene_id "LTnewLTref_150019200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 489197 492958 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019200.1"; gene_id "LTnewLTref_150019200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 493810 501840 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019300.1"; gene_id "LTnewLTref_150019300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 493810 501840 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019300.1"; gene_id "LTnewLTref_150019300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 504303 504638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019400.1"; gene_id "LTnewLTref_150019400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 504303 504638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019400.1"; gene_id "LTnewLTref_150019400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 505640 505966 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019500.1"; gene_id "LTnewLTref_150019500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 505640 505966 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019500.1"; gene_id "LTnewLTref_150019500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 506820 509198 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019600.1"; gene_id "LTnewLTref_150019600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 506820 509198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019600.1"; gene_id "LTnewLTref_150019600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 510472 511908 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019700.1"; gene_id "LTnewLTref_150019700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 510472 511908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019700.1"; gene_id "LTnewLTref_150019700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 514514 515715 0.85 - . transcript_id "LTnewLTref_150019800.1"; gene_id "LTnewLTref_150019800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 514514 514796 0.99 - 1 transcript_id "LTnewLTref_150019800.1"; gene_id "LTnewLTref_150019800"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 514850 515715 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019800.1"; gene_id "LTnewLTref_150019800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 518424 519899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150019900.1"; gene_id "LTnewLTref_150019900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 518424 519899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150019900.1"; gene_id "LTnewLTref_150019900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 520562 521077 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020000.1"; gene_id "LTnewLTref_150020000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 520562 521077 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020000.1"; gene_id "LTnewLTref_150020000"; CM024301.1 . transcript 522050 522400 . - . transcript_id "LTnewLTref_150020100.1"; gene_id "LTnewLTref_150020100:pseudogene" CM024301.1 . exon 522050 522400 . - . transcript_id "LTnewLTref_150020100.1"; gene_id "LTnewLTref_150020100:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 523129 524606 0.91 - . transcript_id "LTnewLTref_150020200.1"; gene_id "LTnewLTref_150020200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 523129 523411 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_150020200.1"; gene_id "LTnewLTref_150020200"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 523456 524606 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020200.1"; gene_id "LTnewLTref_150020200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 527028 528503 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020300.1"; gene_id "LTnewLTref_150020300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 527028 528503 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020300.1"; gene_id "LTnewLTref_150020300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 529166 529681 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020400.1"; gene_id "LTnewLTref_150020400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 529166 529681 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020400.1"; gene_id "LTnewLTref_150020400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 530942 532165 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020500.1"; gene_id "LTnewLTref_150020500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 530942 532165 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020500.1"; gene_id "LTnewLTref_150020500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 534140 535777 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020600.1"; gene_id "LTnewLTref_150020600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 534140 535777 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020600.1"; gene_id "LTnewLTref_150020600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 536852 542419 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020700.1"; gene_id "LTnewLTref_150020700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 536852 542419 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020700.1"; gene_id "LTnewLTref_150020700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 544016 547726 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020800.1"; gene_id "LTnewLTref_150020800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 544016 547726 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020800.1"; gene_id "LTnewLTref_150020800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 549637 553875 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150020900.1"; gene_id "LTnewLTref_150020900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 549637 553875 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150020900.1"; gene_id "LTnewLTref_150020900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 556287 558782 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021000.1"; gene_id "LTnewLTref_150021000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 556287 558782 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021000.1"; gene_id "LTnewLTref_150021000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 559749 564116 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021100.1"; gene_id "LTnewLTref_150021100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 559749 564116 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021100.1"; gene_id "LTnewLTref_150021100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 567404 568726 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021200.1"; gene_id "LTnewLTref_150021200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 567404 568726 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021200.1"; gene_id "LTnewLTref_150021200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 569390 570505 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021300.1"; gene_id "LTnewLTref_150021300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 569390 570505 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021300.1"; gene_id "LTnewLTref_150021300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 571043 572155 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021400.1"; gene_id "LTnewLTref_150021400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 571043 572155 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021400.1"; gene_id "LTnewLTref_150021400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 572784 573695 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021500.1"; gene_id "LTnewLTref_150021500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 572784 573695 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021500.1"; gene_id "LTnewLTref_150021500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 574351 576465 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021600.1"; gene_id "LTnewLTref_150021600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 574351 576465 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021600.1"; gene_id "LTnewLTref_150021600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 577082 577996 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021700.1"; gene_id "LTnewLTref_150021700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 577082 577996 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021700.1"; gene_id "LTnewLTref_150021700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 578400 579617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021800.1"; gene_id "LTnewLTref_150021800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 578400 579617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021800.1"; gene_id "LTnewLTref_150021800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 580659 581876 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150021900.1"; gene_id "LTnewLTref_150021900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 580659 581876 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150021900.1"; gene_id "LTnewLTref_150021900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 583299 584636 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022000.1"; gene_id "LTnewLTref_150022000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 583299 584636 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022000.1"; gene_id "LTnewLTref_150022000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 585570 586469 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022100.1"; gene_id "LTnewLTref_150022100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 585570 586469 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022100.1"; gene_id "LTnewLTref_150022100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 587055 587942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022200.1"; gene_id "LTnewLTref_150022200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 587055 587942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022200.1"; gene_id "LTnewLTref_150022200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 588544 589980 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022300.1"; gene_id "LTnewLTref_150022300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 588544 589980 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022300.1"; gene_id "LTnewLTref_150022300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 590914 593940 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022400.1"; gene_id "LTnewLTref_150022400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 590914 593940 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022400.1"; gene_id "LTnewLTref_150022400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 595978 596265 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022500.1"; gene_id "LTnewLTref_150022500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 595978 596265 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022500.1"; gene_id "LTnewLTref_150022500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 597545 599257 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022600.1"; gene_id "LTnewLTref_150022600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 597545 599257 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022600.1"; gene_id "LTnewLTref_150022600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 600878 601759 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022700.1"; gene_id "LTnewLTref_150022700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 600878 601759 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022700.1"; gene_id "LTnewLTref_150022700"; CM024301.1 . transcript 602535 603932 . - . transcript_id "LTnewLTref_150022800.1"; gene_id "LTnewLTref_150022800:pseudogene" CM024301.1 . exon 602535 603932 . - . transcript_id "LTnewLTref_150022800.1"; gene_id "LTnewLTref_150022800:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 605106 605483 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150022900.1"; gene_id "LTnewLTref_150022900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 605106 605483 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150022900.1"; gene_id "LTnewLTref_150022900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 606929 607309 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023000.1"; gene_id "LTnewLTref_150023000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 606929 607309 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023000.1"; gene_id "LTnewLTref_150023000"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 609953 612745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023100.1"; gene_id "LTnewLTref_150023100" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 609953 612745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023100.1"; gene_id "LTnewLTref_150023100"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 615579 618401 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023200.1"; gene_id "LTnewLTref_150023200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 615579 618401 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023200.1"; gene_id "LTnewLTref_150023200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 619683 621683 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023300.1"; gene_id "LTnewLTref_150023300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 619683 621683 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023300.1"; gene_id "LTnewLTref_150023300"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 622435 623313 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023400.1"; gene_id "LTnewLTref_150023400" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 622435 623313 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023400.1"; gene_id "LTnewLTref_150023400"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 624058 624654 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023500.1"; gene_id "LTnewLTref_150023500" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 624058 624654 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023500.1"; gene_id "LTnewLTref_150023500"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 626481 627539 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023600.1"; gene_id "LTnewLTref_150023600" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 626481 627539 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023600.1"; gene_id "LTnewLTref_150023600"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 628173 629423 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023700.1"; gene_id "LTnewLTref_150023700" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 628173 629423 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023700.1"; gene_id "LTnewLTref_150023700"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 630081 630749 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023800.1"; gene_id "LTnewLTref_150023800" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 630081 630749 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023800.1"; gene_id "LTnewLTref_150023800"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 631325 632485 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150023900.1"; gene_id "LTnewLTref_150023900" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 631325 632485 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150023900.1"; gene_id "LTnewLTref_150023900"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 633364 637134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_150024000.1"; gene_id "LTnewLTref_150024000" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 633364 637134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_150024000.1"; gene_id "LTnewLTref_150024000"; CM024301.1 . transcript 639072 639561 . - . transcript_id "LTnewLTref_150024100.1"; gene_id "LTnewLTref_150024100:pseudogene" CM024301.1 . exon 639072 639561 . - . transcript_id "LTnewLTref_150024100.1"; gene_id "LTnewLTref_150024100:pseudogene"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 641590 643221 1 + . transcript_id "LTnewLTref_150024200.1"; gene_id "LTnewLTref_150024200" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 641590 643221 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150024200.1"; gene_id "LTnewLTref_150024200"; CM024301.1 AUGUSTUS transcript 649127 650075 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_150024300.1"; gene_id "LTnewLTref_150024300" CM024301.1 AUGUSTUS CDS 649127 649441 0.42 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150024300.1"; gene_id "LTnewLTref_150024300"; CM024301.1 AUGUSTUS CDS 649491 650075 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_150024300.1"; gene_id "LTnewLTref_150024300"; CM024302.1 . transcript 3465 4022 . - . transcript_id "LTnewLTref_160005000.1"; gene_id "LTnewLTref_160005000:pseudogene" CM024302.1 . exon 3465 4022 . - . transcript_id "LTnewLTref_160005000.1"; gene_id "LTnewLTref_160005000:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 4481 5605 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005100.1"; gene_id "LTnewLTref_160005100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 4481 5605 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005100.1"; gene_id "LTnewLTref_160005100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 6141 6785 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005200.1"; gene_id "LTnewLTref_160005200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 6141 6785 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005200.1"; gene_id "LTnewLTref_160005200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 7277 8374 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005300.1"; gene_id "LTnewLTref_160005300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 7277 8374 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005300.1"; gene_id "LTnewLTref_160005300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 9055 10008 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005400.1"; gene_id "LTnewLTref_160005400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 9055 10008 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005400.1"; gene_id "LTnewLTref_160005400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 10563 12536 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005500.1"; gene_id "LTnewLTref_160005500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 10563 12536 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005500.1"; gene_id "LTnewLTref_160005500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 13499 16378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005600.1"; gene_id "LTnewLTref_160005600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 13499 16378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005600.1"; gene_id "LTnewLTref_160005600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 16920 18119 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005700.1"; gene_id "LTnewLTref_160005700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 16920 18119 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005700.1"; gene_id "LTnewLTref_160005700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 19493 21709 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005800.1"; gene_id "LTnewLTref_160005800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 19493 21709 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005800.1"; gene_id "LTnewLTref_160005800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 23626 23910 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160005900.1"; gene_id "LTnewLTref_160005900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 23626 23910 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160005900.1"; gene_id "LTnewLTref_160005900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 24751 25734 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006000.1"; gene_id "LTnewLTref_160006000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 24751 25734 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006000.1"; gene_id "LTnewLTref_160006000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 26773 28869 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006100.1"; gene_id "LTnewLTref_160006100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 26773 28869 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006100.1"; gene_id "LTnewLTref_160006100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 30989 33469 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006200.1"; gene_id "LTnewLTref_160006200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 30989 33469 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006200.1"; gene_id "LTnewLTref_160006200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 34283 36643 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006300.1"; gene_id "LTnewLTref_160006300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 34283 36643 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006300.1"; gene_id "LTnewLTref_160006300"; CM024302.1 . transcript 37093 38114 . - . transcript_id "LTnewLTref_160006400.1"; gene_id "LTnewLTref_160006400:pseudogene" CM024302.1 . exon 37093 38114 . - . transcript_id "LTnewLTref_160006400.1"; gene_id "LTnewLTref_160006400:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 38893 39244 0.92 - . transcript_id "LTnewLTref_160006500.1"; gene_id "LTnewLTref_160006500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 38893 38919 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006500.1"; gene_id "LTnewLTref_160006500"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 38981 39244 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006500.1"; gene_id "LTnewLTref_160006500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 41177 41683 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006600.1"; gene_id "LTnewLTref_160006600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 41177 41683 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006600.1"; gene_id "LTnewLTref_160006600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 43114 43821 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006700.1"; gene_id "LTnewLTref_160006700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 43114 43821 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006700.1"; gene_id "LTnewLTref_160006700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 44855 45772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006800.1"; gene_id "LTnewLTref_160006800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 44855 45772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006800.1"; gene_id "LTnewLTref_160006800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 46247 59560 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160006900.1"; gene_id "LTnewLTref_160006900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 46247 59560 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160006900.1"; gene_id "LTnewLTref_160006900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 62015 62785 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007000.1"; gene_id "LTnewLTref_160007000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 62015 62785 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007000.1"; gene_id "LTnewLTref_160007000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 64386 65447 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007100.1"; gene_id "LTnewLTref_160007100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 64386 65447 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007100.1"; gene_id "LTnewLTref_160007100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 67359 68258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007200.1"; gene_id "LTnewLTref_160007200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 67359 68258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007200.1"; gene_id "LTnewLTref_160007200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 72152 73303 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007300.1"; gene_id "LTnewLTref_160007300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 72152 73303 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007300.1"; gene_id "LTnewLTref_160007300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 74442 74837 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007400.1"; gene_id "LTnewLTref_160007400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 74442 74837 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007400.1"; gene_id "LTnewLTref_160007400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 76273 76800 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007500.1"; gene_id "LTnewLTref_160007500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 76273 76800 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007500.1"; gene_id "LTnewLTref_160007500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 79217 81496 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007600.1"; gene_id "LTnewLTref_160007600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 79217 81496 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007600.1"; gene_id "LTnewLTref_160007600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 83591 84121 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007700.1"; gene_id "LTnewLTref_160007700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 83591 84121 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007700.1"; gene_id "LTnewLTref_160007700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 86238 87725 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007800.1"; gene_id "LTnewLTref_160007800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 86238 87725 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007800.1"; gene_id "LTnewLTref_160007800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 88400 91528 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160007900.1"; gene_id "LTnewLTref_160007900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 88400 91528 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160007900.1"; gene_id "LTnewLTref_160007900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 92525 101151 0.46 - . transcript_id "LTnewLTref_160008000.1"; gene_id "LTnewLTref_160008000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 92525 96176 0.46 - 1 transcript_id "LTnewLTref_160008000.1"; gene_id "LTnewLTref_160008000"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 96341 101151 0.46 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008000.1"; gene_id "LTnewLTref_160008000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 102576 103349 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008100.1"; gene_id "LTnewLTref_160008100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 102576 103349 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008100.1"; gene_id "LTnewLTref_160008100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 103874 105709 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008200.1"; gene_id "LTnewLTref_160008200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 103874 105709 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008200.1"; gene_id "LTnewLTref_160008200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 108046 110115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008300.1"; gene_id "LTnewLTref_160008300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 108046 110115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008300.1"; gene_id "LTnewLTref_160008300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 111931 115743 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008400.1"; gene_id "LTnewLTref_160008400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 111931 115743 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008400.1"; gene_id "LTnewLTref_160008400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 117080 118243 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008500.1"; gene_id "LTnewLTref_160008500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 117080 118243 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008500.1"; gene_id "LTnewLTref_160008500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 118982 119839 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008600.1"; gene_id "LTnewLTref_160008600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 118982 119839 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008600.1"; gene_id "LTnewLTref_160008600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 120420 121742 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008700.1"; gene_id "LTnewLTref_160008700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 120420 121742 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008700.1"; gene_id "LTnewLTref_160008700"; CM024302.1 . transcript 121940 122122 . - . transcript_id "LTnewLTref_160008800.1"; gene_id "LTnewLTref_160008800:pseudogene" CM024302.1 . exon 121940 122122 . - . transcript_id "LTnewLTref_160008800.1"; gene_id "LTnewLTref_160008800:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 123678 125741 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160008900.1"; gene_id "LTnewLTref_160008900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 123678 125741 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160008900.1"; gene_id "LTnewLTref_160008900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 126576 128045 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009000.1"; gene_id "LTnewLTref_160009000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 126576 128045 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009000.1"; gene_id "LTnewLTref_160009000"; CM024302.1 Liftoff transcript 130687 133176 . - . transcript_id "LTnewLTref_160009100.1"; gene_id "LTnewLTref_160009100" CM024302.1 Liftoff CDS 130687 133176 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009100.1"; gene_id "LTnewLTref_160009100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 134961 137921 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009200.1"; gene_id "LTnewLTref_160009200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 134961 137921 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009200.1"; gene_id "LTnewLTref_160009200"; CM024302.1 . transcript 138897 139967 . - . transcript_id "LTnewLTref_160009300.1"; gene_id "LTnewLTref_160009300:pseudogene" CM024302.1 . exon 138897 139967 . - . transcript_id "LTnewLTref_160009300.1"; gene_id "LTnewLTref_160009300:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 141368 143323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009400.1"; gene_id "LTnewLTref_160009400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 141368 143323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009400.1"; gene_id "LTnewLTref_160009400"; CM024302.1 Liftoff transcript 144535 147117 . - . transcript_id "LTnewLTref_160009500.1"; gene_id "LTnewLTref_160009500" CM024302.1 Liftoff CDS 144535 147117 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009500.1"; gene_id "LTnewLTref_160009500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 148360 148896 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009600.1"; gene_id "LTnewLTref_160009600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 148360 148896 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009600.1"; gene_id "LTnewLTref_160009600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 150622 154236 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009700.1"; gene_id "LTnewLTref_160009700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 150622 154236 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009700.1"; gene_id "LTnewLTref_160009700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 157413 158174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009800.1"; gene_id "LTnewLTref_160009800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 157413 158174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009800.1"; gene_id "LTnewLTref_160009800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 159268 159747 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160009900.1"; gene_id "LTnewLTref_160009900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 159268 159747 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160009900.1"; gene_id "LTnewLTref_160009900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 163054 163608 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010000.1"; gene_id "LTnewLTref_160010000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 163054 163608 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010000.1"; gene_id "LTnewLTref_160010000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 165045 168659 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010100.1"; gene_id "LTnewLTref_160010100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 165045 168659 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010100.1"; gene_id "LTnewLTref_160010100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 172662 173261 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010200.1"; gene_id "LTnewLTref_160010200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 172662 173261 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010200.1"; gene_id "LTnewLTref_160010200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 177378 178046 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010300.1"; gene_id "LTnewLTref_160010300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 177378 178046 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010300.1"; gene_id "LTnewLTref_160010300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 179888 183472 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010400.1"; gene_id "LTnewLTref_160010400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 179888 183472 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010400.1"; gene_id "LTnewLTref_160010400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 185939 186925 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010500.1"; gene_id "LTnewLTref_160010500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 185939 186925 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010500.1"; gene_id "LTnewLTref_160010500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 188696 189637 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010600.1"; gene_id "LTnewLTref_160010600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 188696 189637 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010600.1"; gene_id "LTnewLTref_160010600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 191098 192081 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160010700.1"; gene_id "LTnewLTref_160010700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 191098 192081 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010700.1"; gene_id "LTnewLTref_160010700"; CM024302.1 . transcript 192407 192923 . - . transcript_id "LTnewLTref_160010800.1"; gene_id "LTnewLTref_160010800:pseudogene" CM024302.1 . exon 192407 192923 . - . transcript_id "LTnewLTref_160010800.1"; gene_id "LTnewLTref_160010800:pseudogene"; CM024302.1 Liftoff transcript 193027 193515 . - . transcript_id "LTnewLTref_160010900.1"; gene_id "LTnewLTref_160010900" CM024302.1 Liftoff CDS 193027 193515 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160010900.1"; gene_id "LTnewLTref_160010900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 195194 196567 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011000.1"; gene_id "LTnewLTref_160011000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 195194 196567 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011000.1"; gene_id "LTnewLTref_160011000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 197189 199390 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011100.1"; gene_id "LTnewLTref_160011100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 197189 199390 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011100.1"; gene_id "LTnewLTref_160011100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 200598 200990 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011200.1"; gene_id "LTnewLTref_160011200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 200598 200990 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011200.1"; gene_id "LTnewLTref_160011200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 201464 201856 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011300.1"; gene_id "LTnewLTref_160011300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 201464 201856 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011300.1"; gene_id "LTnewLTref_160011300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 203273 204490 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011400.1"; gene_id "LTnewLTref_160011400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 203273 204490 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011400.1"; gene_id "LTnewLTref_160011400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 206191 211719 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011500.1"; gene_id "LTnewLTref_160011500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 206191 211719 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011500.1"; gene_id "LTnewLTref_160011500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 214359 214751 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011600.1"; gene_id "LTnewLTref_160011600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 214359 214751 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011600.1"; gene_id "LTnewLTref_160011600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 215213 215605 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011700.1"; gene_id "LTnewLTref_160011700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 215213 215605 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011700.1"; gene_id "LTnewLTref_160011700"; CM024302.1 . transcript 216395 219818 . - . transcript_id "LTnewLTref_160011800.1"; gene_id "LTnewLTref_160011800:pseudogene" CM024302.1 . exon 216395 219818 . - . transcript_id "LTnewLTref_160011800.1"; gene_id "LTnewLTref_160011800:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 220509 222464 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160011900.1"; gene_id "LTnewLTref_160011900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 220509 222464 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160011900.1"; gene_id "LTnewLTref_160011900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 223015 225115 0.52 - . transcript_id "LTnewLTref_160012000.1"; gene_id "LTnewLTref_160012000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 223015 224941 0.52 - 1 transcript_id "LTnewLTref_160012000.1"; gene_id "LTnewLTref_160012000"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 225102 225115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012000.1"; gene_id "LTnewLTref_160012000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 226156 226473 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012100.1"; gene_id "LTnewLTref_160012100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 226156 226473 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012100.1"; gene_id "LTnewLTref_160012100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 227454 228005 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012200.1"; gene_id "LTnewLTref_160012200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 227454 228005 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012200.1"; gene_id "LTnewLTref_160012200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 228917 230791 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012300.1"; gene_id "LTnewLTref_160012300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 228917 230791 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012300.1"; gene_id "LTnewLTref_160012300"; CM024302.1 . transcript 232393 234420 . - . transcript_id "LTnewLTref_160012400.1"; gene_id "LTnewLTref_160012400:pseudogene" CM024302.1 . exon 232393 234420 . - . transcript_id "LTnewLTref_160012400.1"; gene_id "LTnewLTref_160012400:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 235952 237295 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012500.1"; gene_id "LTnewLTref_160012500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 235952 237295 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012500.1"; gene_id "LTnewLTref_160012500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 238287 239942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012600.1"; gene_id "LTnewLTref_160012600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 238287 239942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012600.1"; gene_id "LTnewLTref_160012600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 240748 243297 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012700.1"; gene_id "LTnewLTref_160012700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 240748 243297 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012700.1"; gene_id "LTnewLTref_160012700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 244882 247869 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160012800.1"; gene_id "LTnewLTref_160012800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 244882 247869 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012800.1"; gene_id "LTnewLTref_160012800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 248508 250142 0.74 - . transcript_id "LTnewLTref_160012900.1"; gene_id "LTnewLTref_160012900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 248508 250060 0.74 - 2 transcript_id "LTnewLTref_160012900.1"; gene_id "LTnewLTref_160012900"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 250139 250142 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160012900.1"; gene_id "LTnewLTref_160012900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 250984 256671 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013000.1"; gene_id "LTnewLTref_160013000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 250984 256671 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013000.1"; gene_id "LTnewLTref_160013000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 258115 260337 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013100.1"; gene_id "LTnewLTref_160013100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 258115 260337 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013100.1"; gene_id "LTnewLTref_160013100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 261078 262877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013200.1"; gene_id "LTnewLTref_160013200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 261078 262877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013200.1"; gene_id "LTnewLTref_160013200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 265719 266711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013300.1"; gene_id "LTnewLTref_160013300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 265719 266711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013300.1"; gene_id "LTnewLTref_160013300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 269051 269503 0.82 - . transcript_id "LTnewLTref_160013400.1"; gene_id "LTnewLTref_160013400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 269051 269098 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013400.1"; gene_id "LTnewLTref_160013400"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 269180 269503 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013400.1"; gene_id "LTnewLTref_160013400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 269594 271345 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013500.1"; gene_id "LTnewLTref_160013500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 269594 271345 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013500.1"; gene_id "LTnewLTref_160013500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 273306 273506 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013600.1"; gene_id "LTnewLTref_160013600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 273306 273506 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013600.1"; gene_id "LTnewLTref_160013600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 274678 277740 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_160013700.1"; gene_id "LTnewLTref_160013700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 274678 277740 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013700.1"; gene_id "LTnewLTref_160013700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 274678 279564 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013700.2"; gene_id "LTnewLTref_160013700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 274678 279564 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013700.2"; gene_id "LTnewLTref_160013700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 274678 291606 0.2 - . transcript_id "LTnewLTref_160013700.3"; gene_id "LTnewLTref_160013700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 274678 285529 0.25 - 1 transcript_id "LTnewLTref_160013700.3"; gene_id "LTnewLTref_160013700"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 285605 291606 0.2 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013700.3"; gene_id "LTnewLTref_160013700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 293745 295118 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013800.1"; gene_id "LTnewLTref_160013800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 293745 295118 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013800.1"; gene_id "LTnewLTref_160013800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 296282 298531 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160013900.1"; gene_id "LTnewLTref_160013900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 296282 298531 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160013900.1"; gene_id "LTnewLTref_160013900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 299902 301707 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014000.1"; gene_id "LTnewLTref_160014000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 299902 301707 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014000.1"; gene_id "LTnewLTref_160014000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 302508 304409 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_160014100.1"; gene_id "LTnewLTref_160014100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 302508 304409 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014100.1"; gene_id "LTnewLTref_160014100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 305790 306707 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014200.1"; gene_id "LTnewLTref_160014200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 305790 306707 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014200.1"; gene_id "LTnewLTref_160014200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 307980 310385 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014300.1"; gene_id "LTnewLTref_160014300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 307980 310385 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014300.1"; gene_id "LTnewLTref_160014300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 311361 312785 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014400.1"; gene_id "LTnewLTref_160014400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 311361 312785 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014400.1"; gene_id "LTnewLTref_160014400"; CM024302.1 . transcript 313802 314591 . - . transcript_id "LTnewLTref_160014500.1"; gene_id "LTnewLTref_160014500:pseudogene" CM024302.1 . exon 313802 314591 . - . transcript_id "LTnewLTref_160014500.1"; gene_id "LTnewLTref_160014500:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 315829 317883 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014600.1"; gene_id "LTnewLTref_160014600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 315829 317883 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014600.1"; gene_id "LTnewLTref_160014600"; CM024302.1 . transcript 319018 319886 . - . transcript_id "LTnewLTref_160014700.1"; gene_id "LTnewLTref_160014700:pseudogene" CM024302.1 . exon 319018 319886 . - . transcript_id "LTnewLTref_160014700.1"; gene_id "LTnewLTref_160014700:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 321419 323407 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014800.1"; gene_id "LTnewLTref_160014800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 321419 323407 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014800.1"; gene_id "LTnewLTref_160014800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 324508 325401 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160014900.1"; gene_id "LTnewLTref_160014900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 324508 325401 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160014900.1"; gene_id "LTnewLTref_160014900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 326337 331304 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160015000.1"; gene_id "LTnewLTref_160015000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 326337 331304 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160015000.1"; gene_id "LTnewLTref_160015000"; CM024302.1 . transcript 332519 332879 . - . transcript_id "LTnewLTref_160015100.1"; gene_id "LTnewLTref_160015100:pseudogene" CM024302.1 . exon 332519 332879 . - . transcript_id "LTnewLTref_160015100.1"; gene_id "LTnewLTref_160015100:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 334123 334734 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160015200.1"; gene_id "LTnewLTref_160015200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 334123 334734 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160015200.1"; gene_id "LTnewLTref_160015200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 340407 341069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015300.1"; gene_id "LTnewLTref_160015300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 340407 341069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015300.1"; gene_id "LTnewLTref_160015300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 341341 341679 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015400.1"; gene_id "LTnewLTref_160015400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 341341 341679 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015400.1"; gene_id "LTnewLTref_160015400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 341997 343391 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015500.1"; gene_id "LTnewLTref_160015500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 341997 343391 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015500.1"; gene_id "LTnewLTref_160015500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 343958 345424 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015600.1"; gene_id "LTnewLTref_160015600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 343958 345424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015600.1"; gene_id "LTnewLTref_160015600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 346137 348422 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015700.1"; gene_id "LTnewLTref_160015700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 346137 348422 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015700.1"; gene_id "LTnewLTref_160015700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 352265 355741 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015800.1"; gene_id "LTnewLTref_160015800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 352265 355741 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015800.1"; gene_id "LTnewLTref_160015800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 358913 360334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160015900.1"; gene_id "LTnewLTref_160015900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 358913 360334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160015900.1"; gene_id "LTnewLTref_160015900"; CM024302.1 . transcript 362465 362788 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016000.1"; gene_id "LTnewLTref_160016000" CM024302.1 . CDS 362465 362788 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160016000.1"; gene_id "LTnewLTref_160016000"; CM024302.1 . transcript 362946 365187 . + . transcript_id "LTnewLTref_160016100.1"; gene_id "LTnewLTref_160016100:pseudogene" CM024302.1 . exon 362946 363158 . + . transcript_id "LTnewLTref_160016100.1"; gene_id "LTnewLTref_160016100:pseudogene"; CM024302.1 . exon 363161 364282 . + . transcript_id "LTnewLTref_160016100.1"; gene_id "LTnewLTref_160016100:pseudogene"; CM024302.1 . exon 364288 365187 . + . transcript_id "LTnewLTref_160016100.1"; gene_id "LTnewLTref_160016100:pseudogene"; CM024302.1 . transcript 364311 364841 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016200.1"; gene_id "LTnewLTref_160016200:pseudogene" CM024302.1 . exon 364311 364841 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016200.1"; gene_id "LTnewLTref_160016200:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 364339 365199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160016300.1"; gene_id "LTnewLTref_160016300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 364339 364437 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016300.1"; gene_id "LTnewLTref_160016300"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 364489 365199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016300.1"; gene_id "LTnewLTref_160016300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 370185 373190 0.92 + . transcript_id "LTnewLTref_160016400.1"; gene_id "LTnewLTref_160016400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 370185 372428 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016400.1"; gene_id "LTnewLTref_160016400"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 372480 373190 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016400.1"; gene_id "LTnewLTref_160016400"; CM024302.1 . transcript 372302 372832 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016500.1"; gene_id "LTnewLTref_160016500:pseudogene" CM024302.1 . exon 372302 372832 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016500.1"; gene_id "LTnewLTref_160016500:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 374255 375667 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160016600.1"; gene_id "LTnewLTref_160016600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 374255 375667 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016600.1"; gene_id "LTnewLTref_160016600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 375693 377177 0.53 + . transcript_id "LTnewLTref_160016700.1"; gene_id "LTnewLTref_160016700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 375693 376415 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016700.1"; gene_id "LTnewLTref_160016700"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 376467 377177 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016700.1"; gene_id "LTnewLTref_160016700"; CM024302.1 . transcript 376289 376819 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016800.1"; gene_id "LTnewLTref_160016800:pseudogene" CM024302.1 . exon 376289 376819 . - . transcript_id "LTnewLTref_160016800.1"; gene_id "LTnewLTref_160016800:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 379275 382096 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160016900.1"; gene_id "LTnewLTref_160016900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 379275 381335 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016900.1"; gene_id "LTnewLTref_160016900"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 381386 382096 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160016900.1"; gene_id "LTnewLTref_160016900"; CM024302.1 . transcript 379655 379906 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017000.1"; gene_id "LTnewLTref_160017000:pseudogene" CM024302.1 . exon 379655 379906 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017000.1"; gene_id "LTnewLTref_160017000:pseudogene"; CM024302.1 . transcript 379854 382084 . + . transcript_id "LTnewLTref_160017100.1"; gene_id "LTnewLTref_160017100:pseudogene" CM024302.1 . exon 379854 381335 . + . transcript_id "LTnewLTref_160017100.1"; gene_id "LTnewLTref_160017100:pseudogene"; CM024302.1 . exon 381401 382084 . + . transcript_id "LTnewLTref_160017100.1"; gene_id "LTnewLTref_160017100:pseudogene"; CM024302.1 Liftoff transcript 380963 381250 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017200.1"; gene_id "LTnewLTref_160017200" CM024302.1 Liftoff CDS 380963 381250 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160017200.1"; gene_id "LTnewLTref_160017200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 383602 383922 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_160017300.1"; gene_id "LTnewLTref_160017300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 383602 383922 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160017300.1"; gene_id "LTnewLTref_160017300"; CM024302.1 . transcript 388598 390829 . + . transcript_id "LTnewLTref_160017400.1"; gene_id "LTnewLTref_160017400:pseudogene" CM024302.1 . exon 388598 390829 . + . transcript_id "LTnewLTref_160017400.1"; gene_id "LTnewLTref_160017400:pseudogene"; CM024302.1 . transcript 389956 390486 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017500.1"; gene_id "LTnewLTref_160017500:pseudogene" CM024302.1 . exon 389956 390486 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017500.1"; gene_id "LTnewLTref_160017500:pseudogene"; CM024302.1 Liftoff transcript 390610 390852 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017600.1"; gene_id "LTnewLTref_160017600" CM024302.1 Liftoff CDS 390610 390852 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160017600.1"; gene_id "LTnewLTref_160017600"; CM024302.1 . transcript 390997 391267 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017700.1"; gene_id "LTnewLTref_160017700:pseudogene" CM024302.1 . exon 390997 391267 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017700.1"; gene_id "LTnewLTref_160017700:pseudogene"; CM024302.1 . transcript 392531 392789 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017800.1"; gene_id "LTnewLTref_160017800:pseudogene" CM024302.1 . exon 392531 392789 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017800.1"; gene_id "LTnewLTref_160017800:pseudogene"; CM024302.1 Liftoff transcript 394863 395096 . - . transcript_id "LTnewLTref_160017900.1"; gene_id "LTnewLTref_160017900" CM024302.1 Liftoff CDS 394863 395096 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160017900.1"; gene_id "LTnewLTref_160017900"; CM024302.1 . transcript 395257 397746 . + . transcript_id "LTnewLTref_160018000.1"; gene_id "LTnewLTref_160018000:pseudogene" CM024302.1 . exon 395257 397746 . + . transcript_id "LTnewLTref_160018000.1"; gene_id "LTnewLTref_160018000:pseudogene"; CM024302.1 . transcript 396804 397400 . - . transcript_id "LTnewLTref_160018100.1"; gene_id "LTnewLTref_160018100:pseudogene" CM024302.1 . exon 396804 397400 . - . transcript_id "LTnewLTref_160018100.1"; gene_id "LTnewLTref_160018100:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 399167 402103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160018200.1"; gene_id "LTnewLTref_160018200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 399167 402103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160018200.1"; gene_id "LTnewLTref_160018200"; CM024302.1 . transcript 403116 403510 . + . transcript_id "LTnewLTref_160018300.1"; gene_id "LTnewLTref_160018300:pseudogene" CM024302.1 . exon 403116 403510 . + . transcript_id "LTnewLTref_160018300.1"; gene_id "LTnewLTref_160018300:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 404414 405964 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160018400.1"; gene_id "LTnewLTref_160018400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 404414 405964 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160018400.1"; gene_id "LTnewLTref_160018400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 409943 411862 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160018500.1"; gene_id "LTnewLTref_160018500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 409943 411862 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160018500.1"; gene_id "LTnewLTref_160018500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 414075 415058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160018600.1"; gene_id "LTnewLTref_160018600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 414075 415058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160018600.1"; gene_id "LTnewLTref_160018600"; CM024302.1 . transcript 419285 425700 . + . transcript_id "LTnewLTref_160018700.1"; gene_id "LTnewLTref_160018700:pseudogene" CM024302.1 . exon 419285 425700 . + . transcript_id "LTnewLTref_160018700.1"; gene_id "LTnewLTref_160018700:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 427380 430088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160018800.1"; gene_id "LTnewLTref_160018800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 427380 430088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160018800.1"; gene_id "LTnewLTref_160018800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 432609 434198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160018900.1"; gene_id "LTnewLTref_160018900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 432609 434198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160018900.1"; gene_id "LTnewLTref_160018900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 436072 436419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160019000.1"; gene_id "LTnewLTref_160019000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 436072 436419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160019000.1"; gene_id "LTnewLTref_160019000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 436454 437022 0.83 + . transcript_id "LTnewLTref_160019100.1"; gene_id "LTnewLTref_160019100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 436454 436598 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160019100.1"; gene_id "LTnewLTref_160019100"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 436964 437022 0.83 + 2 transcript_id "LTnewLTref_160019100.1"; gene_id "LTnewLTref_160019100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 438212 438661 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_160019200.1"; gene_id "LTnewLTref_160019200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 438212 438661 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160019200.1"; gene_id "LTnewLTref_160019200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 439328 440041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160019300.1"; gene_id "LTnewLTref_160019300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 439328 440041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160019300.1"; gene_id "LTnewLTref_160019300"; CM024302.1 Aragorn_1.2.36 transcript 440407 440481 . - . transcript_id "LTnewLTref_160019400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_160019400" CM024302.1 Aragorn_1.2.36 exon 440407 440481 . - . transcript_id "LTnewLTref_160019400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_160019400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 440942 442864 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160019500.1"; gene_id "LTnewLTref_160019500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 440942 442864 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160019500.1"; gene_id "LTnewLTref_160019500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 444029 444382 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160019600.1"; gene_id "LTnewLTref_160019600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 444029 444382 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160019600.1"; gene_id "LTnewLTref_160019600"; CM024302.1 Liftoff transcript 445426 446502 . - . transcript_id "LTnewLTref_160019700.1"; gene_id "LTnewLTref_160019700" CM024302.1 Liftoff CDS 445426 446502 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160019700.1"; gene_id "LTnewLTref_160019700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 448121 449581 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160019800.1"; gene_id "LTnewLTref_160019800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 448121 449581 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160019800.1"; gene_id "LTnewLTref_160019800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 451844 453454 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160019900.1"; gene_id "LTnewLTref_160019900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 451844 453454 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160019900.1"; gene_id "LTnewLTref_160019900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 454541 458863 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020000.1"; gene_id "LTnewLTref_160020000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 454541 458863 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020000.1"; gene_id "LTnewLTref_160020000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 460055 461155 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020100.1"; gene_id "LTnewLTref_160020100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 460055 461155 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020100.1"; gene_id "LTnewLTref_160020100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 462114 465944 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020200.1"; gene_id "LTnewLTref_160020200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 462114 465944 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020200.1"; gene_id "LTnewLTref_160020200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 467476 474054 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020300.1"; gene_id "LTnewLTref_160020300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 467476 474054 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020300.1"; gene_id "LTnewLTref_160020300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 475857 481298 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020400.1"; gene_id "LTnewLTref_160020400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 475857 481298 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020400.1"; gene_id "LTnewLTref_160020400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 482319 488831 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020500.1"; gene_id "LTnewLTref_160020500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 482319 488831 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020500.1"; gene_id "LTnewLTref_160020500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 485920 488831 0.92 - . transcript_id "LTnewLTref_160020500.2"; gene_id "LTnewLTref_160020500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 485920 485966 0.92 - 2 transcript_id "LTnewLTref_160020500.2"; gene_id "LTnewLTref_160020500"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 486023 488831 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020500.2"; gene_id "LTnewLTref_160020500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 491276 491718 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020600.1"; gene_id "LTnewLTref_160020600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 491276 491443 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020600.1"; gene_id "LTnewLTref_160020600"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 491500 491718 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020600.1"; gene_id "LTnewLTref_160020600"; CM024302.1 Liftoff transcript 493157 498781 . - . transcript_id "LTnewLTref_160020700.1"; gene_id "LTnewLTref_160020700" CM024302.1 Liftoff CDS 493157 498781 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020700.1"; gene_id "LTnewLTref_160020700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 499544 506095 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160020800.1"; gene_id "LTnewLTref_160020800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 499544 506095 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020800.1"; gene_id "LTnewLTref_160020800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 507405 507704 0.94 - . transcript_id "LTnewLTref_160020900.1"; gene_id "LTnewLTref_160020900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 507405 507704 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160020900.1"; gene_id "LTnewLTref_160020900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 508311 510509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021000.1"; gene_id "LTnewLTref_160021000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 508311 510509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021000.1"; gene_id "LTnewLTref_160021000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 511751 514753 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021100.1"; gene_id "LTnewLTref_160021100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 511751 514753 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021100.1"; gene_id "LTnewLTref_160021100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 518158 518499 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021200.1"; gene_id "LTnewLTref_160021200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 518158 518499 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021200.1"; gene_id "LTnewLTref_160021200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 520996 521337 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021300.1"; gene_id "LTnewLTref_160021300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 520996 521337 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021300.1"; gene_id "LTnewLTref_160021300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 523638 527795 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021400.1"; gene_id "LTnewLTref_160021400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 523638 527795 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021400.1"; gene_id "LTnewLTref_160021400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 524515 527795 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_160021400.2"; gene_id "LTnewLTref_160021400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 524515 524531 0.51 - 2 transcript_id "LTnewLTref_160021400.2"; gene_id "LTnewLTref_160021400"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 524627 527795 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021400.2"; gene_id "LTnewLTref_160021400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 529763 541045 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021500.1"; gene_id "LTnewLTref_160021500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 529763 541045 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021500.1"; gene_id "LTnewLTref_160021500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 542863 548295 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021600.1"; gene_id "LTnewLTref_160021600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 542863 548295 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021600.1"; gene_id "LTnewLTref_160021600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 550309 552108 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021700.1"; gene_id "LTnewLTref_160021700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 550309 552108 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021700.1"; gene_id "LTnewLTref_160021700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 554423 554749 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021800.1"; gene_id "LTnewLTref_160021800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 554423 554749 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021800.1"; gene_id "LTnewLTref_160021800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 556326 556874 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160021900.1"; gene_id "LTnewLTref_160021900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 556326 556874 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160021900.1"; gene_id "LTnewLTref_160021900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 559249 559629 0.67 - . transcript_id "LTnewLTref_160022000.1"; gene_id "LTnewLTref_160022000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 559249 559433 0.67 - 2 transcript_id "LTnewLTref_160022000.1"; gene_id "LTnewLTref_160022000"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 559560 559629 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022000.1"; gene_id "LTnewLTref_160022000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 559809 562610 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022100.1"; gene_id "LTnewLTref_160022100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 559809 562610 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022100.1"; gene_id "LTnewLTref_160022100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 564395 565258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022200.1"; gene_id "LTnewLTref_160022200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 564395 565258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022200.1"; gene_id "LTnewLTref_160022200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 566473 567063 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022300.1"; gene_id "LTnewLTref_160022300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 566473 567063 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022300.1"; gene_id "LTnewLTref_160022300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 567873 569441 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022400.1"; gene_id "LTnewLTref_160022400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 567873 569441 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022400.1"; gene_id "LTnewLTref_160022400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 571660 573240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022500.1"; gene_id "LTnewLTref_160022500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 571660 573240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022500.1"; gene_id "LTnewLTref_160022500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 576023 577822 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022600.1"; gene_id "LTnewLTref_160022600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 576023 577822 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022600.1"; gene_id "LTnewLTref_160022600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 579355 581154 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022700.1"; gene_id "LTnewLTref_160022700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 579355 581154 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022700.1"; gene_id "LTnewLTref_160022700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 582731 584530 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160022800.1"; gene_id "LTnewLTref_160022800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 582731 584530 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022800.1"; gene_id "LTnewLTref_160022800"; CM024302.1 Liftoff transcript 585971 586234 . - . transcript_id "LTnewLTref_160022900.1"; gene_id "LTnewLTref_160022900" CM024302.1 Liftoff CDS 585971 586234 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160022900.1"; gene_id "LTnewLTref_160022900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 587433 593075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023000.1"; gene_id "LTnewLTref_160023000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 587433 593075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023000.1"; gene_id "LTnewLTref_160023000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 588349 593075 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_160023000.2"; gene_id "LTnewLTref_160023000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 588349 588384 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023000.2"; gene_id "LTnewLTref_160023000"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 588450 593075 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023000.2"; gene_id "LTnewLTref_160023000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 590989 593075 0.37 - . transcript_id "LTnewLTref_160023000.3"; gene_id "LTnewLTref_160023000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 590989 591049 0.64 - 1 transcript_id "LTnewLTref_160023000.3"; gene_id "LTnewLTref_160023000"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 591142 593075 0.38 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023000.3"; gene_id "LTnewLTref_160023000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 593715 594620 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023100.1"; gene_id "LTnewLTref_160023100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 593715 594620 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023100.1"; gene_id "LTnewLTref_160023100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 596115 603292 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_160023200.1"; gene_id "LTnewLTref_160023200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 596115 602321 0.57 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023200.1"; gene_id "LTnewLTref_160023200"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 602366 603292 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023200.1"; gene_id "LTnewLTref_160023200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 601181 602282 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_160023200.2"; gene_id "LTnewLTref_160023200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 601181 601192 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023200.2"; gene_id "LTnewLTref_160023200"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 601236 602282 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023200.2"; gene_id "LTnewLTref_160023200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 602359 603292 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_160023200.3"; gene_id "LTnewLTref_160023200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 602359 602384 0.96 - 2 transcript_id "LTnewLTref_160023200.3"; gene_id "LTnewLTref_160023200"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 602452 603292 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023200.3"; gene_id "LTnewLTref_160023200"; CM024302.1 . transcript 606887 608953 . - . transcript_id "LTnewLTref_160023300.1"; gene_id "LTnewLTref_160023300:pseudogene" CM024302.1 . exon 606887 608953 . - . transcript_id "LTnewLTref_160023300.1"; gene_id "LTnewLTref_160023300:pseudogene"; CM024302.1 . transcript 613455 613861 . - . transcript_id "LTnewLTref_160023400.1"; gene_id "LTnewLTref_160023400:pseudogene" CM024302.1 . exon 613455 613550 . - . transcript_id "LTnewLTref_160023400.1"; gene_id "LTnewLTref_160023400:pseudogene"; CM024302.1 . exon 613553 613861 . - . transcript_id "LTnewLTref_160023400.1"; gene_id "LTnewLTref_160023400:pseudogene"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 614683 616605 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023500.1"; gene_id "LTnewLTref_160023500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 614683 616605 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023500.1"; gene_id "LTnewLTref_160023500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 619315 620409 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023600.1"; gene_id "LTnewLTref_160023600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 619315 620409 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023600.1"; gene_id "LTnewLTref_160023600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 621637 623349 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023700.1"; gene_id "LTnewLTref_160023700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 621637 623349 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023700.1"; gene_id "LTnewLTref_160023700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 624797 625138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023800.1"; gene_id "LTnewLTref_160023800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 624797 625138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023800.1"; gene_id "LTnewLTref_160023800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 626570 630022 1 - . transcript_id "LTnewLTref_160023900.1"; gene_id "LTnewLTref_160023900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 626570 630022 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_160023900.1"; gene_id "LTnewLTref_160023900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 632867 634198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024000.1"; gene_id "LTnewLTref_160024000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 632867 634198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024000.1"; gene_id "LTnewLTref_160024000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 634777 638796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024100.1"; gene_id "LTnewLTref_160024100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 634777 638796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024100.1"; gene_id "LTnewLTref_160024100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 640549 644244 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024200.1"; gene_id "LTnewLTref_160024200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 640549 644244 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024200.1"; gene_id "LTnewLTref_160024200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 645558 647636 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024300.1"; gene_id "LTnewLTref_160024300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 645558 647636 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024300.1"; gene_id "LTnewLTref_160024300"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 648591 649616 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024400.1"; gene_id "LTnewLTref_160024400" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 648591 649616 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024400.1"; gene_id "LTnewLTref_160024400"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 650608 653856 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024500.1"; gene_id "LTnewLTref_160024500" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 650608 653856 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024500.1"; gene_id "LTnewLTref_160024500"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 655763 656611 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024600.1"; gene_id "LTnewLTref_160024600" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 655763 656611 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024600.1"; gene_id "LTnewLTref_160024600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 657686 659593 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024700.1"; gene_id "LTnewLTref_160024700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 657686 659593 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024700.1"; gene_id "LTnewLTref_160024700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 661669 662475 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024800.1"; gene_id "LTnewLTref_160024800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 661669 662475 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024800.1"; gene_id "LTnewLTref_160024800"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 663908 665263 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160024900.1"; gene_id "LTnewLTref_160024900" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 663908 665263 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160024900.1"; gene_id "LTnewLTref_160024900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 666052 666771 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160025000.1"; gene_id "LTnewLTref_160025000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 666052 666771 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025000.1"; gene_id "LTnewLTref_160025000"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 667988 673443 0.84 + . transcript_id "LTnewLTref_160025100.1"; gene_id "LTnewLTref_160025100" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 667988 668500 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025100.1"; gene_id "LTnewLTref_160025100"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 668548 673443 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025100.1"; gene_id "LTnewLTref_160025100"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 675669 677741 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160025200.1"; gene_id "LTnewLTref_160025200" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 675669 677741 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025200.1"; gene_id "LTnewLTref_160025200"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 680583 689515 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_160025300.1"; gene_id "LTnewLTref_160025300" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 680583 688745 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025300.1"; gene_id "LTnewLTref_160025300"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 688793 689515 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025300.1"; gene_id "LTnewLTref_160025300"; CM024302.1 Liftoff transcript 681924 682586 . - . transcript_id "LTnewLTref_160025400.1"; gene_id "LTnewLTref_160025400" CM024302.1 Liftoff CDS 681924 682586 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160025400.1"; gene_id "LTnewLTref_160025400"; CM024302.1 Liftoff transcript 682698 683084 . - . transcript_id "LTnewLTref_160025500.1"; gene_id "LTnewLTref_160025500" CM024302.1 Liftoff CDS 682698 683084 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160025500.1"; gene_id "LTnewLTref_160025500"; CM024302.1 Liftoff transcript 683706 683996 . - . transcript_id "LTnewLTref_160025600.1"; gene_id "LTnewLTref_160025600" CM024302.1 Liftoff CDS 683706 683996 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_160025600.1"; gene_id "LTnewLTref_160025600"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 689563 691046 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_160025700.1"; gene_id "LTnewLTref_160025700" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 689563 690310 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025700.1"; gene_id "LTnewLTref_160025700"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 690361 691046 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_160025700.1"; gene_id "LTnewLTref_160025700"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 691312 692158 0.58 + . transcript_id "LTnewLTref_160025800.1"; gene_id "LTnewLTref_160025800" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 691312 692012 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025800.1"; gene_id "LTnewLTref_160025800"; CM024302.1 AUGUSTUS CDS 692092 692158 0.74 + 1 transcript_id "LTnewLTref_160025800.1"; gene_id "LTnewLTref_160025800"; CM024302.1 Liftoff transcript 692341 693999 . + . transcript_id "LTnewLTref_160025900.1"; gene_id "LTnewLTref_160025900" CM024302.1 Liftoff CDS 692341 693999 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_160025900.1"; gene_id "LTnewLTref_160025900"; CM024302.1 AUGUSTUS transcript 694918 695334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_160026000.1"; gene_id "LTnewLTref_160026000" CM024302.1 AUGUSTUS CDS 694918 695334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_160026000.1"; gene_id "LTnewLTref_160026000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 1431 1897 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_170005000.1"; gene_id "LTnewLTref_170005000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 1431 1897 0.88 + 2 transcript_id "LTnewLTref_170005000.1"; gene_id "LTnewLTref_170005000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 6505 8829 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005100.1"; gene_id "LTnewLTref_170005100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 6505 8829 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005100.1"; gene_id "LTnewLTref_170005100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 9892 10386 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005200.1"; gene_id "LTnewLTref_170005200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 9892 10386 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005200.1"; gene_id "LTnewLTref_170005200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 11103 11768 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005300.1"; gene_id "LTnewLTref_170005300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 11103 11768 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005300.1"; gene_id "LTnewLTref_170005300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 12528 13205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005400.1"; gene_id "LTnewLTref_170005400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 12528 13205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005400.1"; gene_id "LTnewLTref_170005400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 14895 15530 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005500.1"; gene_id "LTnewLTref_170005500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 14895 15530 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005500.1"; gene_id "LTnewLTref_170005500"; CM024303.1 Liftoff transcript 16359 17159 . - . transcript_id "LTnewLTref_170005600.1"; gene_id "LTnewLTref_170005600" CM024303.1 Liftoff CDS 16359 17159 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005600.1"; gene_id "LTnewLTref_170005600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 17925 18638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005700.1"; gene_id "LTnewLTref_170005700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 17925 18638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005700.1"; gene_id "LTnewLTref_170005700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 20202 21863 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005800.1"; gene_id "LTnewLTref_170005800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 20202 21863 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005800.1"; gene_id "LTnewLTref_170005800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 22967 23530 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170005900.1"; gene_id "LTnewLTref_170005900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 22967 23530 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170005900.1"; gene_id "LTnewLTref_170005900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 25454 26803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006000.1"; gene_id "LTnewLTref_170006000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 25454 26803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006000.1"; gene_id "LTnewLTref_170006000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 29827 31176 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006100.1"; gene_id "LTnewLTref_170006100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 29827 31176 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006100.1"; gene_id "LTnewLTref_170006100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 32019 33368 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006200.1"; gene_id "LTnewLTref_170006200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 32019 33368 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006200.1"; gene_id "LTnewLTref_170006200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 34205 35554 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006300.1"; gene_id "LTnewLTref_170006300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 34205 35554 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006300.1"; gene_id "LTnewLTref_170006300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 36387 37736 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006400.1"; gene_id "LTnewLTref_170006400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 36387 37736 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006400.1"; gene_id "LTnewLTref_170006400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 38572 39921 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006500.1"; gene_id "LTnewLTref_170006500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 38572 39921 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006500.1"; gene_id "LTnewLTref_170006500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 40756 42105 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006600.1"; gene_id "LTnewLTref_170006600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 40756 42105 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006600.1"; gene_id "LTnewLTref_170006600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 42937 44286 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006700.1"; gene_id "LTnewLTref_170006700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 42937 44286 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006700.1"; gene_id "LTnewLTref_170006700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 45123 46472 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006800.1"; gene_id "LTnewLTref_170006800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 45123 46472 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006800.1"; gene_id "LTnewLTref_170006800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 47308 48657 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170006900.1"; gene_id "LTnewLTref_170006900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 47308 48657 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170006900.1"; gene_id "LTnewLTref_170006900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 53057 57197 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_170007000.1"; gene_id "LTnewLTref_170007000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 53057 53755 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007000.1"; gene_id "LTnewLTref_170007000"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 53808 57197 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007000.1"; gene_id "LTnewLTref_170007000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 61032 61375 0.5 - . transcript_id "LTnewLTref_170007100.1"; gene_id "LTnewLTref_170007100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 61032 61251 0.5 - 1 transcript_id "LTnewLTref_170007100.1"; gene_id "LTnewLTref_170007100"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 61344 61375 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007100.1"; gene_id "LTnewLTref_170007100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 65458 69702 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170007200.1"; gene_id "LTnewLTref_170007200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 65458 69702 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007200.1"; gene_id "LTnewLTref_170007200"; CM024303.1 . transcript 74677 78510 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007300.1"; gene_id "LTnewLTref_170007300:pseudogene" CM024303.1 . exon 74677 77019 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007300.1"; gene_id "LTnewLTref_170007300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 77022 77852 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007300.1"; gene_id "LTnewLTref_170007300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 77855 77863 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007300.1"; gene_id "LTnewLTref_170007300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 77866 78510 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007300.1"; gene_id "LTnewLTref_170007300:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 80356 84346 0.57 - . transcript_id "LTnewLTref_170007400.1"; gene_id "LTnewLTref_170007400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 80356 80456 0.57 - 2 transcript_id "LTnewLTref_170007400.1"; gene_id "LTnewLTref_170007400"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 80542 84346 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007400.1"; gene_id "LTnewLTref_170007400"; CM024303.1 . transcript 86143 90007 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007500.1"; gene_id "LTnewLTref_170007500:pseudogene" CM024303.1 . exon 86143 86295 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007500.1"; gene_id "LTnewLTref_170007500:pseudogene"; CM024303.1 . exon 86298 88580 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007500.1"; gene_id "LTnewLTref_170007500:pseudogene"; CM024303.1 . exon 88583 90007 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007500.1"; gene_id "LTnewLTref_170007500:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 91842 95834 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170007600.1"; gene_id "LTnewLTref_170007600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 91842 95834 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007600.1"; gene_id "LTnewLTref_170007600"; CM024303.1 . transcript 97583 101450 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007700.1"; gene_id "LTnewLTref_170007700:pseudogene" CM024303.1 . exon 97583 99772 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007700.1"; gene_id "LTnewLTref_170007700:pseudogene"; CM024303.1 . exon 99775 100083 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007700.1"; gene_id "LTnewLTref_170007700:pseudogene"; CM024303.1 . exon 100086 101450 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007700.1"; gene_id "LTnewLTref_170007700:pseudogene"; CM024303.1 . transcript 104345 106350 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007800.1"; gene_id "LTnewLTref_170007800:pseudogene" CM024303.1 . exon 104345 106350 . - . transcript_id "LTnewLTref_170007800.1"; gene_id "LTnewLTref_170007800:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 107156 108736 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170007900.1"; gene_id "LTnewLTref_170007900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 107156 108736 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170007900.1"; gene_id "LTnewLTref_170007900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 110574 111527 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008000.1"; gene_id "LTnewLTref_170008000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 110574 111527 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008000.1"; gene_id "LTnewLTref_170008000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 113211 115844 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008100.1"; gene_id "LTnewLTref_170008100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 113211 115844 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008100.1"; gene_id "LTnewLTref_170008100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 118975 120246 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008200.1"; gene_id "LTnewLTref_170008200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 118975 120246 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008200.1"; gene_id "LTnewLTref_170008200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 121828 123891 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008300.1"; gene_id "LTnewLTref_170008300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 121828 123891 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008300.1"; gene_id "LTnewLTref_170008300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 125286 128591 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008400.1"; gene_id "LTnewLTref_170008400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 125286 128591 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008400.1"; gene_id "LTnewLTref_170008400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 132710 134806 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008500.1"; gene_id "LTnewLTref_170008500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 132710 134806 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008500.1"; gene_id "LTnewLTref_170008500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 137428 140172 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008600.1"; gene_id "LTnewLTref_170008600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 137428 140172 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008600.1"; gene_id "LTnewLTref_170008600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 137428 141210 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008600.2"; gene_id "LTnewLTref_170008600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 137428 141210 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008600.2"; gene_id "LTnewLTref_170008600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 145052 146131 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008700.1"; gene_id "LTnewLTref_170008700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 145052 146131 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008700.1"; gene_id "LTnewLTref_170008700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 147947 150406 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008800.1"; gene_id "LTnewLTref_170008800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 147947 150406 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008800.1"; gene_id "LTnewLTref_170008800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 151137 151991 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170008900.1"; gene_id "LTnewLTref_170008900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 151137 151991 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170008900.1"; gene_id "LTnewLTref_170008900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 155475 156008 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009000.1"; gene_id "LTnewLTref_170009000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 155475 156008 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009000.1"; gene_id "LTnewLTref_170009000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 157045 159222 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009100.1"; gene_id "LTnewLTref_170009100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 157045 159222 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009100.1"; gene_id "LTnewLTref_170009100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 160251 161066 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009200.1"; gene_id "LTnewLTref_170009200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 160251 161066 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009200.1"; gene_id "LTnewLTref_170009200"; CM024303.1 Liftoff transcript 162247 166623 . - . transcript_id "LTnewLTref_170009300.1"; gene_id "LTnewLTref_170009300" CM024303.1 Liftoff CDS 162247 166623 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009300.1"; gene_id "LTnewLTref_170009300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 167998 168981 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009400.1"; gene_id "LTnewLTref_170009400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 167998 168981 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009400.1"; gene_id "LTnewLTref_170009400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 169488 174695 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009500.1"; gene_id "LTnewLTref_170009500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 169488 174695 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009500.1"; gene_id "LTnewLTref_170009500"; CM024303.1 . transcript 175503 175937 . - . transcript_id "LTnewLTref_170009600.1"; gene_id "LTnewLTref_170009600:pseudogene" CM024303.1 . exon 175503 175937 . - . transcript_id "LTnewLTref_170009600.1"; gene_id "LTnewLTref_170009600:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 177983 179770 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009700.1"; gene_id "LTnewLTref_170009700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 177983 179770 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009700.1"; gene_id "LTnewLTref_170009700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 180572 181120 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009800.1"; gene_id "LTnewLTref_170009800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 180572 181120 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009800.1"; gene_id "LTnewLTref_170009800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 182616 185018 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170009900.1"; gene_id "LTnewLTref_170009900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 182616 185018 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170009900.1"; gene_id "LTnewLTref_170009900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 186166 186993 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010000.1"; gene_id "LTnewLTref_170010000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 186166 186993 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010000.1"; gene_id "LTnewLTref_170010000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 190647 194235 0.69 - . transcript_id "LTnewLTref_170010100.1"; gene_id "LTnewLTref_170010100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 190647 194119 0.69 - 2 transcript_id "LTnewLTref_170010100.1"; gene_id "LTnewLTref_170010100"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 194172 194235 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010100.1"; gene_id "LTnewLTref_170010100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 198101 201273 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010200.1"; gene_id "LTnewLTref_170010200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 198101 199591 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010200.1"; gene_id "LTnewLTref_170010200"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 199666 201273 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010200.1"; gene_id "LTnewLTref_170010200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 206105 209305 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010300.1"; gene_id "LTnewLTref_170010300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 206105 209305 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010300.1"; gene_id "LTnewLTref_170010300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 210379 212010 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010400.1"; gene_id "LTnewLTref_170010400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 210379 212010 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010400.1"; gene_id "LTnewLTref_170010400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 214059 218009 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010500.1"; gene_id "LTnewLTref_170010500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 214059 218009 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010500.1"; gene_id "LTnewLTref_170010500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 219948 225803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010600.1"; gene_id "LTnewLTref_170010600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 219948 225803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010600.1"; gene_id "LTnewLTref_170010600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 228052 232809 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010700.1"; gene_id "LTnewLTref_170010700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 228052 232809 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010700.1"; gene_id "LTnewLTref_170010700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 234258 235226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010800.1"; gene_id "LTnewLTref_170010800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 234258 235226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010800.1"; gene_id "LTnewLTref_170010800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 236112 247220 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170010900.1"; gene_id "LTnewLTref_170010900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 236112 247220 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170010900.1"; gene_id "LTnewLTref_170010900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 254146 255747 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011000.1"; gene_id "LTnewLTref_170011000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 254146 255747 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011000.1"; gene_id "LTnewLTref_170011000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 258415 261993 0.61 - . transcript_id "LTnewLTref_170011100.1"; gene_id "LTnewLTref_170011100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 258415 261993 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011100.1"; gene_id "LTnewLTref_170011100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 263960 268240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011200.1"; gene_id "LTnewLTref_170011200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 263960 267717 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_170011200.1"; gene_id "LTnewLTref_170011200"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 267952 268240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011200.1"; gene_id "LTnewLTref_170011200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 270520 273612 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011300.1"; gene_id "LTnewLTref_170011300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 270520 273612 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011300.1"; gene_id "LTnewLTref_170011300"; CM024303.1 Liftoff transcript 275544 278327 . - . transcript_id "LTnewLTref_170011400.1"; gene_id "LTnewLTref_170011400" CM024303.1 Liftoff CDS 275544 278327 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011400.1"; gene_id "LTnewLTref_170011400"; CM024303.1 Liftoff transcript 281826 285383 . - . transcript_id "LTnewLTref_170011500.1"; gene_id "LTnewLTref_170011500" CM024303.1 Liftoff CDS 281826 285383 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011500.1"; gene_id "LTnewLTref_170011500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 286760 290623 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011600.1"; gene_id "LTnewLTref_170011600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 286760 290623 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011600.1"; gene_id "LTnewLTref_170011600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 292228 293115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011700.1"; gene_id "LTnewLTref_170011700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 292228 293115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011700.1"; gene_id "LTnewLTref_170011700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 294159 294989 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011800.1"; gene_id "LTnewLTref_170011800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 294159 294989 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011800.1"; gene_id "LTnewLTref_170011800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 295931 299566 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170011900.1"; gene_id "LTnewLTref_170011900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 295931 299566 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170011900.1"; gene_id "LTnewLTref_170011900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 300440 301597 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_170012000.1"; gene_id "LTnewLTref_170012000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 300440 301597 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012000.1"; gene_id "LTnewLTref_170012000"; CM024303.1 . transcript 302329 307494 . - . transcript_id "LTnewLTref_170012100.1"; gene_id "LTnewLTref_170012100" CM024303.1 . CDS 302329 307494 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012100.1"; gene_id "LTnewLTref_170012100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 310650 314054 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012200.1"; gene_id "LTnewLTref_170012200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 310650 314054 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012200.1"; gene_id "LTnewLTref_170012200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 316965 318464 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012300.1"; gene_id "LTnewLTref_170012300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 316965 318464 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012300.1"; gene_id "LTnewLTref_170012300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 319601 319912 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012400.1"; gene_id "LTnewLTref_170012400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 319601 319912 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012400.1"; gene_id "LTnewLTref_170012400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 322168 322620 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012500.1"; gene_id "LTnewLTref_170012500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 322168 322620 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012500.1"; gene_id "LTnewLTref_170012500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 323178 324344 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012600.1"; gene_id "LTnewLTref_170012600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 323178 324344 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012600.1"; gene_id "LTnewLTref_170012600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 324901 325353 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012700.1"; gene_id "LTnewLTref_170012700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 324901 325353 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012700.1"; gene_id "LTnewLTref_170012700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 326228 326518 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170012800.1"; gene_id "LTnewLTref_170012800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 326228 326518 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012800.1"; gene_id "LTnewLTref_170012800"; CM024303.1 Liftoff transcript 330327 331862 . - . transcript_id "LTnewLTref_170012900.1"; gene_id "LTnewLTref_170012900" CM024303.1 Liftoff CDS 330327 331862 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170012900.1"; gene_id "LTnewLTref_170012900"; CM024303.1 Liftoff transcript 333024 334271 . - . transcript_id "LTnewLTref_170013000.1"; gene_id "LTnewLTref_170013000" CM024303.1 Liftoff CDS 333024 334271 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013000.1"; gene_id "LTnewLTref_170013000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 336624 340565 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170013100.1"; gene_id "LTnewLTref_170013100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 336624 340565 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013100.1"; gene_id "LTnewLTref_170013100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 342104 343162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170013200.1"; gene_id "LTnewLTref_170013200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 342104 343162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013200.1"; gene_id "LTnewLTref_170013200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 343856 345829 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170013300.1"; gene_id "LTnewLTref_170013300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 343856 345829 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013300.1"; gene_id "LTnewLTref_170013300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 346901 348220 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170013400.1"; gene_id "LTnewLTref_170013400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 346901 348220 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013400.1"; gene_id "LTnewLTref_170013400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 348799 349450 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_170013500.1"; gene_id "LTnewLTref_170013500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 348799 349240 0.91 - 1 transcript_id "LTnewLTref_170013500.1"; gene_id "LTnewLTref_170013500"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 349437 349450 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013500.1"; gene_id "LTnewLTref_170013500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 349771 350635 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_170013600.1"; gene_id "LTnewLTref_170013600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 349771 350168 0.88 - 2 transcript_id "LTnewLTref_170013600.1"; gene_id "LTnewLTref_170013600"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 350614 350635 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170013600.1"; gene_id "LTnewLTref_170013600"; CM024303.1 Aragorn_1.2.36 transcript 353800 353872 . - . transcript_id "LTnewLTref_170013700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_170013700" CM024303.1 Aragorn_1.2.36 exon 353800 353872 . - . transcript_id "LTnewLTref_170013700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_170013700"; CM024303.1 Aragorn_1.2.36 transcript 353950 354031 . + . transcript_id "LTnewLTref_170013800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_170013800" CM024303.1 Aragorn_1.2.36 exon 353950 354031 . + . transcript_id "LTnewLTref_170013800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_170013800"; CM024303.1 Aragorn_1.2.36 transcript 354090 354165 . + . transcript_id "LTnewLTref_170013900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_170013900" CM024303.1 Aragorn_1.2.36 exon 354090 354165 . + . transcript_id "LTnewLTref_170013900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_170013900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 355022 357127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014000.1"; gene_id "LTnewLTref_170014000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 355022 357127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014000.1"; gene_id "LTnewLTref_170014000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 359400 361073 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014100.1"; gene_id "LTnewLTref_170014100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 359400 361073 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014100.1"; gene_id "LTnewLTref_170014100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 361852 365472 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014200.1"; gene_id "LTnewLTref_170014200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 361852 365472 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014200.1"; gene_id "LTnewLTref_170014200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 366237 370070 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014300.1"; gene_id "LTnewLTref_170014300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 366237 370070 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014300.1"; gene_id "LTnewLTref_170014300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 371386 376902 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014400.1"; gene_id "LTnewLTref_170014400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 371386 376902 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014400.1"; gene_id "LTnewLTref_170014400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 379085 380419 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014500.1"; gene_id "LTnewLTref_170014500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 379085 380419 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014500.1"; gene_id "LTnewLTref_170014500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 381167 382030 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_170014600.1"; gene_id "LTnewLTref_170014600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 381167 382030 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014600.1"; gene_id "LTnewLTref_170014600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 381167 382876 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_170014600.2"; gene_id "LTnewLTref_170014600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 381167 382876 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014600.2"; gene_id "LTnewLTref_170014600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 383765 385194 0.55 - . transcript_id "LTnewLTref_170014700.1"; gene_id "LTnewLTref_170014700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 383765 384918 0.69 - 2 transcript_id "LTnewLTref_170014700.1"; gene_id "LTnewLTref_170014700"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 385029 385194 0.76 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014700.1"; gene_id "LTnewLTref_170014700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 385915 388341 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014800.1"; gene_id "LTnewLTref_170014800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 385915 388341 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014800.1"; gene_id "LTnewLTref_170014800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 389130 391526 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170014900.1"; gene_id "LTnewLTref_170014900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 389130 391526 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170014900.1"; gene_id "LTnewLTref_170014900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 393988 395466 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015000.1"; gene_id "LTnewLTref_170015000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 393988 395466 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015000.1"; gene_id "LTnewLTref_170015000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 396252 397220 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015100.1"; gene_id "LTnewLTref_170015100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 396252 397220 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015100.1"; gene_id "LTnewLTref_170015100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 401054 403876 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015200.1"; gene_id "LTnewLTref_170015200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 401054 403876 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015200.1"; gene_id "LTnewLTref_170015200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 405168 406622 0.94 - . transcript_id "LTnewLTref_170015300.1"; gene_id "LTnewLTref_170015300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 405168 406622 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015300.1"; gene_id "LTnewLTref_170015300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 407665 408288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015400.1"; gene_id "LTnewLTref_170015400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 407665 408288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015400.1"; gene_id "LTnewLTref_170015400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 412951 414741 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015500.1"; gene_id "LTnewLTref_170015500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 412951 414741 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015500.1"; gene_id "LTnewLTref_170015500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 417262 419127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015600.1"; gene_id "LTnewLTref_170015600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 417262 419127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015600.1"; gene_id "LTnewLTref_170015600"; CM024303.1 Liftoff transcript 420021 421730 . - . transcript_id "LTnewLTref_170015700.1"; gene_id "LTnewLTref_170015700" CM024303.1 Liftoff CDS 420021 421730 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015700.1"; gene_id "LTnewLTref_170015700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 422327 422680 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015800.1"; gene_id "LTnewLTref_170015800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 422327 422680 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015800.1"; gene_id "LTnewLTref_170015800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 423655 424089 1 - . transcript_id "LTnewLTref_170015900.1"; gene_id "LTnewLTref_170015900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 423655 424089 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_170015900.1"; gene_id "LTnewLTref_170015900"; CM024303.1 . transcript 425705 427054 . + . transcript_id "LTnewLTref_170016000.1"; gene_id "LTnewLTref_170016000:pseudogene" CM024303.1 . exon 425705 427054 . + . transcript_id "LTnewLTref_170016000.1"; gene_id "LTnewLTref_170016000:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 429654 431339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016100.1"; gene_id "LTnewLTref_170016100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 429654 431339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016100.1"; gene_id "LTnewLTref_170016100"; CM024303.1 Liftoff transcript 431982 432232 . + . transcript_id "LTnewLTref_170016200.1"; gene_id "LTnewLTref_170016200" CM024303.1 Liftoff CDS 431982 432232 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016200.1"; gene_id "LTnewLTref_170016200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 432906 433244 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016300.1"; gene_id "LTnewLTref_170016300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 432906 433244 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016300.1"; gene_id "LTnewLTref_170016300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 435041 437065 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016400.1"; gene_id "LTnewLTref_170016400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 435041 437065 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016400.1"; gene_id "LTnewLTref_170016400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 438337 439770 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016500.1"; gene_id "LTnewLTref_170016500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 438337 439770 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016500.1"; gene_id "LTnewLTref_170016500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 440638 447744 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016600.1"; gene_id "LTnewLTref_170016600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 440638 447744 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016600.1"; gene_id "LTnewLTref_170016600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 450751 455100 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016700.1"; gene_id "LTnewLTref_170016700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 450751 455100 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016700.1"; gene_id "LTnewLTref_170016700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 457085 460291 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016800.1"; gene_id "LTnewLTref_170016800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 457085 460291 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016800.1"; gene_id "LTnewLTref_170016800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 462611 467374 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170016900.1"; gene_id "LTnewLTref_170016900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 462611 467374 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170016900.1"; gene_id "LTnewLTref_170016900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 470060 475387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017000.1"; gene_id "LTnewLTref_170017000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 470060 475387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017000.1"; gene_id "LTnewLTref_170017000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 476465 478690 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017100.1"; gene_id "LTnewLTref_170017100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 476465 478690 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017100.1"; gene_id "LTnewLTref_170017100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 479820 480071 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017200.1"; gene_id "LTnewLTref_170017200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 479820 480071 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017200.1"; gene_id "LTnewLTref_170017200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 481620 502634 0.27 + . transcript_id "LTnewLTref_170017300.1"; gene_id "LTnewLTref_170017300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 481620 492523 0.28 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017300.1"; gene_id "LTnewLTref_170017300"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 492632 502634 0.27 + 1 transcript_id "LTnewLTref_170017300.1"; gene_id "LTnewLTref_170017300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 496686 502634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017300.2"; gene_id "LTnewLTref_170017300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 496686 502634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017300.2"; gene_id "LTnewLTref_170017300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 503380 505572 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017400.1"; gene_id "LTnewLTref_170017400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 503380 505572 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017400.1"; gene_id "LTnewLTref_170017400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 506711 507721 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017500.1"; gene_id "LTnewLTref_170017500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 506711 507721 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017500.1"; gene_id "LTnewLTref_170017500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 509957 511873 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017600.1"; gene_id "LTnewLTref_170017600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 509957 511873 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017600.1"; gene_id "LTnewLTref_170017600"; CM024303.1 . transcript 513005 513319 . - . transcript_id "LTnewLTref_170017700.1"; gene_id "LTnewLTref_170017700:pseudogene" CM024303.1 . exon 513005 513319 . - . transcript_id "LTnewLTref_170017700.1"; gene_id "LTnewLTref_170017700:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 513134 513490 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017800.1"; gene_id "LTnewLTref_170017800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 513134 513490 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017800.1"; gene_id "LTnewLTref_170017800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 514782 517250 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170017900.1"; gene_id "LTnewLTref_170017900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 514782 517250 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170017900.1"; gene_id "LTnewLTref_170017900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 522769 524064 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018000.1"; gene_id "LTnewLTref_170018000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 522769 524064 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018000.1"; gene_id "LTnewLTref_170018000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 524907 526079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018100.1"; gene_id "LTnewLTref_170018100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 524907 526079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018100.1"; gene_id "LTnewLTref_170018100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 529976 532357 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018200.1"; gene_id "LTnewLTref_170018200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 529976 532357 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018200.1"; gene_id "LTnewLTref_170018200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 533731 536007 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018300.1"; gene_id "LTnewLTref_170018300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 533731 536007 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018300.1"; gene_id "LTnewLTref_170018300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 537857 540079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018400.1"; gene_id "LTnewLTref_170018400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 537857 540079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018400.1"; gene_id "LTnewLTref_170018400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 541726 545667 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018500.1"; gene_id "LTnewLTref_170018500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 541726 545667 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018500.1"; gene_id "LTnewLTref_170018500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 546580 548202 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018600.1"; gene_id "LTnewLTref_170018600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 546580 548202 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018600.1"; gene_id "LTnewLTref_170018600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 549005 553297 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018700.1"; gene_id "LTnewLTref_170018700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 549005 553297 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018700.1"; gene_id "LTnewLTref_170018700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 555692 556048 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018800.1"; gene_id "LTnewLTref_170018800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 555692 556048 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018800.1"; gene_id "LTnewLTref_170018800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 557249 560776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170018900.1"; gene_id "LTnewLTref_170018900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 557249 560776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170018900.1"; gene_id "LTnewLTref_170018900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 562774 563376 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019000.1"; gene_id "LTnewLTref_170019000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 562774 563376 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019000.1"; gene_id "LTnewLTref_170019000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 564183 568373 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019100.1"; gene_id "LTnewLTref_170019100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 564183 568373 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019100.1"; gene_id "LTnewLTref_170019100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 570230 573697 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019200.1"; gene_id "LTnewLTref_170019200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 570230 573697 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019200.1"; gene_id "LTnewLTref_170019200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 576043 577935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019300.1"; gene_id "LTnewLTref_170019300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 576043 577935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019300.1"; gene_id "LTnewLTref_170019300"; CM024303.1 Liftoff transcript 578758 580815 . + . transcript_id "LTnewLTref_170019400.1"; gene_id "LTnewLTref_170019400" CM024303.1 Liftoff CDS 578758 580815 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019400.1"; gene_id "LTnewLTref_170019400"; CM024303.1 . transcript 581737 584571 . + . transcript_id "LTnewLTref_170019500.1"; gene_id "LTnewLTref_170019500:pseudogene" CM024303.1 . exon 581737 584571 . + . transcript_id "LTnewLTref_170019500.1"; gene_id "LTnewLTref_170019500:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 586191 588338 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019600.1"; gene_id "LTnewLTref_170019600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 586191 588338 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019600.1"; gene_id "LTnewLTref_170019600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 592351 594936 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019700.1"; gene_id "LTnewLTref_170019700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 592351 594936 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019700.1"; gene_id "LTnewLTref_170019700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 597065 598432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019800.1"; gene_id "LTnewLTref_170019800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 597065 598432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019800.1"; gene_id "LTnewLTref_170019800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 601430 601765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170019900.1"; gene_id "LTnewLTref_170019900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 601430 601765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170019900.1"; gene_id "LTnewLTref_170019900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 603238 607848 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020000.1"; gene_id "LTnewLTref_170020000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 603238 607848 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020000.1"; gene_id "LTnewLTref_170020000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 608723 611587 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020100.1"; gene_id "LTnewLTref_170020100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 608723 611587 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020100.1"; gene_id "LTnewLTref_170020100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 612250 615495 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020200.1"; gene_id "LTnewLTref_170020200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 612250 615495 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020200.1"; gene_id "LTnewLTref_170020200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 616745 618100 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020300.1"; gene_id "LTnewLTref_170020300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 616745 618100 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020300.1"; gene_id "LTnewLTref_170020300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 619460 620407 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020400.1"; gene_id "LTnewLTref_170020400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 619460 620407 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020400.1"; gene_id "LTnewLTref_170020400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 621333 621536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020500.1"; gene_id "LTnewLTref_170020500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 621333 621536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020500.1"; gene_id "LTnewLTref_170020500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 622457 624586 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020600.1"; gene_id "LTnewLTref_170020600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 622457 624586 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020600.1"; gene_id "LTnewLTref_170020600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 626077 627033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020700.1"; gene_id "LTnewLTref_170020700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 626077 627033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020700.1"; gene_id "LTnewLTref_170020700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 628452 631598 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020800.1"; gene_id "LTnewLTref_170020800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 628452 631598 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020800.1"; gene_id "LTnewLTref_170020800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 634914 636677 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170020900.1"; gene_id "LTnewLTref_170020900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 634914 636677 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170020900.1"; gene_id "LTnewLTref_170020900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 639884 640609 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021000.1"; gene_id "LTnewLTref_170021000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 639884 640609 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021000.1"; gene_id "LTnewLTref_170021000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 641600 642523 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021100.1"; gene_id "LTnewLTref_170021100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 641600 642523 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021100.1"; gene_id "LTnewLTref_170021100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 643206 643865 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021200.1"; gene_id "LTnewLTref_170021200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 643206 643865 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021200.1"; gene_id "LTnewLTref_170021200"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 645623 647110 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021300.1"; gene_id "LTnewLTref_170021300" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 645623 647110 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021300.1"; gene_id "LTnewLTref_170021300"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 647511 648156 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_170021400.1"; gene_id "LTnewLTref_170021400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 647511 647568 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021400.1"; gene_id "LTnewLTref_170021400"; CM024303.1 AUGUSTUS CDS 647822 648156 0.86 + 2 transcript_id "LTnewLTref_170021400.1"; gene_id "LTnewLTref_170021400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 648285 648500 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021500.1"; gene_id "LTnewLTref_170021500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 648285 648500 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021500.1"; gene_id "LTnewLTref_170021500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 650133 652745 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021600.1"; gene_id "LTnewLTref_170021600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 650133 652745 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021600.1"; gene_id "LTnewLTref_170021600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 653539 653928 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021700.1"; gene_id "LTnewLTref_170021700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 653539 653928 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021700.1"; gene_id "LTnewLTref_170021700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 654955 657063 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021800.1"; gene_id "LTnewLTref_170021800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 654955 657063 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021800.1"; gene_id "LTnewLTref_170021800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 658196 659059 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170021900.1"; gene_id "LTnewLTref_170021900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 658196 659059 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170021900.1"; gene_id "LTnewLTref_170021900"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 660289 661101 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022000.1"; gene_id "LTnewLTref_170022000" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 660289 661101 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022000.1"; gene_id "LTnewLTref_170022000"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 663651 663908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022100.1"; gene_id "LTnewLTref_170022100" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 663651 663908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022100.1"; gene_id "LTnewLTref_170022100"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 665142 666635 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022200.1"; gene_id "LTnewLTref_170022200" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 665142 666635 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022200.1"; gene_id "LTnewLTref_170022200"; CM024303.1 . transcript 668873 669715 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene" CM024303.1 . exon 668873 669040 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669042 669083 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669085 669126 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669128 669190 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669192 669245 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669248 669373 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669375 669485 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669487 669579 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 . exon 669581 669715 . + . transcript_id "LTnewLTref_170022300.1"; gene_id "LTnewLTref_170022300:pseudogene"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 670208 670981 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022400.1"; gene_id "LTnewLTref_170022400" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 670208 670981 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022400.1"; gene_id "LTnewLTref_170022400"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 671741 672460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022500.1"; gene_id "LTnewLTref_170022500" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 671741 672460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022500.1"; gene_id "LTnewLTref_170022500"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 673787 675334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022600.1"; gene_id "LTnewLTref_170022600" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 673787 675334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022600.1"; gene_id "LTnewLTref_170022600"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 676791 681527 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022700.1"; gene_id "LTnewLTref_170022700" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 676791 681527 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022700.1"; gene_id "LTnewLTref_170022700"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 682162 683628 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022800.1"; gene_id "LTnewLTref_170022800" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 682162 683628 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022800.1"; gene_id "LTnewLTref_170022800"; CM024303.1 AUGUSTUS transcript 686836 687993 1 + . transcript_id "LTnewLTref_170022900.1"; gene_id "LTnewLTref_170022900" CM024303.1 AUGUSTUS CDS 686836 687993 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_170022900.1"; gene_id "LTnewLTref_170022900"; CM024303.1 . transcript 688740 689473 . + . transcript_id "LTnewLTref_170023000.1"; gene_id "LTnewLTref_170023000:pseudogene" CM024303.1 . exon 688740 689473 . + . transcript_id "LTnewLTref_170023000.1"; gene_id "LTnewLTref_170023000:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 1841 4849 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005000.1"; gene_id "LTnewLTref_180005000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 1841 4849 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005000.1"; gene_id "LTnewLTref_180005000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 5343 6160 0.44 - . transcript_id "LTnewLTref_180005100.1"; gene_id "LTnewLTref_180005100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 5343 5522 0.52 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005100.1"; gene_id "LTnewLTref_180005100"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 6062 6160 0.78 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005100.1"; gene_id "LTnewLTref_180005100"; CM024304.1 . transcript 6926 8079 . - . transcript_id "LTnewLTref_180005200.1"; gene_id "LTnewLTref_180005200:pseudogene" CM024304.1 . exon 6926 8079 . - . transcript_id "LTnewLTref_180005200.1"; gene_id "LTnewLTref_180005200:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 8879 9913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005300.1"; gene_id "LTnewLTref_180005300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 8879 9913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005300.1"; gene_id "LTnewLTref_180005300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 10360 11976 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005400.1"; gene_id "LTnewLTref_180005400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 10360 11976 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005400.1"; gene_id "LTnewLTref_180005400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 12852 15776 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005500.1"; gene_id "LTnewLTref_180005500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 12852 15776 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005500.1"; gene_id "LTnewLTref_180005500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 16590 17063 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005600.1"; gene_id "LTnewLTref_180005600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 16590 17063 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005600.1"; gene_id "LTnewLTref_180005600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 17892 18191 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005700.1"; gene_id "LTnewLTref_180005700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 17892 18191 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005700.1"; gene_id "LTnewLTref_180005700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 19278 21452 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005800.1"; gene_id "LTnewLTref_180005800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 19278 21452 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005800.1"; gene_id "LTnewLTref_180005800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 22602 24041 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180005900.1"; gene_id "LTnewLTref_180005900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 22602 24041 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180005900.1"; gene_id "LTnewLTref_180005900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 25429 27867 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006000.1"; gene_id "LTnewLTref_180006000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 25429 27867 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006000.1"; gene_id "LTnewLTref_180006000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 28654 30012 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006100.1"; gene_id "LTnewLTref_180006100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 28654 30012 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006100.1"; gene_id "LTnewLTref_180006100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 30519 34976 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006200.1"; gene_id "LTnewLTref_180006200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 30519 34976 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006200.1"; gene_id "LTnewLTref_180006200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 36485 36868 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006300.1"; gene_id "LTnewLTref_180006300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 36485 36868 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006300.1"; gene_id "LTnewLTref_180006300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 37841 39952 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006400.1"; gene_id "LTnewLTref_180006400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 37841 39952 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006400.1"; gene_id "LTnewLTref_180006400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 42030 44267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006500.1"; gene_id "LTnewLTref_180006500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 42030 44267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006500.1"; gene_id "LTnewLTref_180006500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 46643 48052 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006600.1"; gene_id "LTnewLTref_180006600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 46643 48052 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006600.1"; gene_id "LTnewLTref_180006600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 48883 51000 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006700.1"; gene_id "LTnewLTref_180006700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 48883 51000 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006700.1"; gene_id "LTnewLTref_180006700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 59924 60967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006800.1"; gene_id "LTnewLTref_180006800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 59924 60967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006800.1"; gene_id "LTnewLTref_180006800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 70156 71202 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180006900.1"; gene_id "LTnewLTref_180006900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 70156 71202 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180006900.1"; gene_id "LTnewLTref_180006900"; CM024304.1 . transcript 78896 79196 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007000.1"; gene_id "LTnewLTref_180007000:pseudogene" CM024304.1 . exon 78896 78922 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007000.1"; gene_id "LTnewLTref_180007000:pseudogene"; CM024304.1 . exon 78925 79026 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007000.1"; gene_id "LTnewLTref_180007000:pseudogene"; CM024304.1 . exon 79029 79196 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007000.1"; gene_id "LTnewLTref_180007000:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 86754 87782 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007100.1"; gene_id "LTnewLTref_180007100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 86754 87782 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007100.1"; gene_id "LTnewLTref_180007100"; CM024304.1 . transcript 95026 95465 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007200.1"; gene_id "LTnewLTref_180007200:pseudogene" CM024304.1 . exon 95026 95076 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007200.1"; gene_id "LTnewLTref_180007200:pseudogene"; CM024304.1 . exon 95079 95180 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007200.1"; gene_id "LTnewLTref_180007200:pseudogene"; CM024304.1 . exon 95182 95214 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007200.1"; gene_id "LTnewLTref_180007200:pseudogene"; CM024304.1 . exon 95217 95465 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007200.1"; gene_id "LTnewLTref_180007200:pseudogene"; CM024304.1 . transcript 95572 95998 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007300.1"; gene_id "LTnewLTref_180007300:pseudogene" CM024304.1 . exon 95572 95985 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007300.1"; gene_id "LTnewLTref_180007300:pseudogene"; CM024304.1 . exon 95987 95998 . - . transcript_id "LTnewLTref_180007300.1"; gene_id "LTnewLTref_180007300:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 98313 99791 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007400.1"; gene_id "LTnewLTref_180007400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 98313 99791 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007400.1"; gene_id "LTnewLTref_180007400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 101231 102286 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007500.1"; gene_id "LTnewLTref_180007500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 101231 102286 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007500.1"; gene_id "LTnewLTref_180007500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 104160 105389 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007600.1"; gene_id "LTnewLTref_180007600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 104160 105389 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007600.1"; gene_id "LTnewLTref_180007600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 107801 108697 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007700.1"; gene_id "LTnewLTref_180007700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 107801 108697 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007700.1"; gene_id "LTnewLTref_180007700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 110675 111889 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007800.1"; gene_id "LTnewLTref_180007800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 110675 111889 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007800.1"; gene_id "LTnewLTref_180007800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 112559 113299 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180007900.1"; gene_id "LTnewLTref_180007900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 112559 113299 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180007900.1"; gene_id "LTnewLTref_180007900"; CM024304.1 . transcript 114155 114616 . - . transcript_id "LTnewLTref_180008000.1"; gene_id "LTnewLTref_180008000:pseudogene" CM024304.1 . exon 114155 114616 . - . transcript_id "LTnewLTref_180008000.1"; gene_id "LTnewLTref_180008000:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 122055 123122 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008100.1"; gene_id "LTnewLTref_180008100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 122055 123122 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008100.1"; gene_id "LTnewLTref_180008100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 126287 128401 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008200.1"; gene_id "LTnewLTref_180008200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 126287 128401 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008200.1"; gene_id "LTnewLTref_180008200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 129928 130941 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008300.1"; gene_id "LTnewLTref_180008300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 129928 130941 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008300.1"; gene_id "LTnewLTref_180008300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 132681 133805 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008400.1"; gene_id "LTnewLTref_180008400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 132681 133805 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008400.1"; gene_id "LTnewLTref_180008400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 135319 135627 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008500.1"; gene_id "LTnewLTref_180008500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 135319 135627 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008500.1"; gene_id "LTnewLTref_180008500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 136420 137202 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008600.1"; gene_id "LTnewLTref_180008600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 136420 137202 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008600.1"; gene_id "LTnewLTref_180008600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 138548 139282 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008700.1"; gene_id "LTnewLTref_180008700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 138548 139282 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008700.1"; gene_id "LTnewLTref_180008700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 140898 142301 0.5 - . transcript_id "LTnewLTref_180008800.1"; gene_id "LTnewLTref_180008800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 140898 142301 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008800.1"; gene_id "LTnewLTref_180008800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 143409 144608 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180008900.1"; gene_id "LTnewLTref_180008900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 143409 144608 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180008900.1"; gene_id "LTnewLTref_180008900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 145337 146407 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180009000.1"; gene_id "LTnewLTref_180009000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 145337 146407 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009000.1"; gene_id "LTnewLTref_180009000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 148282 149676 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180009100.1"; gene_id "LTnewLTref_180009100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 148282 149676 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009100.1"; gene_id "LTnewLTref_180009100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 150428 154258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180009200.1"; gene_id "LTnewLTref_180009200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 150428 154258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009200.1"; gene_id "LTnewLTref_180009200"; CM024304.1 Liftoff transcript 156456 161738 . - . transcript_id "LTnewLTref_180009300.1"; gene_id "LTnewLTref_180009300" CM024304.1 Liftoff CDS 156456 161738 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009300.1"; gene_id "LTnewLTref_180009300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 164299 165986 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_180009400.1"; gene_id "LTnewLTref_180009400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 164299 165373 0.66 - 1 transcript_id "LTnewLTref_180009400.1"; gene_id "LTnewLTref_180009400"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 165475 165986 0.52 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009400.1"; gene_id "LTnewLTref_180009400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 168764 169366 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180009500.1"; gene_id "LTnewLTref_180009500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 168764 169366 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009500.1"; gene_id "LTnewLTref_180009500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 170813 171226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180009600.1"; gene_id "LTnewLTref_180009600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 170813 171226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009600.1"; gene_id "LTnewLTref_180009600"; CM024304.1 . transcript 175625 176920 . - . transcript_id "LTnewLTref_180009700.1"; gene_id "LTnewLTref_180009700:pseudogene" CM024304.1 . exon 175625 176920 . - . transcript_id "LTnewLTref_180009700.1"; gene_id "LTnewLTref_180009700:pseudogene"; CM024304.1 . transcript 177665 178936 . - . transcript_id "LTnewLTref_180009800.1"; gene_id "LTnewLTref_180009800:pseudogene" CM024304.1 . exon 177665 178936 . - . transcript_id "LTnewLTref_180009800.1"; gene_id "LTnewLTref_180009800:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 181114 182502 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180009900.1"; gene_id "LTnewLTref_180009900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 181114 182502 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180009900.1"; gene_id "LTnewLTref_180009900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 184397 185095 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010000.1"; gene_id "LTnewLTref_180010000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 184397 185095 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010000.1"; gene_id "LTnewLTref_180010000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 186153 188015 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010100.1"; gene_id "LTnewLTref_180010100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 186153 188015 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010100.1"; gene_id "LTnewLTref_180010100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 188994 190172 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010200.1"; gene_id "LTnewLTref_180010200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 188994 190172 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010200.1"; gene_id "LTnewLTref_180010200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 190745 191587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010300.1"; gene_id "LTnewLTref_180010300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 190745 191587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010300.1"; gene_id "LTnewLTref_180010300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 192470 193732 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010400.1"; gene_id "LTnewLTref_180010400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 192470 193732 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010400.1"; gene_id "LTnewLTref_180010400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 197566 200256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010500.1"; gene_id "LTnewLTref_180010500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 197566 200256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010500.1"; gene_id "LTnewLTref_180010500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 202052 204289 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010600.1"; gene_id "LTnewLTref_180010600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 202052 204289 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010600.1"; gene_id "LTnewLTref_180010600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 207359 208936 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180010700.1"; gene_id "LTnewLTref_180010700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 207359 208936 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010700.1"; gene_id "LTnewLTref_180010700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 212607 214148 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_180010800.1"; gene_id "LTnewLTref_180010800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 212607 214148 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010800.1"; gene_id "LTnewLTref_180010800"; CM024304.1 Liftoff transcript 214809 216134 . - . transcript_id "LTnewLTref_180010900.1"; gene_id "LTnewLTref_180010900" CM024304.1 Liftoff CDS 214809 216134 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_180010900.1"; gene_id "LTnewLTref_180010900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 216713 217951 1 - . transcript_id "LTnewLTref_180011000.1"; gene_id "LTnewLTref_180011000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 216713 217951 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_180011000.1"; gene_id "LTnewLTref_180011000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 219768 222965 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011100.1"; gene_id "LTnewLTref_180011100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 219768 222965 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011100.1"; gene_id "LTnewLTref_180011100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 223878 224849 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011200.1"; gene_id "LTnewLTref_180011200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 223878 224849 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011200.1"; gene_id "LTnewLTref_180011200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 229461 230720 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011300.1"; gene_id "LTnewLTref_180011300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 229461 230720 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011300.1"; gene_id "LTnewLTref_180011300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 240169 242052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011400.1"; gene_id "LTnewLTref_180011400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 240169 242052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011400.1"; gene_id "LTnewLTref_180011400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 244088 244348 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011500.1"; gene_id "LTnewLTref_180011500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 244088 244348 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011500.1"; gene_id "LTnewLTref_180011500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 245585 246187 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011600.1"; gene_id "LTnewLTref_180011600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 245585 246187 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011600.1"; gene_id "LTnewLTref_180011600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 247469 249265 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011700.1"; gene_id "LTnewLTref_180011700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 247469 249265 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011700.1"; gene_id "LTnewLTref_180011700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 250654 251298 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011800.1"; gene_id "LTnewLTref_180011800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 250654 251298 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011800.1"; gene_id "LTnewLTref_180011800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 253783 255471 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180011900.1"; gene_id "LTnewLTref_180011900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 253783 255471 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180011900.1"; gene_id "LTnewLTref_180011900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 256179 256994 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012000.1"; gene_id "LTnewLTref_180012000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 256179 256994 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012000.1"; gene_id "LTnewLTref_180012000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 261126 265049 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012100.1"; gene_id "LTnewLTref_180012100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 261126 265049 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012100.1"; gene_id "LTnewLTref_180012100"; CM024304.1 . transcript 265224 265492 . + . transcript_id "LTnewLTref_180012200.1"; gene_id "LTnewLTref_180012200:pseudogene" CM024304.1 . exon 265224 265492 . + . transcript_id "LTnewLTref_180012200.1"; gene_id "LTnewLTref_180012200:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 268550 270685 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012300.1"; gene_id "LTnewLTref_180012300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 268550 270685 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012300.1"; gene_id "LTnewLTref_180012300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 273133 275637 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012400.1"; gene_id "LTnewLTref_180012400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 273133 275637 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012400.1"; gene_id "LTnewLTref_180012400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 276727 278139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012500.1"; gene_id "LTnewLTref_180012500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 276727 278139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012500.1"; gene_id "LTnewLTref_180012500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 282775 284139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012600.1"; gene_id "LTnewLTref_180012600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 282775 284139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012600.1"; gene_id "LTnewLTref_180012600"; CM024304.1 . transcript 289845 294732 . + . transcript_id "LTnewLTref_180012700.1"; gene_id "LTnewLTref_180012700:pseudogene" CM024304.1 . exon 289845 294732 . + . transcript_id "LTnewLTref_180012700.1"; gene_id "LTnewLTref_180012700:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 307848 311150 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_180012800.1"; gene_id "LTnewLTref_180012800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 307848 311150 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012800.1"; gene_id "LTnewLTref_180012800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 311880 312632 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180012900.1"; gene_id "LTnewLTref_180012900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 311880 312632 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180012900.1"; gene_id "LTnewLTref_180012900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 313680 315080 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013000.1"; gene_id "LTnewLTref_180013000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 313680 315080 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013000.1"; gene_id "LTnewLTref_180013000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 316555 318255 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013100.1"; gene_id "LTnewLTref_180013100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 316555 318255 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013100.1"; gene_id "LTnewLTref_180013100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 319084 319374 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013200.1"; gene_id "LTnewLTref_180013200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 319084 319374 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013200.1"; gene_id "LTnewLTref_180013200"; CM024304.1 . transcript 320585 325621 . + . transcript_id "LTnewLTref_180013300.1"; gene_id "LTnewLTref_180013300:pseudogene" CM024304.1 . exon 320585 325621 . + . transcript_id "LTnewLTref_180013300.1"; gene_id "LTnewLTref_180013300:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 326716 327435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013400.1"; gene_id "LTnewLTref_180013400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 326716 327435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013400.1"; gene_id "LTnewLTref_180013400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 328098 329126 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013500.1"; gene_id "LTnewLTref_180013500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 328098 329126 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013500.1"; gene_id "LTnewLTref_180013500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 329940 330860 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013600.1"; gene_id "LTnewLTref_180013600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 329940 330860 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013600.1"; gene_id "LTnewLTref_180013600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 332320 333552 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013700.1"; gene_id "LTnewLTref_180013700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 332320 333552 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013700.1"; gene_id "LTnewLTref_180013700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 334894 342879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013800.1"; gene_id "LTnewLTref_180013800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 334894 342879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013800.1"; gene_id "LTnewLTref_180013800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 343518 346346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180013900.1"; gene_id "LTnewLTref_180013900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 343518 346346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180013900.1"; gene_id "LTnewLTref_180013900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 347755 353883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014000.1"; gene_id "LTnewLTref_180014000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 347755 353883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014000.1"; gene_id "LTnewLTref_180014000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 355420 358097 0.37 + . transcript_id "LTnewLTref_180014100.1"; gene_id "LTnewLTref_180014100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 355420 357931 0.5 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014100.1"; gene_id "LTnewLTref_180014100"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 358006 358097 0.37 + 2 transcript_id "LTnewLTref_180014100.1"; gene_id "LTnewLTref_180014100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 355420 364038 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014100.2"; gene_id "LTnewLTref_180014100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 355420 364038 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014100.2"; gene_id "LTnewLTref_180014100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 365594 368214 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_180014200.1"; gene_id "LTnewLTref_180014200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 365594 367510 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014200.1"; gene_id "LTnewLTref_180014200"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 367555 368214 0.79 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014200.1"; gene_id "LTnewLTref_180014200"; CM024304.1 Aragorn_1.2.36 transcript 367920 368016 . + . transcript_id "LTnewLTref_180014300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_180014300" CM024304.1 Aragorn_1.2.36 exon 367920 368016 . + . transcript_id "LTnewLTref_180014300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_180014300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 368919 370526 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014400.1"; gene_id "LTnewLTref_180014400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 368919 370526 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014400.1"; gene_id "LTnewLTref_180014400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 371823 372265 0.33 + . transcript_id "LTnewLTref_180014500.1"; gene_id "LTnewLTref_180014500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 371823 372151 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014500.1"; gene_id "LTnewLTref_180014500"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 372211 372265 0.42 + 1 transcript_id "LTnewLTref_180014500.1"; gene_id "LTnewLTref_180014500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 371823 375329 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014500.2"; gene_id "LTnewLTref_180014500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 371823 375329 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014500.2"; gene_id "LTnewLTref_180014500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 375875 376546 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014600.1"; gene_id "LTnewLTref_180014600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 375875 376546 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014600.1"; gene_id "LTnewLTref_180014600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 378883 381504 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014700.1"; gene_id "LTnewLTref_180014700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 378883 381504 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014700.1"; gene_id "LTnewLTref_180014700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 382557 385874 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014800.1"; gene_id "LTnewLTref_180014800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 382557 385874 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014800.1"; gene_id "LTnewLTref_180014800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 386608 388458 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180014900.1"; gene_id "LTnewLTref_180014900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 386608 388458 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180014900.1"; gene_id "LTnewLTref_180014900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 388969 391665 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015000.1"; gene_id "LTnewLTref_180015000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 388969 391665 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015000.1"; gene_id "LTnewLTref_180015000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 392472 396305 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015100.1"; gene_id "LTnewLTref_180015100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 392472 396305 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015100.1"; gene_id "LTnewLTref_180015100"; CM024304.1 Liftoff transcript 397374 398441 . + . transcript_id "LTnewLTref_180015200.1"; gene_id "LTnewLTref_180015200" CM024304.1 Liftoff CDS 397374 398441 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015200.1"; gene_id "LTnewLTref_180015200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 398975 401089 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015300.1"; gene_id "LTnewLTref_180015300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 398975 401089 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015300.1"; gene_id "LTnewLTref_180015300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 402485 408651 0.36 + . transcript_id "LTnewLTref_180015400.1"; gene_id "LTnewLTref_180015400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 402485 403111 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015400.1"; gene_id "LTnewLTref_180015400"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 403255 408651 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015400.1"; gene_id "LTnewLTref_180015400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 403375 405191 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_180015400.2"; gene_id "LTnewLTref_180015400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 403375 405126 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015400.2"; gene_id "LTnewLTref_180015400"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 405171 405191 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015400.2"; gene_id "LTnewLTref_180015400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 409648 410223 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015500.1"; gene_id "LTnewLTref_180015500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 409648 410223 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015500.1"; gene_id "LTnewLTref_180015500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 411712 413196 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015600.1"; gene_id "LTnewLTref_180015600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 411712 413196 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015600.1"; gene_id "LTnewLTref_180015600"; CM024304.1 Liftoff transcript 414070 415410 . + . transcript_id "LTnewLTref_180015700.1"; gene_id "LTnewLTref_180015700" CM024304.1 Liftoff CDS 414070 415410 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015700.1"; gene_id "LTnewLTref_180015700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 416718 417056 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015800.1"; gene_id "LTnewLTref_180015800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 416718 417056 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015800.1"; gene_id "LTnewLTref_180015800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 418609 423171 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180015900.1"; gene_id "LTnewLTref_180015900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 418609 423171 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180015900.1"; gene_id "LTnewLTref_180015900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 424355 424678 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016000.1"; gene_id "LTnewLTref_180016000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 424355 424678 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016000.1"; gene_id "LTnewLTref_180016000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 428870 431332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016100.1"; gene_id "LTnewLTref_180016100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 428870 431332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016100.1"; gene_id "LTnewLTref_180016100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 433100 437122 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016200.1"; gene_id "LTnewLTref_180016200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 433100 437122 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016200.1"; gene_id "LTnewLTref_180016200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 438273 442637 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016300.1"; gene_id "LTnewLTref_180016300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 438273 442637 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016300.1"; gene_id "LTnewLTref_180016300"; CM024304.1 . transcript 442809 443236 . - . transcript_id "LTnewLTref_180016400.1"; gene_id "LTnewLTref_180016400:pseudogene" CM024304.1 . exon 442809 443144 . - . transcript_id "LTnewLTref_180016400.1"; gene_id "LTnewLTref_180016400:pseudogene"; CM024304.1 . exon 443147 443236 . - . transcript_id "LTnewLTref_180016400.1"; gene_id "LTnewLTref_180016400:pseudogene"; CM024304.1 Liftoff transcript 448870 451161 . + . transcript_id "LTnewLTref_180016500.1"; gene_id "LTnewLTref_180016500" CM024304.1 Liftoff CDS 448870 451161 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016500.1"; gene_id "LTnewLTref_180016500"; CM024304.1 Liftoff transcript 451583 454366 . + . transcript_id "LTnewLTref_180016600.1"; gene_id "LTnewLTref_180016600" CM024304.1 Liftoff CDS 451583 454366 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016600.1"; gene_id "LTnewLTref_180016600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 455306 456304 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016700.1"; gene_id "LTnewLTref_180016700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 455306 456304 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016700.1"; gene_id "LTnewLTref_180016700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 459340 461235 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016800.1"; gene_id "LTnewLTref_180016800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 459340 461235 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016800.1"; gene_id "LTnewLTref_180016800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 463225 464163 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180016900.1"; gene_id "LTnewLTref_180016900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 463225 464163 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180016900.1"; gene_id "LTnewLTref_180016900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 464945 467491 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017000.1"; gene_id "LTnewLTref_180017000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 464945 467491 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017000.1"; gene_id "LTnewLTref_180017000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 468589 469659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017100.1"; gene_id "LTnewLTref_180017100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 468589 469659 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017100.1"; gene_id "LTnewLTref_180017100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 471209 471916 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017200.1"; gene_id "LTnewLTref_180017200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 471209 471916 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017200.1"; gene_id "LTnewLTref_180017200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 475574 476053 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_180017300.1"; gene_id "LTnewLTref_180017300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 475574 476053 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017300.1"; gene_id "LTnewLTref_180017300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 475667 476053 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_180017300.2"; gene_id "LTnewLTref_180017300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 475667 476053 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017300.2"; gene_id "LTnewLTref_180017300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 477716 481201 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017400.1"; gene_id "LTnewLTref_180017400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 477716 481201 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017400.1"; gene_id "LTnewLTref_180017400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 481916 483001 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017500.1"; gene_id "LTnewLTref_180017500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 481916 483001 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017500.1"; gene_id "LTnewLTref_180017500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 490253 490582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017600.1"; gene_id "LTnewLTref_180017600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 490253 490582 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017600.1"; gene_id "LTnewLTref_180017600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 493460 494068 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017700.1"; gene_id "LTnewLTref_180017700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 493460 494068 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017700.1"; gene_id "LTnewLTref_180017700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 495630 500258 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017800.1"; gene_id "LTnewLTref_180017800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 495630 500258 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017800.1"; gene_id "LTnewLTref_180017800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 501225 505016 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180017900.1"; gene_id "LTnewLTref_180017900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 501225 505016 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180017900.1"; gene_id "LTnewLTref_180017900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 505615 506427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180018000.1"; gene_id "LTnewLTref_180018000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 505615 506427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018000.1"; gene_id "LTnewLTref_180018000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 507886 510057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180018100.1"; gene_id "LTnewLTref_180018100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 507886 510057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018100.1"; gene_id "LTnewLTref_180018100"; CM024304.1 . transcript 509145 509405 . - . transcript_id "LTnewLTref_180018200.1"; gene_id "LTnewLTref_180018200" CM024304.1 . CDS 509145 509405 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_180018200.1"; gene_id "LTnewLTref_180018200"; CM024304.1 . transcript 509746 510057 . + . transcript_id "LTnewLTref_180018300.1"; gene_id "LTnewLTref_180018300" CM024304.1 . CDS 509746 510057 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018300.1"; gene_id "LTnewLTref_180018300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 512314 514482 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180018400.1"; gene_id "LTnewLTref_180018400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 512314 514482 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018400.1"; gene_id "LTnewLTref_180018400"; CM024304.1 . transcript 513570 513830 . - . transcript_id "LTnewLTref_180018500.1"; gene_id "LTnewLTref_180018500" CM024304.1 . CDS 513570 513830 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_180018500.1"; gene_id "LTnewLTref_180018500"; CM024304.1 . transcript 514171 514482 . + . transcript_id "LTnewLTref_180018600.1"; gene_id "LTnewLTref_180018600" CM024304.1 . CDS 514171 514482 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018600.1"; gene_id "LTnewLTref_180018600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 515441 517303 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180018700.1"; gene_id "LTnewLTref_180018700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 515441 517303 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018700.1"; gene_id "LTnewLTref_180018700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 519070 521352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180018800.1"; gene_id "LTnewLTref_180018800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 519070 521352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018800.1"; gene_id "LTnewLTref_180018800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 523536 525929 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180018900.1"; gene_id "LTnewLTref_180018900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 523536 525929 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180018900.1"; gene_id "LTnewLTref_180018900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 527415 528377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019000.1"; gene_id "LTnewLTref_180019000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 527415 528377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019000.1"; gene_id "LTnewLTref_180019000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 530400 531350 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019100.1"; gene_id "LTnewLTref_180019100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 530400 531350 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019100.1"; gene_id "LTnewLTref_180019100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 533380 534306 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019200.1"; gene_id "LTnewLTref_180019200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 533380 534306 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019200.1"; gene_id "LTnewLTref_180019200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 537994 540114 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019300.1"; gene_id "LTnewLTref_180019300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 537994 540114 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019300.1"; gene_id "LTnewLTref_180019300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 541055 545461 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019400.1"; gene_id "LTnewLTref_180019400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 541055 545461 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019400.1"; gene_id "LTnewLTref_180019400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 549139 550908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019500.1"; gene_id "LTnewLTref_180019500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 549139 550908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019500.1"; gene_id "LTnewLTref_180019500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 556105 558408 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019600.1"; gene_id "LTnewLTref_180019600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 556105 558408 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019600.1"; gene_id "LTnewLTref_180019600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 569220 571097 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019700.1"; gene_id "LTnewLTref_180019700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 569220 571097 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019700.1"; gene_id "LTnewLTref_180019700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 586637 589522 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019800.1"; gene_id "LTnewLTref_180019800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 586637 589522 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019800.1"; gene_id "LTnewLTref_180019800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 590859 593327 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180019900.1"; gene_id "LTnewLTref_180019900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 590859 593327 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180019900.1"; gene_id "LTnewLTref_180019900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 596207 597343 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020000.1"; gene_id "LTnewLTref_180020000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 596207 597343 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020000.1"; gene_id "LTnewLTref_180020000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 599575 600858 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020100.1"; gene_id "LTnewLTref_180020100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 599575 600858 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020100.1"; gene_id "LTnewLTref_180020100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 601443 601949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020200.1"; gene_id "LTnewLTref_180020200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 601443 601949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020200.1"; gene_id "LTnewLTref_180020200"; CM024304.1 . transcript 603130 606242 . + . transcript_id "LTnewLTref_180020300.1"; gene_id "LTnewLTref_180020300:pseudogene" CM024304.1 . exon 603130 606242 . + . transcript_id "LTnewLTref_180020300.1"; gene_id "LTnewLTref_180020300:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 608134 610818 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020400.1"; gene_id "LTnewLTref_180020400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 608134 610818 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020400.1"; gene_id "LTnewLTref_180020400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 614000 614547 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_180020500.1"; gene_id "LTnewLTref_180020500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 614000 614075 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020500.1"; gene_id "LTnewLTref_180020500"; CM024304.1 AUGUSTUS CDS 614126 614547 0.51 + 2 transcript_id "LTnewLTref_180020500.1"; gene_id "LTnewLTref_180020500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 614843 615280 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020600.1"; gene_id "LTnewLTref_180020600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 614843 615280 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020600.1"; gene_id "LTnewLTref_180020600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 621553 624903 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020700.1"; gene_id "LTnewLTref_180020700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 621553 624903 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020700.1"; gene_id "LTnewLTref_180020700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 626971 627672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020800.1"; gene_id "LTnewLTref_180020800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 626971 627672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020800.1"; gene_id "LTnewLTref_180020800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 633636 639755 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180020900.1"; gene_id "LTnewLTref_180020900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 633636 639755 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180020900.1"; gene_id "LTnewLTref_180020900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 641422 641850 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_180021000.1"; gene_id "LTnewLTref_180021000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 641422 641850 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021000.1"; gene_id "LTnewLTref_180021000"; CM024304.1 Liftoff transcript 643270 643472 . + . transcript_id "LTnewLTref_180021100.1"; gene_id "LTnewLTref_180021100" CM024304.1 Liftoff CDS 643270 643472 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021100.1"; gene_id "LTnewLTref_180021100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 644410 647139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021200.1"; gene_id "LTnewLTref_180021200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 644410 647139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021200.1"; gene_id "LTnewLTref_180021200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 647942 648991 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021300.1"; gene_id "LTnewLTref_180021300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 647942 648991 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021300.1"; gene_id "LTnewLTref_180021300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 650554 651468 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021400.1"; gene_id "LTnewLTref_180021400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 650554 651468 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021400.1"; gene_id "LTnewLTref_180021400"; CM024304.1 . transcript 651924 652188 . + . transcript_id "LTnewLTref_180021500.1"; gene_id "LTnewLTref_180021500:pseudogene" CM024304.1 . exon 651924 652188 . + . transcript_id "LTnewLTref_180021500.1"; gene_id "LTnewLTref_180021500:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 653717 654271 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021600.1"; gene_id "LTnewLTref_180021600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 653717 654271 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021600.1"; gene_id "LTnewLTref_180021600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 655592 658732 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021700.1"; gene_id "LTnewLTref_180021700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 655592 658732 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021700.1"; gene_id "LTnewLTref_180021700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 660311 663235 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021800.1"; gene_id "LTnewLTref_180021800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 660311 663235 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021800.1"; gene_id "LTnewLTref_180021800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 665346 668270 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180021900.1"; gene_id "LTnewLTref_180021900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 665346 668270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180021900.1"; gene_id "LTnewLTref_180021900"; CM024304.1 Liftoff transcript 672289 676266 . + . transcript_id "LTnewLTref_180022000.1"; gene_id "LTnewLTref_180022000" CM024304.1 Liftoff CDS 672289 676266 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022000.1"; gene_id "LTnewLTref_180022000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 677013 678104 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022100.1"; gene_id "LTnewLTref_180022100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 677013 678104 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022100.1"; gene_id "LTnewLTref_180022100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 678697 679932 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022200.1"; gene_id "LTnewLTref_180022200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 678697 679932 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022200.1"; gene_id "LTnewLTref_180022200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 680603 682294 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022300.1"; gene_id "LTnewLTref_180022300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 680603 682294 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022300.1"; gene_id "LTnewLTref_180022300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 684236 684700 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022400.1"; gene_id "LTnewLTref_180022400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 684236 684700 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022400.1"; gene_id "LTnewLTref_180022400"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 687041 687985 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022500.1"; gene_id "LTnewLTref_180022500" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 687041 687985 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022500.1"; gene_id "LTnewLTref_180022500"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 690439 691080 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022600.1"; gene_id "LTnewLTref_180022600" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 690439 691080 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022600.1"; gene_id "LTnewLTref_180022600"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 692988 695378 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022700.1"; gene_id "LTnewLTref_180022700" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 692988 695378 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022700.1"; gene_id "LTnewLTref_180022700"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 696014 697978 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022800.1"; gene_id "LTnewLTref_180022800" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 696014 697978 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022800.1"; gene_id "LTnewLTref_180022800"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 699793 700224 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180022900.1"; gene_id "LTnewLTref_180022900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 699793 700224 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180022900.1"; gene_id "LTnewLTref_180022900"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 701214 701891 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180023000.1"; gene_id "LTnewLTref_180023000" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 701214 701891 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023000.1"; gene_id "LTnewLTref_180023000"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 704195 704962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180023100.1"; gene_id "LTnewLTref_180023100" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 704195 704962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023100.1"; gene_id "LTnewLTref_180023100"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 705794 706150 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180023200.1"; gene_id "LTnewLTref_180023200" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 705794 706150 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023200.1"; gene_id "LTnewLTref_180023200"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 707350 709092 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180023300.1"; gene_id "LTnewLTref_180023300" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 707350 709092 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023300.1"; gene_id "LTnewLTref_180023300"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 710298 712361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180023400.1"; gene_id "LTnewLTref_180023400" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 710298 712361 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023400.1"; gene_id "LTnewLTref_180023400"; CM024304.1 Liftoff transcript 713573 713758 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023500.1"; gene_id "LTnewLTref_180023500" CM024304.1 Liftoff CDS 713573 713758 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023500.1"; gene_id "LTnewLTref_180023500"; CM024304.1 . transcript 713771 713992 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023600.1"; gene_id "LTnewLTref_180023600:pseudogene" CM024304.1 . exon 713771 713992 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023600.1"; gene_id "LTnewLTref_180023600:pseudogene"; CM024304.1 . transcript 714305 714569 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023700.1"; gene_id "LTnewLTref_180023700:pseudogene" CM024304.1 . exon 714305 714569 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023700.1"; gene_id "LTnewLTref_180023700:pseudogene"; CM024304.1 . transcript 714867 715070 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023800.1"; gene_id "LTnewLTref_180023800:pseudogene" CM024304.1 . exon 714867 715070 . + . transcript_id "LTnewLTref_180023800.1"; gene_id "LTnewLTref_180023800:pseudogene"; CM024304.1 AUGUSTUS transcript 716370 718364 1 + . transcript_id "LTnewLTref_180023900.1"; gene_id "LTnewLTref_180023900" CM024304.1 AUGUSTUS CDS 716370 718364 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_180023900.1"; gene_id "LTnewLTref_180023900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 4692 5660 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005000.1"; gene_id "LTnewLTref_190005000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 4692 5660 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005000.1"; gene_id "LTnewLTref_190005000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 6855 7973 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005100.1"; gene_id "LTnewLTref_190005100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 6855 7973 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005100.1"; gene_id "LTnewLTref_190005100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 8678 9001 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005200.1"; gene_id "LTnewLTref_190005200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 8678 9001 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005200.1"; gene_id "LTnewLTref_190005200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 9537 9860 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005300.1"; gene_id "LTnewLTref_190005300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 9537 9860 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005300.1"; gene_id "LTnewLTref_190005300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 10397 10720 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005400.1"; gene_id "LTnewLTref_190005400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 10397 10720 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005400.1"; gene_id "LTnewLTref_190005400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 11298 12095 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005500.1"; gene_id "LTnewLTref_190005500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 11298 12095 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005500.1"; gene_id "LTnewLTref_190005500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 13766 15046 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005600.1"; gene_id "LTnewLTref_190005600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 13766 15046 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005600.1"; gene_id "LTnewLTref_190005600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 16047 17345 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005700.1"; gene_id "LTnewLTref_190005700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 16047 17345 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005700.1"; gene_id "LTnewLTref_190005700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 18184 19395 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005800.1"; gene_id "LTnewLTref_190005800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 18184 19395 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005800.1"; gene_id "LTnewLTref_190005800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 21202 22101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190005900.1"; gene_id "LTnewLTref_190005900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 21202 22101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190005900.1"; gene_id "LTnewLTref_190005900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 23465 24340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006000.1"; gene_id "LTnewLTref_190006000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 23465 24340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006000.1"; gene_id "LTnewLTref_190006000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 25361 26050 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006100.1"; gene_id "LTnewLTref_190006100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 25361 26050 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006100.1"; gene_id "LTnewLTref_190006100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 27061 27822 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006200.1"; gene_id "LTnewLTref_190006200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 27061 27822 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006200.1"; gene_id "LTnewLTref_190006200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 28961 30856 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006300.1"; gene_id "LTnewLTref_190006300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 28961 30856 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006300.1"; gene_id "LTnewLTref_190006300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 33309 34151 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006400.1"; gene_id "LTnewLTref_190006400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 33309 34151 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006400.1"; gene_id "LTnewLTref_190006400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 36421 37563 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006500.1"; gene_id "LTnewLTref_190006500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 36421 37563 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006500.1"; gene_id "LTnewLTref_190006500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 39094 43569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006600.1"; gene_id "LTnewLTref_190006600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 39094 43569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006600.1"; gene_id "LTnewLTref_190006600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 48341 49561 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006700.1"; gene_id "LTnewLTref_190006700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 48341 49561 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006700.1"; gene_id "LTnewLTref_190006700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 51490 51981 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006800.1"; gene_id "LTnewLTref_190006800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 51490 51981 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006800.1"; gene_id "LTnewLTref_190006800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 54890 55843 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190006900.1"; gene_id "LTnewLTref_190006900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 54890 55843 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190006900.1"; gene_id "LTnewLTref_190006900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 60296 61249 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190007000.1"; gene_id "LTnewLTref_190007000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 60296 61249 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190007000.1"; gene_id "LTnewLTref_190007000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 62645 64873 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190007100.1"; gene_id "LTnewLTref_190007100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 62645 64873 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190007100.1"; gene_id "LTnewLTref_190007100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 72312 74387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007200.1"; gene_id "LTnewLTref_190007200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 72312 74387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007200.1"; gene_id "LTnewLTref_190007200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 76051 78069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007300.1"; gene_id "LTnewLTref_190007300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 76051 78069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007300.1"; gene_id "LTnewLTref_190007300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 79788 82415 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007400.1"; gene_id "LTnewLTref_190007400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 79788 82415 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007400.1"; gene_id "LTnewLTref_190007400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 84859 87387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007500.1"; gene_id "LTnewLTref_190007500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 84859 87387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007500.1"; gene_id "LTnewLTref_190007500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 95043 97925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007600.1"; gene_id "LTnewLTref_190007600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 95043 97925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007600.1"; gene_id "LTnewLTref_190007600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 101342 103237 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007700.1"; gene_id "LTnewLTref_190007700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 101342 103237 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007700.1"; gene_id "LTnewLTref_190007700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 104691 109226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190007800.1"; gene_id "LTnewLTref_190007800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 104691 109226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007800.1"; gene_id "LTnewLTref_190007800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 105129 109226 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_190007800.2"; gene_id "LTnewLTref_190007800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 105129 109226 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007800.2"; gene_id "LTnewLTref_190007800"; CM024305.1 Liftoff transcript 110916 111860 . + . transcript_id "LTnewLTref_190007900.1"; gene_id "LTnewLTref_190007900" CM024305.1 Liftoff CDS 110916 111860 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190007900.1"; gene_id "LTnewLTref_190007900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 116351 117529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008000.1"; gene_id "LTnewLTref_190008000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 116351 117529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008000.1"; gene_id "LTnewLTref_190008000"; CM024305.1 . transcript 118237 118485 . + . transcript_id "LTnewLTref_190008100.1"; gene_id "LTnewLTref_190008100:pseudogene" CM024305.1 . exon 118237 118485 . + . transcript_id "LTnewLTref_190008100.1"; gene_id "LTnewLTref_190008100:pseudogene"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 120542 121300 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008200.1"; gene_id "LTnewLTref_190008200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 120542 121300 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008200.1"; gene_id "LTnewLTref_190008200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 123808 125832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008300.1"; gene_id "LTnewLTref_190008300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 123808 125832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008300.1"; gene_id "LTnewLTref_190008300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 127366 129720 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008400.1"; gene_id "LTnewLTref_190008400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 127366 129720 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008400.1"; gene_id "LTnewLTref_190008400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 131135 132511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008500.1"; gene_id "LTnewLTref_190008500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 131135 132511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008500.1"; gene_id "LTnewLTref_190008500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 134689 135951 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008600.1"; gene_id "LTnewLTref_190008600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 134689 135951 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008600.1"; gene_id "LTnewLTref_190008600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 138807 144305 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008700.1"; gene_id "LTnewLTref_190008700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 138807 144305 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008700.1"; gene_id "LTnewLTref_190008700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 150094 153552 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190008800.1"; gene_id "LTnewLTref_190008800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 150094 153552 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008800.1"; gene_id "LTnewLTref_190008800"; CM024305.1 Liftoff transcript 157100 163591 . + . transcript_id "LTnewLTref_190008900.1"; gene_id "LTnewLTref_190008900" CM024305.1 Liftoff CDS 157100 163591 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190008900.1"; gene_id "LTnewLTref_190008900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 164512 164967 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009000.1"; gene_id "LTnewLTref_190009000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 164512 164967 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009000.1"; gene_id "LTnewLTref_190009000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 166635 167477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009100.1"; gene_id "LTnewLTref_190009100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 166635 167477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009100.1"; gene_id "LTnewLTref_190009100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 168714 169088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009200.1"; gene_id "LTnewLTref_190009200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 168714 169088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009200.1"; gene_id "LTnewLTref_190009200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 170544 170999 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009300.1"; gene_id "LTnewLTref_190009300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 170544 170999 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009300.1"; gene_id "LTnewLTref_190009300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 171679 175485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009400.1"; gene_id "LTnewLTref_190009400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 171679 175485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009400.1"; gene_id "LTnewLTref_190009400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 176247 177299 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009500.1"; gene_id "LTnewLTref_190009500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 176247 177299 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009500.1"; gene_id "LTnewLTref_190009500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 178933 181782 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009600.1"; gene_id "LTnewLTref_190009600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 178933 181782 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009600.1"; gene_id "LTnewLTref_190009600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 183740 184627 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009700.1"; gene_id "LTnewLTref_190009700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 183740 184627 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009700.1"; gene_id "LTnewLTref_190009700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 185284 186363 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009800.1"; gene_id "LTnewLTref_190009800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 185284 186363 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009800.1"; gene_id "LTnewLTref_190009800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 187632 188402 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190009900.1"; gene_id "LTnewLTref_190009900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 187632 188402 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190009900.1"; gene_id "LTnewLTref_190009900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 192648 193286 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010000.1"; gene_id "LTnewLTref_190010000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 192648 193286 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010000.1"; gene_id "LTnewLTref_190010000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 194450 195349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010100.1"; gene_id "LTnewLTref_190010100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 194450 195349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010100.1"; gene_id "LTnewLTref_190010100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 196680 201497 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010200.1"; gene_id "LTnewLTref_190010200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 196680 201497 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010200.1"; gene_id "LTnewLTref_190010200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 201975 203684 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010300.1"; gene_id "LTnewLTref_190010300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 201975 203684 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010300.1"; gene_id "LTnewLTref_190010300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 206202 208913 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010400.1"; gene_id "LTnewLTref_190010400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 206202 208913 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010400.1"; gene_id "LTnewLTref_190010400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 212965 214170 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010500.1"; gene_id "LTnewLTref_190010500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 212965 214170 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010500.1"; gene_id "LTnewLTref_190010500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 217346 221491 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010600.1"; gene_id "LTnewLTref_190010600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 217346 221491 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010600.1"; gene_id "LTnewLTref_190010600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 223417 224973 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010700.1"; gene_id "LTnewLTref_190010700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 223417 224973 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010700.1"; gene_id "LTnewLTref_190010700"; CM024305.1 Liftoff transcript 231229 231619 . + . transcript_id "LTnewLTref_190010800.1"; gene_id "LTnewLTref_190010800" CM024305.1 Liftoff CDS 231229 231619 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010800.1"; gene_id "LTnewLTref_190010800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 236988 245819 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190010900.1"; gene_id "LTnewLTref_190010900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 236988 245819 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190010900.1"; gene_id "LTnewLTref_190010900"; CM024305.1 . transcript 250423 255438 . + . transcript_id "LTnewLTref_190011000.1"; gene_id "LTnewLTref_190011000:pseudogene" CM024305.1 . exon 250423 255438 . + . transcript_id "LTnewLTref_190011000.1"; gene_id "LTnewLTref_190011000:pseudogene"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 263665 265956 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011100.1"; gene_id "LTnewLTref_190011100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 263665 265956 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011100.1"; gene_id "LTnewLTref_190011100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 270006 270326 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_190011200.1"; gene_id "LTnewLTref_190011200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 270006 270326 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011200.1"; gene_id "LTnewLTref_190011200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 271641 271922 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011300.1"; gene_id "LTnewLTref_190011300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 271641 271922 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011300.1"; gene_id "LTnewLTref_190011300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 273323 275557 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011400.1"; gene_id "LTnewLTref_190011400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 273323 275557 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011400.1"; gene_id "LTnewLTref_190011400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 277543 277980 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011500.1"; gene_id "LTnewLTref_190011500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 277543 277980 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011500.1"; gene_id "LTnewLTref_190011500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 280057 282813 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011600.1"; gene_id "LTnewLTref_190011600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 280057 282813 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011600.1"; gene_id "LTnewLTref_190011600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 284134 289932 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011700.1"; gene_id "LTnewLTref_190011700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 284134 289932 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011700.1"; gene_id "LTnewLTref_190011700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 290994 292322 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011800.1"; gene_id "LTnewLTref_190011800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 290994 292322 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011800.1"; gene_id "LTnewLTref_190011800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 293341 294426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190011900.1"; gene_id "LTnewLTref_190011900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 293341 294426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190011900.1"; gene_id "LTnewLTref_190011900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 296177 298751 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_190012000.1"; gene_id "LTnewLTref_190012000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 296177 298677 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012000.1"; gene_id "LTnewLTref_190012000"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 298739 298751 0.47 + 1 transcript_id "LTnewLTref_190012000.1"; gene_id "LTnewLTref_190012000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 296177 299563 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_190012000.2"; gene_id "LTnewLTref_190012000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 296177 299563 0.82 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012000.2"; gene_id "LTnewLTref_190012000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 304335 307634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012100.1"; gene_id "LTnewLTref_190012100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 304335 307634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012100.1"; gene_id "LTnewLTref_190012100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 311686 318528 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012200.1"; gene_id "LTnewLTref_190012200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 311686 318528 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012200.1"; gene_id "LTnewLTref_190012200"; CM024305.1 . transcript 320011 321013 . + . transcript_id "LTnewLTref_190012300.1"; gene_id "LTnewLTref_190012300:pseudogene" CM024305.1 . exon 320011 320982 . + . transcript_id "LTnewLTref_190012300.1"; gene_id "LTnewLTref_190012300:pseudogene"; CM024305.1 . exon 320984 321013 . + . transcript_id "LTnewLTref_190012300.1"; gene_id "LTnewLTref_190012300:pseudogene"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 322547 323461 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012400.1"; gene_id "LTnewLTref_190012400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 322547 323461 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012400.1"; gene_id "LTnewLTref_190012400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 325360 326517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012500.1"; gene_id "LTnewLTref_190012500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 325360 326517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012500.1"; gene_id "LTnewLTref_190012500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 328456 329799 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012600.1"; gene_id "LTnewLTref_190012600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 328456 329799 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012600.1"; gene_id "LTnewLTref_190012600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 330661 332235 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012700.1"; gene_id "LTnewLTref_190012700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 330661 332235 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012700.1"; gene_id "LTnewLTref_190012700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 334117 335583 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012800.1"; gene_id "LTnewLTref_190012800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 334117 335583 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012800.1"; gene_id "LTnewLTref_190012800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 336528 337235 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190012900.1"; gene_id "LTnewLTref_190012900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 336528 337235 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190012900.1"; gene_id "LTnewLTref_190012900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 337901 338659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013000.1"; gene_id "LTnewLTref_190013000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 337901 338659 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013000.1"; gene_id "LTnewLTref_190013000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 339434 341659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013100.1"; gene_id "LTnewLTref_190013100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 339434 341659 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013100.1"; gene_id "LTnewLTref_190013100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 342431 344269 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013200.1"; gene_id "LTnewLTref_190013200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 342431 344269 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013200.1"; gene_id "LTnewLTref_190013200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 347054 349663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013300.1"; gene_id "LTnewLTref_190013300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 347054 349663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013300.1"; gene_id "LTnewLTref_190013300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 350617 350985 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013400.1"; gene_id "LTnewLTref_190013400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 350617 350985 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013400.1"; gene_id "LTnewLTref_190013400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 351937 352140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013500.1"; gene_id "LTnewLTref_190013500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 351937 352140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013500.1"; gene_id "LTnewLTref_190013500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 352817 353227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013600.1"; gene_id "LTnewLTref_190013600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 352817 353227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013600.1"; gene_id "LTnewLTref_190013600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 355532 355897 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013700.1"; gene_id "LTnewLTref_190013700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 355532 355897 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013700.1"; gene_id "LTnewLTref_190013700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 358000 358377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013800.1"; gene_id "LTnewLTref_190013800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 358000 358377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013800.1"; gene_id "LTnewLTref_190013800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 358998 359375 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190013900.1"; gene_id "LTnewLTref_190013900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 358998 359375 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190013900.1"; gene_id "LTnewLTref_190013900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 360039 360404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014000.1"; gene_id "LTnewLTref_190014000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 360039 360404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014000.1"; gene_id "LTnewLTref_190014000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 362668 363045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014100.1"; gene_id "LTnewLTref_190014100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 362668 363045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014100.1"; gene_id "LTnewLTref_190014100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 363735 364112 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014200.1"; gene_id "LTnewLTref_190014200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 363735 364112 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014200.1"; gene_id "LTnewLTref_190014200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 364805 365182 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014300.1"; gene_id "LTnewLTref_190014300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 364805 365182 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014300.1"; gene_id "LTnewLTref_190014300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 365881 366246 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014400.1"; gene_id "LTnewLTref_190014400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 365881 366246 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014400.1"; gene_id "LTnewLTref_190014400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 368063 370084 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014500.1"; gene_id "LTnewLTref_190014500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 368063 370084 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014500.1"; gene_id "LTnewLTref_190014500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 374001 376727 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014600.1"; gene_id "LTnewLTref_190014600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 374001 376727 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014600.1"; gene_id "LTnewLTref_190014600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 377449 379416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014700.1"; gene_id "LTnewLTref_190014700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 377449 379416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014700.1"; gene_id "LTnewLTref_190014700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 380381 382801 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014800.1"; gene_id "LTnewLTref_190014800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 380381 382801 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014800.1"; gene_id "LTnewLTref_190014800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 383493 383831 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190014900.1"; gene_id "LTnewLTref_190014900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 383493 383831 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190014900.1"; gene_id "LTnewLTref_190014900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 384742 385347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015000.1"; gene_id "LTnewLTref_190015000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 384742 385347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015000.1"; gene_id "LTnewLTref_190015000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 388397 391282 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015100.1"; gene_id "LTnewLTref_190015100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 388397 391282 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015100.1"; gene_id "LTnewLTref_190015100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 396292 398244 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015200.1"; gene_id "LTnewLTref_190015200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 396292 398244 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015200.1"; gene_id "LTnewLTref_190015200"; CM024305.1 . transcript 401498 403248 . + . transcript_id "LTnewLTref_190015300.1"; gene_id "LTnewLTref_190015300:pseudogene" CM024305.1 . exon 401498 401881 . + . transcript_id "LTnewLTref_190015300.1"; gene_id "LTnewLTref_190015300:pseudogene"; CM024305.1 . exon 401884 403248 . + . transcript_id "LTnewLTref_190015300.1"; gene_id "LTnewLTref_190015300:pseudogene"; CM024305.1 . transcript 403976 404206 . + . transcript_id "LTnewLTref_190015400.1"; gene_id "LTnewLTref_190015400:pseudogene" CM024305.1 . exon 403976 404206 . + . transcript_id "LTnewLTref_190015400.1"; gene_id "LTnewLTref_190015400:pseudogene"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 407963 409957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015500.1"; gene_id "LTnewLTref_190015500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 407963 409957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015500.1"; gene_id "LTnewLTref_190015500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 413009 415441 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015600.1"; gene_id "LTnewLTref_190015600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 413009 415441 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015600.1"; gene_id "LTnewLTref_190015600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 417217 418354 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_190015700.1"; gene_id "LTnewLTref_190015700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 417217 418354 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015700.1"; gene_id "LTnewLTref_190015700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 417217 419262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015700.2"; gene_id "LTnewLTref_190015700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 417217 419262 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015700.2"; gene_id "LTnewLTref_190015700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 420444 421331 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015800.1"; gene_id "LTnewLTref_190015800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 420444 421331 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015800.1"; gene_id "LTnewLTref_190015800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 422198 424099 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190015900.1"; gene_id "LTnewLTref_190015900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 422198 424099 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190015900.1"; gene_id "LTnewLTref_190015900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 426292 430401 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016000.1"; gene_id "LTnewLTref_190016000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 426292 427123 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016000.1"; gene_id "LTnewLTref_190016000"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 427199 430401 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_190016000.1"; gene_id "LTnewLTref_190016000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 431768 435532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016100.1"; gene_id "LTnewLTref_190016100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 431768 435532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016100.1"; gene_id "LTnewLTref_190016100"; CM024305.1 Liftoff transcript 437141 437374 . + . transcript_id "LTnewLTref_190016200.1"; gene_id "LTnewLTref_190016200" CM024305.1 Liftoff CDS 437141 437374 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016200.1"; gene_id "LTnewLTref_190016200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 440433 443333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016300.1"; gene_id "LTnewLTref_190016300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 440433 443333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016300.1"; gene_id "LTnewLTref_190016300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 445090 456477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016400.1"; gene_id "LTnewLTref_190016400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 445090 456477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016400.1"; gene_id "LTnewLTref_190016400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 449317 456477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016400.2"; gene_id "LTnewLTref_190016400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 449317 456477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016400.2"; gene_id "LTnewLTref_190016400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 451195 456477 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_190016400.3"; gene_id "LTnewLTref_190016400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 451195 456477 0.82 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016400.3"; gene_id "LTnewLTref_190016400"; CM024305.1 Liftoff transcript 457122 457448 . + . transcript_id "LTnewLTref_190016500.1"; gene_id "LTnewLTref_190016500" CM024305.1 Liftoff CDS 457122 457448 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016500.1"; gene_id "LTnewLTref_190016500"; CM024305.1 . transcript 458377 458673 . + . transcript_id "LTnewLTref_190016600.1"; gene_id "LTnewLTref_190016600" CM024305.1 . CDS 458377 458673 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016600.1"; gene_id "LTnewLTref_190016600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 459540 463493 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016700.1"; gene_id "LTnewLTref_190016700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 459540 463493 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016700.1"; gene_id "LTnewLTref_190016700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 466087 467121 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016800.1"; gene_id "LTnewLTref_190016800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 466087 467121 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016800.1"; gene_id "LTnewLTref_190016800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 468324 469562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190016900.1"; gene_id "LTnewLTref_190016900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 468324 469562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190016900.1"; gene_id "LTnewLTref_190016900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 471784 489170 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_190017000.1"; gene_id "LTnewLTref_190017000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 471784 484442 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017000.1"; gene_id "LTnewLTref_190017000"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 484496 489170 0.98 + 1 transcript_id "LTnewLTref_190017000.1"; gene_id "LTnewLTref_190017000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 490538 492967 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017100.1"; gene_id "LTnewLTref_190017100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 490538 492967 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017100.1"; gene_id "LTnewLTref_190017100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 494450 502459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017200.1"; gene_id "LTnewLTref_190017200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 494450 502459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017200.1"; gene_id "LTnewLTref_190017200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 504098 505207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017300.1"; gene_id "LTnewLTref_190017300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 504098 505207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017300.1"; gene_id "LTnewLTref_190017300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 508035 510857 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017400.1"; gene_id "LTnewLTref_190017400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 508035 510857 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017400.1"; gene_id "LTnewLTref_190017400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 512373 517675 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_190017500.1"; gene_id "LTnewLTref_190017500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 512373 517100 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017500.1"; gene_id "LTnewLTref_190017500"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 517157 517675 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017500.1"; gene_id "LTnewLTref_190017500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 518653 519045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017600.1"; gene_id "LTnewLTref_190017600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 518653 519045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017600.1"; gene_id "LTnewLTref_190017600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 520383 521825 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017700.1"; gene_id "LTnewLTref_190017700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 520383 521825 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017700.1"; gene_id "LTnewLTref_190017700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 521601 521825 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017700.2"; gene_id "LTnewLTref_190017700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 521601 521825 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017700.2"; gene_id "LTnewLTref_190017700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 522706 523335 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017800.1"; gene_id "LTnewLTref_190017800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 522706 523335 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017800.1"; gene_id "LTnewLTref_190017800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 524342 525223 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190017900.1"; gene_id "LTnewLTref_190017900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 524342 525223 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190017900.1"; gene_id "LTnewLTref_190017900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 527396 528562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018000.1"; gene_id "LTnewLTref_190018000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 527396 528562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018000.1"; gene_id "LTnewLTref_190018000"; CM024305.1 Liftoff transcript 528911 529108 . + . transcript_id "LTnewLTref_190018100.1"; gene_id "LTnewLTref_190018100" CM024305.1 Liftoff CDS 528911 529108 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018100.1"; gene_id "LTnewLTref_190018100"; CM024305.1 . transcript 529936 530232 . - . transcript_id "LTnewLTref_190018200.1"; gene_id "LTnewLTref_190018200" CM024305.1 . CDS 529936 530232 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_190018200.1"; gene_id "LTnewLTref_190018200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 531156 536531 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018300.1"; gene_id "LTnewLTref_190018300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 531156 536531 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018300.1"; gene_id "LTnewLTref_190018300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 537722 539107 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018400.1"; gene_id "LTnewLTref_190018400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 537722 539107 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018400.1"; gene_id "LTnewLTref_190018400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 540390 540905 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018500.1"; gene_id "LTnewLTref_190018500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 540390 540905 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018500.1"; gene_id "LTnewLTref_190018500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 541507 542190 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018600.1"; gene_id "LTnewLTref_190018600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 541507 542190 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018600.1"; gene_id "LTnewLTref_190018600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 542990 543823 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018700.1"; gene_id "LTnewLTref_190018700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 542990 543823 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018700.1"; gene_id "LTnewLTref_190018700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 545964 546815 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018800.1"; gene_id "LTnewLTref_190018800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 545964 546815 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018800.1"; gene_id "LTnewLTref_190018800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 548507 551062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190018900.1"; gene_id "LTnewLTref_190018900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 548507 551062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190018900.1"; gene_id "LTnewLTref_190018900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 554447 557377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190019000.1"; gene_id "LTnewLTref_190019000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 554447 557377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019000.1"; gene_id "LTnewLTref_190019000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 558475 559266 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_190019100.1"; gene_id "LTnewLTref_190019100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 558475 558526 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019100.1"; gene_id "LTnewLTref_190019100"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 558623 559266 0.93 + 2 transcript_id "LTnewLTref_190019100.1"; gene_id "LTnewLTref_190019100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 559518 559733 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190019200.1"; gene_id "LTnewLTref_190019200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 559518 559733 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019200.1"; gene_id "LTnewLTref_190019200"; CM024305.1 Liftoff transcript 561613 562005 . + . transcript_id "LTnewLTref_190019300.1"; gene_id "LTnewLTref_190019300" CM024305.1 Liftoff CDS 561613 562005 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019300.1"; gene_id "LTnewLTref_190019300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 562873 566936 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_190019400.1"; gene_id "LTnewLTref_190019400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 562873 563186 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019400.1"; gene_id "LTnewLTref_190019400"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 565403 566936 0.83 + 1 transcript_id "LTnewLTref_190019400.1"; gene_id "LTnewLTref_190019400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 569378 571900 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190019500.1"; gene_id "LTnewLTref_190019500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 569378 571900 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019500.1"; gene_id "LTnewLTref_190019500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 574610 576664 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190019600.1"; gene_id "LTnewLTref_190019600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 574610 576664 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019600.1"; gene_id "LTnewLTref_190019600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 577699 578070 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190019700.1"; gene_id "LTnewLTref_190019700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 577699 578070 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019700.1"; gene_id "LTnewLTref_190019700"; CM024305.1 . transcript 578558 579561 . + . transcript_id "LTnewLTref_190019800.1"; gene_id "LTnewLTref_190019800:pseudogene" CM024305.1 . exon 578558 578800 . + . transcript_id "LTnewLTref_190019800.1"; gene_id "LTnewLTref_190019800:pseudogene"; CM024305.1 . exon 578803 579561 . + . transcript_id "LTnewLTref_190019800.1"; gene_id "LTnewLTref_190019800:pseudogene"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 582971 585238 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190019900.1"; gene_id "LTnewLTref_190019900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 582971 585238 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190019900.1"; gene_id "LTnewLTref_190019900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 587184 587480 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190020000.1"; gene_id "LTnewLTref_190020000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 587184 587480 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190020000.1"; gene_id "LTnewLTref_190020000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 587756 588276 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190020100.1"; gene_id "LTnewLTref_190020100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 587756 587957 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_190020100.1"; gene_id "LTnewLTref_190020100"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 588020 588276 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190020100.1"; gene_id "LTnewLTref_190020100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 588602 588955 1 - . transcript_id "LTnewLTref_190020200.1"; gene_id "LTnewLTref_190020200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 588602 588955 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_190020200.1"; gene_id "LTnewLTref_190020200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 590500 591702 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020300.1"; gene_id "LTnewLTref_190020300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 590500 591702 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020300.1"; gene_id "LTnewLTref_190020300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 593204 593470 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020400.1"; gene_id "LTnewLTref_190020400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 593204 593470 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020400.1"; gene_id "LTnewLTref_190020400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 595134 595628 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020500.1"; gene_id "LTnewLTref_190020500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 595134 595628 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020500.1"; gene_id "LTnewLTref_190020500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 597722 599944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020600.1"; gene_id "LTnewLTref_190020600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 597722 599944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020600.1"; gene_id "LTnewLTref_190020600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 603428 605287 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020700.1"; gene_id "LTnewLTref_190020700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 603428 605287 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020700.1"; gene_id "LTnewLTref_190020700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 606431 607312 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020800.1"; gene_id "LTnewLTref_190020800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 606431 607312 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020800.1"; gene_id "LTnewLTref_190020800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 608171 608857 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190020900.1"; gene_id "LTnewLTref_190020900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 608171 608857 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190020900.1"; gene_id "LTnewLTref_190020900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 611072 613873 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021000.1"; gene_id "LTnewLTref_190021000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 611072 613873 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021000.1"; gene_id "LTnewLTref_190021000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 615009 616073 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021100.1"; gene_id "LTnewLTref_190021100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 615009 616073 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021100.1"; gene_id "LTnewLTref_190021100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 616104 616427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021200.1"; gene_id "LTnewLTref_190021200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 616104 616427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021200.1"; gene_id "LTnewLTref_190021200"; CM024305.1 Liftoff transcript 625638 626735 . + . transcript_id "LTnewLTref_190021300.1"; gene_id "LTnewLTref_190021300" CM024305.1 Liftoff CDS 625638 626735 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021300.1"; gene_id "LTnewLTref_190021300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 627025 628116 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021400.1"; gene_id "LTnewLTref_190021400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 627025 628116 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021400.1"; gene_id "LTnewLTref_190021400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 628510 630264 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021500.1"; gene_id "LTnewLTref_190021500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 628510 630264 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021500.1"; gene_id "LTnewLTref_190021500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 630848 631093 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021600.1"; gene_id "LTnewLTref_190021600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 630848 631093 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021600.1"; gene_id "LTnewLTref_190021600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 631471 631824 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021700.1"; gene_id "LTnewLTref_190021700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 631471 631824 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021700.1"; gene_id "LTnewLTref_190021700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 632621 634486 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021800.1"; gene_id "LTnewLTref_190021800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 632621 634486 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021800.1"; gene_id "LTnewLTref_190021800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 636600 637445 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190021900.1"; gene_id "LTnewLTref_190021900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 636600 637445 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190021900.1"; gene_id "LTnewLTref_190021900"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 638226 638570 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022000.1"; gene_id "LTnewLTref_190022000" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 638226 638570 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022000.1"; gene_id "LTnewLTref_190022000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 639866 640831 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022100.1"; gene_id "LTnewLTref_190022100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 639866 640831 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022100.1"; gene_id "LTnewLTref_190022100"; CM024305.1 . transcript 642708 643004 . + . transcript_id "LTnewLTref_190022200.1"; gene_id "LTnewLTref_190022200" CM024305.1 . CDS 642708 643004 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022200.1"; gene_id "LTnewLTref_190022200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 645690 648308 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022300.1"; gene_id "LTnewLTref_190022300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 645690 648308 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022300.1"; gene_id "LTnewLTref_190022300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 649385 650683 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022400.1"; gene_id "LTnewLTref_190022400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 649385 650683 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022400.1"; gene_id "LTnewLTref_190022400"; CM024305.1 . transcript 651920 652216 . - . transcript_id "LTnewLTref_190022500.1"; gene_id "LTnewLTref_190022500" CM024305.1 . CDS 651920 652216 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_190022500.1"; gene_id "LTnewLTref_190022500"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 655286 657883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022600.1"; gene_id "LTnewLTref_190022600" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 655286 657883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022600.1"; gene_id "LTnewLTref_190022600"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 658764 659969 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022700.1"; gene_id "LTnewLTref_190022700" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 658764 659969 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022700.1"; gene_id "LTnewLTref_190022700"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 661395 662939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022800.1"; gene_id "LTnewLTref_190022800" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 661395 662939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022800.1"; gene_id "LTnewLTref_190022800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 664782 665735 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190022900.1"; gene_id "LTnewLTref_190022900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 664782 665735 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190022900.1"; gene_id "LTnewLTref_190022900"; CM024305.1 Liftoff transcript 666616 667800 . + . transcript_id "LTnewLTref_190023000.1"; gene_id "LTnewLTref_190023000" CM024305.1 Liftoff CDS 666616 667800 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023000.1"; gene_id "LTnewLTref_190023000"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 668762 670558 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190023100.1"; gene_id "LTnewLTref_190023100" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 668762 670558 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023100.1"; gene_id "LTnewLTref_190023100"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 671399 671899 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190023200.1"; gene_id "LTnewLTref_190023200" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 671399 671899 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023200.1"; gene_id "LTnewLTref_190023200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 672700 673632 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190023300.1"; gene_id "LTnewLTref_190023300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 672700 673632 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023300.1"; gene_id "LTnewLTref_190023300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 674093 675019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190023400.1"; gene_id "LTnewLTref_190023400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 674093 675019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023400.1"; gene_id "LTnewLTref_190023400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 675566 675943 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190023500.1"; gene_id "LTnewLTref_190023500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 675566 675943 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023500.1"; gene_id "LTnewLTref_190023500"; CM024305.1 Liftoff transcript 678379 678733 . + . transcript_id "LTnewLTref_190023600.1"; gene_id "LTnewLTref_190023600" CM024305.1 Liftoff CDS 678379 678733 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023600.1"; gene_id "LTnewLTref_190023600"; CM024305.1 INFERNAL transcript 679038 679110 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_190023700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_190023700" CM024305.1 INFERNAL exon 679038 679110 . + . transcript_id "LTnewLTref_190023700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_190023700"; CM024305.1 INFERNAL transcript 679211 679299 106 + . transcript_id "LTnewLTref_190023800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_190023800" CM024305.1 INFERNAL exon 679211 679299 . + . transcript_id "LTnewLTref_190023800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_190023800"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 680018 682045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190023900.1"; gene_id "LTnewLTref_190023900" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 680018 682045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190023900.1"; gene_id "LTnewLTref_190023900"; CM024305.1 . transcript 680381 681097 . - . transcript_id "LTnewLTref_190024000.1"; gene_id "LTnewLTref_190024000:pseudogene" CM024305.1 . exon 680381 681097 . - . transcript_id "LTnewLTref_190024000.1"; gene_id "LTnewLTref_190024000:pseudogene"; CM024305.1 Liftoff transcript 681218 681427 . - . transcript_id "LTnewLTref_190024100.1"; gene_id "LTnewLTref_190024100" CM024305.1 Liftoff CDS 681218 681427 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_190024100.1"; gene_id "LTnewLTref_190024100"; CM024305.1 Liftoff transcript 681544 681804 . - . transcript_id "LTnewLTref_190024200.1"; gene_id "LTnewLTref_190024200" CM024305.1 Liftoff CDS 681544 681804 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_190024200.1"; gene_id "LTnewLTref_190024200"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 686927 689534 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_190024300.1"; gene_id "LTnewLTref_190024300" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 686927 687686 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190024300.1"; gene_id "LTnewLTref_190024300"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 687751 689534 0.59 + 2 transcript_id "LTnewLTref_190024300.1"; gene_id "LTnewLTref_190024300"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 690553 692851 0.71 + . transcript_id "LTnewLTref_190024400.1"; gene_id "LTnewLTref_190024400" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 690553 691098 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190024400.1"; gene_id "LTnewLTref_190024400"; CM024305.1 AUGUSTUS CDS 691160 692851 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190024400.1"; gene_id "LTnewLTref_190024400"; CM024305.1 AUGUSTUS transcript 692897 695449 1 + . transcript_id "LTnewLTref_190024500.1"; gene_id "LTnewLTref_190024500" CM024305.1 AUGUSTUS CDS 692897 695449 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_190024500.1"; gene_id "LTnewLTref_190024500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 7064 10462 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005000.1"; gene_id "LTnewLTref_200005000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 7064 10462 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005000.1"; gene_id "LTnewLTref_200005000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 11097 12335 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005100.1"; gene_id "LTnewLTref_200005100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 11097 12335 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005100.1"; gene_id "LTnewLTref_200005100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 13336 14175 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005200.1"; gene_id "LTnewLTref_200005200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 13336 14175 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005200.1"; gene_id "LTnewLTref_200005200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 16118 17746 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005300.1"; gene_id "LTnewLTref_200005300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 16118 17746 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005300.1"; gene_id "LTnewLTref_200005300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 18655 19623 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005400.1"; gene_id "LTnewLTref_200005400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 18655 19623 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005400.1"; gene_id "LTnewLTref_200005400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 21094 21570 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005500.1"; gene_id "LTnewLTref_200005500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 21094 21570 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005500.1"; gene_id "LTnewLTref_200005500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 22554 26052 0.5 - . transcript_id "LTnewLTref_200005600.1"; gene_id "LTnewLTref_200005600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 22554 23243 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005600.1"; gene_id "LTnewLTref_200005600"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 23344 26052 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005600.1"; gene_id "LTnewLTref_200005600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 27099 27710 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005700.1"; gene_id "LTnewLTref_200005700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 27099 27710 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005700.1"; gene_id "LTnewLTref_200005700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 29329 31056 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005800.1"; gene_id "LTnewLTref_200005800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 29329 31056 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005800.1"; gene_id "LTnewLTref_200005800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 33413 36745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200005900.1"; gene_id "LTnewLTref_200005900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 33413 36745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200005900.1"; gene_id "LTnewLTref_200005900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 39291 40730 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006000.1"; gene_id "LTnewLTref_200006000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 39291 40730 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006000.1"; gene_id "LTnewLTref_200006000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 42122 43375 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006100.1"; gene_id "LTnewLTref_200006100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 42122 43375 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006100.1"; gene_id "LTnewLTref_200006100"; CM024306.1 . transcript 44280 44706 . - . transcript_id "LTnewLTref_200006200.1"; gene_id "LTnewLTref_200006200:pseudogene" CM024306.1 . exon 44280 44706 . - . transcript_id "LTnewLTref_200006200.1"; gene_id "LTnewLTref_200006200:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 46168 47838 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006300.1"; gene_id "LTnewLTref_200006300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 46168 47838 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006300.1"; gene_id "LTnewLTref_200006300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 48798 50132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006400.1"; gene_id "LTnewLTref_200006400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 48798 50132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006400.1"; gene_id "LTnewLTref_200006400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 51897 55556 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006500.1"; gene_id "LTnewLTref_200006500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 51897 55556 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006500.1"; gene_id "LTnewLTref_200006500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 57548 60274 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006600.1"; gene_id "LTnewLTref_200006600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 57548 60274 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006600.1"; gene_id "LTnewLTref_200006600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 61940 64357 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006700.1"; gene_id "LTnewLTref_200006700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 61940 64357 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006700.1"; gene_id "LTnewLTref_200006700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 65253 66371 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006800.1"; gene_id "LTnewLTref_200006800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 65253 66371 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006800.1"; gene_id "LTnewLTref_200006800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 67376 69964 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200006900.1"; gene_id "LTnewLTref_200006900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 67376 69964 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200006900.1"; gene_id "LTnewLTref_200006900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 70991 71593 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007000.1"; gene_id "LTnewLTref_200007000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 70991 71593 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007000.1"; gene_id "LTnewLTref_200007000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 72196 74772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007100.1"; gene_id "LTnewLTref_200007100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 72196 74772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007100.1"; gene_id "LTnewLTref_200007100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 75621 76874 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007200.1"; gene_id "LTnewLTref_200007200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 75621 76874 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007200.1"; gene_id "LTnewLTref_200007200"; CM024306.1 Liftoff transcript 77822 78079 . - . transcript_id "LTnewLTref_200007300.1"; gene_id "LTnewLTref_200007300" CM024306.1 Liftoff CDS 77822 78079 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007300.1"; gene_id "LTnewLTref_200007300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 79593 82442 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007400.1"; gene_id "LTnewLTref_200007400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 79593 82442 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007400.1"; gene_id "LTnewLTref_200007400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 83397 83972 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007500.1"; gene_id "LTnewLTref_200007500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 83397 83972 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007500.1"; gene_id "LTnewLTref_200007500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 84969 85754 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007600.1"; gene_id "LTnewLTref_200007600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 84969 85754 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007600.1"; gene_id "LTnewLTref_200007600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 86510 87649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007700.1"; gene_id "LTnewLTref_200007700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 86510 87649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007700.1"; gene_id "LTnewLTref_200007700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 89711 104188 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200007800.1"; gene_id "LTnewLTref_200007800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 89711 104188 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200007800.1"; gene_id "LTnewLTref_200007800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 105510 106298 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200007900.1"; gene_id "LTnewLTref_200007900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 105510 106298 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200007900.1"; gene_id "LTnewLTref_200007900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 106636 107739 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_200008000.1"; gene_id "LTnewLTref_200008000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 106636 107739 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008000.1"; gene_id "LTnewLTref_200008000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 108237 109598 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200008100.1"; gene_id "LTnewLTref_200008100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 108237 109598 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008100.1"; gene_id "LTnewLTref_200008100"; CM024306.1 . transcript 110083 110351 . + . transcript_id "LTnewLTref_200008200.1"; gene_id "LTnewLTref_200008200:pseudogene" CM024306.1 . exon 110083 110223 . + . transcript_id "LTnewLTref_200008200.1"; gene_id "LTnewLTref_200008200:pseudogene"; CM024306.1 . exon 110226 110351 . + . transcript_id "LTnewLTref_200008200.1"; gene_id "LTnewLTref_200008200:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 111558 113957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200008300.1"; gene_id "LTnewLTref_200008300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 111558 113957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008300.1"; gene_id "LTnewLTref_200008300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 114808 116043 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_200008400.1"; gene_id "LTnewLTref_200008400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 114808 116043 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008400.1"; gene_id "LTnewLTref_200008400"; CM024306.1 . transcript 117779 118047 . - . transcript_id "LTnewLTref_200008500.1"; gene_id "LTnewLTref_200008500:pseudogene" CM024306.1 . exon 117779 117904 . - . transcript_id "LTnewLTref_200008500.1"; gene_id "LTnewLTref_200008500:pseudogene"; CM024306.1 . exon 117907 118047 . - . transcript_id "LTnewLTref_200008500.1"; gene_id "LTnewLTref_200008500:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 119269 119523 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200008600.1"; gene_id "LTnewLTref_200008600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 119269 119523 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008600.1"; gene_id "LTnewLTref_200008600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 120289 122388 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200008700.1"; gene_id "LTnewLTref_200008700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 120289 122388 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008700.1"; gene_id "LTnewLTref_200008700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 123193 124146 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200008800.1"; gene_id "LTnewLTref_200008800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 123193 124146 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008800.1"; gene_id "LTnewLTref_200008800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 125087 126256 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200008900.1"; gene_id "LTnewLTref_200008900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 125087 126256 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200008900.1"; gene_id "LTnewLTref_200008900"; CM024306.1 . transcript 126620 126889 . + . transcript_id "LTnewLTref_200009000.1"; gene_id "LTnewLTref_200009000" CM024306.1 . CDS 126620 126889 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009000.1"; gene_id "LTnewLTref_200009000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 127335 128261 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009100.1"; gene_id "LTnewLTref_200009100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 127335 128261 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009100.1"; gene_id "LTnewLTref_200009100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 149782 151974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009200.1"; gene_id "LTnewLTref_200009200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 149782 151974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009200.1"; gene_id "LTnewLTref_200009200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 153019 154263 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009300.1"; gene_id "LTnewLTref_200009300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 153019 154263 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009300.1"; gene_id "LTnewLTref_200009300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 157096 158058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009400.1"; gene_id "LTnewLTref_200009400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 157096 158058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009400.1"; gene_id "LTnewLTref_200009400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 161515 165156 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009500.1"; gene_id "LTnewLTref_200009500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 161515 165156 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009500.1"; gene_id "LTnewLTref_200009500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 167372 171568 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009600.1"; gene_id "LTnewLTref_200009600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 167372 171568 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009600.1"; gene_id "LTnewLTref_200009600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 172350 173591 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009700.1"; gene_id "LTnewLTref_200009700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 172350 173591 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009700.1"; gene_id "LTnewLTref_200009700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 175712 176799 0.81 + . transcript_id "LTnewLTref_200009800.1"; gene_id "LTnewLTref_200009800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 175712 176638 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009800.1"; gene_id "LTnewLTref_200009800"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 176689 176799 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009800.1"; gene_id "LTnewLTref_200009800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 177625 179331 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200009900.1"; gene_id "LTnewLTref_200009900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 177625 179331 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200009900.1"; gene_id "LTnewLTref_200009900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 180176 180973 0.71 + . transcript_id "LTnewLTref_200010000.1"; gene_id "LTnewLTref_200010000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 180176 180973 0.71 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010000.1"; gene_id "LTnewLTref_200010000"; CM024306.1 . transcript 181983 186014 . + . transcript_id "LTnewLTref_200010100.1"; gene_id "LTnewLTref_200010100:pseudogene" CM024306.1 . exon 181983 186014 . + . transcript_id "LTnewLTref_200010100.1"; gene_id "LTnewLTref_200010100:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 186940 188058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010200.1"; gene_id "LTnewLTref_200010200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 186940 188058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010200.1"; gene_id "LTnewLTref_200010200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 189341 191716 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010300.1"; gene_id "LTnewLTref_200010300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 189341 191716 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010300.1"; gene_id "LTnewLTref_200010300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 193206 194669 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010400.1"; gene_id "LTnewLTref_200010400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 193206 194669 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010400.1"; gene_id "LTnewLTref_200010400"; CM024306.1 Liftoff transcript 195384 195653 . + . transcript_id "LTnewLTref_200010500.1"; gene_id "LTnewLTref_200010500" CM024306.1 Liftoff CDS 195384 195653 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010500.1"; gene_id "LTnewLTref_200010500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 196503 196793 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010600.1"; gene_id "LTnewLTref_200010600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 196503 196793 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010600.1"; gene_id "LTnewLTref_200010600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 199824 200951 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010700.1"; gene_id "LTnewLTref_200010700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 199824 200951 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010700.1"; gene_id "LTnewLTref_200010700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 201858 203675 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010800.1"; gene_id "LTnewLTref_200010800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 201858 203675 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010800.1"; gene_id "LTnewLTref_200010800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 204475 206133 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200010900.1"; gene_id "LTnewLTref_200010900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 204475 206133 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200010900.1"; gene_id "LTnewLTref_200010900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 206746 207174 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_200011000.1"; gene_id "LTnewLTref_200011000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 206746 207174 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011000.1"; gene_id "LTnewLTref_200011000"; CM024306.1 Liftoff transcript 207878 208114 . + . transcript_id "LTnewLTref_200011100.1"; gene_id "LTnewLTref_200011100" CM024306.1 Liftoff CDS 207878 208114 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011100.1"; gene_id "LTnewLTref_200011100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 208873 210525 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011200.1"; gene_id "LTnewLTref_200011200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 208873 210525 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011200.1"; gene_id "LTnewLTref_200011200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 211909 213198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011300.1"; gene_id "LTnewLTref_200011300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 211909 213198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011300.1"; gene_id "LTnewLTref_200011300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 214261 217149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011400.1"; gene_id "LTnewLTref_200011400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 214261 217149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011400.1"; gene_id "LTnewLTref_200011400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 217976 218410 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011500.1"; gene_id "LTnewLTref_200011500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 217976 218410 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011500.1"; gene_id "LTnewLTref_200011500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 219383 220081 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011600.1"; gene_id "LTnewLTref_200011600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 219383 220081 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011600.1"; gene_id "LTnewLTref_200011600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 221112 222749 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011700.1"; gene_id "LTnewLTref_200011700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 221112 222749 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011700.1"; gene_id "LTnewLTref_200011700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 224013 225815 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011800.1"; gene_id "LTnewLTref_200011800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 224013 225815 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011800.1"; gene_id "LTnewLTref_200011800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 228249 230798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200011900.1"; gene_id "LTnewLTref_200011900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 228249 230798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200011900.1"; gene_id "LTnewLTref_200011900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 232481 233776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012000.1"; gene_id "LTnewLTref_200012000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 232481 233776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012000.1"; gene_id "LTnewLTref_200012000"; CM024306.1 . transcript 234470 234828 . + . transcript_id "LTnewLTref_200012100.1"; gene_id "LTnewLTref_200012100:pseudogene" CM024306.1 . exon 234470 234828 . + . transcript_id "LTnewLTref_200012100.1"; gene_id "LTnewLTref_200012100:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 236819 237085 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_200012200.1"; gene_id "LTnewLTref_200012200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 236819 237085 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012200.1"; gene_id "LTnewLTref_200012200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 238110 239957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012300.1"; gene_id "LTnewLTref_200012300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 238110 239957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012300.1"; gene_id "LTnewLTref_200012300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 240957 242177 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012400.1"; gene_id "LTnewLTref_200012400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 240957 242177 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012400.1"; gene_id "LTnewLTref_200012400"; CM024306.1 Liftoff transcript 243296 248146 . + . transcript_id "LTnewLTref_200012500.1"; gene_id "LTnewLTref_200012500" CM024306.1 Liftoff CDS 243296 248146 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012500.1"; gene_id "LTnewLTref_200012500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 249811 253470 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012600.1"; gene_id "LTnewLTref_200012600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 249811 253470 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012600.1"; gene_id "LTnewLTref_200012600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 255287 258811 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012700.1"; gene_id "LTnewLTref_200012700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 255287 258811 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012700.1"; gene_id "LTnewLTref_200012700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 260004 262217 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012800.1"; gene_id "LTnewLTref_200012800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 260004 262217 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012800.1"; gene_id "LTnewLTref_200012800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 263468 265267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200012900.1"; gene_id "LTnewLTref_200012900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 263468 265267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200012900.1"; gene_id "LTnewLTref_200012900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 266423 267169 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200013000.1"; gene_id "LTnewLTref_200013000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 266423 267169 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013000.1"; gene_id "LTnewLTref_200013000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 268684 269331 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200013100.1"; gene_id "LTnewLTref_200013100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 268684 269331 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013100.1"; gene_id "LTnewLTref_200013100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 273855 277852 0.58 + . transcript_id "LTnewLTref_200013200.1"; gene_id "LTnewLTref_200013200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 273855 277403 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013200.1"; gene_id "LTnewLTref_200013200"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 277475 277852 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013200.1"; gene_id "LTnewLTref_200013200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 293470 296678 0.73 + . transcript_id "LTnewLTref_200013300.1"; gene_id "LTnewLTref_200013300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 293470 296159 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013300.1"; gene_id "LTnewLTref_200013300"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 296213 296678 0.73 + 1 transcript_id "LTnewLTref_200013300.1"; gene_id "LTnewLTref_200013300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 301009 301314 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200013400.1"; gene_id "LTnewLTref_200013400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 301009 301314 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013400.1"; gene_id "LTnewLTref_200013400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 310554 315483 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_200013500.1"; gene_id "LTnewLTref_200013500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 310554 315361 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013500.1"; gene_id "LTnewLTref_200013500"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 315417 315483 0.61 + 1 transcript_id "LTnewLTref_200013500.1"; gene_id "LTnewLTref_200013500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 318830 319084 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200013600.1"; gene_id "LTnewLTref_200013600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 318830 319084 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013600.1"; gene_id "LTnewLTref_200013600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 320297 320684 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_200013700.1"; gene_id "LTnewLTref_200013700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 320297 320428 0.52 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013700.1"; gene_id "LTnewLTref_200013700"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 320583 320684 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013700.1"; gene_id "LTnewLTref_200013700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 321057 321323 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200013800.1"; gene_id "LTnewLTref_200013800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 321057 321323 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013800.1"; gene_id "LTnewLTref_200013800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 325792 337837 0.78 + . transcript_id "LTnewLTref_200013900.1"; gene_id "LTnewLTref_200013900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 325792 327805 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200013900.1"; gene_id "LTnewLTref_200013900"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 327921 337837 0.91 + 2 transcript_id "LTnewLTref_200013900.1"; gene_id "LTnewLTref_200013900"; CM024306.1 Aragorn_1.2.36 transcript 327750 327823 . - . transcript_id "LTnewLTref_200014000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_200014000" CM024306.1 Aragorn_1.2.36 exon 327750 327823 . - . transcript_id "LTnewLTref_200014000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_200014000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 339174 341213 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200014100.1"; gene_id "LTnewLTref_200014100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 339174 341213 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014100.1"; gene_id "LTnewLTref_200014100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 341851 344160 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200014200.1"; gene_id "LTnewLTref_200014200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 341851 344160 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014200.1"; gene_id "LTnewLTref_200014200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 344729 345800 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_200014300.1"; gene_id "LTnewLTref_200014300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 344729 344738 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014300.1"; gene_id "LTnewLTref_200014300"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 344842 345800 0.99 + 2 transcript_id "LTnewLTref_200014300.1"; gene_id "LTnewLTref_200014300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 349154 351370 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200014400.1"; gene_id "LTnewLTref_200014400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 349154 351370 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014400.1"; gene_id "LTnewLTref_200014400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 352537 353529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200014500.1"; gene_id "LTnewLTref_200014500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 352537 353529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014500.1"; gene_id "LTnewLTref_200014500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 354361 355182 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_200014600.1"; gene_id "LTnewLTref_200014600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 354361 355182 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014600.1"; gene_id "LTnewLTref_200014600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 355595 356446 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_200014700.1"; gene_id "LTnewLTref_200014700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 355595 356446 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014700.1"; gene_id "LTnewLTref_200014700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 357157 361881 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200014800.1"; gene_id "LTnewLTref_200014800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 357157 361881 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014800.1"; gene_id "LTnewLTref_200014800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 363083 364123 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200014900.1"; gene_id "LTnewLTref_200014900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 363083 364123 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200014900.1"; gene_id "LTnewLTref_200014900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 365159 367465 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015000.1"; gene_id "LTnewLTref_200015000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 365159 367465 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015000.1"; gene_id "LTnewLTref_200015000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 368456 369118 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015100.1"; gene_id "LTnewLTref_200015100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 368456 369118 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015100.1"; gene_id "LTnewLTref_200015100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 370092 370970 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015200.1"; gene_id "LTnewLTref_200015200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 370092 370970 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015200.1"; gene_id "LTnewLTref_200015200"; CM024306.1 Liftoff transcript 371798 374932 . + . transcript_id "LTnewLTref_200015300.1"; gene_id "LTnewLTref_200015300" CM024306.1 Liftoff CDS 371798 374932 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015300.1"; gene_id "LTnewLTref_200015300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 375888 376736 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015400.1"; gene_id "LTnewLTref_200015400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 375888 376736 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015400.1"; gene_id "LTnewLTref_200015400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 377765 379570 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015500.1"; gene_id "LTnewLTref_200015500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 377765 379570 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015500.1"; gene_id "LTnewLTref_200015500"; CM024306.1 . transcript 380684 386952 . + . transcript_id "LTnewLTref_200015600.1"; gene_id "LTnewLTref_200015600:pseudogene" CM024306.1 . exon 380684 386952 . + . transcript_id "LTnewLTref_200015600.1"; gene_id "LTnewLTref_200015600:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 387517 388812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015700.1"; gene_id "LTnewLTref_200015700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 387517 388812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015700.1"; gene_id "LTnewLTref_200015700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 390035 392206 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200015800.1"; gene_id "LTnewLTref_200015800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 390035 392206 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015800.1"; gene_id "LTnewLTref_200015800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 396429 407069 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_200015900.1"; gene_id "LTnewLTref_200015900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 396429 407069 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200015900.1"; gene_id "LTnewLTref_200015900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 409782 410816 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200016000.1"; gene_id "LTnewLTref_200016000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 409782 410816 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200016000.1"; gene_id "LTnewLTref_200016000"; CM024306.1 . transcript 412170 414277 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016100.1"; gene_id "LTnewLTref_200016100:pseudogene" CM024306.1 . exon 412170 414277 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016100.1"; gene_id "LTnewLTref_200016100:pseudogene"; CM024306.1 . transcript 415267 416739 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016200.1"; gene_id "LTnewLTref_200016200:pseudogene" CM024306.1 . exon 415267 416739 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016200.1"; gene_id "LTnewLTref_200016200:pseudogene"; CM024306.1 . transcript 419438 421592 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016300.1"; gene_id "LTnewLTref_200016300:pseudogene" CM024306.1 . exon 419438 421592 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016300.1"; gene_id "LTnewLTref_200016300:pseudogene"; CM024306.1 Liftoff transcript 422556 422880 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016400.1"; gene_id "LTnewLTref_200016400" CM024306.1 Liftoff CDS 422556 422880 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200016400.1"; gene_id "LTnewLTref_200016400"; CM024306.1 . transcript 424659 427952 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016500.1"; gene_id "LTnewLTref_200016500:pseudogene" CM024306.1 . exon 424659 427952 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016500.1"; gene_id "LTnewLTref_200016500:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 431715 432192 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_200016600.1"; gene_id "LTnewLTref_200016600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 431715 431856 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200016600.1"; gene_id "LTnewLTref_200016600"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 431921 432192 0.51 + 2 transcript_id "LTnewLTref_200016600.1"; gene_id "LTnewLTref_200016600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 434953 435963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200016700.1"; gene_id "LTnewLTref_200016700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 434953 435963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200016700.1"; gene_id "LTnewLTref_200016700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 440886 443573 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200016800.1"; gene_id "LTnewLTref_200016800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 440886 443573 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200016800.1"; gene_id "LTnewLTref_200016800"; CM024306.1 Liftoff transcript 452143 455253 . + . transcript_id "LTnewLTref_200016900.1"; gene_id "LTnewLTref_200016900" CM024306.1 Liftoff CDS 452143 455253 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200016900.1"; gene_id "LTnewLTref_200016900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 458379 462329 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200017000.1"; gene_id "LTnewLTref_200017000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 458379 462329 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017000.1"; gene_id "LTnewLTref_200017000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 467061 468164 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_200017100.1"; gene_id "LTnewLTref_200017100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 467061 468164 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017100.1"; gene_id "LTnewLTref_200017100"; CM024306.1 Liftoff transcript 469011 476951 . + . transcript_id "LTnewLTref_200017200.1"; gene_id "LTnewLTref_200017200" CM024306.1 Liftoff CDS 469011 476951 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017200.1"; gene_id "LTnewLTref_200017200"; CM024306.1 Liftoff transcript 477927 484829 . + . transcript_id "LTnewLTref_200017300.1"; gene_id "LTnewLTref_200017300" CM024306.1 Liftoff CDS 477927 484829 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017300.1"; gene_id "LTnewLTref_200017300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 486258 492107 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200017400.1"; gene_id "LTnewLTref_200017400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 486258 492107 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017400.1"; gene_id "LTnewLTref_200017400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 493016 496555 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_200017500.1"; gene_id "LTnewLTref_200017500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 493016 496555 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017500.1"; gene_id "LTnewLTref_200017500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 501921 511811 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200017600.1"; gene_id "LTnewLTref_200017600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 501921 511811 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017600.1"; gene_id "LTnewLTref_200017600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 513819 515781 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_200017700.1"; gene_id "LTnewLTref_200017700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 513819 514748 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017700.1"; gene_id "LTnewLTref_200017700"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 514855 515781 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017700.1"; gene_id "LTnewLTref_200017700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 516742 517701 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200017800.1"; gene_id "LTnewLTref_200017800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 516742 517701 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017800.1"; gene_id "LTnewLTref_200017800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 518540 519349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200017900.1"; gene_id "LTnewLTref_200017900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 518540 519349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200017900.1"; gene_id "LTnewLTref_200017900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 519965 520864 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018000.1"; gene_id "LTnewLTref_200018000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 519965 520864 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018000.1"; gene_id "LTnewLTref_200018000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 521717 522979 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018100.1"; gene_id "LTnewLTref_200018100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 521717 522979 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018100.1"; gene_id "LTnewLTref_200018100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 528165 528404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018200.1"; gene_id "LTnewLTref_200018200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 528165 528404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018200.1"; gene_id "LTnewLTref_200018200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 528525 529472 0.41 + . transcript_id "LTnewLTref_200018300.1"; gene_id "LTnewLTref_200018300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 528525 528973 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018300.1"; gene_id "LTnewLTref_200018300"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 529364 529472 0.41 + 1 transcript_id "LTnewLTref_200018300.1"; gene_id "LTnewLTref_200018300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 537480 540441 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_200018400.1"; gene_id "LTnewLTref_200018400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 537480 537511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018400.1"; gene_id "LTnewLTref_200018400"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 537591 540441 0.48 + 1 transcript_id "LTnewLTref_200018400.1"; gene_id "LTnewLTref_200018400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 538441 540441 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_200018400.2"; gene_id "LTnewLTref_200018400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 538441 540441 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018400.2"; gene_id "LTnewLTref_200018400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 543241 545706 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018500.1"; gene_id "LTnewLTref_200018500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 543241 545706 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018500.1"; gene_id "LTnewLTref_200018500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 548386 550449 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018600.1"; gene_id "LTnewLTref_200018600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 548386 550449 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018600.1"; gene_id "LTnewLTref_200018600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 554784 557015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018700.1"; gene_id "LTnewLTref_200018700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 554784 557015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018700.1"; gene_id "LTnewLTref_200018700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 560002 563319 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018800.1"; gene_id "LTnewLTref_200018800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 560002 563319 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018800.1"; gene_id "LTnewLTref_200018800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 564566 565006 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200018900.1"; gene_id "LTnewLTref_200018900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 564566 565006 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200018900.1"; gene_id "LTnewLTref_200018900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 567627 568028 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019000.1"; gene_id "LTnewLTref_200019000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 567627 568028 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019000.1"; gene_id "LTnewLTref_200019000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 572383 580653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019100.1"; gene_id "LTnewLTref_200019100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 572383 580653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019100.1"; gene_id "LTnewLTref_200019100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 581870 582667 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019200.1"; gene_id "LTnewLTref_200019200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 581870 582667 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019200.1"; gene_id "LTnewLTref_200019200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 582759 582998 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019300.1"; gene_id "LTnewLTref_200019300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 582759 582998 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019300.1"; gene_id "LTnewLTref_200019300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 585805 588318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019400.1"; gene_id "LTnewLTref_200019400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 585805 588318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019400.1"; gene_id "LTnewLTref_200019400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 590592 591161 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019500.1"; gene_id "LTnewLTref_200019500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 590592 591161 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019500.1"; gene_id "LTnewLTref_200019500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 593914 594369 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019600.1"; gene_id "LTnewLTref_200019600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 593914 594369 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019600.1"; gene_id "LTnewLTref_200019600"; CM024306.1 . transcript 597851 598699 . + . transcript_id "LTnewLTref_200019700.1"; gene_id "LTnewLTref_200019700:pseudogene" CM024306.1 . exon 597851 598699 . + . transcript_id "LTnewLTref_200019700.1"; gene_id "LTnewLTref_200019700:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 601233 601643 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019800.1"; gene_id "LTnewLTref_200019800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 601233 601643 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019800.1"; gene_id "LTnewLTref_200019800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 603638 604033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200019900.1"; gene_id "LTnewLTref_200019900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 603638 604033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200019900.1"; gene_id "LTnewLTref_200019900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 608596 609855 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020000.1"; gene_id "LTnewLTref_200020000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 608596 609855 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020000.1"; gene_id "LTnewLTref_200020000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 612389 613534 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020100.1"; gene_id "LTnewLTref_200020100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 612389 613534 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020100.1"; gene_id "LTnewLTref_200020100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 615448 616393 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020200.1"; gene_id "LTnewLTref_200020200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 615448 615483 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020200.1"; gene_id "LTnewLTref_200020200"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 615527 616393 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020200.1"; gene_id "LTnewLTref_200020200"; CM024306.1 . transcript 616441 617162 . + . transcript_id "LTnewLTref_200020300.1"; gene_id "LTnewLTref_200020300:pseudogene" CM024306.1 . exon 616441 617162 . + . transcript_id "LTnewLTref_200020300.1"; gene_id "LTnewLTref_200020300:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 619289 622288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020400.1"; gene_id "LTnewLTref_200020400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 619289 622288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020400.1"; gene_id "LTnewLTref_200020400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 623382 624599 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020500.1"; gene_id "LTnewLTref_200020500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 623382 624599 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020500.1"; gene_id "LTnewLTref_200020500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 626321 628089 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020600.1"; gene_id "LTnewLTref_200020600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 626321 627085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020600.1"; gene_id "LTnewLTref_200020600"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 627130 628089 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020600.1"; gene_id "LTnewLTref_200020600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 633153 634793 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020700.1"; gene_id "LTnewLTref_200020700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 633153 634793 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020700.1"; gene_id "LTnewLTref_200020700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 636994 640851 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020800.1"; gene_id "LTnewLTref_200020800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 636994 640851 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020800.1"; gene_id "LTnewLTref_200020800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 642026 643384 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200020900.1"; gene_id "LTnewLTref_200020900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 642026 643384 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200020900.1"; gene_id "LTnewLTref_200020900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 644160 645692 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200021000.1"; gene_id "LTnewLTref_200021000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 644160 645692 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200021000.1"; gene_id "LTnewLTref_200021000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 647622 650543 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200021100.1"; gene_id "LTnewLTref_200021100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 647622 650543 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200021100.1"; gene_id "LTnewLTref_200021100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 651503 655174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200021200.1"; gene_id "LTnewLTref_200021200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 651503 655174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200021200.1"; gene_id "LTnewLTref_200021200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 657685 658707 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200021300.1"; gene_id "LTnewLTref_200021300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 657685 658707 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200021300.1"; gene_id "LTnewLTref_200021300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 660084 660521 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200021400.1"; gene_id "LTnewLTref_200021400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 660084 660521 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200021400.1"; gene_id "LTnewLTref_200021400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 661561 662739 1 + . transcript_id "LTnewLTref_200021500.1"; gene_id "LTnewLTref_200021500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 661561 662739 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_200021500.1"; gene_id "LTnewLTref_200021500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 664234 664962 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200021600.1"; gene_id "LTnewLTref_200021600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 664234 664962 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200021600.1"; gene_id "LTnewLTref_200021600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 665480 667204 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200021700.1"; gene_id "LTnewLTref_200021700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 665480 667204 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200021700.1"; gene_id "LTnewLTref_200021700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 668501 668803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200021800.1"; gene_id "LTnewLTref_200021800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 668501 668803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200021800.1"; gene_id "LTnewLTref_200021800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 669592 672555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200021900.1"; gene_id "LTnewLTref_200021900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 669592 672555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200021900.1"; gene_id "LTnewLTref_200021900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 673508 676405 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200022000.1"; gene_id "LTnewLTref_200022000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 673508 676405 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022000.1"; gene_id "LTnewLTref_200022000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 677024 679882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200022100.1"; gene_id "LTnewLTref_200022100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 677024 679882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022100.1"; gene_id "LTnewLTref_200022100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 680643 686986 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_200022200.1"; gene_id "LTnewLTref_200022200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 680643 682661 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022200.1"; gene_id "LTnewLTref_200022200"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 682718 686986 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022200.1"; gene_id "LTnewLTref_200022200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 688173 693167 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200022300.1"; gene_id "LTnewLTref_200022300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 688173 693167 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022300.1"; gene_id "LTnewLTref_200022300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 693711 696158 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200022400.1"; gene_id "LTnewLTref_200022400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 693711 696158 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022400.1"; gene_id "LTnewLTref_200022400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 696746 697382 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_200022500.1"; gene_id "LTnewLTref_200022500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 696746 696921 0.44 - 2 transcript_id "LTnewLTref_200022500.1"; gene_id "LTnewLTref_200022500"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 697253 697382 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022500.1"; gene_id "LTnewLTref_200022500"; CM024306.1 . transcript 697643 697901 . - . transcript_id "LTnewLTref_200022600.1"; gene_id "LTnewLTref_200022600:pseudogene" CM024306.1 . exon 697643 697901 . - . transcript_id "LTnewLTref_200022600.1"; gene_id "LTnewLTref_200022600:pseudogene"; CM024306.1 Liftoff transcript 699206 701065 . - . transcript_id "LTnewLTref_200022700.1"; gene_id "LTnewLTref_200022700" CM024306.1 Liftoff CDS 699206 701065 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022700.1"; gene_id "LTnewLTref_200022700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 701892 702533 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200022800.1"; gene_id "LTnewLTref_200022800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 701892 702533 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022800.1"; gene_id "LTnewLTref_200022800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 703944 704465 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200022900.1"; gene_id "LTnewLTref_200022900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 703944 704465 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200022900.1"; gene_id "LTnewLTref_200022900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 705232 706443 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023000.1"; gene_id "LTnewLTref_200023000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 705232 706443 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023000.1"; gene_id "LTnewLTref_200023000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 707340 708290 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023100.1"; gene_id "LTnewLTref_200023100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 707340 708290 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023100.1"; gene_id "LTnewLTref_200023100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 709165 713004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023200.1"; gene_id "LTnewLTref_200023200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 709165 713004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023200.1"; gene_id "LTnewLTref_200023200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 714223 715071 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023300.1"; gene_id "LTnewLTref_200023300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 714223 715071 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023300.1"; gene_id "LTnewLTref_200023300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 716004 716828 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023400.1"; gene_id "LTnewLTref_200023400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 716004 716828 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023400.1"; gene_id "LTnewLTref_200023400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 717432 719243 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023500.1"; gene_id "LTnewLTref_200023500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 717432 719243 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023500.1"; gene_id "LTnewLTref_200023500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 719959 720885 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023600.1"; gene_id "LTnewLTref_200023600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 719959 720885 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023600.1"; gene_id "LTnewLTref_200023600"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 721905 723161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023700.1"; gene_id "LTnewLTref_200023700" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 721905 723161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023700.1"; gene_id "LTnewLTref_200023700"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 723884 724786 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200023800.1"; gene_id "LTnewLTref_200023800" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 723884 724786 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023800.1"; gene_id "LTnewLTref_200023800"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 726990 727554 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_200023900.1"; gene_id "LTnewLTref_200023900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 726990 727093 0.41 - 2 transcript_id "LTnewLTref_200023900.1"; gene_id "LTnewLTref_200023900"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 727425 727554 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200023900.1"; gene_id "LTnewLTref_200023900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 727821 728078 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024000.1"; gene_id "LTnewLTref_200024000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 727821 728078 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024000.1"; gene_id "LTnewLTref_200024000"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 728948 730153 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024100.1"; gene_id "LTnewLTref_200024100" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 728948 730153 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024100.1"; gene_id "LTnewLTref_200024100"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 731247 732434 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024200.1"; gene_id "LTnewLTref_200024200" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 731247 732434 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024200.1"; gene_id "LTnewLTref_200024200"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 733516 734705 0.63 - . transcript_id "LTnewLTref_200024300.1"; gene_id "LTnewLTref_200024300" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 733516 734195 0.65 - 2 transcript_id "LTnewLTref_200024300.1"; gene_id "LTnewLTref_200024300"; CM024306.1 AUGUSTUS CDS 734246 734705 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024300.1"; gene_id "LTnewLTref_200024300"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 736535 737719 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024400.1"; gene_id "LTnewLTref_200024400" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 736535 737719 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024400.1"; gene_id "LTnewLTref_200024400"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 738434 741490 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024500.1"; gene_id "LTnewLTref_200024500" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 738434 741490 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024500.1"; gene_id "LTnewLTref_200024500"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 742049 742414 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024600.1"; gene_id "LTnewLTref_200024600" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 742049 742414 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024600.1"; gene_id "LTnewLTref_200024600"; CM024306.1 Liftoff transcript 742894 746316 . - . transcript_id "LTnewLTref_200024700.1"; gene_id "LTnewLTref_200024700" CM024306.1 Liftoff CDS 742894 746316 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024700.1"; gene_id "LTnewLTref_200024700"; CM024306.1 . transcript 746708 747176 . - . transcript_id "LTnewLTref_200024800.1"; gene_id "LTnewLTref_200024800:pseudogene" CM024306.1 . exon 746708 747176 . - . transcript_id "LTnewLTref_200024800.1"; gene_id "LTnewLTref_200024800:pseudogene"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 747801 748691 1 - . transcript_id "LTnewLTref_200024900.1"; gene_id "LTnewLTref_200024900" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 747801 748691 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_200024900.1"; gene_id "LTnewLTref_200024900"; CM024306.1 AUGUSTUS transcript 759271 759761 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_200025000.1"; gene_id "LTnewLTref_200025000" CM024306.1 AUGUSTUS CDS 759271 759761 0.6 - 2 transcript_id "LTnewLTref_200025000.1"; gene_id "LTnewLTref_200025000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 4433 5672 0.74 - . transcript_id "LTnewLTref_210005000.1"; gene_id "LTnewLTref_210005000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 4433 4573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210005000.1"; gene_id "LTnewLTref_210005000"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 4623 5672 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210005000.1"; gene_id "LTnewLTref_210005000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 5740 6882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210005100.1"; gene_id "LTnewLTref_210005100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 5740 6882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210005100.1"; gene_id "LTnewLTref_210005100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 8754 9095 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210005200.1"; gene_id "LTnewLTref_210005200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 8754 9095 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210005200.1"; gene_id "LTnewLTref_210005200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 10017 11057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210005300.1"; gene_id "LTnewLTref_210005300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 10017 11057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005300.1"; gene_id "LTnewLTref_210005300"; CM024307.1 Liftoff transcript 11600 11920 . + . transcript_id "LTnewLTref_210005400.1"; gene_id "LTnewLTref_210005400" CM024307.1 Liftoff CDS 11600 11920 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005400.1"; gene_id "LTnewLTref_210005400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 13608 14303 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210005500.1"; gene_id "LTnewLTref_210005500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 13608 14303 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005500.1"; gene_id "LTnewLTref_210005500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 15769 16506 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210005600.1"; gene_id "LTnewLTref_210005600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 15769 16506 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005600.1"; gene_id "LTnewLTref_210005600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 17776 18477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210005700.1"; gene_id "LTnewLTref_210005700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 17776 18477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005700.1"; gene_id "LTnewLTref_210005700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 19068 20549 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210005800.1"; gene_id "LTnewLTref_210005800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 19068 20549 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005800.1"; gene_id "LTnewLTref_210005800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 21174 22448 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210005900.1"; gene_id "LTnewLTref_210005900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 21174 22448 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210005900.1"; gene_id "LTnewLTref_210005900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 23298 24353 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006000.1"; gene_id "LTnewLTref_210006000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 23298 24353 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006000.1"; gene_id "LTnewLTref_210006000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 25233 26606 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006100.1"; gene_id "LTnewLTref_210006100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 25233 26606 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006100.1"; gene_id "LTnewLTref_210006100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 28642 29193 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006200.1"; gene_id "LTnewLTref_210006200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 28642 29193 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006200.1"; gene_id "LTnewLTref_210006200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 30085 30540 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006300.1"; gene_id "LTnewLTref_210006300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 30085 30540 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006300.1"; gene_id "LTnewLTref_210006300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 31446 32024 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006400.1"; gene_id "LTnewLTref_210006400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 31446 32024 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006400.1"; gene_id "LTnewLTref_210006400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 32762 37642 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006500.1"; gene_id "LTnewLTref_210006500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 32762 37642 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006500.1"; gene_id "LTnewLTref_210006500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 38998 41427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006600.1"; gene_id "LTnewLTref_210006600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 38998 41427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006600.1"; gene_id "LTnewLTref_210006600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 43566 48698 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006700.1"; gene_id "LTnewLTref_210006700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 43566 48698 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006700.1"; gene_id "LTnewLTref_210006700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 49601 49870 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210006800.1"; gene_id "LTnewLTref_210006800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 49601 49870 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210006800.1"; gene_id "LTnewLTref_210006800"; CM024307.1 . transcript 50398 50594 . + . transcript_id "LTnewLTref_210006900.1"; gene_id "LTnewLTref_210006900:pseudogene" CM024307.1 . exon 50398 50594 . + . transcript_id "LTnewLTref_210006900.1"; gene_id "LTnewLTref_210006900:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 51969 53891 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007000.1"; gene_id "LTnewLTref_210007000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 51969 53891 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007000.1"; gene_id "LTnewLTref_210007000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 54672 55733 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007100.1"; gene_id "LTnewLTref_210007100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 54672 55733 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007100.1"; gene_id "LTnewLTref_210007100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 56305 58548 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007200.1"; gene_id "LTnewLTref_210007200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 56305 58548 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007200.1"; gene_id "LTnewLTref_210007200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 59833 62133 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007300.1"; gene_id "LTnewLTref_210007300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 59833 62133 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007300.1"; gene_id "LTnewLTref_210007300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 62725 67152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007400.1"; gene_id "LTnewLTref_210007400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 62725 67152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007400.1"; gene_id "LTnewLTref_210007400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 68327 70501 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007500.1"; gene_id "LTnewLTref_210007500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 68327 70501 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007500.1"; gene_id "LTnewLTref_210007500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 71363 74242 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007600.1"; gene_id "LTnewLTref_210007600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 71363 74242 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007600.1"; gene_id "LTnewLTref_210007600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 74947 76551 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007700.1"; gene_id "LTnewLTref_210007700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 74947 76551 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007700.1"; gene_id "LTnewLTref_210007700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 77196 77660 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007800.1"; gene_id "LTnewLTref_210007800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 77196 77660 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007800.1"; gene_id "LTnewLTref_210007800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 78300 80072 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210007900.1"; gene_id "LTnewLTref_210007900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 78300 80072 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210007900.1"; gene_id "LTnewLTref_210007900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 80830 82245 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008000.1"; gene_id "LTnewLTref_210008000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 80830 82245 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008000.1"; gene_id "LTnewLTref_210008000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 84390 85805 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008100.1"; gene_id "LTnewLTref_210008100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 84390 85805 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008100.1"; gene_id "LTnewLTref_210008100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 88143 90344 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008200.1"; gene_id "LTnewLTref_210008200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 88143 90344 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008200.1"; gene_id "LTnewLTref_210008200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 91332 94749 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_210008300.1"; gene_id "LTnewLTref_210008300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 91332 93682 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008300.1"; gene_id "LTnewLTref_210008300"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 93774 94749 0.82 + 1 transcript_id "LTnewLTref_210008300.1"; gene_id "LTnewLTref_210008300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 92811 94749 0.65 + . transcript_id "LTnewLTref_210008300.2"; gene_id "LTnewLTref_210008300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 92811 93682 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008300.2"; gene_id "LTnewLTref_210008300"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 93774 94749 0.82 + 1 transcript_id "LTnewLTref_210008300.2"; gene_id "LTnewLTref_210008300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 95456 97090 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008400.1"; gene_id "LTnewLTref_210008400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 95456 97090 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008400.1"; gene_id "LTnewLTref_210008400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 97666 100977 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008500.1"; gene_id "LTnewLTref_210008500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 97666 100977 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008500.1"; gene_id "LTnewLTref_210008500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 101594 102361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008600.1"; gene_id "LTnewLTref_210008600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 101594 102200 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008600.1"; gene_id "LTnewLTref_210008600"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 102252 102361 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_210008600.1"; gene_id "LTnewLTref_210008600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 103214 104182 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008700.1"; gene_id "LTnewLTref_210008700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 103214 104182 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008700.1"; gene_id "LTnewLTref_210008700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 104921 105634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008800.1"; gene_id "LTnewLTref_210008800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 104921 105634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008800.1"; gene_id "LTnewLTref_210008800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 106714 109854 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210008900.1"; gene_id "LTnewLTref_210008900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 106714 109854 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210008900.1"; gene_id "LTnewLTref_210008900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 110994 112397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009000.1"; gene_id "LTnewLTref_210009000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 110994 112397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009000.1"; gene_id "LTnewLTref_210009000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 113423 114094 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009100.1"; gene_id "LTnewLTref_210009100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 113423 114094 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009100.1"; gene_id "LTnewLTref_210009100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 114676 115503 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009200.1"; gene_id "LTnewLTref_210009200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 114676 115503 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009200.1"; gene_id "LTnewLTref_210009200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 115846 118023 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009300.1"; gene_id "LTnewLTref_210009300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 115846 118023 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009300.1"; gene_id "LTnewLTref_210009300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 118747 119394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009400.1"; gene_id "LTnewLTref_210009400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 118747 119394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009400.1"; gene_id "LTnewLTref_210009400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 120542 121615 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009500.1"; gene_id "LTnewLTref_210009500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 120542 121615 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009500.1"; gene_id "LTnewLTref_210009500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 124392 126557 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009600.1"; gene_id "LTnewLTref_210009600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 124392 126557 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009600.1"; gene_id "LTnewLTref_210009600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 129446 133147 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009700.1"; gene_id "LTnewLTref_210009700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 129446 133147 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009700.1"; gene_id "LTnewLTref_210009700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 134259 136358 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009800.1"; gene_id "LTnewLTref_210009800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 134259 136358 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009800.1"; gene_id "LTnewLTref_210009800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 137153 138382 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210009900.1"; gene_id "LTnewLTref_210009900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 137153 138382 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210009900.1"; gene_id "LTnewLTref_210009900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 139854 140666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010000.1"; gene_id "LTnewLTref_210010000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 139854 140666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010000.1"; gene_id "LTnewLTref_210010000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 142103 142870 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010100.1"; gene_id "LTnewLTref_210010100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 142103 142870 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010100.1"; gene_id "LTnewLTref_210010100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 143682 146483 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010200.1"; gene_id "LTnewLTref_210010200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 143682 146483 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010200.1"; gene_id "LTnewLTref_210010200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 147893 150931 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010300.1"; gene_id "LTnewLTref_210010300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 147893 150931 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010300.1"; gene_id "LTnewLTref_210010300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 152051 153541 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010400.1"; gene_id "LTnewLTref_210010400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 152051 153541 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010400.1"; gene_id "LTnewLTref_210010400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 155112 156458 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010500.1"; gene_id "LTnewLTref_210010500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 155112 156458 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010500.1"; gene_id "LTnewLTref_210010500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 157952 158596 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010600.1"; gene_id "LTnewLTref_210010600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 157952 158596 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010600.1"; gene_id "LTnewLTref_210010600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 160119 161774 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010700.1"; gene_id "LTnewLTref_210010700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 160119 161774 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010700.1"; gene_id "LTnewLTref_210010700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 162508 163851 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210010800.1"; gene_id "LTnewLTref_210010800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 162508 163851 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010800.1"; gene_id "LTnewLTref_210010800"; CM024307.1 Liftoff transcript 164350 164594 . + . transcript_id "LTnewLTref_210010900.1"; gene_id "LTnewLTref_210010900" CM024307.1 Liftoff CDS 164350 164594 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_210010900.1"; gene_id "LTnewLTref_210010900"; CM024307.1 Liftoff transcript 164729 164845 . - . transcript_id "LTnewLTref_210011000:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210011000" CM024307.1 Liftoff exon 164729 164845 . - . transcript_id "LTnewLTref_210011000:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210011000"; CM024307.1 INFERNAL transcript 164729 164847 87.4 - . transcript_id "LTnewLTref_210011100:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210011100" CM024307.1 INFERNAL exon 164729 164847 . - . transcript_id "LTnewLTref_210011100:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210011100"; CM024307.1 Aragorn_1.2.36 transcript 164910 164990 . - . transcript_id "LTnewLTref_210011200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210011200" CM024307.1 Aragorn_1.2.36 exon 164910 164990 . - . transcript_id "LTnewLTref_210011200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210011200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 165735 169202 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011300.1"; gene_id "LTnewLTref_210011300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 165735 169202 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011300.1"; gene_id "LTnewLTref_210011300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 170663 171673 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011400.1"; gene_id "LTnewLTref_210011400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 170663 171673 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011400.1"; gene_id "LTnewLTref_210011400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 173705 174511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011500.1"; gene_id "LTnewLTref_210011500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 173705 174511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011500.1"; gene_id "LTnewLTref_210011500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 175656 175946 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011600.1"; gene_id "LTnewLTref_210011600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 175656 175946 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011600.1"; gene_id "LTnewLTref_210011600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 177492 178817 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011700.1"; gene_id "LTnewLTref_210011700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 177492 178817 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011700.1"; gene_id "LTnewLTref_210011700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 179385 180779 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011800.1"; gene_id "LTnewLTref_210011800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 179385 180779 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011800.1"; gene_id "LTnewLTref_210011800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 182014 183180 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210011900.1"; gene_id "LTnewLTref_210011900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 182014 183180 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210011900.1"; gene_id "LTnewLTref_210011900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 184282 185892 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012000.1"; gene_id "LTnewLTref_210012000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 184282 185892 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012000.1"; gene_id "LTnewLTref_210012000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 186785 188875 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012100.1"; gene_id "LTnewLTref_210012100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 186785 188875 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012100.1"; gene_id "LTnewLTref_210012100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 189734 192094 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012200.1"; gene_id "LTnewLTref_210012200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 189734 192094 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012200.1"; gene_id "LTnewLTref_210012200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 192797 195082 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012300.1"; gene_id "LTnewLTref_210012300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 192797 195082 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012300.1"; gene_id "LTnewLTref_210012300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 197105 198874 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012400.1"; gene_id "LTnewLTref_210012400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 197105 198874 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012400.1"; gene_id "LTnewLTref_210012400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 199884 201803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012500.1"; gene_id "LTnewLTref_210012500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 199884 201803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012500.1"; gene_id "LTnewLTref_210012500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 203255 204238 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012600.1"; gene_id "LTnewLTref_210012600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 203255 204238 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012600.1"; gene_id "LTnewLTref_210012600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 205539 206549 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012700.1"; gene_id "LTnewLTref_210012700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 205539 206549 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012700.1"; gene_id "LTnewLTref_210012700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 207680 208972 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012800.1"; gene_id "LTnewLTref_210012800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 207680 208972 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012800.1"; gene_id "LTnewLTref_210012800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 209815 210261 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210012900.1"; gene_id "LTnewLTref_210012900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 209815 210261 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210012900.1"; gene_id "LTnewLTref_210012900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 213963 215828 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210013000.1"; gene_id "LTnewLTref_210013000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 213963 215828 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210013000.1"; gene_id "LTnewLTref_210013000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 217412 219391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210013100.1"; gene_id "LTnewLTref_210013100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 217412 219391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210013100.1"; gene_id "LTnewLTref_210013100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 221494 222426 0.85 - . transcript_id "LTnewLTref_210013200.1"; gene_id "LTnewLTref_210013200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 221494 222426 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210013200.1"; gene_id "LTnewLTref_210013200"; CM024307.1 Liftoff transcript 222699 222881 . - . transcript_id "LTnewLTref_210013300.1"; gene_id "LTnewLTref_210013300" CM024307.1 Liftoff CDS 222699 222881 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_210013300.1"; gene_id "LTnewLTref_210013300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 231544 231945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210013400.1"; gene_id "LTnewLTref_210013400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 231544 231945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210013400.1"; gene_id "LTnewLTref_210013400"; CM024307.1 Liftoff transcript 232212 232550 . + . transcript_id "LTnewLTref_210013500.1"; gene_id "LTnewLTref_210013500" CM024307.1 Liftoff CDS 232212 232550 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_210013500.1"; gene_id "LTnewLTref_210013500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 232901 233221 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210013600.1"; gene_id "LTnewLTref_210013600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 232901 233221 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210013600.1"; gene_id "LTnewLTref_210013600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 233761 235929 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210013700.1"; gene_id "LTnewLTref_210013700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 233761 235929 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210013700.1"; gene_id "LTnewLTref_210013700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 237074 238498 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210013800.1"; gene_id "LTnewLTref_210013800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 237074 238498 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210013800.1"; gene_id "LTnewLTref_210013800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 241116 242609 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210013900.1"; gene_id "LTnewLTref_210013900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 241116 242609 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210013900.1"; gene_id "LTnewLTref_210013900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 246569 249847 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014000.1"; gene_id "LTnewLTref_210014000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 246569 249847 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014000.1"; gene_id "LTnewLTref_210014000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 251711 252577 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014100.1"; gene_id "LTnewLTref_210014100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 251711 252577 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014100.1"; gene_id "LTnewLTref_210014100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 253364 253876 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_210014200.1"; gene_id "LTnewLTref_210014200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 253364 253418 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014200.1"; gene_id "LTnewLTref_210014200"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 253509 253876 0.64 + 2 transcript_id "LTnewLTref_210014200.1"; gene_id "LTnewLTref_210014200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 256501 263262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014300.1"; gene_id "LTnewLTref_210014300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 256501 263262 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014300.1"; gene_id "LTnewLTref_210014300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 264606 266849 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014400.1"; gene_id "LTnewLTref_210014400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 264606 266849 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014400.1"; gene_id "LTnewLTref_210014400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 268960 269214 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014500.1"; gene_id "LTnewLTref_210014500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 268960 269214 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014500.1"; gene_id "LTnewLTref_210014500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 270625 274746 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014600.1"; gene_id "LTnewLTref_210014600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 270625 274746 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014600.1"; gene_id "LTnewLTref_210014600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 280299 283253 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014700.1"; gene_id "LTnewLTref_210014700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 280299 283253 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014700.1"; gene_id "LTnewLTref_210014700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 286834 288049 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_210014800.1"; gene_id "LTnewLTref_210014800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 286834 287928 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014800.1"; gene_id "LTnewLTref_210014800"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 288008 288049 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014800.1"; gene_id "LTnewLTref_210014800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 286834 297019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014800.2"; gene_id "LTnewLTref_210014800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 286834 289160 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014800.2"; gene_id "LTnewLTref_210014800"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 289216 297019 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_210014800.2"; gene_id "LTnewLTref_210014800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 299308 299952 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210014900.1"; gene_id "LTnewLTref_210014900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 299308 299952 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210014900.1"; gene_id "LTnewLTref_210014900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 300987 302141 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015000.1"; gene_id "LTnewLTref_210015000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 300987 302141 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015000.1"; gene_id "LTnewLTref_210015000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 303922 304893 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015100.1"; gene_id "LTnewLTref_210015100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 303922 304893 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015100.1"; gene_id "LTnewLTref_210015100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 306665 308062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015200.1"; gene_id "LTnewLTref_210015200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 306665 308062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015200.1"; gene_id "LTnewLTref_210015200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 310776 311735 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015300.1"; gene_id "LTnewLTref_210015300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 310776 311735 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015300.1"; gene_id "LTnewLTref_210015300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 312605 313240 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015400.1"; gene_id "LTnewLTref_210015400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 312605 313240 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015400.1"; gene_id "LTnewLTref_210015400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 315357 316073 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015500.1"; gene_id "LTnewLTref_210015500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 315357 316073 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015500.1"; gene_id "LTnewLTref_210015500"; CM024307.1 . transcript 318481 325449 . + . transcript_id "LTnewLTref_210015600.1"; gene_id "LTnewLTref_210015600:pseudogene" CM024307.1 . exon 318481 325449 . + . transcript_id "LTnewLTref_210015600.1"; gene_id "LTnewLTref_210015600:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 326189 327079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015700.1"; gene_id "LTnewLTref_210015700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 326189 327079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015700.1"; gene_id "LTnewLTref_210015700"; CM024307.1 . transcript 328474 336416 . + . transcript_id "LTnewLTref_210015800.1"; gene_id "LTnewLTref_210015800:pseudogene" CM024307.1 . exon 328474 336416 . + . transcript_id "LTnewLTref_210015800.1"; gene_id "LTnewLTref_210015800:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 337081 339141 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210015900.1"; gene_id "LTnewLTref_210015900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 337081 339141 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210015900.1"; gene_id "LTnewLTref_210015900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 344987 347737 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016000.1"; gene_id "LTnewLTref_210016000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 344987 347737 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016000.1"; gene_id "LTnewLTref_210016000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 350099 352666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016100.1"; gene_id "LTnewLTref_210016100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 350099 352666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016100.1"; gene_id "LTnewLTref_210016100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 353844 357680 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016200.1"; gene_id "LTnewLTref_210016200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 353844 357680 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016200.1"; gene_id "LTnewLTref_210016200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 359111 361957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016300.1"; gene_id "LTnewLTref_210016300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 359111 361957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016300.1"; gene_id "LTnewLTref_210016300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 362855 363181 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016400.1"; gene_id "LTnewLTref_210016400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 362855 363181 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016400.1"; gene_id "LTnewLTref_210016400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 364130 364741 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016500.1"; gene_id "LTnewLTref_210016500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 364130 364741 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016500.1"; gene_id "LTnewLTref_210016500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 365866 370554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016600.1"; gene_id "LTnewLTref_210016600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 365866 370554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016600.1"; gene_id "LTnewLTref_210016600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 371404 373536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016700.1"; gene_id "LTnewLTref_210016700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 371404 373536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016700.1"; gene_id "LTnewLTref_210016700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 375421 377346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016800.1"; gene_id "LTnewLTref_210016800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 375421 377346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016800.1"; gene_id "LTnewLTref_210016800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 378285 379562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210016900.1"; gene_id "LTnewLTref_210016900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 378285 379562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210016900.1"; gene_id "LTnewLTref_210016900"; CM024307.1 . transcript 379897 381373 . + . transcript_id "LTnewLTref_210017000.1"; gene_id "LTnewLTref_210017000:pseudogene" CM024307.1 . exon 379897 381373 . + . transcript_id "LTnewLTref_210017000.1"; gene_id "LTnewLTref_210017000:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 381661 382800 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_210017100.1"; gene_id "LTnewLTref_210017100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 381661 381681 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017100.1"; gene_id "LTnewLTref_210017100"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 381961 382800 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017100.1"; gene_id "LTnewLTref_210017100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 383544 383942 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017200.1"; gene_id "LTnewLTref_210017200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 383544 383942 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017200.1"; gene_id "LTnewLTref_210017200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 384589 384987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017300.1"; gene_id "LTnewLTref_210017300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 384589 384987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017300.1"; gene_id "LTnewLTref_210017300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 385639 386037 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017400.1"; gene_id "LTnewLTref_210017400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 385639 386037 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017400.1"; gene_id "LTnewLTref_210017400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 388920 389924 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017500.1"; gene_id "LTnewLTref_210017500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 388920 389924 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017500.1"; gene_id "LTnewLTref_210017500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 391533 392870 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017600.1"; gene_id "LTnewLTref_210017600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 391533 392870 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017600.1"; gene_id "LTnewLTref_210017600"; CM024307.1 . transcript 394174 398516 . + . transcript_id "LTnewLTref_210017700.1"; gene_id "LTnewLTref_210017700:pseudogene" CM024307.1 . exon 394174 398516 . + . transcript_id "LTnewLTref_210017700.1"; gene_id "LTnewLTref_210017700:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 399407 401545 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017800.1"; gene_id "LTnewLTref_210017800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 399407 401545 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017800.1"; gene_id "LTnewLTref_210017800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 402516 407918 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210017900.1"; gene_id "LTnewLTref_210017900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 402516 407918 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210017900.1"; gene_id "LTnewLTref_210017900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 409324 409752 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018000.1"; gene_id "LTnewLTref_210018000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 409324 409752 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018000.1"; gene_id "LTnewLTref_210018000"; CM024307.1 . transcript 410741 416893 . + . transcript_id "LTnewLTref_210018100.1"; gene_id "LTnewLTref_210018100:pseudogene" CM024307.1 . exon 410741 416893 . + . transcript_id "LTnewLTref_210018100.1"; gene_id "LTnewLTref_210018100:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 418165 419577 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018200.1"; gene_id "LTnewLTref_210018200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 418165 419577 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018200.1"; gene_id "LTnewLTref_210018200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 420243 421190 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018300.1"; gene_id "LTnewLTref_210018300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 420243 421190 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018300.1"; gene_id "LTnewLTref_210018300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 422886 425342 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018400.1"; gene_id "LTnewLTref_210018400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 422886 425342 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018400.1"; gene_id "LTnewLTref_210018400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 427715 434104 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018500.1"; gene_id "LTnewLTref_210018500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 427715 434104 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018500.1"; gene_id "LTnewLTref_210018500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 436399 436971 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018600.1"; gene_id "LTnewLTref_210018600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 436399 436971 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018600.1"; gene_id "LTnewLTref_210018600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 438175 438606 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018700.1"; gene_id "LTnewLTref_210018700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 438175 438606 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018700.1"; gene_id "LTnewLTref_210018700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 439504 439935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210018800.1"; gene_id "LTnewLTref_210018800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 439504 439935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210018800.1"; gene_id "LTnewLTref_210018800"; CM024307.1 . transcript 442735 443667 . + . transcript_id "LTnewLTref_210018900.1"; gene_id "LTnewLTref_210018900:pseudogene" CM024307.1 . exon 442735 443667 . + . transcript_id "LTnewLTref_210018900.1"; gene_id "LTnewLTref_210018900:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 445412 447067 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210019000.1"; gene_id "LTnewLTref_210019000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 445412 447067 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210019000.1"; gene_id "LTnewLTref_210019000"; CM024307.1 INFERNAL transcript 447849 447967 93.8 + . transcript_id "LTnewLTref_210019100:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019100" CM024307.1 INFERNAL exon 447849 447967 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019100:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019100"; CM024307.1 Liftoff transcript 447849 447967 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019200:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019200" CM024307.1 Liftoff exon 447849 447967 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019200:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019200"; CM024307.1 Aragorn_1.2.36 transcript 448052 448123 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019300" CM024307.1 Aragorn_1.2.36 exon 448052 448123 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019300"; CM024307.1 Aragorn_1.2.36 transcript 448255 448329 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019400" CM024307.1 Aragorn_1.2.36 exon 448255 448329 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019400"; CM024307.1 Aragorn_1.2.36 transcript 448392 448465 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019500" CM024307.1 Aragorn_1.2.36 exon 448392 448465 . + . transcript_id "LTnewLTref_210019500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_210019500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 448704 450788 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210019600.1"; gene_id "LTnewLTref_210019600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 448704 450788 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210019600.1"; gene_id "LTnewLTref_210019600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 452101 457341 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210019700.1"; gene_id "LTnewLTref_210019700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 452101 457341 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210019700.1"; gene_id "LTnewLTref_210019700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 458119 459951 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210019800.1"; gene_id "LTnewLTref_210019800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 458119 459951 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210019800.1"; gene_id "LTnewLTref_210019800"; CM024307.1 . transcript 460067 460260 . - . transcript_id "LTnewLTref_210019900.1"; gene_id "LTnewLTref_210019900:pseudogene" CM024307.1 . exon 460067 460260 . - . transcript_id "LTnewLTref_210019900.1"; gene_id "LTnewLTref_210019900:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 460626 462515 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020000.1"; gene_id "LTnewLTref_210020000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 460626 462515 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020000.1"; gene_id "LTnewLTref_210020000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 463220 464131 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020100.1"; gene_id "LTnewLTref_210020100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 463220 464131 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020100.1"; gene_id "LTnewLTref_210020100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 465209 470476 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020200.1"; gene_id "LTnewLTref_210020200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 465209 470476 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020200.1"; gene_id "LTnewLTref_210020200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 475180 478578 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020300.1"; gene_id "LTnewLTref_210020300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 475180 478578 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020300.1"; gene_id "LTnewLTref_210020300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 483056 484489 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020400.1"; gene_id "LTnewLTref_210020400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 483056 484489 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020400.1"; gene_id "LTnewLTref_210020400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 485715 486512 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020500.1"; gene_id "LTnewLTref_210020500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 485715 486512 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020500.1"; gene_id "LTnewLTref_210020500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 487389 489749 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020600.1"; gene_id "LTnewLTref_210020600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 487389 489749 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020600.1"; gene_id "LTnewLTref_210020600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 491110 491991 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020700.1"; gene_id "LTnewLTref_210020700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 491110 491991 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020700.1"; gene_id "LTnewLTref_210020700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 493673 494527 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020800.1"; gene_id "LTnewLTref_210020800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 493673 494527 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020800.1"; gene_id "LTnewLTref_210020800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 495985 500331 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210020900.1"; gene_id "LTnewLTref_210020900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 495985 500331 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210020900.1"; gene_id "LTnewLTref_210020900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 503777 505582 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021000.1"; gene_id "LTnewLTref_210021000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 503777 505582 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021000.1"; gene_id "LTnewLTref_210021000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 507556 511338 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021100.1"; gene_id "LTnewLTref_210021100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 507556 511338 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021100.1"; gene_id "LTnewLTref_210021100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 514501 515475 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021200.1"; gene_id "LTnewLTref_210021200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 514501 515475 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021200.1"; gene_id "LTnewLTref_210021200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 516917 518410 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021300.1"; gene_id "LTnewLTref_210021300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 516917 518410 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021300.1"; gene_id "LTnewLTref_210021300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 520204 522711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021400.1"; gene_id "LTnewLTref_210021400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 520204 522711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021400.1"; gene_id "LTnewLTref_210021400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 526581 528446 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021500.1"; gene_id "LTnewLTref_210021500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 526581 528446 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021500.1"; gene_id "LTnewLTref_210021500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 530187 530960 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021600.1"; gene_id "LTnewLTref_210021600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 530187 530960 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021600.1"; gene_id "LTnewLTref_210021600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 532006 532836 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021700.1"; gene_id "LTnewLTref_210021700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 532006 532836 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021700.1"; gene_id "LTnewLTref_210021700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 536006 538045 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021800.1"; gene_id "LTnewLTref_210021800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 536006 538045 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021800.1"; gene_id "LTnewLTref_210021800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 539067 540143 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210021900.1"; gene_id "LTnewLTref_210021900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 539067 540143 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210021900.1"; gene_id "LTnewLTref_210021900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 540753 541238 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022000.1"; gene_id "LTnewLTref_210022000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 540753 541238 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022000.1"; gene_id "LTnewLTref_210022000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 542754 547541 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022100.1"; gene_id "LTnewLTref_210022100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 542754 547541 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022100.1"; gene_id "LTnewLTref_210022100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 550738 552189 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022200.1"; gene_id "LTnewLTref_210022200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 550738 552189 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022200.1"; gene_id "LTnewLTref_210022200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 553774 558522 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022300.1"; gene_id "LTnewLTref_210022300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 553774 558522 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022300.1"; gene_id "LTnewLTref_210022300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 559954 561123 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022400.1"; gene_id "LTnewLTref_210022400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 559954 561123 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022400.1"; gene_id "LTnewLTref_210022400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 562001 562240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022500.1"; gene_id "LTnewLTref_210022500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 562001 562240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022500.1"; gene_id "LTnewLTref_210022500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 562878 566027 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022600.1"; gene_id "LTnewLTref_210022600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 562878 566027 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022600.1"; gene_id "LTnewLTref_210022600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 568972 570075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022700.1"; gene_id "LTnewLTref_210022700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 568972 570075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022700.1"; gene_id "LTnewLTref_210022700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 571904 573694 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210022800.1"; gene_id "LTnewLTref_210022800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 571904 573694 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210022800.1"; gene_id "LTnewLTref_210022800"; CM024307.1 . transcript 574921 576208 . - . transcript_id "LTnewLTref_210022900.1"; gene_id "LTnewLTref_210022900:pseudogene" CM024307.1 . exon 574921 576208 . - . transcript_id "LTnewLTref_210022900.1"; gene_id "LTnewLTref_210022900:pseudogene"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 576757 577563 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023000.1"; gene_id "LTnewLTref_210023000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 576757 577563 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023000.1"; gene_id "LTnewLTref_210023000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 579226 580665 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023100.1"; gene_id "LTnewLTref_210023100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 579226 580665 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023100.1"; gene_id "LTnewLTref_210023100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 582930 583595 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023200.1"; gene_id "LTnewLTref_210023200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 582930 583595 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023200.1"; gene_id "LTnewLTref_210023200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 585518 588766 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023300.1"; gene_id "LTnewLTref_210023300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 585518 588766 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023300.1"; gene_id "LTnewLTref_210023300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 589340 591454 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023400.1"; gene_id "LTnewLTref_210023400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 589340 591454 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023400.1"; gene_id "LTnewLTref_210023400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 589939 591454 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_210023400.2"; gene_id "LTnewLTref_210023400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 589939 590059 0.47 - 1 transcript_id "LTnewLTref_210023400.2"; gene_id "LTnewLTref_210023400"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 590109 591454 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023400.2"; gene_id "LTnewLTref_210023400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 592756 593811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023500.1"; gene_id "LTnewLTref_210023500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 592756 593811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023500.1"; gene_id "LTnewLTref_210023500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 594940 597594 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023600.1"; gene_id "LTnewLTref_210023600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 594940 597594 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023600.1"; gene_id "LTnewLTref_210023600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 601066 603075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023700.1"; gene_id "LTnewLTref_210023700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 601066 603075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023700.1"; gene_id "LTnewLTref_210023700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 603764 605398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023800.1"; gene_id "LTnewLTref_210023800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 603764 605398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023800.1"; gene_id "LTnewLTref_210023800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 606119 610516 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210023900.1"; gene_id "LTnewLTref_210023900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 606119 610516 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210023900.1"; gene_id "LTnewLTref_210023900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 613871 614722 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024000.1"; gene_id "LTnewLTref_210024000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 613871 614722 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024000.1"; gene_id "LTnewLTref_210024000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 615491 617518 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024100.1"; gene_id "LTnewLTref_210024100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 615491 617518 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024100.1"; gene_id "LTnewLTref_210024100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 621095 626926 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024200.1"; gene_id "LTnewLTref_210024200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 621095 626926 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024200.1"; gene_id "LTnewLTref_210024200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 628359 628880 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024300.1"; gene_id "LTnewLTref_210024300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 628359 628880 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024300.1"; gene_id "LTnewLTref_210024300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 630129 631721 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024400.1"; gene_id "LTnewLTref_210024400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 630129 631721 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024400.1"; gene_id "LTnewLTref_210024400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 635725 637032 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024500.1"; gene_id "LTnewLTref_210024500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 635725 637032 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024500.1"; gene_id "LTnewLTref_210024500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 638657 639844 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024600.1"; gene_id "LTnewLTref_210024600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 638657 639844 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024600.1"; gene_id "LTnewLTref_210024600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 641692 642834 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024700.1"; gene_id "LTnewLTref_210024700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 641692 642834 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024700.1"; gene_id "LTnewLTref_210024700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 651104 652417 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024800.1"; gene_id "LTnewLTref_210024800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 651104 652417 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024800.1"; gene_id "LTnewLTref_210024800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 655739 657346 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210024900.1"; gene_id "LTnewLTref_210024900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 655739 657346 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210024900.1"; gene_id "LTnewLTref_210024900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 659926 662322 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025000.1"; gene_id "LTnewLTref_210025000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 659926 662322 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025000.1"; gene_id "LTnewLTref_210025000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 663989 665443 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025100.1"; gene_id "LTnewLTref_210025100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 663989 665443 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025100.1"; gene_id "LTnewLTref_210025100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 666500 666940 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025200.1"; gene_id "LTnewLTref_210025200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 666500 666940 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025200.1"; gene_id "LTnewLTref_210025200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 667586 668814 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_210025300.1"; gene_id "LTnewLTref_210025300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 667586 667789 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025300.1"; gene_id "LTnewLTref_210025300"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 667840 668814 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025300.1"; gene_id "LTnewLTref_210025300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 669589 672384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025400.1"; gene_id "LTnewLTref_210025400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 669589 672384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025400.1"; gene_id "LTnewLTref_210025400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 675362 677257 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025500.1"; gene_id "LTnewLTref_210025500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 675362 677257 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025500.1"; gene_id "LTnewLTref_210025500"; CM024307.1 Liftoff transcript 682355 682660 . - . transcript_id "LTnewLTref_210025600.1"; gene_id "LTnewLTref_210025600" CM024307.1 Liftoff CDS 682355 682660 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025600.1"; gene_id "LTnewLTref_210025600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 683883 685877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025700.1"; gene_id "LTnewLTref_210025700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 683883 685877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025700.1"; gene_id "LTnewLTref_210025700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 687270 688682 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025800.1"; gene_id "LTnewLTref_210025800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 687270 688682 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025800.1"; gene_id "LTnewLTref_210025800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 691013 691738 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210025900.1"; gene_id "LTnewLTref_210025900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 691013 691738 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210025900.1"; gene_id "LTnewLTref_210025900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 692467 692874 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026000.1"; gene_id "LTnewLTref_210026000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 692467 692874 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026000.1"; gene_id "LTnewLTref_210026000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 695297 695782 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026100.1"; gene_id "LTnewLTref_210026100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 695297 695782 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026100.1"; gene_id "LTnewLTref_210026100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 697552 698574 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026200.1"; gene_id "LTnewLTref_210026200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 697552 698574 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026200.1"; gene_id "LTnewLTref_210026200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 699410 699937 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026300.1"; gene_id "LTnewLTref_210026300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 699410 699937 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026300.1"; gene_id "LTnewLTref_210026300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 700659 701654 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026400.1"; gene_id "LTnewLTref_210026400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 700659 701654 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026400.1"; gene_id "LTnewLTref_210026400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 703276 704775 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026500.1"; gene_id "LTnewLTref_210026500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 703276 704775 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026500.1"; gene_id "LTnewLTref_210026500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 706153 707046 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026600.1"; gene_id "LTnewLTref_210026600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 706153 707046 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026600.1"; gene_id "LTnewLTref_210026600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 708108 709439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026700.1"; gene_id "LTnewLTref_210026700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 708108 709439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026700.1"; gene_id "LTnewLTref_210026700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 710211 710663 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210026800.1"; gene_id "LTnewLTref_210026800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 710211 710663 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026800.1"; gene_id "LTnewLTref_210026800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 715137 716846 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_210026900.1"; gene_id "LTnewLTref_210026900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 715137 715163 0.59 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026900.1"; gene_id "LTnewLTref_210026900"; CM024307.1 AUGUSTUS CDS 715311 716846 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210026900.1"; gene_id "LTnewLTref_210026900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 717405 718160 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210027000.1"; gene_id "LTnewLTref_210027000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 717405 718160 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210027000.1"; gene_id "LTnewLTref_210027000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 718610 719305 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210027100.1"; gene_id "LTnewLTref_210027100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 718610 719305 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210027100.1"; gene_id "LTnewLTref_210027100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 720062 720535 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210027200.1"; gene_id "LTnewLTref_210027200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 720062 720535 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210027200.1"; gene_id "LTnewLTref_210027200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 720951 721352 1 - . transcript_id "LTnewLTref_210027300.1"; gene_id "LTnewLTref_210027300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 720951 721352 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_210027300.1"; gene_id "LTnewLTref_210027300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 722958 723473 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210027400.1"; gene_id "LTnewLTref_210027400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 722958 723473 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210027400.1"; gene_id "LTnewLTref_210027400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 723984 725132 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210027500.1"; gene_id "LTnewLTref_210027500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 723984 725132 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210027500.1"; gene_id "LTnewLTref_210027500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 725715 726872 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210027600.1"; gene_id "LTnewLTref_210027600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 725715 726872 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210027600.1"; gene_id "LTnewLTref_210027600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 727947 729239 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210027700.1"; gene_id "LTnewLTref_210027700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 727947 729239 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210027700.1"; gene_id "LTnewLTref_210027700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 730633 731544 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210027800.1"; gene_id "LTnewLTref_210027800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 730633 731544 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210027800.1"; gene_id "LTnewLTref_210027800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 732464 733213 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210027900.1"; gene_id "LTnewLTref_210027900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 732464 733213 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210027900.1"; gene_id "LTnewLTref_210027900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 734126 734689 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028000.1"; gene_id "LTnewLTref_210028000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 734126 734689 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028000.1"; gene_id "LTnewLTref_210028000"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 736224 736787 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028100.1"; gene_id "LTnewLTref_210028100" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 736224 736787 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028100.1"; gene_id "LTnewLTref_210028100"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 738216 739610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028200.1"; gene_id "LTnewLTref_210028200" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 738216 739610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028200.1"; gene_id "LTnewLTref_210028200"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 740181 740459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028300.1"; gene_id "LTnewLTref_210028300" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 740181 740459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028300.1"; gene_id "LTnewLTref_210028300"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 741267 742001 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028400.1"; gene_id "LTnewLTref_210028400" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 741267 742001 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028400.1"; gene_id "LTnewLTref_210028400"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 743415 744809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028500.1"; gene_id "LTnewLTref_210028500" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 743415 744809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028500.1"; gene_id "LTnewLTref_210028500"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 745529 748579 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028600.1"; gene_id "LTnewLTref_210028600" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 745529 748579 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028600.1"; gene_id "LTnewLTref_210028600"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 749250 749489 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028700.1"; gene_id "LTnewLTref_210028700" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 749250 749489 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028700.1"; gene_id "LTnewLTref_210028700"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 753308 754639 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028800.1"; gene_id "LTnewLTref_210028800" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 753308 754639 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028800.1"; gene_id "LTnewLTref_210028800"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 756553 758445 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210028900.1"; gene_id "LTnewLTref_210028900" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 756553 758445 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210028900.1"; gene_id "LTnewLTref_210028900"; CM024307.1 AUGUSTUS transcript 759873 760604 1 + . transcript_id "LTnewLTref_210029000.1"; gene_id "LTnewLTref_210029000" CM024307.1 AUGUSTUS CDS 759873 760604 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_210029000.1"; gene_id "LTnewLTref_210029000"; CM024308.1 . transcript 3489 5415 . - . transcript_id "LTnewLTref_220005000.1"; gene_id "LTnewLTref_220005000:pseudogene" CM024308.1 . exon 3489 5415 . - . transcript_id "LTnewLTref_220005000.1"; gene_id "LTnewLTref_220005000:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 10194 10553 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220005100.1"; gene_id "LTnewLTref_220005100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 10194 10553 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220005100.1"; gene_id "LTnewLTref_220005100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 11276 11710 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005200.1"; gene_id "LTnewLTref_220005200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 11276 11710 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005200.1"; gene_id "LTnewLTref_220005200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 12378 12944 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005300.1"; gene_id "LTnewLTref_220005300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 12378 12944 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005300.1"; gene_id "LTnewLTref_220005300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 13322 13615 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005400.1"; gene_id "LTnewLTref_220005400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 13322 13615 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005400.1"; gene_id "LTnewLTref_220005400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 14117 14980 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005500.1"; gene_id "LTnewLTref_220005500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 14117 14980 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005500.1"; gene_id "LTnewLTref_220005500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 15584 17329 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005600.1"; gene_id "LTnewLTref_220005600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 15584 17329 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005600.1"; gene_id "LTnewLTref_220005600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 18491 20809 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005700.1"; gene_id "LTnewLTref_220005700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 18491 20809 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005700.1"; gene_id "LTnewLTref_220005700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 21729 22598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005800.1"; gene_id "LTnewLTref_220005800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 21729 22598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005800.1"; gene_id "LTnewLTref_220005800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 24702 25697 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220005900.1"; gene_id "LTnewLTref_220005900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 24702 25697 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220005900.1"; gene_id "LTnewLTref_220005900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 26411 29545 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006000.1"; gene_id "LTnewLTref_220006000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 26411 29545 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006000.1"; gene_id "LTnewLTref_220006000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 42856 43587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006100.1"; gene_id "LTnewLTref_220006100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 42856 43587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006100.1"; gene_id "LTnewLTref_220006100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 46156 48126 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006200.1"; gene_id "LTnewLTref_220006200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 46156 48126 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006200.1"; gene_id "LTnewLTref_220006200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 48790 49038 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006300.1"; gene_id "LTnewLTref_220006300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 48790 49038 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006300.1"; gene_id "LTnewLTref_220006300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 49964 50698 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006400.1"; gene_id "LTnewLTref_220006400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 49964 50698 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006400.1"; gene_id "LTnewLTref_220006400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 57889 59325 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006500.1"; gene_id "LTnewLTref_220006500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 57889 59325 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006500.1"; gene_id "LTnewLTref_220006500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 61916 63283 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006600.1"; gene_id "LTnewLTref_220006600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 61916 63283 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006600.1"; gene_id "LTnewLTref_220006600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 64415 65842 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006700.1"; gene_id "LTnewLTref_220006700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 64415 65842 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006700.1"; gene_id "LTnewLTref_220006700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 69088 70320 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006800.1"; gene_id "LTnewLTref_220006800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 69088 70320 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006800.1"; gene_id "LTnewLTref_220006800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 73211 76771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220006900.1"; gene_id "LTnewLTref_220006900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 73211 76771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220006900.1"; gene_id "LTnewLTref_220006900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 81099 81881 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007000.1"; gene_id "LTnewLTref_220007000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 81099 81881 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007000.1"; gene_id "LTnewLTref_220007000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 85309 86655 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007100.1"; gene_id "LTnewLTref_220007100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 85309 86655 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007100.1"; gene_id "LTnewLTref_220007100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 88163 92773 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007200.1"; gene_id "LTnewLTref_220007200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 88163 92773 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007200.1"; gene_id "LTnewLTref_220007200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 94161 96845 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007300.1"; gene_id "LTnewLTref_220007300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 94161 96845 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007300.1"; gene_id "LTnewLTref_220007300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 103831 105288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007400.1"; gene_id "LTnewLTref_220007400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 103831 105288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007400.1"; gene_id "LTnewLTref_220007400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 106781 107770 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007500.1"; gene_id "LTnewLTref_220007500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 106781 107770 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007500.1"; gene_id "LTnewLTref_220007500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 110164 110940 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007600.1"; gene_id "LTnewLTref_220007600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 110164 110940 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007600.1"; gene_id "LTnewLTref_220007600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 113758 114606 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007700.1"; gene_id "LTnewLTref_220007700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 113758 114606 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007700.1"; gene_id "LTnewLTref_220007700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 116057 116284 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220007800.1"; gene_id "LTnewLTref_220007800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 116057 116284 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220007800.1"; gene_id "LTnewLTref_220007800"; CM024308.1 . transcript 118499 118903 . - . transcript_id "LTnewLTref_220007900.1"; gene_id "LTnewLTref_220007900:pseudogene" CM024308.1 . exon 118499 118903 . - . transcript_id "LTnewLTref_220007900.1"; gene_id "LTnewLTref_220007900:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 120568 123093 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008000.1"; gene_id "LTnewLTref_220008000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 120568 123093 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008000.1"; gene_id "LTnewLTref_220008000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 124253 125647 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008100.1"; gene_id "LTnewLTref_220008100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 124253 125647 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008100.1"; gene_id "LTnewLTref_220008100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 127064 128749 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008200.1"; gene_id "LTnewLTref_220008200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 127064 128749 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008200.1"; gene_id "LTnewLTref_220008200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 130318 132348 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008300.1"; gene_id "LTnewLTref_220008300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 130318 132348 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008300.1"; gene_id "LTnewLTref_220008300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 133673 134728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008400.1"; gene_id "LTnewLTref_220008400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 133673 134728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008400.1"; gene_id "LTnewLTref_220008400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 136594 139863 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008500.1"; gene_id "LTnewLTref_220008500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 136594 139863 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008500.1"; gene_id "LTnewLTref_220008500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 146183 146488 0.84 - . transcript_id "LTnewLTref_220008600.1"; gene_id "LTnewLTref_220008600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 146183 146488 0.84 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008600.1"; gene_id "LTnewLTref_220008600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 146518 147564 0.84 - . transcript_id "LTnewLTref_220008700.1"; gene_id "LTnewLTref_220008700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 146518 147564 0.84 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008700.1"; gene_id "LTnewLTref_220008700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 148278 149030 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008800.1"; gene_id "LTnewLTref_220008800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 148278 149030 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008800.1"; gene_id "LTnewLTref_220008800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 150143 151174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220008900.1"; gene_id "LTnewLTref_220008900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 150143 151174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220008900.1"; gene_id "LTnewLTref_220008900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 151921 152745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220009000.1"; gene_id "LTnewLTref_220009000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 151921 152745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009000.1"; gene_id "LTnewLTref_220009000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 153578 157405 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220009100.1"; gene_id "LTnewLTref_220009100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 153578 157405 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009100.1"; gene_id "LTnewLTref_220009100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 158404 159756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220009200.1"; gene_id "LTnewLTref_220009200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 158404 159756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009200.1"; gene_id "LTnewLTref_220009200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 161406 163589 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220009300.1"; gene_id "LTnewLTref_220009300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 161406 163589 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009300.1"; gene_id "LTnewLTref_220009300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 167175 170768 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220009400.1"; gene_id "LTnewLTref_220009400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 167175 170768 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009400.1"; gene_id "LTnewLTref_220009400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 172598 172885 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_220009500.1"; gene_id "LTnewLTref_220009500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 172598 172885 0.6 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009500.1"; gene_id "LTnewLTref_220009500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 172914 177393 0.73 - . transcript_id "LTnewLTref_220009600.1"; gene_id "LTnewLTref_220009600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 172914 176675 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009600.1"; gene_id "LTnewLTref_220009600"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 176746 177393 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009600.1"; gene_id "LTnewLTref_220009600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 177528 179409 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_220009700.1"; gene_id "LTnewLTref_220009700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 177528 178800 0.43 - 1 transcript_id "LTnewLTref_220009700.1"; gene_id "LTnewLTref_220009700"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 178847 179409 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009700.1"; gene_id "LTnewLTref_220009700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 179544 180327 0.79 - . transcript_id "LTnewLTref_220009800.1"; gene_id "LTnewLTref_220009800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 179544 179975 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009800.1"; gene_id "LTnewLTref_220009800"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 180046 180327 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009800.1"; gene_id "LTnewLTref_220009800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 180461 183441 0.46 - . transcript_id "LTnewLTref_220009900.1"; gene_id "LTnewLTref_220009900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 180461 181967 0.53 - 1 transcript_id "LTnewLTref_220009900.1"; gene_id "LTnewLTref_220009900"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 182030 183441 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220009900.1"; gene_id "LTnewLTref_220009900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 186697 188525 0.41 - . transcript_id "LTnewLTref_220010000.1"; gene_id "LTnewLTref_220010000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 186697 187298 0.41 - 2 transcript_id "LTnewLTref_220010000.1"; gene_id "LTnewLTref_220010000"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 187370 188525 0.41 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010000.1"; gene_id "LTnewLTref_220010000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 188660 192888 0.68 - . transcript_id "LTnewLTref_220010100.1"; gene_id "LTnewLTref_220010100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 188660 189670 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010100.1"; gene_id "LTnewLTref_220010100"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 189718 192888 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010100.1"; gene_id "LTnewLTref_220010100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 195029 195487 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010200.1"; gene_id "LTnewLTref_220010200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 195029 195487 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010200.1"; gene_id "LTnewLTref_220010200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 196492 200340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010300.1"; gene_id "LTnewLTref_220010300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 196492 200340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010300.1"; gene_id "LTnewLTref_220010300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 201655 202524 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010400.1"; gene_id "LTnewLTref_220010400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 201655 202524 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010400.1"; gene_id "LTnewLTref_220010400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 203298 203756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010500.1"; gene_id "LTnewLTref_220010500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 203298 203756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010500.1"; gene_id "LTnewLTref_220010500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 205223 206470 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010600.1"; gene_id "LTnewLTref_220010600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 205223 206470 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010600.1"; gene_id "LTnewLTref_220010600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 207383 209176 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010700.1"; gene_id "LTnewLTref_220010700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 207383 209176 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010700.1"; gene_id "LTnewLTref_220010700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 212420 214606 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010800.1"; gene_id "LTnewLTref_220010800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 212420 214606 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010800.1"; gene_id "LTnewLTref_220010800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 216738 218294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220010900.1"; gene_id "LTnewLTref_220010900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 216738 218294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220010900.1"; gene_id "LTnewLTref_220010900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 219025 221004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011000.1"; gene_id "LTnewLTref_220011000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 219025 221004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011000.1"; gene_id "LTnewLTref_220011000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 221931 225335 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011100.1"; gene_id "LTnewLTref_220011100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 221931 225335 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011100.1"; gene_id "LTnewLTref_220011100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 226583 227902 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011200.1"; gene_id "LTnewLTref_220011200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 226583 227902 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011200.1"; gene_id "LTnewLTref_220011200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 228499 231174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011300.1"; gene_id "LTnewLTref_220011300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 228499 231174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011300.1"; gene_id "LTnewLTref_220011300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 232066 234735 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011400.1"; gene_id "LTnewLTref_220011400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 232066 234735 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011400.1"; gene_id "LTnewLTref_220011400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 236611 237924 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011500.1"; gene_id "LTnewLTref_220011500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 236611 237924 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011500.1"; gene_id "LTnewLTref_220011500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 240288 240839 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011600.1"; gene_id "LTnewLTref_220011600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 240288 240839 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011600.1"; gene_id "LTnewLTref_220011600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 241863 243341 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011700.1"; gene_id "LTnewLTref_220011700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 241863 243341 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011700.1"; gene_id "LTnewLTref_220011700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 244008 245477 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011800.1"; gene_id "LTnewLTref_220011800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 244008 245477 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011800.1"; gene_id "LTnewLTref_220011800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 247960 248742 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220011900.1"; gene_id "LTnewLTref_220011900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 247960 248742 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220011900.1"; gene_id "LTnewLTref_220011900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 250845 252179 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012000.1"; gene_id "LTnewLTref_220012000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 250845 252179 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012000.1"; gene_id "LTnewLTref_220012000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 254278 257715 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012100.1"; gene_id "LTnewLTref_220012100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 254278 257715 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012100.1"; gene_id "LTnewLTref_220012100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 262842 268199 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012200.1"; gene_id "LTnewLTref_220012200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 262842 268199 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012200.1"; gene_id "LTnewLTref_220012200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 269734 271275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012300.1"; gene_id "LTnewLTref_220012300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 269734 271275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012300.1"; gene_id "LTnewLTref_220012300"; CM024308.1 Liftoff transcript 272862 276554 . - . transcript_id "LTnewLTref_220012400.1"; gene_id "LTnewLTref_220012400" CM024308.1 Liftoff CDS 272862 276554 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012400.1"; gene_id "LTnewLTref_220012400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 279008 279481 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012500.1"; gene_id "LTnewLTref_220012500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 279008 279481 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012500.1"; gene_id "LTnewLTref_220012500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 280350 280649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012600.1"; gene_id "LTnewLTref_220012600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 280350 280649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012600.1"; gene_id "LTnewLTref_220012600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 282355 284205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012700.1"; gene_id "LTnewLTref_220012700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 282355 284205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012700.1"; gene_id "LTnewLTref_220012700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 289068 291380 0.45 - . transcript_id "LTnewLTref_220012800.1"; gene_id "LTnewLTref_220012800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 289068 290785 0.61 - 2 transcript_id "LTnewLTref_220012800.1"; gene_id "LTnewLTref_220012800"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 291068 291380 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012800.1"; gene_id "LTnewLTref_220012800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 298557 299465 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220012900.1"; gene_id "LTnewLTref_220012900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 298557 299465 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220012900.1"; gene_id "LTnewLTref_220012900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 300170 303676 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013000.1"; gene_id "LTnewLTref_220013000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 300170 303676 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013000.1"; gene_id "LTnewLTref_220013000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 305781 307100 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013100.1"; gene_id "LTnewLTref_220013100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 305781 307100 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013100.1"; gene_id "LTnewLTref_220013100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 316054 317823 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013200.1"; gene_id "LTnewLTref_220013200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 316054 317823 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013200.1"; gene_id "LTnewLTref_220013200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 322646 322972 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_220013300.1"; gene_id "LTnewLTref_220013300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 322646 322972 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013300.1"; gene_id "LTnewLTref_220013300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 325904 329347 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013400.1"; gene_id "LTnewLTref_220013400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 325904 329347 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013400.1"; gene_id "LTnewLTref_220013400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 336050 336412 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013500.1"; gene_id "LTnewLTref_220013500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 336050 336412 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013500.1"; gene_id "LTnewLTref_220013500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 338325 339194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013600.1"; gene_id "LTnewLTref_220013600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 338325 339194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013600.1"; gene_id "LTnewLTref_220013600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 340787 341656 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013700.1"; gene_id "LTnewLTref_220013700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 340787 341656 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013700.1"; gene_id "LTnewLTref_220013700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 342443 344437 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220013800.1"; gene_id "LTnewLTref_220013800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 342443 344437 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220013800.1"; gene_id "LTnewLTref_220013800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 346578 347222 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_220013900.1"; gene_id "LTnewLTref_220013900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 346578 347222 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220013900.1"; gene_id "LTnewLTref_220013900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 347937 349052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220014000.1"; gene_id "LTnewLTref_220014000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 347937 349052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014000.1"; gene_id "LTnewLTref_220014000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 352475 355406 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_220014100.1"; gene_id "LTnewLTref_220014100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 352475 354556 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014100.1"; gene_id "LTnewLTref_220014100"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 354609 355406 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014100.1"; gene_id "LTnewLTref_220014100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 356128 357036 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220014200.1"; gene_id "LTnewLTref_220014200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 356128 357036 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014200.1"; gene_id "LTnewLTref_220014200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 364221 364490 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_220014300.1"; gene_id "LTnewLTref_220014300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 364221 364490 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014300.1"; gene_id "LTnewLTref_220014300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 369891 371741 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220014400.1"; gene_id "LTnewLTref_220014400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 369891 371741 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014400.1"; gene_id "LTnewLTref_220014400"; CM024308.1 Liftoff transcript 372086 372310 . + . transcript_id "LTnewLTref_220014500.1"; gene_id "LTnewLTref_220014500" CM024308.1 Liftoff CDS 372086 372310 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014500.1"; gene_id "LTnewLTref_220014500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 373061 377139 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_220014600.1"; gene_id "LTnewLTref_220014600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 373061 376393 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014600.1"; gene_id "LTnewLTref_220014600"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 376483 377139 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014600.1"; gene_id "LTnewLTref_220014600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 379449 380288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220014700.1"; gene_id "LTnewLTref_220014700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 379449 380288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014700.1"; gene_id "LTnewLTref_220014700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 381622 383739 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220014800.1"; gene_id "LTnewLTref_220014800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 381622 383739 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014800.1"; gene_id "LTnewLTref_220014800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 384750 385118 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220014900.1"; gene_id "LTnewLTref_220014900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 384750 385118 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220014900.1"; gene_id "LTnewLTref_220014900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 387610 390402 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015000.1"; gene_id "LTnewLTref_220015000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 387610 390402 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015000.1"; gene_id "LTnewLTref_220015000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 392361 394019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015100.1"; gene_id "LTnewLTref_220015100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 392361 394019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015100.1"; gene_id "LTnewLTref_220015100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 396315 398957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015200.1"; gene_id "LTnewLTref_220015200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 396315 398957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015200.1"; gene_id "LTnewLTref_220015200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 400500 402650 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015300.1"; gene_id "LTnewLTref_220015300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 400500 402650 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015300.1"; gene_id "LTnewLTref_220015300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 404450 405173 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_220015400.1"; gene_id "LTnewLTref_220015400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 404450 405075 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015400.1"; gene_id "LTnewLTref_220015400"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 405125 405173 0.53 + 1 transcript_id "LTnewLTref_220015400.1"; gene_id "LTnewLTref_220015400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 404450 406646 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_220015400.2"; gene_id "LTnewLTref_220015400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 404450 405442 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015400.2"; gene_id "LTnewLTref_220015400"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 405516 406646 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015400.2"; gene_id "LTnewLTref_220015400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 410261 411337 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015500.1"; gene_id "LTnewLTref_220015500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 410261 411337 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015500.1"; gene_id "LTnewLTref_220015500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 418461 422822 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015600.1"; gene_id "LTnewLTref_220015600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 418461 422822 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015600.1"; gene_id "LTnewLTref_220015600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 425521 431403 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015700.1"; gene_id "LTnewLTref_220015700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 425521 431403 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015700.1"; gene_id "LTnewLTref_220015700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 432196 432396 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015800.1"; gene_id "LTnewLTref_220015800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 432196 432396 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015800.1"; gene_id "LTnewLTref_220015800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 433707 436478 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220015900.1"; gene_id "LTnewLTref_220015900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 433707 436478 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220015900.1"; gene_id "LTnewLTref_220015900"; CM024308.1 . transcript 437402 441227 . + . transcript_id "LTnewLTref_220016000.1"; gene_id "LTnewLTref_220016000:pseudogene" CM024308.1 . exon 437402 441227 . + . transcript_id "LTnewLTref_220016000.1"; gene_id "LTnewLTref_220016000:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 442676 444439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016100.1"; gene_id "LTnewLTref_220016100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 442676 444439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016100.1"; gene_id "LTnewLTref_220016100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 446652 448406 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016200.1"; gene_id "LTnewLTref_220016200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 446652 448406 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016200.1"; gene_id "LTnewLTref_220016200"; CM024308.1 . transcript 450709 451843 . + . transcript_id "LTnewLTref_220016300.1"; gene_id "LTnewLTref_220016300:pseudogene" CM024308.1 . exon 450709 451843 . + . transcript_id "LTnewLTref_220016300.1"; gene_id "LTnewLTref_220016300:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 452634 456362 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016400.1"; gene_id "LTnewLTref_220016400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 452634 456362 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016400.1"; gene_id "LTnewLTref_220016400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 457997 460033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016500.1"; gene_id "LTnewLTref_220016500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 457997 460033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016500.1"; gene_id "LTnewLTref_220016500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 461423 464320 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016600.1"; gene_id "LTnewLTref_220016600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 461423 464320 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016600.1"; gene_id "LTnewLTref_220016600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 465873 466184 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016700.1"; gene_id "LTnewLTref_220016700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 465873 466184 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016700.1"; gene_id "LTnewLTref_220016700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 467441 469741 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016800.1"; gene_id "LTnewLTref_220016800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 467441 469741 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016800.1"; gene_id "LTnewLTref_220016800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 470747 471505 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220016900.1"; gene_id "LTnewLTref_220016900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 470747 471505 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220016900.1"; gene_id "LTnewLTref_220016900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 472794 474932 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017000.1"; gene_id "LTnewLTref_220017000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 472794 474932 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017000.1"; gene_id "LTnewLTref_220017000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 476883 484382 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017100.1"; gene_id "LTnewLTref_220017100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 476883 484382 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017100.1"; gene_id "LTnewLTref_220017100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 486198 503183 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_220017200.1"; gene_id "LTnewLTref_220017200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 486198 499268 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017200.1"; gene_id "LTnewLTref_220017200"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 499311 503183 0.58 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017200.1"; gene_id "LTnewLTref_220017200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 498075 503183 0.71 + . transcript_id "LTnewLTref_220017200.2"; gene_id "LTnewLTref_220017200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 498075 503183 0.71 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017200.2"; gene_id "LTnewLTref_220017200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 502533 503183 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017200.3"; gene_id "LTnewLTref_220017200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 502533 503183 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017200.3"; gene_id "LTnewLTref_220017200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 504231 505631 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017300.1"; gene_id "LTnewLTref_220017300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 504231 505631 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017300.1"; gene_id "LTnewLTref_220017300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 506229 507514 0.78 + . transcript_id "LTnewLTref_220017400.1"; gene_id "LTnewLTref_220017400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 506229 507008 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017400.1"; gene_id "LTnewLTref_220017400"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 507053 507514 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017400.1"; gene_id "LTnewLTref_220017400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 508294 509595 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017500.1"; gene_id "LTnewLTref_220017500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 508294 509595 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017500.1"; gene_id "LTnewLTref_220017500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 510718 513879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017600.1"; gene_id "LTnewLTref_220017600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 510718 513879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017600.1"; gene_id "LTnewLTref_220017600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 514828 516168 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017700.1"; gene_id "LTnewLTref_220017700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 514828 516168 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017700.1"; gene_id "LTnewLTref_220017700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 516949 519894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017800.1"; gene_id "LTnewLTref_220017800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 516949 519894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017800.1"; gene_id "LTnewLTref_220017800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 521624 523111 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220017900.1"; gene_id "LTnewLTref_220017900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 521624 523111 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220017900.1"; gene_id "LTnewLTref_220017900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 523741 524430 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220018000.1"; gene_id "LTnewLTref_220018000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 523741 524430 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220018000.1"; gene_id "LTnewLTref_220018000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 525375 526346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220018100.1"; gene_id "LTnewLTref_220018100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 525375 526346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220018100.1"; gene_id "LTnewLTref_220018100"; CM024308.1 Liftoff transcript 528798 533600 . + . transcript_id "LTnewLTref_220018200.1"; gene_id "LTnewLTref_220018200" CM024308.1 Liftoff CDS 528798 533600 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_220018200.1"; gene_id "LTnewLTref_220018200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 534045 534536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220018300.1"; gene_id "LTnewLTref_220018300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 534045 534536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220018300.1"; gene_id "LTnewLTref_220018300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 535458 538370 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220018400.1"; gene_id "LTnewLTref_220018400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 535458 538370 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220018400.1"; gene_id "LTnewLTref_220018400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 539637 541763 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220018500.1"; gene_id "LTnewLTref_220018500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 539637 541763 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220018500.1"; gene_id "LTnewLTref_220018500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 539637 542171 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220018500.2"; gene_id "LTnewLTref_220018500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 539637 542171 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220018500.2"; gene_id "LTnewLTref_220018500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 544044 545402 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220018600.1"; gene_id "LTnewLTref_220018600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 544044 545402 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220018600.1"; gene_id "LTnewLTref_220018600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 546499 549711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220018700.1"; gene_id "LTnewLTref_220018700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 546499 549711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220018700.1"; gene_id "LTnewLTref_220018700"; CM024308.1 . transcript 551273 552621 . - . transcript_id "LTnewLTref_220018800.1"; gene_id "LTnewLTref_220018800:pseudogene" CM024308.1 . exon 551273 552621 . - . transcript_id "LTnewLTref_220018800.1"; gene_id "LTnewLTref_220018800:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 553845 555011 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220018900.1"; gene_id "LTnewLTref_220018900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 553845 555011 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220018900.1"; gene_id "LTnewLTref_220018900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 557574 558752 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220019000.1"; gene_id "LTnewLTref_220019000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 557574 558752 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019000.1"; gene_id "LTnewLTref_220019000"; CM024308.1 Liftoff transcript 560272 561420 . - . transcript_id "LTnewLTref_220019100.1"; gene_id "LTnewLTref_220019100" CM024308.1 Liftoff CDS 560272 561420 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019100.1"; gene_id "LTnewLTref_220019100"; CM024308.1 . transcript 563237 563531 . - . transcript_id "LTnewLTref_220019200.1"; gene_id "LTnewLTref_220019200:pseudogene" CM024308.1 . exon 563237 563531 . - . transcript_id "LTnewLTref_220019200.1"; gene_id "LTnewLTref_220019200:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 566868 570296 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220019300.1"; gene_id "LTnewLTref_220019300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 566868 570296 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019300.1"; gene_id "LTnewLTref_220019300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 571463 574515 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_220019400.1"; gene_id "LTnewLTref_220019400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 571463 574004 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_220019400.1"; gene_id "LTnewLTref_220019400"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 574052 574515 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019400.1"; gene_id "LTnewLTref_220019400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 574601 575086 0.75 - . transcript_id "LTnewLTref_220019500.1"; gene_id "LTnewLTref_220019500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 574601 575086 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019500.1"; gene_id "LTnewLTref_220019500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 575111 579769 0.76 - . transcript_id "LTnewLTref_220019600.1"; gene_id "LTnewLTref_220019600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 575111 579769 0.76 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019600.1"; gene_id "LTnewLTref_220019600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 583347 588866 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220019700.1"; gene_id "LTnewLTref_220019700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 583347 585536 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019700.1"; gene_id "LTnewLTref_220019700"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 586557 588866 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019700.1"; gene_id "LTnewLTref_220019700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 591648 593555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220019800.1"; gene_id "LTnewLTref_220019800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 591648 593555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019800.1"; gene_id "LTnewLTref_220019800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 595262 596446 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220019900.1"; gene_id "LTnewLTref_220019900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 595262 596446 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220019900.1"; gene_id "LTnewLTref_220019900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 599668 600756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020000.1"; gene_id "LTnewLTref_220020000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 599668 600756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020000.1"; gene_id "LTnewLTref_220020000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 602203 603993 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020100.1"; gene_id "LTnewLTref_220020100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 602203 603993 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020100.1"; gene_id "LTnewLTref_220020100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 605927 606733 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020200.1"; gene_id "LTnewLTref_220020200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 605927 606733 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020200.1"; gene_id "LTnewLTref_220020200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 607547 608782 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020300.1"; gene_id "LTnewLTref_220020300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 607547 608782 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020300.1"; gene_id "LTnewLTref_220020300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 609670 611250 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020400.1"; gene_id "LTnewLTref_220020400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 609670 611250 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020400.1"; gene_id "LTnewLTref_220020400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 612934 613383 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020500.1"; gene_id "LTnewLTref_220020500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 612934 613383 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020500.1"; gene_id "LTnewLTref_220020500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 617456 618340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020600.1"; gene_id "LTnewLTref_220020600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 617456 618340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020600.1"; gene_id "LTnewLTref_220020600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 619338 619673 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020700.1"; gene_id "LTnewLTref_220020700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 619338 619673 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020700.1"; gene_id "LTnewLTref_220020700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 624436 625956 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020800.1"; gene_id "LTnewLTref_220020800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 624436 625956 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020800.1"; gene_id "LTnewLTref_220020800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 626693 627382 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220020900.1"; gene_id "LTnewLTref_220020900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 626693 627382 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220020900.1"; gene_id "LTnewLTref_220020900"; CM024308.1 . transcript 628081 628372 . + . transcript_id "LTnewLTref_220021000.1"; gene_id "LTnewLTref_220021000:pseudogene" CM024308.1 . exon 628081 628131 . + . transcript_id "LTnewLTref_220021000.1"; gene_id "LTnewLTref_220021000:pseudogene"; CM024308.1 . exon 628133 628372 . + . transcript_id "LTnewLTref_220021000.1"; gene_id "LTnewLTref_220021000:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 629164 629787 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220021100.1"; gene_id "LTnewLTref_220021100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 629164 629787 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220021100.1"; gene_id "LTnewLTref_220021100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 630225 631562 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220021200.1"; gene_id "LTnewLTref_220021200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 630225 631562 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220021200.1"; gene_id "LTnewLTref_220021200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 631921 632688 1 - . transcript_id "LTnewLTref_220021300.1"; gene_id "LTnewLTref_220021300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 631921 632688 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220021300.1"; gene_id "LTnewLTref_220021300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 633400 633735 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220021400.1"; gene_id "LTnewLTref_220021400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 633400 633735 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220021400.1"; gene_id "LTnewLTref_220021400"; CM024308.1 . transcript 636531 636858 . + . transcript_id "LTnewLTref_220021500.1"; gene_id "LTnewLTref_220021500:pseudogene" CM024308.1 . exon 636531 636858 . + . transcript_id "LTnewLTref_220021500.1"; gene_id "LTnewLTref_220021500:pseudogene"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 639177 640265 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220021600.1"; gene_id "LTnewLTref_220021600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 639177 640265 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220021600.1"; gene_id "LTnewLTref_220021600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 641005 644268 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220021700.1"; gene_id "LTnewLTref_220021700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 641005 644268 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220021700.1"; gene_id "LTnewLTref_220021700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 645164 646657 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220021800.1"; gene_id "LTnewLTref_220021800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 645164 646657 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220021800.1"; gene_id "LTnewLTref_220021800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 648062 648763 0.7 + . transcript_id "LTnewLTref_220021900.1"; gene_id "LTnewLTref_220021900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 648062 648085 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220021900.1"; gene_id "LTnewLTref_220021900"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 648245 648763 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220021900.1"; gene_id "LTnewLTref_220021900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 649368 650102 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022000.1"; gene_id "LTnewLTref_220022000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 649368 650102 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022000.1"; gene_id "LTnewLTref_220022000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 650791 653679 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022100.1"; gene_id "LTnewLTref_220022100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 650791 653679 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022100.1"; gene_id "LTnewLTref_220022100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 655770 657620 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022200.1"; gene_id "LTnewLTref_220022200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 655770 657620 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022200.1"; gene_id "LTnewLTref_220022200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 657861 658562 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_220022300.1"; gene_id "LTnewLTref_220022300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 657861 657884 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022300.1"; gene_id "LTnewLTref_220022300"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 658044 658562 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022300.1"; gene_id "LTnewLTref_220022300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 661614 662594 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022400.1"; gene_id "LTnewLTref_220022400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 661614 662594 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022400.1"; gene_id "LTnewLTref_220022400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 667645 668736 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022500.1"; gene_id "LTnewLTref_220022500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 667645 668736 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022500.1"; gene_id "LTnewLTref_220022500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 669532 670623 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022600.1"; gene_id "LTnewLTref_220022600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 669532 670623 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022600.1"; gene_id "LTnewLTref_220022600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 671598 676226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022700.1"; gene_id "LTnewLTref_220022700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 671598 676226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022700.1"; gene_id "LTnewLTref_220022700"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 678859 681294 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022800.1"; gene_id "LTnewLTref_220022800" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 678859 681294 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022800.1"; gene_id "LTnewLTref_220022800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 685888 688062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220022900.1"; gene_id "LTnewLTref_220022900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 685888 688062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220022900.1"; gene_id "LTnewLTref_220022900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 689976 698366 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023000.1"; gene_id "LTnewLTref_220023000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 689976 698366 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023000.1"; gene_id "LTnewLTref_220023000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 700098 701114 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023100.1"; gene_id "LTnewLTref_220023100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 700098 701114 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023100.1"; gene_id "LTnewLTref_220023100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 702560 702871 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023200.1"; gene_id "LTnewLTref_220023200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 702560 702871 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023200.1"; gene_id "LTnewLTref_220023200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 703984 705144 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023300.1"; gene_id "LTnewLTref_220023300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 703984 705144 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023300.1"; gene_id "LTnewLTref_220023300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 705883 707733 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023400.1"; gene_id "LTnewLTref_220023400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 705883 707733 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023400.1"; gene_id "LTnewLTref_220023400"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 708016 709329 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_220023500.1"; gene_id "LTnewLTref_220023500" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 708016 708186 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023500.1"; gene_id "LTnewLTref_220023500"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 708988 709329 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023500.1"; gene_id "LTnewLTref_220023500"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 710587 713346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023600.1"; gene_id "LTnewLTref_220023600" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 710587 713346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023600.1"; gene_id "LTnewLTref_220023600"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 713952 716087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_220023700.1"; gene_id "LTnewLTref_220023700" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 713952 716087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023700.1"; gene_id "LTnewLTref_220023700"; CM024308.1 Liftoff transcript 718696 718917 . + . transcript_id "LTnewLTref_220023800.1"; gene_id "LTnewLTref_220023800" CM024308.1 Liftoff CDS 718696 718917 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023800.1"; gene_id "LTnewLTref_220023800"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 725338 725952 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_220023900.1"; gene_id "LTnewLTref_220023900" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 725338 725952 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220023900.1"; gene_id "LTnewLTref_220023900"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 726004 728103 0.65 + . transcript_id "LTnewLTref_220024000.1"; gene_id "LTnewLTref_220024000" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 726004 727320 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024000.1"; gene_id "LTnewLTref_220024000"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 727633 728103 0.71 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024000.1"; gene_id "LTnewLTref_220024000"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 728161 729600 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_220024100.1"; gene_id "LTnewLTref_220024100" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 728161 728499 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024100.1"; gene_id "LTnewLTref_220024100"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 728602 729600 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024100.1"; gene_id "LTnewLTref_220024100"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 729819 730753 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_220024200.1"; gene_id "LTnewLTref_220024200" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 729819 730472 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024200.1"; gene_id "LTnewLTref_220024200"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 730535 730753 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024200.1"; gene_id "LTnewLTref_220024200"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 730798 731298 0.93 - . transcript_id "LTnewLTref_220024300.1"; gene_id "LTnewLTref_220024300" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 730798 731298 0.93 - 0 transcript_id "LTnewLTref_220024300.1"; gene_id "LTnewLTref_220024300"; CM024308.1 AUGUSTUS transcript 731350 732326 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_220024400.1"; gene_id "LTnewLTref_220024400" CM024308.1 AUGUSTUS CDS 731350 731565 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024400.1"; gene_id "LTnewLTref_220024400"; CM024308.1 AUGUSTUS CDS 731727 732326 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_220024400.1"; gene_id "LTnewLTref_220024400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 266 477 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_230005000.1"; gene_id "LTnewLTref_230005000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 266 477 0.61 + 2 transcript_id "LTnewLTref_230005000.1"; gene_id "LTnewLTref_230005000"; CM024309.1 Liftoff transcript 2697 4538 . + . transcript_id "LTnewLTref_230005100.1"; gene_id "LTnewLTref_230005100" CM024309.1 Liftoff CDS 2697 4538 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005100.1"; gene_id "LTnewLTref_230005100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 6158 7459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005200.1"; gene_id "LTnewLTref_230005200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 6158 7459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005200.1"; gene_id "LTnewLTref_230005200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 8111 8989 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005300.1"; gene_id "LTnewLTref_230005300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 8111 8989 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005300.1"; gene_id "LTnewLTref_230005300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 9352 10785 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005400.1"; gene_id "LTnewLTref_230005400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 9352 10785 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005400.1"; gene_id "LTnewLTref_230005400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 11570 12250 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005500.1"; gene_id "LTnewLTref_230005500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 11570 12250 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005500.1"; gene_id "LTnewLTref_230005500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 13066 13956 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005600.1"; gene_id "LTnewLTref_230005600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 13066 13956 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005600.1"; gene_id "LTnewLTref_230005600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 14531 15052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005700.1"; gene_id "LTnewLTref_230005700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 14531 15052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005700.1"; gene_id "LTnewLTref_230005700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 15559 16557 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005800.1"; gene_id "LTnewLTref_230005800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 15559 16557 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005800.1"; gene_id "LTnewLTref_230005800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 17133 18392 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230005900.1"; gene_id "LTnewLTref_230005900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 17133 18392 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230005900.1"; gene_id "LTnewLTref_230005900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 19938 20978 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006000.1"; gene_id "LTnewLTref_230006000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 19938 20978 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006000.1"; gene_id "LTnewLTref_230006000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 21820 22602 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006100.1"; gene_id "LTnewLTref_230006100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 21820 22602 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006100.1"; gene_id "LTnewLTref_230006100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 23959 25098 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006200.1"; gene_id "LTnewLTref_230006200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 23959 25098 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006200.1"; gene_id "LTnewLTref_230006200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 28302 37427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006300.1"; gene_id "LTnewLTref_230006300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 28302 37427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006300.1"; gene_id "LTnewLTref_230006300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 44514 45092 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006400.1"; gene_id "LTnewLTref_230006400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 44514 45092 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006400.1"; gene_id "LTnewLTref_230006400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 45718 46221 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006500.1"; gene_id "LTnewLTref_230006500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 45718 46221 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006500.1"; gene_id "LTnewLTref_230006500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 48243 49475 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006600.1"; gene_id "LTnewLTref_230006600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 48243 49475 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006600.1"; gene_id "LTnewLTref_230006600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 52821 53921 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006700.1"; gene_id "LTnewLTref_230006700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 52821 53921 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006700.1"; gene_id "LTnewLTref_230006700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 54638 56218 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230006800.1"; gene_id "LTnewLTref_230006800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 54638 56218 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006800.1"; gene_id "LTnewLTref_230006800"; CM024309.1 Liftoff transcript 57030 57719 . + . transcript_id "LTnewLTref_230006900.1"; gene_id "LTnewLTref_230006900" CM024309.1 Liftoff CDS 57030 57719 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230006900.1"; gene_id "LTnewLTref_230006900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 58362 59252 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007000.1"; gene_id "LTnewLTref_230007000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 58362 59252 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007000.1"; gene_id "LTnewLTref_230007000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 62486 62863 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007100.1"; gene_id "LTnewLTref_230007100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 62486 62863 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007100.1"; gene_id "LTnewLTref_230007100"; CM024309.1 Liftoff transcript 63953 64142 . + . transcript_id "LTnewLTref_230007200.1"; gene_id "LTnewLTref_230007200" CM024309.1 Liftoff CDS 63953 64142 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007200.1"; gene_id "LTnewLTref_230007200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 64592 65083 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007300.1"; gene_id "LTnewLTref_230007300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 64592 65083 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007300.1"; gene_id "LTnewLTref_230007300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 68486 73198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007400.1"; gene_id "LTnewLTref_230007400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 68486 73198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007400.1"; gene_id "LTnewLTref_230007400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 76588 81303 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007500.1"; gene_id "LTnewLTref_230007500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 76588 81303 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007500.1"; gene_id "LTnewLTref_230007500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 83933 84391 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007600.1"; gene_id "LTnewLTref_230007600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 83933 84391 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007600.1"; gene_id "LTnewLTref_230007600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 85148 85813 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007700.1"; gene_id "LTnewLTref_230007700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 85148 85813 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007700.1"; gene_id "LTnewLTref_230007700"; CM024309.1 Liftoff transcript 86604 86897 . + . transcript_id "LTnewLTref_230007800.1"; gene_id "LTnewLTref_230007800" CM024309.1 Liftoff CDS 86604 86897 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007800.1"; gene_id "LTnewLTref_230007800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 89406 89963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230007900.1"; gene_id "LTnewLTref_230007900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 89406 89963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230007900.1"; gene_id "LTnewLTref_230007900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 90998 91567 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008000.1"; gene_id "LTnewLTref_230008000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 90998 91567 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008000.1"; gene_id "LTnewLTref_230008000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 93254 97964 0.72 + . transcript_id "LTnewLTref_230008100.1"; gene_id "LTnewLTref_230008100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 93254 95499 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008100.1"; gene_id "LTnewLTref_230008100"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 95609 97964 0.72 + 1 transcript_id "LTnewLTref_230008100.1"; gene_id "LTnewLTref_230008100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 98913 100169 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008200.1"; gene_id "LTnewLTref_230008200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 98913 100169 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008200.1"; gene_id "LTnewLTref_230008200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 107481 108347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008300.1"; gene_id "LTnewLTref_230008300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 107481 108347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008300.1"; gene_id "LTnewLTref_230008300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 109221 112673 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008400.1"; gene_id "LTnewLTref_230008400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 109221 112673 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008400.1"; gene_id "LTnewLTref_230008400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 113634 114629 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008500.1"; gene_id "LTnewLTref_230008500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 113634 114629 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008500.1"; gene_id "LTnewLTref_230008500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 115377 116849 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008600.1"; gene_id "LTnewLTref_230008600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 115377 116849 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008600.1"; gene_id "LTnewLTref_230008600"; CM024309.1 . transcript 118254 122182 . + . transcript_id "LTnewLTref_230008700.1"; gene_id "LTnewLTref_230008700:pseudogene" CM024309.1 . exon 118254 122182 . + . transcript_id "LTnewLTref_230008700.1"; gene_id "LTnewLTref_230008700:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 123644 124465 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008800.1"; gene_id "LTnewLTref_230008800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 123644 124465 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008800.1"; gene_id "LTnewLTref_230008800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 125448 126110 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230008900.1"; gene_id "LTnewLTref_230008900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 125448 126110 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230008900.1"; gene_id "LTnewLTref_230008900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 126919 127245 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009000.1"; gene_id "LTnewLTref_230009000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 126919 127245 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009000.1"; gene_id "LTnewLTref_230009000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 130334 131239 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009100.1"; gene_id "LTnewLTref_230009100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 130334 131239 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009100.1"; gene_id "LTnewLTref_230009100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 132171 133247 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009200.1"; gene_id "LTnewLTref_230009200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 132171 133247 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009200.1"; gene_id "LTnewLTref_230009200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 134025 134798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009300.1"; gene_id "LTnewLTref_230009300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 134025 134798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009300.1"; gene_id "LTnewLTref_230009300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 136381 137439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009400.1"; gene_id "LTnewLTref_230009400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 136381 137439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009400.1"; gene_id "LTnewLTref_230009400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 140811 141167 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009500.1"; gene_id "LTnewLTref_230009500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 140811 141167 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009500.1"; gene_id "LTnewLTref_230009500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 144156 147896 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009600.1"; gene_id "LTnewLTref_230009600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 144156 147896 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009600.1"; gene_id "LTnewLTref_230009600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 149555 155506 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230009700.1"; gene_id "LTnewLTref_230009700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 149555 155506 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009700.1"; gene_id "LTnewLTref_230009700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 157344 157671 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_230009800.1"; gene_id "LTnewLTref_230009800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 157344 157517 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009800.1"; gene_id "LTnewLTref_230009800"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 157624 157671 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009800.1"; gene_id "LTnewLTref_230009800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 157770 160368 0.53 + . transcript_id "LTnewLTref_230009900.1"; gene_id "LTnewLTref_230009900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 157770 160251 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009900.1"; gene_id "LTnewLTref_230009900"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 160313 160368 0.59 + 2 transcript_id "LTnewLTref_230009900.1"; gene_id "LTnewLTref_230009900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 157770 161663 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_230009900.2"; gene_id "LTnewLTref_230009900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 157770 161663 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230009900.2"; gene_id "LTnewLTref_230009900"; CM024309.1 Liftoff transcript 162050 162475 . + . transcript_id "LTnewLTref_230010000.1"; gene_id "LTnewLTref_230010000" CM024309.1 Liftoff CDS 162050 162475 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010000.1"; gene_id "LTnewLTref_230010000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 164059 165285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010100.1"; gene_id "LTnewLTref_230010100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 164059 165285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010100.1"; gene_id "LTnewLTref_230010100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 167526 168479 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010200.1"; gene_id "LTnewLTref_230010200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 167526 168479 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010200.1"; gene_id "LTnewLTref_230010200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 171412 174726 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010300.1"; gene_id "LTnewLTref_230010300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 171412 174726 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010300.1"; gene_id "LTnewLTref_230010300"; CM024309.1 Liftoff transcript 177625 177814 . + . transcript_id "LTnewLTref_230010400.1"; gene_id "LTnewLTref_230010400" CM024309.1 Liftoff CDS 177625 177814 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010400.1"; gene_id "LTnewLTref_230010400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 179207 180184 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_230010500.1"; gene_id "LTnewLTref_230010500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 179207 180118 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010500.1"; gene_id "LTnewLTref_230010500"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 180161 180184 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010500.1"; gene_id "LTnewLTref_230010500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 180865 181881 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010600.1"; gene_id "LTnewLTref_230010600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 180865 181881 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010600.1"; gene_id "LTnewLTref_230010600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 182848 187098 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010700.1"; gene_id "LTnewLTref_230010700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 182848 187098 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010700.1"; gene_id "LTnewLTref_230010700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 187692 188363 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010800.1"; gene_id "LTnewLTref_230010800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 187692 188363 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010800.1"; gene_id "LTnewLTref_230010800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 189935 190951 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230010900.1"; gene_id "LTnewLTref_230010900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 189935 190951 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230010900.1"; gene_id "LTnewLTref_230010900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 192010 192864 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011000.1"; gene_id "LTnewLTref_230011000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 192010 192864 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011000.1"; gene_id "LTnewLTref_230011000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 193549 193845 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011100.1"; gene_id "LTnewLTref_230011100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 193549 193845 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011100.1"; gene_id "LTnewLTref_230011100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 195770 196834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011200.1"; gene_id "LTnewLTref_230011200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 195770 196834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011200.1"; gene_id "LTnewLTref_230011200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 198401 199279 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011300.1"; gene_id "LTnewLTref_230011300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 198401 199279 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011300.1"; gene_id "LTnewLTref_230011300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 200844 202961 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011400.1"; gene_id "LTnewLTref_230011400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 200844 202961 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011400.1"; gene_id "LTnewLTref_230011400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 204526 205449 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011500.1"; gene_id "LTnewLTref_230011500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 204526 205449 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011500.1"; gene_id "LTnewLTref_230011500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 206352 209558 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011600.1"; gene_id "LTnewLTref_230011600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 206352 209558 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011600.1"; gene_id "LTnewLTref_230011600"; CM024309.1 . transcript 211211 211483 . + . transcript_id "LTnewLTref_230011700.1"; gene_id "LTnewLTref_230011700:pseudogene" CM024309.1 . exon 211211 211483 . + . transcript_id "LTnewLTref_230011700.1"; gene_id "LTnewLTref_230011700:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 212584 215232 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011800.1"; gene_id "LTnewLTref_230011800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 212584 215232 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011800.1"; gene_id "LTnewLTref_230011800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 217343 218740 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230011900.1"; gene_id "LTnewLTref_230011900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 217343 218740 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230011900.1"; gene_id "LTnewLTref_230011900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 220502 221605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230012000.1"; gene_id "LTnewLTref_230012000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 220502 221605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230012000.1"; gene_id "LTnewLTref_230012000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 222893 223927 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230012100.1"; gene_id "LTnewLTref_230012100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 222893 223927 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230012100.1"; gene_id "LTnewLTref_230012100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 224690 226528 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230012200.1"; gene_id "LTnewLTref_230012200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 224690 226528 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230012200.1"; gene_id "LTnewLTref_230012200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 227046 228848 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230012300.1"; gene_id "LTnewLTref_230012300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 227046 228848 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230012300.1"; gene_id "LTnewLTref_230012300"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 229160 229234 . + . transcript_id "LTnewLTref_230012400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012400" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 229160 229234 . + . transcript_id "LTnewLTref_230012400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012400"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 229278 229350 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012500" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 229278 229350 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012500"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 229418 229490 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012600" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 229418 229490 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012600"; CM024309.1 INFERNAL transcript 229548 229666 93 - . transcript_id "LTnewLTref_230012700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012700" CM024309.1 INFERNAL exon 229548 229666 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012700"; CM024309.1 Liftoff transcript 229548 229666 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012800" CM024309.1 Liftoff exon 229548 229666 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012800"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 229734 229807 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012900" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 229734 229807 . - . transcript_id "LTnewLTref_230012900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230012900"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 230028 230112 . - . transcript_id "LTnewLTref_230013000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013000" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 230028 230112 . - . transcript_id "LTnewLTref_230013000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013000"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 230168 230241 . - . transcript_id "LTnewLTref_230013100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013100" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 230168 230241 . - . transcript_id "LTnewLTref_230013100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013100"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 230313 230384 . + . transcript_id "LTnewLTref_230013200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013200" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 230313 230384 . + . transcript_id "LTnewLTref_230013200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013200"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 230699 230771 . + . transcript_id "LTnewLTref_230013300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013300" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 230699 230771 . + . transcript_id "LTnewLTref_230013300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013300"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 230820 230892 . - . transcript_id "LTnewLTref_230013400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013400" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 230820 230892 . - . transcript_id "LTnewLTref_230013400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013400"; CM024309.1 Aragorn_1.2.36 transcript 230968 231039 . + . transcript_id "LTnewLTref_230013500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013500" CM024309.1 Aragorn_1.2.36 exon 230968 231039 . + . transcript_id "LTnewLTref_230013500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_230013500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 232011 242015 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230013600.1"; gene_id "LTnewLTref_230013600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 232011 242015 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230013600.1"; gene_id "LTnewLTref_230013600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 245352 245825 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230013700.1"; gene_id "LTnewLTref_230013700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 245352 245825 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230013700.1"; gene_id "LTnewLTref_230013700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 246392 247534 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230013800.1"; gene_id "LTnewLTref_230013800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 246392 247534 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230013800.1"; gene_id "LTnewLTref_230013800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 250725 251435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230013900.1"; gene_id "LTnewLTref_230013900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 250725 251435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230013900.1"; gene_id "LTnewLTref_230013900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 253012 253551 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_230014000.1"; gene_id "LTnewLTref_230014000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 253012 253551 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014000.1"; gene_id "LTnewLTref_230014000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 254822 257956 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014100.1"; gene_id "LTnewLTref_230014100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 254822 257956 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014100.1"; gene_id "LTnewLTref_230014100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 262234 264522 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014200.1"; gene_id "LTnewLTref_230014200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 262234 264522 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014200.1"; gene_id "LTnewLTref_230014200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 266599 269817 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014300.1"; gene_id "LTnewLTref_230014300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 266599 269817 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014300.1"; gene_id "LTnewLTref_230014300"; CM024309.1 . transcript 270996 274209 . - . transcript_id "LTnewLTref_230014400.1"; gene_id "LTnewLTref_230014400:pseudogene" CM024309.1 . exon 270996 274209 . - . transcript_id "LTnewLTref_230014400.1"; gene_id "LTnewLTref_230014400:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 276119 277348 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014500.1"; gene_id "LTnewLTref_230014500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 276119 277348 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014500.1"; gene_id "LTnewLTref_230014500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 280316 281101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014600.1"; gene_id "LTnewLTref_230014600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 280316 281101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014600.1"; gene_id "LTnewLTref_230014600"; CM024309.1 . transcript 283984 286236 . - . transcript_id "LTnewLTref_230014700.1"; gene_id "LTnewLTref_230014700:pseudogene" CM024309.1 . exon 283984 286236 . - . transcript_id "LTnewLTref_230014700.1"; gene_id "LTnewLTref_230014700:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 289141 291183 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014800.1"; gene_id "LTnewLTref_230014800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 289141 291183 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014800.1"; gene_id "LTnewLTref_230014800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 296522 297475 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230014900.1"; gene_id "LTnewLTref_230014900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 296522 297475 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230014900.1"; gene_id "LTnewLTref_230014900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 304355 308419 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015000.1"; gene_id "LTnewLTref_230015000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 304355 308419 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015000.1"; gene_id "LTnewLTref_230015000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 311434 313061 0.55 - . transcript_id "LTnewLTref_230015100.1"; gene_id "LTnewLTref_230015100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 311434 312557 0.55 - 2 transcript_id "LTnewLTref_230015100.1"; gene_id "LTnewLTref_230015100"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 312620 313061 0.93 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015100.1"; gene_id "LTnewLTref_230015100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 314554 315207 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015200.1"; gene_id "LTnewLTref_230015200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 314554 315207 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015200.1"; gene_id "LTnewLTref_230015200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 317222 319879 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015300.1"; gene_id "LTnewLTref_230015300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 317222 319879 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015300.1"; gene_id "LTnewLTref_230015300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 321502 322626 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015400.1"; gene_id "LTnewLTref_230015400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 321502 322626 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015400.1"; gene_id "LTnewLTref_230015400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 324822 326876 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015500.1"; gene_id "LTnewLTref_230015500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 324822 326876 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015500.1"; gene_id "LTnewLTref_230015500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 330495 331820 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015600.1"; gene_id "LTnewLTref_230015600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 330495 331820 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015600.1"; gene_id "LTnewLTref_230015600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 333143 333484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015700.1"; gene_id "LTnewLTref_230015700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 333143 333484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015700.1"; gene_id "LTnewLTref_230015700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 337630 339719 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_230015800.1"; gene_id "LTnewLTref_230015800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 337630 339290 0.48 - 2 transcript_id "LTnewLTref_230015800.1"; gene_id "LTnewLTref_230015800"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 339335 339719 0.48 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015800.1"; gene_id "LTnewLTref_230015800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 347742 349556 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230015900.1"; gene_id "LTnewLTref_230015900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 347742 349556 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230015900.1"; gene_id "LTnewLTref_230015900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 363012 364811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016000.1"; gene_id "LTnewLTref_230016000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 363012 364811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016000.1"; gene_id "LTnewLTref_230016000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 369665 371239 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016100.1"; gene_id "LTnewLTref_230016100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 369665 371239 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016100.1"; gene_id "LTnewLTref_230016100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 374229 376679 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016200.1"; gene_id "LTnewLTref_230016200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 374229 376679 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016200.1"; gene_id "LTnewLTref_230016200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 379205 380251 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016300.1"; gene_id "LTnewLTref_230016300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 379205 380251 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016300.1"; gene_id "LTnewLTref_230016300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 381354 381728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016400.1"; gene_id "LTnewLTref_230016400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 381354 381728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016400.1"; gene_id "LTnewLTref_230016400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 382708 386934 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016500.1"; gene_id "LTnewLTref_230016500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 382708 386934 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016500.1"; gene_id "LTnewLTref_230016500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 391939 394734 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016600.1"; gene_id "LTnewLTref_230016600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 391939 394734 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016600.1"; gene_id "LTnewLTref_230016600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 396480 399050 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016700.1"; gene_id "LTnewLTref_230016700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 396480 399050 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016700.1"; gene_id "LTnewLTref_230016700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 399735 400865 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230016800.1"; gene_id "LTnewLTref_230016800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 399735 400865 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016800.1"; gene_id "LTnewLTref_230016800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 401348 401859 0.73 - . transcript_id "LTnewLTref_230016900.1"; gene_id "LTnewLTref_230016900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 401348 401654 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_230016900.1"; gene_id "LTnewLTref_230016900"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 401702 401859 0.73 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230016900.1"; gene_id "LTnewLTref_230016900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 402295 403854 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017000.1"; gene_id "LTnewLTref_230017000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 402295 403854 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017000.1"; gene_id "LTnewLTref_230017000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 404777 406144 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017100.1"; gene_id "LTnewLTref_230017100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 404777 406144 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017100.1"; gene_id "LTnewLTref_230017100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 407849 412351 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017200.1"; gene_id "LTnewLTref_230017200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 407849 412351 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017200.1"; gene_id "LTnewLTref_230017200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 414989 416248 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017300.1"; gene_id "LTnewLTref_230017300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 414989 416248 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017300.1"; gene_id "LTnewLTref_230017300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 423478 423762 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017400.1"; gene_id "LTnewLTref_230017400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 423478 423762 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017400.1"; gene_id "LTnewLTref_230017400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 423898 425481 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017500.1"; gene_id "LTnewLTref_230017500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 423898 425481 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017500.1"; gene_id "LTnewLTref_230017500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 426462 426776 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_230017600.1"; gene_id "LTnewLTref_230017600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 426462 426776 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017600.1"; gene_id "LTnewLTref_230017600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 426462 426923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017600.2"; gene_id "LTnewLTref_230017600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 426462 426923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017600.2"; gene_id "LTnewLTref_230017600"; CM024309.1 . transcript 427297 429359 . - . transcript_id "LTnewLTref_230017700.1"; gene_id "LTnewLTref_230017700:pseudogene" CM024309.1 . exon 427297 429359 . - . transcript_id "LTnewLTref_230017700.1"; gene_id "LTnewLTref_230017700:pseudogene"; CM024309.1 Liftoff transcript 430667 433462 . - . transcript_id "LTnewLTref_230017800.1"; gene_id "LTnewLTref_230017800" CM024309.1 Liftoff CDS 430667 433462 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017800.1"; gene_id "LTnewLTref_230017800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 434129 435151 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230017900.1"; gene_id "LTnewLTref_230017900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 434129 435151 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230017900.1"; gene_id "LTnewLTref_230017900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 437429 439087 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018000.1"; gene_id "LTnewLTref_230018000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 437429 439087 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018000.1"; gene_id "LTnewLTref_230018000"; CM024309.1 . transcript 438734 439075 . + . transcript_id "LTnewLTref_230018100.1"; gene_id "LTnewLTref_230018100:pseudogene" CM024309.1 . exon 438734 439075 . + . transcript_id "LTnewLTref_230018100.1"; gene_id "LTnewLTref_230018100:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 442343 443968 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018200.1"; gene_id "LTnewLTref_230018200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 442343 443968 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018200.1"; gene_id "LTnewLTref_230018200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 444760 445389 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018300.1"; gene_id "LTnewLTref_230018300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 444760 445389 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018300.1"; gene_id "LTnewLTref_230018300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 446285 450747 0.27 - . transcript_id "LTnewLTref_230018400.1"; gene_id "LTnewLTref_230018400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 446285 446491 0.57 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018400.1"; gene_id "LTnewLTref_230018400"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 446587 450747 0.27 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018400.1"; gene_id "LTnewLTref_230018400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 446285 454449 0.42 - . transcript_id "LTnewLTref_230018400.2"; gene_id "LTnewLTref_230018400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 446285 446491 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018400.2"; gene_id "LTnewLTref_230018400"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 446587 454449 0.42 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018400.2"; gene_id "LTnewLTref_230018400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 448373 454449 0.52 - . transcript_id "LTnewLTref_230018400.3"; gene_id "LTnewLTref_230018400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 448373 448425 0.52 - 2 transcript_id "LTnewLTref_230018400.3"; gene_id "LTnewLTref_230018400"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 448488 454449 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018400.3"; gene_id "LTnewLTref_230018400"; CM024309.1 . transcript 455297 460013 . - . transcript_id "LTnewLTref_230018500.1"; gene_id "LTnewLTref_230018500:pseudogene" CM024309.1 . exon 455297 460013 . - . transcript_id "LTnewLTref_230018500.1"; gene_id "LTnewLTref_230018500:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 460907 461380 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018600.1"; gene_id "LTnewLTref_230018600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 460907 461380 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018600.1"; gene_id "LTnewLTref_230018600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 462185 463882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018700.1"; gene_id "LTnewLTref_230018700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 462185 463882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018700.1"; gene_id "LTnewLTref_230018700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 465378 467453 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018800.1"; gene_id "LTnewLTref_230018800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 465378 467453 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018800.1"; gene_id "LTnewLTref_230018800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 469419 470590 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230018900.1"; gene_id "LTnewLTref_230018900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 469419 469879 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_230018900.1"; gene_id "LTnewLTref_230018900"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 469933 470590 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230018900.1"; gene_id "LTnewLTref_230018900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 473003 473923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019000.1"; gene_id "LTnewLTref_230019000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 473003 473923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019000.1"; gene_id "LTnewLTref_230019000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 475701 477950 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_230019100.1"; gene_id "LTnewLTref_230019100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 475701 477950 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019100.1"; gene_id "LTnewLTref_230019100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 480405 481103 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019200.1"; gene_id "LTnewLTref_230019200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 480405 481103 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019200.1"; gene_id "LTnewLTref_230019200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 484379 487699 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019300.1"; gene_id "LTnewLTref_230019300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 484379 487699 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019300.1"; gene_id "LTnewLTref_230019300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 493456 493881 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019400.1"; gene_id "LTnewLTref_230019400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 493456 493881 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019400.1"; gene_id "LTnewLTref_230019400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 496600 496821 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019500.1"; gene_id "LTnewLTref_230019500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 496600 496821 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019500.1"; gene_id "LTnewLTref_230019500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 500228 502720 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_230019600.1"; gene_id "LTnewLTref_230019600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 500228 500508 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_230019600.1"; gene_id "LTnewLTref_230019600"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 502558 502720 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019600.1"; gene_id "LTnewLTref_230019600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 506197 507870 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019700.1"; gene_id "LTnewLTref_230019700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 506197 507870 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019700.1"; gene_id "LTnewLTref_230019700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 509191 511269 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019800.1"; gene_id "LTnewLTref_230019800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 509191 511269 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019800.1"; gene_id "LTnewLTref_230019800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 511931 513280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230019900.1"; gene_id "LTnewLTref_230019900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 511931 513280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230019900.1"; gene_id "LTnewLTref_230019900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 514000 515262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020000.1"; gene_id "LTnewLTref_230020000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 514000 515262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020000.1"; gene_id "LTnewLTref_230020000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 515842 517203 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020100.1"; gene_id "LTnewLTref_230020100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 515842 517203 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020100.1"; gene_id "LTnewLTref_230020100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 518097 520115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020200.1"; gene_id "LTnewLTref_230020200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 518097 520115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020200.1"; gene_id "LTnewLTref_230020200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 521576 523039 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020300.1"; gene_id "LTnewLTref_230020300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 521576 523039 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020300.1"; gene_id "LTnewLTref_230020300"; CM024309.1 . transcript 524758 524982 . - . transcript_id "LTnewLTref_230020400.1"; gene_id "LTnewLTref_230020400:pseudogene" CM024309.1 . exon 524758 524982 . - . transcript_id "LTnewLTref_230020400.1"; gene_id "LTnewLTref_230020400:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 525399 525827 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020500.1"; gene_id "LTnewLTref_230020500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 525399 525827 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020500.1"; gene_id "LTnewLTref_230020500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 525399 526066 0.62 - . transcript_id "LTnewLTref_230020500.2"; gene_id "LTnewLTref_230020500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 525399 525995 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020500.2"; gene_id "LTnewLTref_230020500"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 526058 526066 0.64 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020500.2"; gene_id "LTnewLTref_230020500"; CM024309.1 Liftoff transcript 528564 530936 . - . transcript_id "LTnewLTref_230020600.1"; gene_id "LTnewLTref_230020600" CM024309.1 Liftoff CDS 528564 530936 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020600.1"; gene_id "LTnewLTref_230020600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 532546 534522 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020700.1"; gene_id "LTnewLTref_230020700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 532546 534522 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020700.1"; gene_id "LTnewLTref_230020700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 536376 537707 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020800.1"; gene_id "LTnewLTref_230020800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 536376 537707 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020800.1"; gene_id "LTnewLTref_230020800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 539347 543396 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230020900.1"; gene_id "LTnewLTref_230020900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 539347 543396 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230020900.1"; gene_id "LTnewLTref_230020900"; CM024309.1 Liftoff transcript 544738 544923 . - . transcript_id "LTnewLTref_230021000.1"; gene_id "LTnewLTref_230021000" CM024309.1 Liftoff CDS 544738 544923 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_230021000.1"; gene_id "LTnewLTref_230021000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 545770 547650 1 - . transcript_id "LTnewLTref_230021100.1"; gene_id "LTnewLTref_230021100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 545770 547650 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_230021100.1"; gene_id "LTnewLTref_230021100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 554844 555215 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021200.1"; gene_id "LTnewLTref_230021200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 554844 555215 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021200.1"; gene_id "LTnewLTref_230021200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 555499 557031 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021300.1"; gene_id "LTnewLTref_230021300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 555499 557031 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021300.1"; gene_id "LTnewLTref_230021300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 558245 559300 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021400.1"; gene_id "LTnewLTref_230021400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 558245 559300 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021400.1"; gene_id "LTnewLTref_230021400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 559704 560069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021500.1"; gene_id "LTnewLTref_230021500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 559704 560069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021500.1"; gene_id "LTnewLTref_230021500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 560695 562287 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021600.1"; gene_id "LTnewLTref_230021600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 560695 562287 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021600.1"; gene_id "LTnewLTref_230021600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 564175 565644 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021700.1"; gene_id "LTnewLTref_230021700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 564175 565644 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021700.1"; gene_id "LTnewLTref_230021700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 566636 567598 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021800.1"; gene_id "LTnewLTref_230021800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 566636 567598 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021800.1"; gene_id "LTnewLTref_230021800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 568995 570650 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230021900.1"; gene_id "LTnewLTref_230021900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 568995 570650 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230021900.1"; gene_id "LTnewLTref_230021900"; CM024309.1 . transcript 572545 573139 . + . transcript_id "LTnewLTref_230022000.1"; gene_id "LTnewLTref_230022000:pseudogene" CM024309.1 . exon 572545 573139 . + . transcript_id "LTnewLTref_230022000.1"; gene_id "LTnewLTref_230022000:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 574034 576458 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_230022100.1"; gene_id "LTnewLTref_230022100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 574034 575790 0.5 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022100.1"; gene_id "LTnewLTref_230022100"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 575852 576458 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_230022100.1"; gene_id "LTnewLTref_230022100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 577804 581889 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230022200.1"; gene_id "LTnewLTref_230022200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 577804 581889 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022200.1"; gene_id "LTnewLTref_230022200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 582644 583672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230022300.1"; gene_id "LTnewLTref_230022300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 582644 583672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022300.1"; gene_id "LTnewLTref_230022300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 585196 589773 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230022400.1"; gene_id "LTnewLTref_230022400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 585196 589773 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022400.1"; gene_id "LTnewLTref_230022400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 590594 591403 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230022500.1"; gene_id "LTnewLTref_230022500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 590594 591403 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022500.1"; gene_id "LTnewLTref_230022500"; CM024309.1 . transcript 592373 593523 . + . transcript_id "LTnewLTref_230022600.1"; gene_id "LTnewLTref_230022600:pseudogene" CM024309.1 . exon 592373 593523 . + . transcript_id "LTnewLTref_230022600.1"; gene_id "LTnewLTref_230022600:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 594685 595776 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_230022700.1"; gene_id "LTnewLTref_230022700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 594685 595590 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022700.1"; gene_id "LTnewLTref_230022700"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 595711 595776 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022700.1"; gene_id "LTnewLTref_230022700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 597943 600990 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230022800.1"; gene_id "LTnewLTref_230022800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 597943 600990 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022800.1"; gene_id "LTnewLTref_230022800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 603688 607593 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230022900.1"; gene_id "LTnewLTref_230022900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 603688 607593 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230022900.1"; gene_id "LTnewLTref_230022900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 611350 613419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023000.1"; gene_id "LTnewLTref_230023000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 611350 613419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023000.1"; gene_id "LTnewLTref_230023000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 615748 616656 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023100.1"; gene_id "LTnewLTref_230023100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 615748 616656 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023100.1"; gene_id "LTnewLTref_230023100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 619741 634016 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_230023200.1"; gene_id "LTnewLTref_230023200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 619741 628857 0.82 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023200.1"; gene_id "LTnewLTref_230023200"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 628917 634016 0.43 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023200.1"; gene_id "LTnewLTref_230023200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 635470 636039 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023300.1"; gene_id "LTnewLTref_230023300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 635470 636039 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023300.1"; gene_id "LTnewLTref_230023300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 637224 646463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023400.1"; gene_id "LTnewLTref_230023400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 637224 646463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023400.1"; gene_id "LTnewLTref_230023400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 647061 649397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023500.1"; gene_id "LTnewLTref_230023500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 647061 649397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023500.1"; gene_id "LTnewLTref_230023500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 650275 652404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023600.1"; gene_id "LTnewLTref_230023600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 650275 652404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023600.1"; gene_id "LTnewLTref_230023600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 653267 654547 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023700.1"; gene_id "LTnewLTref_230023700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 653267 654547 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023700.1"; gene_id "LTnewLTref_230023700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 654938 655252 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_230023800.1"; gene_id "LTnewLTref_230023800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 654938 655252 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023800.1"; gene_id "LTnewLTref_230023800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 657210 658409 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230023900.1"; gene_id "LTnewLTref_230023900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 657210 658409 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230023900.1"; gene_id "LTnewLTref_230023900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 661866 668600 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024000.1"; gene_id "LTnewLTref_230024000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 661866 668600 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024000.1"; gene_id "LTnewLTref_230024000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 669399 669896 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024100.1"; gene_id "LTnewLTref_230024100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 669399 669896 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024100.1"; gene_id "LTnewLTref_230024100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 670535 671176 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024200.1"; gene_id "LTnewLTref_230024200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 670535 671176 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024200.1"; gene_id "LTnewLTref_230024200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 674824 675567 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024300.1"; gene_id "LTnewLTref_230024300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 674824 675567 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024300.1"; gene_id "LTnewLTref_230024300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 677866 678831 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024400.1"; gene_id "LTnewLTref_230024400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 677866 678831 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024400.1"; gene_id "LTnewLTref_230024400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 679787 681262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024500.1"; gene_id "LTnewLTref_230024500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 679787 681262 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024500.1"; gene_id "LTnewLTref_230024500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 681740 682105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024600.1"; gene_id "LTnewLTref_230024600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 681740 682105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024600.1"; gene_id "LTnewLTref_230024600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 683389 685296 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024700.1"; gene_id "LTnewLTref_230024700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 683389 685296 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024700.1"; gene_id "LTnewLTref_230024700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 686914 692088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024800.1"; gene_id "LTnewLTref_230024800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 686914 692088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024800.1"; gene_id "LTnewLTref_230024800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 693678 694535 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230024900.1"; gene_id "LTnewLTref_230024900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 693678 694535 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230024900.1"; gene_id "LTnewLTref_230024900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 695644 696362 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_230025000.1"; gene_id "LTnewLTref_230025000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 695644 696069 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025000.1"; gene_id "LTnewLTref_230025000"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 696147 696362 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025000.1"; gene_id "LTnewLTref_230025000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 697115 699088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025100.1"; gene_id "LTnewLTref_230025100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 697115 699088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025100.1"; gene_id "LTnewLTref_230025100"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 699853 700245 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025200.1"; gene_id "LTnewLTref_230025200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 699853 700245 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025200.1"; gene_id "LTnewLTref_230025200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 700945 701361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025300.1"; gene_id "LTnewLTref_230025300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 700945 701361 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025300.1"; gene_id "LTnewLTref_230025300"; CM024309.1 . transcript 702751 703956 . + . transcript_id "LTnewLTref_230025400.1"; gene_id "LTnewLTref_230025400:pseudogene" CM024309.1 . exon 702751 703956 . + . transcript_id "LTnewLTref_230025400.1"; gene_id "LTnewLTref_230025400:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 704735 705487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025500.1"; gene_id "LTnewLTref_230025500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 704735 705487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025500.1"; gene_id "LTnewLTref_230025500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 706714 707562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025600.1"; gene_id "LTnewLTref_230025600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 706714 707562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025600.1"; gene_id "LTnewLTref_230025600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 708882 711440 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025700.1"; gene_id "LTnewLTref_230025700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 708882 711440 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025700.1"; gene_id "LTnewLTref_230025700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 712980 713837 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025800.1"; gene_id "LTnewLTref_230025800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 712980 713837 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025800.1"; gene_id "LTnewLTref_230025800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 716262 716876 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230025900.1"; gene_id "LTnewLTref_230025900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 716262 716876 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230025900.1"; gene_id "LTnewLTref_230025900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 722197 723669 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026000.1"; gene_id "LTnewLTref_230026000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 722197 723669 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026000.1"; gene_id "LTnewLTref_230026000"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 725601 726026 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026100.1"; gene_id "LTnewLTref_230026100" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 725601 726026 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026100.1"; gene_id "LTnewLTref_230026100"; CM024309.1 . transcript 727228 727684 . + . transcript_id "LTnewLTref_230026200.1"; gene_id "LTnewLTref_230026200:pseudogene" CM024309.1 . exon 727228 727684 . + . transcript_id "LTnewLTref_230026200.1"; gene_id "LTnewLTref_230026200:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 727768 729339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026300.1"; gene_id "LTnewLTref_230026300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 727768 729339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026300.1"; gene_id "LTnewLTref_230026300"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 730398 731060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026400.1"; gene_id "LTnewLTref_230026400" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 730398 731060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026400.1"; gene_id "LTnewLTref_230026400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 731773 732510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026500.1"; gene_id "LTnewLTref_230026500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 731773 732510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026500.1"; gene_id "LTnewLTref_230026500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 733971 734888 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026600.1"; gene_id "LTnewLTref_230026600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 733971 734888 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026600.1"; gene_id "LTnewLTref_230026600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 735703 736068 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026700.1"; gene_id "LTnewLTref_230026700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 735703 736068 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026700.1"; gene_id "LTnewLTref_230026700"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 737655 739061 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026800.1"; gene_id "LTnewLTref_230026800" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 737655 739061 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026800.1"; gene_id "LTnewLTref_230026800"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 740003 742330 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230026900.1"; gene_id "LTnewLTref_230026900" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 740003 742330 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230026900.1"; gene_id "LTnewLTref_230026900"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 743653 744954 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230027000.1"; gene_id "LTnewLTref_230027000" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 743653 744954 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027000.1"; gene_id "LTnewLTref_230027000"; CM024309.1 . transcript 747633 750173 . + . transcript_id "LTnewLTref_230027100.1"; gene_id "LTnewLTref_230027100:pseudogene" CM024309.1 . exon 747633 750173 . + . transcript_id "LTnewLTref_230027100.1"; gene_id "LTnewLTref_230027100:pseudogene"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 751122 754019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230027200.1"; gene_id "LTnewLTref_230027200" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 751122 754019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027200.1"; gene_id "LTnewLTref_230027200"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 754945 757329 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230027300.1"; gene_id "LTnewLTref_230027300" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 754945 757329 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027300.1"; gene_id "LTnewLTref_230027300"; CM024309.1 Liftoff transcript 759203 759391 . + . transcript_id "LTnewLTref_230027400.1"; gene_id "LTnewLTref_230027400" CM024309.1 Liftoff CDS 759203 759391 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027400.1"; gene_id "LTnewLTref_230027400"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 760353 760920 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_230027500.1"; gene_id "LTnewLTref_230027500" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 760353 760670 0.82 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027500.1"; gene_id "LTnewLTref_230027500"; CM024309.1 AUGUSTUS CDS 760717 760920 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027500.1"; gene_id "LTnewLTref_230027500"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 762013 764790 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230027600.1"; gene_id "LTnewLTref_230027600" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 762013 764790 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027600.1"; gene_id "LTnewLTref_230027600"; CM024309.1 AUGUSTUS transcript 766000 766467 1 + . transcript_id "LTnewLTref_230027700.1"; gene_id "LTnewLTref_230027700" CM024309.1 AUGUSTUS CDS 766000 766467 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_230027700.1"; gene_id "LTnewLTref_230027700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 217 316 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_240005000.1"; gene_id "LTnewLTref_240005000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 217 316 0.54 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240005000.1"; gene_id "LTnewLTref_240005000"; CM024310.1 Liftoff transcript 3292 3526 . - . transcript_id "LTnewLTref_240005100.1"; gene_id "LTnewLTref_240005100" CM024310.1 Liftoff CDS 3292 3526 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_240005100.1"; gene_id "LTnewLTref_240005100"; CM024310.1 . transcript 5498 5701 . + . transcript_id "LTnewLTref_240005200.1"; gene_id "LTnewLTref_240005200:pseudogene" CM024310.1 . exon 5498 5701 . + . transcript_id "LTnewLTref_240005200.1"; gene_id "LTnewLTref_240005200:pseudogene"; CM024310.1 . transcript 6339 7794 . + . transcript_id "LTnewLTref_240005300.1"; gene_id "LTnewLTref_240005300:pseudogene" CM024310.1 . exon 6339 7794 . + . transcript_id "LTnewLTref_240005300.1"; gene_id "LTnewLTref_240005300:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 8472 9923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240005400.1"; gene_id "LTnewLTref_240005400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 8472 9923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240005400.1"; gene_id "LTnewLTref_240005400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 10389 10889 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240005500.1"; gene_id "LTnewLTref_240005500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 10389 10889 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240005500.1"; gene_id "LTnewLTref_240005500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 11297 11797 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240005600.1"; gene_id "LTnewLTref_240005600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 11297 11797 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240005600.1"; gene_id "LTnewLTref_240005600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 12255 13655 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240005700.1"; gene_id "LTnewLTref_240005700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 12255 13655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240005700.1"; gene_id "LTnewLTref_240005700"; CM024310.1 . transcript 14265 15509 . + . transcript_id "LTnewLTref_240005800.1"; gene_id "LTnewLTref_240005800:pseudogene" CM024310.1 . exon 14265 15509 . + . transcript_id "LTnewLTref_240005800.1"; gene_id "LTnewLTref_240005800:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 16398 17717 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240005900.1"; gene_id "LTnewLTref_240005900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 16398 17717 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240005900.1"; gene_id "LTnewLTref_240005900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 18520 19956 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006000.1"; gene_id "LTnewLTref_240006000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 18520 19956 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006000.1"; gene_id "LTnewLTref_240006000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 20505 21191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006100.1"; gene_id "LTnewLTref_240006100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 20505 21191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006100.1"; gene_id "LTnewLTref_240006100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 22035 22874 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006200.1"; gene_id "LTnewLTref_240006200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 22035 22874 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006200.1"; gene_id "LTnewLTref_240006200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 23798 25114 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006300.1"; gene_id "LTnewLTref_240006300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 23798 25114 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006300.1"; gene_id "LTnewLTref_240006300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 25925 27592 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006400.1"; gene_id "LTnewLTref_240006400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 25925 27592 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006400.1"; gene_id "LTnewLTref_240006400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 29511 30695 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006500.1"; gene_id "LTnewLTref_240006500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 29511 30695 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006500.1"; gene_id "LTnewLTref_240006500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 31602 32264 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006600.1"; gene_id "LTnewLTref_240006600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 31602 32264 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006600.1"; gene_id "LTnewLTref_240006600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 34010 34879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006700.1"; gene_id "LTnewLTref_240006700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 34010 34879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006700.1"; gene_id "LTnewLTref_240006700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 35789 36511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006800.1"; gene_id "LTnewLTref_240006800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 35789 36511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006800.1"; gene_id "LTnewLTref_240006800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 37337 38944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240006900.1"; gene_id "LTnewLTref_240006900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 37337 38944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240006900.1"; gene_id "LTnewLTref_240006900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 40022 42463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007000.1"; gene_id "LTnewLTref_240007000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 40022 42463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007000.1"; gene_id "LTnewLTref_240007000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 45477 46184 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007100.1"; gene_id "LTnewLTref_240007100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 45477 46184 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007100.1"; gene_id "LTnewLTref_240007100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 47209 48210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007200.1"; gene_id "LTnewLTref_240007200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 47209 48210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007200.1"; gene_id "LTnewLTref_240007200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 49197 50219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007300.1"; gene_id "LTnewLTref_240007300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 49197 50219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007300.1"; gene_id "LTnewLTref_240007300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 52352 53983 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007400.1"; gene_id "LTnewLTref_240007400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 52352 53983 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007400.1"; gene_id "LTnewLTref_240007400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 55008 56411 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007500.1"; gene_id "LTnewLTref_240007500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 55008 56411 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007500.1"; gene_id "LTnewLTref_240007500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 57390 59207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007600.1"; gene_id "LTnewLTref_240007600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 57390 59207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007600.1"; gene_id "LTnewLTref_240007600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 60278 69793 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007700.1"; gene_id "LTnewLTref_240007700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 60278 69793 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007700.1"; gene_id "LTnewLTref_240007700"; CM024310.1 Liftoff transcript 70687 74910 . + . transcript_id "LTnewLTref_240007800.1"; gene_id "LTnewLTref_240007800" CM024310.1 Liftoff CDS 70687 74910 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007800.1"; gene_id "LTnewLTref_240007800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 75755 77815 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240007900.1"; gene_id "LTnewLTref_240007900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 75755 77815 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240007900.1"; gene_id "LTnewLTref_240007900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 82036 83193 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008000.1"; gene_id "LTnewLTref_240008000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 82036 83193 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008000.1"; gene_id "LTnewLTref_240008000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 85412 90796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008100.1"; gene_id "LTnewLTref_240008100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 85412 90796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008100.1"; gene_id "LTnewLTref_240008100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 91781 92740 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008200.1"; gene_id "LTnewLTref_240008200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 91781 92740 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008200.1"; gene_id "LTnewLTref_240008200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 95373 97022 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008300.1"; gene_id "LTnewLTref_240008300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 95373 97022 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008300.1"; gene_id "LTnewLTref_240008300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 99295 102420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008400.1"; gene_id "LTnewLTref_240008400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 99295 102420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008400.1"; gene_id "LTnewLTref_240008400"; CM024310.1 . transcript 103322 106295 . + . transcript_id "LTnewLTref_240008500.1"; gene_id "LTnewLTref_240008500:pseudogene" CM024310.1 . exon 103322 106295 . + . transcript_id "LTnewLTref_240008500.1"; gene_id "LTnewLTref_240008500:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 107194 107985 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008600.1"; gene_id "LTnewLTref_240008600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 107194 107985 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008600.1"; gene_id "LTnewLTref_240008600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 110265 110666 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_240008700.1"; gene_id "LTnewLTref_240008700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 110265 110666 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008700.1"; gene_id "LTnewLTref_240008700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 111223 112632 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240008800.1"; gene_id "LTnewLTref_240008800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 111223 112632 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008800.1"; gene_id "LTnewLTref_240008800"; CM024310.1 Liftoff transcript 115359 115718 . + . transcript_id "LTnewLTref_240008900.1"; gene_id "LTnewLTref_240008900" CM024310.1 Liftoff CDS 115359 115718 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_240008900.1"; gene_id "LTnewLTref_240008900"; CM024310.1 . transcript 115819 116288 . + . transcript_id "LTnewLTref_240009000.1"; gene_id "LTnewLTref_240009000:pseudogene" CM024310.1 . exon 115819 116288 . + . transcript_id "LTnewLTref_240009000.1"; gene_id "LTnewLTref_240009000:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 116364 116711 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_240009100.1"; gene_id "LTnewLTref_240009100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 116364 116462 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009100.1"; gene_id "LTnewLTref_240009100"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 116511 116711 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009100.1"; gene_id "LTnewLTref_240009100"; CM024310.1 . transcript 117643 118505 . + . transcript_id "LTnewLTref_240009200.1"; gene_id "LTnewLTref_240009200:pseudogene" CM024310.1 . exon 117643 118505 . + . transcript_id "LTnewLTref_240009200.1"; gene_id "LTnewLTref_240009200:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 118812 120167 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240009300.1"; gene_id "LTnewLTref_240009300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 118812 120167 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009300.1"; gene_id "LTnewLTref_240009300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 125153 126448 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240009400.1"; gene_id "LTnewLTref_240009400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 125153 126448 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009400.1"; gene_id "LTnewLTref_240009400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 128691 131768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240009500.1"; gene_id "LTnewLTref_240009500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 128691 131768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009500.1"; gene_id "LTnewLTref_240009500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 134159 136027 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240009600.1"; gene_id "LTnewLTref_240009600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 134159 136027 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009600.1"; gene_id "LTnewLTref_240009600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 137342 139333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240009700.1"; gene_id "LTnewLTref_240009700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 137342 139333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009700.1"; gene_id "LTnewLTref_240009700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 141587 143859 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_240009800.1"; gene_id "LTnewLTref_240009800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 141587 143629 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009800.1"; gene_id "LTnewLTref_240009800"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 143680 143859 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009800.1"; gene_id "LTnewLTref_240009800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 144849 145772 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240009900.1"; gene_id "LTnewLTref_240009900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 144849 145772 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240009900.1"; gene_id "LTnewLTref_240009900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 147030 151013 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_240010000.1"; gene_id "LTnewLTref_240010000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 147030 151013 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010000.1"; gene_id "LTnewLTref_240010000"; CM024310.1 . transcript 151415 152137 . + . transcript_id "LTnewLTref_240010100.1"; gene_id "LTnewLTref_240010100:pseudogene" CM024310.1 . exon 151415 152137 . + . transcript_id "LTnewLTref_240010100.1"; gene_id "LTnewLTref_240010100:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 153186 157310 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010200.1"; gene_id "LTnewLTref_240010200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 153186 157310 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010200.1"; gene_id "LTnewLTref_240010200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 160518 164639 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010300.1"; gene_id "LTnewLTref_240010300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 160518 164639 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010300.1"; gene_id "LTnewLTref_240010300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 166487 166764 0.41 + . transcript_id "LTnewLTref_240010400.1"; gene_id "LTnewLTref_240010400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 166487 166491 0.42 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010400.1"; gene_id "LTnewLTref_240010400"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 166548 166764 0.41 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240010400.1"; gene_id "LTnewLTref_240010400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 168068 168898 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010500.1"; gene_id "LTnewLTref_240010500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 168068 168898 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010500.1"; gene_id "LTnewLTref_240010500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 169633 170898 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010600.1"; gene_id "LTnewLTref_240010600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 169633 170898 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010600.1"; gene_id "LTnewLTref_240010600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 175838 179428 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010700.1"; gene_id "LTnewLTref_240010700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 175838 179428 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010700.1"; gene_id "LTnewLTref_240010700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 180950 186310 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010800.1"; gene_id "LTnewLTref_240010800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 180950 186310 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010800.1"; gene_id "LTnewLTref_240010800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 187338 188054 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240010900.1"; gene_id "LTnewLTref_240010900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 187338 188054 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240010900.1"; gene_id "LTnewLTref_240010900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 188740 191073 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011000.1"; gene_id "LTnewLTref_240011000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 188740 191073 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011000.1"; gene_id "LTnewLTref_240011000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 192530 194914 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011100.1"; gene_id "LTnewLTref_240011100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 192530 194914 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011100.1"; gene_id "LTnewLTref_240011100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 196937 197620 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011200.1"; gene_id "LTnewLTref_240011200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 196937 197620 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011200.1"; gene_id "LTnewLTref_240011200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 198690 200378 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011300.1"; gene_id "LTnewLTref_240011300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 198690 200378 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011300.1"; gene_id "LTnewLTref_240011300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 201501 203039 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011400.1"; gene_id "LTnewLTref_240011400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 201501 203039 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011400.1"; gene_id "LTnewLTref_240011400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 203917 204309 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011500.1"; gene_id "LTnewLTref_240011500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 203917 204309 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011500.1"; gene_id "LTnewLTref_240011500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 204922 205200 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011600.1"; gene_id "LTnewLTref_240011600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 204922 205200 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011600.1"; gene_id "LTnewLTref_240011600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 206414 207502 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011700.1"; gene_id "LTnewLTref_240011700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 206414 207502 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011700.1"; gene_id "LTnewLTref_240011700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 208414 210477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240011800.1"; gene_id "LTnewLTref_240011800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 208414 210477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240011800.1"; gene_id "LTnewLTref_240011800"; CM024310.1 . transcript 210594 210921 . + . transcript_id "LTnewLTref_240011900.1"; gene_id "LTnewLTref_240011900:pseudogene" CM024310.1 . exon 210594 210921 . + . transcript_id "LTnewLTref_240011900.1"; gene_id "LTnewLTref_240011900:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 213156 213653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012000.1"; gene_id "LTnewLTref_240012000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 213156 213653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012000.1"; gene_id "LTnewLTref_240012000"; CM024310.1 Aragorn_1.2.36 transcript 213682 213753 . + . transcript_id "LTnewLTref_240012100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240012100" CM024310.1 Aragorn_1.2.36 exon 213682 213753 . + . transcript_id "LTnewLTref_240012100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240012100"; CM024310.1 . transcript 214468 219828 . + . transcript_id "LTnewLTref_240012200.1"; gene_id "LTnewLTref_240012200:pseudogene" CM024310.1 . exon 214468 219828 . + . transcript_id "LTnewLTref_240012200.1"; gene_id "LTnewLTref_240012200:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 221187 224495 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012300.1"; gene_id "LTnewLTref_240012300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 221187 224495 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012300.1"; gene_id "LTnewLTref_240012300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 225333 227765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012400.1"; gene_id "LTnewLTref_240012400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 225333 227765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012400.1"; gene_id "LTnewLTref_240012400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 229027 229347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012500.1"; gene_id "LTnewLTref_240012500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 229027 229347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012500.1"; gene_id "LTnewLTref_240012500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 231274 233007 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012600.1"; gene_id "LTnewLTref_240012600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 231274 233007 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012600.1"; gene_id "LTnewLTref_240012600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 235213 238197 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012700.1"; gene_id "LTnewLTref_240012700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 235213 238197 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012700.1"; gene_id "LTnewLTref_240012700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 239251 241539 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012800.1"; gene_id "LTnewLTref_240012800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 239251 241539 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012800.1"; gene_id "LTnewLTref_240012800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 241986 245939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240012900.1"; gene_id "LTnewLTref_240012900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 241986 245939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240012900.1"; gene_id "LTnewLTref_240012900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 248254 249897 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013000.1"; gene_id "LTnewLTref_240013000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 248254 249897 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013000.1"; gene_id "LTnewLTref_240013000"; CM024310.1 . transcript 253759 254283 . + . transcript_id "LTnewLTref_240013100.1"; gene_id "LTnewLTref_240013100:pseudogene" CM024310.1 . exon 253759 254283 . + . transcript_id "LTnewLTref_240013100.1"; gene_id "LTnewLTref_240013100:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 254958 257927 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013200.1"; gene_id "LTnewLTref_240013200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 254958 257927 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013200.1"; gene_id "LTnewLTref_240013200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 258970 260286 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013300.1"; gene_id "LTnewLTref_240013300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 258970 260286 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013300.1"; gene_id "LTnewLTref_240013300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 260907 261164 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013400.1"; gene_id "LTnewLTref_240013400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 260907 261164 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013400.1"; gene_id "LTnewLTref_240013400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 262179 263738 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013500.1"; gene_id "LTnewLTref_240013500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 262179 263738 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013500.1"; gene_id "LTnewLTref_240013500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 265393 268575 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013600.1"; gene_id "LTnewLTref_240013600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 265393 268575 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013600.1"; gene_id "LTnewLTref_240013600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 269878 270855 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013700.1"; gene_id "LTnewLTref_240013700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 269878 270855 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013700.1"; gene_id "LTnewLTref_240013700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 273096 276476 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013800.1"; gene_id "LTnewLTref_240013800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 273096 276476 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013800.1"; gene_id "LTnewLTref_240013800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 277617 279332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240013900.1"; gene_id "LTnewLTref_240013900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 277617 279332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240013900.1"; gene_id "LTnewLTref_240013900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 283064 284785 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014000.1"; gene_id "LTnewLTref_240014000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 283064 284785 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014000.1"; gene_id "LTnewLTref_240014000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 287296 288225 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014100.1"; gene_id "LTnewLTref_240014100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 287296 288225 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014100.1"; gene_id "LTnewLTref_240014100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 288746 290494 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014200.1"; gene_id "LTnewLTref_240014200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 288746 290494 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014200.1"; gene_id "LTnewLTref_240014200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 291265 293064 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014300.1"; gene_id "LTnewLTref_240014300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 291265 293064 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014300.1"; gene_id "LTnewLTref_240014300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 293842 295617 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014400.1"; gene_id "LTnewLTref_240014400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 293842 295617 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014400.1"; gene_id "LTnewLTref_240014400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 296828 305041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014500.1"; gene_id "LTnewLTref_240014500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 296828 305041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014500.1"; gene_id "LTnewLTref_240014500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 306359 308794 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014600.1"; gene_id "LTnewLTref_240014600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 306359 308794 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014600.1"; gene_id "LTnewLTref_240014600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 310176 310889 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014700.1"; gene_id "LTnewLTref_240014700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 310176 310889 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014700.1"; gene_id "LTnewLTref_240014700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 312020 312775 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014800.1"; gene_id "LTnewLTref_240014800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 312020 312775 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014800.1"; gene_id "LTnewLTref_240014800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 314120 315154 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240014900.1"; gene_id "LTnewLTref_240014900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 314120 315154 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240014900.1"; gene_id "LTnewLTref_240014900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 315796 316479 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015000.1"; gene_id "LTnewLTref_240015000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 315796 316479 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015000.1"; gene_id "LTnewLTref_240015000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 317662 318015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015100.1"; gene_id "LTnewLTref_240015100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 317662 318015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015100.1"; gene_id "LTnewLTref_240015100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 319801 323316 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015200.1"; gene_id "LTnewLTref_240015200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 319801 323316 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015200.1"; gene_id "LTnewLTref_240015200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 324199 327750 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015300.1"; gene_id "LTnewLTref_240015300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 324199 327750 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015300.1"; gene_id "LTnewLTref_240015300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 328863 331268 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015400.1"; gene_id "LTnewLTref_240015400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 328863 331268 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015400.1"; gene_id "LTnewLTref_240015400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 331776 333176 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015500.1"; gene_id "LTnewLTref_240015500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 331776 333176 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015500.1"; gene_id "LTnewLTref_240015500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 333774 336599 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015600.1"; gene_id "LTnewLTref_240015600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 333774 336599 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015600.1"; gene_id "LTnewLTref_240015600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 337393 337740 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015700.1"; gene_id "LTnewLTref_240015700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 337393 337740 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015700.1"; gene_id "LTnewLTref_240015700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 338675 339961 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015800.1"; gene_id "LTnewLTref_240015800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 338675 339961 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015800.1"; gene_id "LTnewLTref_240015800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 341103 344066 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240015900.1"; gene_id "LTnewLTref_240015900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 341103 344066 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240015900.1"; gene_id "LTnewLTref_240015900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 344629 346923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240016000.1"; gene_id "LTnewLTref_240016000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 344629 346923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016000.1"; gene_id "LTnewLTref_240016000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 348274 348695 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_240016100.1"; gene_id "LTnewLTref_240016100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 348274 348599 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016100.1"; gene_id "LTnewLTref_240016100"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 348659 348695 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240016100.1"; gene_id "LTnewLTref_240016100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 348274 352942 0.41 + . transcript_id "LTnewLTref_240016100.2"; gene_id "LTnewLTref_240016100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 348274 350258 0.41 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016100.2"; gene_id "LTnewLTref_240016100"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 350302 352942 0.83 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240016100.2"; gene_id "LTnewLTref_240016100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 353580 355559 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240016200.1"; gene_id "LTnewLTref_240016200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 353580 355559 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016200.1"; gene_id "LTnewLTref_240016200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 356453 358096 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240016300.1"; gene_id "LTnewLTref_240016300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 356453 358096 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016300.1"; gene_id "LTnewLTref_240016300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 359049 360332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240016400.1"; gene_id "LTnewLTref_240016400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 359049 360332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016400.1"; gene_id "LTnewLTref_240016400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 361397 364429 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240016500.1"; gene_id "LTnewLTref_240016500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 361397 364429 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016500.1"; gene_id "LTnewLTref_240016500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 365062 365694 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240016600.1"; gene_id "LTnewLTref_240016600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 365062 365694 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016600.1"; gene_id "LTnewLTref_240016600"; CM024310.1 Liftoff transcript 366606 369365 . + . transcript_id "LTnewLTref_240016700.1"; gene_id "LTnewLTref_240016700" CM024310.1 Liftoff CDS 366606 369365 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016700.1"; gene_id "LTnewLTref_240016700"; CM024310.1 Liftoff transcript 370375 374304 . + . transcript_id "LTnewLTref_240016800.1"; gene_id "LTnewLTref_240016800" CM024310.1 Liftoff CDS 370375 374304 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016800.1"; gene_id "LTnewLTref_240016800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 375035 376561 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_240016900.1"; gene_id "LTnewLTref_240016900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 375035 376561 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240016900.1"; gene_id "LTnewLTref_240016900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 377615 385255 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017000.1"; gene_id "LTnewLTref_240017000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 377615 382405 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017000.1"; gene_id "LTnewLTref_240017000"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 382499 385255 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017000.1"; gene_id "LTnewLTref_240017000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 386338 387645 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017100.1"; gene_id "LTnewLTref_240017100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 386338 387645 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017100.1"; gene_id "LTnewLTref_240017100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 389212 390765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017200.1"; gene_id "LTnewLTref_240017200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 389212 390765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017200.1"; gene_id "LTnewLTref_240017200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 392166 395426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017300.1"; gene_id "LTnewLTref_240017300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 392166 395426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017300.1"; gene_id "LTnewLTref_240017300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 396909 400460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017400.1"; gene_id "LTnewLTref_240017400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 396909 400460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017400.1"; gene_id "LTnewLTref_240017400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 400922 401632 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017500.1"; gene_id "LTnewLTref_240017500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 400922 401632 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017500.1"; gene_id "LTnewLTref_240017500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 403068 403832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017600.1"; gene_id "LTnewLTref_240017600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 403068 403832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017600.1"; gene_id "LTnewLTref_240017600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 404596 407358 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017700.1"; gene_id "LTnewLTref_240017700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 404596 407358 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017700.1"; gene_id "LTnewLTref_240017700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 409009 411417 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017800.1"; gene_id "LTnewLTref_240017800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 409009 411417 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017800.1"; gene_id "LTnewLTref_240017800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 412310 415753 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240017900.1"; gene_id "LTnewLTref_240017900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 412310 415753 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240017900.1"; gene_id "LTnewLTref_240017900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 416648 417709 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_240018000.1"; gene_id "LTnewLTref_240018000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 416648 417709 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018000.1"; gene_id "LTnewLTref_240018000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 418542 423074 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018100.1"; gene_id "LTnewLTref_240018100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 418542 423074 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018100.1"; gene_id "LTnewLTref_240018100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 424175 427276 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018200.1"; gene_id "LTnewLTref_240018200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 424175 425924 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018200.1"; gene_id "LTnewLTref_240018200"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 426009 427276 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_240018200.1"; gene_id "LTnewLTref_240018200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 428702 429478 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018300.1"; gene_id "LTnewLTref_240018300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 428702 429478 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018300.1"; gene_id "LTnewLTref_240018300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 431106 434639 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018400.1"; gene_id "LTnewLTref_240018400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 431106 434639 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018400.1"; gene_id "LTnewLTref_240018400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 435216 435962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018500.1"; gene_id "LTnewLTref_240018500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 435216 435962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018500.1"; gene_id "LTnewLTref_240018500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 436842 437783 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018600.1"; gene_id "LTnewLTref_240018600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 436842 437783 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018600.1"; gene_id "LTnewLTref_240018600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 439553 440527 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018700.1"; gene_id "LTnewLTref_240018700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 439553 440527 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018700.1"; gene_id "LTnewLTref_240018700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 441193 441516 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018800.1"; gene_id "LTnewLTref_240018800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 441193 441516 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018800.1"; gene_id "LTnewLTref_240018800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 444555 446186 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240018900.1"; gene_id "LTnewLTref_240018900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 444555 446186 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240018900.1"; gene_id "LTnewLTref_240018900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 448271 450559 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019000.1"; gene_id "LTnewLTref_240019000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 448271 450559 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019000.1"; gene_id "LTnewLTref_240019000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 451395 453221 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019100.1"; gene_id "LTnewLTref_240019100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 451395 453221 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019100.1"; gene_id "LTnewLTref_240019100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 454527 455087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019200.1"; gene_id "LTnewLTref_240019200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 454527 455087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019200.1"; gene_id "LTnewLTref_240019200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 457973 458491 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019300.1"; gene_id "LTnewLTref_240019300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 457973 458491 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019300.1"; gene_id "LTnewLTref_240019300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 460442 460966 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019400.1"; gene_id "LTnewLTref_240019400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 460442 460966 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019400.1"; gene_id "LTnewLTref_240019400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 464931 465491 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019500.1"; gene_id "LTnewLTref_240019500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 464931 465491 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019500.1"; gene_id "LTnewLTref_240019500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 467743 468490 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_240019600.1"; gene_id "LTnewLTref_240019600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 467743 467855 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019600.1"; gene_id "LTnewLTref_240019600"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 468088 468490 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240019600.1"; gene_id "LTnewLTref_240019600"; CM024310.1 . transcript 469290 473528 . + . transcript_id "LTnewLTref_240019700.1"; gene_id "LTnewLTref_240019700:pseudogene" CM024310.1 . exon 469290 473528 . + . transcript_id "LTnewLTref_240019700.1"; gene_id "LTnewLTref_240019700:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 474717 477143 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019800.1"; gene_id "LTnewLTref_240019800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 474717 477143 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019800.1"; gene_id "LTnewLTref_240019800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 482029 482793 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240019900.1"; gene_id "LTnewLTref_240019900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 482029 482793 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240019900.1"; gene_id "LTnewLTref_240019900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 483045 483774 0.83 + . transcript_id "LTnewLTref_240020000.1"; gene_id "LTnewLTref_240020000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 483045 483058 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020000.1"; gene_id "LTnewLTref_240020000"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 483192 483774 0.83 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240020000.1"; gene_id "LTnewLTref_240020000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 484067 484660 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020100.1"; gene_id "LTnewLTref_240020100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 484067 484660 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020100.1"; gene_id "LTnewLTref_240020100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 484933 485208 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020200.1"; gene_id "LTnewLTref_240020200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 484933 485208 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020200.1"; gene_id "LTnewLTref_240020200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 485646 488321 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020300.1"; gene_id "LTnewLTref_240020300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 485646 488321 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020300.1"; gene_id "LTnewLTref_240020300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 488824 491490 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020400.1"; gene_id "LTnewLTref_240020400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 488824 491490 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020400.1"; gene_id "LTnewLTref_240020400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 493175 495889 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020500.1"; gene_id "LTnewLTref_240020500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 493175 495889 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020500.1"; gene_id "LTnewLTref_240020500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 496909 497376 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020600.1"; gene_id "LTnewLTref_240020600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 496909 497376 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020600.1"; gene_id "LTnewLTref_240020600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 498941 500551 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020700.1"; gene_id "LTnewLTref_240020700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 498941 500551 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020700.1"; gene_id "LTnewLTref_240020700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 502746 503930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020800.1"; gene_id "LTnewLTref_240020800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 502746 503930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020800.1"; gene_id "LTnewLTref_240020800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 506039 507043 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240020900.1"; gene_id "LTnewLTref_240020900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 506039 507043 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240020900.1"; gene_id "LTnewLTref_240020900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 508901 509503 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021000.1"; gene_id "LTnewLTref_240021000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 508901 509503 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021000.1"; gene_id "LTnewLTref_240021000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 511528 514398 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021100.1"; gene_id "LTnewLTref_240021100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 511528 514398 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021100.1"; gene_id "LTnewLTref_240021100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 515457 519566 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021200.1"; gene_id "LTnewLTref_240021200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 515457 519566 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021200.1"; gene_id "LTnewLTref_240021200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 521566 531390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021300.1"; gene_id "LTnewLTref_240021300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 521566 531390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021300.1"; gene_id "LTnewLTref_240021300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 532067 534808 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021400.1"; gene_id "LTnewLTref_240021400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 532067 534808 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021400.1"; gene_id "LTnewLTref_240021400"; CM024310.1 . transcript 535642 535991 . + . transcript_id "LTnewLTref_240021500.1"; gene_id "LTnewLTref_240021500:pseudogene" CM024310.1 . exon 535642 535991 . + . transcript_id "LTnewLTref_240021500.1"; gene_id "LTnewLTref_240021500:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 536463 536696 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_240021600.1"; gene_id "LTnewLTref_240021600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 536463 536696 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021600.1"; gene_id "LTnewLTref_240021600"; CM024310.1 . transcript 538241 538658 . + . transcript_id "LTnewLTref_240021700.1"; gene_id "LTnewLTref_240021700:pseudogene" CM024310.1 . exon 538241 538516 . + . transcript_id "LTnewLTref_240021700.1"; gene_id "LTnewLTref_240021700:pseudogene"; CM024310.1 . exon 538518 538658 . + . transcript_id "LTnewLTref_240021700.1"; gene_id "LTnewLTref_240021700:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 539170 540783 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021800.1"; gene_id "LTnewLTref_240021800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 539170 540783 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021800.1"; gene_id "LTnewLTref_240021800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 541588 543414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240021900.1"; gene_id "LTnewLTref_240021900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 541588 543414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240021900.1"; gene_id "LTnewLTref_240021900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 545760 555864 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_240022000.1"; gene_id "LTnewLTref_240022000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 545760 550739 0.46 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022000.1"; gene_id "LTnewLTref_240022000"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 550789 555864 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022000.1"; gene_id "LTnewLTref_240022000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 555421 555864 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_240022000.2"; gene_id "LTnewLTref_240022000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 555421 555864 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022000.2"; gene_id "LTnewLTref_240022000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 556667 559105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022100.1"; gene_id "LTnewLTref_240022100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 556667 559105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022100.1"; gene_id "LTnewLTref_240022100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 560346 569111 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022200.1"; gene_id "LTnewLTref_240022200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 560346 569111 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022200.1"; gene_id "LTnewLTref_240022200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 571786 573635 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022300.1"; gene_id "LTnewLTref_240022300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 571786 573497 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022300.1"; gene_id "LTnewLTref_240022300"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 573542 573635 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_240022300.1"; gene_id "LTnewLTref_240022300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 574174 575514 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022400.1"; gene_id "LTnewLTref_240022400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 574174 575514 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022400.1"; gene_id "LTnewLTref_240022400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 576828 577340 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022500.1"; gene_id "LTnewLTref_240022500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 576828 577340 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022500.1"; gene_id "LTnewLTref_240022500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 578857 579369 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022600.1"; gene_id "LTnewLTref_240022600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 578857 579369 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022600.1"; gene_id "LTnewLTref_240022600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 581102 584557 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022700.1"; gene_id "LTnewLTref_240022700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 581102 584557 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022700.1"; gene_id "LTnewLTref_240022700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 585838 591678 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022800.1"; gene_id "LTnewLTref_240022800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 585838 591678 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022800.1"; gene_id "LTnewLTref_240022800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 592502 593002 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240022900.1"; gene_id "LTnewLTref_240022900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 592502 593002 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240022900.1"; gene_id "LTnewLTref_240022900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 593671 596532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240023000.1"; gene_id "LTnewLTref_240023000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 593671 596532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023000.1"; gene_id "LTnewLTref_240023000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 597328 599130 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240023100.1"; gene_id "LTnewLTref_240023100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 597328 599130 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023100.1"; gene_id "LTnewLTref_240023100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 608667 611111 0.86 + . transcript_id "LTnewLTref_240023200.1"; gene_id "LTnewLTref_240023200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 608667 611111 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023200.1"; gene_id "LTnewLTref_240023200"; CM024310.1 . transcript 613893 614325 . + . transcript_id "LTnewLTref_240023300.1"; gene_id "LTnewLTref_240023300:pseudogene" CM024310.1 . exon 613893 614168 . + . transcript_id "LTnewLTref_240023300.1"; gene_id "LTnewLTref_240023300:pseudogene"; CM024310.1 . exon 614170 614325 . + . transcript_id "LTnewLTref_240023300.1"; gene_id "LTnewLTref_240023300:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 620575 621765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240023400.1"; gene_id "LTnewLTref_240023400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 620575 621765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023400.1"; gene_id "LTnewLTref_240023400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 622601 624271 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240023500.1"; gene_id "LTnewLTref_240023500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 622601 624271 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023500.1"; gene_id "LTnewLTref_240023500"; CM024310.1 Liftoff transcript 625423 625617 . + . transcript_id "LTnewLTref_240023600.1"; gene_id "LTnewLTref_240023600" CM024310.1 Liftoff CDS 625423 625617 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023600.1"; gene_id "LTnewLTref_240023600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 626943 627302 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240023700.1"; gene_id "LTnewLTref_240023700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 626943 627302 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023700.1"; gene_id "LTnewLTref_240023700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 628413 629474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240023800.1"; gene_id "LTnewLTref_240023800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 628413 629474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240023800.1"; gene_id "LTnewLTref_240023800"; CM024310.1 . transcript 630998 631379 . + . transcript_id "LTnewLTref_240023900.1"; gene_id "LTnewLTref_240023900:pseudogene" CM024310.1 . exon 630998 631379 . + . transcript_id "LTnewLTref_240023900.1"; gene_id "LTnewLTref_240023900:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 632664 634487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240024000.1"; gene_id "LTnewLTref_240024000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 632664 634487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240024000.1"; gene_id "LTnewLTref_240024000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 638558 640297 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240024100.1"; gene_id "LTnewLTref_240024100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 638558 640297 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240024100.1"; gene_id "LTnewLTref_240024100"; CM024310.1 INFERNAL transcript 642110 642207 56.5 - . transcript_id "LTnewLTref_240024200:snRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024200" CM024310.1 INFERNAL exon 642110 642207 . - . transcript_id "LTnewLTref_240024200:snRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024200"; CM024310.1 Aragorn_1.2.36 transcript 642308 642380 . + . transcript_id "LTnewLTref_240024300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024300" CM024310.1 Aragorn_1.2.36 exon 642308 642380 . + . transcript_id "LTnewLTref_240024300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 642312 643204 0.56 - . transcript_id "LTnewLTref_240024400.1"; gene_id "LTnewLTref_240024400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 642312 642340 0.6 - 2 transcript_id "LTnewLTref_240024400.1"; gene_id "LTnewLTref_240024400"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 642991 643204 0.78 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240024400.1"; gene_id "LTnewLTref_240024400"; CM024310.1 Aragorn_1.2.36 transcript 642590 642671 . - . transcript_id "LTnewLTref_240024500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024500" CM024310.1 Aragorn_1.2.36 exon 642590 642671 . - . transcript_id "LTnewLTref_240024500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024500"; CM024310.1 Aragorn_1.2.36 transcript 642758 642832 . + . transcript_id "LTnewLTref_240024600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024600" CM024310.1 Aragorn_1.2.36 exon 642758 642832 . + . transcript_id "LTnewLTref_240024600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024600"; CM024310.1 . transcript 643314 643740 . - . transcript_id "LTnewLTref_240024700.1"; gene_id "LTnewLTref_240024700:pseudogene" CM024310.1 . exon 643314 643466 . - . transcript_id "LTnewLTref_240024700.1"; gene_id "LTnewLTref_240024700:pseudogene"; CM024310.1 . exon 643468 643740 . - . transcript_id "LTnewLTref_240024700.1"; gene_id "LTnewLTref_240024700:pseudogene"; CM024310.1 Aragorn_1.2.36 transcript 644925 644999 . + . transcript_id "LTnewLTref_240024800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024800" CM024310.1 Aragorn_1.2.36 exon 644925 644999 . + . transcript_id "LTnewLTref_240024800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240024800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 645512 647116 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240024900.1"; gene_id "LTnewLTref_240024900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 645512 647116 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240024900.1"; gene_id "LTnewLTref_240024900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 647882 649435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025000.1"; gene_id "LTnewLTref_240025000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 647882 649435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025000.1"; gene_id "LTnewLTref_240025000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 650049 650873 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025100.1"; gene_id "LTnewLTref_240025100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 650049 650873 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025100.1"; gene_id "LTnewLTref_240025100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 651462 652796 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025200.1"; gene_id "LTnewLTref_240025200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 651462 652796 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025200.1"; gene_id "LTnewLTref_240025200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 653974 655113 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025300.1"; gene_id "LTnewLTref_240025300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 653974 655113 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025300.1"; gene_id "LTnewLTref_240025300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 655928 657337 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025400.1"; gene_id "LTnewLTref_240025400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 655928 657337 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025400.1"; gene_id "LTnewLTref_240025400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 658965 659543 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025500.1"; gene_id "LTnewLTref_240025500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 658965 659543 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025500.1"; gene_id "LTnewLTref_240025500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 661544 664054 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025600.1"; gene_id "LTnewLTref_240025600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 661544 664054 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025600.1"; gene_id "LTnewLTref_240025600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 667681 672024 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025700.1"; gene_id "LTnewLTref_240025700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 667681 672024 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025700.1"; gene_id "LTnewLTref_240025700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 672891 673994 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025800.1"; gene_id "LTnewLTref_240025800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 672891 673994 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025800.1"; gene_id "LTnewLTref_240025800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 674818 677034 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240025900.1"; gene_id "LTnewLTref_240025900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 674818 677034 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240025900.1"; gene_id "LTnewLTref_240025900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 677870 678682 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026000.1"; gene_id "LTnewLTref_240026000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 677870 678682 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026000.1"; gene_id "LTnewLTref_240026000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 680296 680649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026100.1"; gene_id "LTnewLTref_240026100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 680296 680649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026100.1"; gene_id "LTnewLTref_240026100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 682042 685992 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026200.1"; gene_id "LTnewLTref_240026200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 682042 685992 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026200.1"; gene_id "LTnewLTref_240026200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 689553 690272 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026300.1"; gene_id "LTnewLTref_240026300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 689553 690272 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026300.1"; gene_id "LTnewLTref_240026300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 691417 691737 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026400.1"; gene_id "LTnewLTref_240026400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 691417 691737 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026400.1"; gene_id "LTnewLTref_240026400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 692345 693850 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026500.1"; gene_id "LTnewLTref_240026500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 692345 693850 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026500.1"; gene_id "LTnewLTref_240026500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 694733 696256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026600.1"; gene_id "LTnewLTref_240026600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 694733 696256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026600.1"; gene_id "LTnewLTref_240026600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 697146 697868 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026700.1"; gene_id "LTnewLTref_240026700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 697146 697868 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026700.1"; gene_id "LTnewLTref_240026700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 698424 699260 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026800.1"; gene_id "LTnewLTref_240026800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 698424 699260 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026800.1"; gene_id "LTnewLTref_240026800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 700318 701553 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240026900.1"; gene_id "LTnewLTref_240026900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 700318 701553 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240026900.1"; gene_id "LTnewLTref_240026900"; CM024310.1 Aragorn_1.2.36 transcript 701928 701999 . - . transcript_id "LTnewLTref_240027000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240027000" CM024310.1 Aragorn_1.2.36 exon 701928 701999 . - . transcript_id "LTnewLTref_240027000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_240027000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 703627 705237 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027100.1"; gene_id "LTnewLTref_240027100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 703627 705237 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027100.1"; gene_id "LTnewLTref_240027100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 706819 710679 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027200.1"; gene_id "LTnewLTref_240027200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 706819 710679 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027200.1"; gene_id "LTnewLTref_240027200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 715787 718582 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027300.1"; gene_id "LTnewLTref_240027300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 715787 718582 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027300.1"; gene_id "LTnewLTref_240027300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 729404 731575 0.56 - . transcript_id "LTnewLTref_240027400.1"; gene_id "LTnewLTref_240027400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 729404 731575 0.56 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027400.1"; gene_id "LTnewLTref_240027400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 733436 735922 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027500.1"; gene_id "LTnewLTref_240027500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 733436 735922 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027500.1"; gene_id "LTnewLTref_240027500"; CM024310.1 Liftoff transcript 736441 737898 . - . transcript_id "LTnewLTref_240027600.1"; gene_id "LTnewLTref_240027600" CM024310.1 Liftoff CDS 736441 737898 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027600.1"; gene_id "LTnewLTref_240027600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 738407 738772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027700.1"; gene_id "LTnewLTref_240027700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 738407 738772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027700.1"; gene_id "LTnewLTref_240027700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 739381 740949 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027800.1"; gene_id "LTnewLTref_240027800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 739381 740949 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027800.1"; gene_id "LTnewLTref_240027800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 742069 744189 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240027900.1"; gene_id "LTnewLTref_240027900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 742069 744189 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240027900.1"; gene_id "LTnewLTref_240027900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 745849 746949 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028000.1"; gene_id "LTnewLTref_240028000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 745849 746949 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028000.1"; gene_id "LTnewLTref_240028000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 747743 750118 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028100.1"; gene_id "LTnewLTref_240028100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 747743 750118 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028100.1"; gene_id "LTnewLTref_240028100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 750732 753687 0.42 - . transcript_id "LTnewLTref_240028200.1"; gene_id "LTnewLTref_240028200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 750732 752397 0.71 - 1 transcript_id "LTnewLTref_240028200.1"; gene_id "LTnewLTref_240028200"; CM024310.1 AUGUSTUS CDS 752444 753687 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028200.1"; gene_id "LTnewLTref_240028200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 754737 757004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028300.1"; gene_id "LTnewLTref_240028300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 754737 757004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028300.1"; gene_id "LTnewLTref_240028300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 758353 759153 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028400.1"; gene_id "LTnewLTref_240028400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 758353 759153 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028400.1"; gene_id "LTnewLTref_240028400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 760103 761161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028500.1"; gene_id "LTnewLTref_240028500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 760103 761161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028500.1"; gene_id "LTnewLTref_240028500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 761573 763342 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028600.1"; gene_id "LTnewLTref_240028600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 761573 763342 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028600.1"; gene_id "LTnewLTref_240028600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 763816 767085 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028700.1"; gene_id "LTnewLTref_240028700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 763816 767085 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028700.1"; gene_id "LTnewLTref_240028700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 768003 772340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028800.1"; gene_id "LTnewLTref_240028800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 768003 772340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028800.1"; gene_id "LTnewLTref_240028800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 773652 774431 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240028900.1"; gene_id "LTnewLTref_240028900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 773652 774431 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240028900.1"; gene_id "LTnewLTref_240028900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 775554 775820 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029000.1"; gene_id "LTnewLTref_240029000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 775554 775820 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029000.1"; gene_id "LTnewLTref_240029000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 776808 777323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029100.1"; gene_id "LTnewLTref_240029100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 776808 777323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029100.1"; gene_id "LTnewLTref_240029100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 778301 778732 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029200.1"; gene_id "LTnewLTref_240029200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 778301 778732 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029200.1"; gene_id "LTnewLTref_240029200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 780893 782908 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029300.1"; gene_id "LTnewLTref_240029300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 780893 782908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029300.1"; gene_id "LTnewLTref_240029300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 784550 785212 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029400.1"; gene_id "LTnewLTref_240029400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 784550 785212 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029400.1"; gene_id "LTnewLTref_240029400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 786140 786802 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029500.1"; gene_id "LTnewLTref_240029500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 786140 786802 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029500.1"; gene_id "LTnewLTref_240029500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 787714 788850 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029600.1"; gene_id "LTnewLTref_240029600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 787714 788850 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029600.1"; gene_id "LTnewLTref_240029600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 789607 790533 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029700.1"; gene_id "LTnewLTref_240029700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 789607 790533 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029700.1"; gene_id "LTnewLTref_240029700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 793609 795114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029800.1"; gene_id "LTnewLTref_240029800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 793609 795114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029800.1"; gene_id "LTnewLTref_240029800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 795864 799460 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240029900.1"; gene_id "LTnewLTref_240029900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 795864 799460 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240029900.1"; gene_id "LTnewLTref_240029900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 800800 801267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030000.1"; gene_id "LTnewLTref_240030000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 800800 801267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030000.1"; gene_id "LTnewLTref_240030000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 802594 803574 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030100.1"; gene_id "LTnewLTref_240030100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 802594 803574 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030100.1"; gene_id "LTnewLTref_240030100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 808407 808844 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030200.1"; gene_id "LTnewLTref_240030200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 808407 808844 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030200.1"; gene_id "LTnewLTref_240030200"; CM024310.1 . transcript 810464 810663 . - . transcript_id "LTnewLTref_240030300.1"; gene_id "LTnewLTref_240030300:pseudogene" CM024310.1 . exon 810464 810663 . - . transcript_id "LTnewLTref_240030300.1"; gene_id "LTnewLTref_240030300:pseudogene"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 812163 813167 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030400.1"; gene_id "LTnewLTref_240030400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 812163 813167 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030400.1"; gene_id "LTnewLTref_240030400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 814610 817660 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030500.1"; gene_id "LTnewLTref_240030500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 814610 817660 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030500.1"; gene_id "LTnewLTref_240030500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 818388 822704 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030600.1"; gene_id "LTnewLTref_240030600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 818388 822704 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030600.1"; gene_id "LTnewLTref_240030600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 823506 824249 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030700.1"; gene_id "LTnewLTref_240030700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 823506 824249 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030700.1"; gene_id "LTnewLTref_240030700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 824931 825671 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030800.1"; gene_id "LTnewLTref_240030800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 824931 825671 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030800.1"; gene_id "LTnewLTref_240030800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 829021 829515 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240030900.1"; gene_id "LTnewLTref_240030900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 829021 829515 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240030900.1"; gene_id "LTnewLTref_240030900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 830251 831444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031000.1"; gene_id "LTnewLTref_240031000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 830251 831444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031000.1"; gene_id "LTnewLTref_240031000"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 833944 834471 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031100.1"; gene_id "LTnewLTref_240031100" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 833944 834471 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031100.1"; gene_id "LTnewLTref_240031100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 835320 836450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031200.1"; gene_id "LTnewLTref_240031200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 835320 836450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031200.1"; gene_id "LTnewLTref_240031200"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 838778 840073 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031300.1"; gene_id "LTnewLTref_240031300" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 838778 840073 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031300.1"; gene_id "LTnewLTref_240031300"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 840648 842216 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031400.1"; gene_id "LTnewLTref_240031400" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 840648 842216 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031400.1"; gene_id "LTnewLTref_240031400"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 842879 843715 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031500.1"; gene_id "LTnewLTref_240031500" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 842879 843715 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031500.1"; gene_id "LTnewLTref_240031500"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 844637 847078 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031600.1"; gene_id "LTnewLTref_240031600" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 844637 847078 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031600.1"; gene_id "LTnewLTref_240031600"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 847790 850024 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031700.1"; gene_id "LTnewLTref_240031700" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 847790 850024 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031700.1"; gene_id "LTnewLTref_240031700"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 850781 851491 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031800.1"; gene_id "LTnewLTref_240031800" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 850781 851491 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031800.1"; gene_id "LTnewLTref_240031800"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 851903 852394 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240031900.1"; gene_id "LTnewLTref_240031900" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 851903 852394 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240031900.1"; gene_id "LTnewLTref_240031900"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 853096 854148 1 - . transcript_id "LTnewLTref_240032000.1"; gene_id "LTnewLTref_240032000" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 853096 854148 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_240032000.1"; gene_id "LTnewLTref_240032000"; CM024310.1 Liftoff transcript 854988 855764 . - . transcript_id "LTnewLTref_240032100.1"; gene_id "LTnewLTref_240032100" CM024310.1 Liftoff CDS 854988 855764 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_240032100.1"; gene_id "LTnewLTref_240032100"; CM024310.1 AUGUSTUS transcript 857015 858421 1 + . transcript_id "LTnewLTref_240032200.1"; gene_id "LTnewLTref_240032200" CM024310.1 AUGUSTUS CDS 857015 858421 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_240032200.1"; gene_id "LTnewLTref_240032200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 780 1084 0.68 + . transcript_id "LTnewLTref_250005000.1"; gene_id "LTnewLTref_250005000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 780 1084 0.68 + 2 transcript_id "LTnewLTref_250005000.1"; gene_id "LTnewLTref_250005000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 3213 4517 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005100.1"; gene_id "LTnewLTref_250005100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 3213 4517 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005100.1"; gene_id "LTnewLTref_250005100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 5179 5862 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005200.1"; gene_id "LTnewLTref_250005200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 5179 5862 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005200.1"; gene_id "LTnewLTref_250005200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 6119 7834 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005300.1"; gene_id "LTnewLTref_250005300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 6119 7834 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005300.1"; gene_id "LTnewLTref_250005300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 8601 12404 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005400.1"; gene_id "LTnewLTref_250005400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 8601 12404 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005400.1"; gene_id "LTnewLTref_250005400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 13106 13621 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005500.1"; gene_id "LTnewLTref_250005500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 13106 13621 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005500.1"; gene_id "LTnewLTref_250005500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 14234 14692 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005600.1"; gene_id "LTnewLTref_250005600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 14234 14692 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005600.1"; gene_id "LTnewLTref_250005600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 15455 15811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005700.1"; gene_id "LTnewLTref_250005700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 15455 15811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005700.1"; gene_id "LTnewLTref_250005700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 16570 17463 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005800.1"; gene_id "LTnewLTref_250005800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 16570 17463 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005800.1"; gene_id "LTnewLTref_250005800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 19126 20760 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250005900.1"; gene_id "LTnewLTref_250005900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 19126 20760 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250005900.1"; gene_id "LTnewLTref_250005900"; CM024311.1 Liftoff transcript 21936 22197 . - . transcript_id "LTnewLTref_250006000.1"; gene_id "LTnewLTref_250006000" CM024311.1 Liftoff CDS 21936 22197 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006000.1"; gene_id "LTnewLTref_250006000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 23152 23514 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006100.1"; gene_id "LTnewLTref_250006100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 23152 23514 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006100.1"; gene_id "LTnewLTref_250006100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 26451 26666 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006200.1"; gene_id "LTnewLTref_250006200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 26451 26666 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006200.1"; gene_id "LTnewLTref_250006200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 27327 28751 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006300.1"; gene_id "LTnewLTref_250006300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 27327 28751 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006300.1"; gene_id "LTnewLTref_250006300"; CM024311.1 Liftoff transcript 29683 29895 . - . transcript_id "LTnewLTref_250006400.1"; gene_id "LTnewLTref_250006400" CM024311.1 Liftoff CDS 29683 29895 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006400.1"; gene_id "LTnewLTref_250006400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 31499 32275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006500.1"; gene_id "LTnewLTref_250006500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 31499 32275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006500.1"; gene_id "LTnewLTref_250006500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 33619 35523 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006600.1"; gene_id "LTnewLTref_250006600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 33619 35523 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006600.1"; gene_id "LTnewLTref_250006600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 36505 36894 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006700.1"; gene_id "LTnewLTref_250006700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 36505 36894 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006700.1"; gene_id "LTnewLTref_250006700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 37662 39803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006800.1"; gene_id "LTnewLTref_250006800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 37662 39803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006800.1"; gene_id "LTnewLTref_250006800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 40547 41194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250006900.1"; gene_id "LTnewLTref_250006900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 40547 41194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250006900.1"; gene_id "LTnewLTref_250006900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 42467 44923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007000.1"; gene_id "LTnewLTref_250007000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 42467 44923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007000.1"; gene_id "LTnewLTref_250007000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 45899 49048 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007100.1"; gene_id "LTnewLTref_250007100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 45899 49048 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007100.1"; gene_id "LTnewLTref_250007100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 50874 51577 0.81 - . transcript_id "LTnewLTref_250007200.1"; gene_id "LTnewLTref_250007200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 50874 51311 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007200.1"; gene_id "LTnewLTref_250007200"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 51359 51577 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007200.1"; gene_id "LTnewLTref_250007200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 52707 56837 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007300.1"; gene_id "LTnewLTref_250007300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 52707 56837 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007300.1"; gene_id "LTnewLTref_250007300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 59116 60027 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007400.1"; gene_id "LTnewLTref_250007400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 59116 60027 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007400.1"; gene_id "LTnewLTref_250007400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 62222 64363 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007500.1"; gene_id "LTnewLTref_250007500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 62222 64363 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007500.1"; gene_id "LTnewLTref_250007500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 65800 66786 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007600.1"; gene_id "LTnewLTref_250007600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 65800 66786 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007600.1"; gene_id "LTnewLTref_250007600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 67602 68162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007700.1"; gene_id "LTnewLTref_250007700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 67602 68162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007700.1"; gene_id "LTnewLTref_250007700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 68816 71449 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007800.1"; gene_id "LTnewLTref_250007800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 68816 71449 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007800.1"; gene_id "LTnewLTref_250007800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 72319 72588 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250007900.1"; gene_id "LTnewLTref_250007900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 72319 72588 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250007900.1"; gene_id "LTnewLTref_250007900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 73615 77085 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008000.1"; gene_id "LTnewLTref_250008000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 73615 77085 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008000.1"; gene_id "LTnewLTref_250008000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 78409 80484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008100.1"; gene_id "LTnewLTref_250008100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 78409 80484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008100.1"; gene_id "LTnewLTref_250008100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 84014 85768 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008200.1"; gene_id "LTnewLTref_250008200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 84014 85768 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008200.1"; gene_id "LTnewLTref_250008200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 87385 89232 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008300.1"; gene_id "LTnewLTref_250008300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 87385 89232 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008300.1"; gene_id "LTnewLTref_250008300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 90008 90280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008400.1"; gene_id "LTnewLTref_250008400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 90008 90280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008400.1"; gene_id "LTnewLTref_250008400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 90947 94195 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008500.1"; gene_id "LTnewLTref_250008500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 90947 94195 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008500.1"; gene_id "LTnewLTref_250008500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 94853 95404 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008600.1"; gene_id "LTnewLTref_250008600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 94853 95404 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008600.1"; gene_id "LTnewLTref_250008600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 96592 98649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250008700.1"; gene_id "LTnewLTref_250008700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 96592 98649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008700.1"; gene_id "LTnewLTref_250008700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 101522 101985 0.36 - . transcript_id "LTnewLTref_250008800.1"; gene_id "LTnewLTref_250008800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 101522 101528 0.63 - 1 transcript_id "LTnewLTref_250008800.1"; gene_id "LTnewLTref_250008800"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 101708 101985 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008800.1"; gene_id "LTnewLTref_250008800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 101542 101985 0.32 - . transcript_id "LTnewLTref_250008800.2"; gene_id "LTnewLTref_250008800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 101542 101625 0.48 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008800.2"; gene_id "LTnewLTref_250008800"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 101689 101985 0.4 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250008800.2"; gene_id "LTnewLTref_250008800"; CM024311.1 . transcript 103698 105688 . - . transcript_id "LTnewLTref_250008900.1"; gene_id "LTnewLTref_250008900:pseudogene" CM024311.1 . exon 103698 105688 . - . transcript_id "LTnewLTref_250008900.1"; gene_id "LTnewLTref_250008900:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 107338 109599 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009000.1"; gene_id "LTnewLTref_250009000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 107338 109599 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009000.1"; gene_id "LTnewLTref_250009000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 110384 110758 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009100.1"; gene_id "LTnewLTref_250009100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 110384 110758 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009100.1"; gene_id "LTnewLTref_250009100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 111958 112497 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009200.1"; gene_id "LTnewLTref_250009200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 111958 112497 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009200.1"; gene_id "LTnewLTref_250009200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 113397 115949 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009300.1"; gene_id "LTnewLTref_250009300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 113397 115949 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009300.1"; gene_id "LTnewLTref_250009300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 117328 117933 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009400.1"; gene_id "LTnewLTref_250009400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 117328 117933 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009400.1"; gene_id "LTnewLTref_250009400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 118819 119121 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009500.1"; gene_id "LTnewLTref_250009500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 118819 119121 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009500.1"; gene_id "LTnewLTref_250009500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 120523 121410 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009600.1"; gene_id "LTnewLTref_250009600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 120523 121410 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009600.1"; gene_id "LTnewLTref_250009600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 122706 127646 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009700.1"; gene_id "LTnewLTref_250009700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 122706 127646 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009700.1"; gene_id "LTnewLTref_250009700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 128980 132033 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009800.1"; gene_id "LTnewLTref_250009800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 128980 132033 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009800.1"; gene_id "LTnewLTref_250009800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 132950 135061 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250009900.1"; gene_id "LTnewLTref_250009900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 132950 135061 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250009900.1"; gene_id "LTnewLTref_250009900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 136276 137418 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010000.1"; gene_id "LTnewLTref_250010000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 136276 137418 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010000.1"; gene_id "LTnewLTref_250010000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 139468 139869 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010100.1"; gene_id "LTnewLTref_250010100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 139468 139869 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010100.1"; gene_id "LTnewLTref_250010100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 142693 146136 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010200.1"; gene_id "LTnewLTref_250010200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 142693 146136 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010200.1"; gene_id "LTnewLTref_250010200"; CM024311.1 Liftoff transcript 148385 153460 . - . transcript_id "LTnewLTref_250010300.1"; gene_id "LTnewLTref_250010300" CM024311.1 Liftoff CDS 148385 153460 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010300.1"; gene_id "LTnewLTref_250010300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 160908 161426 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010400.1"; gene_id "LTnewLTref_250010400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 160908 161426 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010400.1"; gene_id "LTnewLTref_250010400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 170555 171058 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010500.1"; gene_id "LTnewLTref_250010500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 170555 171058 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010500.1"; gene_id "LTnewLTref_250010500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 172436 174121 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010600.1"; gene_id "LTnewLTref_250010600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 172436 174121 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010600.1"; gene_id "LTnewLTref_250010600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 175662 176384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010700.1"; gene_id "LTnewLTref_250010700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 175662 176384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010700.1"; gene_id "LTnewLTref_250010700"; CM024311.1 . transcript 179897 181881 . - . transcript_id "LTnewLTref_250010800.1"; gene_id "LTnewLTref_250010800:pseudogene" CM024311.1 . exon 179897 181881 . - . transcript_id "LTnewLTref_250010800.1"; gene_id "LTnewLTref_250010800:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 189117 190004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250010900.1"; gene_id "LTnewLTref_250010900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 189117 190004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250010900.1"; gene_id "LTnewLTref_250010900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 191263 193293 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011000.1"; gene_id "LTnewLTref_250011000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 191263 193293 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011000.1"; gene_id "LTnewLTref_250011000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 194367 194960 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011100.1"; gene_id "LTnewLTref_250011100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 194367 194960 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011100.1"; gene_id "LTnewLTref_250011100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 195862 196842 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011200.1"; gene_id "LTnewLTref_250011200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 195862 196842 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011200.1"; gene_id "LTnewLTref_250011200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 197653 198225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011300.1"; gene_id "LTnewLTref_250011300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 197653 198225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011300.1"; gene_id "LTnewLTref_250011300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 199743 200042 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011400.1"; gene_id "LTnewLTref_250011400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 199743 200042 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011400.1"; gene_id "LTnewLTref_250011400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 200953 201258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011500.1"; gene_id "LTnewLTref_250011500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 200953 201258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011500.1"; gene_id "LTnewLTref_250011500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 202789 204036 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011600.1"; gene_id "LTnewLTref_250011600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 202789 204036 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011600.1"; gene_id "LTnewLTref_250011600"; CM024311.1 . transcript 205077 209490 . - . transcript_id "LTnewLTref_250011700.1"; gene_id "LTnewLTref_250011700:pseudogene" CM024311.1 . exon 205077 209490 . - . transcript_id "LTnewLTref_250011700.1"; gene_id "LTnewLTref_250011700:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 211372 216222 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011800.1"; gene_id "LTnewLTref_250011800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 211372 216222 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011800.1"; gene_id "LTnewLTref_250011800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 217435 218340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250011900.1"; gene_id "LTnewLTref_250011900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 217435 218340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250011900.1"; gene_id "LTnewLTref_250011900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 219086 219574 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012000.1"; gene_id "LTnewLTref_250012000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 219086 219574 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012000.1"; gene_id "LTnewLTref_250012000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 220062 222059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012100.1"; gene_id "LTnewLTref_250012100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 220062 222059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012100.1"; gene_id "LTnewLTref_250012100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 222948 223235 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012200.1"; gene_id "LTnewLTref_250012200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 222948 223235 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012200.1"; gene_id "LTnewLTref_250012200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 226165 227823 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012300.1"; gene_id "LTnewLTref_250012300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 226165 227823 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012300.1"; gene_id "LTnewLTref_250012300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 231396 236573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012400.1"; gene_id "LTnewLTref_250012400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 231396 236573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012400.1"; gene_id "LTnewLTref_250012400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 243219 243440 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012500.1"; gene_id "LTnewLTref_250012500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 243219 243440 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012500.1"; gene_id "LTnewLTref_250012500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 243219 246451 0.69 - . transcript_id "LTnewLTref_250012500.2"; gene_id "LTnewLTref_250012500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 243219 246151 0.69 - 2 transcript_id "LTnewLTref_250012500.2"; gene_id "LTnewLTref_250012500"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 246391 246451 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012500.2"; gene_id "LTnewLTref_250012500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 247180 248805 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012600.1"; gene_id "LTnewLTref_250012600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 247180 248805 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012600.1"; gene_id "LTnewLTref_250012600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 253186 254271 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012700.1"; gene_id "LTnewLTref_250012700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 253186 254271 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012700.1"; gene_id "LTnewLTref_250012700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 254714 255178 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012800.1"; gene_id "LTnewLTref_250012800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 254714 255178 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012800.1"; gene_id "LTnewLTref_250012800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 255635 256474 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250012900.1"; gene_id "LTnewLTref_250012900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 255635 256474 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250012900.1"; gene_id "LTnewLTref_250012900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 256987 257538 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250013000.1"; gene_id "LTnewLTref_250013000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 256987 257538 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250013000.1"; gene_id "LTnewLTref_250013000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 259017 259517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013100.1"; gene_id "LTnewLTref_250013100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 259017 259517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013100.1"; gene_id "LTnewLTref_250013100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 259909 260409 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013200.1"; gene_id "LTnewLTref_250013200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 259909 260409 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013200.1"; gene_id "LTnewLTref_250013200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 260802 261302 0.88 + . transcript_id "LTnewLTref_250013300.1"; gene_id "LTnewLTref_250013300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 260802 261302 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013300.1"; gene_id "LTnewLTref_250013300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 262813 266091 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013400.1"; gene_id "LTnewLTref_250013400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 262813 266091 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013400.1"; gene_id "LTnewLTref_250013400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 268231 269451 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013500.1"; gene_id "LTnewLTref_250013500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 268231 269451 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013500.1"; gene_id "LTnewLTref_250013500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 275721 276764 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013600.1"; gene_id "LTnewLTref_250013600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 275721 276764 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013600.1"; gene_id "LTnewLTref_250013600"; CM024311.1 . transcript 277299 278737 . + . transcript_id "LTnewLTref_250013700.1"; gene_id "LTnewLTref_250013700:pseudogene" CM024311.1 . exon 277299 278737 . + . transcript_id "LTnewLTref_250013700.1"; gene_id "LTnewLTref_250013700:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 281558 282478 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013800.1"; gene_id "LTnewLTref_250013800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 281558 282478 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013800.1"; gene_id "LTnewLTref_250013800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 286621 290127 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250013900.1"; gene_id "LTnewLTref_250013900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 286621 290127 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250013900.1"; gene_id "LTnewLTref_250013900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 290619 291350 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014000.1"; gene_id "LTnewLTref_250014000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 290619 291350 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014000.1"; gene_id "LTnewLTref_250014000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 295294 298359 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014100.1"; gene_id "LTnewLTref_250014100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 295294 298359 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014100.1"; gene_id "LTnewLTref_250014100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 300643 301026 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014200.1"; gene_id "LTnewLTref_250014200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 300643 301026 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014200.1"; gene_id "LTnewLTref_250014200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 304140 307268 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014300.1"; gene_id "LTnewLTref_250014300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 304140 307268 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014300.1"; gene_id "LTnewLTref_250014300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 309444 310691 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014400.1"; gene_id "LTnewLTref_250014400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 309444 310691 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014400.1"; gene_id "LTnewLTref_250014400"; CM024311.1 . transcript 313359 316797 . + . transcript_id "LTnewLTref_250014500.1"; gene_id "LTnewLTref_250014500:pseudogene" CM024311.1 . exon 313359 316797 . + . transcript_id "LTnewLTref_250014500.1"; gene_id "LTnewLTref_250014500:pseudogene"; CM024311.1 . transcript 317581 320967 . + . transcript_id "LTnewLTref_250014600.1"; gene_id "LTnewLTref_250014600:pseudogene" CM024311.1 . exon 317581 320967 . + . transcript_id "LTnewLTref_250014600.1"; gene_id "LTnewLTref_250014600:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 325585 326463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014700.1"; gene_id "LTnewLTref_250014700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 325585 326463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014700.1"; gene_id "LTnewLTref_250014700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 327454 327784 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_250014800.1"; gene_id "LTnewLTref_250014800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 327454 327661 0.42 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014800.1"; gene_id "LTnewLTref_250014800"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 327708 327784 0.67 + 2 transcript_id "LTnewLTref_250014800.1"; gene_id "LTnewLTref_250014800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 327454 331866 0.58 + . transcript_id "LTnewLTref_250014800.2"; gene_id "LTnewLTref_250014800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 327454 331866 0.58 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014800.2"; gene_id "LTnewLTref_250014800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 332624 333394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250014900.1"; gene_id "LTnewLTref_250014900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 332624 333394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250014900.1"; gene_id "LTnewLTref_250014900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 334149 335171 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015000.1"; gene_id "LTnewLTref_250015000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 334149 335171 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015000.1"; gene_id "LTnewLTref_250015000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 335839 336372 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015100.1"; gene_id "LTnewLTref_250015100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 335839 336372 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015100.1"; gene_id "LTnewLTref_250015100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 338762 341317 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015200.1"; gene_id "LTnewLTref_250015200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 338762 341317 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015200.1"; gene_id "LTnewLTref_250015200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 343184 343972 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015300.1"; gene_id "LTnewLTref_250015300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 343184 343972 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015300.1"; gene_id "LTnewLTref_250015300"; CM024311.1 Liftoff transcript 344468 346351 . + . transcript_id "LTnewLTref_250015400.1"; gene_id "LTnewLTref_250015400" CM024311.1 Liftoff CDS 344468 346351 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015400.1"; gene_id "LTnewLTref_250015400"; CM024311.1 . transcript 347084 348407 . + . transcript_id "LTnewLTref_250015500.1"; gene_id "LTnewLTref_250015500:pseudogene" CM024311.1 . exon 347084 348407 . + . transcript_id "LTnewLTref_250015500.1"; gene_id "LTnewLTref_250015500:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 349361 350704 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015600.1"; gene_id "LTnewLTref_250015600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 349361 350704 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015600.1"; gene_id "LTnewLTref_250015600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 351978 355655 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015700.1"; gene_id "LTnewLTref_250015700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 351978 355655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015700.1"; gene_id "LTnewLTref_250015700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 356774 370882 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250015800.1"; gene_id "LTnewLTref_250015800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 356774 370882 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015800.1"; gene_id "LTnewLTref_250015800"; CM024311.1 Liftoff transcript 372957 373171 . + . transcript_id "LTnewLTref_250015900.1"; gene_id "LTnewLTref_250015900" CM024311.1 Liftoff CDS 372957 373171 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_250015900.1"; gene_id "LTnewLTref_250015900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 374215 374703 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016000.1"; gene_id "LTnewLTref_250016000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 374215 374703 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016000.1"; gene_id "LTnewLTref_250016000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 375841 379890 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016100.1"; gene_id "LTnewLTref_250016100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 375841 379890 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016100.1"; gene_id "LTnewLTref_250016100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 382384 383679 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016200.1"; gene_id "LTnewLTref_250016200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 382384 383679 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016200.1"; gene_id "LTnewLTref_250016200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 384809 385018 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016300.1"; gene_id "LTnewLTref_250016300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 384809 385018 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016300.1"; gene_id "LTnewLTref_250016300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 386608 387900 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016400.1"; gene_id "LTnewLTref_250016400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 386608 387900 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016400.1"; gene_id "LTnewLTref_250016400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 388676 388987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016500.1"; gene_id "LTnewLTref_250016500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 388676 388987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016500.1"; gene_id "LTnewLTref_250016500"; CM024311.1 . transcript 390182 392698 . + . transcript_id "LTnewLTref_250016600.1"; gene_id "LTnewLTref_250016600:pseudogene" CM024311.1 . exon 390182 392698 . + . transcript_id "LTnewLTref_250016600.1"; gene_id "LTnewLTref_250016600:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 393998 396901 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016700.1"; gene_id "LTnewLTref_250016700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 393998 396901 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016700.1"; gene_id "LTnewLTref_250016700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 397891 398460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016800.1"; gene_id "LTnewLTref_250016800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 397891 398460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016800.1"; gene_id "LTnewLTref_250016800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 399930 400559 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250016900.1"; gene_id "LTnewLTref_250016900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 399930 400559 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250016900.1"; gene_id "LTnewLTref_250016900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 400619 402492 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250017000.1"; gene_id "LTnewLTref_250017000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 400619 401108 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250017000.1"; gene_id "LTnewLTref_250017000"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 401177 402492 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_250017000.1"; gene_id "LTnewLTref_250017000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 406042 408618 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250017100.1"; gene_id "LTnewLTref_250017100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 406042 408618 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250017100.1"; gene_id "LTnewLTref_250017100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 410649 411974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250017200.1"; gene_id "LTnewLTref_250017200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 410649 411974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250017200.1"; gene_id "LTnewLTref_250017200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 414482 415723 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250017300.1"; gene_id "LTnewLTref_250017300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 414482 415723 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017300.1"; gene_id "LTnewLTref_250017300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 417748 418938 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250017400.1"; gene_id "LTnewLTref_250017400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 417748 418938 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017400.1"; gene_id "LTnewLTref_250017400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 420318 439901 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_250017500.1"; gene_id "LTnewLTref_250017500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 420318 432126 0.48 - 1 transcript_id "LTnewLTref_250017500.1"; gene_id "LTnewLTref_250017500"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 432298 439901 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017500.1"; gene_id "LTnewLTref_250017500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 443314 444813 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250017600.1"; gene_id "LTnewLTref_250017600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 443314 444813 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017600.1"; gene_id "LTnewLTref_250017600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 447080 447577 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250017700.1"; gene_id "LTnewLTref_250017700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 447080 447577 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017700.1"; gene_id "LTnewLTref_250017700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 449082 450719 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250017800.1"; gene_id "LTnewLTref_250017800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 449082 450719 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017800.1"; gene_id "LTnewLTref_250017800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 451644 451954 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_250017900.1"; gene_id "LTnewLTref_250017900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 451644 451899 0.83 - 1 transcript_id "LTnewLTref_250017900.1"; gene_id "LTnewLTref_250017900"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 451947 451954 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250017900.1"; gene_id "LTnewLTref_250017900"; CM024311.1 Liftoff transcript 453390 454103 . - . transcript_id "LTnewLTref_250018000.1"; gene_id "LTnewLTref_250018000" CM024311.1 Liftoff CDS 453390 454103 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018000.1"; gene_id "LTnewLTref_250018000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 454112 454852 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018100.1"; gene_id "LTnewLTref_250018100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 454112 454852 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018100.1"; gene_id "LTnewLTref_250018100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 456056 457498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018200.1"; gene_id "LTnewLTref_250018200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 456056 457498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018200.1"; gene_id "LTnewLTref_250018200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 459498 461074 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018300.1"; gene_id "LTnewLTref_250018300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 459498 460048 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_250018300.1"; gene_id "LTnewLTref_250018300"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 460120 461074 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018300.1"; gene_id "LTnewLTref_250018300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 462850 464428 0.91 - . transcript_id "LTnewLTref_250018400.1"; gene_id "LTnewLTref_250018400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 462850 464070 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018400.1"; gene_id "LTnewLTref_250018400"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 464123 464428 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018400.1"; gene_id "LTnewLTref_250018400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 465337 465699 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018500.1"; gene_id "LTnewLTref_250018500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 465337 465699 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018500.1"; gene_id "LTnewLTref_250018500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 466379 468901 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018600.1"; gene_id "LTnewLTref_250018600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 466379 468901 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018600.1"; gene_id "LTnewLTref_250018600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 470170 473376 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018700.1"; gene_id "LTnewLTref_250018700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 470170 473376 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018700.1"; gene_id "LTnewLTref_250018700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 473943 475775 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018800.1"; gene_id "LTnewLTref_250018800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 473943 475775 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018800.1"; gene_id "LTnewLTref_250018800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 476771 482995 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250018900.1"; gene_id "LTnewLTref_250018900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 476771 482995 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250018900.1"; gene_id "LTnewLTref_250018900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 483645 489305 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019000.1"; gene_id "LTnewLTref_250019000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 483645 489305 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019000.1"; gene_id "LTnewLTref_250019000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 490225 497137 0.79 - . transcript_id "LTnewLTref_250019100.1"; gene_id "LTnewLTref_250019100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 490225 492535 0.9 - 1 transcript_id "LTnewLTref_250019100.1"; gene_id "LTnewLTref_250019100"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 492597 497137 0.79 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019100.1"; gene_id "LTnewLTref_250019100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 499587 501116 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019200.1"; gene_id "LTnewLTref_250019200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 499587 501116 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019200.1"; gene_id "LTnewLTref_250019200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 502235 505414 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019300.1"; gene_id "LTnewLTref_250019300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 502235 505414 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019300.1"; gene_id "LTnewLTref_250019300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 506345 507628 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019400.1"; gene_id "LTnewLTref_250019400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 506345 507628 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019400.1"; gene_id "LTnewLTref_250019400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 508660 510639 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019500.1"; gene_id "LTnewLTref_250019500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 508660 510639 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019500.1"; gene_id "LTnewLTref_250019500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 512174 512941 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019600.1"; gene_id "LTnewLTref_250019600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 512174 512941 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019600.1"; gene_id "LTnewLTref_250019600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 514008 514262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019700.1"; gene_id "LTnewLTref_250019700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 514008 514262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019700.1"; gene_id "LTnewLTref_250019700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 515450 516403 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250019800.1"; gene_id "LTnewLTref_250019800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 515450 516403 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250019800.1"; gene_id "LTnewLTref_250019800"; CM024311.1 . transcript 517548 518045 . - . transcript_id "LTnewLTref_250019900.1"; gene_id "LTnewLTref_250019900:pseudogene" CM024311.1 . exon 517548 518045 . - . transcript_id "LTnewLTref_250019900.1"; gene_id "LTnewLTref_250019900:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 518667 520784 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020000.1"; gene_id "LTnewLTref_250020000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 518667 520784 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020000.1"; gene_id "LTnewLTref_250020000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 521938 524985 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020100.1"; gene_id "LTnewLTref_250020100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 521938 524985 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020100.1"; gene_id "LTnewLTref_250020100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 525718 533493 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020200.1"; gene_id "LTnewLTref_250020200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 525718 533493 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020200.1"; gene_id "LTnewLTref_250020200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 534295 537195 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020300.1"; gene_id "LTnewLTref_250020300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 534295 537195 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020300.1"; gene_id "LTnewLTref_250020300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 538892 540313 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020400.1"; gene_id "LTnewLTref_250020400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 538892 540313 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020400.1"; gene_id "LTnewLTref_250020400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 541391 542101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020500.1"; gene_id "LTnewLTref_250020500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 541391 542101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020500.1"; gene_id "LTnewLTref_250020500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 543068 543868 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020600.1"; gene_id "LTnewLTref_250020600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 543068 543868 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020600.1"; gene_id "LTnewLTref_250020600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 545330 546517 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020700.1"; gene_id "LTnewLTref_250020700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 545330 546517 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020700.1"; gene_id "LTnewLTref_250020700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 547780 549552 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020800.1"; gene_id "LTnewLTref_250020800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 547780 549552 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020800.1"; gene_id "LTnewLTref_250020800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 551620 552270 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250020900.1"; gene_id "LTnewLTref_250020900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 551620 552270 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250020900.1"; gene_id "LTnewLTref_250020900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 553742 555205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021000.1"; gene_id "LTnewLTref_250021000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 553742 555205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021000.1"; gene_id "LTnewLTref_250021000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 556001 557530 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021100.1"; gene_id "LTnewLTref_250021100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 556001 557530 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021100.1"; gene_id "LTnewLTref_250021100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 563290 564078 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021200.1"; gene_id "LTnewLTref_250021200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 563290 564078 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021200.1"; gene_id "LTnewLTref_250021200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 566799 567059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021300.1"; gene_id "LTnewLTref_250021300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 566799 567059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021300.1"; gene_id "LTnewLTref_250021300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 568335 569108 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021400.1"; gene_id "LTnewLTref_250021400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 568335 569108 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021400.1"; gene_id "LTnewLTref_250021400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 569688 571007 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021500.1"; gene_id "LTnewLTref_250021500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 569688 571007 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021500.1"; gene_id "LTnewLTref_250021500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 571585 573906 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021600.1"; gene_id "LTnewLTref_250021600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 571585 573906 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021600.1"; gene_id "LTnewLTref_250021600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 575128 576057 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021700.1"; gene_id "LTnewLTref_250021700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 575128 576057 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021700.1"; gene_id "LTnewLTref_250021700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 582283 584403 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021800.1"; gene_id "LTnewLTref_250021800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 582283 584403 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021800.1"; gene_id "LTnewLTref_250021800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 585502 589254 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250021900.1"; gene_id "LTnewLTref_250021900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 585502 589254 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250021900.1"; gene_id "LTnewLTref_250021900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 590089 592215 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022000.1"; gene_id "LTnewLTref_250022000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 590089 592215 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022000.1"; gene_id "LTnewLTref_250022000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 592863 594509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022100.1"; gene_id "LTnewLTref_250022100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 592863 594509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022100.1"; gene_id "LTnewLTref_250022100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 596687 599509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022200.1"; gene_id "LTnewLTref_250022200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 596687 599509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022200.1"; gene_id "LTnewLTref_250022200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 600285 602075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022300.1"; gene_id "LTnewLTref_250022300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 600285 602075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022300.1"; gene_id "LTnewLTref_250022300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 602995 605238 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022400.1"; gene_id "LTnewLTref_250022400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 602995 605238 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022400.1"; gene_id "LTnewLTref_250022400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 616805 617113 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022500.1"; gene_id "LTnewLTref_250022500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 616805 617113 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022500.1"; gene_id "LTnewLTref_250022500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 619148 621730 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022600.1"; gene_id "LTnewLTref_250022600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 619148 621730 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022600.1"; gene_id "LTnewLTref_250022600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 623669 630472 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022700.1"; gene_id "LTnewLTref_250022700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 623669 630472 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022700.1"; gene_id "LTnewLTref_250022700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 634019 635575 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250022800.1"; gene_id "LTnewLTref_250022800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 634019 635575 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022800.1"; gene_id "LTnewLTref_250022800"; CM024311.1 Liftoff transcript 636810 640448 . - . transcript_id "LTnewLTref_250022900.1"; gene_id "LTnewLTref_250022900" CM024311.1 Liftoff CDS 636810 640448 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250022900.1"; gene_id "LTnewLTref_250022900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 641731 645238 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_250023000.1"; gene_id "LTnewLTref_250023000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 641731 643435 0.51 - 1 transcript_id "LTnewLTref_250023000.1"; gene_id "LTnewLTref_250023000"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 643488 645238 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023000.1"; gene_id "LTnewLTref_250023000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 644671 645238 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_250023000.2"; gene_id "LTnewLTref_250023000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 644671 644686 0.93 - 1 transcript_id "LTnewLTref_250023000.2"; gene_id "LTnewLTref_250023000"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 644736 645238 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023000.2"; gene_id "LTnewLTref_250023000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 646431 647411 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023100.1"; gene_id "LTnewLTref_250023100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 646431 647411 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023100.1"; gene_id "LTnewLTref_250023100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 648745 649182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023200.1"; gene_id "LTnewLTref_250023200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 648745 649182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023200.1"; gene_id "LTnewLTref_250023200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 650961 652793 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023300.1"; gene_id "LTnewLTref_250023300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 650961 652793 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023300.1"; gene_id "LTnewLTref_250023300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 654219 656460 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023400.1"; gene_id "LTnewLTref_250023400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 654219 655481 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023400.1"; gene_id "LTnewLTref_250023400"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 656209 656460 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023400.1"; gene_id "LTnewLTref_250023400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 657177 657878 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023500.1"; gene_id "LTnewLTref_250023500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 657177 657878 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023500.1"; gene_id "LTnewLTref_250023500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 658915 661797 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023600.1"; gene_id "LTnewLTref_250023600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 658915 661797 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023600.1"; gene_id "LTnewLTref_250023600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 662631 663236 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023700.1"; gene_id "LTnewLTref_250023700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 662631 663236 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023700.1"; gene_id "LTnewLTref_250023700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 664633 670383 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023800.1"; gene_id "LTnewLTref_250023800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 664633 670383 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023800.1"; gene_id "LTnewLTref_250023800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 671407 672243 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250023900.1"; gene_id "LTnewLTref_250023900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 671407 672243 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250023900.1"; gene_id "LTnewLTref_250023900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 673863 677303 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024000.1"; gene_id "LTnewLTref_250024000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 673863 677303 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024000.1"; gene_id "LTnewLTref_250024000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 678021 678416 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024100.1"; gene_id "LTnewLTref_250024100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 678021 678416 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024100.1"; gene_id "LTnewLTref_250024100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 681080 682132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024200.1"; gene_id "LTnewLTref_250024200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 681080 682132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024200.1"; gene_id "LTnewLTref_250024200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 683183 687895 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024300.1"; gene_id "LTnewLTref_250024300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 683183 687895 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024300.1"; gene_id "LTnewLTref_250024300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 689077 690039 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024400.1"; gene_id "LTnewLTref_250024400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 689077 690039 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024400.1"; gene_id "LTnewLTref_250024400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 691126 692049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024500.1"; gene_id "LTnewLTref_250024500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 691126 692049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024500.1"; gene_id "LTnewLTref_250024500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 694348 694776 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024600.1"; gene_id "LTnewLTref_250024600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 694348 694776 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024600.1"; gene_id "LTnewLTref_250024600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 695469 696974 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024700.1"; gene_id "LTnewLTref_250024700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 695469 696974 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024700.1"; gene_id "LTnewLTref_250024700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 699822 700742 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024800.1"; gene_id "LTnewLTref_250024800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 699822 700742 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024800.1"; gene_id "LTnewLTref_250024800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 701542 704139 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250024900.1"; gene_id "LTnewLTref_250024900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 701542 704139 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250024900.1"; gene_id "LTnewLTref_250024900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 705243 706145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025000.1"; gene_id "LTnewLTref_250025000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 705243 706145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025000.1"; gene_id "LTnewLTref_250025000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 706908 710006 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025100.1"; gene_id "LTnewLTref_250025100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 706908 710006 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025100.1"; gene_id "LTnewLTref_250025100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 711596 712444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025200.1"; gene_id "LTnewLTref_250025200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 711596 712444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025200.1"; gene_id "LTnewLTref_250025200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 714694 717191 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_250025300.1"; gene_id "LTnewLTref_250025300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 714694 714993 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025300.1"; gene_id "LTnewLTref_250025300"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 715056 717191 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025300.1"; gene_id "LTnewLTref_250025300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 719070 722057 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025400.1"; gene_id "LTnewLTref_250025400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 719070 722057 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025400.1"; gene_id "LTnewLTref_250025400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 724694 726592 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025500.1"; gene_id "LTnewLTref_250025500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 724694 726592 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025500.1"; gene_id "LTnewLTref_250025500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 727647 729212 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025600.1"; gene_id "LTnewLTref_250025600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 727647 729212 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025600.1"; gene_id "LTnewLTref_250025600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 729917 731224 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025700.1"; gene_id "LTnewLTref_250025700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 729917 731224 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025700.1"; gene_id "LTnewLTref_250025700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 731977 733116 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025800.1"; gene_id "LTnewLTref_250025800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 731977 733116 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025800.1"; gene_id "LTnewLTref_250025800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 733278 733553 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250025900.1"; gene_id "LTnewLTref_250025900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 733278 733553 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250025900.1"; gene_id "LTnewLTref_250025900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 733638 734477 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026000.1"; gene_id "LTnewLTref_250026000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 733638 734341 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_250026000.1"; gene_id "LTnewLTref_250026000"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 734441 734477 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026000.1"; gene_id "LTnewLTref_250026000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 735507 735926 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026100.1"; gene_id "LTnewLTref_250026100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 735507 735926 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026100.1"; gene_id "LTnewLTref_250026100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 736893 737555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026200.1"; gene_id "LTnewLTref_250026200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 736893 737555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026200.1"; gene_id "LTnewLTref_250026200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 738240 739412 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026300.1"; gene_id "LTnewLTref_250026300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 738240 739412 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026300.1"; gene_id "LTnewLTref_250026300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 739749 740789 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026400.1"; gene_id "LTnewLTref_250026400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 739749 740789 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026400.1"; gene_id "LTnewLTref_250026400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 741551 743035 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026500.1"; gene_id "LTnewLTref_250026500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 741551 743035 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026500.1"; gene_id "LTnewLTref_250026500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 743755 744450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026600.1"; gene_id "LTnewLTref_250026600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 743755 744450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026600.1"; gene_id "LTnewLTref_250026600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 744953 746944 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026700.1"; gene_id "LTnewLTref_250026700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 744953 746944 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026700.1"; gene_id "LTnewLTref_250026700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 747771 750971 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026800.1"; gene_id "LTnewLTref_250026800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 747771 750971 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026800.1"; gene_id "LTnewLTref_250026800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 752110 752448 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250026900.1"; gene_id "LTnewLTref_250026900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 752110 752448 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250026900.1"; gene_id "LTnewLTref_250026900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 753078 756266 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027000.1"; gene_id "LTnewLTref_250027000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 753078 756266 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027000.1"; gene_id "LTnewLTref_250027000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 757971 762407 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027100.1"; gene_id "LTnewLTref_250027100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 757971 762407 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027100.1"; gene_id "LTnewLTref_250027100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 763899 765629 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027200.1"; gene_id "LTnewLTref_250027200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 763899 765629 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027200.1"; gene_id "LTnewLTref_250027200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 767223 771212 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027300.1"; gene_id "LTnewLTref_250027300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 767223 771212 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027300.1"; gene_id "LTnewLTref_250027300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 773284 774123 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027400.1"; gene_id "LTnewLTref_250027400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 773284 774123 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027400.1"; gene_id "LTnewLTref_250027400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 775330 776247 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027500.1"; gene_id "LTnewLTref_250027500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 775330 776247 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027500.1"; gene_id "LTnewLTref_250027500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 777366 778463 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027600.1"; gene_id "LTnewLTref_250027600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 777366 778463 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027600.1"; gene_id "LTnewLTref_250027600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 780452 781603 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027700.1"; gene_id "LTnewLTref_250027700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 780452 781603 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027700.1"; gene_id "LTnewLTref_250027700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 782902 786036 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027800.1"; gene_id "LTnewLTref_250027800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 782902 786036 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027800.1"; gene_id "LTnewLTref_250027800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 787072 788181 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250027900.1"; gene_id "LTnewLTref_250027900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 787072 788181 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250027900.1"; gene_id "LTnewLTref_250027900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 788870 790498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028000.1"; gene_id "LTnewLTref_250028000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 788870 790498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028000.1"; gene_id "LTnewLTref_250028000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 791954 794617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028100.1"; gene_id "LTnewLTref_250028100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 791954 794617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028100.1"; gene_id "LTnewLTref_250028100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 795793 796263 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028200.1"; gene_id "LTnewLTref_250028200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 795793 796263 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028200.1"; gene_id "LTnewLTref_250028200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 797101 797982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028300.1"; gene_id "LTnewLTref_250028300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 797101 797982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028300.1"; gene_id "LTnewLTref_250028300"; CM024311.1 Liftoff transcript 798682 799743 . - . transcript_id "LTnewLTref_250028400.1"; gene_id "LTnewLTref_250028400" CM024311.1 Liftoff CDS 798682 799743 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028400.1"; gene_id "LTnewLTref_250028400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 800918 802723 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028500.1"; gene_id "LTnewLTref_250028500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 800918 802723 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028500.1"; gene_id "LTnewLTref_250028500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 803971 804609 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028600.1"; gene_id "LTnewLTref_250028600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 803971 804609 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028600.1"; gene_id "LTnewLTref_250028600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 805549 806448 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028700.1"; gene_id "LTnewLTref_250028700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 805549 806448 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028700.1"; gene_id "LTnewLTref_250028700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 809715 810614 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028800.1"; gene_id "LTnewLTref_250028800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 809715 810614 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028800.1"; gene_id "LTnewLTref_250028800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 811909 813123 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250028900.1"; gene_id "LTnewLTref_250028900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 811909 813123 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250028900.1"; gene_id "LTnewLTref_250028900"; CM024311.1 Liftoff transcript 813616 814032 . - . transcript_id "LTnewLTref_250029000.1"; gene_id "LTnewLTref_250029000" CM024311.1 Liftoff CDS 813616 814032 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_250029000.1"; gene_id "LTnewLTref_250029000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 814829 815539 1 - . transcript_id "LTnewLTref_250029100.1"; gene_id "LTnewLTref_250029100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 814829 815539 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_250029100.1"; gene_id "LTnewLTref_250029100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 816908 818245 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029200.1"; gene_id "LTnewLTref_250029200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 816908 818245 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029200.1"; gene_id "LTnewLTref_250029200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 818642 820435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029300.1"; gene_id "LTnewLTref_250029300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 818642 820435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029300.1"; gene_id "LTnewLTref_250029300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 820774 821907 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029400.1"; gene_id "LTnewLTref_250029400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 820774 821907 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029400.1"; gene_id "LTnewLTref_250029400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 822743 823675 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029500.1"; gene_id "LTnewLTref_250029500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 822743 823675 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029500.1"; gene_id "LTnewLTref_250029500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 825318 826631 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029600.1"; gene_id "LTnewLTref_250029600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 825318 826631 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029600.1"; gene_id "LTnewLTref_250029600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 827519 829432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029700.1"; gene_id "LTnewLTref_250029700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 827519 829432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029700.1"; gene_id "LTnewLTref_250029700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 830425 831417 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029800.1"; gene_id "LTnewLTref_250029800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 830425 831417 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029800.1"; gene_id "LTnewLTref_250029800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 832234 832746 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250029900.1"; gene_id "LTnewLTref_250029900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 832234 832746 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250029900.1"; gene_id "LTnewLTref_250029900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 833505 835103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030000.1"; gene_id "LTnewLTref_250030000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 833505 835103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030000.1"; gene_id "LTnewLTref_250030000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 835995 836396 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030100.1"; gene_id "LTnewLTref_250030100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 835995 836396 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030100.1"; gene_id "LTnewLTref_250030100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 837691 838062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030200.1"; gene_id "LTnewLTref_250030200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 837691 838062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030200.1"; gene_id "LTnewLTref_250030200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 839195 840559 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030300.1"; gene_id "LTnewLTref_250030300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 839195 840559 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030300.1"; gene_id "LTnewLTref_250030300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 842567 843550 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030400.1"; gene_id "LTnewLTref_250030400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 842567 843550 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030400.1"; gene_id "LTnewLTref_250030400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 845621 846511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030500.1"; gene_id "LTnewLTref_250030500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 845621 846511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030500.1"; gene_id "LTnewLTref_250030500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 847440 849431 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030600.1"; gene_id "LTnewLTref_250030600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 847440 849431 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030600.1"; gene_id "LTnewLTref_250030600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 850427 852151 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030700.1"; gene_id "LTnewLTref_250030700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 850427 852151 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030700.1"; gene_id "LTnewLTref_250030700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 853119 853556 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030800.1"; gene_id "LTnewLTref_250030800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 853119 853556 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030800.1"; gene_id "LTnewLTref_250030800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 854517 857030 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250030900.1"; gene_id "LTnewLTref_250030900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 854517 857030 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250030900.1"; gene_id "LTnewLTref_250030900"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 859186 860355 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031000.1"; gene_id "LTnewLTref_250031000" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 859186 860355 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031000.1"; gene_id "LTnewLTref_250031000"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 863337 864431 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031100.1"; gene_id "LTnewLTref_250031100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 863337 864431 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031100.1"; gene_id "LTnewLTref_250031100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 865709 867430 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031200.1"; gene_id "LTnewLTref_250031200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 865709 867430 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031200.1"; gene_id "LTnewLTref_250031200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 868731 869435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031300.1"; gene_id "LTnewLTref_250031300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 868731 869435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031300.1"; gene_id "LTnewLTref_250031300"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 870306 870695 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031400.1"; gene_id "LTnewLTref_250031400" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 870306 870695 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031400.1"; gene_id "LTnewLTref_250031400"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 872072 872278 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031500.1"; gene_id "LTnewLTref_250031500" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 872072 872278 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031500.1"; gene_id "LTnewLTref_250031500"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 874235 876394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031600.1"; gene_id "LTnewLTref_250031600" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 874235 876394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031600.1"; gene_id "LTnewLTref_250031600"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 879308 880060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031700.1"; gene_id "LTnewLTref_250031700" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 879308 880060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031700.1"; gene_id "LTnewLTref_250031700"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 880728 883613 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031800.1"; gene_id "LTnewLTref_250031800" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 880728 883613 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031800.1"; gene_id "LTnewLTref_250031800"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 885295 886080 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250031900.1"; gene_id "LTnewLTref_250031900" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 885295 886080 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250031900.1"; gene_id "LTnewLTref_250031900"; CM024311.1 . transcript 887068 888912 . + . transcript_id "LTnewLTref_250032000.1"; gene_id "LTnewLTref_250032000:pseudogene" CM024311.1 . exon 887068 888912 . + . transcript_id "LTnewLTref_250032000.1"; gene_id "LTnewLTref_250032000:pseudogene"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 890084 890740 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_250032100.1"; gene_id "LTnewLTref_250032100" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 890084 890617 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250032100.1"; gene_id "LTnewLTref_250032100"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 890669 890740 0.5 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250032100.1"; gene_id "LTnewLTref_250032100"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 891555 891857 1 + . transcript_id "LTnewLTref_250032200.1"; gene_id "LTnewLTref_250032200" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 891555 891857 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250032200.1"; gene_id "LTnewLTref_250032200"; CM024311.1 AUGUSTUS transcript 893673 895462 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_250032300.1"; gene_id "LTnewLTref_250032300" CM024311.1 AUGUSTUS CDS 893673 893702 0.52 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250032300.1"; gene_id "LTnewLTref_250032300"; CM024311.1 AUGUSTUS CDS 894110 895462 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_250032300.1"; gene_id "LTnewLTref_250032300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 6142 7230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005000.1"; gene_id "LTnewLTref_260005000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 6142 7230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005000.1"; gene_id "LTnewLTref_260005000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 8458 8913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005100.1"; gene_id "LTnewLTref_260005100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 8458 8913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005100.1"; gene_id "LTnewLTref_260005100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 10126 13047 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005200.1"; gene_id "LTnewLTref_260005200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 10126 13047 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005200.1"; gene_id "LTnewLTref_260005200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 14108 14998 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005300.1"; gene_id "LTnewLTref_260005300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 14108 14998 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005300.1"; gene_id "LTnewLTref_260005300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 15780 16565 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005400.1"; gene_id "LTnewLTref_260005400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 15780 16565 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005400.1"; gene_id "LTnewLTref_260005400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 19046 19567 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_260005500.1"; gene_id "LTnewLTref_260005500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 19046 19087 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005500.1"; gene_id "LTnewLTref_260005500"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 19130 19567 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005500.1"; gene_id "LTnewLTref_260005500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 20102 21010 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005600.1"; gene_id "LTnewLTref_260005600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 20102 21010 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005600.1"; gene_id "LTnewLTref_260005600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 21397 22206 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005700.1"; gene_id "LTnewLTref_260005700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 21397 22206 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005700.1"; gene_id "LTnewLTref_260005700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 22870 23103 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005800.1"; gene_id "LTnewLTref_260005800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 22870 23103 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005800.1"; gene_id "LTnewLTref_260005800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 23597 24667 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260005900.1"; gene_id "LTnewLTref_260005900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 23597 24667 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260005900.1"; gene_id "LTnewLTref_260005900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 25446 26153 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006000.1"; gene_id "LTnewLTref_260006000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 25446 26153 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006000.1"; gene_id "LTnewLTref_260006000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 29088 29321 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006100.1"; gene_id "LTnewLTref_260006100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 29088 29321 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006100.1"; gene_id "LTnewLTref_260006100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 29814 30884 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006200.1"; gene_id "LTnewLTref_260006200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 29814 30884 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006200.1"; gene_id "LTnewLTref_260006200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 31632 32339 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006300.1"; gene_id "LTnewLTref_260006300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 31632 32339 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006300.1"; gene_id "LTnewLTref_260006300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 34604 35317 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006400.1"; gene_id "LTnewLTref_260006400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 34604 35317 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006400.1"; gene_id "LTnewLTref_260006400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 36082 37878 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006500.1"; gene_id "LTnewLTref_260006500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 36082 37878 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006500.1"; gene_id "LTnewLTref_260006500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 41884 42756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006600.1"; gene_id "LTnewLTref_260006600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 41884 42756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006600.1"; gene_id "LTnewLTref_260006600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 48213 48971 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006700.1"; gene_id "LTnewLTref_260006700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 48213 48971 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006700.1"; gene_id "LTnewLTref_260006700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 49906 50664 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006800.1"; gene_id "LTnewLTref_260006800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 49906 50664 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006800.1"; gene_id "LTnewLTref_260006800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 52147 52632 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260006900.1"; gene_id "LTnewLTref_260006900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 52147 52632 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260006900.1"; gene_id "LTnewLTref_260006900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 53654 54508 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007000.1"; gene_id "LTnewLTref_260007000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 53654 54508 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007000.1"; gene_id "LTnewLTref_260007000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 56402 57622 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007100.1"; gene_id "LTnewLTref_260007100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 56402 57622 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007100.1"; gene_id "LTnewLTref_260007100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 58706 59827 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007200.1"; gene_id "LTnewLTref_260007200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 58706 59827 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007200.1"; gene_id "LTnewLTref_260007200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 60444 61388 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007300.1"; gene_id "LTnewLTref_260007300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 60444 61388 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007300.1"; gene_id "LTnewLTref_260007300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 62901 64037 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007400.1"; gene_id "LTnewLTref_260007400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 62901 64037 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007400.1"; gene_id "LTnewLTref_260007400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 65086 65634 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007500.1"; gene_id "LTnewLTref_260007500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 65086 65634 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007500.1"; gene_id "LTnewLTref_260007500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 66437 69820 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007600.1"; gene_id "LTnewLTref_260007600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 66437 69820 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007600.1"; gene_id "LTnewLTref_260007600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 70321 72345 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007700.1"; gene_id "LTnewLTref_260007700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 70321 72345 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007700.1"; gene_id "LTnewLTref_260007700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 73232 75049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007800.1"; gene_id "LTnewLTref_260007800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 73232 75049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007800.1"; gene_id "LTnewLTref_260007800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 75772 76380 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260007900.1"; gene_id "LTnewLTref_260007900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 75772 76380 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260007900.1"; gene_id "LTnewLTref_260007900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 77629 78444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008000.1"; gene_id "LTnewLTref_260008000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 77629 78444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008000.1"; gene_id "LTnewLTref_260008000"; CM024312.1 . transcript 79220 81882 . - . transcript_id "LTnewLTref_260008100.1"; gene_id "LTnewLTref_260008100:pseudogene" CM024312.1 . exon 79220 81882 . - . transcript_id "LTnewLTref_260008100.1"; gene_id "LTnewLTref_260008100:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 82772 84775 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008200.1"; gene_id "LTnewLTref_260008200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 82772 84775 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008200.1"; gene_id "LTnewLTref_260008200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 85597 86493 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008300.1"; gene_id "LTnewLTref_260008300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 85597 86493 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008300.1"; gene_id "LTnewLTref_260008300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 88200 89708 0.72 - . transcript_id "LTnewLTref_260008400.1"; gene_id "LTnewLTref_260008400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 88200 89708 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008400.1"; gene_id "LTnewLTref_260008400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 90959 91987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008500.1"; gene_id "LTnewLTref_260008500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 90959 91987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008500.1"; gene_id "LTnewLTref_260008500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 93180 95939 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008600.1"; gene_id "LTnewLTref_260008600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 93180 95939 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008600.1"; gene_id "LTnewLTref_260008600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 96915 102491 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008700.1"; gene_id "LTnewLTref_260008700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 96915 102491 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008700.1"; gene_id "LTnewLTref_260008700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 103330 105891 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008800.1"; gene_id "LTnewLTref_260008800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 103330 105891 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008800.1"; gene_id "LTnewLTref_260008800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 108337 109140 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260008900.1"; gene_id "LTnewLTref_260008900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 108337 109140 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260008900.1"; gene_id "LTnewLTref_260008900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 109858 111390 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009000.1"; gene_id "LTnewLTref_260009000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 109858 111390 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009000.1"; gene_id "LTnewLTref_260009000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 111899 113590 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009100.1"; gene_id "LTnewLTref_260009100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 111899 113590 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009100.1"; gene_id "LTnewLTref_260009100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 114460 114762 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009200.1"; gene_id "LTnewLTref_260009200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 114460 114762 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009200.1"; gene_id "LTnewLTref_260009200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 117219 119306 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009300.1"; gene_id "LTnewLTref_260009300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 117219 119306 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009300.1"; gene_id "LTnewLTref_260009300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 120532 121458 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009400.1"; gene_id "LTnewLTref_260009400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 120532 121458 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009400.1"; gene_id "LTnewLTref_260009400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 122719 123717 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009500.1"; gene_id "LTnewLTref_260009500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 122719 123717 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009500.1"; gene_id "LTnewLTref_260009500"; CM024312.1 Liftoff transcript 124641 125993 . - . transcript_id "LTnewLTref_260009600.1"; gene_id "LTnewLTref_260009600" CM024312.1 Liftoff CDS 124641 125993 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009600.1"; gene_id "LTnewLTref_260009600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 127496 127816 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009700.1"; gene_id "LTnewLTref_260009700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 127496 127816 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009700.1"; gene_id "LTnewLTref_260009700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 128892 131849 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009800.1"; gene_id "LTnewLTref_260009800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 128892 131849 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009800.1"; gene_id "LTnewLTref_260009800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 133092 134072 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260009900.1"; gene_id "LTnewLTref_260009900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 133092 134072 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260009900.1"; gene_id "LTnewLTref_260009900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 135657 137456 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010000.1"; gene_id "LTnewLTref_260010000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 135657 137456 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010000.1"; gene_id "LTnewLTref_260010000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 139038 140474 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010100.1"; gene_id "LTnewLTref_260010100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 139038 140474 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010100.1"; gene_id "LTnewLTref_260010100"; CM024312.1 . transcript 142194 143251 . - . transcript_id "LTnewLTref_260010200.1"; gene_id "LTnewLTref_260010200:pseudogene" CM024312.1 . exon 142194 143251 . - . transcript_id "LTnewLTref_260010200.1"; gene_id "LTnewLTref_260010200:pseudogene"; CM024312.1 . transcript 143316 145296 . - . transcript_id "LTnewLTref_260010300.1"; gene_id "LTnewLTref_260010300:pseudogene" CM024312.1 . exon 143316 145296 . - . transcript_id "LTnewLTref_260010300.1"; gene_id "LTnewLTref_260010300:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 145618 146397 0.27 - . transcript_id "LTnewLTref_260010400.1"; gene_id "LTnewLTref_260010400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 145618 145767 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010400.1"; gene_id "LTnewLTref_260010400"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 146248 146397 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010400.1"; gene_id "LTnewLTref_260010400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 146127 146397 0.23 - . transcript_id "LTnewLTref_260010400.2"; gene_id "LTnewLTref_260010400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 146127 146301 0.3 - 1 transcript_id "LTnewLTref_260010400.2"; gene_id "LTnewLTref_260010400"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 146345 146397 0.24 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010400.2"; gene_id "LTnewLTref_260010400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 147756 151223 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010500.1"; gene_id "LTnewLTref_260010500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 147756 151223 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010500.1"; gene_id "LTnewLTref_260010500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 152731 154509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010600.1"; gene_id "LTnewLTref_260010600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 152731 154509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010600.1"; gene_id "LTnewLTref_260010600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 155608 157716 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010700.1"; gene_id "LTnewLTref_260010700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 155608 157716 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010700.1"; gene_id "LTnewLTref_260010700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 158808 159260 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010800.1"; gene_id "LTnewLTref_260010800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 158808 159260 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010800.1"; gene_id "LTnewLTref_260010800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 160091 161824 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260010900.1"; gene_id "LTnewLTref_260010900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 160091 161824 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260010900.1"; gene_id "LTnewLTref_260010900"; CM024312.1 Liftoff transcript 164666 164860 . - . transcript_id "LTnewLTref_260011000.1"; gene_id "LTnewLTref_260011000" CM024312.1 Liftoff CDS 164666 164860 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011000.1"; gene_id "LTnewLTref_260011000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 165908 168017 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_260011100.1"; gene_id "LTnewLTref_260011100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 165908 167890 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011100.1"; gene_id "LTnewLTref_260011100"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 168000 168017 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011100.1"; gene_id "LTnewLTref_260011100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 168553 169551 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011200.1"; gene_id "LTnewLTref_260011200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 168553 169551 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011200.1"; gene_id "LTnewLTref_260011200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 171018 172205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011300.1"; gene_id "LTnewLTref_260011300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 171018 172205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011300.1"; gene_id "LTnewLTref_260011300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 174005 174307 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011400.1"; gene_id "LTnewLTref_260011400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 174005 174307 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011400.1"; gene_id "LTnewLTref_260011400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 175758 177002 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011500.1"; gene_id "LTnewLTref_260011500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 175758 177002 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011500.1"; gene_id "LTnewLTref_260011500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 179128 179430 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011600.1"; gene_id "LTnewLTref_260011600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 179128 179430 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011600.1"; gene_id "LTnewLTref_260011600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 180362 184735 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011700.1"; gene_id "LTnewLTref_260011700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 180362 184735 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011700.1"; gene_id "LTnewLTref_260011700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 186292 187425 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260011800.1"; gene_id "LTnewLTref_260011800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 186292 187425 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260011800.1"; gene_id "LTnewLTref_260011800"; CM024312.1 . transcript 188366 188863 . - . transcript_id "LTnewLTref_260011900.1"; gene_id "LTnewLTref_260011900:pseudogene" CM024312.1 . exon 188366 188863 . - . transcript_id "LTnewLTref_260011900.1"; gene_id "LTnewLTref_260011900:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 190030 190707 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012000.1"; gene_id "LTnewLTref_260012000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 190030 190707 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012000.1"; gene_id "LTnewLTref_260012000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 191802 192554 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012100.1"; gene_id "LTnewLTref_260012100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 191802 192554 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012100.1"; gene_id "LTnewLTref_260012100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 193517 195049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012200.1"; gene_id "LTnewLTref_260012200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 193517 195049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012200.1"; gene_id "LTnewLTref_260012200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 197121 199928 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012300.1"; gene_id "LTnewLTref_260012300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 197121 199928 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012300.1"; gene_id "LTnewLTref_260012300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 201954 205226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012400.1"; gene_id "LTnewLTref_260012400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 201954 205226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012400.1"; gene_id "LTnewLTref_260012400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 206256 212372 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012500.1"; gene_id "LTnewLTref_260012500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 206256 212372 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012500.1"; gene_id "LTnewLTref_260012500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 217182 219713 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012600.1"; gene_id "LTnewLTref_260012600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 217182 219713 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012600.1"; gene_id "LTnewLTref_260012600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 220940 226207 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012700.1"; gene_id "LTnewLTref_260012700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 220940 226207 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012700.1"; gene_id "LTnewLTref_260012700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 227014 227490 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260012800.1"; gene_id "LTnewLTref_260012800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 227014 227490 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012800.1"; gene_id "LTnewLTref_260012800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 228290 229924 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_260012900.1"; gene_id "LTnewLTref_260012900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 228290 229924 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260012900.1"; gene_id "LTnewLTref_260012900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 231116 231328 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013000.1"; gene_id "LTnewLTref_260013000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 231116 231328 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013000.1"; gene_id "LTnewLTref_260013000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 231926 232390 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013100.1"; gene_id "LTnewLTref_260013100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 231926 232390 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013100.1"; gene_id "LTnewLTref_260013100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 232995 233393 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013200.1"; gene_id "LTnewLTref_260013200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 232995 233393 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013200.1"; gene_id "LTnewLTref_260013200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 235732 236283 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013300.1"; gene_id "LTnewLTref_260013300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 235732 236283 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013300.1"; gene_id "LTnewLTref_260013300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 237844 238368 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013400.1"; gene_id "LTnewLTref_260013400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 237844 238368 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013400.1"; gene_id "LTnewLTref_260013400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 241019 242080 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013500.1"; gene_id "LTnewLTref_260013500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 241019 242080 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013500.1"; gene_id "LTnewLTref_260013500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 242920 246174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013600.1"; gene_id "LTnewLTref_260013600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 242920 246174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013600.1"; gene_id "LTnewLTref_260013600"; CM024312.1 Liftoff transcript 246698 247714 . - . transcript_id "LTnewLTref_260013700.1"; gene_id "LTnewLTref_260013700" CM024312.1 Liftoff CDS 246698 247714 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013700.1"; gene_id "LTnewLTref_260013700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 248924 251905 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260013800.1"; gene_id "LTnewLTref_260013800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 248924 251905 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013800.1"; gene_id "LTnewLTref_260013800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 253143 253430 0.53 - . transcript_id "LTnewLTref_260013900.1"; gene_id "LTnewLTref_260013900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 253143 253221 0.66 - 1 transcript_id "LTnewLTref_260013900.1"; gene_id "LTnewLTref_260013900"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 253294 253430 0.59 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260013900.1"; gene_id "LTnewLTref_260013900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 253654 256089 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_260014000.1"; gene_id "LTnewLTref_260014000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 253654 253715 0.91 - 2 transcript_id "LTnewLTref_260014000.1"; gene_id "LTnewLTref_260014000"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 253764 256089 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014000.1"; gene_id "LTnewLTref_260014000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 257777 258226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014100.1"; gene_id "LTnewLTref_260014100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 257777 258226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014100.1"; gene_id "LTnewLTref_260014100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 259310 259759 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014200.1"; gene_id "LTnewLTref_260014200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 259310 259759 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014200.1"; gene_id "LTnewLTref_260014200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 260935 263769 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014300.1"; gene_id "LTnewLTref_260014300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 260935 263769 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014300.1"; gene_id "LTnewLTref_260014300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 264986 266191 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014400.1"; gene_id "LTnewLTref_260014400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 264986 266191 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014400.1"; gene_id "LTnewLTref_260014400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 266958 267473 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014500.1"; gene_id "LTnewLTref_260014500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 266958 267473 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014500.1"; gene_id "LTnewLTref_260014500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 268597 270666 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014600.1"; gene_id "LTnewLTref_260014600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 268597 270666 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014600.1"; gene_id "LTnewLTref_260014600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 272368 274899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014700.1"; gene_id "LTnewLTref_260014700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 272368 274899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014700.1"; gene_id "LTnewLTref_260014700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 276725 278564 0.41 - . transcript_id "LTnewLTref_260014800.1"; gene_id "LTnewLTref_260014800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 276725 276837 0.55 - 2 transcript_id "LTnewLTref_260014800.1"; gene_id "LTnewLTref_260014800"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 276947 278564 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014800.1"; gene_id "LTnewLTref_260014800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 279385 284601 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260014900.1"; gene_id "LTnewLTref_260014900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 279385 284601 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260014900.1"; gene_id "LTnewLTref_260014900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 286261 287952 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260015000.1"; gene_id "LTnewLTref_260015000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 286261 287952 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260015000.1"; gene_id "LTnewLTref_260015000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 291198 295388 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260015100.1"; gene_id "LTnewLTref_260015100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 291198 295388 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260015100.1"; gene_id "LTnewLTref_260015100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 299695 301467 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260015200.1"; gene_id "LTnewLTref_260015200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 299695 301467 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260015200.1"; gene_id "LTnewLTref_260015200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 302242 303744 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260015300.1"; gene_id "LTnewLTref_260015300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 302242 303744 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260015300.1"; gene_id "LTnewLTref_260015300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 305089 306321 1 - . transcript_id "LTnewLTref_260015400.1"; gene_id "LTnewLTref_260015400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 305089 306321 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_260015400.1"; gene_id "LTnewLTref_260015400"; CM024312.1 Liftoff transcript 306741 306938 . - . transcript_id "LTnewLTref_260015500.1"; gene_id "LTnewLTref_260015500" CM024312.1 Liftoff CDS 306741 306938 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_260015500.1"; gene_id "LTnewLTref_260015500"; CM024312.1 Liftoff transcript 308190 320540 . + . transcript_id "LTnewLTref_260015600.1"; gene_id "LTnewLTref_260015600" CM024312.1 Liftoff CDS 308190 320540 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_260015600.1"; gene_id "LTnewLTref_260015600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 322016 324349 0.75 + . transcript_id "LTnewLTref_260015700.1"; gene_id "LTnewLTref_260015700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 322016 324280 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260015700.1"; gene_id "LTnewLTref_260015700"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 324332 324349 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260015700.1"; gene_id "LTnewLTref_260015700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 325966 327615 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260015800.1"; gene_id "LTnewLTref_260015800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 325966 327615 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260015800.1"; gene_id "LTnewLTref_260015800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 329951 330478 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260015900.1"; gene_id "LTnewLTref_260015900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 329951 330478 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260015900.1"; gene_id "LTnewLTref_260015900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 331996 332982 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016000.1"; gene_id "LTnewLTref_260016000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 331996 332982 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016000.1"; gene_id "LTnewLTref_260016000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 333627 335315 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016100.1"; gene_id "LTnewLTref_260016100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 333627 335315 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016100.1"; gene_id "LTnewLTref_260016100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 336481 342225 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016200.1"; gene_id "LTnewLTref_260016200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 336481 342225 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016200.1"; gene_id "LTnewLTref_260016200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 343146 344432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016300.1"; gene_id "LTnewLTref_260016300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 343146 344432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016300.1"; gene_id "LTnewLTref_260016300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 345196 345576 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016400.1"; gene_id "LTnewLTref_260016400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 345196 345576 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016400.1"; gene_id "LTnewLTref_260016400"; CM024312.1 . transcript 348210 360771 . + . transcript_id "LTnewLTref_260016500.1"; gene_id "LTnewLTref_260016500:pseudogene" CM024312.1 . exon 348210 360771 . + . transcript_id "LTnewLTref_260016500.1"; gene_id "LTnewLTref_260016500:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 361691 363091 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016600.1"; gene_id "LTnewLTref_260016600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 361691 363091 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016600.1"; gene_id "LTnewLTref_260016600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 364746 369932 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016700.1"; gene_id "LTnewLTref_260016700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 364746 369932 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016700.1"; gene_id "LTnewLTref_260016700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 372301 373920 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016800.1"; gene_id "LTnewLTref_260016800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 372301 373920 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016800.1"; gene_id "LTnewLTref_260016800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 375020 377404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260016900.1"; gene_id "LTnewLTref_260016900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 375020 377404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260016900.1"; gene_id "LTnewLTref_260016900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 378099 381029 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017000.1"; gene_id "LTnewLTref_260017000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 378099 381029 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017000.1"; gene_id "LTnewLTref_260017000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 381764 383347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017100.1"; gene_id "LTnewLTref_260017100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 381764 383347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017100.1"; gene_id "LTnewLTref_260017100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 384161 386212 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017200.1"; gene_id "LTnewLTref_260017200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 384161 386212 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017200.1"; gene_id "LTnewLTref_260017200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 387855 393116 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017300.1"; gene_id "LTnewLTref_260017300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 387855 393116 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017300.1"; gene_id "LTnewLTref_260017300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 393925 395883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017400.1"; gene_id "LTnewLTref_260017400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 393925 395883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017400.1"; gene_id "LTnewLTref_260017400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 396750 397991 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017500.1"; gene_id "LTnewLTref_260017500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 396750 397991 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017500.1"; gene_id "LTnewLTref_260017500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 398660 400666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017600.1"; gene_id "LTnewLTref_260017600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 398660 400666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017600.1"; gene_id "LTnewLTref_260017600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 402319 411633 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017700.1"; gene_id "LTnewLTref_260017700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 402319 411633 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017700.1"; gene_id "LTnewLTref_260017700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 412418 414343 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017800.1"; gene_id "LTnewLTref_260017800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 412418 414343 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017800.1"; gene_id "LTnewLTref_260017800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 416812 418908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260017900.1"; gene_id "LTnewLTref_260017900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 416812 418908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260017900.1"; gene_id "LTnewLTref_260017900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 424505 429454 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018000.1"; gene_id "LTnewLTref_260018000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 424505 429454 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018000.1"; gene_id "LTnewLTref_260018000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 430321 433017 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018100.1"; gene_id "LTnewLTref_260018100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 430321 433017 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018100.1"; gene_id "LTnewLTref_260018100"; CM024312.1 Liftoff transcript 434675 438289 . + . transcript_id "LTnewLTref_260018200.1"; gene_id "LTnewLTref_260018200" CM024312.1 Liftoff CDS 434675 438289 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018200.1"; gene_id "LTnewLTref_260018200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 438968 440740 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018300.1"; gene_id "LTnewLTref_260018300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 438968 440740 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018300.1"; gene_id "LTnewLTref_260018300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 441505 445074 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018400.1"; gene_id "LTnewLTref_260018400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 441505 445074 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018400.1"; gene_id "LTnewLTref_260018400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 446792 447820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018500.1"; gene_id "LTnewLTref_260018500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 446792 447820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018500.1"; gene_id "LTnewLTref_260018500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 449360 450196 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018600.1"; gene_id "LTnewLTref_260018600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 449360 450196 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018600.1"; gene_id "LTnewLTref_260018600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 451155 452381 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018700.1"; gene_id "LTnewLTref_260018700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 451155 452381 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018700.1"; gene_id "LTnewLTref_260018700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 454005 455897 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018800.1"; gene_id "LTnewLTref_260018800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 454005 455897 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018800.1"; gene_id "LTnewLTref_260018800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 457905 459389 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260018900.1"; gene_id "LTnewLTref_260018900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 457905 459389 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260018900.1"; gene_id "LTnewLTref_260018900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 460388 462205 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019000.1"; gene_id "LTnewLTref_260019000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 460388 462205 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019000.1"; gene_id "LTnewLTref_260019000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 463258 465975 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019100.1"; gene_id "LTnewLTref_260019100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 463258 465975 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019100.1"; gene_id "LTnewLTref_260019100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 466839 467423 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019200.1"; gene_id "LTnewLTref_260019200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 466839 467423 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019200.1"; gene_id "LTnewLTref_260019200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 468733 472077 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019300.1"; gene_id "LTnewLTref_260019300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 468733 472077 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019300.1"; gene_id "LTnewLTref_260019300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 474196 475941 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019400.1"; gene_id "LTnewLTref_260019400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 474196 475941 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019400.1"; gene_id "LTnewLTref_260019400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 477711 479321 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019500.1"; gene_id "LTnewLTref_260019500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 477711 479321 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019500.1"; gene_id "LTnewLTref_260019500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 481971 489233 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019600.1"; gene_id "LTnewLTref_260019600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 481971 489233 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019600.1"; gene_id "LTnewLTref_260019600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 492161 495607 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019700.1"; gene_id "LTnewLTref_260019700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 492161 495607 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019700.1"; gene_id "LTnewLTref_260019700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 498365 500713 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019800.1"; gene_id "LTnewLTref_260019800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 498365 500713 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019800.1"; gene_id "LTnewLTref_260019800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 505825 509949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260019900.1"; gene_id "LTnewLTref_260019900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 505825 509949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260019900.1"; gene_id "LTnewLTref_260019900"; CM024312.1 Liftoff transcript 511677 511907 . + . transcript_id "LTnewLTref_260020000.1"; gene_id "LTnewLTref_260020000" CM024312.1 Liftoff CDS 511677 511907 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020000.1"; gene_id "LTnewLTref_260020000"; CM024312.1 . transcript 513327 513630 . + . transcript_id "LTnewLTref_260020100.1"; gene_id "LTnewLTref_260020100:pseudogene" CM024312.1 . exon 513327 513630 . + . transcript_id "LTnewLTref_260020100.1"; gene_id "LTnewLTref_260020100:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 514258 515274 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020200.1"; gene_id "LTnewLTref_260020200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 514258 515274 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020200.1"; gene_id "LTnewLTref_260020200"; CM024312.1 . transcript 517086 519222 . + . transcript_id "LTnewLTref_260020300.1"; gene_id "LTnewLTref_260020300:pseudogene" CM024312.1 . exon 517086 519222 . + . transcript_id "LTnewLTref_260020300.1"; gene_id "LTnewLTref_260020300:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 520144 523203 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020400.1"; gene_id "LTnewLTref_260020400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 520144 523203 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020400.1"; gene_id "LTnewLTref_260020400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 524853 526820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020500.1"; gene_id "LTnewLTref_260020500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 524853 526820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020500.1"; gene_id "LTnewLTref_260020500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 528808 529107 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020600.1"; gene_id "LTnewLTref_260020600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 528808 529107 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020600.1"; gene_id "LTnewLTref_260020600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 531866 532276 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020700.1"; gene_id "LTnewLTref_260020700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 531866 532276 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020700.1"; gene_id "LTnewLTref_260020700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 538000 542703 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020800.1"; gene_id "LTnewLTref_260020800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 538000 542703 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020800.1"; gene_id "LTnewLTref_260020800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 539512 542703 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_260020800.2"; gene_id "LTnewLTref_260020800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 539512 542703 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020800.2"; gene_id "LTnewLTref_260020800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 544921 546126 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260020900.1"; gene_id "LTnewLTref_260020900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 544921 546126 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260020900.1"; gene_id "LTnewLTref_260020900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 546905 547570 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021000.1"; gene_id "LTnewLTref_260021000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 546905 547570 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021000.1"; gene_id "LTnewLTref_260021000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 549194 550387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021100.1"; gene_id "LTnewLTref_260021100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 549194 550387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021100.1"; gene_id "LTnewLTref_260021100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 551609 554050 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021200.1"; gene_id "LTnewLTref_260021200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 551609 554050 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021200.1"; gene_id "LTnewLTref_260021200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 556737 562352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021300.1"; gene_id "LTnewLTref_260021300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 556737 562352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021300.1"; gene_id "LTnewLTref_260021300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 566941 568998 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021400.1"; gene_id "LTnewLTref_260021400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 566941 568998 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021400.1"; gene_id "LTnewLTref_260021400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 570576 572336 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021500.1"; gene_id "LTnewLTref_260021500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 570576 572336 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021500.1"; gene_id "LTnewLTref_260021500"; CM024312.1 . transcript 573045 574835 . + . transcript_id "LTnewLTref_260021600.1"; gene_id "LTnewLTref_260021600:pseudogene" CM024312.1 . exon 573045 574835 . + . transcript_id "LTnewLTref_260021600.1"; gene_id "LTnewLTref_260021600:pseudogene"; CM024312.1 . transcript 577384 579494 . + . transcript_id "LTnewLTref_260021700.1"; gene_id "LTnewLTref_260021700:pseudogene" CM024312.1 . exon 577384 579494 . + . transcript_id "LTnewLTref_260021700.1"; gene_id "LTnewLTref_260021700:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 580669 582354 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021800.1"; gene_id "LTnewLTref_260021800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 580669 582354 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021800.1"; gene_id "LTnewLTref_260021800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 586977 588272 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260021900.1"; gene_id "LTnewLTref_260021900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 586977 588272 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260021900.1"; gene_id "LTnewLTref_260021900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 589446 589709 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022000.1"; gene_id "LTnewLTref_260022000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 589446 589709 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022000.1"; gene_id "LTnewLTref_260022000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 590380 590643 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022100.1"; gene_id "LTnewLTref_260022100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 590380 590643 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022100.1"; gene_id "LTnewLTref_260022100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 591477 592463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022200.1"; gene_id "LTnewLTref_260022200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 591477 592463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022200.1"; gene_id "LTnewLTref_260022200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 593279 595090 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022300.1"; gene_id "LTnewLTref_260022300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 593279 595090 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022300.1"; gene_id "LTnewLTref_260022300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 595291 596086 0.76 + . transcript_id "LTnewLTref_260022400.1"; gene_id "LTnewLTref_260022400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 595291 595386 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022400.1"; gene_id "LTnewLTref_260022400"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 595706 596086 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022400.1"; gene_id "LTnewLTref_260022400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 601840 602898 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_260022500.1"; gene_id "LTnewLTref_260022500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 601840 602898 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022500.1"; gene_id "LTnewLTref_260022500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 604336 605421 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022600.1"; gene_id "LTnewLTref_260022600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 604336 605421 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022600.1"; gene_id "LTnewLTref_260022600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 606058 606648 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022700.1"; gene_id "LTnewLTref_260022700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 606058 606648 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022700.1"; gene_id "LTnewLTref_260022700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 607478 607894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022800.1"; gene_id "LTnewLTref_260022800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 607478 607894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022800.1"; gene_id "LTnewLTref_260022800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 608584 610704 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260022900.1"; gene_id "LTnewLTref_260022900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 608584 610704 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260022900.1"; gene_id "LTnewLTref_260022900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 611927 615004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023000.1"; gene_id "LTnewLTref_260023000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 611927 615004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023000.1"; gene_id "LTnewLTref_260023000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 617460 617759 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023100.1"; gene_id "LTnewLTref_260023100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 617460 617759 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023100.1"; gene_id "LTnewLTref_260023100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 619642 621654 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023200.1"; gene_id "LTnewLTref_260023200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 619642 621654 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023200.1"; gene_id "LTnewLTref_260023200"; CM024312.1 Liftoff transcript 622690 624267 . + . transcript_id "LTnewLTref_260023300.1"; gene_id "LTnewLTref_260023300" CM024312.1 Liftoff CDS 622690 624267 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023300.1"; gene_id "LTnewLTref_260023300"; CM024312.1 . transcript 624658 626380 . + . transcript_id "LTnewLTref_260023400.1"; gene_id "LTnewLTref_260023400:pseudogene" CM024312.1 . exon 624658 626380 . + . transcript_id "LTnewLTref_260023400.1"; gene_id "LTnewLTref_260023400:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 627361 627681 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023500.1"; gene_id "LTnewLTref_260023500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 627361 627681 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023500.1"; gene_id "LTnewLTref_260023500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 628664 629809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023600.1"; gene_id "LTnewLTref_260023600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 628664 629809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023600.1"; gene_id "LTnewLTref_260023600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 630536 631174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023700.1"; gene_id "LTnewLTref_260023700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 630536 631174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023700.1"; gene_id "LTnewLTref_260023700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 656396 657385 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023800.1"; gene_id "LTnewLTref_260023800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 656396 657385 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023800.1"; gene_id "LTnewLTref_260023800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 658493 666799 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260023900.1"; gene_id "LTnewLTref_260023900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 658493 666799 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260023900.1"; gene_id "LTnewLTref_260023900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 667644 668498 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024000.1"; gene_id "LTnewLTref_260024000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 667644 668498 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024000.1"; gene_id "LTnewLTref_260024000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 670540 672372 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024100.1"; gene_id "LTnewLTref_260024100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 670540 672372 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024100.1"; gene_id "LTnewLTref_260024100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 677751 684974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024200.1"; gene_id "LTnewLTref_260024200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 677751 684974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024200.1"; gene_id "LTnewLTref_260024200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 686417 689041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024300.1"; gene_id "LTnewLTref_260024300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 686417 689041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024300.1"; gene_id "LTnewLTref_260024300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 690703 693666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024400.1"; gene_id "LTnewLTref_260024400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 690703 693666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024400.1"; gene_id "LTnewLTref_260024400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 695116 696372 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024500.1"; gene_id "LTnewLTref_260024500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 695116 696372 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024500.1"; gene_id "LTnewLTref_260024500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 697507 699213 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024600.1"; gene_id "LTnewLTref_260024600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 697507 699213 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024600.1"; gene_id "LTnewLTref_260024600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 702074 710923 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_260024700.1"; gene_id "LTnewLTref_260024700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 702074 710923 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024700.1"; gene_id "LTnewLTref_260024700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 711856 714060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024800.1"; gene_id "LTnewLTref_260024800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 711856 714060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024800.1"; gene_id "LTnewLTref_260024800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 718123 719076 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260024900.1"; gene_id "LTnewLTref_260024900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 718123 719076 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260024900.1"; gene_id "LTnewLTref_260024900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 720259 723927 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025000.1"; gene_id "LTnewLTref_260025000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 720259 723927 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025000.1"; gene_id "LTnewLTref_260025000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 725337 726317 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025100.1"; gene_id "LTnewLTref_260025100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 725337 726317 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025100.1"; gene_id "LTnewLTref_260025100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 728297 729214 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025200.1"; gene_id "LTnewLTref_260025200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 728297 729214 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025200.1"; gene_id "LTnewLTref_260025200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 730519 735960 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025300.1"; gene_id "LTnewLTref_260025300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 730519 735960 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025300.1"; gene_id "LTnewLTref_260025300"; CM024312.1 . transcript 737636 738703 . + . transcript_id "LTnewLTref_260025400.1"; gene_id "LTnewLTref_260025400:pseudogene" CM024312.1 . exon 737636 738703 . + . transcript_id "LTnewLTref_260025400.1"; gene_id "LTnewLTref_260025400:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 742096 749694 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025500.1"; gene_id "LTnewLTref_260025500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 742096 749694 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025500.1"; gene_id "LTnewLTref_260025500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 751696 754236 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025600.1"; gene_id "LTnewLTref_260025600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 751696 754236 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025600.1"; gene_id "LTnewLTref_260025600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 759747 761045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025700.1"; gene_id "LTnewLTref_260025700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 759747 761045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025700.1"; gene_id "LTnewLTref_260025700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 761812 762432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025800.1"; gene_id "LTnewLTref_260025800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 761812 762432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025800.1"; gene_id "LTnewLTref_260025800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 767481 768161 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260025900.1"; gene_id "LTnewLTref_260025900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 767481 768161 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260025900.1"; gene_id "LTnewLTref_260025900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 770633 771682 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026000.1"; gene_id "LTnewLTref_260026000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 770633 771682 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026000.1"; gene_id "LTnewLTref_260026000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 772850 775033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026100.1"; gene_id "LTnewLTref_260026100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 772850 775033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026100.1"; gene_id "LTnewLTref_260026100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 775884 776168 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026200.1"; gene_id "LTnewLTref_260026200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 775884 776168 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026200.1"; gene_id "LTnewLTref_260026200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 776990 779230 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026300.1"; gene_id "LTnewLTref_260026300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 776990 779230 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026300.1"; gene_id "LTnewLTref_260026300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 780179 781285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026400.1"; gene_id "LTnewLTref_260026400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 780179 781285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026400.1"; gene_id "LTnewLTref_260026400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 782683 785343 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_260026500.1"; gene_id "LTnewLTref_260026500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 782683 785343 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026500.1"; gene_id "LTnewLTref_260026500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 788070 791387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026600.1"; gene_id "LTnewLTref_260026600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 788070 791387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026600.1"; gene_id "LTnewLTref_260026600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 792657 796724 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026700.1"; gene_id "LTnewLTref_260026700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 792657 796724 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026700.1"; gene_id "LTnewLTref_260026700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 799920 800870 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026800.1"; gene_id "LTnewLTref_260026800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 799920 800870 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026800.1"; gene_id "LTnewLTref_260026800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 805702 806043 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260026900.1"; gene_id "LTnewLTref_260026900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 805702 806043 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260026900.1"; gene_id "LTnewLTref_260026900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 809633 812617 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027000.1"; gene_id "LTnewLTref_260027000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 809633 812617 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027000.1"; gene_id "LTnewLTref_260027000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 818763 824069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027100.1"; gene_id "LTnewLTref_260027100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 818763 824069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027100.1"; gene_id "LTnewLTref_260027100"; CM024312.1 . transcript 826234 838670 . + . transcript_id "LTnewLTref_260027200.1"; gene_id "LTnewLTref_260027200:pseudogene" CM024312.1 . exon 826234 838670 . + . transcript_id "LTnewLTref_260027200.1"; gene_id "LTnewLTref_260027200:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 839281 840048 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027300.1"; gene_id "LTnewLTref_260027300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 839281 840048 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027300.1"; gene_id "LTnewLTref_260027300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 841109 841450 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027400.1"; gene_id "LTnewLTref_260027400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 841109 841450 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027400.1"; gene_id "LTnewLTref_260027400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 842498 844174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027500.1"; gene_id "LTnewLTref_260027500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 842498 844174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027500.1"; gene_id "LTnewLTref_260027500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 846482 853264 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027600.1"; gene_id "LTnewLTref_260027600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 846482 853264 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027600.1"; gene_id "LTnewLTref_260027600"; CM024312.1 . transcript 862364 863709 . + . transcript_id "LTnewLTref_260027700.1"; gene_id "LTnewLTref_260027700:pseudogene" CM024312.1 . exon 862364 863709 . + . transcript_id "LTnewLTref_260027700.1"; gene_id "LTnewLTref_260027700:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 865876 870516 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027800.1"; gene_id "LTnewLTref_260027800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 865876 870516 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027800.1"; gene_id "LTnewLTref_260027800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 871214 872428 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260027900.1"; gene_id "LTnewLTref_260027900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 871214 872428 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260027900.1"; gene_id "LTnewLTref_260027900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 873724 874098 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028000.1"; gene_id "LTnewLTref_260028000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 873724 874098 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028000.1"; gene_id "LTnewLTref_260028000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 875181 876776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028100.1"; gene_id "LTnewLTref_260028100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 875181 876776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028100.1"; gene_id "LTnewLTref_260028100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 878316 880925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028200.1"; gene_id "LTnewLTref_260028200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 878316 880925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028200.1"; gene_id "LTnewLTref_260028200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 881663 881914 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028300.1"; gene_id "LTnewLTref_260028300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 881663 881914 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028300.1"; gene_id "LTnewLTref_260028300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 882943 884292 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028400.1"; gene_id "LTnewLTref_260028400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 882943 884292 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028400.1"; gene_id "LTnewLTref_260028400"; CM024312.1 . transcript 885171 886619 . + . transcript_id "LTnewLTref_260028500.1"; gene_id "LTnewLTref_260028500:pseudogene" CM024312.1 . exon 885171 886619 . + . transcript_id "LTnewLTref_260028500.1"; gene_id "LTnewLTref_260028500:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 887666 890143 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028600.1"; gene_id "LTnewLTref_260028600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 887666 890143 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028600.1"; gene_id "LTnewLTref_260028600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 891583 893802 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028700.1"; gene_id "LTnewLTref_260028700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 891583 893802 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028700.1"; gene_id "LTnewLTref_260028700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 894925 895728 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028800.1"; gene_id "LTnewLTref_260028800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 894925 895728 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028800.1"; gene_id "LTnewLTref_260028800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 897433 898272 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260028900.1"; gene_id "LTnewLTref_260028900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 897433 898272 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260028900.1"; gene_id "LTnewLTref_260028900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 898794 900011 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029000.1"; gene_id "LTnewLTref_260029000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 898794 900011 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029000.1"; gene_id "LTnewLTref_260029000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 900764 904489 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029100.1"; gene_id "LTnewLTref_260029100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 900764 904489 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029100.1"; gene_id "LTnewLTref_260029100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 905726 906088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029200.1"; gene_id "LTnewLTref_260029200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 905726 906088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029200.1"; gene_id "LTnewLTref_260029200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 907889 908734 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029300.1"; gene_id "LTnewLTref_260029300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 907889 908734 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029300.1"; gene_id "LTnewLTref_260029300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 909819 912014 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029400.1"; gene_id "LTnewLTref_260029400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 909819 912014 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029400.1"; gene_id "LTnewLTref_260029400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 913251 913634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029500.1"; gene_id "LTnewLTref_260029500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 913251 913634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029500.1"; gene_id "LTnewLTref_260029500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 914886 915269 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_260029600.1"; gene_id "LTnewLTref_260029600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 914886 915269 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029600.1"; gene_id "LTnewLTref_260029600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 916472 919057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029700.1"; gene_id "LTnewLTref_260029700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 916472 919057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029700.1"; gene_id "LTnewLTref_260029700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 920100 922172 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029800.1"; gene_id "LTnewLTref_260029800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 920100 922172 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029800.1"; gene_id "LTnewLTref_260029800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 924592 936543 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260029900.1"; gene_id "LTnewLTref_260029900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 924592 936543 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260029900.1"; gene_id "LTnewLTref_260029900"; CM024312.1 Liftoff transcript 937647 952943 . + . transcript_id "LTnewLTref_260030000.1"; gene_id "LTnewLTref_260030000" CM024312.1 Liftoff CDS 937647 952943 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030000.1"; gene_id "LTnewLTref_260030000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 955363 958140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030100.1"; gene_id "LTnewLTref_260030100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 955363 958140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030100.1"; gene_id "LTnewLTref_260030100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 958626 959309 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030200.1"; gene_id "LTnewLTref_260030200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 958626 959309 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030200.1"; gene_id "LTnewLTref_260030200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 960049 961377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030300.1"; gene_id "LTnewLTref_260030300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 960049 961377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030300.1"; gene_id "LTnewLTref_260030300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 962769 964703 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030400.1"; gene_id "LTnewLTref_260030400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 962769 964703 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030400.1"; gene_id "LTnewLTref_260030400"; CM024312.1 . transcript 966309 967317 . + . transcript_id "LTnewLTref_260030500.1"; gene_id "LTnewLTref_260030500:pseudogene" CM024312.1 . exon 966309 967317 . + . transcript_id "LTnewLTref_260030500.1"; gene_id "LTnewLTref_260030500:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 968783 972676 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030600.1"; gene_id "LTnewLTref_260030600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 968783 972676 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030600.1"; gene_id "LTnewLTref_260030600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 973350 974015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030700.1"; gene_id "LTnewLTref_260030700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 973350 974015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030700.1"; gene_id "LTnewLTref_260030700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 974688 976013 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030800.1"; gene_id "LTnewLTref_260030800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 974688 976013 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030800.1"; gene_id "LTnewLTref_260030800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 976871 977233 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260030900.1"; gene_id "LTnewLTref_260030900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 976871 977233 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260030900.1"; gene_id "LTnewLTref_260030900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 977847 978536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031000.1"; gene_id "LTnewLTref_260031000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 977847 978536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031000.1"; gene_id "LTnewLTref_260031000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 981193 985923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031100.1"; gene_id "LTnewLTref_260031100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 981193 985923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031100.1"; gene_id "LTnewLTref_260031100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 988456 989151 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_260031200.1"; gene_id "LTnewLTref_260031200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 988456 988626 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031200.1"; gene_id "LTnewLTref_260031200"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 988705 989151 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031200.1"; gene_id "LTnewLTref_260031200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 989376 989795 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031300.1"; gene_id "LTnewLTref_260031300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 989376 989795 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031300.1"; gene_id "LTnewLTref_260031300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 990663 991094 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031400.1"; gene_id "LTnewLTref_260031400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 990663 991094 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031400.1"; gene_id "LTnewLTref_260031400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 992252 993709 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031500.1"; gene_id "LTnewLTref_260031500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 992252 993709 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031500.1"; gene_id "LTnewLTref_260031500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 995366 996832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031600.1"; gene_id "LTnewLTref_260031600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 995366 996832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031600.1"; gene_id "LTnewLTref_260031600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 997915 999552 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_260031700.1"; gene_id "LTnewLTref_260031700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 997915 999466 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031700.1"; gene_id "LTnewLTref_260031700"; CM024312.1 AUGUSTUS CDS 999515 999552 0.49 + 2 transcript_id "LTnewLTref_260031700.1"; gene_id "LTnewLTref_260031700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1003034 1005400 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_260031800.1"; gene_id "LTnewLTref_260031800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1003034 1005400 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031800.1"; gene_id "LTnewLTref_260031800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1008006 1008290 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260031900.1"; gene_id "LTnewLTref_260031900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1008006 1008290 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260031900.1"; gene_id "LTnewLTref_260031900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1009825 1010085 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032000.1"; gene_id "LTnewLTref_260032000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1009825 1010085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032000.1"; gene_id "LTnewLTref_260032000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1011247 1012797 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032100.1"; gene_id "LTnewLTref_260032100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1011247 1012797 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032100.1"; gene_id "LTnewLTref_260032100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1013610 1014029 0.78 + . transcript_id "LTnewLTref_260032200.1"; gene_id "LTnewLTref_260032200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1013610 1014029 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032200.1"; gene_id "LTnewLTref_260032200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1015582 1016880 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032300.1"; gene_id "LTnewLTref_260032300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1015582 1016880 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032300.1"; gene_id "LTnewLTref_260032300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1018317 1018772 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032400.1"; gene_id "LTnewLTref_260032400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1018317 1018772 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032400.1"; gene_id "LTnewLTref_260032400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1020614 1023082 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032500.1"; gene_id "LTnewLTref_260032500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1020614 1023082 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032500.1"; gene_id "LTnewLTref_260032500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1024719 1025183 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032600.1"; gene_id "LTnewLTref_260032600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1024719 1025183 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032600.1"; gene_id "LTnewLTref_260032600"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1026054 1028528 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032700.1"; gene_id "LTnewLTref_260032700" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1026054 1028528 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032700.1"; gene_id "LTnewLTref_260032700"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1029498 1030862 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032800.1"; gene_id "LTnewLTref_260032800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1029498 1030862 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032800.1"; gene_id "LTnewLTref_260032800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1031925 1032758 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260032900.1"; gene_id "LTnewLTref_260032900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1031925 1032758 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260032900.1"; gene_id "LTnewLTref_260032900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1033440 1033682 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033000.1"; gene_id "LTnewLTref_260033000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1033440 1033682 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033000.1"; gene_id "LTnewLTref_260033000"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1035116 1036270 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033100.1"; gene_id "LTnewLTref_260033100" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1035116 1036270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033100.1"; gene_id "LTnewLTref_260033100"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1038995 1039213 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033200.1"; gene_id "LTnewLTref_260033200" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1038995 1039213 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033200.1"; gene_id "LTnewLTref_260033200"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1040148 1041899 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033300.1"; gene_id "LTnewLTref_260033300" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1040148 1041899 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033300.1"; gene_id "LTnewLTref_260033300"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1043978 1046479 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033400.1"; gene_id "LTnewLTref_260033400" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1043978 1046479 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033400.1"; gene_id "LTnewLTref_260033400"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1047852 1051655 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033500.1"; gene_id "LTnewLTref_260033500" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1047852 1051655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033500.1"; gene_id "LTnewLTref_260033500"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1055823 1056956 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033600.1"; gene_id "LTnewLTref_260033600" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1055823 1056956 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033600.1"; gene_id "LTnewLTref_260033600"; CM024312.1 . transcript 1059014 1059652 . + . transcript_id "LTnewLTref_260033700.1"; gene_id "LTnewLTref_260033700:pseudogene" CM024312.1 . exon 1059014 1059652 . + . transcript_id "LTnewLTref_260033700.1"; gene_id "LTnewLTref_260033700:pseudogene"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1062649 1063506 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_260033800.1"; gene_id "LTnewLTref_260033800" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1062649 1063506 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033800.1"; gene_id "LTnewLTref_260033800"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1063953 1064756 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260033900.1"; gene_id "LTnewLTref_260033900" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1063953 1064756 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260033900.1"; gene_id "LTnewLTref_260033900"; CM024312.1 AUGUSTUS transcript 1065543 1066337 1 + . transcript_id "LTnewLTref_260034000.1"; gene_id "LTnewLTref_260034000" CM024312.1 AUGUSTUS CDS 1065543 1066337 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_260034000.1"; gene_id "LTnewLTref_260034000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 2426 3823 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005000.1"; gene_id "LTnewLTref_270005000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 2426 3823 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005000.1"; gene_id "LTnewLTref_270005000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 4638 7727 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005100.1"; gene_id "LTnewLTref_270005100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 4638 7727 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005100.1"; gene_id "LTnewLTref_270005100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 8581 9591 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005200.1"; gene_id "LTnewLTref_270005200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 8581 9591 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005200.1"; gene_id "LTnewLTref_270005200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 10295 11578 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005300.1"; gene_id "LTnewLTref_270005300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 10295 11578 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005300.1"; gene_id "LTnewLTref_270005300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 12249 14612 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005400.1"; gene_id "LTnewLTref_270005400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 12249 14612 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005400.1"; gene_id "LTnewLTref_270005400"; CM024313.1 . transcript 15800 16170 . - . transcript_id "LTnewLTref_270005500.1"; gene_id "LTnewLTref_270005500:pseudogene" CM024313.1 . exon 15800 16170 . - . transcript_id "LTnewLTref_270005500.1"; gene_id "LTnewLTref_270005500:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 16464 17405 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005600.1"; gene_id "LTnewLTref_270005600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 16464 17405 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005600.1"; gene_id "LTnewLTref_270005600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 17874 18923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005700.1"; gene_id "LTnewLTref_270005700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 17874 18923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005700.1"; gene_id "LTnewLTref_270005700"; CM024313.1 . transcript 20107 21928 . - . transcript_id "LTnewLTref_270005800.1"; gene_id "LTnewLTref_270005800:pseudogene" CM024313.1 . exon 20107 21928 . - . transcript_id "LTnewLTref_270005800.1"; gene_id "LTnewLTref_270005800:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 23614 25596 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270005900.1"; gene_id "LTnewLTref_270005900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 23614 25596 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270005900.1"; gene_id "LTnewLTref_270005900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 26480 26737 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006000.1"; gene_id "LTnewLTref_270006000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 26480 26737 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006000.1"; gene_id "LTnewLTref_270006000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 28300 30201 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006100.1"; gene_id "LTnewLTref_270006100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 28300 30201 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006100.1"; gene_id "LTnewLTref_270006100"; CM024313.1 Liftoff transcript 31903 32358 . - . transcript_id "LTnewLTref_270006200.1"; gene_id "LTnewLTref_270006200" CM024313.1 Liftoff CDS 31903 32358 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006200.1"; gene_id "LTnewLTref_270006200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 33145 33876 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006300.1"; gene_id "LTnewLTref_270006300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 33145 33876 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006300.1"; gene_id "LTnewLTref_270006300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 35701 36357 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006400.1"; gene_id "LTnewLTref_270006400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 35701 36357 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006400.1"; gene_id "LTnewLTref_270006400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 37731 38726 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006500.1"; gene_id "LTnewLTref_270006500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 37731 38726 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006500.1"; gene_id "LTnewLTref_270006500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 40133 41545 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006600.1"; gene_id "LTnewLTref_270006600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 40133 41545 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006600.1"; gene_id "LTnewLTref_270006600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 42387 42926 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006700.1"; gene_id "LTnewLTref_270006700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 42387 42926 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006700.1"; gene_id "LTnewLTref_270006700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 43976 44692 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006800.1"; gene_id "LTnewLTref_270006800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 43976 44692 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006800.1"; gene_id "LTnewLTref_270006800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 45555 46673 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270006900.1"; gene_id "LTnewLTref_270006900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 45555 46673 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270006900.1"; gene_id "LTnewLTref_270006900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 47416 48285 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007000.1"; gene_id "LTnewLTref_270007000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 47416 48285 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007000.1"; gene_id "LTnewLTref_270007000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 49898 50842 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007100.1"; gene_id "LTnewLTref_270007100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 49898 50842 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007100.1"; gene_id "LTnewLTref_270007100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 51678 52241 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007200.1"; gene_id "LTnewLTref_270007200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 51678 52241 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007200.1"; gene_id "LTnewLTref_270007200"; CM024313.1 Liftoff transcript 60027 60266 . - . transcript_id "LTnewLTref_270007300.1"; gene_id "LTnewLTref_270007300" CM024313.1 Liftoff CDS 60027 60266 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007300.1"; gene_id "LTnewLTref_270007300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 61089 62276 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007400.1"; gene_id "LTnewLTref_270007400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 61089 62276 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007400.1"; gene_id "LTnewLTref_270007400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 62920 63906 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007500.1"; gene_id "LTnewLTref_270007500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 62920 63906 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007500.1"; gene_id "LTnewLTref_270007500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 66108 69425 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007600.1"; gene_id "LTnewLTref_270007600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 66108 69425 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007600.1"; gene_id "LTnewLTref_270007600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 70274 70726 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270007700.1"; gene_id "LTnewLTref_270007700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 70274 70726 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270007700.1"; gene_id "LTnewLTref_270007700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 74338 76509 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270007800.1"; gene_id "LTnewLTref_270007800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 74338 76509 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270007800.1"; gene_id "LTnewLTref_270007800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 78477 82163 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270007900.1"; gene_id "LTnewLTref_270007900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 78477 82163 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270007900.1"; gene_id "LTnewLTref_270007900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 83668 85152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008000.1"; gene_id "LTnewLTref_270008000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 83668 85152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008000.1"; gene_id "LTnewLTref_270008000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 86028 88238 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008100.1"; gene_id "LTnewLTref_270008100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 86028 88238 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008100.1"; gene_id "LTnewLTref_270008100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 89242 90363 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008200.1"; gene_id "LTnewLTref_270008200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 89242 90363 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008200.1"; gene_id "LTnewLTref_270008200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 93655 95142 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008300.1"; gene_id "LTnewLTref_270008300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 93655 95142 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008300.1"; gene_id "LTnewLTref_270008300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 98448 100418 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008400.1"; gene_id "LTnewLTref_270008400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 98448 100418 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008400.1"; gene_id "LTnewLTref_270008400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 101271 101855 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008500.1"; gene_id "LTnewLTref_270008500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 101271 101855 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008500.1"; gene_id "LTnewLTref_270008500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 103174 107844 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008600.1"; gene_id "LTnewLTref_270008600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 103174 107844 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008600.1"; gene_id "LTnewLTref_270008600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 105181 107844 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008600.2"; gene_id "LTnewLTref_270008600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 105181 107844 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008600.2"; gene_id "LTnewLTref_270008600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 109397 111588 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_270008700.1"; gene_id "LTnewLTref_270008700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 109397 109647 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008700.1"; gene_id "LTnewLTref_270008700"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 109740 111588 0.99 + 1 transcript_id "LTnewLTref_270008700.1"; gene_id "LTnewLTref_270008700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 112555 112977 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008800.1"; gene_id "LTnewLTref_270008800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 112555 112977 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008800.1"; gene_id "LTnewLTref_270008800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 114175 115308 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270008900.1"; gene_id "LTnewLTref_270008900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 114175 115308 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270008900.1"; gene_id "LTnewLTref_270008900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 116578 117567 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270009000.1"; gene_id "LTnewLTref_270009000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 116578 117567 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009000.1"; gene_id "LTnewLTref_270009000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 119598 121430 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270009100.1"; gene_id "LTnewLTref_270009100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 119598 121430 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009100.1"; gene_id "LTnewLTref_270009100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 122842 124512 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270009200.1"; gene_id "LTnewLTref_270009200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 122842 124512 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009200.1"; gene_id "LTnewLTref_270009200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 126148 127140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270009300.1"; gene_id "LTnewLTref_270009300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 126148 127140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009300.1"; gene_id "LTnewLTref_270009300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 128127 129989 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270009400.1"; gene_id "LTnewLTref_270009400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 128127 129989 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009400.1"; gene_id "LTnewLTref_270009400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 132421 134487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270009500.1"; gene_id "LTnewLTref_270009500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 132421 134487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009500.1"; gene_id "LTnewLTref_270009500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 136714 137097 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_270009600.1"; gene_id "LTnewLTref_270009600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 136714 137097 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009600.1"; gene_id "LTnewLTref_270009600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 138955 140755 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_270009700.1"; gene_id "LTnewLTref_270009700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 138955 139401 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009700.1"; gene_id "LTnewLTref_270009700"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 139451 140755 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009700.1"; gene_id "LTnewLTref_270009700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 143273 160608 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_270009800.1"; gene_id "LTnewLTref_270009800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 143273 149967 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009800.1"; gene_id "LTnewLTref_270009800"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 150030 160608 0.82 + 1 transcript_id "LTnewLTref_270009800.1"; gene_id "LTnewLTref_270009800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 167460 185966 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_270009900.1"; gene_id "LTnewLTref_270009900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 167460 176012 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009900.1"; gene_id "LTnewLTref_270009900"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 176064 185966 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270009900.1"; gene_id "LTnewLTref_270009900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 196738 204837 0.88 + . transcript_id "LTnewLTref_270010000.1"; gene_id "LTnewLTref_270010000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 196738 204837 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010000.1"; gene_id "LTnewLTref_270010000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 204900 214853 0.88 + . transcript_id "LTnewLTref_270010100.1"; gene_id "LTnewLTref_270010100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 204900 214853 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010100.1"; gene_id "LTnewLTref_270010100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 217981 219057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010200.1"; gene_id "LTnewLTref_270010200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 217981 219057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010200.1"; gene_id "LTnewLTref_270010200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 220361 222145 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010300.1"; gene_id "LTnewLTref_270010300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 220361 222145 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010300.1"; gene_id "LTnewLTref_270010300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 223002 223631 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010400.1"; gene_id "LTnewLTref_270010400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 223002 223631 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010400.1"; gene_id "LTnewLTref_270010400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 225176 226258 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010500.1"; gene_id "LTnewLTref_270010500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 225176 226258 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010500.1"; gene_id "LTnewLTref_270010500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 227452 228435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010600.1"; gene_id "LTnewLTref_270010600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 227452 228435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010600.1"; gene_id "LTnewLTref_270010600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 229808 231457 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010700.1"; gene_id "LTnewLTref_270010700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 229808 231457 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010700.1"; gene_id "LTnewLTref_270010700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 232244 234334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010800.1"; gene_id "LTnewLTref_270010800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 232244 234334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010800.1"; gene_id "LTnewLTref_270010800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 235320 237101 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270010900.1"; gene_id "LTnewLTref_270010900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 235320 237101 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270010900.1"; gene_id "LTnewLTref_270010900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 239121 242090 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011000.1"; gene_id "LTnewLTref_270011000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 239121 242090 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011000.1"; gene_id "LTnewLTref_270011000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 242995 244383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011100.1"; gene_id "LTnewLTref_270011100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 242995 244383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011100.1"; gene_id "LTnewLTref_270011100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 246123 247562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011200.1"; gene_id "LTnewLTref_270011200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 246123 247562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011200.1"; gene_id "LTnewLTref_270011200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 248195 250867 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011300.1"; gene_id "LTnewLTref_270011300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 248195 250867 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011300.1"; gene_id "LTnewLTref_270011300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 252326 253270 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011400.1"; gene_id "LTnewLTref_270011400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 252326 253270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011400.1"; gene_id "LTnewLTref_270011400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 253976 254479 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011500.1"; gene_id "LTnewLTref_270011500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 253976 254479 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011500.1"; gene_id "LTnewLTref_270011500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 258871 260397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011600.1"; gene_id "LTnewLTref_270011600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 258871 260397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011600.1"; gene_id "LTnewLTref_270011600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 264877 266379 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011700.1"; gene_id "LTnewLTref_270011700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 264877 266379 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011700.1"; gene_id "LTnewLTref_270011700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 270939 272546 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270011800.1"; gene_id "LTnewLTref_270011800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 270939 272546 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011800.1"; gene_id "LTnewLTref_270011800"; CM024313.1 Liftoff transcript 274292 274495 . + . transcript_id "LTnewLTref_270011900.1"; gene_id "LTnewLTref_270011900" CM024313.1 Liftoff CDS 274292 274495 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270011900.1"; gene_id "LTnewLTref_270011900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 275434 276036 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_270012000.1"; gene_id "LTnewLTref_270012000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 275434 276036 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012000.1"; gene_id "LTnewLTref_270012000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 277244 279997 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012100.1"; gene_id "LTnewLTref_270012100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 277244 279997 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012100.1"; gene_id "LTnewLTref_270012100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 284589 285944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012200.1"; gene_id "LTnewLTref_270012200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 284589 285944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012200.1"; gene_id "LTnewLTref_270012200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 289221 290573 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012300.1"; gene_id "LTnewLTref_270012300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 289221 290573 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012300.1"; gene_id "LTnewLTref_270012300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 292229 293464 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012400.1"; gene_id "LTnewLTref_270012400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 292229 293464 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012400.1"; gene_id "LTnewLTref_270012400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 293656 294225 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_270012500.1"; gene_id "LTnewLTref_270012500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 293656 294225 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012500.1"; gene_id "LTnewLTref_270012500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 294945 295934 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012600.1"; gene_id "LTnewLTref_270012600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 294945 295934 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012600.1"; gene_id "LTnewLTref_270012600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 296856 297436 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_270012700.1"; gene_id "LTnewLTref_270012700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 296856 297294 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012700.1"; gene_id "LTnewLTref_270012700"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 297372 297436 0.66 + 2 transcript_id "LTnewLTref_270012700.1"; gene_id "LTnewLTref_270012700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 298591 299196 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012800.1"; gene_id "LTnewLTref_270012800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 298591 299196 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012800.1"; gene_id "LTnewLTref_270012800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 301930 302262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270012900.1"; gene_id "LTnewLTref_270012900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 301930 302262 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270012900.1"; gene_id "LTnewLTref_270012900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 303093 303476 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013000.1"; gene_id "LTnewLTref_270013000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 303093 303476 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013000.1"; gene_id "LTnewLTref_270013000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 305458 306060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013100.1"; gene_id "LTnewLTref_270013100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 305458 306060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013100.1"; gene_id "LTnewLTref_270013100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 309050 313051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013200.1"; gene_id "LTnewLTref_270013200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 309050 313051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013200.1"; gene_id "LTnewLTref_270013200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 315551 316510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013300.1"; gene_id "LTnewLTref_270013300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 315551 316510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013300.1"; gene_id "LTnewLTref_270013300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 318723 321377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013400.1"; gene_id "LTnewLTref_270013400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 318723 321377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013400.1"; gene_id "LTnewLTref_270013400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 322569 323885 0.7 + . transcript_id "LTnewLTref_270013500.1"; gene_id "LTnewLTref_270013500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 322569 322578 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013500.1"; gene_id "LTnewLTref_270013500"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 322849 323885 0.75 + 2 transcript_id "LTnewLTref_270013500.1"; gene_id "LTnewLTref_270013500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 322827 323885 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_270013500.2"; gene_id "LTnewLTref_270013500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 322827 323885 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013500.2"; gene_id "LTnewLTref_270013500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 324597 324923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013600.1"; gene_id "LTnewLTref_270013600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 324597 324923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013600.1"; gene_id "LTnewLTref_270013600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 328343 338215 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013700.1"; gene_id "LTnewLTref_270013700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 328343 338215 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013700.1"; gene_id "LTnewLTref_270013700"; CM024313.1 Liftoff transcript 339197 340825 . + . transcript_id "LTnewLTref_270013800.1"; gene_id "LTnewLTref_270013800" CM024313.1 Liftoff CDS 339197 340825 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013800.1"; gene_id "LTnewLTref_270013800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 341810 344416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270013900.1"; gene_id "LTnewLTref_270013900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 341810 344416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270013900.1"; gene_id "LTnewLTref_270013900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 345259 347040 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270014000.1"; gene_id "LTnewLTref_270014000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 345259 347040 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270014000.1"; gene_id "LTnewLTref_270014000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 347835 350942 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270014100.1"; gene_id "LTnewLTref_270014100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 347835 350942 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270014100.1"; gene_id "LTnewLTref_270014100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 352926 355196 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270014200.1"; gene_id "LTnewLTref_270014200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 352926 355196 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270014200.1"; gene_id "LTnewLTref_270014200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 356514 357017 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270014300.1"; gene_id "LTnewLTref_270014300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 356514 357017 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270014300.1"; gene_id "LTnewLTref_270014300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 358633 361653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270014400.1"; gene_id "LTnewLTref_270014400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 358633 361653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270014400.1"; gene_id "LTnewLTref_270014400"; CM024313.1 . transcript 363967 369056 . + . transcript_id "LTnewLTref_270014500.1"; gene_id "LTnewLTref_270014500:pseudogene" CM024313.1 . exon 363967 369056 . + . transcript_id "LTnewLTref_270014500.1"; gene_id "LTnewLTref_270014500:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 371112 371702 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270014600.1"; gene_id "LTnewLTref_270014600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 371112 371702 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270014600.1"; gene_id "LTnewLTref_270014600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 374173 377448 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270014700.1"; gene_id "LTnewLTref_270014700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 374173 377448 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270014700.1"; gene_id "LTnewLTref_270014700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 389397 390323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270014800.1"; gene_id "LTnewLTref_270014800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 389397 390323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270014800.1"; gene_id "LTnewLTref_270014800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 392431 393663 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270014900.1"; gene_id "LTnewLTref_270014900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 392431 393663 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270014900.1"; gene_id "LTnewLTref_270014900"; CM024313.1 . transcript 394594 396354 . - . transcript_id "LTnewLTref_270015000.1"; gene_id "LTnewLTref_270015000:pseudogene" CM024313.1 . exon 394594 396354 . - . transcript_id "LTnewLTref_270015000.1"; gene_id "LTnewLTref_270015000:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 399300 402038 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015100.1"; gene_id "LTnewLTref_270015100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 399300 402038 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015100.1"; gene_id "LTnewLTref_270015100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 403475 407776 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015200.1"; gene_id "LTnewLTref_270015200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 403475 407776 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015200.1"; gene_id "LTnewLTref_270015200"; CM024313.1 Liftoff transcript 408932 409327 . - . transcript_id "LTnewLTref_270015300.1"; gene_id "LTnewLTref_270015300" CM024313.1 Liftoff CDS 408932 409327 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015300.1"; gene_id "LTnewLTref_270015300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 414749 420262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015400.1"; gene_id "LTnewLTref_270015400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 414749 420262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015400.1"; gene_id "LTnewLTref_270015400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 425656 431297 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_270015500.1"; gene_id "LTnewLTref_270015500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 425656 428973 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015500.1"; gene_id "LTnewLTref_270015500"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 429021 431297 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015500.1"; gene_id "LTnewLTref_270015500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 434316 435158 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015600.1"; gene_id "LTnewLTref_270015600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 434316 435158 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015600.1"; gene_id "LTnewLTref_270015600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 435943 437082 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015700.1"; gene_id "LTnewLTref_270015700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 435943 437082 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015700.1"; gene_id "LTnewLTref_270015700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 438456 441260 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015800.1"; gene_id "LTnewLTref_270015800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 438456 441260 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015800.1"; gene_id "LTnewLTref_270015800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 442214 442834 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270015900.1"; gene_id "LTnewLTref_270015900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 442214 442834 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270015900.1"; gene_id "LTnewLTref_270015900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 443885 446653 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016000.1"; gene_id "LTnewLTref_270016000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 443885 446653 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016000.1"; gene_id "LTnewLTref_270016000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 448075 449331 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016100.1"; gene_id "LTnewLTref_270016100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 448075 449331 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016100.1"; gene_id "LTnewLTref_270016100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 450262 450702 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016200.1"; gene_id "LTnewLTref_270016200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 450262 450702 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016200.1"; gene_id "LTnewLTref_270016200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 451448 453448 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016300.1"; gene_id "LTnewLTref_270016300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 451448 453448 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016300.1"; gene_id "LTnewLTref_270016300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 455615 456937 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016400.1"; gene_id "LTnewLTref_270016400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 455615 456937 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016400.1"; gene_id "LTnewLTref_270016400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 458433 461426 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016500.1"; gene_id "LTnewLTref_270016500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 458433 461426 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016500.1"; gene_id "LTnewLTref_270016500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 463577 468286 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016600.1"; gene_id "LTnewLTref_270016600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 463577 468286 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016600.1"; gene_id "LTnewLTref_270016600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 470906 471499 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016700.1"; gene_id "LTnewLTref_270016700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 470906 471499 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016700.1"; gene_id "LTnewLTref_270016700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 472340 474280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016800.1"; gene_id "LTnewLTref_270016800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 472340 474280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016800.1"; gene_id "LTnewLTref_270016800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 475900 476604 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270016900.1"; gene_id "LTnewLTref_270016900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 475900 476604 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270016900.1"; gene_id "LTnewLTref_270016900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 477872 478537 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017000.1"; gene_id "LTnewLTref_270017000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 477872 478537 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017000.1"; gene_id "LTnewLTref_270017000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 482079 484514 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017100.1"; gene_id "LTnewLTref_270017100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 482079 484514 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017100.1"; gene_id "LTnewLTref_270017100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 487475 489226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017200.1"; gene_id "LTnewLTref_270017200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 487475 489226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017200.1"; gene_id "LTnewLTref_270017200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 491162 492622 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017300.1"; gene_id "LTnewLTref_270017300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 491162 492622 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017300.1"; gene_id "LTnewLTref_270017300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 493453 496413 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017400.1"; gene_id "LTnewLTref_270017400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 493453 496413 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017400.1"; gene_id "LTnewLTref_270017400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 497160 497885 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017500.1"; gene_id "LTnewLTref_270017500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 497160 497885 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017500.1"; gene_id "LTnewLTref_270017500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 500976 502244 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017600.1"; gene_id "LTnewLTref_270017600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 500976 502244 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017600.1"; gene_id "LTnewLTref_270017600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 505479 505802 0.7 - . transcript_id "LTnewLTref_270017700.1"; gene_id "LTnewLTref_270017700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 505479 505802 0.7 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017700.1"; gene_id "LTnewLTref_270017700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 509797 511044 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017800.1"; gene_id "LTnewLTref_270017800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 509797 511044 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017800.1"; gene_id "LTnewLTref_270017800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 514751 516418 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270017900.1"; gene_id "LTnewLTref_270017900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 514751 516418 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270017900.1"; gene_id "LTnewLTref_270017900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 519140 520375 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270018000.1"; gene_id "LTnewLTref_270018000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 519140 520375 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018000.1"; gene_id "LTnewLTref_270018000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 521662 523218 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270018100.1"; gene_id "LTnewLTref_270018100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 521662 523218 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018100.1"; gene_id "LTnewLTref_270018100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 524564 524860 0.7 - . transcript_id "LTnewLTref_270018200.1"; gene_id "LTnewLTref_270018200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 524564 524860 0.7 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018200.1"; gene_id "LTnewLTref_270018200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 526127 526811 0.49 - . transcript_id "LTnewLTref_270018300.1"; gene_id "LTnewLTref_270018300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 526127 526568 0.53 - 1 transcript_id "LTnewLTref_270018300.1"; gene_id "LTnewLTref_270018300"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 526771 526811 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018300.1"; gene_id "LTnewLTref_270018300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 529297 530262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270018400.1"; gene_id "LTnewLTref_270018400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 529297 530262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018400.1"; gene_id "LTnewLTref_270018400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 531507 533096 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270018500.1"; gene_id "LTnewLTref_270018500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 531507 533096 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018500.1"; gene_id "LTnewLTref_270018500"; CM024313.1 Liftoff transcript 533852 535096 . - . transcript_id "LTnewLTref_270018600.1"; gene_id "LTnewLTref_270018600" CM024313.1 Liftoff CDS 533852 535096 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270018600.1"; gene_id "LTnewLTref_270018600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 537480 539207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270018700.1"; gene_id "LTnewLTref_270018700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 537480 539207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270018700.1"; gene_id "LTnewLTref_270018700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 541809 542486 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270018800.1"; gene_id "LTnewLTref_270018800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 541809 542486 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270018800.1"; gene_id "LTnewLTref_270018800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 543104 544294 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270018900.1"; gene_id "LTnewLTref_270018900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 543104 544294 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270018900.1"; gene_id "LTnewLTref_270018900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 545158 545502 0.75 + . transcript_id "LTnewLTref_270019000.1"; gene_id "LTnewLTref_270019000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 545158 545268 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019000.1"; gene_id "LTnewLTref_270019000"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 545329 545502 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019000.1"; gene_id "LTnewLTref_270019000"; CM024313.1 . transcript 545756 546032 . + . transcript_id "LTnewLTref_270019100.1"; gene_id "LTnewLTref_270019100:pseudogene" CM024313.1 . exon 545756 546032 . + . transcript_id "LTnewLTref_270019100.1"; gene_id "LTnewLTref_270019100:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 547862 549451 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019200.1"; gene_id "LTnewLTref_270019200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 547862 549451 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019200.1"; gene_id "LTnewLTref_270019200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 552672 554750 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019300.1"; gene_id "LTnewLTref_270019300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 552672 554750 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019300.1"; gene_id "LTnewLTref_270019300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 556123 557916 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019400.1"; gene_id "LTnewLTref_270019400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 556123 557916 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019400.1"; gene_id "LTnewLTref_270019400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 559088 560389 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019500.1"; gene_id "LTnewLTref_270019500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 559088 560389 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019500.1"; gene_id "LTnewLTref_270019500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 563149 564231 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019600.1"; gene_id "LTnewLTref_270019600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 563149 564231 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019600.1"; gene_id "LTnewLTref_270019600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 567814 568761 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019700.1"; gene_id "LTnewLTref_270019700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 567814 568761 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019700.1"; gene_id "LTnewLTref_270019700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 570528 572588 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019800.1"; gene_id "LTnewLTref_270019800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 570528 572588 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019800.1"; gene_id "LTnewLTref_270019800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 575293 579864 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270019900.1"; gene_id "LTnewLTref_270019900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 575293 579864 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270019900.1"; gene_id "LTnewLTref_270019900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 581794 582765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020000.1"; gene_id "LTnewLTref_270020000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 581794 582765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020000.1"; gene_id "LTnewLTref_270020000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 584168 585139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020100.1"; gene_id "LTnewLTref_270020100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 584168 585139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020100.1"; gene_id "LTnewLTref_270020100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 586466 586900 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020200.1"; gene_id "LTnewLTref_270020200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 586466 586900 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020200.1"; gene_id "LTnewLTref_270020200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 588129 589256 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020300.1"; gene_id "LTnewLTref_270020300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 588129 589256 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020300.1"; gene_id "LTnewLTref_270020300"; CM024313.1 . transcript 591639 592306 . - . transcript_id "LTnewLTref_270020400.1"; gene_id "LTnewLTref_270020400:pseudogene" CM024313.1 . exon 591639 592166 . - . transcript_id "LTnewLTref_270020400.1"; gene_id "LTnewLTref_270020400:pseudogene"; CM024313.1 . exon 592169 592306 . - . transcript_id "LTnewLTref_270020400.1"; gene_id "LTnewLTref_270020400:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 593399 595318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020500.1"; gene_id "LTnewLTref_270020500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 593399 595318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020500.1"; gene_id "LTnewLTref_270020500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 596445 596735 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020600.1"; gene_id "LTnewLTref_270020600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 596445 596735 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020600.1"; gene_id "LTnewLTref_270020600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 597537 600254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020700.1"; gene_id "LTnewLTref_270020700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 597537 600254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020700.1"; gene_id "LTnewLTref_270020700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 601689 602336 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020800.1"; gene_id "LTnewLTref_270020800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 601689 602336 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020800.1"; gene_id "LTnewLTref_270020800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 605283 607841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270020900.1"; gene_id "LTnewLTref_270020900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 605283 607841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270020900.1"; gene_id "LTnewLTref_270020900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 609483 610487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021000.1"; gene_id "LTnewLTref_270021000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 609483 610487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021000.1"; gene_id "LTnewLTref_270021000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 611862 615905 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021100.1"; gene_id "LTnewLTref_270021100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 611862 615905 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021100.1"; gene_id "LTnewLTref_270021100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 618207 620300 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021200.1"; gene_id "LTnewLTref_270021200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 618207 620300 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021200.1"; gene_id "LTnewLTref_270021200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 622072 622545 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021300.1"; gene_id "LTnewLTref_270021300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 622072 622545 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021300.1"; gene_id "LTnewLTref_270021300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 623906 625318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021400.1"; gene_id "LTnewLTref_270021400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 623906 625318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021400.1"; gene_id "LTnewLTref_270021400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 625979 628210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021500.1"; gene_id "LTnewLTref_270021500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 625979 628210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021500.1"; gene_id "LTnewLTref_270021500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 629934 630263 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021600.1"; gene_id "LTnewLTref_270021600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 629934 630263 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021600.1"; gene_id "LTnewLTref_270021600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 631524 631803 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021700.1"; gene_id "LTnewLTref_270021700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 631524 631721 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021700.1"; gene_id "LTnewLTref_270021700"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 631786 631803 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021700.1"; gene_id "LTnewLTref_270021700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 631524 632288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021700.2"; gene_id "LTnewLTref_270021700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 631524 632288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021700.2"; gene_id "LTnewLTref_270021700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 633270 633674 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270021800.1"; gene_id "LTnewLTref_270021800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 633270 633674 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021800.1"; gene_id "LTnewLTref_270021800"; CM024313.1 Liftoff transcript 636295 641175 . + . transcript_id "LTnewLTref_270021900.1"; gene_id "LTnewLTref_270021900" CM024313.1 Liftoff CDS 636295 641175 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270021900.1"; gene_id "LTnewLTref_270021900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 642437 643743 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_270022000.1"; gene_id "LTnewLTref_270022000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 642437 643456 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022000.1"; gene_id "LTnewLTref_270022000"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 643525 643743 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022000.1"; gene_id "LTnewLTref_270022000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 644496 645941 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270022100.1"; gene_id "LTnewLTref_270022100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 644496 645941 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022100.1"; gene_id "LTnewLTref_270022100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 650197 651276 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_270022200.1"; gene_id "LTnewLTref_270022200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 650197 651276 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022200.1"; gene_id "LTnewLTref_270022200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 652540 653849 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_270022300.1"; gene_id "LTnewLTref_270022300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 652540 653562 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022300.1"; gene_id "LTnewLTref_270022300"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 653655 653849 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022300.1"; gene_id "LTnewLTref_270022300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 654590 656035 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270022400.1"; gene_id "LTnewLTref_270022400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 654590 656035 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022400.1"; gene_id "LTnewLTref_270022400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 661824 662480 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270022500.1"; gene_id "LTnewLTref_270022500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 661824 662480 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022500.1"; gene_id "LTnewLTref_270022500"; CM024313.1 Liftoff transcript 663139 663327 . + . transcript_id "LTnewLTref_270022600.1"; gene_id "LTnewLTref_270022600" CM024313.1 Liftoff CDS 663139 663327 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022600.1"; gene_id "LTnewLTref_270022600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 671034 671675 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270022700.1"; gene_id "LTnewLTref_270022700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 671034 671675 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022700.1"; gene_id "LTnewLTref_270022700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 672537 672872 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_270022800.1"; gene_id "LTnewLTref_270022800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 672537 672872 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022800.1"; gene_id "LTnewLTref_270022800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 676054 678579 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270022900.1"; gene_id "LTnewLTref_270022900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 676054 678579 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270022900.1"; gene_id "LTnewLTref_270022900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 680304 683051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023000.1"; gene_id "LTnewLTref_270023000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 680304 683051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023000.1"; gene_id "LTnewLTref_270023000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 685591 689463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023100.1"; gene_id "LTnewLTref_270023100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 685591 689463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023100.1"; gene_id "LTnewLTref_270023100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 690194 694072 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023200.1"; gene_id "LTnewLTref_270023200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 690194 694072 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023200.1"; gene_id "LTnewLTref_270023200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 695252 696643 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023300.1"; gene_id "LTnewLTref_270023300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 695252 696643 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023300.1"; gene_id "LTnewLTref_270023300"; CM024313.1 . transcript 698452 698771 . + . transcript_id "LTnewLTref_270023400.1"; gene_id "LTnewLTref_270023400:pseudogene" CM024313.1 . exon 698452 698771 . + . transcript_id "LTnewLTref_270023400.1"; gene_id "LTnewLTref_270023400:pseudogene"; CM024313.1 . transcript 698874 699350 . + . transcript_id "LTnewLTref_270023500.1"; gene_id "LTnewLTref_270023500:pseudogene" CM024313.1 . exon 698874 699350 . + . transcript_id "LTnewLTref_270023500.1"; gene_id "LTnewLTref_270023500:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 701070 702683 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023600.1"; gene_id "LTnewLTref_270023600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 701070 702683 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023600.1"; gene_id "LTnewLTref_270023600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 709423 711273 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023700.1"; gene_id "LTnewLTref_270023700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 709423 711273 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023700.1"; gene_id "LTnewLTref_270023700"; CM024313.1 Liftoff transcript 713776 716103 . + . transcript_id "LTnewLTref_270023800.1"; gene_id "LTnewLTref_270023800" CM024313.1 Liftoff CDS 713776 716103 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023800.1"; gene_id "LTnewLTref_270023800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 717151 718512 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270023900.1"; gene_id "LTnewLTref_270023900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 717151 718512 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270023900.1"; gene_id "LTnewLTref_270023900"; CM024313.1 Liftoff transcript 720026 720246 . + . transcript_id "LTnewLTref_270024000.1"; gene_id "LTnewLTref_270024000" CM024313.1 Liftoff CDS 720026 720246 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270024000.1"; gene_id "LTnewLTref_270024000"; CM024313.1 . transcript 720525 721331 . + . transcript_id "LTnewLTref_270024100.1"; gene_id "LTnewLTref_270024100:pseudogene" CM024313.1 . exon 720525 721331 . + . transcript_id "LTnewLTref_270024100.1"; gene_id "LTnewLTref_270024100:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 722524 723543 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270024200.1"; gene_id "LTnewLTref_270024200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 722524 723543 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270024200.1"; gene_id "LTnewLTref_270024200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 728977 742346 0.46 - . transcript_id "LTnewLTref_270024300.1"; gene_id "LTnewLTref_270024300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 728977 734055 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024300.1"; gene_id "LTnewLTref_270024300"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 734136 742346 0.64 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024300.1"; gene_id "LTnewLTref_270024300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 745572 747287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270024400.1"; gene_id "LTnewLTref_270024400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 745572 747287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024400.1"; gene_id "LTnewLTref_270024400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 750478 754650 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270024500.1"; gene_id "LTnewLTref_270024500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 750478 754650 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024500.1"; gene_id "LTnewLTref_270024500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 760455 762161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270024600.1"; gene_id "LTnewLTref_270024600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 760455 762161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024600.1"; gene_id "LTnewLTref_270024600"; CM024313.1 . transcript 763359 763711 . - . transcript_id "LTnewLTref_270024700.1"; gene_id "LTnewLTref_270024700:pseudogene" CM024313.1 . exon 763359 763472 . - . transcript_id "LTnewLTref_270024700.1"; gene_id "LTnewLTref_270024700:pseudogene"; CM024313.1 . exon 763475 763711 . - . transcript_id "LTnewLTref_270024700.1"; gene_id "LTnewLTref_270024700:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 765319 768456 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_270024800.1"; gene_id "LTnewLTref_270024800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 765319 768456 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024800.1"; gene_id "LTnewLTref_270024800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 765918 768456 0.37 - . transcript_id "LTnewLTref_270024800.2"; gene_id "LTnewLTref_270024800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 765918 766079 0.37 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024800.2"; gene_id "LTnewLTref_270024800"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 766123 768456 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024800.2"; gene_id "LTnewLTref_270024800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 772315 777531 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270024900.1"; gene_id "LTnewLTref_270024900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 772315 777531 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270024900.1"; gene_id "LTnewLTref_270024900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 780396 781973 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025000.1"; gene_id "LTnewLTref_270025000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 780396 781973 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025000.1"; gene_id "LTnewLTref_270025000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 784638 786215 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025100.1"; gene_id "LTnewLTref_270025100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 784638 786215 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025100.1"; gene_id "LTnewLTref_270025100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 788516 796930 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025200.1"; gene_id "LTnewLTref_270025200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 788516 796930 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025200.1"; gene_id "LTnewLTref_270025200"; CM024313.1 . transcript 795275 795496 . + . transcript_id "LTnewLTref_270025300.1"; gene_id "LTnewLTref_270025300:pseudogene" CM024313.1 . exon 795275 795496 . + . transcript_id "LTnewLTref_270025300.1"; gene_id "LTnewLTref_270025300:pseudogene"; CM024313.1 . transcript 795515 795736 . + . transcript_id "LTnewLTref_270025400.1"; gene_id "LTnewLTref_270025400:pseudogene" CM024313.1 . exon 795515 795736 . + . transcript_id "LTnewLTref_270025400.1"; gene_id "LTnewLTref_270025400:pseudogene"; CM024313.1 Liftoff transcript 796271 796483 . + . transcript_id "LTnewLTref_270025500.1"; gene_id "LTnewLTref_270025500" CM024313.1 Liftoff CDS 796271 796483 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_270025500.1"; gene_id "LTnewLTref_270025500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 797926 799044 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025600.1"; gene_id "LTnewLTref_270025600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 797926 799044 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025600.1"; gene_id "LTnewLTref_270025600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 799811 804985 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025700.1"; gene_id "LTnewLTref_270025700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 799811 804985 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025700.1"; gene_id "LTnewLTref_270025700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 807145 809484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025800.1"; gene_id "LTnewLTref_270025800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 807145 809484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025800.1"; gene_id "LTnewLTref_270025800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 810703 813297 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270025900.1"; gene_id "LTnewLTref_270025900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 810703 813297 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270025900.1"; gene_id "LTnewLTref_270025900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 815804 817762 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026000.1"; gene_id "LTnewLTref_270026000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 815804 817762 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026000.1"; gene_id "LTnewLTref_270026000"; CM024313.1 Liftoff transcript 818471 820465 . - . transcript_id "LTnewLTref_270026100.1"; gene_id "LTnewLTref_270026100" CM024313.1 Liftoff CDS 818471 820465 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026100.1"; gene_id "LTnewLTref_270026100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 821203 823779 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026200.1"; gene_id "LTnewLTref_270026200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 821203 823779 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026200.1"; gene_id "LTnewLTref_270026200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 825101 828913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026300.1"; gene_id "LTnewLTref_270026300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 825101 828913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026300.1"; gene_id "LTnewLTref_270026300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 827511 828913 0.57 - . transcript_id "LTnewLTref_270026300.2"; gene_id "LTnewLTref_270026300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 827511 827521 0.81 - 2 transcript_id "LTnewLTref_270026300.2"; gene_id "LTnewLTref_270026300"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 827593 828913 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026300.2"; gene_id "LTnewLTref_270026300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 830698 831435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026400.1"; gene_id "LTnewLTref_270026400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 830698 831435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026400.1"; gene_id "LTnewLTref_270026400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 832500 832922 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026500.1"; gene_id "LTnewLTref_270026500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 832500 832922 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026500.1"; gene_id "LTnewLTref_270026500"; CM024313.1 Liftoff transcript 833884 837711 . - . transcript_id "LTnewLTref_270026600.1"; gene_id "LTnewLTref_270026600" CM024313.1 Liftoff CDS 833884 837711 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026600.1"; gene_id "LTnewLTref_270026600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 842246 843310 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026700.1"; gene_id "LTnewLTref_270026700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 842246 843310 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026700.1"; gene_id "LTnewLTref_270026700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 844255 845034 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026800.1"; gene_id "LTnewLTref_270026800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 844255 845034 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026800.1"; gene_id "LTnewLTref_270026800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 846702 849569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270026900.1"; gene_id "LTnewLTref_270026900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 846702 849569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270026900.1"; gene_id "LTnewLTref_270026900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 850725 855263 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027000.1"; gene_id "LTnewLTref_270027000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 850725 855263 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027000.1"; gene_id "LTnewLTref_270027000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 856636 857928 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027100.1"; gene_id "LTnewLTref_270027100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 856636 857928 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027100.1"; gene_id "LTnewLTref_270027100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 859122 859457 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027200.1"; gene_id "LTnewLTref_270027200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 859122 859457 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027200.1"; gene_id "LTnewLTref_270027200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 860705 863479 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027300.1"; gene_id "LTnewLTref_270027300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 860705 863479 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027300.1"; gene_id "LTnewLTref_270027300"; CM024313.1 . transcript 864584 867808 . - . transcript_id "LTnewLTref_270027400.1"; gene_id "LTnewLTref_270027400:pseudogene" CM024313.1 . exon 864584 867808 . - . transcript_id "LTnewLTref_270027400.1"; gene_id "LTnewLTref_270027400:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 870857 871450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027500.1"; gene_id "LTnewLTref_270027500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 870857 871450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027500.1"; gene_id "LTnewLTref_270027500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 872340 874028 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027600.1"; gene_id "LTnewLTref_270027600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 872340 874028 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027600.1"; gene_id "LTnewLTref_270027600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 877092 878573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027700.1"; gene_id "LTnewLTref_270027700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 877092 878573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027700.1"; gene_id "LTnewLTref_270027700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 880011 881216 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027800.1"; gene_id "LTnewLTref_270027800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 880011 881216 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027800.1"; gene_id "LTnewLTref_270027800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 883858 885069 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270027900.1"; gene_id "LTnewLTref_270027900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 883858 885069 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270027900.1"; gene_id "LTnewLTref_270027900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 886238 886921 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028000.1"; gene_id "LTnewLTref_270028000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 886238 886921 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028000.1"; gene_id "LTnewLTref_270028000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 890340 891506 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028100.1"; gene_id "LTnewLTref_270028100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 890340 891506 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028100.1"; gene_id "LTnewLTref_270028100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 892457 893605 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028200.1"; gene_id "LTnewLTref_270028200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 892457 893605 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028200.1"; gene_id "LTnewLTref_270028200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 894842 897400 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028300.1"; gene_id "LTnewLTref_270028300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 894842 897400 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028300.1"; gene_id "LTnewLTref_270028300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 899618 899866 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028400.1"; gene_id "LTnewLTref_270028400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 899618 899866 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028400.1"; gene_id "LTnewLTref_270028400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 901671 902117 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028500.1"; gene_id "LTnewLTref_270028500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 901671 902117 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028500.1"; gene_id "LTnewLTref_270028500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 903583 904902 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028600.1"; gene_id "LTnewLTref_270028600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 903583 904902 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028600.1"; gene_id "LTnewLTref_270028600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 907530 910808 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028700.1"; gene_id "LTnewLTref_270028700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 907530 910808 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028700.1"; gene_id "LTnewLTref_270028700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 913966 914979 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028800.1"; gene_id "LTnewLTref_270028800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 913966 914979 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028800.1"; gene_id "LTnewLTref_270028800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 916895 922459 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270028900.1"; gene_id "LTnewLTref_270028900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 916895 922459 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028900.1"; gene_id "LTnewLTref_270028900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 921151 922459 0.61 - . transcript_id "LTnewLTref_270028900.2"; gene_id "LTnewLTref_270028900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 921151 921217 0.66 - 1 transcript_id "LTnewLTref_270028900.2"; gene_id "LTnewLTref_270028900"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 921324 922459 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270028900.2"; gene_id "LTnewLTref_270028900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 923807 924415 0.75 - . transcript_id "LTnewLTref_270029000.1"; gene_id "LTnewLTref_270029000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 923807 923823 0.83 - 2 transcript_id "LTnewLTref_270029000.1"; gene_id "LTnewLTref_270029000"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 923941 924415 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029000.1"; gene_id "LTnewLTref_270029000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 927375 930407 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029100.1"; gene_id "LTnewLTref_270029100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 927375 930407 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029100.1"; gene_id "LTnewLTref_270029100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 934837 935967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029200.1"; gene_id "LTnewLTref_270029200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 934837 935967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029200.1"; gene_id "LTnewLTref_270029200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 937543 942318 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029300.1"; gene_id "LTnewLTref_270029300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 937543 942318 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029300.1"; gene_id "LTnewLTref_270029300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 943437 944615 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029400.1"; gene_id "LTnewLTref_270029400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 943437 944615 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029400.1"; gene_id "LTnewLTref_270029400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 945824 946312 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029500.1"; gene_id "LTnewLTref_270029500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 945824 946312 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029500.1"; gene_id "LTnewLTref_270029500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 947310 948029 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029600.1"; gene_id "LTnewLTref_270029600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 947310 948029 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029600.1"; gene_id "LTnewLTref_270029600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 950941 951999 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029700.1"; gene_id "LTnewLTref_270029700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 950941 951999 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029700.1"; gene_id "LTnewLTref_270029700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 953211 954248 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029800.1"; gene_id "LTnewLTref_270029800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 953211 954248 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029800.1"; gene_id "LTnewLTref_270029800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 955375 961752 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270029900.1"; gene_id "LTnewLTref_270029900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 955375 961752 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270029900.1"; gene_id "LTnewLTref_270029900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 963423 963695 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030000.1"; gene_id "LTnewLTref_270030000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 963423 963695 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030000.1"; gene_id "LTnewLTref_270030000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 964723 967017 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030100.1"; gene_id "LTnewLTref_270030100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 964723 967017 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030100.1"; gene_id "LTnewLTref_270030100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 967995 969194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030200.1"; gene_id "LTnewLTref_270030200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 967995 969194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030200.1"; gene_id "LTnewLTref_270030200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 969817 973245 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030300.1"; gene_id "LTnewLTref_270030300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 969817 973245 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030300.1"; gene_id "LTnewLTref_270030300"; CM024313.1 Liftoff transcript 975165 977261 . - . transcript_id "LTnewLTref_270030400.1"; gene_id "LTnewLTref_270030400" CM024313.1 Liftoff CDS 975165 977261 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030400.1"; gene_id "LTnewLTref_270030400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 978889 980604 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030500.1"; gene_id "LTnewLTref_270030500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 978889 980604 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030500.1"; gene_id "LTnewLTref_270030500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 982755 984914 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030600.1"; gene_id "LTnewLTref_270030600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 982755 984914 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030600.1"; gene_id "LTnewLTref_270030600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 986202 988295 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030700.1"; gene_id "LTnewLTref_270030700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 986202 988295 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030700.1"; gene_id "LTnewLTref_270030700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 989125 989673 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030800.1"; gene_id "LTnewLTref_270030800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 989125 989673 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030800.1"; gene_id "LTnewLTref_270030800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 990256 990999 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270030900.1"; gene_id "LTnewLTref_270030900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 990256 990999 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270030900.1"; gene_id "LTnewLTref_270030900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 991873 992817 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270031000.1"; gene_id "LTnewLTref_270031000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 991873 992817 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270031000.1"; gene_id "LTnewLTref_270031000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 993391 994569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270031100.1"; gene_id "LTnewLTref_270031100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 993391 994569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270031100.1"; gene_id "LTnewLTref_270031100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 994949 995431 1 - . transcript_id "LTnewLTref_270031200.1"; gene_id "LTnewLTref_270031200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 994949 995431 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270031200.1"; gene_id "LTnewLTref_270031200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 995744 996994 0.45 - . transcript_id "LTnewLTref_270031300.1"; gene_id "LTnewLTref_270031300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 995744 996994 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_270031300.1"; gene_id "LTnewLTref_270031300"; CM024313.1 INFERNAL transcript 1011502 1013707 982 + . transcript_id "LTnewLTref_270031400:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031400" CM024313.1 INFERNAL exon 1011502 1013707 . + . transcript_id "LTnewLTref_270031400:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031400"; CM024313.1 INFERNAL transcript 1013937 1014104 108 + . transcript_id "LTnewLTref_270031500:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031500" CM024313.1 INFERNAL exon 1013937 1014104 . + . transcript_id "LTnewLTref_270031500:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031500"; CM024313.1 INFERNAL transcript 1022780 1024982 990 + . transcript_id "LTnewLTref_270031600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031600" CM024313.1 INFERNAL exon 1022780 1024982 . + . transcript_id "LTnewLTref_270031600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031600"; CM024313.1 INFERNAL transcript 1025224 1025391 108 + . transcript_id "LTnewLTref_270031700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031700" CM024313.1 INFERNAL exon 1025224 1025391 . + . transcript_id "LTnewLTref_270031700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031700"; CM024313.1 INFERNAL transcript 1033397 1035599 990 + . transcript_id "LTnewLTref_270031800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031800" CM024313.1 INFERNAL exon 1033397 1035599 . + . transcript_id "LTnewLTref_270031800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031800"; CM024313.1 INFERNAL transcript 1035842 1036009 108 + . transcript_id "LTnewLTref_270031900:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031900" CM024313.1 INFERNAL exon 1035842 1036009 . + . transcript_id "LTnewLTref_270031900:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_270031900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1042388 1043857 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032000.1"; gene_id "LTnewLTref_270032000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1042388 1043857 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032000.1"; gene_id "LTnewLTref_270032000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1044661 1045323 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032100.1"; gene_id "LTnewLTref_270032100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1044661 1045323 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032100.1"; gene_id "LTnewLTref_270032100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1045727 1046881 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032200.1"; gene_id "LTnewLTref_270032200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1045727 1046881 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032200.1"; gene_id "LTnewLTref_270032200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1047347 1047808 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032300.1"; gene_id "LTnewLTref_270032300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1047347 1047808 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032300.1"; gene_id "LTnewLTref_270032300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1048146 1048487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032400.1"; gene_id "LTnewLTref_270032400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1048146 1048487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032400.1"; gene_id "LTnewLTref_270032400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1049080 1050549 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032500.1"; gene_id "LTnewLTref_270032500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1049080 1050549 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032500.1"; gene_id "LTnewLTref_270032500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1051531 1052721 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032600.1"; gene_id "LTnewLTref_270032600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1051531 1052721 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032600.1"; gene_id "LTnewLTref_270032600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1054812 1055930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032700.1"; gene_id "LTnewLTref_270032700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1054812 1055930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032700.1"; gene_id "LTnewLTref_270032700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1056413 1057255 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032800.1"; gene_id "LTnewLTref_270032800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1056413 1057255 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032800.1"; gene_id "LTnewLTref_270032800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1057867 1059519 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270032900.1"; gene_id "LTnewLTref_270032900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1057867 1059519 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270032900.1"; gene_id "LTnewLTref_270032900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1059949 1060674 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033000.1"; gene_id "LTnewLTref_270033000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1059949 1060674 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033000.1"; gene_id "LTnewLTref_270033000"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1061197 1062540 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033100.1"; gene_id "LTnewLTref_270033100" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1061197 1062540 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033100.1"; gene_id "LTnewLTref_270033100"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1063276 1064175 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033200.1"; gene_id "LTnewLTref_270033200" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1063276 1064175 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033200.1"; gene_id "LTnewLTref_270033200"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1064864 1066546 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033300.1"; gene_id "LTnewLTref_270033300" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1064864 1066546 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033300.1"; gene_id "LTnewLTref_270033300"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1068235 1069776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033400.1"; gene_id "LTnewLTref_270033400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1068235 1069776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033400.1"; gene_id "LTnewLTref_270033400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1070376 1071806 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033500.1"; gene_id "LTnewLTref_270033500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1070376 1071806 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033500.1"; gene_id "LTnewLTref_270033500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1072433 1072846 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033600.1"; gene_id "LTnewLTref_270033600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1072433 1072846 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033600.1"; gene_id "LTnewLTref_270033600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1073642 1086658 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033700.1"; gene_id "LTnewLTref_270033700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1073642 1086658 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033700.1"; gene_id "LTnewLTref_270033700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1089902 1091716 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270033800.1"; gene_id "LTnewLTref_270033800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1089902 1091716 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033800.1"; gene_id "LTnewLTref_270033800"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1092530 1093893 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_270033900.1"; gene_id "LTnewLTref_270033900" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1092530 1093500 0.4 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270033900.1"; gene_id "LTnewLTref_270033900"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1093563 1093893 0.4 + 1 transcript_id "LTnewLTref_270033900.1"; gene_id "LTnewLTref_270033900"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1094681 1097485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270034000.1"; gene_id "LTnewLTref_270034000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1094681 1097485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270034000.1"; gene_id "LTnewLTref_270034000"; CM024313.1 . transcript 1095266 1096018 . - . transcript_id "LTnewLTref_270034100.1"; gene_id "LTnewLTref_270034100" CM024313.1 . CDS 1095266 1096018 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_270034100.1"; gene_id "LTnewLTref_270034100"; CM024313.1 . transcript 1096733 1097485 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034200.1"; gene_id "LTnewLTref_270034200:pseudogene" CM024313.1 . exon 1096733 1097485 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034200.1"; gene_id "LTnewLTref_270034200:pseudogene"; CM024313.1 . transcript 1099479 1101564 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034300.1"; gene_id "LTnewLTref_270034300:pseudogene" CM024313.1 . exon 1099479 1100195 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034300.1"; gene_id "LTnewLTref_270034300:pseudogene"; CM024313.1 . exon 1100197 1101564 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034300.1"; gene_id "LTnewLTref_270034300:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1104149 1104694 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_270034400.1"; gene_id "LTnewLTref_270034400" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1104149 1104694 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270034400.1"; gene_id "LTnewLTref_270034400"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1105104 1105598 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270034500.1"; gene_id "LTnewLTref_270034500" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1105104 1105598 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270034500.1"; gene_id "LTnewLTref_270034500"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1105819 1106241 0.81 + . transcript_id "LTnewLTref_270034600.1"; gene_id "LTnewLTref_270034600" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1105819 1106241 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270034600.1"; gene_id "LTnewLTref_270034600"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1107505 1108884 1 + . transcript_id "LTnewLTref_270034700.1"; gene_id "LTnewLTref_270034700" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1107505 1108884 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270034700.1"; gene_id "LTnewLTref_270034700"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1109022 1109544 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_270034800.1"; gene_id "LTnewLTref_270034800" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1109022 1109184 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_270034800.1"; gene_id "LTnewLTref_270034800"; CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1109267 1109544 0.98 + 2 transcript_id "LTnewLTref_270034800.1"; gene_id "LTnewLTref_270034800"; CM024313.1 . transcript 1111353 1112151 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034900.1"; gene_id "LTnewLTref_270034900:pseudogene" CM024313.1 . exon 1111353 1111907 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034900.1"; gene_id "LTnewLTref_270034900:pseudogene"; CM024313.1 . exon 1111910 1111969 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034900.1"; gene_id "LTnewLTref_270034900:pseudogene"; CM024313.1 . exon 1111972 1112151 . + . transcript_id "LTnewLTref_270034900.1"; gene_id "LTnewLTref_270034900:pseudogene"; CM024313.1 AUGUSTUS transcript 1114048 1114241 0.65 - . transcript_id "LTnewLTref_270035000.1"; gene_id "LTnewLTref_270035000" CM024313.1 AUGUSTUS CDS 1114048 1114241 0.65 - 2 transcript_id "LTnewLTref_270035000.1"; gene_id "LTnewLTref_270035000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1167 1425 0.76 + . transcript_id "LTnewLTref_280005000.1"; gene_id "LTnewLTref_280005000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1167 1425 0.88 + 1 transcript_id "LTnewLTref_280005000.1"; gene_id "LTnewLTref_280005000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 5713 7365 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005100.1"; gene_id "LTnewLTref_280005100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 5713 7365 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005100.1"; gene_id "LTnewLTref_280005100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 7987 8388 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005200.1"; gene_id "LTnewLTref_280005200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 7987 8388 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005200.1"; gene_id "LTnewLTref_280005200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 8932 10227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005300.1"; gene_id "LTnewLTref_280005300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 8932 10227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005300.1"; gene_id "LTnewLTref_280005300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 10656 13364 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005400.1"; gene_id "LTnewLTref_280005400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 10656 13364 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005400.1"; gene_id "LTnewLTref_280005400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 14108 15646 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005500.1"; gene_id "LTnewLTref_280005500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 14108 15646 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005500.1"; gene_id "LTnewLTref_280005500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 16427 17884 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005600.1"; gene_id "LTnewLTref_280005600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 16427 17884 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005600.1"; gene_id "LTnewLTref_280005600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 18449 20023 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005700.1"; gene_id "LTnewLTref_280005700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 18449 20023 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005700.1"; gene_id "LTnewLTref_280005700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 20643 26831 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280005800.1"; gene_id "LTnewLTref_280005800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 20643 26831 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005800.1"; gene_id "LTnewLTref_280005800"; CM024314.1 Liftoff transcript 28107 28430 . + . transcript_id "LTnewLTref_280005900.1"; gene_id "LTnewLTref_280005900" CM024314.1 Liftoff CDS 28107 28430 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280005900.1"; gene_id "LTnewLTref_280005900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 29735 31768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006000.1"; gene_id "LTnewLTref_280006000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 29735 31768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006000.1"; gene_id "LTnewLTref_280006000"; CM024314.1 Liftoff transcript 32873 33106 . + . transcript_id "LTnewLTref_280006100.1"; gene_id "LTnewLTref_280006100" CM024314.1 Liftoff CDS 32873 33106 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006100.1"; gene_id "LTnewLTref_280006100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 34021 34638 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006200.1"; gene_id "LTnewLTref_280006200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 34021 34638 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006200.1"; gene_id "LTnewLTref_280006200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 35697 36119 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006300.1"; gene_id "LTnewLTref_280006300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 35697 36119 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006300.1"; gene_id "LTnewLTref_280006300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 36863 37411 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006400.1"; gene_id "LTnewLTref_280006400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 36863 37411 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006400.1"; gene_id "LTnewLTref_280006400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 38225 42610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006500.1"; gene_id "LTnewLTref_280006500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 38225 42610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006500.1"; gene_id "LTnewLTref_280006500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 44637 46223 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006600.1"; gene_id "LTnewLTref_280006600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 44637 46223 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006600.1"; gene_id "LTnewLTref_280006600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 47232 48140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006700.1"; gene_id "LTnewLTref_280006700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 47232 48140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006700.1"; gene_id "LTnewLTref_280006700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 50376 51650 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280006800.1"; gene_id "LTnewLTref_280006800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 50376 51650 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006800.1"; gene_id "LTnewLTref_280006800"; CM024314.1 Liftoff transcript 52925 53563 . + . transcript_id "LTnewLTref_280006900.1"; gene_id "LTnewLTref_280006900" CM024314.1 Liftoff CDS 52925 53563 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280006900.1"; gene_id "LTnewLTref_280006900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 55700 57475 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007000.1"; gene_id "LTnewLTref_280007000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 55700 57475 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007000.1"; gene_id "LTnewLTref_280007000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 63026 64885 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007100.1"; gene_id "LTnewLTref_280007100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 63026 64885 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007100.1"; gene_id "LTnewLTref_280007100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 67404 67832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007200.1"; gene_id "LTnewLTref_280007200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 67404 67832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007200.1"; gene_id "LTnewLTref_280007200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 70944 72011 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007300.1"; gene_id "LTnewLTref_280007300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 70944 72011 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007300.1"; gene_id "LTnewLTref_280007300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 73131 74165 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007400.1"; gene_id "LTnewLTref_280007400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 73131 74165 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007400.1"; gene_id "LTnewLTref_280007400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 76966 78792 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007500.1"; gene_id "LTnewLTref_280007500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 76966 78792 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007500.1"; gene_id "LTnewLTref_280007500"; CM024314.1 Liftoff transcript 79206 79430 . + . transcript_id "LTnewLTref_280007600.1"; gene_id "LTnewLTref_280007600" CM024314.1 Liftoff CDS 79206 79430 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007600.1"; gene_id "LTnewLTref_280007600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 83106 83999 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007700.1"; gene_id "LTnewLTref_280007700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 83106 83999 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007700.1"; gene_id "LTnewLTref_280007700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 85362 88802 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007800.1"; gene_id "LTnewLTref_280007800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 85362 88802 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007800.1"; gene_id "LTnewLTref_280007800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 90143 90892 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280007900.1"; gene_id "LTnewLTref_280007900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 90143 90892 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280007900.1"; gene_id "LTnewLTref_280007900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 92491 93159 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008000.1"; gene_id "LTnewLTref_280008000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 92491 93159 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008000.1"; gene_id "LTnewLTref_280008000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 93806 94564 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008100.1"; gene_id "LTnewLTref_280008100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 93806 94564 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008100.1"; gene_id "LTnewLTref_280008100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 95441 97432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008200.1"; gene_id "LTnewLTref_280008200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 95441 97432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008200.1"; gene_id "LTnewLTref_280008200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 98588 99619 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008300.1"; gene_id "LTnewLTref_280008300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 98588 99619 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008300.1"; gene_id "LTnewLTref_280008300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 100553 101581 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008400.1"; gene_id "LTnewLTref_280008400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 100553 101581 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008400.1"; gene_id "LTnewLTref_280008400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 102638 105607 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008500.1"; gene_id "LTnewLTref_280008500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 102638 105607 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008500.1"; gene_id "LTnewLTref_280008500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 106900 110361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008600.1"; gene_id "LTnewLTref_280008600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 106900 110361 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008600.1"; gene_id "LTnewLTref_280008600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 111974 112702 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280008700.1"; gene_id "LTnewLTref_280008700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 111974 112702 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280008700.1"; gene_id "LTnewLTref_280008700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 113332 114195 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280008800.1"; gene_id "LTnewLTref_280008800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 113332 114195 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280008800.1"; gene_id "LTnewLTref_280008800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 115183 115797 0.68 - . transcript_id "LTnewLTref_280008900.1"; gene_id "LTnewLTref_280008900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 115183 115797 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280008900.1"; gene_id "LTnewLTref_280008900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 116461 117639 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009000.1"; gene_id "LTnewLTref_280009000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 116461 117639 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009000.1"; gene_id "LTnewLTref_280009000"; CM024314.1 . transcript 118072 118296 . - . transcript_id "LTnewLTref_280009100.1"; gene_id "LTnewLTref_280009100:pseudogene" CM024314.1 . exon 118072 118296 . - . transcript_id "LTnewLTref_280009100.1"; gene_id "LTnewLTref_280009100:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 120277 123066 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009200.1"; gene_id "LTnewLTref_280009200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 120277 123066 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009200.1"; gene_id "LTnewLTref_280009200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 124186 125778 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009300.1"; gene_id "LTnewLTref_280009300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 124186 125778 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009300.1"; gene_id "LTnewLTref_280009300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 135245 137305 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009400.1"; gene_id "LTnewLTref_280009400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 135245 137305 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009400.1"; gene_id "LTnewLTref_280009400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 141183 142556 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009500.1"; gene_id "LTnewLTref_280009500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 141183 142556 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009500.1"; gene_id "LTnewLTref_280009500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 143432 144712 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009600.1"; gene_id "LTnewLTref_280009600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 143432 144712 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009600.1"; gene_id "LTnewLTref_280009600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 145488 147812 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009700.1"; gene_id "LTnewLTref_280009700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 145488 147812 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009700.1"; gene_id "LTnewLTref_280009700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 148433 151261 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009800.1"; gene_id "LTnewLTref_280009800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 148433 151261 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009800.1"; gene_id "LTnewLTref_280009800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 151991 152926 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280009900.1"; gene_id "LTnewLTref_280009900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 151991 152926 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280009900.1"; gene_id "LTnewLTref_280009900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 154306 156696 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010000.1"; gene_id "LTnewLTref_280010000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 154306 156696 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010000.1"; gene_id "LTnewLTref_280010000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 158344 160230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010100.1"; gene_id "LTnewLTref_280010100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 158344 160230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010100.1"; gene_id "LTnewLTref_280010100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 161843 162526 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010200.1"; gene_id "LTnewLTref_280010200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 161843 162526 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010200.1"; gene_id "LTnewLTref_280010200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 164547 166115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010300.1"; gene_id "LTnewLTref_280010300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 164547 166115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010300.1"; gene_id "LTnewLTref_280010300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 173970 176108 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010400.1"; gene_id "LTnewLTref_280010400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 173970 176108 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010400.1"; gene_id "LTnewLTref_280010400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 180192 181349 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010500.1"; gene_id "LTnewLTref_280010500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 180192 181349 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010500.1"; gene_id "LTnewLTref_280010500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 182942 183847 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010600.1"; gene_id "LTnewLTref_280010600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 182942 183847 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010600.1"; gene_id "LTnewLTref_280010600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 184868 188950 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010700.1"; gene_id "LTnewLTref_280010700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 184868 188950 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010700.1"; gene_id "LTnewLTref_280010700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 189950 190288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010800.1"; gene_id "LTnewLTref_280010800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 189950 190288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010800.1"; gene_id "LTnewLTref_280010800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 191856 192986 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280010900.1"; gene_id "LTnewLTref_280010900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 191856 192986 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280010900.1"; gene_id "LTnewLTref_280010900"; CM024314.1 Liftoff transcript 198051 198275 . - . transcript_id "LTnewLTref_280011000.1"; gene_id "LTnewLTref_280011000" CM024314.1 Liftoff CDS 198051 198275 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011000.1"; gene_id "LTnewLTref_280011000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 200648 201508 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011100.1"; gene_id "LTnewLTref_280011100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 200648 201508 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011100.1"; gene_id "LTnewLTref_280011100"; CM024314.1 . transcript 202616 202794 . - . transcript_id "LTnewLTref_280011200.1"; gene_id "LTnewLTref_280011200:pseudogene" CM024314.1 . exon 202616 202794 . - . transcript_id "LTnewLTref_280011200.1"; gene_id "LTnewLTref_280011200:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 203651 205351 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011300.1"; gene_id "LTnewLTref_280011300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 203651 205351 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011300.1"; gene_id "LTnewLTref_280011300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 207215 211936 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011400.1"; gene_id "LTnewLTref_280011400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 207215 211936 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011400.1"; gene_id "LTnewLTref_280011400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 216267 217838 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011500.1"; gene_id "LTnewLTref_280011500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 216267 217838 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011500.1"; gene_id "LTnewLTref_280011500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 218722 219009 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011600.1"; gene_id "LTnewLTref_280011600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 218722 219009 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011600.1"; gene_id "LTnewLTref_280011600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 220954 233769 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011700.1"; gene_id "LTnewLTref_280011700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 220954 233769 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011700.1"; gene_id "LTnewLTref_280011700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 235270 239217 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011800.1"; gene_id "LTnewLTref_280011800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 235270 239217 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011800.1"; gene_id "LTnewLTref_280011800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 242319 242978 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280011900.1"; gene_id "LTnewLTref_280011900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 242319 242978 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280011900.1"; gene_id "LTnewLTref_280011900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 244410 244616 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012000.1"; gene_id "LTnewLTref_280012000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 244410 244616 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012000.1"; gene_id "LTnewLTref_280012000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 245798 246877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012100.1"; gene_id "LTnewLTref_280012100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 245798 246877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012100.1"; gene_id "LTnewLTref_280012100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 247986 249008 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012200.1"; gene_id "LTnewLTref_280012200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 247986 249008 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012200.1"; gene_id "LTnewLTref_280012200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 250901 252424 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_280012300.1"; gene_id "LTnewLTref_280012300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 250901 252424 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012300.1"; gene_id "LTnewLTref_280012300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 253460 254245 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012400.1"; gene_id "LTnewLTref_280012400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 253460 254245 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012400.1"; gene_id "LTnewLTref_280012400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 256595 257500 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012500.1"; gene_id "LTnewLTref_280012500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 256595 257500 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012500.1"; gene_id "LTnewLTref_280012500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 259730 261157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012600.1"; gene_id "LTnewLTref_280012600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 259730 261157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012600.1"; gene_id "LTnewLTref_280012600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 262545 263297 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012700.1"; gene_id "LTnewLTref_280012700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 262545 263297 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012700.1"; gene_id "LTnewLTref_280012700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 264484 266241 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012800.1"; gene_id "LTnewLTref_280012800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 264484 266241 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012800.1"; gene_id "LTnewLTref_280012800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 267559 269241 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280012900.1"; gene_id "LTnewLTref_280012900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 267559 269241 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280012900.1"; gene_id "LTnewLTref_280012900"; CM024314.1 Liftoff transcript 270370 270930 . - . transcript_id "LTnewLTref_280013000.1"; gene_id "LTnewLTref_280013000" CM024314.1 Liftoff CDS 270370 270930 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_280013000.1"; gene_id "LTnewLTref_280013000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 272269 273570 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280013100.1"; gene_id "LTnewLTref_280013100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 272269 273570 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280013100.1"; gene_id "LTnewLTref_280013100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 275414 276082 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280013200.1"; gene_id "LTnewLTref_280013200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 275414 276082 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280013200.1"; gene_id "LTnewLTref_280013200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 277675 280041 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280013300.1"; gene_id "LTnewLTref_280013300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 277675 280041 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280013300.1"; gene_id "LTnewLTref_280013300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 280596 282035 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_280013400.1"; gene_id "LTnewLTref_280013400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 280596 281011 0.95 - 2 transcript_id "LTnewLTref_280013400.1"; gene_id "LTnewLTref_280013400"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 281534 282035 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280013400.1"; gene_id "LTnewLTref_280013400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 284239 285606 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280013500.1"; gene_id "LTnewLTref_280013500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 284239 285606 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280013500.1"; gene_id "LTnewLTref_280013500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 286046 287935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280013600.1"; gene_id "LTnewLTref_280013600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 286046 287935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280013600.1"; gene_id "LTnewLTref_280013600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 288595 289059 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280013700.1"; gene_id "LTnewLTref_280013700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 288595 289059 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280013700.1"; gene_id "LTnewLTref_280013700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 290024 290473 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280013800.1"; gene_id "LTnewLTref_280013800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 290024 290473 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280013800.1"; gene_id "LTnewLTref_280013800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 291288 292796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280013900.1"; gene_id "LTnewLTref_280013900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 291288 292796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280013900.1"; gene_id "LTnewLTref_280013900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 293872 294630 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014000.1"; gene_id "LTnewLTref_280014000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 293872 294630 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014000.1"; gene_id "LTnewLTref_280014000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 295854 296285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014100.1"; gene_id "LTnewLTref_280014100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 295854 296285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014100.1"; gene_id "LTnewLTref_280014100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 299608 301206 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014200.1"; gene_id "LTnewLTref_280014200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 299608 301206 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014200.1"; gene_id "LTnewLTref_280014200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 306621 307151 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014300.1"; gene_id "LTnewLTref_280014300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 306621 307151 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014300.1"; gene_id "LTnewLTref_280014300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 307851 310463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014400.1"; gene_id "LTnewLTref_280014400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 307851 310463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014400.1"; gene_id "LTnewLTref_280014400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 312039 314957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014500.1"; gene_id "LTnewLTref_280014500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 312039 314957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014500.1"; gene_id "LTnewLTref_280014500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 315627 317141 0.53 + . transcript_id "LTnewLTref_280014600.1"; gene_id "LTnewLTref_280014600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 315627 317141 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014600.1"; gene_id "LTnewLTref_280014600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 318162 319898 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014700.1"; gene_id "LTnewLTref_280014700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 318162 319898 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014700.1"; gene_id "LTnewLTref_280014700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 321454 321984 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014800.1"; gene_id "LTnewLTref_280014800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 321454 321984 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014800.1"; gene_id "LTnewLTref_280014800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 323523 325922 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280014900.1"; gene_id "LTnewLTref_280014900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 323523 325922 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280014900.1"; gene_id "LTnewLTref_280014900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 327856 328767 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015000.1"; gene_id "LTnewLTref_280015000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 327856 328767 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015000.1"; gene_id "LTnewLTref_280015000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 331022 335437 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015100.1"; gene_id "LTnewLTref_280015100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 331022 335437 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015100.1"; gene_id "LTnewLTref_280015100"; CM024314.1 . transcript 338396 338624 . + . transcript_id "LTnewLTref_280015200.1"; gene_id "LTnewLTref_280015200:pseudogene" CM024314.1 . exon 338396 338624 . + . transcript_id "LTnewLTref_280015200.1"; gene_id "LTnewLTref_280015200:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 340835 341404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015300.1"; gene_id "LTnewLTref_280015300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 340835 341404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015300.1"; gene_id "LTnewLTref_280015300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 342589 343824 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015400.1"; gene_id "LTnewLTref_280015400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 342589 343824 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015400.1"; gene_id "LTnewLTref_280015400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 345575 348496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015500.1"; gene_id "LTnewLTref_280015500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 345575 348496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015500.1"; gene_id "LTnewLTref_280015500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 349487 349867 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015600.1"; gene_id "LTnewLTref_280015600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 349487 349867 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015600.1"; gene_id "LTnewLTref_280015600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 350885 351319 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015700.1"; gene_id "LTnewLTref_280015700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 350885 351319 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015700.1"; gene_id "LTnewLTref_280015700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 352642 353139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015800.1"; gene_id "LTnewLTref_280015800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 352642 353139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015800.1"; gene_id "LTnewLTref_280015800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 353930 354652 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280015900.1"; gene_id "LTnewLTref_280015900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 353930 354652 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280015900.1"; gene_id "LTnewLTref_280015900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 357612 358058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280016000.1"; gene_id "LTnewLTref_280016000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 357612 358058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016000.1"; gene_id "LTnewLTref_280016000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 359079 359624 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_280016100.1"; gene_id "LTnewLTref_280016100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 359079 359624 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016100.1"; gene_id "LTnewLTref_280016100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 360721 361971 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280016200.1"; gene_id "LTnewLTref_280016200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 360721 361971 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016200.1"; gene_id "LTnewLTref_280016200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 365700 368873 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_280016300.1"; gene_id "LTnewLTref_280016300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 365700 368873 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016300.1"; gene_id "LTnewLTref_280016300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 369990 370340 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280016400.1"; gene_id "LTnewLTref_280016400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 369990 370340 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016400.1"; gene_id "LTnewLTref_280016400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 371541 373424 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280016500.1"; gene_id "LTnewLTref_280016500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 371541 373424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016500.1"; gene_id "LTnewLTref_280016500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 374530 374880 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280016600.1"; gene_id "LTnewLTref_280016600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 374530 374880 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016600.1"; gene_id "LTnewLTref_280016600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 375858 378392 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280016700.1"; gene_id "LTnewLTref_280016700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 375858 378392 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016700.1"; gene_id "LTnewLTref_280016700"; CM024314.1 Liftoff transcript 379436 381466 . + . transcript_id "LTnewLTref_280016800.1"; gene_id "LTnewLTref_280016800" CM024314.1 Liftoff CDS 379436 381466 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016800.1"; gene_id "LTnewLTref_280016800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 382688 383124 0.89 + . transcript_id "LTnewLTref_280016900.1"; gene_id "LTnewLTref_280016900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 382688 382885 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016900.1"; gene_id "LTnewLTref_280016900"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 382930 383124 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280016900.1"; gene_id "LTnewLTref_280016900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 386696 387913 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017000.1"; gene_id "LTnewLTref_280017000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 386696 387913 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017000.1"; gene_id "LTnewLTref_280017000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 390263 394906 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017100.1"; gene_id "LTnewLTref_280017100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 390263 394906 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017100.1"; gene_id "LTnewLTref_280017100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 396712 398880 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017200.1"; gene_id "LTnewLTref_280017200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 396712 398880 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017200.1"; gene_id "LTnewLTref_280017200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 401838 404468 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017300.1"; gene_id "LTnewLTref_280017300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 401838 404468 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017300.1"; gene_id "LTnewLTref_280017300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 406782 407426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017400.1"; gene_id "LTnewLTref_280017400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 406782 407426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017400.1"; gene_id "LTnewLTref_280017400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 409285 411840 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017500.1"; gene_id "LTnewLTref_280017500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 409285 411840 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017500.1"; gene_id "LTnewLTref_280017500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 412955 414844 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017600.1"; gene_id "LTnewLTref_280017600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 412955 414844 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017600.1"; gene_id "LTnewLTref_280017600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 417679 418443 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017700.1"; gene_id "LTnewLTref_280017700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 417679 418443 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017700.1"; gene_id "LTnewLTref_280017700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 421466 423025 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017800.1"; gene_id "LTnewLTref_280017800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 421466 423025 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017800.1"; gene_id "LTnewLTref_280017800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 428726 429703 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280017900.1"; gene_id "LTnewLTref_280017900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 428726 429703 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280017900.1"; gene_id "LTnewLTref_280017900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 432356 434581 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018000.1"; gene_id "LTnewLTref_280018000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 432356 434581 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018000.1"; gene_id "LTnewLTref_280018000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 436341 436811 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018100.1"; gene_id "LTnewLTref_280018100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 436341 436811 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018100.1"; gene_id "LTnewLTref_280018100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 438236 438841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018200.1"; gene_id "LTnewLTref_280018200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 438236 438841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018200.1"; gene_id "LTnewLTref_280018200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 440650 443562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018300.1"; gene_id "LTnewLTref_280018300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 440650 443562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018300.1"; gene_id "LTnewLTref_280018300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 444267 444569 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018400.1"; gene_id "LTnewLTref_280018400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 444267 444569 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018400.1"; gene_id "LTnewLTref_280018400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 445376 446056 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018500.1"; gene_id "LTnewLTref_280018500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 445376 446056 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018500.1"; gene_id "LTnewLTref_280018500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 448478 450004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018600.1"; gene_id "LTnewLTref_280018600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 448478 450004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018600.1"; gene_id "LTnewLTref_280018600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 451297 453273 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018700.1"; gene_id "LTnewLTref_280018700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 451297 453273 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018700.1"; gene_id "LTnewLTref_280018700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 458181 460538 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018800.1"; gene_id "LTnewLTref_280018800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 458181 460538 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018800.1"; gene_id "LTnewLTref_280018800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 461266 462669 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280018900.1"; gene_id "LTnewLTref_280018900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 461266 462669 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280018900.1"; gene_id "LTnewLTref_280018900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 463809 465050 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019000.1"; gene_id "LTnewLTref_280019000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 463809 465050 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019000.1"; gene_id "LTnewLTref_280019000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 466668 468605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019100.1"; gene_id "LTnewLTref_280019100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 466668 468605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019100.1"; gene_id "LTnewLTref_280019100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 470054 471370 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019200.1"; gene_id "LTnewLTref_280019200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 470054 471370 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019200.1"; gene_id "LTnewLTref_280019200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 472438 475893 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019300.1"; gene_id "LTnewLTref_280019300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 472438 475893 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019300.1"; gene_id "LTnewLTref_280019300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 477036 478448 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019400.1"; gene_id "LTnewLTref_280019400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 477036 478448 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019400.1"; gene_id "LTnewLTref_280019400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 479068 480426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019500.1"; gene_id "LTnewLTref_280019500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 479068 480426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019500.1"; gene_id "LTnewLTref_280019500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 483170 484489 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019600.1"; gene_id "LTnewLTref_280019600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 483170 484489 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019600.1"; gene_id "LTnewLTref_280019600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 485080 486276 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019700.1"; gene_id "LTnewLTref_280019700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 485080 486276 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019700.1"; gene_id "LTnewLTref_280019700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 487241 489952 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019800.1"; gene_id "LTnewLTref_280019800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 487241 489952 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019800.1"; gene_id "LTnewLTref_280019800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 491423 492892 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280019900.1"; gene_id "LTnewLTref_280019900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 491423 492892 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280019900.1"; gene_id "LTnewLTref_280019900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 494016 495068 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020000.1"; gene_id "LTnewLTref_280020000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 494016 495068 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020000.1"; gene_id "LTnewLTref_280020000"; CM024314.1 Liftoff transcript 498382 498627 . + . transcript_id "LTnewLTref_280020100.1"; gene_id "LTnewLTref_280020100" CM024314.1 Liftoff CDS 498382 498627 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020100.1"; gene_id "LTnewLTref_280020100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 499068 500120 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020200.1"; gene_id "LTnewLTref_280020200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 499068 500120 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020200.1"; gene_id "LTnewLTref_280020200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 501332 502333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020300.1"; gene_id "LTnewLTref_280020300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 501332 502333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020300.1"; gene_id "LTnewLTref_280020300"; CM024314.1 . transcript 503679 504230 . + . transcript_id "LTnewLTref_280020400.1"; gene_id "LTnewLTref_280020400:pseudogene" CM024314.1 . exon 503679 504230 . + . transcript_id "LTnewLTref_280020400.1"; gene_id "LTnewLTref_280020400:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 505014 505883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020500.1"; gene_id "LTnewLTref_280020500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 505014 505883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020500.1"; gene_id "LTnewLTref_280020500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 507818 508672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020600.1"; gene_id "LTnewLTref_280020600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 507818 508672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020600.1"; gene_id "LTnewLTref_280020600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 510369 511577 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020700.1"; gene_id "LTnewLTref_280020700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 510369 511577 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020700.1"; gene_id "LTnewLTref_280020700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 514927 515955 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020800.1"; gene_id "LTnewLTref_280020800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 514927 515955 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020800.1"; gene_id "LTnewLTref_280020800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 519506 521128 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280020900.1"; gene_id "LTnewLTref_280020900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 519506 521128 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280020900.1"; gene_id "LTnewLTref_280020900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 527956 529152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280021000.1"; gene_id "LTnewLTref_280021000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 527956 529152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021000.1"; gene_id "LTnewLTref_280021000"; CM024314.1 Liftoff transcript 530107 530310 . + . transcript_id "LTnewLTref_280021100.1"; gene_id "LTnewLTref_280021100" CM024314.1 Liftoff CDS 530107 530310 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021100.1"; gene_id "LTnewLTref_280021100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 532671 534935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280021200.1"; gene_id "LTnewLTref_280021200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 532671 534935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021200.1"; gene_id "LTnewLTref_280021200"; CM024314.1 Liftoff transcript 537465 539432 . + . transcript_id "LTnewLTref_280021300.1"; gene_id "LTnewLTref_280021300" CM024314.1 Liftoff CDS 537465 539432 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021300.1"; gene_id "LTnewLTref_280021300"; CM024314.1 . transcript 541627 543431 . + . transcript_id "LTnewLTref_280021400.1"; gene_id "LTnewLTref_280021400:pseudogene" CM024314.1 . exon 541627 543431 . + . transcript_id "LTnewLTref_280021400.1"; gene_id "LTnewLTref_280021400:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 545053 547230 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280021500.1"; gene_id "LTnewLTref_280021500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 545053 547230 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021500.1"; gene_id "LTnewLTref_280021500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 548768 551002 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_280021600.1"; gene_id "LTnewLTref_280021600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 548768 551002 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021600.1"; gene_id "LTnewLTref_280021600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 551683 553995 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280021700.1"; gene_id "LTnewLTref_280021700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 551683 553995 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021700.1"; gene_id "LTnewLTref_280021700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 554782 555804 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280021800.1"; gene_id "LTnewLTref_280021800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 554782 555804 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021800.1"; gene_id "LTnewLTref_280021800"; CM024314.1 Liftoff transcript 557915 558763 . + . transcript_id "LTnewLTref_280021900.1"; gene_id "LTnewLTref_280021900" CM024314.1 Liftoff CDS 557915 558763 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280021900.1"; gene_id "LTnewLTref_280021900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 559667 560083 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022000.1"; gene_id "LTnewLTref_280022000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 559667 560083 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022000.1"; gene_id "LTnewLTref_280022000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 562270 562668 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022100.1"; gene_id "LTnewLTref_280022100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 562270 562668 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022100.1"; gene_id "LTnewLTref_280022100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 564836 565219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022200.1"; gene_id "LTnewLTref_280022200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 564836 565219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022200.1"; gene_id "LTnewLTref_280022200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 565804 566301 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022300.1"; gene_id "LTnewLTref_280022300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 565804 566301 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022300.1"; gene_id "LTnewLTref_280022300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 567357 569282 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022400.1"; gene_id "LTnewLTref_280022400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 567357 569282 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022400.1"; gene_id "LTnewLTref_280022400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 570007 571176 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022500.1"; gene_id "LTnewLTref_280022500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 570007 571176 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022500.1"; gene_id "LTnewLTref_280022500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 573926 576496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022600.1"; gene_id "LTnewLTref_280022600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 573926 576496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022600.1"; gene_id "LTnewLTref_280022600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 579837 580709 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022700.1"; gene_id "LTnewLTref_280022700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 579837 580709 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022700.1"; gene_id "LTnewLTref_280022700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 582223 583908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280022800.1"; gene_id "LTnewLTref_280022800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 582223 583908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022800.1"; gene_id "LTnewLTref_280022800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 584515 585011 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_280022900.1"; gene_id "LTnewLTref_280022900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 584515 584657 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280022900.1"; gene_id "LTnewLTref_280022900"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 584708 585011 0.69 + 1 transcript_id "LTnewLTref_280022900.1"; gene_id "LTnewLTref_280022900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 585941 586981 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280023000.1"; gene_id "LTnewLTref_280023000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 585941 586981 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280023000.1"; gene_id "LTnewLTref_280023000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 590862 591095 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_280023100.1"; gene_id "LTnewLTref_280023100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 590862 591095 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280023100.1"; gene_id "LTnewLTref_280023100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 592582 593112 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280023200.1"; gene_id "LTnewLTref_280023200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 592582 593112 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280023200.1"; gene_id "LTnewLTref_280023200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 594683 595930 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023300.1"; gene_id "LTnewLTref_280023300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 594683 595930 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023300.1"; gene_id "LTnewLTref_280023300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 597447 598727 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023400.1"; gene_id "LTnewLTref_280023400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 597447 598727 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023400.1"; gene_id "LTnewLTref_280023400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 599348 603178 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023500.1"; gene_id "LTnewLTref_280023500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 599348 603178 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023500.1"; gene_id "LTnewLTref_280023500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 604336 605334 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023600.1"; gene_id "LTnewLTref_280023600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 604336 605334 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023600.1"; gene_id "LTnewLTref_280023600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 606005 609382 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023700.1"; gene_id "LTnewLTref_280023700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 606005 609382 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023700.1"; gene_id "LTnewLTref_280023700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 610706 612574 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023800.1"; gene_id "LTnewLTref_280023800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 610706 612574 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023800.1"; gene_id "LTnewLTref_280023800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 613320 613643 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280023900.1"; gene_id "LTnewLTref_280023900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 613320 613643 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280023900.1"; gene_id "LTnewLTref_280023900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 617885 622006 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024000.1"; gene_id "LTnewLTref_280024000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 617885 622006 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024000.1"; gene_id "LTnewLTref_280024000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 624487 627039 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024100.1"; gene_id "LTnewLTref_280024100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 624487 627039 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024100.1"; gene_id "LTnewLTref_280024100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 627856 630258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024200.1"; gene_id "LTnewLTref_280024200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 627856 630258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024200.1"; gene_id "LTnewLTref_280024200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 632470 636441 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024300.1"; gene_id "LTnewLTref_280024300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 632470 636441 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024300.1"; gene_id "LTnewLTref_280024300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 638887 644913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024400.1"; gene_id "LTnewLTref_280024400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 638887 644913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024400.1"; gene_id "LTnewLTref_280024400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 647837 649294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024500.1"; gene_id "LTnewLTref_280024500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 647837 649294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024500.1"; gene_id "LTnewLTref_280024500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 651118 652929 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_280024600.1"; gene_id "LTnewLTref_280024600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 651118 652929 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024600.1"; gene_id "LTnewLTref_280024600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 651118 658459 0.36 - . transcript_id "LTnewLTref_280024600.2"; gene_id "LTnewLTref_280024600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 651118 653524 0.36 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280024600.2"; gene_id "LTnewLTref_280024600"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 653595 658459 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024600.2"; gene_id "LTnewLTref_280024600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 656163 658459 0.33 - . transcript_id "LTnewLTref_280024600.3"; gene_id "LTnewLTref_280024600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 656163 656172 0.34 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280024600.3"; gene_id "LTnewLTref_280024600"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 656235 658459 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024600.3"; gene_id "LTnewLTref_280024600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 659819 661678 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024700.1"; gene_id "LTnewLTref_280024700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 659819 661678 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024700.1"; gene_id "LTnewLTref_280024700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 663407 666382 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024800.1"; gene_id "LTnewLTref_280024800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 663407 666382 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024800.1"; gene_id "LTnewLTref_280024800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 667552 669321 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280024900.1"; gene_id "LTnewLTref_280024900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 667552 669321 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280024900.1"; gene_id "LTnewLTref_280024900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 670151 672973 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025000.1"; gene_id "LTnewLTref_280025000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 670151 672973 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025000.1"; gene_id "LTnewLTref_280025000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 673906 676701 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025100.1"; gene_id "LTnewLTref_280025100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 673906 676701 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025100.1"; gene_id "LTnewLTref_280025100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 673906 679929 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025100.2"; gene_id "LTnewLTref_280025100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 673906 679929 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025100.2"; gene_id "LTnewLTref_280025100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 681955 683157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025200.1"; gene_id "LTnewLTref_280025200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 681955 683157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025200.1"; gene_id "LTnewLTref_280025200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 684292 686892 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025300.1"; gene_id "LTnewLTref_280025300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 684292 686892 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025300.1"; gene_id "LTnewLTref_280025300"; CM024314.1 . transcript 687870 689645 . - . transcript_id "LTnewLTref_280025400.1"; gene_id "LTnewLTref_280025400:pseudogene" CM024314.1 . exon 687870 689645 . - . transcript_id "LTnewLTref_280025400.1"; gene_id "LTnewLTref_280025400:pseudogene"; CM024314.1 Liftoff transcript 690844 699477 . - . transcript_id "LTnewLTref_280025500.1"; gene_id "LTnewLTref_280025500" CM024314.1 Liftoff CDS 690844 699477 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025500.1"; gene_id "LTnewLTref_280025500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 701595 702125 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025600.1"; gene_id "LTnewLTref_280025600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 701595 702125 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025600.1"; gene_id "LTnewLTref_280025600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 704119 705522 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025700.1"; gene_id "LTnewLTref_280025700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 704119 705522 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025700.1"; gene_id "LTnewLTref_280025700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 706863 710660 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025800.1"; gene_id "LTnewLTref_280025800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 706863 710660 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025800.1"; gene_id "LTnewLTref_280025800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 711758 712435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280025900.1"; gene_id "LTnewLTref_280025900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 711758 712435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280025900.1"; gene_id "LTnewLTref_280025900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 713034 715931 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026000.1"; gene_id "LTnewLTref_280026000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 713034 715931 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026000.1"; gene_id "LTnewLTref_280026000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 717213 718079 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026100.1"; gene_id "LTnewLTref_280026100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 717213 718079 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026100.1"; gene_id "LTnewLTref_280026100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 718899 720917 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026200.1"; gene_id "LTnewLTref_280026200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 718899 720917 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026200.1"; gene_id "LTnewLTref_280026200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 724445 728227 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026300.1"; gene_id "LTnewLTref_280026300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 724445 728227 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026300.1"; gene_id "LTnewLTref_280026300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 729355 730728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026400.1"; gene_id "LTnewLTref_280026400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 729355 730728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026400.1"; gene_id "LTnewLTref_280026400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 732806 733102 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026500.1"; gene_id "LTnewLTref_280026500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 732806 733102 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026500.1"; gene_id "LTnewLTref_280026500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 733432 733644 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_280026600.1"; gene_id "LTnewLTref_280026600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 733432 733644 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026600.1"; gene_id "LTnewLTref_280026600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 734387 736123 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026700.1"; gene_id "LTnewLTref_280026700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 734387 736123 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026700.1"; gene_id "LTnewLTref_280026700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 737071 739113 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026800.1"; gene_id "LTnewLTref_280026800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 737071 739113 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026800.1"; gene_id "LTnewLTref_280026800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 740797 741138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280026900.1"; gene_id "LTnewLTref_280026900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 740797 741138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280026900.1"; gene_id "LTnewLTref_280026900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 744361 745908 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027000.1"; gene_id "LTnewLTref_280027000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 744361 745908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027000.1"; gene_id "LTnewLTref_280027000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 748742 749638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027100.1"; gene_id "LTnewLTref_280027100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 748742 749638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027100.1"; gene_id "LTnewLTref_280027100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 748742 750274 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027100.2"; gene_id "LTnewLTref_280027100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 748742 750274 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027100.2"; gene_id "LTnewLTref_280027100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 752215 754251 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027200.1"; gene_id "LTnewLTref_280027200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 752215 754251 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027200.1"; gene_id "LTnewLTref_280027200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 758170 760230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027300.1"; gene_id "LTnewLTref_280027300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 758170 760230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027300.1"; gene_id "LTnewLTref_280027300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 763943 766495 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027400.1"; gene_id "LTnewLTref_280027400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 763943 766495 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027400.1"; gene_id "LTnewLTref_280027400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 769907 770425 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027500.1"; gene_id "LTnewLTref_280027500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 769907 770425 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027500.1"; gene_id "LTnewLTref_280027500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 772026 776306 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027600.1"; gene_id "LTnewLTref_280027600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 772026 776306 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027600.1"; gene_id "LTnewLTref_280027600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 780616 782877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027700.1"; gene_id "LTnewLTref_280027700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 780616 782877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027700.1"; gene_id "LTnewLTref_280027700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 784857 785186 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280027800.1"; gene_id "LTnewLTref_280027800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 784857 785186 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027800.1"; gene_id "LTnewLTref_280027800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 786137 786647 0.78 - . transcript_id "LTnewLTref_280027900.1"; gene_id "LTnewLTref_280027900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 786137 786212 0.83 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280027900.1"; gene_id "LTnewLTref_280027900"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 786262 786647 0.78 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280027900.1"; gene_id "LTnewLTref_280027900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 796395 799025 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028000.1"; gene_id "LTnewLTref_280028000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 796395 799025 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028000.1"; gene_id "LTnewLTref_280028000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 801697 803349 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028100.1"; gene_id "LTnewLTref_280028100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 801697 803349 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028100.1"; gene_id "LTnewLTref_280028100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 804117 805853 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028200.1"; gene_id "LTnewLTref_280028200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 804117 805853 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028200.1"; gene_id "LTnewLTref_280028200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 806838 807359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028300.1"; gene_id "LTnewLTref_280028300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 806838 807359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028300.1"; gene_id "LTnewLTref_280028300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 808488 809084 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028400.1"; gene_id "LTnewLTref_280028400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 808488 809084 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028400.1"; gene_id "LTnewLTref_280028400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 809803 812814 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028500.1"; gene_id "LTnewLTref_280028500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 809803 812814 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028500.1"; gene_id "LTnewLTref_280028500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 813413 813826 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028600.1"; gene_id "LTnewLTref_280028600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 813413 813826 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028600.1"; gene_id "LTnewLTref_280028600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 814662 815822 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028700.1"; gene_id "LTnewLTref_280028700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 814662 815822 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028700.1"; gene_id "LTnewLTref_280028700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 817441 819075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028800.1"; gene_id "LTnewLTref_280028800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 817441 819075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028800.1"; gene_id "LTnewLTref_280028800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 819547 821430 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280028900.1"; gene_id "LTnewLTref_280028900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 819547 821430 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280028900.1"; gene_id "LTnewLTref_280028900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 821692 822120 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280029000.1"; gene_id "LTnewLTref_280029000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 821692 822120 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280029000.1"; gene_id "LTnewLTref_280029000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 822409 823458 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280029100.1"; gene_id "LTnewLTref_280029100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 822409 823458 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280029100.1"; gene_id "LTnewLTref_280029100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 827844 830150 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029200.1"; gene_id "LTnewLTref_280029200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 827844 830150 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029200.1"; gene_id "LTnewLTref_280029200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 831084 833237 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029300.1"; gene_id "LTnewLTref_280029300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 831084 833237 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029300.1"; gene_id "LTnewLTref_280029300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 836902 837174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029400.1"; gene_id "LTnewLTref_280029400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 836902 837174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029400.1"; gene_id "LTnewLTref_280029400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 837876 839381 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029500.1"; gene_id "LTnewLTref_280029500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 837876 839381 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029500.1"; gene_id "LTnewLTref_280029500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 839887 842391 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029600.1"; gene_id "LTnewLTref_280029600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 839887 842391 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029600.1"; gene_id "LTnewLTref_280029600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 842866 843597 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029700.1"; gene_id "LTnewLTref_280029700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 842866 843597 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029700.1"; gene_id "LTnewLTref_280029700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 844396 846351 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029800.1"; gene_id "LTnewLTref_280029800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 844396 846351 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029800.1"; gene_id "LTnewLTref_280029800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 847995 848987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280029900.1"; gene_id "LTnewLTref_280029900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 847995 848987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280029900.1"; gene_id "LTnewLTref_280029900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 850457 853195 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030000.1"; gene_id "LTnewLTref_280030000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 850457 853195 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030000.1"; gene_id "LTnewLTref_280030000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 854284 857127 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030100.1"; gene_id "LTnewLTref_280030100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 854284 857127 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030100.1"; gene_id "LTnewLTref_280030100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 860834 862669 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030200.1"; gene_id "LTnewLTref_280030200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 860834 862669 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030200.1"; gene_id "LTnewLTref_280030200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 865469 867970 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030300.1"; gene_id "LTnewLTref_280030300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 865469 867970 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030300.1"; gene_id "LTnewLTref_280030300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 869699 872464 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030400.1"; gene_id "LTnewLTref_280030400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 869699 872464 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030400.1"; gene_id "LTnewLTref_280030400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 873692 874810 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030500.1"; gene_id "LTnewLTref_280030500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 873692 874810 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030500.1"; gene_id "LTnewLTref_280030500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 877940 878605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030600.1"; gene_id "LTnewLTref_280030600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 877940 878605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030600.1"; gene_id "LTnewLTref_280030600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 879498 880166 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030700.1"; gene_id "LTnewLTref_280030700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 879498 880166 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030700.1"; gene_id "LTnewLTref_280030700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 883456 885750 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030800.1"; gene_id "LTnewLTref_280030800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 883456 885750 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030800.1"; gene_id "LTnewLTref_280030800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 886824 891317 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280030900.1"; gene_id "LTnewLTref_280030900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 886824 891317 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280030900.1"; gene_id "LTnewLTref_280030900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 892161 894671 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031000.1"; gene_id "LTnewLTref_280031000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 892161 894671 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031000.1"; gene_id "LTnewLTref_280031000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 895935 897872 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031100.1"; gene_id "LTnewLTref_280031100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 895935 897872 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031100.1"; gene_id "LTnewLTref_280031100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 898968 900185 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031200.1"; gene_id "LTnewLTref_280031200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 898968 900185 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031200.1"; gene_id "LTnewLTref_280031200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 903436 906150 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031300.1"; gene_id "LTnewLTref_280031300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 903436 906150 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031300.1"; gene_id "LTnewLTref_280031300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 907333 909408 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031400.1"; gene_id "LTnewLTref_280031400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 907333 909408 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031400.1"; gene_id "LTnewLTref_280031400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 910216 911073 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031500.1"; gene_id "LTnewLTref_280031500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 910216 911073 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031500.1"; gene_id "LTnewLTref_280031500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 912285 913019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031600.1"; gene_id "LTnewLTref_280031600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 912285 913019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031600.1"; gene_id "LTnewLTref_280031600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 915329 916771 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031700.1"; gene_id "LTnewLTref_280031700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 915329 916771 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031700.1"; gene_id "LTnewLTref_280031700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 918609 923813 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031800.1"; gene_id "LTnewLTref_280031800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 918609 923813 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031800.1"; gene_id "LTnewLTref_280031800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 926816 929458 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280031900.1"; gene_id "LTnewLTref_280031900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 926816 929458 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280031900.1"; gene_id "LTnewLTref_280031900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 930840 934913 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032000.1"; gene_id "LTnewLTref_280032000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 930840 934913 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032000.1"; gene_id "LTnewLTref_280032000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 935857 936920 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_280032100.1"; gene_id "LTnewLTref_280032100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 935857 936723 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032100.1"; gene_id "LTnewLTref_280032100"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 936795 936920 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032100.1"; gene_id "LTnewLTref_280032100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 937735 939924 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032200.1"; gene_id "LTnewLTref_280032200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 937735 939924 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032200.1"; gene_id "LTnewLTref_280032200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 941390 942559 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032300.1"; gene_id "LTnewLTref_280032300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 941390 942559 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032300.1"; gene_id "LTnewLTref_280032300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 945457 946944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032400.1"; gene_id "LTnewLTref_280032400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 945457 946944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032400.1"; gene_id "LTnewLTref_280032400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 949379 951400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032500.1"; gene_id "LTnewLTref_280032500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 949379 951400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032500.1"; gene_id "LTnewLTref_280032500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 952342 953787 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032600.1"; gene_id "LTnewLTref_280032600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 952342 953787 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032600.1"; gene_id "LTnewLTref_280032600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 955275 957689 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032700.1"; gene_id "LTnewLTref_280032700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 955275 957689 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032700.1"; gene_id "LTnewLTref_280032700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 960225 961103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032800.1"; gene_id "LTnewLTref_280032800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 960225 961103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032800.1"; gene_id "LTnewLTref_280032800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 961817 962722 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280032900.1"; gene_id "LTnewLTref_280032900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 961817 962722 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280032900.1"; gene_id "LTnewLTref_280032900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 964419 965963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033000.1"; gene_id "LTnewLTref_280033000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 964419 965963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033000.1"; gene_id "LTnewLTref_280033000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 966885 967934 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033100.1"; gene_id "LTnewLTref_280033100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 966885 967934 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033100.1"; gene_id "LTnewLTref_280033100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 971826 973715 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033200.1"; gene_id "LTnewLTref_280033200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 971826 973715 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033200.1"; gene_id "LTnewLTref_280033200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 976447 978369 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033300.1"; gene_id "LTnewLTref_280033300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 976447 978369 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033300.1"; gene_id "LTnewLTref_280033300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 979940 983239 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_280033400.1"; gene_id "LTnewLTref_280033400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 979940 983239 0.51 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033400.1"; gene_id "LTnewLTref_280033400"; CM024314.1 . transcript 984568 989282 . + . transcript_id "LTnewLTref_280033500.1"; gene_id "LTnewLTref_280033500:pseudogene" CM024314.1 . exon 984568 989282 . + . transcript_id "LTnewLTref_280033500.1"; gene_id "LTnewLTref_280033500:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 990818 993829 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033600.1"; gene_id "LTnewLTref_280033600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 990818 993829 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033600.1"; gene_id "LTnewLTref_280033600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 994574 995005 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033700.1"; gene_id "LTnewLTref_280033700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 994574 995005 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033700.1"; gene_id "LTnewLTref_280033700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 996133 996564 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033800.1"; gene_id "LTnewLTref_280033800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 996133 996564 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033800.1"; gene_id "LTnewLTref_280033800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 997624 998304 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280033900.1"; gene_id "LTnewLTref_280033900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 997624 998304 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280033900.1"; gene_id "LTnewLTref_280033900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 999037 1002432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034000.1"; gene_id "LTnewLTref_280034000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 999037 1002432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034000.1"; gene_id "LTnewLTref_280034000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1004025 1006685 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034100.1"; gene_id "LTnewLTref_280034100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1004025 1006685 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034100.1"; gene_id "LTnewLTref_280034100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1007805 1009058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034200.1"; gene_id "LTnewLTref_280034200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1007805 1009058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034200.1"; gene_id "LTnewLTref_280034200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1010394 1015658 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034300.1"; gene_id "LTnewLTref_280034300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1010394 1015658 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034300.1"; gene_id "LTnewLTref_280034300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1016707 1019304 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034400.1"; gene_id "LTnewLTref_280034400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1016707 1019304 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034400.1"; gene_id "LTnewLTref_280034400"; CM024314.1 Liftoff transcript 1021450 1022946 . + . transcript_id "LTnewLTref_280034500.1"; gene_id "LTnewLTref_280034500" CM024314.1 Liftoff CDS 1021450 1022946 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034500.1"; gene_id "LTnewLTref_280034500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1024552 1027254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034600.1"; gene_id "LTnewLTref_280034600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1024552 1027254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034600.1"; gene_id "LTnewLTref_280034600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1028409 1030055 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034700.1"; gene_id "LTnewLTref_280034700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1028409 1030055 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034700.1"; gene_id "LTnewLTref_280034700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1032694 1033134 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034800.1"; gene_id "LTnewLTref_280034800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1032694 1033134 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034800.1"; gene_id "LTnewLTref_280034800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1034494 1035417 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280034900.1"; gene_id "LTnewLTref_280034900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1034494 1035417 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280034900.1"; gene_id "LTnewLTref_280034900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1036380 1037627 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280035000.1"; gene_id "LTnewLTref_280035000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1036380 1037627 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280035000.1"; gene_id "LTnewLTref_280035000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1038212 1039333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_280035100.1"; gene_id "LTnewLTref_280035100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1038212 1039333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_280035100.1"; gene_id "LTnewLTref_280035100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1040043 1041434 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035200.1"; gene_id "LTnewLTref_280035200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1040043 1041434 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035200.1"; gene_id "LTnewLTref_280035200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1042071 1042931 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035300.1"; gene_id "LTnewLTref_280035300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1042071 1042931 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035300.1"; gene_id "LTnewLTref_280035300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1043628 1043996 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035400.1"; gene_id "LTnewLTref_280035400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1043628 1043996 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035400.1"; gene_id "LTnewLTref_280035400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1044622 1046433 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035500.1"; gene_id "LTnewLTref_280035500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1044622 1046433 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035500.1"; gene_id "LTnewLTref_280035500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1047730 1048668 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035600.1"; gene_id "LTnewLTref_280035600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1047730 1048668 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035600.1"; gene_id "LTnewLTref_280035600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1051753 1052691 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035700.1"; gene_id "LTnewLTref_280035700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1051753 1052691 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035700.1"; gene_id "LTnewLTref_280035700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1053396 1055879 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280035800.1"; gene_id "LTnewLTref_280035800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1053396 1055879 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035800.1"; gene_id "LTnewLTref_280035800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1057885 1059880 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_280035900.1"; gene_id "LTnewLTref_280035900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1057885 1058349 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035900.1"; gene_id "LTnewLTref_280035900"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1058408 1059880 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280035900.1"; gene_id "LTnewLTref_280035900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1061543 1063537 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280036000.1"; gene_id "LTnewLTref_280036000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1061543 1063537 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036000.1"; gene_id "LTnewLTref_280036000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1065203 1067198 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_280036100.1"; gene_id "LTnewLTref_280036100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1065203 1065667 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036100.1"; gene_id "LTnewLTref_280036100"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1065726 1067198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036100.1"; gene_id "LTnewLTref_280036100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1068876 1070873 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280036200.1"; gene_id "LTnewLTref_280036200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1068876 1070873 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036200.1"; gene_id "LTnewLTref_280036200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1072527 1074517 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_280036300.1"; gene_id "LTnewLTref_280036300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1072527 1072544 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036300.1"; gene_id "LTnewLTref_280036300"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1072655 1074517 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036300.1"; gene_id "LTnewLTref_280036300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1076173 1078139 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_280036400.1"; gene_id "LTnewLTref_280036400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1076173 1076467 0.97 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280036400.1"; gene_id "LTnewLTref_280036400"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1076524 1078139 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036400.1"; gene_id "LTnewLTref_280036400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1078964 1079746 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_280036500.1"; gene_id "LTnewLTref_280036500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1078964 1079746 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036500.1"; gene_id "LTnewLTref_280036500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1078964 1080433 0.7 - . transcript_id "LTnewLTref_280036500.2"; gene_id "LTnewLTref_280036500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1078964 1079775 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_280036500.2"; gene_id "LTnewLTref_280036500"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1079854 1080433 0.7 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036500.2"; gene_id "LTnewLTref_280036500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1079807 1080433 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280036500.3"; gene_id "LTnewLTref_280036500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1079807 1080433 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036500.3"; gene_id "LTnewLTref_280036500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1081251 1082807 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280036600.1"; gene_id "LTnewLTref_280036600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1081251 1082807 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036600.1"; gene_id "LTnewLTref_280036600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1083531 1084157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280036700.1"; gene_id "LTnewLTref_280036700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1083531 1084157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036700.1"; gene_id "LTnewLTref_280036700"; CM024314.1 . transcript 1084935 1086935 . - . transcript_id "LTnewLTref_280036800.1"; gene_id "LTnewLTref_280036800:pseudogene" CM024314.1 . exon 1084935 1086935 . - . transcript_id "LTnewLTref_280036800.1"; gene_id "LTnewLTref_280036800:pseudogene"; CM024314.1 Liftoff transcript 1088006 1091038 . - . transcript_id "LTnewLTref_280036900.1"; gene_id "LTnewLTref_280036900" CM024314.1 Liftoff CDS 1088006 1091038 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_280036900.1"; gene_id "LTnewLTref_280036900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1091448 1092920 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037000.1"; gene_id "LTnewLTref_280037000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1091448 1092920 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037000.1"; gene_id "LTnewLTref_280037000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1093735 1095126 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037100.1"; gene_id "LTnewLTref_280037100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1093735 1095126 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037100.1"; gene_id "LTnewLTref_280037100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1097028 1098002 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037200.1"; gene_id "LTnewLTref_280037200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1097028 1098002 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037200.1"; gene_id "LTnewLTref_280037200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1098828 1099577 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037300.1"; gene_id "LTnewLTref_280037300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1098828 1099577 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037300.1"; gene_id "LTnewLTref_280037300"; CM024314.1 . transcript 1100895 1113580 . - . transcript_id "LTnewLTref_280037400.1"; gene_id "LTnewLTref_280037400:pseudogene" CM024314.1 . exon 1100895 1113580 . - . transcript_id "LTnewLTref_280037400.1"; gene_id "LTnewLTref_280037400:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1115260 1116417 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037500.1"; gene_id "LTnewLTref_280037500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1115260 1116417 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037500.1"; gene_id "LTnewLTref_280037500"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1118183 1119772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037600.1"; gene_id "LTnewLTref_280037600" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1118183 1119772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037600.1"; gene_id "LTnewLTref_280037600"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1123146 1124504 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037700.1"; gene_id "LTnewLTref_280037700" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1123146 1124504 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037700.1"; gene_id "LTnewLTref_280037700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1126805 1127344 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037800.1"; gene_id "LTnewLTref_280037800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1126805 1127344 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037800.1"; gene_id "LTnewLTref_280037800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1128449 1130653 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280037900.1"; gene_id "LTnewLTref_280037900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1128449 1130653 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280037900.1"; gene_id "LTnewLTref_280037900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1131622 1133166 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038000.1"; gene_id "LTnewLTref_280038000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1131622 1133166 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038000.1"; gene_id "LTnewLTref_280038000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1136124 1137134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038100.1"; gene_id "LTnewLTref_280038100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1136124 1137134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038100.1"; gene_id "LTnewLTref_280038100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1138439 1139407 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038200.1"; gene_id "LTnewLTref_280038200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1138439 1139407 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038200.1"; gene_id "LTnewLTref_280038200"; CM024314.1 . transcript 1141644 1141958 . - . transcript_id "LTnewLTref_280038300.1"; gene_id "LTnewLTref_280038300:pseudogene" CM024314.1 . exon 1141644 1141958 . - . transcript_id "LTnewLTref_280038300.1"; gene_id "LTnewLTref_280038300:pseudogene"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1142183 1142623 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038400.1"; gene_id "LTnewLTref_280038400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1142183 1142623 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038400.1"; gene_id "LTnewLTref_280038400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1142684 1143010 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038500.1"; gene_id "LTnewLTref_280038500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1142684 1143010 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038500.1"; gene_id "LTnewLTref_280038500"; CM024314.1 . transcript 1143023 1143343 . - . transcript_id "LTnewLTref_280038600.1"; gene_id "LTnewLTref_280038600:pseudogene" CM024314.1 . exon 1143023 1143343 . - . transcript_id "LTnewLTref_280038600.1"; gene_id "LTnewLTref_280038600:pseudogene"; CM024314.1 Liftoff transcript 1143380 1143751 . - . transcript_id "LTnewLTref_280038700.1"; gene_id "LTnewLTref_280038700" CM024314.1 Liftoff CDS 1143380 1143751 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038700.1"; gene_id "LTnewLTref_280038700"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1145329 1145694 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038800.1"; gene_id "LTnewLTref_280038800" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1145329 1145694 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038800.1"; gene_id "LTnewLTref_280038800"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1146567 1147076 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280038900.1"; gene_id "LTnewLTref_280038900" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1146567 1147076 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280038900.1"; gene_id "LTnewLTref_280038900"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1147879 1148583 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280039000.1"; gene_id "LTnewLTref_280039000" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1147879 1148583 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039000.1"; gene_id "LTnewLTref_280039000"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1149313 1150473 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280039100.1"; gene_id "LTnewLTref_280039100" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1149313 1150473 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039100.1"; gene_id "LTnewLTref_280039100"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1151192 1151638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280039200.1"; gene_id "LTnewLTref_280039200" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1151192 1151638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039200.1"; gene_id "LTnewLTref_280039200"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1156149 1158653 0.38 - . transcript_id "LTnewLTref_280039300.1"; gene_id "LTnewLTref_280039300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1156149 1156443 0.4 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280039300.1"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1156639 1158653 0.38 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039300.1"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1156149 1160594 0.44 - . transcript_id "LTnewLTref_280039300.2"; gene_id "LTnewLTref_280039300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1156149 1156443 0.52 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280039300.2"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1156639 1160594 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039300.2"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1157299 1160594 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_280039300.3"; gene_id "LTnewLTref_280039300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1157299 1157380 0.49 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280039300.3"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1157449 1160594 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039300.3"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1158920 1160594 0.35 - . transcript_id "LTnewLTref_280039300.4"; gene_id "LTnewLTref_280039300" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1158920 1158982 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039300.4"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1159062 1160594 0.35 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039300.4"; gene_id "LTnewLTref_280039300"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1161030 1162498 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_280039400.1"; gene_id "LTnewLTref_280039400" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1161030 1161303 0.58 - 1 transcript_id "LTnewLTref_280039400.1"; gene_id "LTnewLTref_280039400"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1161393 1162498 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039400.1"; gene_id "LTnewLTref_280039400"; CM024314.1 AUGUSTUS transcript 1162596 1164017 1 - . transcript_id "LTnewLTref_280039500.1"; gene_id "LTnewLTref_280039500" CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1162596 1163375 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039500.1"; gene_id "LTnewLTref_280039500"; CM024314.1 AUGUSTUS CDS 1163727 1164017 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_280039500.1"; gene_id "LTnewLTref_280039500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 4066 4956 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005000.1"; gene_id "LTnewLTref_290005000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 4066 4956 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005000.1"; gene_id "LTnewLTref_290005000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 7228 10365 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005100.1"; gene_id "LTnewLTref_290005100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 7228 10365 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005100.1"; gene_id "LTnewLTref_290005100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 11682 13085 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005200.1"; gene_id "LTnewLTref_290005200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 11682 13085 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005200.1"; gene_id "LTnewLTref_290005200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 14121 14984 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005300.1"; gene_id "LTnewLTref_290005300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 14121 14984 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005300.1"; gene_id "LTnewLTref_290005300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 15615 15875 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_290005400.1"; gene_id "LTnewLTref_290005400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 15615 15875 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005400.1"; gene_id "LTnewLTref_290005400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 16255 18273 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005500.1"; gene_id "LTnewLTref_290005500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 16255 18273 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005500.1"; gene_id "LTnewLTref_290005500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 19187 20377 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005600.1"; gene_id "LTnewLTref_290005600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 19187 20377 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005600.1"; gene_id "LTnewLTref_290005600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 21793 22557 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005700.1"; gene_id "LTnewLTref_290005700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 21793 22557 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005700.1"; gene_id "LTnewLTref_290005700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 23326 23700 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005800.1"; gene_id "LTnewLTref_290005800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 23326 23700 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005800.1"; gene_id "LTnewLTref_290005800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 24323 24883 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290005900.1"; gene_id "LTnewLTref_290005900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 24323 24883 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290005900.1"; gene_id "LTnewLTref_290005900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 25850 26068 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006000.1"; gene_id "LTnewLTref_290006000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 25850 26068 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006000.1"; gene_id "LTnewLTref_290006000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 27002 28612 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006100.1"; gene_id "LTnewLTref_290006100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 27002 28612 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006100.1"; gene_id "LTnewLTref_290006100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 30037 37493 0.68 - . transcript_id "LTnewLTref_290006200.1"; gene_id "LTnewLTref_290006200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 30037 36539 0.68 - 2 transcript_id "LTnewLTref_290006200.1"; gene_id "LTnewLTref_290006200"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 36584 37493 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006200.1"; gene_id "LTnewLTref_290006200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 40232 42961 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006300.1"; gene_id "LTnewLTref_290006300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 40232 42961 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006300.1"; gene_id "LTnewLTref_290006300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 44228 46930 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_290006400.1"; gene_id "LTnewLTref_290006400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 44228 46930 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006400.1"; gene_id "LTnewLTref_290006400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 47686 48699 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006500.1"; gene_id "LTnewLTref_290006500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 47686 48699 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006500.1"; gene_id "LTnewLTref_290006500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 50060 52141 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006600.1"; gene_id "LTnewLTref_290006600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 50060 52141 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006600.1"; gene_id "LTnewLTref_290006600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 52973 54682 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006700.1"; gene_id "LTnewLTref_290006700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 52973 54682 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006700.1"; gene_id "LTnewLTref_290006700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 59996 60409 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006800.1"; gene_id "LTnewLTref_290006800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 59996 60409 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006800.1"; gene_id "LTnewLTref_290006800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 61102 62712 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290006900.1"; gene_id "LTnewLTref_290006900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 61102 62712 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290006900.1"; gene_id "LTnewLTref_290006900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 63846 66893 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007000.1"; gene_id "LTnewLTref_290007000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 63846 66893 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007000.1"; gene_id "LTnewLTref_290007000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 68149 72891 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007100.1"; gene_id "LTnewLTref_290007100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 68149 72891 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007100.1"; gene_id "LTnewLTref_290007100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 74068 74871 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007200.1"; gene_id "LTnewLTref_290007200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 74068 74871 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007200.1"; gene_id "LTnewLTref_290007200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 76181 79081 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007300.1"; gene_id "LTnewLTref_290007300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 76181 79081 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007300.1"; gene_id "LTnewLTref_290007300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 80058 80705 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007400.1"; gene_id "LTnewLTref_290007400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 80058 80705 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007400.1"; gene_id "LTnewLTref_290007400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 82046 83662 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007500.1"; gene_id "LTnewLTref_290007500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 82046 83662 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007500.1"; gene_id "LTnewLTref_290007500"; CM024315.1 . transcript 85114 85485 . - . transcript_id "LTnewLTref_290007600.1"; gene_id "LTnewLTref_290007600:pseudogene" CM024315.1 . exon 85114 85485 . - . transcript_id "LTnewLTref_290007600.1"; gene_id "LTnewLTref_290007600:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 88834 89793 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007700.1"; gene_id "LTnewLTref_290007700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 88834 89793 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007700.1"; gene_id "LTnewLTref_290007700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 90534 92387 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007800.1"; gene_id "LTnewLTref_290007800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 90534 92387 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007800.1"; gene_id "LTnewLTref_290007800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 93324 94073 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290007900.1"; gene_id "LTnewLTref_290007900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 93324 94073 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290007900.1"; gene_id "LTnewLTref_290007900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 97196 98671 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008000.1"; gene_id "LTnewLTref_290008000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 97196 98671 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008000.1"; gene_id "LTnewLTref_290008000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 99895 101109 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_290008100.1"; gene_id "LTnewLTref_290008100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 99895 101109 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008100.1"; gene_id "LTnewLTref_290008100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 102311 103324 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008200.1"; gene_id "LTnewLTref_290008200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 102311 103324 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008200.1"; gene_id "LTnewLTref_290008200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 106719 107090 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008300.1"; gene_id "LTnewLTref_290008300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 106719 107090 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008300.1"; gene_id "LTnewLTref_290008300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 108504 109661 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008400.1"; gene_id "LTnewLTref_290008400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 108504 109661 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008400.1"; gene_id "LTnewLTref_290008400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 110303 111472 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008500.1"; gene_id "LTnewLTref_290008500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 110303 111472 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008500.1"; gene_id "LTnewLTref_290008500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 112630 113916 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008600.1"; gene_id "LTnewLTref_290008600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 112630 113916 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008600.1"; gene_id "LTnewLTref_290008600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 115632 119723 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008700.1"; gene_id "LTnewLTref_290008700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 115632 119723 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008700.1"; gene_id "LTnewLTref_290008700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 120778 121302 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008800.1"; gene_id "LTnewLTref_290008800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 120778 121302 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008800.1"; gene_id "LTnewLTref_290008800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 124917 129569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290008900.1"; gene_id "LTnewLTref_290008900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 124917 129569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290008900.1"; gene_id "LTnewLTref_290008900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 131256 134183 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009000.1"; gene_id "LTnewLTref_290009000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 131256 134183 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009000.1"; gene_id "LTnewLTref_290009000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 135805 136587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009100.1"; gene_id "LTnewLTref_290009100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 135805 136587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009100.1"; gene_id "LTnewLTref_290009100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 137474 137974 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009200.1"; gene_id "LTnewLTref_290009200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 137474 137974 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009200.1"; gene_id "LTnewLTref_290009200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 138590 140326 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009300.1"; gene_id "LTnewLTref_290009300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 138590 140326 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009300.1"; gene_id "LTnewLTref_290009300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 141378 142592 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009400.1"; gene_id "LTnewLTref_290009400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 141378 142592 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009400.1"; gene_id "LTnewLTref_290009400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 143889 145583 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009500.1"; gene_id "LTnewLTref_290009500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 143889 145583 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009500.1"; gene_id "LTnewLTref_290009500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 148643 149068 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_290009600.1"; gene_id "LTnewLTref_290009600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 148643 149068 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009600.1"; gene_id "LTnewLTref_290009600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 149303 149638 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_290009700.1"; gene_id "LTnewLTref_290009700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 149303 149638 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009700.1"; gene_id "LTnewLTref_290009700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 150626 151765 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009800.1"; gene_id "LTnewLTref_290009800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 150626 151765 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009800.1"; gene_id "LTnewLTref_290009800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 152779 154728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290009900.1"; gene_id "LTnewLTref_290009900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 152779 154728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290009900.1"; gene_id "LTnewLTref_290009900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 157987 160182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010000.1"; gene_id "LTnewLTref_290010000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 157987 160182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010000.1"; gene_id "LTnewLTref_290010000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 164196 165542 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010100.1"; gene_id "LTnewLTref_290010100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 164196 165542 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010100.1"; gene_id "LTnewLTref_290010100"; CM024315.1 Liftoff transcript 167134 168099 . - . transcript_id "LTnewLTref_290010200.1"; gene_id "LTnewLTref_290010200" CM024315.1 Liftoff CDS 167134 168099 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010200.1"; gene_id "LTnewLTref_290010200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 169487 170581 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010300.1"; gene_id "LTnewLTref_290010300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 169487 170581 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010300.1"; gene_id "LTnewLTref_290010300"; CM024315.1 Liftoff transcript 176102 180022 . - . transcript_id "LTnewLTref_290010400.1"; gene_id "LTnewLTref_290010400" CM024315.1 Liftoff CDS 176102 180022 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010400.1"; gene_id "LTnewLTref_290010400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 186842 187261 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010500.1"; gene_id "LTnewLTref_290010500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 186842 187261 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010500.1"; gene_id "LTnewLTref_290010500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 187930 189291 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010600.1"; gene_id "LTnewLTref_290010600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 187930 189291 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010600.1"; gene_id "LTnewLTref_290010600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 190397 199267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010700.1"; gene_id "LTnewLTref_290010700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 190397 199267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010700.1"; gene_id "LTnewLTref_290010700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 200539 202047 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010800.1"; gene_id "LTnewLTref_290010800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 200539 202047 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010800.1"; gene_id "LTnewLTref_290010800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 203225 203530 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010900.1"; gene_id "LTnewLTref_290010900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 203225 203530 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010900.1"; gene_id "LTnewLTref_290010900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 203225 206413 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290010900.2"; gene_id "LTnewLTref_290010900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 203225 206413 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290010900.2"; gene_id "LTnewLTref_290010900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 209765 210982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011000.1"; gene_id "LTnewLTref_290011000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 209765 210982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011000.1"; gene_id "LTnewLTref_290011000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 211734 214271 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011100.1"; gene_id "LTnewLTref_290011100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 211734 214271 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011100.1"; gene_id "LTnewLTref_290011100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 215491 216942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011200.1"; gene_id "LTnewLTref_290011200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 215491 216942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011200.1"; gene_id "LTnewLTref_290011200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 217837 221157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011300.1"; gene_id "LTnewLTref_290011300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 217837 221157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011300.1"; gene_id "LTnewLTref_290011300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 222066 223802 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011400.1"; gene_id "LTnewLTref_290011400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 222066 223802 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011400.1"; gene_id "LTnewLTref_290011400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 225215 227110 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011500.1"; gene_id "LTnewLTref_290011500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 225215 227110 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011500.1"; gene_id "LTnewLTref_290011500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 231621 237221 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011600.1"; gene_id "LTnewLTref_290011600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 231621 237221 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011600.1"; gene_id "LTnewLTref_290011600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 242330 242749 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011700.1"; gene_id "LTnewLTref_290011700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 242330 242749 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011700.1"; gene_id "LTnewLTref_290011700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 243489 244283 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011800.1"; gene_id "LTnewLTref_290011800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 243489 244283 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011800.1"; gene_id "LTnewLTref_290011800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 245238 247367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290011900.1"; gene_id "LTnewLTref_290011900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 245238 247367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290011900.1"; gene_id "LTnewLTref_290011900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 249199 250968 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012000.1"; gene_id "LTnewLTref_290012000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 249199 250968 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012000.1"; gene_id "LTnewLTref_290012000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 252043 252459 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012100.1"; gene_id "LTnewLTref_290012100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 252043 252459 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012100.1"; gene_id "LTnewLTref_290012100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 253186 255616 0.52 - . transcript_id "LTnewLTref_290012200.1"; gene_id "LTnewLTref_290012200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 253186 255028 0.52 - 1 transcript_id "LTnewLTref_290012200.1"; gene_id "LTnewLTref_290012200"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 255351 255616 0.52 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012200.1"; gene_id "LTnewLTref_290012200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 256130 256966 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012300.1"; gene_id "LTnewLTref_290012300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 256130 256966 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012300.1"; gene_id "LTnewLTref_290012300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 258464 260582 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_290012400.1"; gene_id "LTnewLTref_290012400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 258464 258568 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012400.1"; gene_id "LTnewLTref_290012400"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 258612 260582 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012400.1"; gene_id "LTnewLTref_290012400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 261580 264147 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012500.1"; gene_id "LTnewLTref_290012500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 261580 264147 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012500.1"; gene_id "LTnewLTref_290012500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 265533 266363 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012600.1"; gene_id "LTnewLTref_290012600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 265533 266363 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012600.1"; gene_id "LTnewLTref_290012600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 268575 269255 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012700.1"; gene_id "LTnewLTref_290012700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 268575 269255 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012700.1"; gene_id "LTnewLTref_290012700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 270683 271804 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012800.1"; gene_id "LTnewLTref_290012800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 270683 271804 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012800.1"; gene_id "LTnewLTref_290012800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 273150 273899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290012900.1"; gene_id "LTnewLTref_290012900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 273150 273899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290012900.1"; gene_id "LTnewLTref_290012900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 275111 277138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013000.1"; gene_id "LTnewLTref_290013000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 275111 277138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013000.1"; gene_id "LTnewLTref_290013000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 279081 281396 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013100.1"; gene_id "LTnewLTref_290013100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 279081 281396 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013100.1"; gene_id "LTnewLTref_290013100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 282547 283122 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013200.1"; gene_id "LTnewLTref_290013200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 282547 283122 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013200.1"; gene_id "LTnewLTref_290013200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 286406 288211 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013300.1"; gene_id "LTnewLTref_290013300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 286406 288211 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013300.1"; gene_id "LTnewLTref_290013300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 290177 294946 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013400.1"; gene_id "LTnewLTref_290013400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 290177 294946 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013400.1"; gene_id "LTnewLTref_290013400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 295841 297787 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013500.1"; gene_id "LTnewLTref_290013500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 295841 297787 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013500.1"; gene_id "LTnewLTref_290013500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 299389 301173 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013600.1"; gene_id "LTnewLTref_290013600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 299389 301173 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013600.1"; gene_id "LTnewLTref_290013600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 302124 303980 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013700.1"; gene_id "LTnewLTref_290013700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 302124 303980 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013700.1"; gene_id "LTnewLTref_290013700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 307781 308803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013800.1"; gene_id "LTnewLTref_290013800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 307781 308803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013800.1"; gene_id "LTnewLTref_290013800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 310098 311552 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290013900.1"; gene_id "LTnewLTref_290013900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 310098 311552 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290013900.1"; gene_id "LTnewLTref_290013900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 312817 313992 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290014000.1"; gene_id "LTnewLTref_290014000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 312817 313992 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014000.1"; gene_id "LTnewLTref_290014000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 316209 317117 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290014100.1"; gene_id "LTnewLTref_290014100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 316209 317117 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014100.1"; gene_id "LTnewLTref_290014100"; CM024315.1 . transcript 318408 318692 . + . transcript_id "LTnewLTref_290014200.1"; gene_id "LTnewLTref_290014200:pseudogene" CM024315.1 . exon 318408 318443 . + . transcript_id "LTnewLTref_290014200.1"; gene_id "LTnewLTref_290014200:pseudogene"; CM024315.1 . exon 318446 318643 . + . transcript_id "LTnewLTref_290014200.1"; gene_id "LTnewLTref_290014200:pseudogene"; CM024315.1 . exon 318645 318692 . + . transcript_id "LTnewLTref_290014200.1"; gene_id "LTnewLTref_290014200:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 319283 319958 0.44 - . transcript_id "LTnewLTref_290014300.1"; gene_id "LTnewLTref_290014300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 319283 319696 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014300.1"; gene_id "LTnewLTref_290014300"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 319767 319958 0.44 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014300.1"; gene_id "LTnewLTref_290014300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 320709 321134 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_290014400.1"; gene_id "LTnewLTref_290014400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 320709 321048 0.91 - 1 transcript_id "LTnewLTref_290014400.1"; gene_id "LTnewLTref_290014400"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 321130 321134 0.64 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014400.1"; gene_id "LTnewLTref_290014400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 322283 323826 0.5 - . transcript_id "LTnewLTref_290014500.1"; gene_id "LTnewLTref_290014500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 322283 322364 0.5 - 1 transcript_id "LTnewLTref_290014500.1"; gene_id "LTnewLTref_290014500"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 322448 323826 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014500.1"; gene_id "LTnewLTref_290014500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 324823 325167 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290014600.1"; gene_id "LTnewLTref_290014600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 324823 325167 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014600.1"; gene_id "LTnewLTref_290014600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 326152 327516 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290014700.1"; gene_id "LTnewLTref_290014700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 326152 327516 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014700.1"; gene_id "LTnewLTref_290014700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 329785 330291 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290014800.1"; gene_id "LTnewLTref_290014800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 329785 330291 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290014800.1"; gene_id "LTnewLTref_290014800"; CM024315.1 . transcript 332682 333209 . - . transcript_id "LTnewLTref_290014900.1"; gene_id "LTnewLTref_290014900:pseudogene" CM024315.1 . exon 332682 333209 . - . transcript_id "LTnewLTref_290014900.1"; gene_id "LTnewLTref_290014900:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 334057 334377 0.83 + . transcript_id "LTnewLTref_290015000.1"; gene_id "LTnewLTref_290015000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 334057 334377 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290015000.1"; gene_id "LTnewLTref_290015000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 334639 334905 0.81 + . transcript_id "LTnewLTref_290015100.1"; gene_id "LTnewLTref_290015100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 334639 334905 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290015100.1"; gene_id "LTnewLTref_290015100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 335795 336115 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_290015200.1"; gene_id "LTnewLTref_290015200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 335795 336115 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290015200.1"; gene_id "LTnewLTref_290015200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 336488 337963 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290015300.1"; gene_id "LTnewLTref_290015300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 336488 337963 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290015300.1"; gene_id "LTnewLTref_290015300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 338552 339091 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290015400.1"; gene_id "LTnewLTref_290015400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 338552 339091 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290015400.1"; gene_id "LTnewLTref_290015400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 339523 340572 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_290015500.1"; gene_id "LTnewLTref_290015500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 339523 340572 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290015500.1"; gene_id "LTnewLTref_290015500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 345423 345818 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_290015600.1"; gene_id "LTnewLTref_290015600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 345423 345818 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290015600.1"; gene_id "LTnewLTref_290015600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 346821 348179 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290015700.1"; gene_id "LTnewLTref_290015700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 346821 348179 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290015700.1"; gene_id "LTnewLTref_290015700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 348535 349890 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290015800.1"; gene_id "LTnewLTref_290015800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 348535 349890 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290015800.1"; gene_id "LTnewLTref_290015800"; CM024315.1 . transcript 350313 351332 . + . transcript_id "LTnewLTref_290015900.1"; gene_id "LTnewLTref_290015900:pseudogene" CM024315.1 . exon 350313 351332 . + . transcript_id "LTnewLTref_290015900.1"; gene_id "LTnewLTref_290015900:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 351909 353417 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016000.1"; gene_id "LTnewLTref_290016000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 351909 353417 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016000.1"; gene_id "LTnewLTref_290016000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 355430 357592 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016100.1"; gene_id "LTnewLTref_290016100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 355430 357592 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016100.1"; gene_id "LTnewLTref_290016100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 358138 358665 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016200.1"; gene_id "LTnewLTref_290016200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 358138 358665 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016200.1"; gene_id "LTnewLTref_290016200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 359937 362210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016300.1"; gene_id "LTnewLTref_290016300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 359937 362210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016300.1"; gene_id "LTnewLTref_290016300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 366433 368157 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016400.1"; gene_id "LTnewLTref_290016400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 366433 368157 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016400.1"; gene_id "LTnewLTref_290016400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 370578 371876 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016500.1"; gene_id "LTnewLTref_290016500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 370578 371876 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016500.1"; gene_id "LTnewLTref_290016500"; CM024315.1 Liftoff transcript 375199 380358 . + . transcript_id "LTnewLTref_290016600.1"; gene_id "LTnewLTref_290016600" CM024315.1 Liftoff CDS 375199 380358 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016600.1"; gene_id "LTnewLTref_290016600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 382462 384105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016700.1"; gene_id "LTnewLTref_290016700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 382462 384105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016700.1"; gene_id "LTnewLTref_290016700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 385492 388470 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016800.1"; gene_id "LTnewLTref_290016800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 385492 388470 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016800.1"; gene_id "LTnewLTref_290016800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 390523 392400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290016900.1"; gene_id "LTnewLTref_290016900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 390523 392400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290016900.1"; gene_id "LTnewLTref_290016900"; CM024315.1 . transcript 394588 395064 . + . transcript_id "LTnewLTref_290017000.1"; gene_id "LTnewLTref_290017000:pseudogene" CM024315.1 . exon 394588 395064 . + . transcript_id "LTnewLTref_290017000.1"; gene_id "LTnewLTref_290017000:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 398760 399812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017100.1"; gene_id "LTnewLTref_290017100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 398760 399812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017100.1"; gene_id "LTnewLTref_290017100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 401550 403724 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017200.1"; gene_id "LTnewLTref_290017200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 401550 403724 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017200.1"; gene_id "LTnewLTref_290017200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 404833 405426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017300.1"; gene_id "LTnewLTref_290017300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 404833 405426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017300.1"; gene_id "LTnewLTref_290017300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 407227 412923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017400.1"; gene_id "LTnewLTref_290017400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 407227 412923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017400.1"; gene_id "LTnewLTref_290017400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 415026 417800 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017500.1"; gene_id "LTnewLTref_290017500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 415026 417800 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017500.1"; gene_id "LTnewLTref_290017500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 419599 422826 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017600.1"; gene_id "LTnewLTref_290017600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 419599 422826 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017600.1"; gene_id "LTnewLTref_290017600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 423909 425030 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017700.1"; gene_id "LTnewLTref_290017700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 423909 425030 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017700.1"; gene_id "LTnewLTref_290017700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 426295 427416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017800.1"; gene_id "LTnewLTref_290017800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 426295 427416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017800.1"; gene_id "LTnewLTref_290017800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 428682 429803 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290017900.1"; gene_id "LTnewLTref_290017900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 428682 429803 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290017900.1"; gene_id "LTnewLTref_290017900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 430683 431765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018000.1"; gene_id "LTnewLTref_290018000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 430683 431765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018000.1"; gene_id "LTnewLTref_290018000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 433931 435808 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018100.1"; gene_id "LTnewLTref_290018100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 433931 435808 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018100.1"; gene_id "LTnewLTref_290018100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 442267 445662 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018200.1"; gene_id "LTnewLTref_290018200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 442267 445662 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018200.1"; gene_id "LTnewLTref_290018200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 449754 450869 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018300.1"; gene_id "LTnewLTref_290018300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 449754 450869 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018300.1"; gene_id "LTnewLTref_290018300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 453961 454788 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018400.1"; gene_id "LTnewLTref_290018400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 453961 454788 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018400.1"; gene_id "LTnewLTref_290018400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 459097 459546 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018500.1"; gene_id "LTnewLTref_290018500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 459097 459546 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018500.1"; gene_id "LTnewLTref_290018500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 460922 461359 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018600.1"; gene_id "LTnewLTref_290018600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 460922 461359 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018600.1"; gene_id "LTnewLTref_290018600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 462535 463647 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018700.1"; gene_id "LTnewLTref_290018700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 462535 463647 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018700.1"; gene_id "LTnewLTref_290018700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 466469 473833 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018800.1"; gene_id "LTnewLTref_290018800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 466469 473833 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018800.1"; gene_id "LTnewLTref_290018800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 475252 477045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290018900.1"; gene_id "LTnewLTref_290018900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 475252 477045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290018900.1"; gene_id "LTnewLTref_290018900"; CM024315.1 Liftoff transcript 478598 480421 . + . transcript_id "LTnewLTref_290019000.1"; gene_id "LTnewLTref_290019000" CM024315.1 Liftoff CDS 478598 480421 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019000.1"; gene_id "LTnewLTref_290019000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 481252 482379 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019100.1"; gene_id "LTnewLTref_290019100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 481252 482379 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019100.1"; gene_id "LTnewLTref_290019100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 483069 484492 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019200.1"; gene_id "LTnewLTref_290019200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 483069 483759 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019200.1"; gene_id "LTnewLTref_290019200"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 483819 484492 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_290019200.1"; gene_id "LTnewLTref_290019200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 485525 492070 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019300.1"; gene_id "LTnewLTref_290019300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 485525 488893 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019300.1"; gene_id "LTnewLTref_290019300"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 488963 492070 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019300.1"; gene_id "LTnewLTref_290019300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 493425 495746 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019400.1"; gene_id "LTnewLTref_290019400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 493425 495746 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019400.1"; gene_id "LTnewLTref_290019400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 497607 503057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019500.1"; gene_id "LTnewLTref_290019500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 497607 503057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019500.1"; gene_id "LTnewLTref_290019500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 504477 509639 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019600.1"; gene_id "LTnewLTref_290019600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 504477 509639 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019600.1"; gene_id "LTnewLTref_290019600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 511898 514501 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019700.1"; gene_id "LTnewLTref_290019700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 511898 514501 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019700.1"; gene_id "LTnewLTref_290019700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 518082 523802 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019800.1"; gene_id "LTnewLTref_290019800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 518082 523802 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019800.1"; gene_id "LTnewLTref_290019800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 524686 525042 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290019900.1"; gene_id "LTnewLTref_290019900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 524686 525042 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290019900.1"; gene_id "LTnewLTref_290019900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 526165 527238 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290020000.1"; gene_id "LTnewLTref_290020000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 526165 527238 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020000.1"; gene_id "LTnewLTref_290020000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 529318 531201 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290020100.1"; gene_id "LTnewLTref_290020100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 529318 531201 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020100.1"; gene_id "LTnewLTref_290020100"; CM024315.1 Liftoff transcript 533544 533732 . + . transcript_id "LTnewLTref_290020200.1"; gene_id "LTnewLTref_290020200" CM024315.1 Liftoff CDS 533544 533732 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020200.1"; gene_id "LTnewLTref_290020200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 534957 536303 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290020300.1"; gene_id "LTnewLTref_290020300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 534957 536303 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020300.1"; gene_id "LTnewLTref_290020300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 537842 539605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290020400.1"; gene_id "LTnewLTref_290020400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 537842 539605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020400.1"; gene_id "LTnewLTref_290020400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 544666 546585 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290020500.1"; gene_id "LTnewLTref_290020500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 544666 546585 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020500.1"; gene_id "LTnewLTref_290020500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 560594 561821 0.92 + . transcript_id "LTnewLTref_290020600.1"; gene_id "LTnewLTref_290020600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 560594 561154 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020600.1"; gene_id "LTnewLTref_290020600"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 561729 561821 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020600.1"; gene_id "LTnewLTref_290020600"; CM024315.1 . transcript 561939 562521 . + . transcript_id "LTnewLTref_290020700.1"; gene_id "LTnewLTref_290020700:pseudogene" CM024315.1 . exon 561939 562521 . + . transcript_id "LTnewLTref_290020700.1"; gene_id "LTnewLTref_290020700:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 563829 568130 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_290020800.1"; gene_id "LTnewLTref_290020800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 563829 564408 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290020800.1"; gene_id "LTnewLTref_290020800"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 567574 568130 0.93 + 2 transcript_id "LTnewLTref_290020800.1"; gene_id "LTnewLTref_290020800"; CM024315.1 . transcript 568964 569398 . + . transcript_id "LTnewLTref_290020900.1"; gene_id "LTnewLTref_290020900:pseudogene" CM024315.1 . exon 568964 569398 . + . transcript_id "LTnewLTref_290020900.1"; gene_id "LTnewLTref_290020900:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 575306 578067 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_290021000.1"; gene_id "LTnewLTref_290021000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 575306 575389 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021000.1"; gene_id "LTnewLTref_290021000"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 575482 578067 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021000.1"; gene_id "LTnewLTref_290021000"; CM024315.1 Aragorn_1.2.36 transcript 575598 575682 . - . transcript_id "LTnewLTref_290021100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_290021100" CM024315.1 Aragorn_1.2.36 exon 575598 575682 . - . transcript_id "LTnewLTref_290021100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_290021100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 591056 593047 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290021200.1"; gene_id "LTnewLTref_290021200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 591056 593047 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021200.1"; gene_id "LTnewLTref_290021200"; CM024315.1 Liftoff transcript 612619 617004 . + . transcript_id "LTnewLTref_290021300.1"; gene_id "LTnewLTref_290021300" CM024315.1 Liftoff CDS 612619 617004 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021300.1"; gene_id "LTnewLTref_290021300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 619890 621818 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290021400.1"; gene_id "LTnewLTref_290021400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 619890 621818 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021400.1"; gene_id "LTnewLTref_290021400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 624422 626767 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290021500.1"; gene_id "LTnewLTref_290021500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 624422 626767 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021500.1"; gene_id "LTnewLTref_290021500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 637135 638085 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290021600.1"; gene_id "LTnewLTref_290021600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 637135 638085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021600.1"; gene_id "LTnewLTref_290021600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 641224 645009 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_290021700.1"; gene_id "LTnewLTref_290021700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 641224 645009 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021700.1"; gene_id "LTnewLTref_290021700"; CM024315.1 Liftoff transcript 647154 647431 . + . transcript_id "LTnewLTref_290021800.1"; gene_id "LTnewLTref_290021800" CM024315.1 Liftoff CDS 647154 647431 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_290021800.1"; gene_id "LTnewLTref_290021800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 649357 649854 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290021900.1"; gene_id "LTnewLTref_290021900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 649357 649854 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290021900.1"; gene_id "LTnewLTref_290021900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 650592 652211 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290022000.1"; gene_id "LTnewLTref_290022000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 650592 652211 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022000.1"; gene_id "LTnewLTref_290022000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 655422 655661 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290022100.1"; gene_id "LTnewLTref_290022100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 655422 655661 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022100.1"; gene_id "LTnewLTref_290022100"; CM024315.1 . transcript 656356 656885 . - . transcript_id "LTnewLTref_290022200.1"; gene_id "LTnewLTref_290022200:pseudogene" CM024315.1 . exon 656356 656885 . - . transcript_id "LTnewLTref_290022200.1"; gene_id "LTnewLTref_290022200:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 659029 667005 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290022300.1"; gene_id "LTnewLTref_290022300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 659029 667005 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022300.1"; gene_id "LTnewLTref_290022300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 668633 672766 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290022400.1"; gene_id "LTnewLTref_290022400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 668633 672766 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022400.1"; gene_id "LTnewLTref_290022400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 675143 677281 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290022500.1"; gene_id "LTnewLTref_290022500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 675143 677281 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022500.1"; gene_id "LTnewLTref_290022500"; CM024315.1 . transcript 678403 678933 . - . transcript_id "LTnewLTref_290022600.1"; gene_id "LTnewLTref_290022600:pseudogene" CM024315.1 . exon 678403 678933 . - . transcript_id "LTnewLTref_290022600.1"; gene_id "LTnewLTref_290022600:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 681549 685256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290022700.1"; gene_id "LTnewLTref_290022700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 681549 685256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022700.1"; gene_id "LTnewLTref_290022700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 689192 691211 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_290022800.1"; gene_id "LTnewLTref_290022800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 689192 690760 0.59 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022800.1"; gene_id "LTnewLTref_290022800"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 690807 691211 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022800.1"; gene_id "LTnewLTref_290022800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 699410 700622 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_290022900.1"; gene_id "LTnewLTref_290022900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 699410 700244 0.53 - 1 transcript_id "LTnewLTref_290022900.1"; gene_id "LTnewLTref_290022900"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 700303 700622 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290022900.1"; gene_id "LTnewLTref_290022900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 700657 703119 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023000.1"; gene_id "LTnewLTref_290023000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 700657 703119 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023000.1"; gene_id "LTnewLTref_290023000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 707025 709046 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023100.1"; gene_id "LTnewLTref_290023100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 707025 709046 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023100.1"; gene_id "LTnewLTref_290023100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 715097 717043 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023200.1"; gene_id "LTnewLTref_290023200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 715097 717043 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023200.1"; gene_id "LTnewLTref_290023200"; CM024315.1 . transcript 722404 724373 . - . transcript_id "LTnewLTref_290023300.1"; gene_id "LTnewLTref_290023300:pseudogene" CM024315.1 . exon 722404 724373 . - . transcript_id "LTnewLTref_290023300.1"; gene_id "LTnewLTref_290023300:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 726033 728168 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023400.1"; gene_id "LTnewLTref_290023400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 726033 728168 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023400.1"; gene_id "LTnewLTref_290023400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 729955 730533 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023500.1"; gene_id "LTnewLTref_290023500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 729955 730533 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023500.1"; gene_id "LTnewLTref_290023500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 731445 733805 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023600.1"; gene_id "LTnewLTref_290023600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 731445 733805 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023600.1"; gene_id "LTnewLTref_290023600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 735124 736713 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023700.1"; gene_id "LTnewLTref_290023700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 735124 736713 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023700.1"; gene_id "LTnewLTref_290023700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 736775 737472 0.45 - . transcript_id "LTnewLTref_290023800.1"; gene_id "LTnewLTref_290023800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 736775 737025 0.93 - 2 transcript_id "LTnewLTref_290023800.1"; gene_id "LTnewLTref_290023800"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 737079 737472 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023800.1"; gene_id "LTnewLTref_290023800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 739167 740372 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290023900.1"; gene_id "LTnewLTref_290023900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 739167 740372 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290023900.1"; gene_id "LTnewLTref_290023900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 741243 743132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290024000.1"; gene_id "LTnewLTref_290024000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 741243 743132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024000.1"; gene_id "LTnewLTref_290024000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 744553 745755 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290024100.1"; gene_id "LTnewLTref_290024100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 744553 745755 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024100.1"; gene_id "LTnewLTref_290024100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 746370 746738 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290024200.1"; gene_id "LTnewLTref_290024200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 746370 746738 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024200.1"; gene_id "LTnewLTref_290024200"; CM024315.1 . transcript 747773 750813 . - . transcript_id "LTnewLTref_290024300.1"; gene_id "LTnewLTref_290024300:pseudogene" CM024315.1 . exon 747773 750813 . - . transcript_id "LTnewLTref_290024300.1"; gene_id "LTnewLTref_290024300:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 754578 756620 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290024400.1"; gene_id "LTnewLTref_290024400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 754578 756620 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024400.1"; gene_id "LTnewLTref_290024400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 758044 759174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290024500.1"; gene_id "LTnewLTref_290024500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 758044 759174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024500.1"; gene_id "LTnewLTref_290024500"; CM024315.1 Liftoff transcript 760365 760638 . - . transcript_id "LTnewLTref_290024600.1"; gene_id "LTnewLTref_290024600" CM024315.1 Liftoff CDS 760365 760638 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024600.1"; gene_id "LTnewLTref_290024600"; CM024315.1 Liftoff transcript 761012 761343 . - . transcript_id "LTnewLTref_290024700.1"; gene_id "LTnewLTref_290024700" CM024315.1 Liftoff CDS 761012 761343 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024700.1"; gene_id "LTnewLTref_290024700"; CM024315.1 Liftoff transcript 762180 768719 . - . transcript_id "LTnewLTref_290024800.1"; gene_id "LTnewLTref_290024800" CM024315.1 Liftoff CDS 762180 768719 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024800.1"; gene_id "LTnewLTref_290024800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 770109 773762 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290024900.1"; gene_id "LTnewLTref_290024900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 770109 773762 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290024900.1"; gene_id "LTnewLTref_290024900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 777424 778815 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025000.1"; gene_id "LTnewLTref_290025000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 777424 778815 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025000.1"; gene_id "LTnewLTref_290025000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 780902 781294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025100.1"; gene_id "LTnewLTref_290025100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 780902 781294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025100.1"; gene_id "LTnewLTref_290025100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 783186 784541 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025200.1"; gene_id "LTnewLTref_290025200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 783186 784541 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025200.1"; gene_id "LTnewLTref_290025200"; CM024315.1 . transcript 786962 787339 . - . transcript_id "LTnewLTref_290025300.1"; gene_id "LTnewLTref_290025300:pseudogene" CM024315.1 . exon 786962 787339 . - . transcript_id "LTnewLTref_290025300.1"; gene_id "LTnewLTref_290025300:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 787837 788646 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025400.1"; gene_id "LTnewLTref_290025400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 787837 788646 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025400.1"; gene_id "LTnewLTref_290025400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 791918 792310 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025500.1"; gene_id "LTnewLTref_290025500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 791918 792310 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025500.1"; gene_id "LTnewLTref_290025500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 793626 794825 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025600.1"; gene_id "LTnewLTref_290025600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 793626 794825 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025600.1"; gene_id "LTnewLTref_290025600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 796016 799702 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025700.1"; gene_id "LTnewLTref_290025700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 796016 799702 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025700.1"; gene_id "LTnewLTref_290025700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 800868 804158 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025800.1"; gene_id "LTnewLTref_290025800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 800868 804158 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025800.1"; gene_id "LTnewLTref_290025800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 805068 805466 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290025900.1"; gene_id "LTnewLTref_290025900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 805068 805466 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290025900.1"; gene_id "LTnewLTref_290025900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 806661 807059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026000.1"; gene_id "LTnewLTref_290026000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 806661 807059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026000.1"; gene_id "LTnewLTref_290026000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 807709 808107 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026100.1"; gene_id "LTnewLTref_290026100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 807709 808107 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026100.1"; gene_id "LTnewLTref_290026100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 810404 812179 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026200.1"; gene_id "LTnewLTref_290026200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 810404 812179 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026200.1"; gene_id "LTnewLTref_290026200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 814392 816179 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026300.1"; gene_id "LTnewLTref_290026300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 814392 816179 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026300.1"; gene_id "LTnewLTref_290026300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 818412 820199 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026400.1"; gene_id "LTnewLTref_290026400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 818412 820199 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026400.1"; gene_id "LTnewLTref_290026400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 822411 824198 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026500.1"; gene_id "LTnewLTref_290026500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 822411 824198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026500.1"; gene_id "LTnewLTref_290026500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 825458 826579 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026600.1"; gene_id "LTnewLTref_290026600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 825458 826579 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026600.1"; gene_id "LTnewLTref_290026600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 827418 830921 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026700.1"; gene_id "LTnewLTref_290026700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 827418 830921 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026700.1"; gene_id "LTnewLTref_290026700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 832675 833067 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026800.1"; gene_id "LTnewLTref_290026800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 832675 833067 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026800.1"; gene_id "LTnewLTref_290026800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 835539 837401 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290026900.1"; gene_id "LTnewLTref_290026900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 835539 837401 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290026900.1"; gene_id "LTnewLTref_290026900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 838107 839528 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_290027000.1"; gene_id "LTnewLTref_290027000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 838107 839528 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027000.1"; gene_id "LTnewLTref_290027000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 840059 841585 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027100.1"; gene_id "LTnewLTref_290027100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 840059 841585 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027100.1"; gene_id "LTnewLTref_290027100"; CM024315.1 Aragorn_1.2.36 transcript 842571 842653 . - . transcript_id "LTnewLTref_290027200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_290027200" CM024315.1 Aragorn_1.2.36 exon 842571 842653 . - . transcript_id "LTnewLTref_290027200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_290027200"; CM024315.1 Aragorn_1.2.36 transcript 842713 842793 . - . transcript_id "LTnewLTref_290027300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_290027300" CM024315.1 Aragorn_1.2.36 exon 842713 842793 . - . transcript_id "LTnewLTref_290027300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_290027300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 843468 844466 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027400.1"; gene_id "LTnewLTref_290027400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 843468 844466 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027400.1"; gene_id "LTnewLTref_290027400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 845394 846236 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027500.1"; gene_id "LTnewLTref_290027500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 845394 846236 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027500.1"; gene_id "LTnewLTref_290027500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 846737 848401 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027600.1"; gene_id "LTnewLTref_290027600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 846737 848401 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027600.1"; gene_id "LTnewLTref_290027600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 850693 851019 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027700.1"; gene_id "LTnewLTref_290027700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 850693 851019 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027700.1"; gene_id "LTnewLTref_290027700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 852432 855638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027800.1"; gene_id "LTnewLTref_290027800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 852432 855638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027800.1"; gene_id "LTnewLTref_290027800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 857471 858661 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290027900.1"; gene_id "LTnewLTref_290027900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 857471 858661 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290027900.1"; gene_id "LTnewLTref_290027900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 859302 860645 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028000.1"; gene_id "LTnewLTref_290028000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 859302 860645 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028000.1"; gene_id "LTnewLTref_290028000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 861439 862818 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028100.1"; gene_id "LTnewLTref_290028100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 861439 862818 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028100.1"; gene_id "LTnewLTref_290028100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 863526 864353 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028200.1"; gene_id "LTnewLTref_290028200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 863526 864353 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028200.1"; gene_id "LTnewLTref_290028200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 865157 866974 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028300.1"; gene_id "LTnewLTref_290028300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 865157 866974 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028300.1"; gene_id "LTnewLTref_290028300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 867784 868404 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028400.1"; gene_id "LTnewLTref_290028400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 867784 868404 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028400.1"; gene_id "LTnewLTref_290028400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 872782 875064 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028500.1"; gene_id "LTnewLTref_290028500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 872782 875064 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028500.1"; gene_id "LTnewLTref_290028500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 877608 879314 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028600.1"; gene_id "LTnewLTref_290028600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 877608 879314 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028600.1"; gene_id "LTnewLTref_290028600"; CM024315.1 Liftoff transcript 880577 880977 . - . transcript_id "LTnewLTref_290028700.1"; gene_id "LTnewLTref_290028700" CM024315.1 Liftoff CDS 880577 880977 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028700.1"; gene_id "LTnewLTref_290028700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 883096 888915 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028800.1"; gene_id "LTnewLTref_290028800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 883096 888915 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028800.1"; gene_id "LTnewLTref_290028800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 890622 892232 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290028900.1"; gene_id "LTnewLTref_290028900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 890622 892232 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290028900.1"; gene_id "LTnewLTref_290028900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 892785 893894 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029000.1"; gene_id "LTnewLTref_290029000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 892785 893894 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029000.1"; gene_id "LTnewLTref_290029000"; CM024315.1 . transcript 894280 896392 . - . transcript_id "LTnewLTref_290029100.1"; gene_id "LTnewLTref_290029100:pseudogene" CM024315.1 . exon 894280 896392 . - . transcript_id "LTnewLTref_290029100.1"; gene_id "LTnewLTref_290029100:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 897012 899126 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029200.1"; gene_id "LTnewLTref_290029200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 897012 899126 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029200.1"; gene_id "LTnewLTref_290029200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 901279 903726 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029300.1"; gene_id "LTnewLTref_290029300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 901279 903726 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029300.1"; gene_id "LTnewLTref_290029300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 905705 908353 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029400.1"; gene_id "LTnewLTref_290029400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 905705 908353 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029400.1"; gene_id "LTnewLTref_290029400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 909200 913063 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029500.1"; gene_id "LTnewLTref_290029500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 909200 913063 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029500.1"; gene_id "LTnewLTref_290029500"; CM024315.1 Liftoff transcript 916244 916687 . - . transcript_id "LTnewLTref_290029600.1"; gene_id "LTnewLTref_290029600" CM024315.1 Liftoff CDS 916244 916687 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029600.1"; gene_id "LTnewLTref_290029600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 917464 919701 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029700.1"; gene_id "LTnewLTref_290029700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 917464 919701 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029700.1"; gene_id "LTnewLTref_290029700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 924204 927485 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029800.1"; gene_id "LTnewLTref_290029800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 924204 927485 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029800.1"; gene_id "LTnewLTref_290029800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 928422 929750 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290029900.1"; gene_id "LTnewLTref_290029900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 928422 929750 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290029900.1"; gene_id "LTnewLTref_290029900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 930638 931993 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030000.1"; gene_id "LTnewLTref_290030000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 930638 931993 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030000.1"; gene_id "LTnewLTref_290030000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 934034 938842 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030100.1"; gene_id "LTnewLTref_290030100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 934034 938842 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030100.1"; gene_id "LTnewLTref_290030100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 942003 943925 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030200.1"; gene_id "LTnewLTref_290030200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 942003 943925 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030200.1"; gene_id "LTnewLTref_290030200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 944896 945120 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030300.1"; gene_id "LTnewLTref_290030300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 944896 945120 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030300.1"; gene_id "LTnewLTref_290030300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 945860 951223 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030400.1"; gene_id "LTnewLTref_290030400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 945860 951223 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030400.1"; gene_id "LTnewLTref_290030400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 954372 955262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030500.1"; gene_id "LTnewLTref_290030500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 954372 955262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030500.1"; gene_id "LTnewLTref_290030500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 957419 958849 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030600.1"; gene_id "LTnewLTref_290030600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 957419 958849 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030600.1"; gene_id "LTnewLTref_290030600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 961769 962440 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030700.1"; gene_id "LTnewLTref_290030700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 961769 962440 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030700.1"; gene_id "LTnewLTref_290030700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 970092 971828 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030800.1"; gene_id "LTnewLTref_290030800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 970092 971828 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030800.1"; gene_id "LTnewLTref_290030800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 976430 977767 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290030900.1"; gene_id "LTnewLTref_290030900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 976430 977767 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290030900.1"; gene_id "LTnewLTref_290030900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 978504 980348 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290031000.1"; gene_id "LTnewLTref_290031000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 978504 980348 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290031000.1"; gene_id "LTnewLTref_290031000"; CM024315.1 . transcript 981455 983059 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031100.1"; gene_id "LTnewLTref_290031100:pseudogene" CM024315.1 . exon 981455 983059 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031100.1"; gene_id "LTnewLTref_290031100:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 986615 990925 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290031200.1"; gene_id "LTnewLTref_290031200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 986615 990925 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290031200.1"; gene_id "LTnewLTref_290031200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 994835 996925 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290031300.1"; gene_id "LTnewLTref_290031300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 994835 996925 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290031300.1"; gene_id "LTnewLTref_290031300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 998833 1000299 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290031400.1"; gene_id "LTnewLTref_290031400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 998833 1000299 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290031400.1"; gene_id "LTnewLTref_290031400"; CM024315.1 . transcript 1002674 1002994 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031500.1"; gene_id "LTnewLTref_290031500:pseudogene" CM024315.1 . exon 1002674 1002994 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031500.1"; gene_id "LTnewLTref_290031500:pseudogene"; CM024315.1 . transcript 1003064 1004152 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031600.1"; gene_id "LTnewLTref_290031600:pseudogene" CM024315.1 . exon 1003064 1004152 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031600.1"; gene_id "LTnewLTref_290031600:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1005427 1007031 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290031700.1"; gene_id "LTnewLTref_290031700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1005427 1007031 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290031700.1"; gene_id "LTnewLTref_290031700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1009185 1011791 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290031800.1"; gene_id "LTnewLTref_290031800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1009185 1011791 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290031800.1"; gene_id "LTnewLTref_290031800"; CM024315.1 . transcript 1012307 1012560 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031900.1"; gene_id "LTnewLTref_290031900:pseudogene" CM024315.1 . exon 1012307 1012560 . - . transcript_id "LTnewLTref_290031900.1"; gene_id "LTnewLTref_290031900:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1014236 1016359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032000.1"; gene_id "LTnewLTref_290032000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1014236 1016359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032000.1"; gene_id "LTnewLTref_290032000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1017395 1018357 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032100.1"; gene_id "LTnewLTref_290032100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1017395 1018357 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032100.1"; gene_id "LTnewLTref_290032100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1021256 1022230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032200.1"; gene_id "LTnewLTref_290032200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1021256 1022230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032200.1"; gene_id "LTnewLTref_290032200"; CM024315.1 . transcript 1023563 1024792 . - . transcript_id "LTnewLTref_290032300.1"; gene_id "LTnewLTref_290032300:pseudogene" CM024315.1 . exon 1023563 1024792 . - . transcript_id "LTnewLTref_290032300.1"; gene_id "LTnewLTref_290032300:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1034206 1035444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032400.1"; gene_id "LTnewLTref_290032400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1034206 1035444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032400.1"; gene_id "LTnewLTref_290032400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1040105 1042351 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032500.1"; gene_id "LTnewLTref_290032500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1040105 1042351 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032500.1"; gene_id "LTnewLTref_290032500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1045247 1046050 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032600.1"; gene_id "LTnewLTref_290032600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1045247 1046050 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032600.1"; gene_id "LTnewLTref_290032600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1048532 1049650 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032700.1"; gene_id "LTnewLTref_290032700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1048532 1049650 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032700.1"; gene_id "LTnewLTref_290032700"; CM024315.1 . transcript 1050237 1051342 . - . transcript_id "LTnewLTref_290032800.1"; gene_id "LTnewLTref_290032800:pseudogene" CM024315.1 . exon 1050237 1051342 . - . transcript_id "LTnewLTref_290032800.1"; gene_id "LTnewLTref_290032800:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1051745 1052299 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290032900.1"; gene_id "LTnewLTref_290032900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1051745 1052299 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290032900.1"; gene_id "LTnewLTref_290032900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1052696 1053316 1 - . transcript_id "LTnewLTref_290033000.1"; gene_id "LTnewLTref_290033000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1052696 1053316 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_290033000.1"; gene_id "LTnewLTref_290033000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1054862 1056223 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_290033100.1"; gene_id "LTnewLTref_290033100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1054862 1056223 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033100.1"; gene_id "LTnewLTref_290033100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1057796 1059568 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033200.1"; gene_id "LTnewLTref_290033200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1057796 1059568 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033200.1"; gene_id "LTnewLTref_290033200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1061293 1063062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033300.1"; gene_id "LTnewLTref_290033300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1061293 1063062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033300.1"; gene_id "LTnewLTref_290033300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1067851 1069050 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033400.1"; gene_id "LTnewLTref_290033400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1067851 1069050 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033400.1"; gene_id "LTnewLTref_290033400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1071387 1072634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033500.1"; gene_id "LTnewLTref_290033500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1071387 1072634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033500.1"; gene_id "LTnewLTref_290033500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1074577 1076745 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033600.1"; gene_id "LTnewLTref_290033600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1074577 1076745 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033600.1"; gene_id "LTnewLTref_290033600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1077986 1080352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033700.1"; gene_id "LTnewLTref_290033700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1077986 1080352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033700.1"; gene_id "LTnewLTref_290033700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1081750 1083924 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033800.1"; gene_id "LTnewLTref_290033800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1081750 1083924 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033800.1"; gene_id "LTnewLTref_290033800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1089049 1089516 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290033900.1"; gene_id "LTnewLTref_290033900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1089049 1089516 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290033900.1"; gene_id "LTnewLTref_290033900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1092286 1092948 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034000.1"; gene_id "LTnewLTref_290034000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1092286 1092948 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034000.1"; gene_id "LTnewLTref_290034000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1094324 1094986 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034100.1"; gene_id "LTnewLTref_290034100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1094324 1094986 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034100.1"; gene_id "LTnewLTref_290034100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1096397 1098925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034200.1"; gene_id "LTnewLTref_290034200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1096397 1098925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034200.1"; gene_id "LTnewLTref_290034200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1100658 1102001 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034300.1"; gene_id "LTnewLTref_290034300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1100658 1102001 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034300.1"; gene_id "LTnewLTref_290034300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1103833 1105170 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034400.1"; gene_id "LTnewLTref_290034400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1103833 1105170 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034400.1"; gene_id "LTnewLTref_290034400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1107951 1109411 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034500.1"; gene_id "LTnewLTref_290034500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1107951 1109411 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034500.1"; gene_id "LTnewLTref_290034500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1113375 1114583 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034600.1"; gene_id "LTnewLTref_290034600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1113375 1114583 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034600.1"; gene_id "LTnewLTref_290034600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1115806 1116009 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034700.1"; gene_id "LTnewLTref_290034700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1115806 1116009 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034700.1"; gene_id "LTnewLTref_290034700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1117094 1117540 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_290034800.1"; gene_id "LTnewLTref_290034800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1117094 1117376 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034800.1"; gene_id "LTnewLTref_290034800"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1117482 1117540 0.67 + 2 transcript_id "LTnewLTref_290034800.1"; gene_id "LTnewLTref_290034800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1118653 1120557 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290034900.1"; gene_id "LTnewLTref_290034900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1118653 1120557 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290034900.1"; gene_id "LTnewLTref_290034900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1123139 1125760 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035000.1"; gene_id "LTnewLTref_290035000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1123139 1125760 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035000.1"; gene_id "LTnewLTref_290035000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1126968 1127990 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035100.1"; gene_id "LTnewLTref_290035100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1126968 1127990 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035100.1"; gene_id "LTnewLTref_290035100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1129961 1131466 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035200.1"; gene_id "LTnewLTref_290035200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1129961 1131466 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035200.1"; gene_id "LTnewLTref_290035200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1134617 1136371 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035300.1"; gene_id "LTnewLTref_290035300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1134617 1136371 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035300.1"; gene_id "LTnewLTref_290035300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1138398 1140485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035400.1"; gene_id "LTnewLTref_290035400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1138398 1140485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035400.1"; gene_id "LTnewLTref_290035400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1141598 1143919 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035500.1"; gene_id "LTnewLTref_290035500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1141598 1141860 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035500.1"; gene_id "LTnewLTref_290035500"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1142680 1143919 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_290035500.1"; gene_id "LTnewLTref_290035500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1144577 1146736 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035600.1"; gene_id "LTnewLTref_290035600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1144577 1146736 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035600.1"; gene_id "LTnewLTref_290035600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1147257 1147625 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035700.1"; gene_id "LTnewLTref_290035700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1147257 1147625 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035700.1"; gene_id "LTnewLTref_290035700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1150877 1154590 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035800.1"; gene_id "LTnewLTref_290035800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1150877 1154590 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035800.1"; gene_id "LTnewLTref_290035800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1156436 1157761 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290035900.1"; gene_id "LTnewLTref_290035900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1156436 1157761 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290035900.1"; gene_id "LTnewLTref_290035900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1158848 1161970 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036000.1"; gene_id "LTnewLTref_290036000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1158848 1161970 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036000.1"; gene_id "LTnewLTref_290036000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1163176 1166037 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036100.1"; gene_id "LTnewLTref_290036100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1163176 1166037 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036100.1"; gene_id "LTnewLTref_290036100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1167230 1168798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036200.1"; gene_id "LTnewLTref_290036200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1167230 1168798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036200.1"; gene_id "LTnewLTref_290036200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1169651 1171229 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_290036300.1"; gene_id "LTnewLTref_290036300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1169651 1170210 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036300.1"; gene_id "LTnewLTref_290036300"; CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1171100 1171229 0.57 + 1 transcript_id "LTnewLTref_290036300.1"; gene_id "LTnewLTref_290036300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1171614 1174859 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036400.1"; gene_id "LTnewLTref_290036400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1171614 1174859 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036400.1"; gene_id "LTnewLTref_290036400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1175774 1176700 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036500.1"; gene_id "LTnewLTref_290036500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1175774 1176700 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036500.1"; gene_id "LTnewLTref_290036500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1177689 1180667 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036600.1"; gene_id "LTnewLTref_290036600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1177689 1180667 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036600.1"; gene_id "LTnewLTref_290036600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1181395 1182231 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036700.1"; gene_id "LTnewLTref_290036700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1181395 1182231 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036700.1"; gene_id "LTnewLTref_290036700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1183351 1184322 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036800.1"; gene_id "LTnewLTref_290036800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1183351 1184322 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036800.1"; gene_id "LTnewLTref_290036800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1186977 1188077 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290036900.1"; gene_id "LTnewLTref_290036900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1186977 1188077 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290036900.1"; gene_id "LTnewLTref_290036900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1189220 1190191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037000.1"; gene_id "LTnewLTref_290037000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1189220 1190191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037000.1"; gene_id "LTnewLTref_290037000"; CM024315.1 Liftoff transcript 1190967 1191185 . + . transcript_id "LTnewLTref_290037100.1"; gene_id "LTnewLTref_290037100" CM024315.1 Liftoff CDS 1190967 1191185 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037100.1"; gene_id "LTnewLTref_290037100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1192088 1193794 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037200.1"; gene_id "LTnewLTref_290037200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1192088 1193794 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037200.1"; gene_id "LTnewLTref_290037200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1194771 1195385 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037300.1"; gene_id "LTnewLTref_290037300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1194771 1195385 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037300.1"; gene_id "LTnewLTref_290037300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1196008 1196883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037400.1"; gene_id "LTnewLTref_290037400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1196008 1196883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037400.1"; gene_id "LTnewLTref_290037400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1200113 1200691 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037500.1"; gene_id "LTnewLTref_290037500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1200113 1200691 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037500.1"; gene_id "LTnewLTref_290037500"; CM024315.1 . transcript 1202098 1202536 . - . transcript_id "LTnewLTref_290037600.1"; gene_id "LTnewLTref_290037600:pseudogene" CM024315.1 . exon 1202098 1202271 . - . transcript_id "LTnewLTref_290037600.1"; gene_id "LTnewLTref_290037600:pseudogene"; CM024315.1 . exon 1202273 1202536 . - . transcript_id "LTnewLTref_290037600.1"; gene_id "LTnewLTref_290037600:pseudogene"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1203784 1204785 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037700.1"; gene_id "LTnewLTref_290037700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1203784 1204785 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037700.1"; gene_id "LTnewLTref_290037700"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1207452 1209662 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037800.1"; gene_id "LTnewLTref_290037800" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1207452 1209662 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037800.1"; gene_id "LTnewLTref_290037800"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1210412 1211146 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290037900.1"; gene_id "LTnewLTref_290037900" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1210412 1211146 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290037900.1"; gene_id "LTnewLTref_290037900"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1212245 1212877 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038000.1"; gene_id "LTnewLTref_290038000" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1212245 1212877 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038000.1"; gene_id "LTnewLTref_290038000"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1217471 1218412 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038100.1"; gene_id "LTnewLTref_290038100" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1217471 1218412 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038100.1"; gene_id "LTnewLTref_290038100"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1218830 1219207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038200.1"; gene_id "LTnewLTref_290038200" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1218830 1219207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038200.1"; gene_id "LTnewLTref_290038200"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1219717 1220202 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038300.1"; gene_id "LTnewLTref_290038300" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1219717 1220202 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038300.1"; gene_id "LTnewLTref_290038300"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1220839 1221996 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038400.1"; gene_id "LTnewLTref_290038400" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1220839 1221996 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038400.1"; gene_id "LTnewLTref_290038400"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1223425 1223691 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038500.1"; gene_id "LTnewLTref_290038500" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1223425 1223691 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038500.1"; gene_id "LTnewLTref_290038500"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1226306 1228420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_290038600.1"; gene_id "LTnewLTref_290038600" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1226306 1228420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_290038600.1"; gene_id "LTnewLTref_290038600"; CM024315.1 AUGUSTUS transcript 1231631 1231920 0.57 - . transcript_id "LTnewLTref_290038700.1"; gene_id "LTnewLTref_290038700" CM024315.1 AUGUSTUS CDS 1231631 1231920 0.58 - 2 transcript_id "LTnewLTref_290038700.1"; gene_id "LTnewLTref_290038700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 3574 3984 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005000.1"; gene_id "LTnewLTref_300005000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 3574 3984 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005000.1"; gene_id "LTnewLTref_300005000"; CM024316.1 Liftoff transcript 6379 6584 . + . transcript_id "LTnewLTref_300005100.1"; gene_id "LTnewLTref_300005100" CM024316.1 Liftoff CDS 6379 6584 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300005100.1"; gene_id "LTnewLTref_300005100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 7918 9195 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005200.1"; gene_id "LTnewLTref_300005200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 7918 9195 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005200.1"; gene_id "LTnewLTref_300005200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 9956 10693 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005300.1"; gene_id "LTnewLTref_300005300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 9956 10693 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005300.1"; gene_id "LTnewLTref_300005300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 11437 12153 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005400.1"; gene_id "LTnewLTref_300005400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 11437 12153 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005400.1"; gene_id "LTnewLTref_300005400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 13192 13617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005500.1"; gene_id "LTnewLTref_300005500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 13192 13617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005500.1"; gene_id "LTnewLTref_300005500"; CM024316.1 Liftoff transcript 14688 16982 . - . transcript_id "LTnewLTref_300005600.1"; gene_id "LTnewLTref_300005600" CM024316.1 Liftoff CDS 14688 16982 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005600.1"; gene_id "LTnewLTref_300005600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 18207 18929 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005700.1"; gene_id "LTnewLTref_300005700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 18207 18929 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005700.1"; gene_id "LTnewLTref_300005700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 19947 20831 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005800.1"; gene_id "LTnewLTref_300005800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 19947 20831 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005800.1"; gene_id "LTnewLTref_300005800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 21498 22760 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300005900.1"; gene_id "LTnewLTref_300005900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 21498 22760 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300005900.1"; gene_id "LTnewLTref_300005900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 27820 28485 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006000.1"; gene_id "LTnewLTref_300006000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 27820 28485 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006000.1"; gene_id "LTnewLTref_300006000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 30679 31077 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006100.1"; gene_id "LTnewLTref_300006100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 30679 31077 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006100.1"; gene_id "LTnewLTref_300006100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 32398 37095 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006200.1"; gene_id "LTnewLTref_300006200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 32398 37095 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006200.1"; gene_id "LTnewLTref_300006200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 38100 39383 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006300.1"; gene_id "LTnewLTref_300006300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 38100 39383 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006300.1"; gene_id "LTnewLTref_300006300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 41783 43648 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006400.1"; gene_id "LTnewLTref_300006400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 41783 43648 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006400.1"; gene_id "LTnewLTref_300006400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 44471 46588 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006500.1"; gene_id "LTnewLTref_300006500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 44471 46588 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006500.1"; gene_id "LTnewLTref_300006500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 47817 48857 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006600.1"; gene_id "LTnewLTref_300006600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 47817 48857 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006600.1"; gene_id "LTnewLTref_300006600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 50059 51129 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300006700.1"; gene_id "LTnewLTref_300006700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 50059 51129 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006700.1"; gene_id "LTnewLTref_300006700"; CM024316.1 Liftoff transcript 52373 54235 . - . transcript_id "LTnewLTref_300006800.1"; gene_id "LTnewLTref_300006800" CM024316.1 Liftoff CDS 52373 54235 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300006800.1"; gene_id "LTnewLTref_300006800"; CM024316.1 . transcript 54605 55784 . - . transcript_id "LTnewLTref_300006900.1"; gene_id "LTnewLTref_300006900:pseudogene" CM024316.1 . exon 54605 55784 . - . transcript_id "LTnewLTref_300006900.1"; gene_id "LTnewLTref_300006900:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 56360 57259 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007000.1"; gene_id "LTnewLTref_300007000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 56360 57259 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007000.1"; gene_id "LTnewLTref_300007000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 58624 59547 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007100.1"; gene_id "LTnewLTref_300007100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 58624 59547 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007100.1"; gene_id "LTnewLTref_300007100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 60359 62035 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_300007200.1"; gene_id "LTnewLTref_300007200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 60359 62035 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007200.1"; gene_id "LTnewLTref_300007200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 62807 63166 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007300.1"; gene_id "LTnewLTref_300007300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 62807 63166 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007300.1"; gene_id "LTnewLTref_300007300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 63937 65061 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007400.1"; gene_id "LTnewLTref_300007400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 63937 65061 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007400.1"; gene_id "LTnewLTref_300007400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 65703 66206 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007500.1"; gene_id "LTnewLTref_300007500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 65703 66206 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007500.1"; gene_id "LTnewLTref_300007500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 67438 68598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007600.1"; gene_id "LTnewLTref_300007600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 67438 68598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007600.1"; gene_id "LTnewLTref_300007600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 70456 71511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007700.1"; gene_id "LTnewLTref_300007700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 70456 71511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007700.1"; gene_id "LTnewLTref_300007700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 72497 74287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007800.1"; gene_id "LTnewLTref_300007800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 72497 74287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007800.1"; gene_id "LTnewLTref_300007800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 75171 78569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300007900.1"; gene_id "LTnewLTref_300007900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 75171 78569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300007900.1"; gene_id "LTnewLTref_300007900"; CM024316.1 Liftoff transcript 80201 82387 . - . transcript_id "LTnewLTref_300008000.1"; gene_id "LTnewLTref_300008000" CM024316.1 Liftoff CDS 80201 82387 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008000.1"; gene_id "LTnewLTref_300008000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 83906 85090 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300008100.1"; gene_id "LTnewLTref_300008100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 83906 85090 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008100.1"; gene_id "LTnewLTref_300008100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 86370 87023 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300008200.1"; gene_id "LTnewLTref_300008200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 86370 87023 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008200.1"; gene_id "LTnewLTref_300008200"; CM024316.1 Liftoff transcript 89409 94172 . - . transcript_id "LTnewLTref_300008300.1"; gene_id "LTnewLTref_300008300" CM024316.1 Liftoff CDS 89409 94172 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008300.1"; gene_id "LTnewLTref_300008300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 95770 96216 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300008400.1"; gene_id "LTnewLTref_300008400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 95770 96216 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008400.1"; gene_id "LTnewLTref_300008400"; CM024316.1 . transcript 97405 101629 . - . transcript_id "LTnewLTref_300008500.1"; gene_id "LTnewLTref_300008500:pseudogene" CM024316.1 . exon 97405 101629 . - . transcript_id "LTnewLTref_300008500.1"; gene_id "LTnewLTref_300008500:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 102610 104370 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300008600.1"; gene_id "LTnewLTref_300008600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 102610 104370 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008600.1"; gene_id "LTnewLTref_300008600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 105330 107910 0.86 - . transcript_id "LTnewLTref_300008700.1"; gene_id "LTnewLTref_300008700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 105330 105413 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008700.1"; gene_id "LTnewLTref_300008700"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 105460 107910 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008700.1"; gene_id "LTnewLTref_300008700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 109368 111764 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300008800.1"; gene_id "LTnewLTref_300008800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 109368 111764 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008800.1"; gene_id "LTnewLTref_300008800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 114984 116816 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300008900.1"; gene_id "LTnewLTref_300008900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 114984 116816 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300008900.1"; gene_id "LTnewLTref_300008900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 118442 120370 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009000.1"; gene_id "LTnewLTref_300009000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 118442 120370 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009000.1"; gene_id "LTnewLTref_300009000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 121950 123182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009100.1"; gene_id "LTnewLTref_300009100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 121950 123182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009100.1"; gene_id "LTnewLTref_300009100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 126351 127505 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009200.1"; gene_id "LTnewLTref_300009200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 126351 127505 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009200.1"; gene_id "LTnewLTref_300009200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 133079 133879 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009300.1"; gene_id "LTnewLTref_300009300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 133079 133879 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009300.1"; gene_id "LTnewLTref_300009300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 135894 137384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009400.1"; gene_id "LTnewLTref_300009400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 135894 137384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009400.1"; gene_id "LTnewLTref_300009400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 138306 139124 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009500.1"; gene_id "LTnewLTref_300009500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 138306 139124 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009500.1"; gene_id "LTnewLTref_300009500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 139604 141067 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009600.1"; gene_id "LTnewLTref_300009600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 139604 141067 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009600.1"; gene_id "LTnewLTref_300009600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 142038 143138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009700.1"; gene_id "LTnewLTref_300009700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 142038 143138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009700.1"; gene_id "LTnewLTref_300009700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 143922 145580 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009800.1"; gene_id "LTnewLTref_300009800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 143922 145580 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009800.1"; gene_id "LTnewLTref_300009800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 151018 151884 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300009900.1"; gene_id "LTnewLTref_300009900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 151018 151884 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300009900.1"; gene_id "LTnewLTref_300009900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 153438 154790 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010000.1"; gene_id "LTnewLTref_300010000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 153438 154790 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010000.1"; gene_id "LTnewLTref_300010000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 156378 158030 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010100.1"; gene_id "LTnewLTref_300010100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 156378 158030 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010100.1"; gene_id "LTnewLTref_300010100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 159002 161005 0.73 - . transcript_id "LTnewLTref_300010200.1"; gene_id "LTnewLTref_300010200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 159002 161005 0.73 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010200.1"; gene_id "LTnewLTref_300010200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 161720 163129 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010300.1"; gene_id "LTnewLTref_300010300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 161720 163129 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010300.1"; gene_id "LTnewLTref_300010300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 164054 166204 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010400.1"; gene_id "LTnewLTref_300010400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 164054 166204 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010400.1"; gene_id "LTnewLTref_300010400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 168644 170101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010500.1"; gene_id "LTnewLTref_300010500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 168644 170101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010500.1"; gene_id "LTnewLTref_300010500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 171654 175100 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010600.1"; gene_id "LTnewLTref_300010600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 171654 175100 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010600.1"; gene_id "LTnewLTref_300010600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 175896 178586 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010700.1"; gene_id "LTnewLTref_300010700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 175896 178586 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010700.1"; gene_id "LTnewLTref_300010700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 179485 180798 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010800.1"; gene_id "LTnewLTref_300010800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 179485 180798 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010800.1"; gene_id "LTnewLTref_300010800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 181548 182114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300010900.1"; gene_id "LTnewLTref_300010900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 181548 182114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300010900.1"; gene_id "LTnewLTref_300010900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 183244 185073 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011000.1"; gene_id "LTnewLTref_300011000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 183244 185073 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011000.1"; gene_id "LTnewLTref_300011000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 187205 188182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011100.1"; gene_id "LTnewLTref_300011100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 187205 188182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011100.1"; gene_id "LTnewLTref_300011100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 188771 190195 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011200.1"; gene_id "LTnewLTref_300011200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 188771 190195 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011200.1"; gene_id "LTnewLTref_300011200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 191606 193177 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011300.1"; gene_id "LTnewLTref_300011300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 191606 193177 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011300.1"; gene_id "LTnewLTref_300011300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 194324 196816 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011400.1"; gene_id "LTnewLTref_300011400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 194324 196816 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011400.1"; gene_id "LTnewLTref_300011400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 204101 206887 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011500.1"; gene_id "LTnewLTref_300011500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 204101 206887 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011500.1"; gene_id "LTnewLTref_300011500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 211536 213149 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011600.1"; gene_id "LTnewLTref_300011600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 211536 213149 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011600.1"; gene_id "LTnewLTref_300011600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 214233 214883 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011700.1"; gene_id "LTnewLTref_300011700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 214233 214883 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011700.1"; gene_id "LTnewLTref_300011700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 215655 217076 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011800.1"; gene_id "LTnewLTref_300011800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 215655 217076 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011800.1"; gene_id "LTnewLTref_300011800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 217764 218378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300011900.1"; gene_id "LTnewLTref_300011900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 217764 218378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300011900.1"; gene_id "LTnewLTref_300011900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 218787 219383 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012000.1"; gene_id "LTnewLTref_300012000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 218787 219383 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012000.1"; gene_id "LTnewLTref_300012000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 220205 221398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012100.1"; gene_id "LTnewLTref_300012100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 220205 221398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012100.1"; gene_id "LTnewLTref_300012100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 223432 225624 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012200.1"; gene_id "LTnewLTref_300012200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 223432 225624 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012200.1"; gene_id "LTnewLTref_300012200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 226271 226471 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_300012300.1"; gene_id "LTnewLTref_300012300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 226271 226471 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012300.1"; gene_id "LTnewLTref_300012300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 227103 227303 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012400.1"; gene_id "LTnewLTref_300012400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 227103 227303 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012400.1"; gene_id "LTnewLTref_300012400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 227755 227955 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012500.1"; gene_id "LTnewLTref_300012500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 227755 227955 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012500.1"; gene_id "LTnewLTref_300012500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 228409 228609 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012600.1"; gene_id "LTnewLTref_300012600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 228409 228609 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012600.1"; gene_id "LTnewLTref_300012600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 228928 229413 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012700.1"; gene_id "LTnewLTref_300012700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 228928 229413 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012700.1"; gene_id "LTnewLTref_300012700"; CM024316.1 Liftoff transcript 229850 230647 . - . transcript_id "LTnewLTref_300012800.1"; gene_id "LTnewLTref_300012800" CM024316.1 Liftoff CDS 229850 230647 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012800.1"; gene_id "LTnewLTref_300012800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 232111 233751 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300012900.1"; gene_id "LTnewLTref_300012900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 232111 233751 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300012900.1"; gene_id "LTnewLTref_300012900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 238636 239469 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013000.1"; gene_id "LTnewLTref_300013000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 238636 239469 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013000.1"; gene_id "LTnewLTref_300013000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 239847 240506 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013100.1"; gene_id "LTnewLTref_300013100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 239847 240506 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013100.1"; gene_id "LTnewLTref_300013100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 241319 241936 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013200.1"; gene_id "LTnewLTref_300013200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 241319 241936 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013200.1"; gene_id "LTnewLTref_300013200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 242241 242756 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013300.1"; gene_id "LTnewLTref_300013300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 242241 242756 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013300.1"; gene_id "LTnewLTref_300013300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 243055 243894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013400.1"; gene_id "LTnewLTref_300013400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 243055 243894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013400.1"; gene_id "LTnewLTref_300013400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 244244 244834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013500.1"; gene_id "LTnewLTref_300013500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 244244 244834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013500.1"; gene_id "LTnewLTref_300013500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 245698 249111 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013600.1"; gene_id "LTnewLTref_300013600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 245698 249111 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013600.1"; gene_id "LTnewLTref_300013600"; CM024316.1 Liftoff transcript 245734 245814 . - . transcript_id "LTnewLTref_300013700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_300013700" CM024316.1 Liftoff exon 245734 245814 . - . transcript_id "LTnewLTref_300013700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_300013700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 250144 250518 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013800.1"; gene_id "LTnewLTref_300013800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 250144 250518 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013800.1"; gene_id "LTnewLTref_300013800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 251278 253248 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300013900.1"; gene_id "LTnewLTref_300013900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 251278 253248 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300013900.1"; gene_id "LTnewLTref_300013900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 254442 255719 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014000.1"; gene_id "LTnewLTref_300014000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 254442 255719 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014000.1"; gene_id "LTnewLTref_300014000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 257699 259231 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014100.1"; gene_id "LTnewLTref_300014100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 257699 259231 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014100.1"; gene_id "LTnewLTref_300014100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 262933 263529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014200.1"; gene_id "LTnewLTref_300014200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 262933 263529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014200.1"; gene_id "LTnewLTref_300014200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 264126 264875 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014300.1"; gene_id "LTnewLTref_300014300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 264126 264875 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014300.1"; gene_id "LTnewLTref_300014300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 266130 266882 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014400.1"; gene_id "LTnewLTref_300014400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 266130 266882 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014400.1"; gene_id "LTnewLTref_300014400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 267853 270168 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014500.1"; gene_id "LTnewLTref_300014500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 267853 270168 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014500.1"; gene_id "LTnewLTref_300014500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 273412 273852 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014600.1"; gene_id "LTnewLTref_300014600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 273412 273852 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014600.1"; gene_id "LTnewLTref_300014600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 274759 277752 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014700.1"; gene_id "LTnewLTref_300014700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 274759 277752 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014700.1"; gene_id "LTnewLTref_300014700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 278605 279201 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014800.1"; gene_id "LTnewLTref_300014800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 278605 279201 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014800.1"; gene_id "LTnewLTref_300014800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 280691 281287 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300014900.1"; gene_id "LTnewLTref_300014900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 280691 281287 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300014900.1"; gene_id "LTnewLTref_300014900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 284418 285086 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015000.1"; gene_id "LTnewLTref_300015000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 284418 285086 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015000.1"; gene_id "LTnewLTref_300015000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 288272 289309 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015100.1"; gene_id "LTnewLTref_300015100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 288272 289309 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015100.1"; gene_id "LTnewLTref_300015100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 292139 292783 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015200.1"; gene_id "LTnewLTref_300015200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 292139 292783 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015200.1"; gene_id "LTnewLTref_300015200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 292139 292969 0.17 + . transcript_id "LTnewLTref_300015200.2"; gene_id "LTnewLTref_300015200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 292139 292762 0.25 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015200.2"; gene_id "LTnewLTref_300015200"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 292853 292969 0.24 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015200.2"; gene_id "LTnewLTref_300015200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 297386 299458 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015300.1"; gene_id "LTnewLTref_300015300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 297386 299458 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015300.1"; gene_id "LTnewLTref_300015300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 302061 306266 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015400.1"; gene_id "LTnewLTref_300015400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 302061 306266 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015400.1"; gene_id "LTnewLTref_300015400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 307717 310530 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015500.1"; gene_id "LTnewLTref_300015500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 307717 310530 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015500.1"; gene_id "LTnewLTref_300015500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 312154 313893 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015600.1"; gene_id "LTnewLTref_300015600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 312154 313893 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015600.1"; gene_id "LTnewLTref_300015600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 316092 318377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015700.1"; gene_id "LTnewLTref_300015700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 316092 318377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015700.1"; gene_id "LTnewLTref_300015700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 319398 321344 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300015800.1"; gene_id "LTnewLTref_300015800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 319398 321344 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015800.1"; gene_id "LTnewLTref_300015800"; CM024316.1 Liftoff transcript 325657 327420 . + . transcript_id "LTnewLTref_300015900.1"; gene_id "LTnewLTref_300015900" CM024316.1 Liftoff CDS 325657 327420 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300015900.1"; gene_id "LTnewLTref_300015900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 328414 329115 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016000.1"; gene_id "LTnewLTref_300016000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 328414 329115 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016000.1"; gene_id "LTnewLTref_300016000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 330697 332199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016100.1"; gene_id "LTnewLTref_300016100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 330697 332199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016100.1"; gene_id "LTnewLTref_300016100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 333337 335475 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_300016200.1"; gene_id "LTnewLTref_300016200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 333337 335475 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016200.1"; gene_id "LTnewLTref_300016200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 336077 337912 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016300.1"; gene_id "LTnewLTref_300016300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 336077 337912 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016300.1"; gene_id "LTnewLTref_300016300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 339080 342148 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016400.1"; gene_id "LTnewLTref_300016400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 339080 342148 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016400.1"; gene_id "LTnewLTref_300016400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 343911 345527 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016500.1"; gene_id "LTnewLTref_300016500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 343911 345527 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016500.1"; gene_id "LTnewLTref_300016500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 346272 347540 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016600.1"; gene_id "LTnewLTref_300016600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 346272 347540 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016600.1"; gene_id "LTnewLTref_300016600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 348467 349219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016700.1"; gene_id "LTnewLTref_300016700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 348467 349219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016700.1"; gene_id "LTnewLTref_300016700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 351157 352173 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016800.1"; gene_id "LTnewLTref_300016800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 351157 352173 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016800.1"; gene_id "LTnewLTref_300016800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 353295 353903 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300016900.1"; gene_id "LTnewLTref_300016900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 353295 353903 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300016900.1"; gene_id "LTnewLTref_300016900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 354724 355428 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017000.1"; gene_id "LTnewLTref_300017000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 354724 355428 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017000.1"; gene_id "LTnewLTref_300017000"; CM024316.1 Liftoff transcript 359759 367570 . + . transcript_id "LTnewLTref_300017100.1"; gene_id "LTnewLTref_300017100" CM024316.1 Liftoff CDS 359759 367570 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017100.1"; gene_id "LTnewLTref_300017100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 369756 373265 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017200.1"; gene_id "LTnewLTref_300017200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 369756 373265 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017200.1"; gene_id "LTnewLTref_300017200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 375198 376121 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017300.1"; gene_id "LTnewLTref_300017300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 375198 376121 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017300.1"; gene_id "LTnewLTref_300017300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 379221 381803 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017400.1"; gene_id "LTnewLTref_300017400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 379221 381803 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017400.1"; gene_id "LTnewLTref_300017400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 390748 392367 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017500.1"; gene_id "LTnewLTref_300017500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 390748 392367 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017500.1"; gene_id "LTnewLTref_300017500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 395173 395457 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017600.1"; gene_id "LTnewLTref_300017600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 395173 395457 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017600.1"; gene_id "LTnewLTref_300017600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 396432 396983 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017700.1"; gene_id "LTnewLTref_300017700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 396432 396983 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017700.1"; gene_id "LTnewLTref_300017700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 398252 400945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300017800.1"; gene_id "LTnewLTref_300017800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 398252 400945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017800.1"; gene_id "LTnewLTref_300017800"; CM024316.1 Liftoff transcript 401491 407280 . + . transcript_id "LTnewLTref_300017900.1"; gene_id "LTnewLTref_300017900" CM024316.1 Liftoff CDS 401491 407280 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300017900.1"; gene_id "LTnewLTref_300017900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 408599 410647 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018000.1"; gene_id "LTnewLTref_300018000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 408599 410647 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018000.1"; gene_id "LTnewLTref_300018000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 412959 413459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018100.1"; gene_id "LTnewLTref_300018100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 412959 413459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018100.1"; gene_id "LTnewLTref_300018100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 414380 416236 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018200.1"; gene_id "LTnewLTref_300018200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 414380 416236 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018200.1"; gene_id "LTnewLTref_300018200"; CM024316.1 . transcript 417512 417696 . + . transcript_id "LTnewLTref_300018300.1"; gene_id "LTnewLTref_300018300:pseudogene" CM024316.1 . exon 417512 417696 . + . transcript_id "LTnewLTref_300018300.1"; gene_id "LTnewLTref_300018300:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 418408 421428 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018400.1"; gene_id "LTnewLTref_300018400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 418408 421428 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018400.1"; gene_id "LTnewLTref_300018400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 423075 423335 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018500.1"; gene_id "LTnewLTref_300018500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 423075 423335 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018500.1"; gene_id "LTnewLTref_300018500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 424275 427067 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018600.1"; gene_id "LTnewLTref_300018600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 424275 427067 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018600.1"; gene_id "LTnewLTref_300018600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 429168 431339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018700.1"; gene_id "LTnewLTref_300018700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 429168 431339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018700.1"; gene_id "LTnewLTref_300018700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 433073 434314 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018800.1"; gene_id "LTnewLTref_300018800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 433073 434314 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018800.1"; gene_id "LTnewLTref_300018800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 435969 436877 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300018900.1"; gene_id "LTnewLTref_300018900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 435969 436877 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300018900.1"; gene_id "LTnewLTref_300018900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 437791 438846 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019000.1"; gene_id "LTnewLTref_300019000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 437791 438846 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019000.1"; gene_id "LTnewLTref_300019000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 440194 446166 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019100.1"; gene_id "LTnewLTref_300019100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 440194 446166 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019100.1"; gene_id "LTnewLTref_300019100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 447290 449404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019200.1"; gene_id "LTnewLTref_300019200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 447290 449404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019200.1"; gene_id "LTnewLTref_300019200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 450356 454696 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019300.1"; gene_id "LTnewLTref_300019300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 450356 454696 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019300.1"; gene_id "LTnewLTref_300019300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 455360 456226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019400.1"; gene_id "LTnewLTref_300019400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 455360 456226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019400.1"; gene_id "LTnewLTref_300019400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 457895 462253 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019500.1"; gene_id "LTnewLTref_300019500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 457895 462253 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019500.1"; gene_id "LTnewLTref_300019500"; CM024316.1 Liftoff transcript 463593 469385 . + . transcript_id "LTnewLTref_300019600.1"; gene_id "LTnewLTref_300019600" CM024316.1 Liftoff CDS 463593 469385 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019600.1"; gene_id "LTnewLTref_300019600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 470338 471939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019700.1"; gene_id "LTnewLTref_300019700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 470338 471939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019700.1"; gene_id "LTnewLTref_300019700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 470614 471939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019700.2"; gene_id "LTnewLTref_300019700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 470614 471939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019700.2"; gene_id "LTnewLTref_300019700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 472707 473663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019800.1"; gene_id "LTnewLTref_300019800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 472707 473663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019800.1"; gene_id "LTnewLTref_300019800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 474287 476434 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300019900.1"; gene_id "LTnewLTref_300019900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 474287 476434 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300019900.1"; gene_id "LTnewLTref_300019900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 477249 478838 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020000.1"; gene_id "LTnewLTref_300020000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 477249 478838 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020000.1"; gene_id "LTnewLTref_300020000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 477378 478838 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020000.2"; gene_id "LTnewLTref_300020000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 477378 478838 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020000.2"; gene_id "LTnewLTref_300020000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 481047 484226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020100.1"; gene_id "LTnewLTref_300020100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 481047 484226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020100.1"; gene_id "LTnewLTref_300020100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 488574 489899 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_300020200.1"; gene_id "LTnewLTref_300020200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 488574 489899 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020200.1"; gene_id "LTnewLTref_300020200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 492764 493261 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020300.1"; gene_id "LTnewLTref_300020300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 492764 493261 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020300.1"; gene_id "LTnewLTref_300020300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 495168 496829 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020400.1"; gene_id "LTnewLTref_300020400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 495168 496829 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020400.1"; gene_id "LTnewLTref_300020400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 499553 500080 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020500.1"; gene_id "LTnewLTref_300020500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 499553 500080 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020500.1"; gene_id "LTnewLTref_300020500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 501352 502149 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_300020600.1"; gene_id "LTnewLTref_300020600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 501352 501812 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020600.1"; gene_id "LTnewLTref_300020600"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 502029 502149 0.6 + 1 transcript_id "LTnewLTref_300020600.1"; gene_id "LTnewLTref_300020600"; CM024316.1 Liftoff transcript 502173 502616 . + . transcript_id "LTnewLTref_300020700.1"; gene_id "LTnewLTref_300020700" CM024316.1 Liftoff CDS 502173 502616 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020700.1"; gene_id "LTnewLTref_300020700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 503360 504152 0.31 + . transcript_id "LTnewLTref_300020800.1"; gene_id "LTnewLTref_300020800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 503360 503450 0.43 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020800.1"; gene_id "LTnewLTref_300020800"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 503998 504152 0.57 + 2 transcript_id "LTnewLTref_300020800.1"; gene_id "LTnewLTref_300020800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 503757 504152 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_300020800.2"; gene_id "LTnewLTref_300020800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 503757 504152 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020800.2"; gene_id "LTnewLTref_300020800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 505716 506243 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300020900.1"; gene_id "LTnewLTref_300020900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 505716 506243 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300020900.1"; gene_id "LTnewLTref_300020900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 507519 508180 0.21 + . transcript_id "LTnewLTref_300021000.1"; gene_id "LTnewLTref_300021000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 507519 507979 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021000.1"; gene_id "LTnewLTref_300021000"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 508147 508180 0.23 + 1 transcript_id "LTnewLTref_300021000.1"; gene_id "LTnewLTref_300021000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 507519 508313 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_300021000.2"; gene_id "LTnewLTref_300021000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 507519 507979 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021000.2"; gene_id "LTnewLTref_300021000"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 508193 508313 0.58 + 1 transcript_id "LTnewLTref_300021000.2"; gene_id "LTnewLTref_300021000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 508471 508692 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021100.1"; gene_id "LTnewLTref_300021100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 508471 508692 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021100.1"; gene_id "LTnewLTref_300021100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 509523 510315 0.29 + . transcript_id "LTnewLTref_300021200.1"; gene_id "LTnewLTref_300021200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 509523 509613 0.4 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021200.1"; gene_id "LTnewLTref_300021200"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 510161 510315 0.46 + 2 transcript_id "LTnewLTref_300021200.1"; gene_id "LTnewLTref_300021200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 509920 510315 0.7 + . transcript_id "LTnewLTref_300021200.2"; gene_id "LTnewLTref_300021200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 509920 510315 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021200.2"; gene_id "LTnewLTref_300021200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 511877 512404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021300.1"; gene_id "LTnewLTref_300021300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 511877 512404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021300.1"; gene_id "LTnewLTref_300021300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 514633 514854 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021400.1"; gene_id "LTnewLTref_300021400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 514633 514854 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021400.1"; gene_id "LTnewLTref_300021400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 515362 516630 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_300021500.1"; gene_id "LTnewLTref_300021500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 515362 516630 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021500.1"; gene_id "LTnewLTref_300021500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 518037 518564 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021600.1"; gene_id "LTnewLTref_300021600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 518037 518564 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021600.1"; gene_id "LTnewLTref_300021600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 520771 520992 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021700.1"; gene_id "LTnewLTref_300021700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 520771 520992 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021700.1"; gene_id "LTnewLTref_300021700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 527733 532127 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021800.1"; gene_id "LTnewLTref_300021800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 527733 532127 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021800.1"; gene_id "LTnewLTref_300021800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 535321 538956 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300021900.1"; gene_id "LTnewLTref_300021900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 535321 538956 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300021900.1"; gene_id "LTnewLTref_300021900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 542882 543832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022000.1"; gene_id "LTnewLTref_300022000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 542882 543832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022000.1"; gene_id "LTnewLTref_300022000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 545660 547093 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022100.1"; gene_id "LTnewLTref_300022100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 545660 547093 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022100.1"; gene_id "LTnewLTref_300022100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 547914 551087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022200.1"; gene_id "LTnewLTref_300022200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 547914 551087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022200.1"; gene_id "LTnewLTref_300022200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 552461 553432 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022300.1"; gene_id "LTnewLTref_300022300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 552461 553432 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022300.1"; gene_id "LTnewLTref_300022300"; CM024316.1 . transcript 555057 555407 . + . transcript_id "LTnewLTref_300022400.1"; gene_id "LTnewLTref_300022400:pseudogene" CM024316.1 . exon 555057 555407 . + . transcript_id "LTnewLTref_300022400.1"; gene_id "LTnewLTref_300022400:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 556699 558198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022500.1"; gene_id "LTnewLTref_300022500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 556699 558198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022500.1"; gene_id "LTnewLTref_300022500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 559405 564471 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022600.1"; gene_id "LTnewLTref_300022600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 559405 564471 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022600.1"; gene_id "LTnewLTref_300022600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 565318 566565 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022700.1"; gene_id "LTnewLTref_300022700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 565318 566565 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022700.1"; gene_id "LTnewLTref_300022700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 567506 570046 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022800.1"; gene_id "LTnewLTref_300022800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 567506 570046 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022800.1"; gene_id "LTnewLTref_300022800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 573642 574790 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300022900.1"; gene_id "LTnewLTref_300022900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 573642 574790 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300022900.1"; gene_id "LTnewLTref_300022900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 575642 577240 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023000.1"; gene_id "LTnewLTref_300023000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 575642 577240 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023000.1"; gene_id "LTnewLTref_300023000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 584551 587796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023100.1"; gene_id "LTnewLTref_300023100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 584551 587796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023100.1"; gene_id "LTnewLTref_300023100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 590780 592870 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023200.1"; gene_id "LTnewLTref_300023200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 590780 592870 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023200.1"; gene_id "LTnewLTref_300023200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 593968 594354 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023300.1"; gene_id "LTnewLTref_300023300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 593968 594354 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023300.1"; gene_id "LTnewLTref_300023300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 596796 597248 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023400.1"; gene_id "LTnewLTref_300023400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 596796 597248 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023400.1"; gene_id "LTnewLTref_300023400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 598320 599819 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023500.1"; gene_id "LTnewLTref_300023500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 598320 599819 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023500.1"; gene_id "LTnewLTref_300023500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 602234 603145 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023600.1"; gene_id "LTnewLTref_300023600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 602234 603145 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023600.1"; gene_id "LTnewLTref_300023600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 605647 605957 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_300023700.1"; gene_id "LTnewLTref_300023700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 605647 605851 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023700.1"; gene_id "LTnewLTref_300023700"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 605902 605957 0.51 + 2 transcript_id "LTnewLTref_300023700.1"; gene_id "LTnewLTref_300023700"; CM024316.1 Liftoff transcript 607056 608114 . + . transcript_id "LTnewLTref_300023800.1"; gene_id "LTnewLTref_300023800" CM024316.1 Liftoff CDS 607056 608114 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023800.1"; gene_id "LTnewLTref_300023800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 608930 611836 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300023900.1"; gene_id "LTnewLTref_300023900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 608930 611836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300023900.1"; gene_id "LTnewLTref_300023900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 612485 613192 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024000.1"; gene_id "LTnewLTref_300024000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 612485 613192 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024000.1"; gene_id "LTnewLTref_300024000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 614484 615434 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024100.1"; gene_id "LTnewLTref_300024100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 614484 615434 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024100.1"; gene_id "LTnewLTref_300024100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 616012 617187 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024200.1"; gene_id "LTnewLTref_300024200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 616012 617187 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024200.1"; gene_id "LTnewLTref_300024200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 618042 618983 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024300.1"; gene_id "LTnewLTref_300024300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 618042 618983 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024300.1"; gene_id "LTnewLTref_300024300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 619712 620209 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024400.1"; gene_id "LTnewLTref_300024400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 619712 620209 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024400.1"; gene_id "LTnewLTref_300024400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 620916 626804 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024500.1"; gene_id "LTnewLTref_300024500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 620916 626804 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024500.1"; gene_id "LTnewLTref_300024500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 631592 632965 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024600.1"; gene_id "LTnewLTref_300024600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 631592 632965 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024600.1"; gene_id "LTnewLTref_300024600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 634929 636809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024700.1"; gene_id "LTnewLTref_300024700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 634929 636809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024700.1"; gene_id "LTnewLTref_300024700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 640601 642844 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024800.1"; gene_id "LTnewLTref_300024800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 640601 642844 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024800.1"; gene_id "LTnewLTref_300024800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 645843 647252 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300024900.1"; gene_id "LTnewLTref_300024900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 645843 647252 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300024900.1"; gene_id "LTnewLTref_300024900"; CM024316.1 Liftoff transcript 649213 665880 . + . transcript_id "LTnewLTref_300025000.1"; gene_id "LTnewLTref_300025000" CM024316.1 Liftoff CDS 649213 665880 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025000.1"; gene_id "LTnewLTref_300025000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 667856 669721 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025100.1"; gene_id "LTnewLTref_300025100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 667856 669721 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025100.1"; gene_id "LTnewLTref_300025100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 670691 673159 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025200.1"; gene_id "LTnewLTref_300025200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 670691 673159 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025200.1"; gene_id "LTnewLTref_300025200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 676557 680681 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025300.1"; gene_id "LTnewLTref_300025300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 676557 680681 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025300.1"; gene_id "LTnewLTref_300025300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 682219 683841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025400.1"; gene_id "LTnewLTref_300025400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 682219 683841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025400.1"; gene_id "LTnewLTref_300025400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 685213 689031 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025500.1"; gene_id "LTnewLTref_300025500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 685213 689031 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025500.1"; gene_id "LTnewLTref_300025500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 690217 690561 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025600.1"; gene_id "LTnewLTref_300025600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 690217 690561 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025600.1"; gene_id "LTnewLTref_300025600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 691314 691856 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025700.1"; gene_id "LTnewLTref_300025700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 691314 691856 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025700.1"; gene_id "LTnewLTref_300025700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 693275 696322 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300025800.1"; gene_id "LTnewLTref_300025800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 693275 696322 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025800.1"; gene_id "LTnewLTref_300025800"; CM024316.1 Liftoff transcript 697347 699878 . + . transcript_id "LTnewLTref_300025900.1"; gene_id "LTnewLTref_300025900" CM024316.1 Liftoff CDS 697347 699878 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300025900.1"; gene_id "LTnewLTref_300025900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 702555 704052 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_300026000.1"; gene_id "LTnewLTref_300026000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 702555 703058 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026000.1"; gene_id "LTnewLTref_300026000"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 703114 704052 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026000.1"; gene_id "LTnewLTref_300026000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 706800 708299 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026100.1"; gene_id "LTnewLTref_300026100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 706800 708299 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026100.1"; gene_id "LTnewLTref_300026100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 710301 713798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026200.1"; gene_id "LTnewLTref_300026200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 710301 713798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026200.1"; gene_id "LTnewLTref_300026200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 715019 716620 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026300.1"; gene_id "LTnewLTref_300026300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 715019 716620 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026300.1"; gene_id "LTnewLTref_300026300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 717370 718692 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026400.1"; gene_id "LTnewLTref_300026400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 717370 718692 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026400.1"; gene_id "LTnewLTref_300026400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 721106 722398 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026500.1"; gene_id "LTnewLTref_300026500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 721106 722398 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026500.1"; gene_id "LTnewLTref_300026500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 723037 724062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026600.1"; gene_id "LTnewLTref_300026600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 723037 724062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026600.1"; gene_id "LTnewLTref_300026600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 724966 725931 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026700.1"; gene_id "LTnewLTref_300026700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 724966 725931 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026700.1"; gene_id "LTnewLTref_300026700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 726828 733310 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026800.1"; gene_id "LTnewLTref_300026800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 726828 733310 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026800.1"; gene_id "LTnewLTref_300026800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 734203 734592 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300026900.1"; gene_id "LTnewLTref_300026900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 734203 734592 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300026900.1"; gene_id "LTnewLTref_300026900"; CM024316.1 . transcript 736560 742207 . + . transcript_id "LTnewLTref_300027000.1"; gene_id "LTnewLTref_300027000:pseudogene" CM024316.1 . exon 736560 742207 . + . transcript_id "LTnewLTref_300027000.1"; gene_id "LTnewLTref_300027000:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 742314 742717 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_300027100.1"; gene_id "LTnewLTref_300027100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 742314 742666 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027100.1"; gene_id "LTnewLTref_300027100"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 742714 742717 0.93 + 1 transcript_id "LTnewLTref_300027100.1"; gene_id "LTnewLTref_300027100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 742812 743159 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027200.1"; gene_id "LTnewLTref_300027200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 742812 743159 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027200.1"; gene_id "LTnewLTref_300027200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 744141 745439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027300.1"; gene_id "LTnewLTref_300027300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 744141 745439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027300.1"; gene_id "LTnewLTref_300027300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 747621 751685 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027400.1"; gene_id "LTnewLTref_300027400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 747621 751685 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027400.1"; gene_id "LTnewLTref_300027400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 753352 754034 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_300027500.1"; gene_id "LTnewLTref_300027500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 753352 753413 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027500.1"; gene_id "LTnewLTref_300027500"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 753581 754034 0.79 + 1 transcript_id "LTnewLTref_300027500.1"; gene_id "LTnewLTref_300027500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 756522 760148 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027600.1"; gene_id "LTnewLTref_300027600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 756522 760148 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027600.1"; gene_id "LTnewLTref_300027600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 761449 762390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027700.1"; gene_id "LTnewLTref_300027700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 761449 762390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027700.1"; gene_id "LTnewLTref_300027700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 763462 764088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027800.1"; gene_id "LTnewLTref_300027800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 763462 764088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027800.1"; gene_id "LTnewLTref_300027800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 764796 766508 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300027900.1"; gene_id "LTnewLTref_300027900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 764796 766508 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300027900.1"; gene_id "LTnewLTref_300027900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 768778 769449 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300028000.1"; gene_id "LTnewLTref_300028000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 768778 769449 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300028000.1"; gene_id "LTnewLTref_300028000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 770181 771404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300028100.1"; gene_id "LTnewLTref_300028100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 770181 771404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300028100.1"; gene_id "LTnewLTref_300028100"; CM024316.1 Aragorn_1.2.36 transcript 771766 771837 . - . transcript_id "LTnewLTref_300028200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_300028200" CM024316.1 Aragorn_1.2.36 exon 771766 771837 . - . transcript_id "LTnewLTref_300028200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_300028200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 772208 774118 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300028300.1"; gene_id "LTnewLTref_300028300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 772208 774118 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028300.1"; gene_id "LTnewLTref_300028300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 775402 777012 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300028400.1"; gene_id "LTnewLTref_300028400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 775402 777012 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028400.1"; gene_id "LTnewLTref_300028400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 778406 779488 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_300028500.1"; gene_id "LTnewLTref_300028500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 778406 779488 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028500.1"; gene_id "LTnewLTref_300028500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 781231 784197 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300028600.1"; gene_id "LTnewLTref_300028600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 781231 784197 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028600.1"; gene_id "LTnewLTref_300028600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 785716 788388 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300028700.1"; gene_id "LTnewLTref_300028700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 785716 788388 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028700.1"; gene_id "LTnewLTref_300028700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 789521 792250 0.87 - . transcript_id "LTnewLTref_300028800.1"; gene_id "LTnewLTref_300028800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 789521 792250 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028800.1"; gene_id "LTnewLTref_300028800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 793055 795331 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_300028900.1"; gene_id "LTnewLTref_300028900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 793055 795331 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300028900.1"; gene_id "LTnewLTref_300028900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 797693 799273 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029000.1"; gene_id "LTnewLTref_300029000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 797693 799273 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029000.1"; gene_id "LTnewLTref_300029000"; CM024316.1 . transcript 805072 805251 . - . transcript_id "LTnewLTref_300029100.1"; gene_id "LTnewLTref_300029100:pseudogene" CM024316.1 . exon 805072 805251 . - . transcript_id "LTnewLTref_300029100.1"; gene_id "LTnewLTref_300029100:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 808188 809699 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029200.1"; gene_id "LTnewLTref_300029200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 808188 809699 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029200.1"; gene_id "LTnewLTref_300029200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 814799 816298 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029300.1"; gene_id "LTnewLTref_300029300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 814799 816298 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029300.1"; gene_id "LTnewLTref_300029300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 828524 829033 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029400.1"; gene_id "LTnewLTref_300029400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 828524 829033 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029400.1"; gene_id "LTnewLTref_300029400"; CM024316.1 . transcript 830276 837661 . - . transcript_id "LTnewLTref_300029500.1"; gene_id "LTnewLTref_300029500:pseudogene" CM024316.1 . exon 830276 837661 . - . transcript_id "LTnewLTref_300029500.1"; gene_id "LTnewLTref_300029500:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 839461 841077 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029600.1"; gene_id "LTnewLTref_300029600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 839461 841077 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029600.1"; gene_id "LTnewLTref_300029600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 842723 843478 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029700.1"; gene_id "LTnewLTref_300029700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 842723 843478 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029700.1"; gene_id "LTnewLTref_300029700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 845890 846810 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029800.1"; gene_id "LTnewLTref_300029800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 845890 846810 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029800.1"; gene_id "LTnewLTref_300029800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 848196 849311 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300029900.1"; gene_id "LTnewLTref_300029900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 848196 849311 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300029900.1"; gene_id "LTnewLTref_300029900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 851104 855449 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_300030000.1"; gene_id "LTnewLTref_300030000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 851104 855301 0.4 - 1 transcript_id "LTnewLTref_300030000.1"; gene_id "LTnewLTref_300030000"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 855388 855449 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030000.1"; gene_id "LTnewLTref_300030000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 856751 861847 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030100.1"; gene_id "LTnewLTref_300030100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 856751 861847 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030100.1"; gene_id "LTnewLTref_300030100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 863343 865457 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030200.1"; gene_id "LTnewLTref_300030200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 863343 865457 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030200.1"; gene_id "LTnewLTref_300030200"; CM024316.1 . transcript 867513 870764 . - . transcript_id "LTnewLTref_300030300.1"; gene_id "LTnewLTref_300030300:pseudogene" CM024316.1 . exon 867513 870764 . - . transcript_id "LTnewLTref_300030300.1"; gene_id "LTnewLTref_300030300:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 871507 875421 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030400.1"; gene_id "LTnewLTref_300030400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 871507 875421 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030400.1"; gene_id "LTnewLTref_300030400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 876066 877460 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030500.1"; gene_id "LTnewLTref_300030500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 876066 877460 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030500.1"; gene_id "LTnewLTref_300030500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 878326 879390 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030600.1"; gene_id "LTnewLTref_300030600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 878326 879390 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030600.1"; gene_id "LTnewLTref_300030600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 882610 883659 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030700.1"; gene_id "LTnewLTref_300030700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 882610 883659 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030700.1"; gene_id "LTnewLTref_300030700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 885150 888668 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030800.1"; gene_id "LTnewLTref_300030800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 885150 888668 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030800.1"; gene_id "LTnewLTref_300030800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 891798 893411 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300030900.1"; gene_id "LTnewLTref_300030900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 891798 893411 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300030900.1"; gene_id "LTnewLTref_300030900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 895930 897570 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031000.1"; gene_id "LTnewLTref_300031000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 895930 897570 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031000.1"; gene_id "LTnewLTref_300031000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 898752 899291 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031100.1"; gene_id "LTnewLTref_300031100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 898752 899291 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031100.1"; gene_id "LTnewLTref_300031100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 900463 901365 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031200.1"; gene_id "LTnewLTref_300031200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 900463 901365 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031200.1"; gene_id "LTnewLTref_300031200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 902074 913446 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031300.1"; gene_id "LTnewLTref_300031300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 902074 913446 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031300.1"; gene_id "LTnewLTref_300031300"; CM024316.1 . transcript 916462 917319 . - . transcript_id "LTnewLTref_300031400.1"; gene_id "LTnewLTref_300031400:pseudogene" CM024316.1 . exon 916462 917319 . - . transcript_id "LTnewLTref_300031400.1"; gene_id "LTnewLTref_300031400:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 918053 919330 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031500.1"; gene_id "LTnewLTref_300031500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 918053 919330 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031500.1"; gene_id "LTnewLTref_300031500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 920376 921194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031600.1"; gene_id "LTnewLTref_300031600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 920376 921194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031600.1"; gene_id "LTnewLTref_300031600"; CM024316.1 . transcript 922318 925986 . - . transcript_id "LTnewLTref_300031700.1"; gene_id "LTnewLTref_300031700:pseudogene" CM024316.1 . exon 922318 925986 . - . transcript_id "LTnewLTref_300031700.1"; gene_id "LTnewLTref_300031700:pseudogene"; CM024316.1 Liftoff transcript 930088 932766 . - . transcript_id "LTnewLTref_300031800.1"; gene_id "LTnewLTref_300031800" CM024316.1 Liftoff CDS 930088 932766 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031800.1"; gene_id "LTnewLTref_300031800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 935398 936408 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300031900.1"; gene_id "LTnewLTref_300031900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 935398 936408 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300031900.1"; gene_id "LTnewLTref_300031900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 937170 939079 0.84 - . transcript_id "LTnewLTref_300032000.1"; gene_id "LTnewLTref_300032000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 937170 939014 0.84 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032000.1"; gene_id "LTnewLTref_300032000"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 939065 939079 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032000.1"; gene_id "LTnewLTref_300032000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 940704 942247 0.61 - . transcript_id "LTnewLTref_300032100.1"; gene_id "LTnewLTref_300032100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 940704 940883 0.71 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032100.1"; gene_id "LTnewLTref_300032100"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 940928 942247 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032100.1"; gene_id "LTnewLTref_300032100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 942318 942689 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300032200.1"; gene_id "LTnewLTref_300032200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 942318 942689 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032200.1"; gene_id "LTnewLTref_300032200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 946930 948915 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300032300.1"; gene_id "LTnewLTref_300032300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 946930 948915 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032300.1"; gene_id "LTnewLTref_300032300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 949941 950243 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_300032400.1"; gene_id "LTnewLTref_300032400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 949941 950243 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032400.1"; gene_id "LTnewLTref_300032400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 950427 950759 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_300032500.1"; gene_id "LTnewLTref_300032500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 950427 950642 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032500.1"; gene_id "LTnewLTref_300032500"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 950694 950759 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032500.1"; gene_id "LTnewLTref_300032500"; CM024316.1 . transcript 950779 951087 . - . transcript_id "LTnewLTref_300032600.1"; gene_id "LTnewLTref_300032600:pseudogene" CM024316.1 . exon 950779 951087 . - . transcript_id "LTnewLTref_300032600.1"; gene_id "LTnewLTref_300032600:pseudogene"; CM024316.1 Liftoff transcript 951162 951447 . - . transcript_id "LTnewLTref_300032700.1"; gene_id "LTnewLTref_300032700" CM024316.1 Liftoff CDS 951162 951447 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032700.1"; gene_id "LTnewLTref_300032700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 952711 953760 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300032800.1"; gene_id "LTnewLTref_300032800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 952711 953760 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032800.1"; gene_id "LTnewLTref_300032800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 954272 954880 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300032900.1"; gene_id "LTnewLTref_300032900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 954272 954880 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300032900.1"; gene_id "LTnewLTref_300032900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 955692 958526 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033000.1"; gene_id "LTnewLTref_300033000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 955692 958526 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033000.1"; gene_id "LTnewLTref_300033000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 960708 962672 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033100.1"; gene_id "LTnewLTref_300033100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 960708 962672 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033100.1"; gene_id "LTnewLTref_300033100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 967045 970281 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033200.1"; gene_id "LTnewLTref_300033200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 967045 970281 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033200.1"; gene_id "LTnewLTref_300033200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 976265 976590 0.75 - . transcript_id "LTnewLTref_300033300.1"; gene_id "LTnewLTref_300033300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 976265 976368 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_300033300.1"; gene_id "LTnewLTref_300033300"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 976419 976590 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033300.1"; gene_id "LTnewLTref_300033300"; CM024316.1 Liftoff transcript 977340 977615 . - . transcript_id "LTnewLTref_300033400.1"; gene_id "LTnewLTref_300033400" CM024316.1 Liftoff CDS 977340 977615 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033400.1"; gene_id "LTnewLTref_300033400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 979231 980457 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033500.1"; gene_id "LTnewLTref_300033500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 979231 980457 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033500.1"; gene_id "LTnewLTref_300033500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 986542 987135 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033600.1"; gene_id "LTnewLTref_300033600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 986542 987135 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033600.1"; gene_id "LTnewLTref_300033600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 988168 989649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033700.1"; gene_id "LTnewLTref_300033700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 988168 989649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033700.1"; gene_id "LTnewLTref_300033700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 992101 993969 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033800.1"; gene_id "LTnewLTref_300033800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 992101 993969 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033800.1"; gene_id "LTnewLTref_300033800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 995341 995991 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300033900.1"; gene_id "LTnewLTref_300033900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 995341 995991 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300033900.1"; gene_id "LTnewLTref_300033900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 997477 999636 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034000.1"; gene_id "LTnewLTref_300034000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 997477 999636 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034000.1"; gene_id "LTnewLTref_300034000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1000220 1001284 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034100.1"; gene_id "LTnewLTref_300034100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1000220 1001284 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034100.1"; gene_id "LTnewLTref_300034100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1002072 1004567 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034200.1"; gene_id "LTnewLTref_300034200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1002072 1004567 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034200.1"; gene_id "LTnewLTref_300034200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1005921 1006262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034300.1"; gene_id "LTnewLTref_300034300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1005921 1006262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034300.1"; gene_id "LTnewLTref_300034300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1007133 1007603 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034400.1"; gene_id "LTnewLTref_300034400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1007133 1007603 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034400.1"; gene_id "LTnewLTref_300034400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1008531 1009796 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034500.1"; gene_id "LTnewLTref_300034500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1008531 1009796 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034500.1"; gene_id "LTnewLTref_300034500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1010455 1011561 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034600.1"; gene_id "LTnewLTref_300034600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1010455 1011561 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034600.1"; gene_id "LTnewLTref_300034600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1012320 1013297 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034700.1"; gene_id "LTnewLTref_300034700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1012320 1013297 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034700.1"; gene_id "LTnewLTref_300034700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1016156 1017040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034800.1"; gene_id "LTnewLTref_300034800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1016156 1017040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034800.1"; gene_id "LTnewLTref_300034800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1018689 1019861 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300034900.1"; gene_id "LTnewLTref_300034900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1018689 1019861 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300034900.1"; gene_id "LTnewLTref_300034900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1021104 1023902 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035000.1"; gene_id "LTnewLTref_300035000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1021104 1023902 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035000.1"; gene_id "LTnewLTref_300035000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1026102 1028294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035100.1"; gene_id "LTnewLTref_300035100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1026102 1028294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035100.1"; gene_id "LTnewLTref_300035100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1031098 1033929 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035200.1"; gene_id "LTnewLTref_300035200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1031098 1033929 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035200.1"; gene_id "LTnewLTref_300035200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1035293 1036519 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035300.1"; gene_id "LTnewLTref_300035300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1035293 1036519 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035300.1"; gene_id "LTnewLTref_300035300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1037293 1037997 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035400.1"; gene_id "LTnewLTref_300035400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1037293 1037997 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035400.1"; gene_id "LTnewLTref_300035400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1040910 1041239 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035500.1"; gene_id "LTnewLTref_300035500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1040910 1041239 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035500.1"; gene_id "LTnewLTref_300035500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1042136 1042942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035600.1"; gene_id "LTnewLTref_300035600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1042136 1042942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035600.1"; gene_id "LTnewLTref_300035600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1044763 1045779 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035700.1"; gene_id "LTnewLTref_300035700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1044763 1045779 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035700.1"; gene_id "LTnewLTref_300035700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1046719 1047282 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035800.1"; gene_id "LTnewLTref_300035800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1046719 1047282 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035800.1"; gene_id "LTnewLTref_300035800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1048847 1049671 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300035900.1"; gene_id "LTnewLTref_300035900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1048847 1049671 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300035900.1"; gene_id "LTnewLTref_300035900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1050605 1051222 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036000.1"; gene_id "LTnewLTref_300036000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1050605 1051222 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036000.1"; gene_id "LTnewLTref_300036000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1052182 1053798 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036100.1"; gene_id "LTnewLTref_300036100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1052182 1053798 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036100.1"; gene_id "LTnewLTref_300036100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1054980 1057376 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036200.1"; gene_id "LTnewLTref_300036200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1054980 1057376 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036200.1"; gene_id "LTnewLTref_300036200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1058026 1059117 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036300.1"; gene_id "LTnewLTref_300036300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1058026 1059117 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036300.1"; gene_id "LTnewLTref_300036300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1059954 1060268 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036400.1"; gene_id "LTnewLTref_300036400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1059954 1060268 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036400.1"; gene_id "LTnewLTref_300036400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1060832 1061179 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036500.1"; gene_id "LTnewLTref_300036500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1060832 1061179 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036500.1"; gene_id "LTnewLTref_300036500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1064876 1065184 0.79 - . transcript_id "LTnewLTref_300036600.1"; gene_id "LTnewLTref_300036600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1064876 1064960 0.79 - 1 transcript_id "LTnewLTref_300036600.1"; gene_id "LTnewLTref_300036600"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1065018 1065184 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036600.1"; gene_id "LTnewLTref_300036600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1065468 1066145 0.5 - . transcript_id "LTnewLTref_300036700.1"; gene_id "LTnewLTref_300036700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1065468 1065769 0.6 - 2 transcript_id "LTnewLTref_300036700.1"; gene_id "LTnewLTref_300036700"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1065878 1066145 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036700.1"; gene_id "LTnewLTref_300036700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1067417 1068571 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036800.1"; gene_id "LTnewLTref_300036800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1067417 1068571 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036800.1"; gene_id "LTnewLTref_300036800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1069369 1070781 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300036900.1"; gene_id "LTnewLTref_300036900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1069369 1070781 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300036900.1"; gene_id "LTnewLTref_300036900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1072525 1074546 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037000.1"; gene_id "LTnewLTref_300037000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1072525 1074546 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037000.1"; gene_id "LTnewLTref_300037000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1075260 1076633 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037100.1"; gene_id "LTnewLTref_300037100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1075260 1076633 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037100.1"; gene_id "LTnewLTref_300037100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1078213 1079970 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037200.1"; gene_id "LTnewLTref_300037200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1078213 1079970 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037200.1"; gene_id "LTnewLTref_300037200"; CM024316.1 . transcript 1081926 1083089 . - . transcript_id "LTnewLTref_300037300.1"; gene_id "LTnewLTref_300037300:pseudogene" CM024316.1 . exon 1081926 1083089 . - . transcript_id "LTnewLTref_300037300.1"; gene_id "LTnewLTref_300037300:pseudogene"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1084548 1086479 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037400.1"; gene_id "LTnewLTref_300037400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1084548 1086479 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037400.1"; gene_id "LTnewLTref_300037400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1087212 1087787 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037500.1"; gene_id "LTnewLTref_300037500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1087212 1087787 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037500.1"; gene_id "LTnewLTref_300037500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1089054 1090076 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037600.1"; gene_id "LTnewLTref_300037600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1089054 1090076 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037600.1"; gene_id "LTnewLTref_300037600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1092950 1095163 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037700.1"; gene_id "LTnewLTref_300037700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1092950 1095163 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037700.1"; gene_id "LTnewLTref_300037700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1096693 1097370 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037800.1"; gene_id "LTnewLTref_300037800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1096693 1097370 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037800.1"; gene_id "LTnewLTref_300037800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1100422 1101507 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300037900.1"; gene_id "LTnewLTref_300037900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1100422 1101507 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300037900.1"; gene_id "LTnewLTref_300037900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1102226 1103311 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038000.1"; gene_id "LTnewLTref_300038000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1102226 1103311 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038000.1"; gene_id "LTnewLTref_300038000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1104143 1105369 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038100.1"; gene_id "LTnewLTref_300038100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1104143 1105369 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038100.1"; gene_id "LTnewLTref_300038100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1106023 1106637 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038200.1"; gene_id "LTnewLTref_300038200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1106023 1106637 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038200.1"; gene_id "LTnewLTref_300038200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1107179 1109722 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038300.1"; gene_id "LTnewLTref_300038300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1107179 1109722 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038300.1"; gene_id "LTnewLTref_300038300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1111069 1111455 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038400.1"; gene_id "LTnewLTref_300038400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1111069 1111455 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038400.1"; gene_id "LTnewLTref_300038400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1113075 1114040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038500.1"; gene_id "LTnewLTref_300038500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1113075 1114040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038500.1"; gene_id "LTnewLTref_300038500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1115233 1115520 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038600.1"; gene_id "LTnewLTref_300038600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1115233 1115520 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038600.1"; gene_id "LTnewLTref_300038600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1116946 1118445 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038700.1"; gene_id "LTnewLTref_300038700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1116946 1118445 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038700.1"; gene_id "LTnewLTref_300038700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1120206 1121801 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300038800.1"; gene_id "LTnewLTref_300038800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1120206 1121801 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038800.1"; gene_id "LTnewLTref_300038800"; CM024316.1 Liftoff transcript 1122617 1128745 . - . transcript_id "LTnewLTref_300038900.1"; gene_id "LTnewLTref_300038900" CM024316.1 Liftoff CDS 1122617 1128745 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300038900.1"; gene_id "LTnewLTref_300038900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1132188 1135760 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039000.1"; gene_id "LTnewLTref_300039000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1132188 1135760 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039000.1"; gene_id "LTnewLTref_300039000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1137192 1138355 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039100.1"; gene_id "LTnewLTref_300039100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1137192 1138355 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039100.1"; gene_id "LTnewLTref_300039100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1140184 1141209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039200.1"; gene_id "LTnewLTref_300039200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1140184 1141209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039200.1"; gene_id "LTnewLTref_300039200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1143650 1144648 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039300.1"; gene_id "LTnewLTref_300039300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1143650 1144648 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039300.1"; gene_id "LTnewLTref_300039300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1145699 1147618 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039400.1"; gene_id "LTnewLTref_300039400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1145699 1147618 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039400.1"; gene_id "LTnewLTref_300039400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1150029 1151177 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039500.1"; gene_id "LTnewLTref_300039500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1150029 1151177 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039500.1"; gene_id "LTnewLTref_300039500"; CM024316.1 Liftoff transcript 1154575 1154754 . - . transcript_id "LTnewLTref_300039600.1"; gene_id "LTnewLTref_300039600" CM024316.1 Liftoff CDS 1154575 1154754 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039600.1"; gene_id "LTnewLTref_300039600"; CM024316.1 Liftoff transcript 1156431 1157387 . - . transcript_id "LTnewLTref_300039700.1"; gene_id "LTnewLTref_300039700" CM024316.1 Liftoff CDS 1156431 1157387 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039700.1"; gene_id "LTnewLTref_300039700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1159332 1162256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300039800.1"; gene_id "LTnewLTref_300039800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1159332 1162256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039800.1"; gene_id "LTnewLTref_300039800"; CM024316.1 Liftoff transcript 1175601 1176308 . - . transcript_id "LTnewLTref_300039900.1"; gene_id "LTnewLTref_300039900" CM024316.1 Liftoff CDS 1175601 1176308 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_300039900.1"; gene_id "LTnewLTref_300039900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1178106 1178744 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040000.1"; gene_id "LTnewLTref_300040000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1178106 1178744 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040000.1"; gene_id "LTnewLTref_300040000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1180000 1180947 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040100.1"; gene_id "LTnewLTref_300040100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1180000 1180947 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040100.1"; gene_id "LTnewLTref_300040100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1183424 1184761 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040200.1"; gene_id "LTnewLTref_300040200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1183424 1184761 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040200.1"; gene_id "LTnewLTref_300040200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1187273 1187698 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040300.1"; gene_id "LTnewLTref_300040300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1187273 1187698 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040300.1"; gene_id "LTnewLTref_300040300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1189887 1191191 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040400.1"; gene_id "LTnewLTref_300040400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1189887 1191191 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040400.1"; gene_id "LTnewLTref_300040400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1192783 1193121 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040500.1"; gene_id "LTnewLTref_300040500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1192783 1193121 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040500.1"; gene_id "LTnewLTref_300040500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1193786 1196437 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040600.1"; gene_id "LTnewLTref_300040600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1193786 1196437 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040600.1"; gene_id "LTnewLTref_300040600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1196866 1198110 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_300040700.1"; gene_id "LTnewLTref_300040700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1196866 1198110 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040700.1"; gene_id "LTnewLTref_300040700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1198709 1199134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040800.1"; gene_id "LTnewLTref_300040800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1198709 1199134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040800.1"; gene_id "LTnewLTref_300040800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1199535 1199822 1 - . transcript_id "LTnewLTref_300040900.1"; gene_id "LTnewLTref_300040900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1199535 1199822 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_300040900.1"; gene_id "LTnewLTref_300040900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1203708 1205492 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041000.1"; gene_id "LTnewLTref_300041000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1203708 1205492 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041000.1"; gene_id "LTnewLTref_300041000"; CM024316.1 Liftoff transcript 1206403 1209552 . + . transcript_id "LTnewLTref_300041100.1"; gene_id "LTnewLTref_300041100" CM024316.1 Liftoff CDS 1206403 1209552 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041100.1"; gene_id "LTnewLTref_300041100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1210626 1211861 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041200.1"; gene_id "LTnewLTref_300041200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1210626 1211861 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041200.1"; gene_id "LTnewLTref_300041200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1212544 1213041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041300.1"; gene_id "LTnewLTref_300041300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1212544 1213041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041300.1"; gene_id "LTnewLTref_300041300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1213994 1215109 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041400.1"; gene_id "LTnewLTref_300041400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1213994 1215109 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041400.1"; gene_id "LTnewLTref_300041400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1216456 1219578 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041500.1"; gene_id "LTnewLTref_300041500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1216456 1219578 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041500.1"; gene_id "LTnewLTref_300041500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1220743 1222020 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041600.1"; gene_id "LTnewLTref_300041600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1220743 1222020 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041600.1"; gene_id "LTnewLTref_300041600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1224175 1224971 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_300041700.1"; gene_id "LTnewLTref_300041700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1224175 1224312 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041700.1"; gene_id "LTnewLTref_300041700"; CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1224768 1224971 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041700.1"; gene_id "LTnewLTref_300041700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1225011 1225400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041800.1"; gene_id "LTnewLTref_300041800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1225011 1225400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041800.1"; gene_id "LTnewLTref_300041800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1226157 1227233 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300041900.1"; gene_id "LTnewLTref_300041900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1226157 1227233 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300041900.1"; gene_id "LTnewLTref_300041900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1229628 1230710 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042000.1"; gene_id "LTnewLTref_300042000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1229628 1230710 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042000.1"; gene_id "LTnewLTref_300042000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1232955 1234277 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042100.1"; gene_id "LTnewLTref_300042100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1232955 1234277 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042100.1"; gene_id "LTnewLTref_300042100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1235256 1235828 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042200.1"; gene_id "LTnewLTref_300042200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1235256 1235828 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042200.1"; gene_id "LTnewLTref_300042200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1236768 1237733 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042300.1"; gene_id "LTnewLTref_300042300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1236768 1237733 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042300.1"; gene_id "LTnewLTref_300042300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1238607 1240784 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042400.1"; gene_id "LTnewLTref_300042400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1238607 1240784 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042400.1"; gene_id "LTnewLTref_300042400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1244527 1246503 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042500.1"; gene_id "LTnewLTref_300042500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1244527 1246503 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042500.1"; gene_id "LTnewLTref_300042500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1254911 1256494 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042600.1"; gene_id "LTnewLTref_300042600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1254911 1256494 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042600.1"; gene_id "LTnewLTref_300042600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1259645 1262572 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042700.1"; gene_id "LTnewLTref_300042700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1259645 1262572 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042700.1"; gene_id "LTnewLTref_300042700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1265110 1265613 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042800.1"; gene_id "LTnewLTref_300042800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1265110 1265613 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042800.1"; gene_id "LTnewLTref_300042800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1266520 1267224 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300042900.1"; gene_id "LTnewLTref_300042900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1266520 1267224 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300042900.1"; gene_id "LTnewLTref_300042900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1269432 1271285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043000.1"; gene_id "LTnewLTref_300043000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1269432 1271285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043000.1"; gene_id "LTnewLTref_300043000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1273622 1276243 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043100.1"; gene_id "LTnewLTref_300043100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1273622 1276243 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043100.1"; gene_id "LTnewLTref_300043100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1278309 1280708 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043200.1"; gene_id "LTnewLTref_300043200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1278309 1280708 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043200.1"; gene_id "LTnewLTref_300043200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1286115 1288418 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043300.1"; gene_id "LTnewLTref_300043300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1286115 1288418 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043300.1"; gene_id "LTnewLTref_300043300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1289121 1289552 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043400.1"; gene_id "LTnewLTref_300043400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1289121 1289552 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043400.1"; gene_id "LTnewLTref_300043400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1290645 1291850 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043500.1"; gene_id "LTnewLTref_300043500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1290645 1291850 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043500.1"; gene_id "LTnewLTref_300043500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1292775 1293209 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043600.1"; gene_id "LTnewLTref_300043600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1292775 1293209 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043600.1"; gene_id "LTnewLTref_300043600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1294046 1295227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043700.1"; gene_id "LTnewLTref_300043700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1294046 1295227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043700.1"; gene_id "LTnewLTref_300043700"; CM024316.1 Liftoff transcript 1301322 1302071 . + . transcript_id "LTnewLTref_300043800.1"; gene_id "LTnewLTref_300043800" CM024316.1 Liftoff CDS 1301322 1302071 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043800.1"; gene_id "LTnewLTref_300043800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1304303 1306084 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300043900.1"; gene_id "LTnewLTref_300043900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1304303 1306084 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300043900.1"; gene_id "LTnewLTref_300043900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1306774 1307952 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044000.1"; gene_id "LTnewLTref_300044000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1306774 1307952 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044000.1"; gene_id "LTnewLTref_300044000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1309425 1311203 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044100.1"; gene_id "LTnewLTref_300044100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1309425 1311203 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044100.1"; gene_id "LTnewLTref_300044100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1311897 1313075 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044200.1"; gene_id "LTnewLTref_300044200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1311897 1313075 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044200.1"; gene_id "LTnewLTref_300044200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1314697 1315440 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044300.1"; gene_id "LTnewLTref_300044300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1314697 1315440 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044300.1"; gene_id "LTnewLTref_300044300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1316949 1318334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044400.1"; gene_id "LTnewLTref_300044400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1316949 1318334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044400.1"; gene_id "LTnewLTref_300044400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1319438 1320964 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044500.1"; gene_id "LTnewLTref_300044500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1319438 1320964 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044500.1"; gene_id "LTnewLTref_300044500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1322984 1323472 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044600.1"; gene_id "LTnewLTref_300044600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1322984 1323472 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044600.1"; gene_id "LTnewLTref_300044600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1324532 1325332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044700.1"; gene_id "LTnewLTref_300044700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1324532 1325332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044700.1"; gene_id "LTnewLTref_300044700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1327783 1330029 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044800.1"; gene_id "LTnewLTref_300044800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1327783 1330029 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044800.1"; gene_id "LTnewLTref_300044800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1330827 1331261 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300044900.1"; gene_id "LTnewLTref_300044900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1330827 1331261 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300044900.1"; gene_id "LTnewLTref_300044900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1332133 1332678 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045000.1"; gene_id "LTnewLTref_300045000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1332133 1332678 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045000.1"; gene_id "LTnewLTref_300045000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1334713 1335879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045100.1"; gene_id "LTnewLTref_300045100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1334713 1335879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045100.1"; gene_id "LTnewLTref_300045100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1336791 1337903 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045200.1"; gene_id "LTnewLTref_300045200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1336791 1337903 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045200.1"; gene_id "LTnewLTref_300045200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1339815 1340576 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045300.1"; gene_id "LTnewLTref_300045300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1339815 1340576 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045300.1"; gene_id "LTnewLTref_300045300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1344755 1346422 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045400.1"; gene_id "LTnewLTref_300045400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1344755 1346422 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045400.1"; gene_id "LTnewLTref_300045400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1347366 1347980 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045500.1"; gene_id "LTnewLTref_300045500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1347366 1347980 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045500.1"; gene_id "LTnewLTref_300045500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1348835 1349509 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045600.1"; gene_id "LTnewLTref_300045600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1348835 1349509 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045600.1"; gene_id "LTnewLTref_300045600"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1350551 1350985 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045700.1"; gene_id "LTnewLTref_300045700" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1350551 1350985 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045700.1"; gene_id "LTnewLTref_300045700"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1352048 1353376 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045800.1"; gene_id "LTnewLTref_300045800" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1352048 1353376 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045800.1"; gene_id "LTnewLTref_300045800"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1355027 1356772 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300045900.1"; gene_id "LTnewLTref_300045900" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1355027 1356772 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300045900.1"; gene_id "LTnewLTref_300045900"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1358370 1358786 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046000.1"; gene_id "LTnewLTref_300046000" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1358370 1358786 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046000.1"; gene_id "LTnewLTref_300046000"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1361804 1364377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046100.1"; gene_id "LTnewLTref_300046100" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1361804 1364377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046100.1"; gene_id "LTnewLTref_300046100"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1365190 1365435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046200.1"; gene_id "LTnewLTref_300046200" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1365190 1365435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046200.1"; gene_id "LTnewLTref_300046200"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1366184 1370227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046300.1"; gene_id "LTnewLTref_300046300" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1366184 1370227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046300.1"; gene_id "LTnewLTref_300046300"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1370706 1371023 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046400.1"; gene_id "LTnewLTref_300046400" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1370706 1371023 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046400.1"; gene_id "LTnewLTref_300046400"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1371571 1371888 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046500.1"; gene_id "LTnewLTref_300046500" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1371571 1371888 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046500.1"; gene_id "LTnewLTref_300046500"; CM024316.1 AUGUSTUS transcript 1372166 1372834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_300046600.1"; gene_id "LTnewLTref_300046600" CM024316.1 AUGUSTUS CDS 1372166 1372834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_300046600.1"; gene_id "LTnewLTref_300046600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 293 486 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_310005000.1"; gene_id "LTnewLTref_310005000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 293 486 0.8 + 2 transcript_id "LTnewLTref_310005000.1"; gene_id "LTnewLTref_310005000"; CM024317.1 . transcript 9617 9967 . - . transcript_id "LTnewLTref_310005100.1"; gene_id "LTnewLTref_310005100:pseudogene" CM024317.1 . exon 9617 9967 . - . transcript_id "LTnewLTref_310005100.1"; gene_id "LTnewLTref_310005100:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 11646 13958 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005200.1"; gene_id "LTnewLTref_310005200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 11646 13958 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005200.1"; gene_id "LTnewLTref_310005200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 16105 17049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005300.1"; gene_id "LTnewLTref_310005300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 16105 17049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005300.1"; gene_id "LTnewLTref_310005300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 18019 21176 0.73 - . transcript_id "LTnewLTref_310005400.1"; gene_id "LTnewLTref_310005400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 18019 18047 0.73 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310005400.1"; gene_id "LTnewLTref_310005400"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 18098 21176 0.73 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005400.1"; gene_id "LTnewLTref_310005400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 23212 24852 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005500.1"; gene_id "LTnewLTref_310005500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 23212 24852 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005500.1"; gene_id "LTnewLTref_310005500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 25443 26132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005600.1"; gene_id "LTnewLTref_310005600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 25443 26132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005600.1"; gene_id "LTnewLTref_310005600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 26688 27089 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005700.1"; gene_id "LTnewLTref_310005700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 26688 27089 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005700.1"; gene_id "LTnewLTref_310005700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 27435 30287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005800.1"; gene_id "LTnewLTref_310005800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 27435 30287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005800.1"; gene_id "LTnewLTref_310005800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 32029 32724 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310005900.1"; gene_id "LTnewLTref_310005900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 32029 32724 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310005900.1"; gene_id "LTnewLTref_310005900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 33421 34899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006000.1"; gene_id "LTnewLTref_310006000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 33421 34899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006000.1"; gene_id "LTnewLTref_310006000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 35422 36516 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006100.1"; gene_id "LTnewLTref_310006100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 35422 36516 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006100.1"; gene_id "LTnewLTref_310006100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 36823 37074 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006200.1"; gene_id "LTnewLTref_310006200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 36823 37074 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006200.1"; gene_id "LTnewLTref_310006200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 37662 40019 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006300.1"; gene_id "LTnewLTref_310006300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 37662 40019 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006300.1"; gene_id "LTnewLTref_310006300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 40451 40834 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006400.1"; gene_id "LTnewLTref_310006400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 40451 40834 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006400.1"; gene_id "LTnewLTref_310006400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 41334 43805 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006500.1"; gene_id "LTnewLTref_310006500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 41334 43805 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006500.1"; gene_id "LTnewLTref_310006500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 44484 45860 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006600.1"; gene_id "LTnewLTref_310006600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 44484 45860 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006600.1"; gene_id "LTnewLTref_310006600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 46525 47493 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006700.1"; gene_id "LTnewLTref_310006700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 46525 47493 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006700.1"; gene_id "LTnewLTref_310006700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 48411 51956 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006800.1"; gene_id "LTnewLTref_310006800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 48411 51956 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006800.1"; gene_id "LTnewLTref_310006800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 52500 53183 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310006900.1"; gene_id "LTnewLTref_310006900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 52500 52508 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006900.1"; gene_id "LTnewLTref_310006900"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 52557 53183 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310006900.1"; gene_id "LTnewLTref_310006900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 53655 55181 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007000.1"; gene_id "LTnewLTref_310007000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 53655 55181 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007000.1"; gene_id "LTnewLTref_310007000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 55802 56275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007100.1"; gene_id "LTnewLTref_310007100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 55802 56275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007100.1"; gene_id "LTnewLTref_310007100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 56911 58797 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007200.1"; gene_id "LTnewLTref_310007200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 56911 58797 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007200.1"; gene_id "LTnewLTref_310007200"; CM024317.1 Liftoff transcript 59566 61023 . - . transcript_id "LTnewLTref_310007300.1"; gene_id "LTnewLTref_310007300" CM024317.1 Liftoff CDS 59566 61023 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007300.1"; gene_id "LTnewLTref_310007300"; CM024317.1 Liftoff transcript 62174 62791 . - . transcript_id "LTnewLTref_310007400.1"; gene_id "LTnewLTref_310007400" CM024317.1 Liftoff CDS 62174 62791 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007400.1"; gene_id "LTnewLTref_310007400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 63218 64783 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007500.1"; gene_id "LTnewLTref_310007500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 63218 64783 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007500.1"; gene_id "LTnewLTref_310007500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 65247 65870 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007600.1"; gene_id "LTnewLTref_310007600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 65247 65870 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007600.1"; gene_id "LTnewLTref_310007600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 66458 69037 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007700.1"; gene_id "LTnewLTref_310007700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 66458 69037 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007700.1"; gene_id "LTnewLTref_310007700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 69920 71443 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007800.1"; gene_id "LTnewLTref_310007800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 69920 71443 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007800.1"; gene_id "LTnewLTref_310007800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 72155 75670 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310007900.1"; gene_id "LTnewLTref_310007900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 72155 75670 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310007900.1"; gene_id "LTnewLTref_310007900"; CM024317.1 . transcript 78130 79015 . - . transcript_id "LTnewLTref_310008000.1"; gene_id "LTnewLTref_310008000:pseudogene" CM024317.1 . exon 78130 79015 . - . transcript_id "LTnewLTref_310008000.1"; gene_id "LTnewLTref_310008000:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 80232 81209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008100.1"; gene_id "LTnewLTref_310008100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 80232 81209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008100.1"; gene_id "LTnewLTref_310008100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 81808 82833 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008200.1"; gene_id "LTnewLTref_310008200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 81808 82833 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008200.1"; gene_id "LTnewLTref_310008200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 83799 86654 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008300.1"; gene_id "LTnewLTref_310008300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 83799 86654 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008300.1"; gene_id "LTnewLTref_310008300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 87353 90772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008400.1"; gene_id "LTnewLTref_310008400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 87353 90772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008400.1"; gene_id "LTnewLTref_310008400"; CM024317.1 . transcript 90821 91459 . - . transcript_id "LTnewLTref_310008500.1"; gene_id "LTnewLTref_310008500:pseudogene" CM024317.1 . exon 90821 91459 . - . transcript_id "LTnewLTref_310008500.1"; gene_id "LTnewLTref_310008500:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 92315 95728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008600.1"; gene_id "LTnewLTref_310008600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 92315 95728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008600.1"; gene_id "LTnewLTref_310008600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 98204 99811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008700.1"; gene_id "LTnewLTref_310008700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 98204 99811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008700.1"; gene_id "LTnewLTref_310008700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 102776 104278 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008800.1"; gene_id "LTnewLTref_310008800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 102776 104278 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008800.1"; gene_id "LTnewLTref_310008800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 110220 111623 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310008900.1"; gene_id "LTnewLTref_310008900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 110220 111623 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310008900.1"; gene_id "LTnewLTref_310008900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 115229 116764 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009000.1"; gene_id "LTnewLTref_310009000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 115229 116764 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009000.1"; gene_id "LTnewLTref_310009000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 118156 121134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009100.1"; gene_id "LTnewLTref_310009100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 118156 121134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009100.1"; gene_id "LTnewLTref_310009100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 122784 124820 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009200.1"; gene_id "LTnewLTref_310009200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 122784 124820 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009200.1"; gene_id "LTnewLTref_310009200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 125422 129564 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009300.1"; gene_id "LTnewLTref_310009300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 125422 129564 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009300.1"; gene_id "LTnewLTref_310009300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 132355 134709 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009400.1"; gene_id "LTnewLTref_310009400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 132355 134709 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009400.1"; gene_id "LTnewLTref_310009400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 135519 140006 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009500.1"; gene_id "LTnewLTref_310009500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 135519 140006 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009500.1"; gene_id "LTnewLTref_310009500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 142183 144807 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009600.1"; gene_id "LTnewLTref_310009600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 142183 144807 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009600.1"; gene_id "LTnewLTref_310009600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 147738 150557 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009700.1"; gene_id "LTnewLTref_310009700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 147738 150557 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009700.1"; gene_id "LTnewLTref_310009700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 153231 155405 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310009800.1"; gene_id "LTnewLTref_310009800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 153231 155405 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009800.1"; gene_id "LTnewLTref_310009800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 157809 158180 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_310009900.1"; gene_id "LTnewLTref_310009900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 157809 158180 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310009900.1"; gene_id "LTnewLTref_310009900"; CM024317.1 . transcript 159708 160356 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010000.1"; gene_id "LTnewLTref_310010000:pseudogene" CM024317.1 . exon 159708 159773 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010000.1"; gene_id "LTnewLTref_310010000:pseudogene"; CM024317.1 . exon 159776 159913 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010000.1"; gene_id "LTnewLTref_310010000:pseudogene"; CM024317.1 . exon 159916 160356 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010000.1"; gene_id "LTnewLTref_310010000:pseudogene"; CM024317.1 . transcript 165849 166497 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010100.1"; gene_id "LTnewLTref_310010100:pseudogene" CM024317.1 . exon 165849 165917 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010100.1"; gene_id "LTnewLTref_310010100:pseudogene"; CM024317.1 . exon 165923 165943 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010100.1"; gene_id "LTnewLTref_310010100:pseudogene"; CM024317.1 . exon 165946 166497 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010100.1"; gene_id "LTnewLTref_310010100:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 167878 168900 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_310010200.1"; gene_id "LTnewLTref_310010200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 167878 168900 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310010200.1"; gene_id "LTnewLTref_310010200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 169025 169228 0.57 - . transcript_id "LTnewLTref_310010300.1"; gene_id "LTnewLTref_310010300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 169025 169228 0.57 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310010300.1"; gene_id "LTnewLTref_310010300"; CM024317.1 . transcript 171994 172631 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010400.1"; gene_id "LTnewLTref_310010400:pseudogene" CM024317.1 . exon 171994 172044 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010400.1"; gene_id "LTnewLTref_310010400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 172047 172421 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010400.1"; gene_id "LTnewLTref_310010400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 172423 172518 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010400.1"; gene_id "LTnewLTref_310010400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 172521 172631 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010400.1"; gene_id "LTnewLTref_310010400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 174007 174999 0.49 - . transcript_id "LTnewLTref_310010500.1"; gene_id "LTnewLTref_310010500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 174007 174999 0.49 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310010500.1"; gene_id "LTnewLTref_310010500"; CM024317.1 . transcript 178025 178675 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010600.1"; gene_id "LTnewLTref_310010600:pseudogene" CM024317.1 . exon 178025 178063 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010600.1"; gene_id "LTnewLTref_310010600:pseudogene"; CM024317.1 . exon 178065 178079 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010600.1"; gene_id "LTnewLTref_310010600:pseudogene"; CM024317.1 . exon 178093 178257 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010600.1"; gene_id "LTnewLTref_310010600:pseudogene"; CM024317.1 . exon 178260 178541 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010600.1"; gene_id "LTnewLTref_310010600:pseudogene"; CM024317.1 . exon 178544 178675 . - . transcript_id "LTnewLTref_310010600.1"; gene_id "LTnewLTref_310010600:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 180051 181031 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_310010700.1"; gene_id "LTnewLTref_310010700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 180051 181031 0.6 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310010700.1"; gene_id "LTnewLTref_310010700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 184152 184801 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_310010800.1"; gene_id "LTnewLTref_310010800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 184152 184369 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310010800.1"; gene_id "LTnewLTref_310010800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 184678 184801 0.6 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310010800.1"; gene_id "LTnewLTref_310010800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 186492 187367 0.71 - . transcript_id "LTnewLTref_310010900.1"; gene_id "LTnewLTref_310010900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 186492 187367 0.71 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310010900.1"; gene_id "LTnewLTref_310010900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 187801 188280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011000.1"; gene_id "LTnewLTref_310011000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 187801 188280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011000.1"; gene_id "LTnewLTref_310011000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 189132 190127 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_310011100.1"; gene_id "LTnewLTref_310011100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 189132 190127 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011100.1"; gene_id "LTnewLTref_310011100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 189132 191066 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011100.2"; gene_id "LTnewLTref_310011100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 189132 191066 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011100.2"; gene_id "LTnewLTref_310011100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 189132 191465 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011100.3"; gene_id "LTnewLTref_310011100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 189132 191465 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011100.3"; gene_id "LTnewLTref_310011100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 193045 193773 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011200.1"; gene_id "LTnewLTref_310011200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 193045 193773 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011200.1"; gene_id "LTnewLTref_310011200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 194333 194614 0.63 - . transcript_id "LTnewLTref_310011300.1"; gene_id "LTnewLTref_310011300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 194333 194614 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011300.1"; gene_id "LTnewLTref_310011300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 194809 195063 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011400.1"; gene_id "LTnewLTref_310011400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 194809 195063 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011400.1"; gene_id "LTnewLTref_310011400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 195812 196966 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011500.1"; gene_id "LTnewLTref_310011500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 195812 196966 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011500.1"; gene_id "LTnewLTref_310011500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 197881 200349 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011600.1"; gene_id "LTnewLTref_310011600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 197881 200349 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011600.1"; gene_id "LTnewLTref_310011600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 203761 205680 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011700.1"; gene_id "LTnewLTref_310011700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 203761 205680 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011700.1"; gene_id "LTnewLTref_310011700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 206818 208629 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011800.1"; gene_id "LTnewLTref_310011800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 206818 208629 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011800.1"; gene_id "LTnewLTref_310011800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 209322 211016 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310011900.1"; gene_id "LTnewLTref_310011900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 209322 211016 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310011900.1"; gene_id "LTnewLTref_310011900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 216881 218917 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012000.1"; gene_id "LTnewLTref_310012000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 216881 218917 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012000.1"; gene_id "LTnewLTref_310012000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 222170 224689 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012100.1"; gene_id "LTnewLTref_310012100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 222170 224689 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012100.1"; gene_id "LTnewLTref_310012100"; CM024317.1 . transcript 226136 229942 . - . transcript_id "LTnewLTref_310012200.1"; gene_id "LTnewLTref_310012200:pseudogene" CM024317.1 . exon 226136 229942 . - . transcript_id "LTnewLTref_310012200.1"; gene_id "LTnewLTref_310012200:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 230728 231717 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012300.1"; gene_id "LTnewLTref_310012300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 230728 231717 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012300.1"; gene_id "LTnewLTref_310012300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 233199 234617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012400.1"; gene_id "LTnewLTref_310012400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 233199 234617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012400.1"; gene_id "LTnewLTref_310012400"; CM024317.1 INFERNAL transcript 235183 235329 85.4 - . transcript_id "LTnewLTref_310012500:snRNA"; gene_id "LTnewLTref_310012500" CM024317.1 INFERNAL exon 235183 235329 . - . transcript_id "LTnewLTref_310012500:snRNA"; gene_id "LTnewLTref_310012500"; CM024317.1 Aragorn_1.2.36 transcript 235541 235613 . + . transcript_id "LTnewLTref_310012600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310012600" CM024317.1 Aragorn_1.2.36 exon 235541 235613 . + . transcript_id "LTnewLTref_310012600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310012600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 239145 240770 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012700.1"; gene_id "LTnewLTref_310012700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 239145 240770 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012700.1"; gene_id "LTnewLTref_310012700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 241974 242798 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012800.1"; gene_id "LTnewLTref_310012800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 241974 242798 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012800.1"; gene_id "LTnewLTref_310012800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 243371 244747 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310012900.1"; gene_id "LTnewLTref_310012900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 243371 244747 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310012900.1"; gene_id "LTnewLTref_310012900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 245221 246903 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013000.1"; gene_id "LTnewLTref_310013000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 245221 246903 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013000.1"; gene_id "LTnewLTref_310013000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 247350 249800 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013100.1"; gene_id "LTnewLTref_310013100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 247350 249800 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013100.1"; gene_id "LTnewLTref_310013100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 250325 253162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013200.1"; gene_id "LTnewLTref_310013200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 250325 253162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013200.1"; gene_id "LTnewLTref_310013200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 253829 256603 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013300.1"; gene_id "LTnewLTref_310013300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 253829 256603 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013300.1"; gene_id "LTnewLTref_310013300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 257284 258291 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013400.1"; gene_id "LTnewLTref_310013400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 257284 258291 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013400.1"; gene_id "LTnewLTref_310013400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 259491 265258 0.53 - . transcript_id "LTnewLTref_310013500.1"; gene_id "LTnewLTref_310013500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 259491 262318 0.53 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310013500.1"; gene_id "LTnewLTref_310013500"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 262393 265258 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013500.1"; gene_id "LTnewLTref_310013500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 267531 271124 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013600.1"; gene_id "LTnewLTref_310013600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 267531 271124 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013600.1"; gene_id "LTnewLTref_310013600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 272697 273545 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013700.1"; gene_id "LTnewLTref_310013700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 272697 273545 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013700.1"; gene_id "LTnewLTref_310013700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 274346 275785 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013800.1"; gene_id "LTnewLTref_310013800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 274346 275785 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013800.1"; gene_id "LTnewLTref_310013800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 276429 279086 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310013900.1"; gene_id "LTnewLTref_310013900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 276429 279086 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310013900.1"; gene_id "LTnewLTref_310013900"; CM024317.1 . transcript 281624 281920 . - . transcript_id "LTnewLTref_310014000.1"; gene_id "LTnewLTref_310014000:pseudogene" CM024317.1 . exon 281624 281920 . - . transcript_id "LTnewLTref_310014000.1"; gene_id "LTnewLTref_310014000:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 285016 285405 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014100.1"; gene_id "LTnewLTref_310014100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 285016 285405 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014100.1"; gene_id "LTnewLTref_310014100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 290015 292954 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014200.1"; gene_id "LTnewLTref_310014200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 290015 292954 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014200.1"; gene_id "LTnewLTref_310014200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 294924 295256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014300.1"; gene_id "LTnewLTref_310014300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 294924 295256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014300.1"; gene_id "LTnewLTref_310014300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 296353 297306 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014400.1"; gene_id "LTnewLTref_310014400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 296353 297306 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014400.1"; gene_id "LTnewLTref_310014400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 298427 298678 0.41 - . transcript_id "LTnewLTref_310014500.1"; gene_id "LTnewLTref_310014500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 298427 298678 0.41 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014500.1"; gene_id "LTnewLTref_310014500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 298753 299043 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014600.1"; gene_id "LTnewLTref_310014600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 298753 299043 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014600.1"; gene_id "LTnewLTref_310014600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 300232 301125 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014700.1"; gene_id "LTnewLTref_310014700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 300232 301125 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014700.1"; gene_id "LTnewLTref_310014700"; CM024317.1 . transcript 302799 303039 . - . transcript_id "LTnewLTref_310014800.1"; gene_id "LTnewLTref_310014800:pseudogene" CM024317.1 . exon 302799 303039 . - . transcript_id "LTnewLTref_310014800.1"; gene_id "LTnewLTref_310014800:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 305756 306658 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310014900.1"; gene_id "LTnewLTref_310014900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 305756 306658 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310014900.1"; gene_id "LTnewLTref_310014900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 312054 312989 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015000.1"; gene_id "LTnewLTref_310015000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 312054 312989 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015000.1"; gene_id "LTnewLTref_310015000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 313947 314771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015100.1"; gene_id "LTnewLTref_310015100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 313947 314771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015100.1"; gene_id "LTnewLTref_310015100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 315813 316679 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015200.1"; gene_id "LTnewLTref_310015200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 315813 316679 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015200.1"; gene_id "LTnewLTref_310015200"; CM024317.1 . transcript 318404 318769 . - . transcript_id "LTnewLTref_310015300.1"; gene_id "LTnewLTref_310015300:pseudogene" CM024317.1 . exon 318404 318769 . - . transcript_id "LTnewLTref_310015300.1"; gene_id "LTnewLTref_310015300:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 321049 322998 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015400.1"; gene_id "LTnewLTref_310015400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 321049 322998 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015400.1"; gene_id "LTnewLTref_310015400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 324319 326208 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015500.1"; gene_id "LTnewLTref_310015500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 324319 326208 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015500.1"; gene_id "LTnewLTref_310015500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 331326 332252 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015600.1"; gene_id "LTnewLTref_310015600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 331326 332252 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015600.1"; gene_id "LTnewLTref_310015600"; CM024317.1 . transcript 333847 334834 . - . transcript_id "LTnewLTref_310015700.1"; gene_id "LTnewLTref_310015700:pseudogene" CM024317.1 . exon 333847 334834 . - . transcript_id "LTnewLTref_310015700.1"; gene_id "LTnewLTref_310015700:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 338643 339908 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015800.1"; gene_id "LTnewLTref_310015800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 338643 339908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015800.1"; gene_id "LTnewLTref_310015800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 345243 345575 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310015900.1"; gene_id "LTnewLTref_310015900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 345243 345575 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310015900.1"; gene_id "LTnewLTref_310015900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 346380 348209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016000.1"; gene_id "LTnewLTref_310016000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 346380 348209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016000.1"; gene_id "LTnewLTref_310016000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 352672 354114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016100.1"; gene_id "LTnewLTref_310016100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 352672 354114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016100.1"; gene_id "LTnewLTref_310016100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 359633 361075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016200.1"; gene_id "LTnewLTref_310016200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 359633 361075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016200.1"; gene_id "LTnewLTref_310016200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 362660 363136 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016300.1"; gene_id "LTnewLTref_310016300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 362660 363136 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016300.1"; gene_id "LTnewLTref_310016300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 364753 364992 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016400.1"; gene_id "LTnewLTref_310016400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 364753 364992 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016400.1"; gene_id "LTnewLTref_310016400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 369018 369377 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016500.1"; gene_id "LTnewLTref_310016500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 369018 369377 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016500.1"; gene_id "LTnewLTref_310016500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 372719 374585 0.82 - . transcript_id "LTnewLTref_310016600.1"; gene_id "LTnewLTref_310016600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 372719 374278 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016600.1"; gene_id "LTnewLTref_310016600"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 374322 374585 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016600.1"; gene_id "LTnewLTref_310016600"; CM024317.1 . transcript 375613 376112 . - . transcript_id "LTnewLTref_310016700.1"; gene_id "LTnewLTref_310016700:pseudogene" CM024317.1 . exon 375613 375834 . - . transcript_id "LTnewLTref_310016700.1"; gene_id "LTnewLTref_310016700:pseudogene"; CM024317.1 . exon 375837 376112 . - . transcript_id "LTnewLTref_310016700.1"; gene_id "LTnewLTref_310016700:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 376739 377349 0.87 - . transcript_id "LTnewLTref_310016800.1"; gene_id "LTnewLTref_310016800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 376739 377136 0.92 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310016800.1"; gene_id "LTnewLTref_310016800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 377181 377349 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016800.1"; gene_id "LTnewLTref_310016800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 381282 383147 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310016900.1"; gene_id "LTnewLTref_310016900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 381282 383147 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310016900.1"; gene_id "LTnewLTref_310016900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 384323 384559 0.94 - . transcript_id "LTnewLTref_310017000.1"; gene_id "LTnewLTref_310017000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 384323 384559 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017000.1"; gene_id "LTnewLTref_310017000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 384323 385288 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_310017000.2"; gene_id "LTnewLTref_310017000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 384323 384571 0.65 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017000.2"; gene_id "LTnewLTref_310017000"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 384845 385288 0.55 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017000.2"; gene_id "LTnewLTref_310017000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 384623 385288 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_310017000.3"; gene_id "LTnewLTref_310017000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 384623 385288 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017000.3"; gene_id "LTnewLTref_310017000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 385316 385950 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_310017100.1"; gene_id "LTnewLTref_310017100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 385316 385737 0.97 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310017100.1"; gene_id "LTnewLTref_310017100"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 385782 385950 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017100.1"; gene_id "LTnewLTref_310017100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 389906 391772 0.46 - . transcript_id "LTnewLTref_310017200.1"; gene_id "LTnewLTref_310017200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 389906 389950 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017200.1"; gene_id "LTnewLTref_310017200"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 390048 391772 0.46 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017200.1"; gene_id "LTnewLTref_310017200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 392951 393187 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_310017300.1"; gene_id "LTnewLTref_310017300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 392951 393187 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017300.1"; gene_id "LTnewLTref_310017300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 392951 393757 0.79 - . transcript_id "LTnewLTref_310017300.2"; gene_id "LTnewLTref_310017300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 392951 393199 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017300.2"; gene_id "LTnewLTref_310017300"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 393452 393757 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017300.2"; gene_id "LTnewLTref_310017300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 393251 393757 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_310017300.3"; gene_id "LTnewLTref_310017300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 393251 393757 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017300.3"; gene_id "LTnewLTref_310017300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 394032 394687 0.87 - . transcript_id "LTnewLTref_310017400.1"; gene_id "LTnewLTref_310017400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 394032 394365 0.87 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310017400.1"; gene_id "LTnewLTref_310017400"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 394446 394687 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017400.1"; gene_id "LTnewLTref_310017400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 397494 399359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310017500.1"; gene_id "LTnewLTref_310017500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 397494 399359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017500.1"; gene_id "LTnewLTref_310017500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 400535 400771 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_310017600.1"; gene_id "LTnewLTref_310017600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 400535 400771 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017600.1"; gene_id "LTnewLTref_310017600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 400535 401000 0.25 - . transcript_id "LTnewLTref_310017600.2"; gene_id "LTnewLTref_310017600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 400535 400783 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017600.2"; gene_id "LTnewLTref_310017600"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 400893 401000 0.29 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017600.2"; gene_id "LTnewLTref_310017600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 400835 401548 0.79 - . transcript_id "LTnewLTref_310017700.1"; gene_id "LTnewLTref_310017700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 400835 400946 0.79 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310017700.1"; gene_id "LTnewLTref_310017700"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 401205 401548 0.84 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017700.1"; gene_id "LTnewLTref_310017700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 401201 401548 0.72 - . transcript_id "LTnewLTref_310017700.2"; gene_id "LTnewLTref_310017700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 401201 401548 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017700.2"; gene_id "LTnewLTref_310017700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 401576 402352 0.41 - . transcript_id "LTnewLTref_310017800.1"; gene_id "LTnewLTref_310017800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 401576 401969 0.44 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310017800.1"; gene_id "LTnewLTref_310017800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 402273 402352 0.65 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017800.1"; gene_id "LTnewLTref_310017800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 404806 405045 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310017900.1"; gene_id "LTnewLTref_310017900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 404806 405045 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310017900.1"; gene_id "LTnewLTref_310017900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 405624 408305 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018000.1"; gene_id "LTnewLTref_310018000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 405624 408305 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018000.1"; gene_id "LTnewLTref_310018000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 409529 411841 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018100.1"; gene_id "LTnewLTref_310018100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 409529 411841 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018100.1"; gene_id "LTnewLTref_310018100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 412790 413992 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018200.1"; gene_id "LTnewLTref_310018200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 412790 413992 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018200.1"; gene_id "LTnewLTref_310018200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 415142 418507 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018300.1"; gene_id "LTnewLTref_310018300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 415142 418507 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018300.1"; gene_id "LTnewLTref_310018300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 419350 421605 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018400.1"; gene_id "LTnewLTref_310018400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 419350 421605 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018400.1"; gene_id "LTnewLTref_310018400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 425853 428693 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018500.1"; gene_id "LTnewLTref_310018500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 425853 428693 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018500.1"; gene_id "LTnewLTref_310018500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 436929 439646 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018600.1"; gene_id "LTnewLTref_310018600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 436929 439646 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018600.1"; gene_id "LTnewLTref_310018600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 447611 449929 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018700.1"; gene_id "LTnewLTref_310018700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 447611 449929 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018700.1"; gene_id "LTnewLTref_310018700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 452902 454056 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310018800.1"; gene_id "LTnewLTref_310018800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 452902 454056 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018800.1"; gene_id "LTnewLTref_310018800"; CM024317.1 Liftoff transcript 455651 457447 . - . transcript_id "LTnewLTref_310018900.1"; gene_id "LTnewLTref_310018900" CM024317.1 Liftoff CDS 455651 457447 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310018900.1"; gene_id "LTnewLTref_310018900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 457492 457870 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_310019000.1"; gene_id "LTnewLTref_310019000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 457492 457598 0.68 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310019000.1"; gene_id "LTnewLTref_310019000"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 457690 457870 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019000.1"; gene_id "LTnewLTref_310019000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 459158 459949 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019100.1"; gene_id "LTnewLTref_310019100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 459158 459949 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019100.1"; gene_id "LTnewLTref_310019100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 461063 463999 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019200.1"; gene_id "LTnewLTref_310019200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 461063 463999 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019200.1"; gene_id "LTnewLTref_310019200"; CM024317.1 . transcript 466986 468911 . - . transcript_id "LTnewLTref_310019300.1"; gene_id "LTnewLTref_310019300:pseudogene" CM024317.1 . exon 466986 468911 . - . transcript_id "LTnewLTref_310019300.1"; gene_id "LTnewLTref_310019300:pseudogene"; CM024317.1 . transcript 471767 472567 . - . transcript_id "LTnewLTref_310019400.1"; gene_id "LTnewLTref_310019400:pseudogene" CM024317.1 . exon 471767 472567 . - . transcript_id "LTnewLTref_310019400.1"; gene_id "LTnewLTref_310019400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 472604 472930 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019500.1"; gene_id "LTnewLTref_310019500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 472604 472930 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019500.1"; gene_id "LTnewLTref_310019500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 474700 475845 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019600.1"; gene_id "LTnewLTref_310019600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 474700 475845 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019600.1"; gene_id "LTnewLTref_310019600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 476606 477253 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019700.1"; gene_id "LTnewLTref_310019700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 476606 477253 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019700.1"; gene_id "LTnewLTref_310019700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 478216 478845 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019800.1"; gene_id "LTnewLTref_310019800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 478216 478845 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019800.1"; gene_id "LTnewLTref_310019800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 480770 481987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310019900.1"; gene_id "LTnewLTref_310019900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 480770 481987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310019900.1"; gene_id "LTnewLTref_310019900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 484138 485355 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020000.1"; gene_id "LTnewLTref_310020000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 484138 485355 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020000.1"; gene_id "LTnewLTref_310020000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 486295 486831 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_310020100.1"; gene_id "LTnewLTref_310020100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 486295 486831 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020100.1"; gene_id "LTnewLTref_310020100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 486886 487821 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020200.1"; gene_id "LTnewLTref_310020200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 486886 487821 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020200.1"; gene_id "LTnewLTref_310020200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 488499 491822 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020300.1"; gene_id "LTnewLTref_310020300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 488499 491822 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020300.1"; gene_id "LTnewLTref_310020300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 494789 496678 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020400.1"; gene_id "LTnewLTref_310020400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 494789 496678 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020400.1"; gene_id "LTnewLTref_310020400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 497808 498173 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020500.1"; gene_id "LTnewLTref_310020500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 497808 498173 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020500.1"; gene_id "LTnewLTref_310020500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 500743 501081 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020600.1"; gene_id "LTnewLTref_310020600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 500743 501081 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020600.1"; gene_id "LTnewLTref_310020600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 501937 502425 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020700.1"; gene_id "LTnewLTref_310020700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 501937 502425 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020700.1"; gene_id "LTnewLTref_310020700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 503579 503971 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020800.1"; gene_id "LTnewLTref_310020800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 503579 503971 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020800.1"; gene_id "LTnewLTref_310020800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 506598 507002 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310020900.1"; gene_id "LTnewLTref_310020900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 506598 507002 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310020900.1"; gene_id "LTnewLTref_310020900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 508325 523165 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310021000.1"; gene_id "LTnewLTref_310021000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 508325 523165 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021000.1"; gene_id "LTnewLTref_310021000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 525319 525564 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_310021100.1"; gene_id "LTnewLTref_310021100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 525319 525564 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021100.1"; gene_id "LTnewLTref_310021100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 528027 530432 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310021200.1"; gene_id "LTnewLTref_310021200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 528027 530432 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021200.1"; gene_id "LTnewLTref_310021200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 531035 533731 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310021300.1"; gene_id "LTnewLTref_310021300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 531035 533731 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021300.1"; gene_id "LTnewLTref_310021300"; CM024317.1 Aragorn_1.2.36 transcript 534747 534819 . + . transcript_id "LTnewLTref_310021400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310021400" CM024317.1 Aragorn_1.2.36 exon 534747 534819 . + . transcript_id "LTnewLTref_310021400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310021400"; CM024317.1 Aragorn_1.2.36 transcript 534865 534938 . - . transcript_id "LTnewLTref_310021500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310021500" CM024317.1 Aragorn_1.2.36 exon 534865 534938 . - . transcript_id "LTnewLTref_310021500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310021500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 537011 540889 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310021600.1"; gene_id "LTnewLTref_310021600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 537011 540889 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021600.1"; gene_id "LTnewLTref_310021600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 542340 545612 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310021700.1"; gene_id "LTnewLTref_310021700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 542340 545612 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021700.1"; gene_id "LTnewLTref_310021700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 547399 549283 0.57 - . transcript_id "LTnewLTref_310021800.1"; gene_id "LTnewLTref_310021800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 547399 549068 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310021800.1"; gene_id "LTnewLTref_310021800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 549166 549283 0.57 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021800.1"; gene_id "LTnewLTref_310021800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 550998 556040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310021900.1"; gene_id "LTnewLTref_310021900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 550998 556040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310021900.1"; gene_id "LTnewLTref_310021900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 557946 562559 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022000.1"; gene_id "LTnewLTref_310022000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 557946 562559 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022000.1"; gene_id "LTnewLTref_310022000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 564379 569040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022100.1"; gene_id "LTnewLTref_310022100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 564379 569040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022100.1"; gene_id "LTnewLTref_310022100"; CM024317.1 . transcript 568687 568959 . + . transcript_id "LTnewLTref_310022200.1"; gene_id "LTnewLTref_310022200:pseudogene" CM024317.1 . exon 568687 568959 . + . transcript_id "LTnewLTref_310022200.1"; gene_id "LTnewLTref_310022200:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 571415 574405 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022300.1"; gene_id "LTnewLTref_310022300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 571415 574405 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022300.1"; gene_id "LTnewLTref_310022300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 576607 581199 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022400.1"; gene_id "LTnewLTref_310022400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 576607 581199 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022400.1"; gene_id "LTnewLTref_310022400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 576607 581598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022400.2"; gene_id "LTnewLTref_310022400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 576607 581598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022400.2"; gene_id "LTnewLTref_310022400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 583503 591206 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022500.1"; gene_id "LTnewLTref_310022500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 583503 591206 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022500.1"; gene_id "LTnewLTref_310022500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 600623 606328 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022600.1"; gene_id "LTnewLTref_310022600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 600623 606328 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022600.1"; gene_id "LTnewLTref_310022600"; CM024317.1 . transcript 610548 610833 . - . transcript_id "LTnewLTref_310022700.1"; gene_id "LTnewLTref_310022700:pseudogene" CM024317.1 . exon 610548 610833 . - . transcript_id "LTnewLTref_310022700.1"; gene_id "LTnewLTref_310022700:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 620101 621708 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022800.1"; gene_id "LTnewLTref_310022800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 620101 621708 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022800.1"; gene_id "LTnewLTref_310022800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 633278 634846 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310022900.1"; gene_id "LTnewLTref_310022900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 633278 634846 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310022900.1"; gene_id "LTnewLTref_310022900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 641574 642590 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310023000.1"; gene_id "LTnewLTref_310023000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 641574 642590 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023000.1"; gene_id "LTnewLTref_310023000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 643610 648070 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310023100.1"; gene_id "LTnewLTref_310023100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 643610 648070 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023100.1"; gene_id "LTnewLTref_310023100"; CM024317.1 . transcript 646334 646510 . + . transcript_id "LTnewLTref_310023200.1"; gene_id "LTnewLTref_310023200:pseudogene" CM024317.1 . exon 646334 646510 . + . transcript_id "LTnewLTref_310023200.1"; gene_id "LTnewLTref_310023200:pseudogene"; CM024317.1 Liftoff transcript 646533 647279 . + . transcript_id "LTnewLTref_310023300.1"; gene_id "LTnewLTref_310023300" CM024317.1 Liftoff CDS 646533 647279 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_310023300.1"; gene_id "LTnewLTref_310023300"; CM024317.1 Liftoff transcript 647325 647594 . + . transcript_id "LTnewLTref_310023400.1"; gene_id "LTnewLTref_310023400" CM024317.1 Liftoff CDS 647325 647594 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_310023400.1"; gene_id "LTnewLTref_310023400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 649267 652776 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310023500.1"; gene_id "LTnewLTref_310023500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 649267 652776 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023500.1"; gene_id "LTnewLTref_310023500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 653660 655981 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310023600.1"; gene_id "LTnewLTref_310023600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 653660 655981 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023600.1"; gene_id "LTnewLTref_310023600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 659187 661086 0.41 - . transcript_id "LTnewLTref_310023700.1"; gene_id "LTnewLTref_310023700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 659187 659353 0.68 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310023700.1"; gene_id "LTnewLTref_310023700"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 660660 661086 0.41 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023700.1"; gene_id "LTnewLTref_310023700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 661836 662216 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310023800.1"; gene_id "LTnewLTref_310023800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 661836 662216 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023800.1"; gene_id "LTnewLTref_310023800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 663210 663860 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_310023900.1"; gene_id "LTnewLTref_310023900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 663210 663860 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310023900.1"; gene_id "LTnewLTref_310023900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 665342 669250 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310024000.1"; gene_id "LTnewLTref_310024000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 665342 669250 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024000.1"; gene_id "LTnewLTref_310024000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 676978 677505 0.91 - . transcript_id "LTnewLTref_310024100.1"; gene_id "LTnewLTref_310024100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 676978 677505 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024100.1"; gene_id "LTnewLTref_310024100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 678424 685566 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310024200.1"; gene_id "LTnewLTref_310024200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 678424 685566 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024200.1"; gene_id "LTnewLTref_310024200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 690952 694425 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310024300.1"; gene_id "LTnewLTref_310024300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 690952 694425 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024300.1"; gene_id "LTnewLTref_310024300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 695436 700841 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310024400.1"; gene_id "LTnewLTref_310024400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 695436 700841 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024400.1"; gene_id "LTnewLTref_310024400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 702087 702464 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310024500.1"; gene_id "LTnewLTref_310024500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 702087 702464 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024500.1"; gene_id "LTnewLTref_310024500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 707461 709071 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310024600.1"; gene_id "LTnewLTref_310024600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 707461 709071 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024600.1"; gene_id "LTnewLTref_310024600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 712842 713219 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_310024700.1"; gene_id "LTnewLTref_310024700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 712842 713219 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024700.1"; gene_id "LTnewLTref_310024700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 718251 719885 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_310024800.1"; gene_id "LTnewLTref_310024800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 718251 718357 0.71 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310024800.1"; gene_id "LTnewLTref_310024800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 718448 719885 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024800.1"; gene_id "LTnewLTref_310024800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 725413 726827 0.91 - . transcript_id "LTnewLTref_310024900.1"; gene_id "LTnewLTref_310024900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 725413 725945 0.91 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310024900.1"; gene_id "LTnewLTref_310024900"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 726131 726827 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310024900.1"; gene_id "LTnewLTref_310024900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 729776 730114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025000.1"; gene_id "LTnewLTref_310025000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 729776 730114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025000.1"; gene_id "LTnewLTref_310025000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 735420 736328 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025100.1"; gene_id "LTnewLTref_310025100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 735420 736328 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025100.1"; gene_id "LTnewLTref_310025100"; CM024317.1 Liftoff transcript 739906 740148 . - . transcript_id "LTnewLTref_310025200.1"; gene_id "LTnewLTref_310025200" CM024317.1 Liftoff CDS 739906 740148 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025200.1"; gene_id "LTnewLTref_310025200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 740161 741072 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025300.1"; gene_id "LTnewLTref_310025300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 740161 741072 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025300.1"; gene_id "LTnewLTref_310025300"; CM024317.1 . transcript 742188 745306 . - . transcript_id "LTnewLTref_310025400.1"; gene_id "LTnewLTref_310025400:pseudogene" CM024317.1 . exon 742188 745306 . - . transcript_id "LTnewLTref_310025400.1"; gene_id "LTnewLTref_310025400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 747632 752521 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025500.1"; gene_id "LTnewLTref_310025500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 747632 752521 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025500.1"; gene_id "LTnewLTref_310025500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 753545 757918 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025600.1"; gene_id "LTnewLTref_310025600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 753545 757918 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025600.1"; gene_id "LTnewLTref_310025600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 759966 760793 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_310025700.1"; gene_id "LTnewLTref_310025700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 759966 760072 0.76 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310025700.1"; gene_id "LTnewLTref_310025700"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 760133 760793 0.44 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025700.1"; gene_id "LTnewLTref_310025700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 764124 767570 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025800.1"; gene_id "LTnewLTref_310025800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 764124 767570 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025800.1"; gene_id "LTnewLTref_310025800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 770255 775333 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310025900.1"; gene_id "LTnewLTref_310025900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 770255 775333 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310025900.1"; gene_id "LTnewLTref_310025900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 786198 789026 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026000.1"; gene_id "LTnewLTref_310026000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 786198 789026 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026000.1"; gene_id "LTnewLTref_310026000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 795828 802670 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026100.1"; gene_id "LTnewLTref_310026100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 795828 802670 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026100.1"; gene_id "LTnewLTref_310026100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 810125 811390 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026200.1"; gene_id "LTnewLTref_310026200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 810125 811390 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026200.1"; gene_id "LTnewLTref_310026200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 813562 814350 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026300.1"; gene_id "LTnewLTref_310026300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 813562 814350 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026300.1"; gene_id "LTnewLTref_310026300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 814874 815842 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026400.1"; gene_id "LTnewLTref_310026400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 814874 815842 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026400.1"; gene_id "LTnewLTref_310026400"; CM024317.1 . transcript 816647 816990 . - . transcript_id "LTnewLTref_310026500.1"; gene_id "LTnewLTref_310026500:pseudogene" CM024317.1 . exon 816647 816880 . - . transcript_id "LTnewLTref_310026500.1"; gene_id "LTnewLTref_310026500:pseudogene"; CM024317.1 . exon 816883 816990 . - . transcript_id "LTnewLTref_310026500.1"; gene_id "LTnewLTref_310026500:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 817775 818248 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026600.1"; gene_id "LTnewLTref_310026600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 817775 818248 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026600.1"; gene_id "LTnewLTref_310026600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 818822 819193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026700.1"; gene_id "LTnewLTref_310026700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 818822 819193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026700.1"; gene_id "LTnewLTref_310026700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 819698 820258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026800.1"; gene_id "LTnewLTref_310026800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 819698 820258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026800.1"; gene_id "LTnewLTref_310026800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 821867 824302 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310026900.1"; gene_id "LTnewLTref_310026900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 821867 824302 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310026900.1"; gene_id "LTnewLTref_310026900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 824573 825388 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027000.1"; gene_id "LTnewLTref_310027000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 824573 825388 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027000.1"; gene_id "LTnewLTref_310027000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 825657 826196 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027100.1"; gene_id "LTnewLTref_310027100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 825657 826196 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027100.1"; gene_id "LTnewLTref_310027100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 826548 827624 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027200.1"; gene_id "LTnewLTref_310027200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 826548 827624 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027200.1"; gene_id "LTnewLTref_310027200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 828190 829512 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027300.1"; gene_id "LTnewLTref_310027300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 828190 829512 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027300.1"; gene_id "LTnewLTref_310027300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 834422 835858 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027400.1"; gene_id "LTnewLTref_310027400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 834422 835858 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027400.1"; gene_id "LTnewLTref_310027400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 836325 836885 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027500.1"; gene_id "LTnewLTref_310027500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 836325 836885 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027500.1"; gene_id "LTnewLTref_310027500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 838029 838877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027600.1"; gene_id "LTnewLTref_310027600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 838029 838877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027600.1"; gene_id "LTnewLTref_310027600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 839934 840761 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027700.1"; gene_id "LTnewLTref_310027700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 839934 840761 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027700.1"; gene_id "LTnewLTref_310027700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 841364 845680 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027800.1"; gene_id "LTnewLTref_310027800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 841364 845680 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027800.1"; gene_id "LTnewLTref_310027800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 846140 848173 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310027900.1"; gene_id "LTnewLTref_310027900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 846140 848173 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310027900.1"; gene_id "LTnewLTref_310027900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 849091 851220 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028000.1"; gene_id "LTnewLTref_310028000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 849091 851220 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028000.1"; gene_id "LTnewLTref_310028000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 852455 856051 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028100.1"; gene_id "LTnewLTref_310028100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 852455 856051 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028100.1"; gene_id "LTnewLTref_310028100"; CM024317.1 . transcript 859265 859717 . - . transcript_id "LTnewLTref_310028200.1"; gene_id "LTnewLTref_310028200:pseudogene" CM024317.1 . exon 859265 859717 . - . transcript_id "LTnewLTref_310028200.1"; gene_id "LTnewLTref_310028200:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 859769 860917 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028300.1"; gene_id "LTnewLTref_310028300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 859769 860917 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028300.1"; gene_id "LTnewLTref_310028300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 863265 864515 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028400.1"; gene_id "LTnewLTref_310028400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 863265 864515 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028400.1"; gene_id "LTnewLTref_310028400"; CM024317.1 . transcript 867036 867518 . - . transcript_id "LTnewLTref_310028500.1"; gene_id "LTnewLTref_310028500:pseudogene" CM024317.1 . exon 867036 867518 . - . transcript_id "LTnewLTref_310028500.1"; gene_id "LTnewLTref_310028500:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 868714 869925 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028600.1"; gene_id "LTnewLTref_310028600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 868714 869925 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028600.1"; gene_id "LTnewLTref_310028600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 875522 876649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028700.1"; gene_id "LTnewLTref_310028700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 875522 876649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028700.1"; gene_id "LTnewLTref_310028700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 879004 882375 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028800.1"; gene_id "LTnewLTref_310028800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 879004 882375 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028800.1"; gene_id "LTnewLTref_310028800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 885416 886801 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310028900.1"; gene_id "LTnewLTref_310028900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 885416 886801 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310028900.1"; gene_id "LTnewLTref_310028900"; CM024317.1 . transcript 890503 890832 . - . transcript_id "LTnewLTref_310029000.1"; gene_id "LTnewLTref_310029000:pseudogene" CM024317.1 . exon 890503 890832 . - . transcript_id "LTnewLTref_310029000.1"; gene_id "LTnewLTref_310029000:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 892470 894287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310029100.1"; gene_id "LTnewLTref_310029100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 892470 894287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029100.1"; gene_id "LTnewLTref_310029100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 895764 896036 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_310029200.1"; gene_id "LTnewLTref_310029200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 895764 896036 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029200.1"; gene_id "LTnewLTref_310029200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 899298 901061 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310029300.1"; gene_id "LTnewLTref_310029300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 899298 901061 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029300.1"; gene_id "LTnewLTref_310029300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 903929 904234 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310029400.1"; gene_id "LTnewLTref_310029400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 903929 904234 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029400.1"; gene_id "LTnewLTref_310029400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 906794 907153 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310029500.1"; gene_id "LTnewLTref_310029500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 906794 907153 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029500.1"; gene_id "LTnewLTref_310029500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 908064 908411 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_310029600.1"; gene_id "LTnewLTref_310029600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 908064 908411 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029600.1"; gene_id "LTnewLTref_310029600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 909517 911334 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310029700.1"; gene_id "LTnewLTref_310029700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 909517 911334 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029700.1"; gene_id "LTnewLTref_310029700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 915878 919999 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310029800.1"; gene_id "LTnewLTref_310029800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 915878 919999 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029800.1"; gene_id "LTnewLTref_310029800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 921609 921929 0.64 - . transcript_id "LTnewLTref_310029900.1"; gene_id "LTnewLTref_310029900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 921609 921929 0.64 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310029900.1"; gene_id "LTnewLTref_310029900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 925070 929149 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030000.1"; gene_id "LTnewLTref_310030000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 925070 929149 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030000.1"; gene_id "LTnewLTref_310030000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 932936 933241 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030100.1"; gene_id "LTnewLTref_310030100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 932936 933241 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030100.1"; gene_id "LTnewLTref_310030100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 934466 934924 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030200.1"; gene_id "LTnewLTref_310030200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 934466 934924 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030200.1"; gene_id "LTnewLTref_310030200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 936773 937069 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030300.1"; gene_id "LTnewLTref_310030300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 936773 937069 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030300.1"; gene_id "LTnewLTref_310030300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 941062 942141 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030400.1"; gene_id "LTnewLTref_310030400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 941062 942141 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030400.1"; gene_id "LTnewLTref_310030400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 944100 944795 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030500.1"; gene_id "LTnewLTref_310030500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 944100 944795 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030500.1"; gene_id "LTnewLTref_310030500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 948708 949511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030600.1"; gene_id "LTnewLTref_310030600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 948708 949511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030600.1"; gene_id "LTnewLTref_310030600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 953984 954484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310030700.1"; gene_id "LTnewLTref_310030700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 953984 954484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030700.1"; gene_id "LTnewLTref_310030700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 961424 964000 0.81 - . transcript_id "LTnewLTref_310030800.1"; gene_id "LTnewLTref_310030800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 961424 964000 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310030800.1"; gene_id "LTnewLTref_310030800"; CM024317.1 . transcript 967543 970445 . - . transcript_id "LTnewLTref_310030900.1"; gene_id "LTnewLTref_310030900:pseudogene" CM024317.1 . exon 967543 970445 . - . transcript_id "LTnewLTref_310030900.1"; gene_id "LTnewLTref_310030900:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 974954 976369 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031000.1"; gene_id "LTnewLTref_310031000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 974954 976369 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031000.1"; gene_id "LTnewLTref_310031000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 977100 977486 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031100.1"; gene_id "LTnewLTref_310031100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 977100 977486 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031100.1"; gene_id "LTnewLTref_310031100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 980280 982829 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031200.1"; gene_id "LTnewLTref_310031200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 980280 982829 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031200.1"; gene_id "LTnewLTref_310031200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 984503 984817 0.91 - . transcript_id "LTnewLTref_310031300.1"; gene_id "LTnewLTref_310031300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 984503 984817 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031300.1"; gene_id "LTnewLTref_310031300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 987188 991060 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031400.1"; gene_id "LTnewLTref_310031400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 987188 991060 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031400.1"; gene_id "LTnewLTref_310031400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 992824 994806 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031500.1"; gene_id "LTnewLTref_310031500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 992824 994806 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031500.1"; gene_id "LTnewLTref_310031500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 997827 999263 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031600.1"; gene_id "LTnewLTref_310031600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 997827 999263 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031600.1"; gene_id "LTnewLTref_310031600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1000872 1002590 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031700.1"; gene_id "LTnewLTref_310031700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1000872 1002590 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031700.1"; gene_id "LTnewLTref_310031700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1005570 1006130 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310031800.1"; gene_id "LTnewLTref_310031800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1005570 1006130 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031800.1"; gene_id "LTnewLTref_310031800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1007821 1008099 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_310031900.1"; gene_id "LTnewLTref_310031900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1007821 1008099 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310031900.1"; gene_id "LTnewLTref_310031900"; CM024317.1 . transcript 1008183 1008439 . - . transcript_id "LTnewLTref_310032000.1"; gene_id "LTnewLTref_310032000:pseudogene" CM024317.1 . exon 1008183 1008302 . - . transcript_id "LTnewLTref_310032000.1"; gene_id "LTnewLTref_310032000:pseudogene"; CM024317.1 . exon 1008305 1008439 . - . transcript_id "LTnewLTref_310032000.1"; gene_id "LTnewLTref_310032000:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1009034 1009582 0.72 - . transcript_id "LTnewLTref_310032100.1"; gene_id "LTnewLTref_310032100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1009034 1009071 0.97 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310032100.1"; gene_id "LTnewLTref_310032100"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1009408 1009582 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032100.1"; gene_id "LTnewLTref_310032100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1011138 1011350 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310032200.1"; gene_id "LTnewLTref_310032200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1011138 1011350 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032200.1"; gene_id "LTnewLTref_310032200"; CM024317.1 Liftoff transcript 1016068 1019418 . - . transcript_id "LTnewLTref_310032300.1"; gene_id "LTnewLTref_310032300" CM024317.1 Liftoff CDS 1016068 1019418 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032300.1"; gene_id "LTnewLTref_310032300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1020694 1020996 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310032400.1"; gene_id "LTnewLTref_310032400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1020694 1020996 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032400.1"; gene_id "LTnewLTref_310032400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1021318 1021608 0.45 - . transcript_id "LTnewLTref_310032500.1"; gene_id "LTnewLTref_310032500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1021318 1021608 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032500.1"; gene_id "LTnewLTref_310032500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1022877 1023098 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310032600.1"; gene_id "LTnewLTref_310032600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1022877 1023098 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032600.1"; gene_id "LTnewLTref_310032600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1024968 1026878 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310032700.1"; gene_id "LTnewLTref_310032700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1024968 1026878 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032700.1"; gene_id "LTnewLTref_310032700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1029246 1031066 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310032800.1"; gene_id "LTnewLTref_310032800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1029246 1031066 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032800.1"; gene_id "LTnewLTref_310032800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1034632 1036047 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310032900.1"; gene_id "LTnewLTref_310032900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1034632 1036047 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310032900.1"; gene_id "LTnewLTref_310032900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1036735 1037121 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310033000.1"; gene_id "LTnewLTref_310033000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1036735 1037121 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033000.1"; gene_id "LTnewLTref_310033000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1039031 1040533 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310033100.1"; gene_id "LTnewLTref_310033100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1039031 1040533 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033100.1"; gene_id "LTnewLTref_310033100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1043103 1044665 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310033200.1"; gene_id "LTnewLTref_310033200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1043103 1044665 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033200.1"; gene_id "LTnewLTref_310033200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1047975 1049450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310033300.1"; gene_id "LTnewLTref_310033300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1047975 1049450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033300.1"; gene_id "LTnewLTref_310033300"; CM024317.1 . transcript 1050524 1051922 . - . transcript_id "LTnewLTref_310033400.1"; gene_id "LTnewLTref_310033400:pseudogene" CM024317.1 . exon 1050524 1050760 . - . transcript_id "LTnewLTref_310033400.1"; gene_id "LTnewLTref_310033400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 1050762 1051922 . - . transcript_id "LTnewLTref_310033400.1"; gene_id "LTnewLTref_310033400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1052737 1053589 0.75 - . transcript_id "LTnewLTref_310033500.1"; gene_id "LTnewLTref_310033500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1052737 1052745 0.84 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033500.1"; gene_id "LTnewLTref_310033500"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1053230 1053589 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033500.1"; gene_id "LTnewLTref_310033500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1053182 1053589 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310033500.2"; gene_id "LTnewLTref_310033500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1053182 1053589 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033500.2"; gene_id "LTnewLTref_310033500"; CM024317.1 . transcript 1054841 1057330 . - . transcript_id "LTnewLTref_310033600.1"; gene_id "LTnewLTref_310033600:pseudogene" CM024317.1 . exon 1054841 1057330 . - . transcript_id "LTnewLTref_310033600.1"; gene_id "LTnewLTref_310033600:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1059829 1060980 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310033700.1"; gene_id "LTnewLTref_310033700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1059829 1060980 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033700.1"; gene_id "LTnewLTref_310033700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1063607 1064032 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_310033800.1"; gene_id "LTnewLTref_310033800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1063607 1063645 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033800.1"; gene_id "LTnewLTref_310033800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1063820 1064032 0.42 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033800.1"; gene_id "LTnewLTref_310033800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1064162 1064389 0.65 - . transcript_id "LTnewLTref_310033900.1"; gene_id "LTnewLTref_310033900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1064162 1064389 0.65 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310033900.1"; gene_id "LTnewLTref_310033900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1064603 1065778 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034000.1"; gene_id "LTnewLTref_310034000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1064603 1065778 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034000.1"; gene_id "LTnewLTref_310034000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1069761 1070379 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_310034100.1"; gene_id "LTnewLTref_310034100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1069761 1069915 0.78 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310034100.1"; gene_id "LTnewLTref_310034100"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1070214 1070379 0.69 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034100.1"; gene_id "LTnewLTref_310034100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1070489 1073536 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034200.1"; gene_id "LTnewLTref_310034200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1070489 1073536 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034200.1"; gene_id "LTnewLTref_310034200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1077602 1078681 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034300.1"; gene_id "LTnewLTref_310034300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1077602 1078681 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034300.1"; gene_id "LTnewLTref_310034300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1080428 1082719 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034400.1"; gene_id "LTnewLTref_310034400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1080428 1082719 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034400.1"; gene_id "LTnewLTref_310034400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1084979 1087771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034500.1"; gene_id "LTnewLTref_310034500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1084979 1087771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034500.1"; gene_id "LTnewLTref_310034500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1090555 1093701 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034600.1"; gene_id "LTnewLTref_310034600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1090555 1093701 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034600.1"; gene_id "LTnewLTref_310034600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1096421 1097275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034700.1"; gene_id "LTnewLTref_310034700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1096421 1097275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034700.1"; gene_id "LTnewLTref_310034700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1101858 1104335 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034800.1"; gene_id "LTnewLTref_310034800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1101858 1104335 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034800.1"; gene_id "LTnewLTref_310034800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1107577 1111350 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310034900.1"; gene_id "LTnewLTref_310034900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1107577 1111350 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310034900.1"; gene_id "LTnewLTref_310034900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1116313 1119024 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035000.1"; gene_id "LTnewLTref_310035000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1116313 1119024 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035000.1"; gene_id "LTnewLTref_310035000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1124008 1126314 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035100.1"; gene_id "LTnewLTref_310035100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1124008 1126314 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035100.1"; gene_id "LTnewLTref_310035100"; CM024317.1 Liftoff transcript 1129480 1129684 . - . transcript_id "LTnewLTref_310035200.1"; gene_id "LTnewLTref_310035200" CM024317.1 Liftoff CDS 1129480 1129684 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035200.1"; gene_id "LTnewLTref_310035200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1134367 1136115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035300.1"; gene_id "LTnewLTref_310035300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1134367 1136115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035300.1"; gene_id "LTnewLTref_310035300"; CM024317.1 . transcript 1135181 1135582 . + . transcript_id "LTnewLTref_310035400.1"; gene_id "LTnewLTref_310035400:pseudogene" CM024317.1 . exon 1135181 1135582 . + . transcript_id "LTnewLTref_310035400.1"; gene_id "LTnewLTref_310035400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1141114 1142571 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035500.1"; gene_id "LTnewLTref_310035500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1141114 1142571 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035500.1"; gene_id "LTnewLTref_310035500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1146814 1149336 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035600.1"; gene_id "LTnewLTref_310035600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1146814 1149336 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035600.1"; gene_id "LTnewLTref_310035600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1150701 1157588 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035700.1"; gene_id "LTnewLTref_310035700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1150701 1157588 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035700.1"; gene_id "LTnewLTref_310035700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1159198 1160538 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035800.1"; gene_id "LTnewLTref_310035800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1159198 1160538 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035800.1"; gene_id "LTnewLTref_310035800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1164047 1164505 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310035900.1"; gene_id "LTnewLTref_310035900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1164047 1164505 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310035900.1"; gene_id "LTnewLTref_310035900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1165294 1166322 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036000.1"; gene_id "LTnewLTref_310036000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1165294 1166322 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036000.1"; gene_id "LTnewLTref_310036000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1166763 1168628 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036100.1"; gene_id "LTnewLTref_310036100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1166763 1168628 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036100.1"; gene_id "LTnewLTref_310036100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1169874 1171262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036200.1"; gene_id "LTnewLTref_310036200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1169874 1171262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036200.1"; gene_id "LTnewLTref_310036200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1174477 1175025 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036300.1"; gene_id "LTnewLTref_310036300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1174477 1175025 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036300.1"; gene_id "LTnewLTref_310036300"; CM024317.1 Liftoff transcript 1177983 1178660 . - . transcript_id "LTnewLTref_310036400.1"; gene_id "LTnewLTref_310036400" CM024317.1 Liftoff CDS 1177983 1178660 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036400.1"; gene_id "LTnewLTref_310036400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1180238 1180528 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036500.1"; gene_id "LTnewLTref_310036500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1180238 1180528 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036500.1"; gene_id "LTnewLTref_310036500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1181037 1181324 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036600.1"; gene_id "LTnewLTref_310036600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1181037 1181324 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036600.1"; gene_id "LTnewLTref_310036600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1183096 1184244 0.56 - . transcript_id "LTnewLTref_310036700.1"; gene_id "LTnewLTref_310036700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1183096 1184154 0.59 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036700.1"; gene_id "LTnewLTref_310036700"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1184197 1184244 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036700.1"; gene_id "LTnewLTref_310036700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1186023 1187159 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036800.1"; gene_id "LTnewLTref_310036800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1186023 1187159 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036800.1"; gene_id "LTnewLTref_310036800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1187639 1190365 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310036900.1"; gene_id "LTnewLTref_310036900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1187639 1190365 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310036900.1"; gene_id "LTnewLTref_310036900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1193176 1194225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037000.1"; gene_id "LTnewLTref_310037000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1193176 1194225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037000.1"; gene_id "LTnewLTref_310037000"; CM024317.1 . transcript 1196177 1197518 . - . transcript_id "LTnewLTref_310037100.1"; gene_id "LTnewLTref_310037100:pseudogene" CM024317.1 . exon 1196177 1197518 . - . transcript_id "LTnewLTref_310037100.1"; gene_id "LTnewLTref_310037100:pseudogene"; CM024317.1 . transcript 1197999 1198367 . - . transcript_id "LTnewLTref_310037200.1"; gene_id "LTnewLTref_310037200:pseudogene" CM024317.1 . exon 1197999 1198367 . - . transcript_id "LTnewLTref_310037200.1"; gene_id "LTnewLTref_310037200:pseudogene"; CM024317.1 Liftoff transcript 1203334 1204056 . - . transcript_id "LTnewLTref_310037300.1"; gene_id "LTnewLTref_310037300" CM024317.1 Liftoff CDS 1203334 1204056 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037300.1"; gene_id "LTnewLTref_310037300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1207971 1212464 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037400.1"; gene_id "LTnewLTref_310037400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1207971 1212464 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037400.1"; gene_id "LTnewLTref_310037400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1213913 1215529 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037500.1"; gene_id "LTnewLTref_310037500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1213913 1215529 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037500.1"; gene_id "LTnewLTref_310037500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1216231 1217613 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037600.1"; gene_id "LTnewLTref_310037600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1216231 1217613 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037600.1"; gene_id "LTnewLTref_310037600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1222582 1225038 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037700.1"; gene_id "LTnewLTref_310037700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1222582 1225038 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037700.1"; gene_id "LTnewLTref_310037700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1229561 1230916 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037800.1"; gene_id "LTnewLTref_310037800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1229561 1230916 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037800.1"; gene_id "LTnewLTref_310037800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1232930 1236610 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310037900.1"; gene_id "LTnewLTref_310037900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1232930 1236610 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310037900.1"; gene_id "LTnewLTref_310037900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1245489 1246100 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038000.1"; gene_id "LTnewLTref_310038000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1245489 1246100 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038000.1"; gene_id "LTnewLTref_310038000"; CM024317.1 . transcript 1249981 1250771 . - . transcript_id "LTnewLTref_310038100.1"; gene_id "LTnewLTref_310038100:pseudogene" CM024317.1 . exon 1249981 1250771 . - . transcript_id "LTnewLTref_310038100.1"; gene_id "LTnewLTref_310038100:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1253130 1254102 0.32 - . transcript_id "LTnewLTref_310038200.1"; gene_id "LTnewLTref_310038200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1253130 1253253 0.41 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310038200.1"; gene_id "LTnewLTref_310038200"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1253888 1254102 0.41 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038200.1"; gene_id "LTnewLTref_310038200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1253130 1254459 0.31 - . transcript_id "LTnewLTref_310038200.2"; gene_id "LTnewLTref_310038200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1253130 1253253 0.32 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310038200.2"; gene_id "LTnewLTref_310038200"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1253888 1254459 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038200.2"; gene_id "LTnewLTref_310038200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1255600 1256358 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038300.1"; gene_id "LTnewLTref_310038300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1255600 1256358 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038300.1"; gene_id "LTnewLTref_310038300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1258815 1259474 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038400.1"; gene_id "LTnewLTref_310038400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1258815 1259474 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038400.1"; gene_id "LTnewLTref_310038400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1260983 1261567 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038500.1"; gene_id "LTnewLTref_310038500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1260983 1261567 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038500.1"; gene_id "LTnewLTref_310038500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1262602 1263699 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038600.1"; gene_id "LTnewLTref_310038600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1262602 1263699 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038600.1"; gene_id "LTnewLTref_310038600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1266030 1267520 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038700.1"; gene_id "LTnewLTref_310038700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1266030 1267520 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038700.1"; gene_id "LTnewLTref_310038700"; CM024317.1 . transcript 1268613 1269372 . - . transcript_id "LTnewLTref_310038800.1"; gene_id "LTnewLTref_310038800:pseudogene" CM024317.1 . exon 1268613 1269372 . - . transcript_id "LTnewLTref_310038800.1"; gene_id "LTnewLTref_310038800:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1269680 1270162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310038900.1"; gene_id "LTnewLTref_310038900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1269680 1270162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310038900.1"; gene_id "LTnewLTref_310038900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1270853 1271290 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039000.1"; gene_id "LTnewLTref_310039000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1270853 1271290 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039000.1"; gene_id "LTnewLTref_310039000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1272070 1272495 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039100.1"; gene_id "LTnewLTref_310039100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1272070 1272495 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039100.1"; gene_id "LTnewLTref_310039100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1273348 1273896 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039200.1"; gene_id "LTnewLTref_310039200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1273348 1273896 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039200.1"; gene_id "LTnewLTref_310039200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1275794 1278263 0.52 - . transcript_id "LTnewLTref_310039300.1"; gene_id "LTnewLTref_310039300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1275794 1275796 0.65 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039300.1"; gene_id "LTnewLTref_310039300"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1275921 1278263 0.73 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039300.1"; gene_id "LTnewLTref_310039300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1279889 1282369 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039400.1"; gene_id "LTnewLTref_310039400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1279889 1282369 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039400.1"; gene_id "LTnewLTref_310039400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1283662 1286028 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039500.1"; gene_id "LTnewLTref_310039500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1283662 1286028 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039500.1"; gene_id "LTnewLTref_310039500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1288106 1290757 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039600.1"; gene_id "LTnewLTref_310039600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1288106 1290757 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039600.1"; gene_id "LTnewLTref_310039600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1293056 1296382 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039700.1"; gene_id "LTnewLTref_310039700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1293056 1296382 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039700.1"; gene_id "LTnewLTref_310039700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1298599 1298811 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039800.1"; gene_id "LTnewLTref_310039800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1298599 1298811 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039800.1"; gene_id "LTnewLTref_310039800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1299923 1302697 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310039900.1"; gene_id "LTnewLTref_310039900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1299923 1302697 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310039900.1"; gene_id "LTnewLTref_310039900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1304365 1305567 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040000.1"; gene_id "LTnewLTref_310040000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1304365 1305567 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040000.1"; gene_id "LTnewLTref_310040000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1306632 1311620 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040100.1"; gene_id "LTnewLTref_310040100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1306632 1311620 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040100.1"; gene_id "LTnewLTref_310040100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1312504 1313682 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040200.1"; gene_id "LTnewLTref_310040200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1312504 1313682 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040200.1"; gene_id "LTnewLTref_310040200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1315584 1316681 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040300.1"; gene_id "LTnewLTref_310040300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1315584 1316681 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040300.1"; gene_id "LTnewLTref_310040300"; CM024317.1 . transcript 1317574 1319079 . - . transcript_id "LTnewLTref_310040400.1"; gene_id "LTnewLTref_310040400:pseudogene" CM024317.1 . exon 1317574 1319079 . - . transcript_id "LTnewLTref_310040400.1"; gene_id "LTnewLTref_310040400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1321054 1322691 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040500.1"; gene_id "LTnewLTref_310040500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1321054 1322691 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040500.1"; gene_id "LTnewLTref_310040500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1327249 1328982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040600.1"; gene_id "LTnewLTref_310040600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1327249 1328982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040600.1"; gene_id "LTnewLTref_310040600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1331659 1332174 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040700.1"; gene_id "LTnewLTref_310040700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1331659 1332174 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040700.1"; gene_id "LTnewLTref_310040700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1332511 1332756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040800.1"; gene_id "LTnewLTref_310040800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1332511 1332756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040800.1"; gene_id "LTnewLTref_310040800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1335413 1337425 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310040900.1"; gene_id "LTnewLTref_310040900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1335413 1337425 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310040900.1"; gene_id "LTnewLTref_310040900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1338150 1338807 0.59 - . transcript_id "LTnewLTref_310041000.1"; gene_id "LTnewLTref_310041000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1338150 1338246 0.81 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310041000.1"; gene_id "LTnewLTref_310041000"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1338374 1338807 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041000.1"; gene_id "LTnewLTref_310041000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1338843 1340281 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_310041100.1"; gene_id "LTnewLTref_310041100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1338843 1339508 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041100.1"; gene_id "LTnewLTref_310041100"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1339577 1340281 0.48 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041100.1"; gene_id "LTnewLTref_310041100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1340325 1340612 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_310041200.1"; gene_id "LTnewLTref_310041200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1340325 1340423 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041200.1"; gene_id "LTnewLTref_310041200"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1340469 1340612 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041200.1"; gene_id "LTnewLTref_310041200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1342794 1346744 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310041300.1"; gene_id "LTnewLTref_310041300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1342794 1346744 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041300.1"; gene_id "LTnewLTref_310041300"; CM024317.1 . transcript 1346895 1350016 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041400.1"; gene_id "LTnewLTref_310041400:pseudogene" CM024317.1 . exon 1346895 1347011 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041400.1"; gene_id "LTnewLTref_310041400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 1347014 1347037 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041400.1"; gene_id "LTnewLTref_310041400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 1347039 1347242 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041400.1"; gene_id "LTnewLTref_310041400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 1347244 1347273 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041400.1"; gene_id "LTnewLTref_310041400:pseudogene"; CM024317.1 . exon 1347413 1350016 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041400.1"; gene_id "LTnewLTref_310041400:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1351040 1354294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310041500.1"; gene_id "LTnewLTref_310041500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1351040 1354294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041500.1"; gene_id "LTnewLTref_310041500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1354643 1355083 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310041600.1"; gene_id "LTnewLTref_310041600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1354643 1355083 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041600.1"; gene_id "LTnewLTref_310041600"; CM024317.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1355542 1355614 . + . transcript_id "LTnewLTref_310041700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310041700" CM024317.1 Aragorn_1.2.36 exon 1355542 1355614 . + . transcript_id "LTnewLTref_310041700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310041700"; CM024317.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1355649 1355730 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310041800" CM024317.1 Aragorn_1.2.36 exon 1355649 1355730 . - . transcript_id "LTnewLTref_310041800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_310041800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1356080 1357687 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310041900.1"; gene_id "LTnewLTref_310041900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1356080 1357687 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310041900.1"; gene_id "LTnewLTref_310041900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1358219 1359010 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042000.1"; gene_id "LTnewLTref_310042000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1358219 1359010 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042000.1"; gene_id "LTnewLTref_310042000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1359659 1361062 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042100.1"; gene_id "LTnewLTref_310042100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1359659 1361062 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042100.1"; gene_id "LTnewLTref_310042100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1361639 1362943 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042200.1"; gene_id "LTnewLTref_310042200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1361639 1362943 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042200.1"; gene_id "LTnewLTref_310042200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1364473 1368399 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042300.1"; gene_id "LTnewLTref_310042300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1364473 1368399 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042300.1"; gene_id "LTnewLTref_310042300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1372173 1373114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042400.1"; gene_id "LTnewLTref_310042400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1372173 1373114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042400.1"; gene_id "LTnewLTref_310042400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1375603 1376103 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042500.1"; gene_id "LTnewLTref_310042500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1375603 1376103 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042500.1"; gene_id "LTnewLTref_310042500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1378731 1379444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042600.1"; gene_id "LTnewLTref_310042600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1378731 1379444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042600.1"; gene_id "LTnewLTref_310042600"; CM024317.1 . transcript 1381329 1381772 . - . transcript_id "LTnewLTref_310042700.1"; gene_id "LTnewLTref_310042700:pseudogene" CM024317.1 . exon 1381329 1381772 . - . transcript_id "LTnewLTref_310042700.1"; gene_id "LTnewLTref_310042700:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1383962 1384498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310042800.1"; gene_id "LTnewLTref_310042800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1383962 1384498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310042800.1"; gene_id "LTnewLTref_310042800"; CM024317.1 . transcript 1388807 1389620 . - . transcript_id "LTnewLTref_310042900.1"; gene_id "LTnewLTref_310042900:pseudogene" CM024317.1 . exon 1388807 1389620 . - . transcript_id "LTnewLTref_310042900.1"; gene_id "LTnewLTref_310042900:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1391152 1391991 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043000.1"; gene_id "LTnewLTref_310043000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1391152 1391991 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043000.1"; gene_id "LTnewLTref_310043000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1392835 1393647 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043100.1"; gene_id "LTnewLTref_310043100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1392835 1393647 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043100.1"; gene_id "LTnewLTref_310043100"; CM024317.1 Liftoff transcript 1395573 1397450 . - . transcript_id "LTnewLTref_310043200.1"; gene_id "LTnewLTref_310043200" CM024317.1 Liftoff CDS 1395573 1397450 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043200.1"; gene_id "LTnewLTref_310043200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1398485 1399459 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043300.1"; gene_id "LTnewLTref_310043300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1398485 1399459 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043300.1"; gene_id "LTnewLTref_310043300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1399947 1400582 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043400.1"; gene_id "LTnewLTref_310043400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1399947 1400582 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043400.1"; gene_id "LTnewLTref_310043400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1401350 1403380 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043500.1"; gene_id "LTnewLTref_310043500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1401350 1403380 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043500.1"; gene_id "LTnewLTref_310043500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1404101 1404550 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043600.1"; gene_id "LTnewLTref_310043600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1404101 1404550 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043600.1"; gene_id "LTnewLTref_310043600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1405280 1406140 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043700.1"; gene_id "LTnewLTref_310043700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1405280 1406140 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043700.1"; gene_id "LTnewLTref_310043700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1406823 1410545 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043800.1"; gene_id "LTnewLTref_310043800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1406823 1410545 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043800.1"; gene_id "LTnewLTref_310043800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1411008 1413207 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310043900.1"; gene_id "LTnewLTref_310043900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1411008 1412352 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_310043900.1"; gene_id "LTnewLTref_310043900"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1412960 1413207 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310043900.1"; gene_id "LTnewLTref_310043900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1414572 1415315 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044000.1"; gene_id "LTnewLTref_310044000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1414572 1415315 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044000.1"; gene_id "LTnewLTref_310044000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1417854 1419158 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044100.1"; gene_id "LTnewLTref_310044100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1417854 1419158 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044100.1"; gene_id "LTnewLTref_310044100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1419844 1420593 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044200.1"; gene_id "LTnewLTref_310044200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1419844 1420593 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044200.1"; gene_id "LTnewLTref_310044200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1424238 1425482 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044300.1"; gene_id "LTnewLTref_310044300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1424238 1425482 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044300.1"; gene_id "LTnewLTref_310044300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1426199 1427176 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044400.1"; gene_id "LTnewLTref_310044400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1426199 1427176 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044400.1"; gene_id "LTnewLTref_310044400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1430349 1431674 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044500.1"; gene_id "LTnewLTref_310044500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1430349 1431674 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044500.1"; gene_id "LTnewLTref_310044500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1434535 1441041 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044600.1"; gene_id "LTnewLTref_310044600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1434535 1441041 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044600.1"; gene_id "LTnewLTref_310044600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1441842 1444805 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044700.1"; gene_id "LTnewLTref_310044700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1441842 1444805 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044700.1"; gene_id "LTnewLTref_310044700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1446358 1452219 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044800.1"; gene_id "LTnewLTref_310044800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1446358 1452219 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044800.1"; gene_id "LTnewLTref_310044800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1450409 1452219 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310044800.2"; gene_id "LTnewLTref_310044800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1450409 1450411 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044800.2"; gene_id "LTnewLTref_310044800"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1450483 1452219 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310044800.2"; gene_id "LTnewLTref_310044800"; CM024317.1 . transcript 1453480 1456308 . - . transcript_id "LTnewLTref_310044900.1"; gene_id "LTnewLTref_310044900:pseudogene" CM024317.1 . exon 1453480 1456308 . - . transcript_id "LTnewLTref_310044900.1"; gene_id "LTnewLTref_310044900:pseudogene"; CM024317.1 Liftoff transcript 1457525 1459090 . - . transcript_id "LTnewLTref_310045000.1"; gene_id "LTnewLTref_310045000" CM024317.1 Liftoff CDS 1457525 1459090 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045000.1"; gene_id "LTnewLTref_310045000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1459403 1460826 0.49 - . transcript_id "LTnewLTref_310045100.1"; gene_id "LTnewLTref_310045100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1459403 1459860 0.89 - 2 transcript_id "LTnewLTref_310045100.1"; gene_id "LTnewLTref_310045100"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1459941 1460826 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045100.1"; gene_id "LTnewLTref_310045100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1461459 1466792 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310045200.1"; gene_id "LTnewLTref_310045200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1461459 1466792 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045200.1"; gene_id "LTnewLTref_310045200"; CM024317.1 . transcript 1467609 1467848 . - . transcript_id "LTnewLTref_310045300.1"; gene_id "LTnewLTref_310045300:pseudogene" CM024317.1 . exon 1467609 1467848 . - . transcript_id "LTnewLTref_310045300.1"; gene_id "LTnewLTref_310045300:pseudogene"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1468093 1468434 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_310045400.1"; gene_id "LTnewLTref_310045400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1468093 1468434 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045400.1"; gene_id "LTnewLTref_310045400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1468459 1468686 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310045500.1"; gene_id "LTnewLTref_310045500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1468459 1468686 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045500.1"; gene_id "LTnewLTref_310045500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1469839 1470585 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310045600.1"; gene_id "LTnewLTref_310045600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1469839 1470585 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045600.1"; gene_id "LTnewLTref_310045600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1471233 1471757 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310045700.1"; gene_id "LTnewLTref_310045700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1471233 1471757 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045700.1"; gene_id "LTnewLTref_310045700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1475011 1476309 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310045800.1"; gene_id "LTnewLTref_310045800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1475011 1476309 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045800.1"; gene_id "LTnewLTref_310045800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1479603 1480901 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310045900.1"; gene_id "LTnewLTref_310045900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1479603 1480901 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310045900.1"; gene_id "LTnewLTref_310045900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1484643 1485728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046000.1"; gene_id "LTnewLTref_310046000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1484643 1485728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046000.1"; gene_id "LTnewLTref_310046000"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1486368 1489760 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046100.1"; gene_id "LTnewLTref_310046100" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1486368 1489760 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046100.1"; gene_id "LTnewLTref_310046100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1490797 1491450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046200.1"; gene_id "LTnewLTref_310046200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1490797 1491450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046200.1"; gene_id "LTnewLTref_310046200"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1491911 1492477 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046300.1"; gene_id "LTnewLTref_310046300" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1491911 1492477 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046300.1"; gene_id "LTnewLTref_310046300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1493630 1496170 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046400.1"; gene_id "LTnewLTref_310046400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1493630 1496170 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046400.1"; gene_id "LTnewLTref_310046400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1497102 1498850 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046500.1"; gene_id "LTnewLTref_310046500" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1497102 1498850 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046500.1"; gene_id "LTnewLTref_310046500"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1499648 1501711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046600.1"; gene_id "LTnewLTref_310046600" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1499648 1501711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046600.1"; gene_id "LTnewLTref_310046600"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1502278 1503435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046700.1"; gene_id "LTnewLTref_310046700" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1502278 1503435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046700.1"; gene_id "LTnewLTref_310046700"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1503775 1504146 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046800.1"; gene_id "LTnewLTref_310046800" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1503775 1504146 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046800.1"; gene_id "LTnewLTref_310046800"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1504599 1509008 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310046900.1"; gene_id "LTnewLTref_310046900" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1504599 1509008 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310046900.1"; gene_id "LTnewLTref_310046900"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1509852 1511141 1 - . transcript_id "LTnewLTref_310047000.1"; gene_id "LTnewLTref_310047000" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1509852 1511141 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_310047000.1"; gene_id "LTnewLTref_310047000"; CM024317.1 . transcript 1513245 1514708 . + . transcript_id "LTnewLTref_310047100.1"; gene_id "LTnewLTref_310047100" CM024317.1 . CDS 1513245 1514708 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_310047100.1"; gene_id "LTnewLTref_310047100"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1515211 1515513 1 + . transcript_id "LTnewLTref_310047200.1"; gene_id "LTnewLTref_310047200" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1515211 1515513 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_310047200.1"; gene_id "LTnewLTref_310047200"; CM024317.1 Liftoff transcript 1517225 1517422 . - . transcript_id "LTnewLTref_310047300.1"; gene_id "LTnewLTref_310047300" CM024317.1 Liftoff CDS 1517225 1517422 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_310047300.1"; gene_id "LTnewLTref_310047300"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1517421 1519863 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_310047400.1"; gene_id "LTnewLTref_310047400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1517421 1518760 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_310047400.1"; gene_id "LTnewLTref_310047400"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1518837 1519863 0.7 + 1 transcript_id "LTnewLTref_310047400.1"; gene_id "LTnewLTref_310047400"; CM024317.1 AUGUSTUS transcript 1517778 1519863 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_310047400.2"; gene_id "LTnewLTref_310047400" CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1517778 1518760 0.58 + 0 transcript_id "LTnewLTref_310047400.2"; gene_id "LTnewLTref_310047400"; CM024317.1 AUGUSTUS CDS 1518837 1519863 0.66 + 1 transcript_id "LTnewLTref_310047400.2"; gene_id "LTnewLTref_310047400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1622 2268 0.63 - . transcript_id "LTnewLTref_320005000.1"; gene_id "LTnewLTref_320005000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1622 1789 0.69 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005000.1"; gene_id "LTnewLTref_320005000"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1987 2268 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005000.1"; gene_id "LTnewLTref_320005000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 4439 4843 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320005100.1"; gene_id "LTnewLTref_320005100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 4439 4843 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005100.1"; gene_id "LTnewLTref_320005100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 5787 7271 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320005200.1"; gene_id "LTnewLTref_320005200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 5787 7271 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005200.1"; gene_id "LTnewLTref_320005200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 10981 12084 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320005300.1"; gene_id "LTnewLTref_320005300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 10981 12084 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005300.1"; gene_id "LTnewLTref_320005300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 13110 13796 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_320005400.1"; gene_id "LTnewLTref_320005400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 13110 13694 0.93 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005400.1"; gene_id "LTnewLTref_320005400"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 13773 13796 0.59 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005400.1"; gene_id "LTnewLTref_320005400"; CM024318.1 Liftoff transcript 14505 14684 . - . transcript_id "LTnewLTref_320005500.1"; gene_id "LTnewLTref_320005500" CM024318.1 Liftoff CDS 14505 14684 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005500.1"; gene_id "LTnewLTref_320005500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 16710 17855 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320005600.1"; gene_id "LTnewLTref_320005600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 16710 17855 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005600.1"; gene_id "LTnewLTref_320005600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 20135 21178 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320005700.1"; gene_id "LTnewLTref_320005700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 20135 21178 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005700.1"; gene_id "LTnewLTref_320005700"; CM024318.1 Liftoff transcript 21865 23016 . - . transcript_id "LTnewLTref_320005800.1"; gene_id "LTnewLTref_320005800" CM024318.1 Liftoff CDS 21865 23016 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005800.1"; gene_id "LTnewLTref_320005800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 23834 24757 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320005900.1"; gene_id "LTnewLTref_320005900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 23834 24757 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320005900.1"; gene_id "LTnewLTref_320005900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 25677 26942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006000.1"; gene_id "LTnewLTref_320006000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 25677 26942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006000.1"; gene_id "LTnewLTref_320006000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 29069 29983 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006100.1"; gene_id "LTnewLTref_320006100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 29069 29983 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006100.1"; gene_id "LTnewLTref_320006100"; CM024318.1 Liftoff transcript 30934 31161 . - . transcript_id "LTnewLTref_320006200.1"; gene_id "LTnewLTref_320006200" CM024318.1 Liftoff CDS 30934 31161 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006200.1"; gene_id "LTnewLTref_320006200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 32939 33634 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006300.1"; gene_id "LTnewLTref_320006300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 32939 33634 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006300.1"; gene_id "LTnewLTref_320006300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 35438 36376 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006400.1"; gene_id "LTnewLTref_320006400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 35438 36376 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006400.1"; gene_id "LTnewLTref_320006400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 38423 41791 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006500.1"; gene_id "LTnewLTref_320006500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 38423 41791 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006500.1"; gene_id "LTnewLTref_320006500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 44153 44872 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006600.1"; gene_id "LTnewLTref_320006600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 44153 44872 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006600.1"; gene_id "LTnewLTref_320006600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 46306 49434 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006700.1"; gene_id "LTnewLTref_320006700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 46306 49434 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006700.1"; gene_id "LTnewLTref_320006700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 50759 53755 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006800.1"; gene_id "LTnewLTref_320006800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 50759 53755 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006800.1"; gene_id "LTnewLTref_320006800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 54819 56687 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320006900.1"; gene_id "LTnewLTref_320006900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 54819 56687 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320006900.1"; gene_id "LTnewLTref_320006900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 57323 57598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007000.1"; gene_id "LTnewLTref_320007000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 57323 57598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007000.1"; gene_id "LTnewLTref_320007000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 58284 59210 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007100.1"; gene_id "LTnewLTref_320007100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 58284 59210 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007100.1"; gene_id "LTnewLTref_320007100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 59929 60279 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007200.1"; gene_id "LTnewLTref_320007200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 59929 60279 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007200.1"; gene_id "LTnewLTref_320007200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 61186 63492 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007300.1"; gene_id "LTnewLTref_320007300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 61186 63492 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007300.1"; gene_id "LTnewLTref_320007300"; CM024318.1 Liftoff transcript 64179 65522 . - . transcript_id "LTnewLTref_320007400.1"; gene_id "LTnewLTref_320007400" CM024318.1 Liftoff CDS 64179 65522 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007400.1"; gene_id "LTnewLTref_320007400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 66494 68074 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007500.1"; gene_id "LTnewLTref_320007500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 66494 68074 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007500.1"; gene_id "LTnewLTref_320007500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 70056 73136 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007600.1"; gene_id "LTnewLTref_320007600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 70056 73136 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007600.1"; gene_id "LTnewLTref_320007600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 75400 75675 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007700.1"; gene_id "LTnewLTref_320007700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 75400 75675 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007700.1"; gene_id "LTnewLTref_320007700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 76697 79957 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007800.1"; gene_id "LTnewLTref_320007800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 76697 79957 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007800.1"; gene_id "LTnewLTref_320007800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 82249 88611 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320007900.1"; gene_id "LTnewLTref_320007900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 82249 87658 1 - 1 transcript_id "LTnewLTref_320007900.1"; gene_id "LTnewLTref_320007900"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 87746 88611 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320007900.1"; gene_id "LTnewLTref_320007900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 90112 94194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008000.1"; gene_id "LTnewLTref_320008000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 90112 94194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008000.1"; gene_id "LTnewLTref_320008000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 97624 101529 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008100.1"; gene_id "LTnewLTref_320008100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 97624 101529 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008100.1"; gene_id "LTnewLTref_320008100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 102941 103645 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008200.1"; gene_id "LTnewLTref_320008200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 102941 103645 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008200.1"; gene_id "LTnewLTref_320008200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 104866 105897 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008300.1"; gene_id "LTnewLTref_320008300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 104866 105897 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008300.1"; gene_id "LTnewLTref_320008300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 106936 109224 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008400.1"; gene_id "LTnewLTref_320008400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 106936 109224 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008400.1"; gene_id "LTnewLTref_320008400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 110236 115203 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008500.1"; gene_id "LTnewLTref_320008500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 110236 115203 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008500.1"; gene_id "LTnewLTref_320008500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 116296 117222 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008600.1"; gene_id "LTnewLTref_320008600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 116296 117222 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008600.1"; gene_id "LTnewLTref_320008600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 118813 123429 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008700.1"; gene_id "LTnewLTref_320008700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 118813 123429 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008700.1"; gene_id "LTnewLTref_320008700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 124888 127569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008800.1"; gene_id "LTnewLTref_320008800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 124888 127569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008800.1"; gene_id "LTnewLTref_320008800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 129571 130971 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320008900.1"; gene_id "LTnewLTref_320008900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 129571 130971 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320008900.1"; gene_id "LTnewLTref_320008900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 132055 133155 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009000.1"; gene_id "LTnewLTref_320009000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 132055 133155 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009000.1"; gene_id "LTnewLTref_320009000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 133948 136833 0.61 - . transcript_id "LTnewLTref_320009100.1"; gene_id "LTnewLTref_320009100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 133948 136833 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009100.1"; gene_id "LTnewLTref_320009100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 138670 140244 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009200.1"; gene_id "LTnewLTref_320009200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 138670 140244 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009200.1"; gene_id "LTnewLTref_320009200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 141443 142522 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009300.1"; gene_id "LTnewLTref_320009300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 141443 142522 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009300.1"; gene_id "LTnewLTref_320009300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 155708 157552 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009400.1"; gene_id "LTnewLTref_320009400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 155708 157552 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009400.1"; gene_id "LTnewLTref_320009400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 158652 160934 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009500.1"; gene_id "LTnewLTref_320009500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 158652 160934 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009500.1"; gene_id "LTnewLTref_320009500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 161879 164038 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009600.1"; gene_id "LTnewLTref_320009600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 161879 164038 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009600.1"; gene_id "LTnewLTref_320009600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 165223 165723 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009700.1"; gene_id "LTnewLTref_320009700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 165223 165723 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009700.1"; gene_id "LTnewLTref_320009700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 167369 168244 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009800.1"; gene_id "LTnewLTref_320009800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 167369 168244 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009800.1"; gene_id "LTnewLTref_320009800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 169381 170175 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320009900.1"; gene_id "LTnewLTref_320009900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 169381 170175 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320009900.1"; gene_id "LTnewLTref_320009900"; CM024318.1 . transcript 170824 171096 . - . transcript_id "LTnewLTref_320010000.1"; gene_id "LTnewLTref_320010000" CM024318.1 . CDS 170824 171096 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320010000.1"; gene_id "LTnewLTref_320010000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 172146 172988 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320010100.1"; gene_id "LTnewLTref_320010100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 172146 172988 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320010100.1"; gene_id "LTnewLTref_320010100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 173975 176794 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320010200.1"; gene_id "LTnewLTref_320010200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 173975 176794 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320010200.1"; gene_id "LTnewLTref_320010200"; CM024318.1 Liftoff transcript 178692 179312 . - . transcript_id "LTnewLTref_320010300.1"; gene_id "LTnewLTref_320010300" CM024318.1 Liftoff CDS 178692 179312 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320010300.1"; gene_id "LTnewLTref_320010300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 179818 180123 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320010400.1"; gene_id "LTnewLTref_320010400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 179818 180123 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320010400.1"; gene_id "LTnewLTref_320010400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 180579 181730 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320010500.1"; gene_id "LTnewLTref_320010500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 180579 181730 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320010500.1"; gene_id "LTnewLTref_320010500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 183618 184229 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320010600.1"; gene_id "LTnewLTref_320010600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 183618 184229 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320010600.1"; gene_id "LTnewLTref_320010600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 184829 185611 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320010700.1"; gene_id "LTnewLTref_320010700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 184829 185611 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320010700.1"; gene_id "LTnewLTref_320010700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 186173 187264 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320010800.1"; gene_id "LTnewLTref_320010800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 186173 187264 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320010800.1"; gene_id "LTnewLTref_320010800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 188372 188824 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320010900.1"; gene_id "LTnewLTref_320010900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 188372 188824 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320010900.1"; gene_id "LTnewLTref_320010900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 191594 192031 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011000.1"; gene_id "LTnewLTref_320011000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 191594 192031 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011000.1"; gene_id "LTnewLTref_320011000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 193169 194704 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011100.1"; gene_id "LTnewLTref_320011100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 193169 194704 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011100.1"; gene_id "LTnewLTref_320011100"; CM024318.1 . transcript 196052 196324 . + . transcript_id "LTnewLTref_320011200.1"; gene_id "LTnewLTref_320011200" CM024318.1 . CDS 196052 196324 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011200.1"; gene_id "LTnewLTref_320011200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 197704 198045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011300.1"; gene_id "LTnewLTref_320011300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 197704 198045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011300.1"; gene_id "LTnewLTref_320011300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 199010 199546 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011400.1"; gene_id "LTnewLTref_320011400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 199010 199546 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011400.1"; gene_id "LTnewLTref_320011400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 201368 203122 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011500.1"; gene_id "LTnewLTref_320011500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 201368 203122 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011500.1"; gene_id "LTnewLTref_320011500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 204150 205913 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011600.1"; gene_id "LTnewLTref_320011600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 204150 205913 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011600.1"; gene_id "LTnewLTref_320011600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 206980 207930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011700.1"; gene_id "LTnewLTref_320011700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 206980 207930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011700.1"; gene_id "LTnewLTref_320011700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 208758 211190 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011800.1"; gene_id "LTnewLTref_320011800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 208758 211190 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011800.1"; gene_id "LTnewLTref_320011800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 212383 213474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320011900.1"; gene_id "LTnewLTref_320011900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 212383 213474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320011900.1"; gene_id "LTnewLTref_320011900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 214834 215964 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012000.1"; gene_id "LTnewLTref_320012000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 214834 215964 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012000.1"; gene_id "LTnewLTref_320012000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 216588 217349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012100.1"; gene_id "LTnewLTref_320012100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 216588 217349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012100.1"; gene_id "LTnewLTref_320012100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 219956 221770 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012200.1"; gene_id "LTnewLTref_320012200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 219956 221770 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012200.1"; gene_id "LTnewLTref_320012200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 223326 224174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012300.1"; gene_id "LTnewLTref_320012300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 223326 224174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012300.1"; gene_id "LTnewLTref_320012300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 225125 225754 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012400.1"; gene_id "LTnewLTref_320012400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 225125 225754 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012400.1"; gene_id "LTnewLTref_320012400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 227068 227976 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012500.1"; gene_id "LTnewLTref_320012500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 227068 227976 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012500.1"; gene_id "LTnewLTref_320012500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 230443 233796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012600.1"; gene_id "LTnewLTref_320012600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 230443 233796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012600.1"; gene_id "LTnewLTref_320012600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 235501 236181 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012700.1"; gene_id "LTnewLTref_320012700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 235501 236181 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012700.1"; gene_id "LTnewLTref_320012700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 238193 238753 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012800.1"; gene_id "LTnewLTref_320012800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 238193 238753 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012800.1"; gene_id "LTnewLTref_320012800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 241410 242114 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320012900.1"; gene_id "LTnewLTref_320012900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 241410 242114 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320012900.1"; gene_id "LTnewLTref_320012900"; CM024318.1 Liftoff transcript 244801 245073 . + . transcript_id "LTnewLTref_320013000.1"; gene_id "LTnewLTref_320013000" CM024318.1 Liftoff CDS 244801 245073 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013000.1"; gene_id "LTnewLTref_320013000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 247694 248584 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013100.1"; gene_id "LTnewLTref_320013100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 247694 248584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013100.1"; gene_id "LTnewLTref_320013100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 249503 249853 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013200.1"; gene_id "LTnewLTref_320013200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 249503 249853 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013200.1"; gene_id "LTnewLTref_320013200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 251469 253040 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013300.1"; gene_id "LTnewLTref_320013300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 251469 253040 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013300.1"; gene_id "LTnewLTref_320013300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 255466 257259 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013400.1"; gene_id "LTnewLTref_320013400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 255466 257259 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013400.1"; gene_id "LTnewLTref_320013400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 258503 259672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013500.1"; gene_id "LTnewLTref_320013500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 258503 259672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013500.1"; gene_id "LTnewLTref_320013500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 260334 261041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013600.1"; gene_id "LTnewLTref_320013600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 260334 261041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013600.1"; gene_id "LTnewLTref_320013600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 262698 263588 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013700.1"; gene_id "LTnewLTref_320013700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 262698 263588 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013700.1"; gene_id "LTnewLTref_320013700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 264627 269558 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013800.1"; gene_id "LTnewLTref_320013800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 264627 269558 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013800.1"; gene_id "LTnewLTref_320013800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 271914 275330 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320013900.1"; gene_id "LTnewLTref_320013900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 271914 275330 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320013900.1"; gene_id "LTnewLTref_320013900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 276892 277389 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320014000.1"; gene_id "LTnewLTref_320014000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 276892 277389 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014000.1"; gene_id "LTnewLTref_320014000"; CM024318.1 . transcript 279145 279655 . + . transcript_id "LTnewLTref_320014100.1"; gene_id "LTnewLTref_320014100:pseudogene" CM024318.1 . exon 279145 279655 . + . transcript_id "LTnewLTref_320014100.1"; gene_id "LTnewLTref_320014100:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 279851 280463 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_320014200.1"; gene_id "LTnewLTref_320014200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 279851 279871 0.52 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014200.1"; gene_id "LTnewLTref_320014200"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 280080 280463 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014200.1"; gene_id "LTnewLTref_320014200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 281110 282111 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_320014300.1"; gene_id "LTnewLTref_320014300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 281110 281354 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014300.1"; gene_id "LTnewLTref_320014300"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 281706 282111 0.74 + 1 transcript_id "LTnewLTref_320014300.1"; gene_id "LTnewLTref_320014300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 282863 286315 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320014400.1"; gene_id "LTnewLTref_320014400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 282863 286315 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014400.1"; gene_id "LTnewLTref_320014400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 291100 295692 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_320014500.1"; gene_id "LTnewLTref_320014500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 291100 295692 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014500.1"; gene_id "LTnewLTref_320014500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 304059 304898 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320014600.1"; gene_id "LTnewLTref_320014600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 304059 304898 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014600.1"; gene_id "LTnewLTref_320014600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 309407 310807 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320014700.1"; gene_id "LTnewLTref_320014700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 309407 310807 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014700.1"; gene_id "LTnewLTref_320014700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 311966 313501 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320014800.1"; gene_id "LTnewLTref_320014800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 311966 313501 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014800.1"; gene_id "LTnewLTref_320014800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 319201 321474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320014900.1"; gene_id "LTnewLTref_320014900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 319201 321474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320014900.1"; gene_id "LTnewLTref_320014900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 322375 324081 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015000.1"; gene_id "LTnewLTref_320015000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 322375 324081 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015000.1"; gene_id "LTnewLTref_320015000"; CM024318.1 Liftoff transcript 326039 326580 . + . transcript_id "LTnewLTref_320015100.1"; gene_id "LTnewLTref_320015100" CM024318.1 Liftoff CDS 326039 326580 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015100.1"; gene_id "LTnewLTref_320015100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 327015 328514 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015200.1"; gene_id "LTnewLTref_320015200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 327015 328514 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015200.1"; gene_id "LTnewLTref_320015200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 330448 330987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015300.1"; gene_id "LTnewLTref_320015300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 330448 330987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015300.1"; gene_id "LTnewLTref_320015300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 332254 333462 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015400.1"; gene_id "LTnewLTref_320015400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 332254 333462 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015400.1"; gene_id "LTnewLTref_320015400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 334954 335808 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015500.1"; gene_id "LTnewLTref_320015500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 334954 335808 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015500.1"; gene_id "LTnewLTref_320015500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 336392 337522 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015600.1"; gene_id "LTnewLTref_320015600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 336392 337522 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015600.1"; gene_id "LTnewLTref_320015600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 339660 342341 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015700.1"; gene_id "LTnewLTref_320015700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 339660 342341 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015700.1"; gene_id "LTnewLTref_320015700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 344367 344732 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320015800.1"; gene_id "LTnewLTref_320015800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 344367 344732 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320015800.1"; gene_id "LTnewLTref_320015800"; CM024318.1 . transcript 345303 345592 . + . transcript_id "LTnewLTref_320015900.1"; gene_id "LTnewLTref_320015900:pseudogene" CM024318.1 . exon 345303 345512 . + . transcript_id "LTnewLTref_320015900.1"; gene_id "LTnewLTref_320015900:pseudogene"; CM024318.1 . exon 345515 345592 . + . transcript_id "LTnewLTref_320015900.1"; gene_id "LTnewLTref_320015900:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 350090 352204 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016000.1"; gene_id "LTnewLTref_320016000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 350090 352204 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016000.1"; gene_id "LTnewLTref_320016000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 353243 356434 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016100.1"; gene_id "LTnewLTref_320016100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 353243 356434 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016100.1"; gene_id "LTnewLTref_320016100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 357450 360254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016200.1"; gene_id "LTnewLTref_320016200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 357450 360254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016200.1"; gene_id "LTnewLTref_320016200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 363764 364579 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016300.1"; gene_id "LTnewLTref_320016300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 363764 364579 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016300.1"; gene_id "LTnewLTref_320016300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 365601 371267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016400.1"; gene_id "LTnewLTref_320016400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 365601 371267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016400.1"; gene_id "LTnewLTref_320016400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 376693 378372 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016500.1"; gene_id "LTnewLTref_320016500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 376693 378372 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016500.1"; gene_id "LTnewLTref_320016500"; CM024318.1 . transcript 379464 379751 . + . transcript_id "LTnewLTref_320016600.1"; gene_id "LTnewLTref_320016600:pseudogene" CM024318.1 . exon 379464 379751 . + . transcript_id "LTnewLTref_320016600.1"; gene_id "LTnewLTref_320016600:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 390361 391590 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016700.1"; gene_id "LTnewLTref_320016700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 390361 391590 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016700.1"; gene_id "LTnewLTref_320016700"; CM024318.1 Liftoff transcript 392161 392448 . + . transcript_id "LTnewLTref_320016800.1"; gene_id "LTnewLTref_320016800" CM024318.1 Liftoff CDS 392161 392448 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016800.1"; gene_id "LTnewLTref_320016800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 394305 398840 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320016900.1"; gene_id "LTnewLTref_320016900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 394305 398840 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320016900.1"; gene_id "LTnewLTref_320016900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 399894 401510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017000.1"; gene_id "LTnewLTref_320017000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 399894 401510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017000.1"; gene_id "LTnewLTref_320017000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 403115 404386 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017100.1"; gene_id "LTnewLTref_320017100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 403115 404386 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017100.1"; gene_id "LTnewLTref_320017100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 406266 408701 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017200.1"; gene_id "LTnewLTref_320017200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 406266 408701 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017200.1"; gene_id "LTnewLTref_320017200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 409482 410147 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017300.1"; gene_id "LTnewLTref_320017300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 409482 410147 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017300.1"; gene_id "LTnewLTref_320017300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 410924 412666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017400.1"; gene_id "LTnewLTref_320017400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 410924 412666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017400.1"; gene_id "LTnewLTref_320017400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 414432 415046 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017500.1"; gene_id "LTnewLTref_320017500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 414432 415046 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017500.1"; gene_id "LTnewLTref_320017500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 416592 418397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017600.1"; gene_id "LTnewLTref_320017600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 416592 418397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017600.1"; gene_id "LTnewLTref_320017600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 420032 420277 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017700.1"; gene_id "LTnewLTref_320017700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 420032 420277 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017700.1"; gene_id "LTnewLTref_320017700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 421509 422075 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320017800.1"; gene_id "LTnewLTref_320017800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 421509 422075 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017800.1"; gene_id "LTnewLTref_320017800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 424180 429065 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_320017900.1"; gene_id "LTnewLTref_320017900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 424180 427899 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017900.1"; gene_id "LTnewLTref_320017900"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 427959 429065 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320017900.1"; gene_id "LTnewLTref_320017900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 430681 433794 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018000.1"; gene_id "LTnewLTref_320018000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 430681 433794 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018000.1"; gene_id "LTnewLTref_320018000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 435073 436170 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018100.1"; gene_id "LTnewLTref_320018100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 435073 436170 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018100.1"; gene_id "LTnewLTref_320018100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 437173 438186 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018200.1"; gene_id "LTnewLTref_320018200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 437173 438186 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018200.1"; gene_id "LTnewLTref_320018200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 439588 444409 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_320018300.1"; gene_id "LTnewLTref_320018300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 439588 441096 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018300.1"; gene_id "LTnewLTref_320018300"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 441176 444409 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018300.1"; gene_id "LTnewLTref_320018300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 445658 447928 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018400.1"; gene_id "LTnewLTref_320018400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 445658 447928 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018400.1"; gene_id "LTnewLTref_320018400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 449464 450381 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018500.1"; gene_id "LTnewLTref_320018500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 449464 450381 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018500.1"; gene_id "LTnewLTref_320018500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 455139 456284 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018600.1"; gene_id "LTnewLTref_320018600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 455139 456284 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018600.1"; gene_id "LTnewLTref_320018600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 458096 459181 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018700.1"; gene_id "LTnewLTref_320018700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 458096 459181 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018700.1"; gene_id "LTnewLTref_320018700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 459946 461928 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018800.1"; gene_id "LTnewLTref_320018800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 459946 461928 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018800.1"; gene_id "LTnewLTref_320018800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 463136 464836 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320018900.1"; gene_id "LTnewLTref_320018900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 463136 464836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320018900.1"; gene_id "LTnewLTref_320018900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 465570 466394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019000.1"; gene_id "LTnewLTref_320019000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 465570 466394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019000.1"; gene_id "LTnewLTref_320019000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 467424 469829 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019100.1"; gene_id "LTnewLTref_320019100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 467424 469829 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019100.1"; gene_id "LTnewLTref_320019100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 471005 473398 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019200.1"; gene_id "LTnewLTref_320019200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 471005 473398 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019200.1"; gene_id "LTnewLTref_320019200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 474628 475839 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019300.1"; gene_id "LTnewLTref_320019300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 474628 475839 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019300.1"; gene_id "LTnewLTref_320019300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 477042 479816 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019400.1"; gene_id "LTnewLTref_320019400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 477042 479816 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019400.1"; gene_id "LTnewLTref_320019400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 481087 481333 0.37 + . transcript_id "LTnewLTref_320019500.1"; gene_id "LTnewLTref_320019500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 481087 481281 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019500.1"; gene_id "LTnewLTref_320019500"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 481325 481333 0.38 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019500.1"; gene_id "LTnewLTref_320019500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 481087 482707 0.35 + . transcript_id "LTnewLTref_320019500.2"; gene_id "LTnewLTref_320019500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 481087 481313 0.37 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019500.2"; gene_id "LTnewLTref_320019500"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 481468 482707 0.36 + 1 transcript_id "LTnewLTref_320019500.2"; gene_id "LTnewLTref_320019500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 481457 482707 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019500.3"; gene_id "LTnewLTref_320019500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 481457 482707 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019500.3"; gene_id "LTnewLTref_320019500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 483716 485152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019600.1"; gene_id "LTnewLTref_320019600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 483716 485152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019600.1"; gene_id "LTnewLTref_320019600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 491077 493377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019700.1"; gene_id "LTnewLTref_320019700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 491077 493377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019700.1"; gene_id "LTnewLTref_320019700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 498047 498646 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019800.1"; gene_id "LTnewLTref_320019800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 498047 498646 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019800.1"; gene_id "LTnewLTref_320019800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 499233 499517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320019900.1"; gene_id "LTnewLTref_320019900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 499233 499517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320019900.1"; gene_id "LTnewLTref_320019900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 501913 503610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020000.1"; gene_id "LTnewLTref_320020000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 501913 503610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020000.1"; gene_id "LTnewLTref_320020000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 506301 507116 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020100.1"; gene_id "LTnewLTref_320020100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 506301 507116 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020100.1"; gene_id "LTnewLTref_320020100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 507917 509155 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020200.1"; gene_id "LTnewLTref_320020200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 507917 509155 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020200.1"; gene_id "LTnewLTref_320020200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 509839 511470 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020300.1"; gene_id "LTnewLTref_320020300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 509839 511470 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020300.1"; gene_id "LTnewLTref_320020300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 512721 514613 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020400.1"; gene_id "LTnewLTref_320020400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 512721 514613 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020400.1"; gene_id "LTnewLTref_320020400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 516158 520786 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020500.1"; gene_id "LTnewLTref_320020500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 516158 520786 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020500.1"; gene_id "LTnewLTref_320020500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 521563 523041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020600.1"; gene_id "LTnewLTref_320020600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 521563 523041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020600.1"; gene_id "LTnewLTref_320020600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 525845 529153 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020700.1"; gene_id "LTnewLTref_320020700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 525845 529153 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020700.1"; gene_id "LTnewLTref_320020700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 532746 535118 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320020800.1"; gene_id "LTnewLTref_320020800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 532746 535118 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320020800.1"; gene_id "LTnewLTref_320020800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 539304 540362 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320020900.1"; gene_id "LTnewLTref_320020900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 539304 539729 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320020900.1"; gene_id "LTnewLTref_320020900"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 539820 540362 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320020900.1"; gene_id "LTnewLTref_320020900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 542126 544378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021000.1"; gene_id "LTnewLTref_320021000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 542126 544378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021000.1"; gene_id "LTnewLTref_320021000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 545917 550986 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021100.1"; gene_id "LTnewLTref_320021100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 545917 550986 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021100.1"; gene_id "LTnewLTref_320021100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 551719 552951 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021200.1"; gene_id "LTnewLTref_320021200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 551719 552951 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021200.1"; gene_id "LTnewLTref_320021200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 553626 555698 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021300.1"; gene_id "LTnewLTref_320021300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 553626 555698 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021300.1"; gene_id "LTnewLTref_320021300"; CM024318.1 Liftoff transcript 557626 561414 . - . transcript_id "LTnewLTref_320021400.1"; gene_id "LTnewLTref_320021400" CM024318.1 Liftoff CDS 557626 561414 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021400.1"; gene_id "LTnewLTref_320021400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 562843 563286 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021500.1"; gene_id "LTnewLTref_320021500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 562843 563286 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021500.1"; gene_id "LTnewLTref_320021500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 564093 564578 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021600.1"; gene_id "LTnewLTref_320021600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 564093 564578 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021600.1"; gene_id "LTnewLTref_320021600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 565436 575071 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021700.1"; gene_id "LTnewLTref_320021700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 565436 575071 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021700.1"; gene_id "LTnewLTref_320021700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 577022 577861 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021800.1"; gene_id "LTnewLTref_320021800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 577022 577861 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021800.1"; gene_id "LTnewLTref_320021800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 579048 581021 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320021900.1"; gene_id "LTnewLTref_320021900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 579048 581021 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320021900.1"; gene_id "LTnewLTref_320021900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 584812 585384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022000.1"; gene_id "LTnewLTref_320022000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 584812 585384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022000.1"; gene_id "LTnewLTref_320022000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 586173 587300 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022100.1"; gene_id "LTnewLTref_320022100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 586173 587300 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022100.1"; gene_id "LTnewLTref_320022100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 588929 591061 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022200.1"; gene_id "LTnewLTref_320022200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 588929 591061 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022200.1"; gene_id "LTnewLTref_320022200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 594081 594860 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022300.1"; gene_id "LTnewLTref_320022300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 594081 594860 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022300.1"; gene_id "LTnewLTref_320022300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 595750 598395 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022400.1"; gene_id "LTnewLTref_320022400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 595750 598395 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022400.1"; gene_id "LTnewLTref_320022400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 599786 601336 0.76 - . transcript_id "LTnewLTref_320022500.1"; gene_id "LTnewLTref_320022500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 599786 601336 0.76 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022500.1"; gene_id "LTnewLTref_320022500"; CM024318.1 . transcript 602236 602883 . - . transcript_id "LTnewLTref_320022600.1"; gene_id "LTnewLTref_320022600:pseudogene" CM024318.1 . exon 602236 602883 . - . transcript_id "LTnewLTref_320022600.1"; gene_id "LTnewLTref_320022600:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 604261 604995 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022700.1"; gene_id "LTnewLTref_320022700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 604261 604995 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022700.1"; gene_id "LTnewLTref_320022700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 609050 610387 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022800.1"; gene_id "LTnewLTref_320022800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 609050 610387 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022800.1"; gene_id "LTnewLTref_320022800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 611372 614128 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320022900.1"; gene_id "LTnewLTref_320022900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 611372 614128 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320022900.1"; gene_id "LTnewLTref_320022900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 615117 617312 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023000.1"; gene_id "LTnewLTref_320023000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 615117 617312 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023000.1"; gene_id "LTnewLTref_320023000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 620079 621344 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023100.1"; gene_id "LTnewLTref_320023100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 620079 621344 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023100.1"; gene_id "LTnewLTref_320023100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 622519 625332 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023200.1"; gene_id "LTnewLTref_320023200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 622519 625332 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023200.1"; gene_id "LTnewLTref_320023200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 626310 628316 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023300.1"; gene_id "LTnewLTref_320023300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 626310 628316 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023300.1"; gene_id "LTnewLTref_320023300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 632300 633175 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023400.1"; gene_id "LTnewLTref_320023400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 632300 633175 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023400.1"; gene_id "LTnewLTref_320023400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 634593 636896 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023500.1"; gene_id "LTnewLTref_320023500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 634593 636896 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023500.1"; gene_id "LTnewLTref_320023500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 638808 639560 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023600.1"; gene_id "LTnewLTref_320023600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 638808 639560 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023600.1"; gene_id "LTnewLTref_320023600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 640575 641243 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023700.1"; gene_id "LTnewLTref_320023700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 640575 641243 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023700.1"; gene_id "LTnewLTref_320023700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 643196 645958 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023800.1"; gene_id "LTnewLTref_320023800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 643196 645958 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023800.1"; gene_id "LTnewLTref_320023800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 647837 651367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320023900.1"; gene_id "LTnewLTref_320023900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 647837 651367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320023900.1"; gene_id "LTnewLTref_320023900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 652317 653198 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024000.1"; gene_id "LTnewLTref_320024000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 652317 653198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024000.1"; gene_id "LTnewLTref_320024000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 654792 655202 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024100.1"; gene_id "LTnewLTref_320024100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 654792 655202 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024100.1"; gene_id "LTnewLTref_320024100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 658436 660127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024200.1"; gene_id "LTnewLTref_320024200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 658436 660127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024200.1"; gene_id "LTnewLTref_320024200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 662981 665503 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024300.1"; gene_id "LTnewLTref_320024300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 662981 665503 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024300.1"; gene_id "LTnewLTref_320024300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 666833 668848 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024400.1"; gene_id "LTnewLTref_320024400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 666833 668848 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024400.1"; gene_id "LTnewLTref_320024400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 670362 672542 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024500.1"; gene_id "LTnewLTref_320024500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 670362 672542 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024500.1"; gene_id "LTnewLTref_320024500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 673930 674901 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024600.1"; gene_id "LTnewLTref_320024600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 673930 674901 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024600.1"; gene_id "LTnewLTref_320024600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 678578 678967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024700.1"; gene_id "LTnewLTref_320024700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 678578 678967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024700.1"; gene_id "LTnewLTref_320024700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 680767 683100 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024800.1"; gene_id "LTnewLTref_320024800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 680767 683100 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024800.1"; gene_id "LTnewLTref_320024800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 684972 686669 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320024900.1"; gene_id "LTnewLTref_320024900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 684972 686669 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320024900.1"; gene_id "LTnewLTref_320024900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 687775 689316 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025000.1"; gene_id "LTnewLTref_320025000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 687775 689316 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025000.1"; gene_id "LTnewLTref_320025000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 690116 690655 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025100.1"; gene_id "LTnewLTref_320025100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 690116 690655 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025100.1"; gene_id "LTnewLTref_320025100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 691450 693312 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025200.1"; gene_id "LTnewLTref_320025200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 691450 693312 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025200.1"; gene_id "LTnewLTref_320025200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 694480 695214 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025300.1"; gene_id "LTnewLTref_320025300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 694480 695214 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025300.1"; gene_id "LTnewLTref_320025300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 696055 696516 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025400.1"; gene_id "LTnewLTref_320025400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 696055 696516 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025400.1"; gene_id "LTnewLTref_320025400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 700981 702948 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025500.1"; gene_id "LTnewLTref_320025500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 700981 702948 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025500.1"; gene_id "LTnewLTref_320025500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 709109 709696 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025600.1"; gene_id "LTnewLTref_320025600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 709109 709696 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025600.1"; gene_id "LTnewLTref_320025600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 711599 712225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025700.1"; gene_id "LTnewLTref_320025700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 711599 712225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025700.1"; gene_id "LTnewLTref_320025700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 714558 715232 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025800.1"; gene_id "LTnewLTref_320025800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 714558 715232 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025800.1"; gene_id "LTnewLTref_320025800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 716313 718097 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320025900.1"; gene_id "LTnewLTref_320025900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 716313 718097 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320025900.1"; gene_id "LTnewLTref_320025900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 718871 720115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026000.1"; gene_id "LTnewLTref_320026000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 718871 720115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026000.1"; gene_id "LTnewLTref_320026000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 722106 723983 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026100.1"; gene_id "LTnewLTref_320026100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 722106 723983 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026100.1"; gene_id "LTnewLTref_320026100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 726269 726745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026200.1"; gene_id "LTnewLTref_320026200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 726269 726745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026200.1"; gene_id "LTnewLTref_320026200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 730077 732341 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026300.1"; gene_id "LTnewLTref_320026300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 730077 732341 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026300.1"; gene_id "LTnewLTref_320026300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 735275 739507 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026400.1"; gene_id "LTnewLTref_320026400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 735275 739507 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026400.1"; gene_id "LTnewLTref_320026400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 740611 742428 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026500.1"; gene_id "LTnewLTref_320026500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 740611 742428 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026500.1"; gene_id "LTnewLTref_320026500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 744188 746161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026600.1"; gene_id "LTnewLTref_320026600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 744188 744313 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026600.1"; gene_id "LTnewLTref_320026600"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 744965 746161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026600.1"; gene_id "LTnewLTref_320026600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 748826 750454 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026700.1"; gene_id "LTnewLTref_320026700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 748826 750454 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026700.1"; gene_id "LTnewLTref_320026700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 754419 756767 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026800.1"; gene_id "LTnewLTref_320026800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 754419 756767 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026800.1"; gene_id "LTnewLTref_320026800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 758169 759140 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320026900.1"; gene_id "LTnewLTref_320026900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 758169 759140 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320026900.1"; gene_id "LTnewLTref_320026900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 762322 763605 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_320027000.1"; gene_id "LTnewLTref_320027000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 762322 763339 0.86 - 1 transcript_id "LTnewLTref_320027000.1"; gene_id "LTnewLTref_320027000"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 763397 763605 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027000.1"; gene_id "LTnewLTref_320027000"; CM024318.1 . transcript 766061 766942 . - . transcript_id "LTnewLTref_320027100.1"; gene_id "LTnewLTref_320027100:pseudogene" CM024318.1 . exon 766061 766942 . - . transcript_id "LTnewLTref_320027100.1"; gene_id "LTnewLTref_320027100:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 768534 769964 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027200.1"; gene_id "LTnewLTref_320027200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 768534 769964 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027200.1"; gene_id "LTnewLTref_320027200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 774588 775481 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027300.1"; gene_id "LTnewLTref_320027300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 774588 775481 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027300.1"; gene_id "LTnewLTref_320027300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 776271 776717 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027400.1"; gene_id "LTnewLTref_320027400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 776271 776717 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027400.1"; gene_id "LTnewLTref_320027400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 777960 780155 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027500.1"; gene_id "LTnewLTref_320027500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 777960 780155 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027500.1"; gene_id "LTnewLTref_320027500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 781874 782194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027600.1"; gene_id "LTnewLTref_320027600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 781874 782194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027600.1"; gene_id "LTnewLTref_320027600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 783471 784580 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027700.1"; gene_id "LTnewLTref_320027700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 783471 784580 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027700.1"; gene_id "LTnewLTref_320027700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 785698 786585 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027800.1"; gene_id "LTnewLTref_320027800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 785698 786585 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027800.1"; gene_id "LTnewLTref_320027800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 788171 788836 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320027900.1"; gene_id "LTnewLTref_320027900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 788171 788836 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320027900.1"; gene_id "LTnewLTref_320027900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 791568 792203 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028000.1"; gene_id "LTnewLTref_320028000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 791568 792203 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028000.1"; gene_id "LTnewLTref_320028000"; CM024318.1 . transcript 793780 796386 . - . transcript_id "LTnewLTref_320028100.1"; gene_id "LTnewLTref_320028100:pseudogene" CM024318.1 . exon 793780 796386 . - . transcript_id "LTnewLTref_320028100.1"; gene_id "LTnewLTref_320028100:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 798012 798287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028200.1"; gene_id "LTnewLTref_320028200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 798012 798287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028200.1"; gene_id "LTnewLTref_320028200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 798973 801168 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028300.1"; gene_id "LTnewLTref_320028300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 798973 801168 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028300.1"; gene_id "LTnewLTref_320028300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 804583 805587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028400.1"; gene_id "LTnewLTref_320028400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 804583 805587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028400.1"; gene_id "LTnewLTref_320028400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 807249 808877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028500.1"; gene_id "LTnewLTref_320028500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 807249 808877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028500.1"; gene_id "LTnewLTref_320028500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 809503 810516 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028600.1"; gene_id "LTnewLTref_320028600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 809503 810516 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028600.1"; gene_id "LTnewLTref_320028600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 811746 814634 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028700.1"; gene_id "LTnewLTref_320028700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 811746 814634 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028700.1"; gene_id "LTnewLTref_320028700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 819528 822134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028800.1"; gene_id "LTnewLTref_320028800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 819528 822134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028800.1"; gene_id "LTnewLTref_320028800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 823585 825651 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320028900.1"; gene_id "LTnewLTref_320028900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 823585 825651 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320028900.1"; gene_id "LTnewLTref_320028900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 826936 828150 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029000.1"; gene_id "LTnewLTref_320029000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 826936 828150 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029000.1"; gene_id "LTnewLTref_320029000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 829029 829430 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029100.1"; gene_id "LTnewLTref_320029100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 829029 829430 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029100.1"; gene_id "LTnewLTref_320029100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 831078 834326 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029200.1"; gene_id "LTnewLTref_320029200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 831078 834326 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029200.1"; gene_id "LTnewLTref_320029200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 835508 838612 0.68 - . transcript_id "LTnewLTref_320029300.1"; gene_id "LTnewLTref_320029300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 835508 838612 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029300.1"; gene_id "LTnewLTref_320029300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 839083 839460 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029400.1"; gene_id "LTnewLTref_320029400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 839083 839460 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029400.1"; gene_id "LTnewLTref_320029400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 840016 843933 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029500.1"; gene_id "LTnewLTref_320029500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 840016 843933 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029500.1"; gene_id "LTnewLTref_320029500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 844921 846756 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029600.1"; gene_id "LTnewLTref_320029600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 844921 846756 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029600.1"; gene_id "LTnewLTref_320029600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 848263 848964 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029700.1"; gene_id "LTnewLTref_320029700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 848263 848964 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029700.1"; gene_id "LTnewLTref_320029700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 850309 852213 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029800.1"; gene_id "LTnewLTref_320029800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 850309 852213 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029800.1"; gene_id "LTnewLTref_320029800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 853344 856391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320029900.1"; gene_id "LTnewLTref_320029900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 853344 856391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320029900.1"; gene_id "LTnewLTref_320029900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 857108 857728 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030000.1"; gene_id "LTnewLTref_320030000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 857108 857728 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030000.1"; gene_id "LTnewLTref_320030000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 859216 864403 0.62 - . transcript_id "LTnewLTref_320030100.1"; gene_id "LTnewLTref_320030100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 859216 861945 0.62 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030100.1"; gene_id "LTnewLTref_320030100"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 861995 864403 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030100.1"; gene_id "LTnewLTref_320030100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 865704 868025 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030200.1"; gene_id "LTnewLTref_320030200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 865704 868025 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030200.1"; gene_id "LTnewLTref_320030200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 868946 872353 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_320030300.1"; gene_id "LTnewLTref_320030300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 868946 872353 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030300.1"; gene_id "LTnewLTref_320030300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 878941 880059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030400.1"; gene_id "LTnewLTref_320030400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 878941 880059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030400.1"; gene_id "LTnewLTref_320030400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 888295 888858 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030500.1"; gene_id "LTnewLTref_320030500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 888295 888858 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030500.1"; gene_id "LTnewLTref_320030500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 890093 895234 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030600.1"; gene_id "LTnewLTref_320030600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 890093 895234 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030600.1"; gene_id "LTnewLTref_320030600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 896949 897803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030700.1"; gene_id "LTnewLTref_320030700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 896949 897803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030700.1"; gene_id "LTnewLTref_320030700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 900478 902391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030800.1"; gene_id "LTnewLTref_320030800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 900478 902391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030800.1"; gene_id "LTnewLTref_320030800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 904409 905722 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320030900.1"; gene_id "LTnewLTref_320030900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 904409 905722 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320030900.1"; gene_id "LTnewLTref_320030900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 906674 910363 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031000.1"; gene_id "LTnewLTref_320031000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 906674 910363 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031000.1"; gene_id "LTnewLTref_320031000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 911706 913019 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031100.1"; gene_id "LTnewLTref_320031100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 911706 913019 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031100.1"; gene_id "LTnewLTref_320031100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 914162 914674 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031200.1"; gene_id "LTnewLTref_320031200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 914162 914674 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031200.1"; gene_id "LTnewLTref_320031200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 918028 919044 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031300.1"; gene_id "LTnewLTref_320031300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 918028 919044 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031300.1"; gene_id "LTnewLTref_320031300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 920172 922106 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031400.1"; gene_id "LTnewLTref_320031400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 920172 922106 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031400.1"; gene_id "LTnewLTref_320031400"; CM024318.1 Liftoff transcript 922916 925483 . - . transcript_id "LTnewLTref_320031500.1"; gene_id "LTnewLTref_320031500" CM024318.1 Liftoff CDS 922916 925483 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031500.1"; gene_id "LTnewLTref_320031500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 927328 928164 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031600.1"; gene_id "LTnewLTref_320031600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 927328 928164 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031600.1"; gene_id "LTnewLTref_320031600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 929246 931036 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031700.1"; gene_id "LTnewLTref_320031700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 929246 931036 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031700.1"; gene_id "LTnewLTref_320031700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 932115 933686 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031800.1"; gene_id "LTnewLTref_320031800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 932115 933686 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031800.1"; gene_id "LTnewLTref_320031800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 935404 936471 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320031900.1"; gene_id "LTnewLTref_320031900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 935404 936471 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320031900.1"; gene_id "LTnewLTref_320031900"; CM024318.1 . transcript 937095 938153 . - . transcript_id "LTnewLTref_320032000.1"; gene_id "LTnewLTref_320032000:pseudogene" CM024318.1 . exon 937095 938153 . - . transcript_id "LTnewLTref_320032000.1"; gene_id "LTnewLTref_320032000:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 938726 939340 0.78 - . transcript_id "LTnewLTref_320032100.1"; gene_id "LTnewLTref_320032100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 938726 939191 0.8 - 1 transcript_id "LTnewLTref_320032100.1"; gene_id "LTnewLTref_320032100"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 939252 939340 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032100.1"; gene_id "LTnewLTref_320032100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 941449 948630 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032200.1"; gene_id "LTnewLTref_320032200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 941449 948630 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032200.1"; gene_id "LTnewLTref_320032200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 949998 953048 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032300.1"; gene_id "LTnewLTref_320032300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 949998 953048 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032300.1"; gene_id "LTnewLTref_320032300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 953601 954845 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032400.1"; gene_id "LTnewLTref_320032400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 953601 954845 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032400.1"; gene_id "LTnewLTref_320032400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 955783 957225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032500.1"; gene_id "LTnewLTref_320032500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 955783 957225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032500.1"; gene_id "LTnewLTref_320032500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 958573 959643 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032600.1"; gene_id "LTnewLTref_320032600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 958573 959643 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032600.1"; gene_id "LTnewLTref_320032600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 960685 963618 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032700.1"; gene_id "LTnewLTref_320032700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 960685 963618 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032700.1"; gene_id "LTnewLTref_320032700"; CM024318.1 . transcript 965381 965605 . - . transcript_id "LTnewLTref_320032800.1"; gene_id "LTnewLTref_320032800:pseudogene" CM024318.1 . exon 965381 965605 . - . transcript_id "LTnewLTref_320032800.1"; gene_id "LTnewLTref_320032800:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 970611 971015 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320032900.1"; gene_id "LTnewLTref_320032900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 970611 971015 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320032900.1"; gene_id "LTnewLTref_320032900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 971701 975573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033000.1"; gene_id "LTnewLTref_320033000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 971701 975573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033000.1"; gene_id "LTnewLTref_320033000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 976845 977333 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033100.1"; gene_id "LTnewLTref_320033100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 976845 977333 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033100.1"; gene_id "LTnewLTref_320033100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 978319 979125 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033200.1"; gene_id "LTnewLTref_320033200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 978319 979125 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033200.1"; gene_id "LTnewLTref_320033200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 980092 982089 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033300.1"; gene_id "LTnewLTref_320033300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 980092 982089 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033300.1"; gene_id "LTnewLTref_320033300"; CM024318.1 . transcript 983278 986052 . - . transcript_id "LTnewLTref_320033400.1"; gene_id "LTnewLTref_320033400:pseudogene" CM024318.1 . exon 983278 986052 . - . transcript_id "LTnewLTref_320033400.1"; gene_id "LTnewLTref_320033400:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 989472 992348 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033500.1"; gene_id "LTnewLTref_320033500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 989472 992348 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033500.1"; gene_id "LTnewLTref_320033500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 993573 995594 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033600.1"; gene_id "LTnewLTref_320033600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 993573 995594 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033600.1"; gene_id "LTnewLTref_320033600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 996779 1001617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033700.1"; gene_id "LTnewLTref_320033700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 996779 1001617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033700.1"; gene_id "LTnewLTref_320033700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1002801 1004057 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033800.1"; gene_id "LTnewLTref_320033800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1002801 1004057 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033800.1"; gene_id "LTnewLTref_320033800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1004699 1007518 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320033900.1"; gene_id "LTnewLTref_320033900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1004699 1007518 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320033900.1"; gene_id "LTnewLTref_320033900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1008598 1009704 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034000.1"; gene_id "LTnewLTref_320034000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1008598 1009704 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034000.1"; gene_id "LTnewLTref_320034000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1009206 1009704 0.86 - . transcript_id "LTnewLTref_320034000.2"; gene_id "LTnewLTref_320034000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1009206 1009215 0.99 - 1 transcript_id "LTnewLTref_320034000.2"; gene_id "LTnewLTref_320034000"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1009307 1009704 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034000.2"; gene_id "LTnewLTref_320034000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1011105 1011503 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034100.1"; gene_id "LTnewLTref_320034100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1011105 1011503 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034100.1"; gene_id "LTnewLTref_320034100"; CM024318.1 . transcript 1012058 1012303 . - . transcript_id "LTnewLTref_320034200.1"; gene_id "LTnewLTref_320034200:pseudogene" CM024318.1 . exon 1012058 1012303 . - . transcript_id "LTnewLTref_320034200.1"; gene_id "LTnewLTref_320034200:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1012679 1014589 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034300.1"; gene_id "LTnewLTref_320034300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1012679 1014589 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034300.1"; gene_id "LTnewLTref_320034300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1017692 1020706 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034400.1"; gene_id "LTnewLTref_320034400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1017692 1020706 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034400.1"; gene_id "LTnewLTref_320034400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1022554 1023462 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034500.1"; gene_id "LTnewLTref_320034500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1022554 1023462 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034500.1"; gene_id "LTnewLTref_320034500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1025150 1026091 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034600.1"; gene_id "LTnewLTref_320034600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1025150 1026091 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034600.1"; gene_id "LTnewLTref_320034600"; CM024318.1 Liftoff transcript 1028843 1029133 . - . transcript_id "LTnewLTref_320034700.1"; gene_id "LTnewLTref_320034700" CM024318.1 Liftoff CDS 1028843 1029133 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034700.1"; gene_id "LTnewLTref_320034700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1033081 1034280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034800.1"; gene_id "LTnewLTref_320034800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1033081 1034280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034800.1"; gene_id "LTnewLTref_320034800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1036621 1042758 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320034900.1"; gene_id "LTnewLTref_320034900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1036621 1042758 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320034900.1"; gene_id "LTnewLTref_320034900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1043361 1044116 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035000.1"; gene_id "LTnewLTref_320035000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1043361 1044116 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035000.1"; gene_id "LTnewLTref_320035000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1047809 1049269 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035100.1"; gene_id "LTnewLTref_320035100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1047809 1049269 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035100.1"; gene_id "LTnewLTref_320035100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1050473 1052992 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035200.1"; gene_id "LTnewLTref_320035200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1050473 1052992 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035200.1"; gene_id "LTnewLTref_320035200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1055509 1056663 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035300.1"; gene_id "LTnewLTref_320035300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1055509 1056663 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035300.1"; gene_id "LTnewLTref_320035300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1058091 1058495 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035400.1"; gene_id "LTnewLTref_320035400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1058091 1058495 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035400.1"; gene_id "LTnewLTref_320035400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1059417 1062803 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035500.1"; gene_id "LTnewLTref_320035500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1059417 1062803 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035500.1"; gene_id "LTnewLTref_320035500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1064409 1064813 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035600.1"; gene_id "LTnewLTref_320035600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1064409 1064813 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035600.1"; gene_id "LTnewLTref_320035600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1065770 1066219 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035700.1"; gene_id "LTnewLTref_320035700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1065770 1066219 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035700.1"; gene_id "LTnewLTref_320035700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1067025 1070144 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320035800.1"; gene_id "LTnewLTref_320035800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1067025 1070144 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320035800.1"; gene_id "LTnewLTref_320035800"; CM024318.1 . transcript 1071228 1071920 . - . transcript_id "LTnewLTref_320035900.1"; gene_id "LTnewLTref_320035900:pseudogene" CM024318.1 . exon 1071228 1071920 . - . transcript_id "LTnewLTref_320035900.1"; gene_id "LTnewLTref_320035900:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1073161 1077732 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036000.1"; gene_id "LTnewLTref_320036000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1073161 1077732 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036000.1"; gene_id "LTnewLTref_320036000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1078874 1081519 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036100.1"; gene_id "LTnewLTref_320036100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1078874 1081519 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036100.1"; gene_id "LTnewLTref_320036100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1083550 1083831 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036200.1"; gene_id "LTnewLTref_320036200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1083550 1083831 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036200.1"; gene_id "LTnewLTref_320036200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1085748 1088621 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036300.1"; gene_id "LTnewLTref_320036300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1085748 1088621 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036300.1"; gene_id "LTnewLTref_320036300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1090618 1093899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036400.1"; gene_id "LTnewLTref_320036400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1090618 1093899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036400.1"; gene_id "LTnewLTref_320036400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1094590 1095804 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036500.1"; gene_id "LTnewLTref_320036500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1094590 1095804 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036500.1"; gene_id "LTnewLTref_320036500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1097372 1101457 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036600.1"; gene_id "LTnewLTref_320036600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1097372 1101457 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036600.1"; gene_id "LTnewLTref_320036600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1103142 1104488 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036700.1"; gene_id "LTnewLTref_320036700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1103142 1104488 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036700.1"; gene_id "LTnewLTref_320036700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1106020 1107246 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036800.1"; gene_id "LTnewLTref_320036800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1106020 1107246 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036800.1"; gene_id "LTnewLTref_320036800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1108893 1112333 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320036900.1"; gene_id "LTnewLTref_320036900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1108893 1112333 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320036900.1"; gene_id "LTnewLTref_320036900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1113244 1114956 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037000.1"; gene_id "LTnewLTref_320037000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1113244 1114956 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037000.1"; gene_id "LTnewLTref_320037000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1116204 1118117 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037100.1"; gene_id "LTnewLTref_320037100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1116204 1118117 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037100.1"; gene_id "LTnewLTref_320037100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1119810 1122062 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037200.1"; gene_id "LTnewLTref_320037200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1119810 1122062 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037200.1"; gene_id "LTnewLTref_320037200"; CM024318.1 . transcript 1125411 1126907 . - . transcript_id "LTnewLTref_320037300.1"; gene_id "LTnewLTref_320037300:pseudogene" CM024318.1 . exon 1125411 1126907 . - . transcript_id "LTnewLTref_320037300.1"; gene_id "LTnewLTref_320037300:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1128706 1130139 0.63 - . transcript_id "LTnewLTref_320037400.1"; gene_id "LTnewLTref_320037400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1128706 1130139 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037400.1"; gene_id "LTnewLTref_320037400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1128706 1131021 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037400.2"; gene_id "LTnewLTref_320037400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1128706 1131021 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037400.2"; gene_id "LTnewLTref_320037400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1135352 1136686 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037500.1"; gene_id "LTnewLTref_320037500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1135352 1136686 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037500.1"; gene_id "LTnewLTref_320037500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1137565 1138440 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037600.1"; gene_id "LTnewLTref_320037600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1137565 1138440 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037600.1"; gene_id "LTnewLTref_320037600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1140761 1142617 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037700.1"; gene_id "LTnewLTref_320037700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1140761 1142617 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037700.1"; gene_id "LTnewLTref_320037700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1145113 1149138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037800.1"; gene_id "LTnewLTref_320037800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1145113 1149138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037800.1"; gene_id "LTnewLTref_320037800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1150640 1152823 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320037900.1"; gene_id "LTnewLTref_320037900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1150640 1152823 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320037900.1"; gene_id "LTnewLTref_320037900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1153422 1155338 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038000.1"; gene_id "LTnewLTref_320038000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1153422 1155338 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038000.1"; gene_id "LTnewLTref_320038000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1156647 1158461 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038100.1"; gene_id "LTnewLTref_320038100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1156647 1158461 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038100.1"; gene_id "LTnewLTref_320038100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1159411 1159866 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038200.1"; gene_id "LTnewLTref_320038200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1159411 1159866 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038200.1"; gene_id "LTnewLTref_320038200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1160456 1160911 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038300.1"; gene_id "LTnewLTref_320038300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1160456 1160911 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038300.1"; gene_id "LTnewLTref_320038300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1161290 1163467 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038400.1"; gene_id "LTnewLTref_320038400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1161290 1163467 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038400.1"; gene_id "LTnewLTref_320038400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1163874 1164251 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038500.1"; gene_id "LTnewLTref_320038500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1163874 1164251 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038500.1"; gene_id "LTnewLTref_320038500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1164541 1165110 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038600.1"; gene_id "LTnewLTref_320038600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1164541 1165110 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038600.1"; gene_id "LTnewLTref_320038600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1165397 1165993 1 - . transcript_id "LTnewLTref_320038700.1"; gene_id "LTnewLTref_320038700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1165397 1165993 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_320038700.1"; gene_id "LTnewLTref_320038700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1173209 1175488 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320038800.1"; gene_id "LTnewLTref_320038800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1173209 1175488 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320038800.1"; gene_id "LTnewLTref_320038800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1175861 1176394 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_320038900.1"; gene_id "LTnewLTref_320038900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1175861 1176394 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320038900.1"; gene_id "LTnewLTref_320038900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1176809 1177024 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_320039000.1"; gene_id "LTnewLTref_320039000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1176809 1177024 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039000.1"; gene_id "LTnewLTref_320039000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1177393 1177716 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039100.1"; gene_id "LTnewLTref_320039100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1177393 1177716 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039100.1"; gene_id "LTnewLTref_320039100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1178479 1178931 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039200.1"; gene_id "LTnewLTref_320039200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1178479 1178931 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039200.1"; gene_id "LTnewLTref_320039200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1179093 1179613 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_320039300.1"; gene_id "LTnewLTref_320039300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1179093 1179434 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039300.1"; gene_id "LTnewLTref_320039300"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1179557 1179613 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039300.1"; gene_id "LTnewLTref_320039300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1180380 1181591 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039400.1"; gene_id "LTnewLTref_320039400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1180380 1181591 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039400.1"; gene_id "LTnewLTref_320039400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1182340 1184967 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039500.1"; gene_id "LTnewLTref_320039500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1182340 1184967 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039500.1"; gene_id "LTnewLTref_320039500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1187482 1189809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039600.1"; gene_id "LTnewLTref_320039600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1187482 1189809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039600.1"; gene_id "LTnewLTref_320039600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1190496 1191485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039700.1"; gene_id "LTnewLTref_320039700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1190496 1191485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039700.1"; gene_id "LTnewLTref_320039700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1194221 1195147 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039800.1"; gene_id "LTnewLTref_320039800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1194221 1195147 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039800.1"; gene_id "LTnewLTref_320039800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1197628 1200717 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320039900.1"; gene_id "LTnewLTref_320039900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1197628 1200717 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320039900.1"; gene_id "LTnewLTref_320039900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1202320 1205619 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040000.1"; gene_id "LTnewLTref_320040000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1202320 1205619 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040000.1"; gene_id "LTnewLTref_320040000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1206782 1207135 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040100.1"; gene_id "LTnewLTref_320040100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1206782 1207135 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040100.1"; gene_id "LTnewLTref_320040100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1208374 1210326 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040200.1"; gene_id "LTnewLTref_320040200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1208374 1210326 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040200.1"; gene_id "LTnewLTref_320040200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1211513 1214188 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040300.1"; gene_id "LTnewLTref_320040300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1211513 1214188 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040300.1"; gene_id "LTnewLTref_320040300"; CM024318.1 Liftoff transcript 1216642 1221420 . + . transcript_id "LTnewLTref_320040400.1"; gene_id "LTnewLTref_320040400" CM024318.1 Liftoff CDS 1216642 1221420 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040400.1"; gene_id "LTnewLTref_320040400"; CM024318.1 . transcript 1222100 1223802 . + . transcript_id "LTnewLTref_320040500.1"; gene_id "LTnewLTref_320040500:pseudogene" CM024318.1 . exon 1222100 1223802 . + . transcript_id "LTnewLTref_320040500.1"; gene_id "LTnewLTref_320040500:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1224707 1227586 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040600.1"; gene_id "LTnewLTref_320040600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1224707 1227586 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040600.1"; gene_id "LTnewLTref_320040600"; CM024318.1 . transcript 1228869 1229268 . + . transcript_id "LTnewLTref_320040700.1"; gene_id "LTnewLTref_320040700:pseudogene" CM024318.1 . exon 1228869 1229268 . + . transcript_id "LTnewLTref_320040700.1"; gene_id "LTnewLTref_320040700:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1229325 1229663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040800.1"; gene_id "LTnewLTref_320040800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1229325 1229663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040800.1"; gene_id "LTnewLTref_320040800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1230224 1231483 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320040900.1"; gene_id "LTnewLTref_320040900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1230224 1231483 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320040900.1"; gene_id "LTnewLTref_320040900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1233104 1234543 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320041000.1"; gene_id "LTnewLTref_320041000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1233104 1234543 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041000.1"; gene_id "LTnewLTref_320041000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1235874 1242952 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320041100.1"; gene_id "LTnewLTref_320041100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1235874 1239388 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041100.1"; gene_id "LTnewLTref_320041100"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1239604 1242952 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_320041100.1"; gene_id "LTnewLTref_320041100"; CM024318.1 . transcript 1244843 1247308 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041200.1"; gene_id "LTnewLTref_320041200:pseudogene" CM024318.1 . exon 1244843 1247308 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041200.1"; gene_id "LTnewLTref_320041200:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1248735 1249232 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320041300.1"; gene_id "LTnewLTref_320041300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1248735 1249232 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041300.1"; gene_id "LTnewLTref_320041300"; CM024318.1 . transcript 1250431 1252458 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041400.1"; gene_id "LTnewLTref_320041400:pseudogene" CM024318.1 . exon 1250431 1252458 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041400.1"; gene_id "LTnewLTref_320041400:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1253354 1255961 0.89 + . transcript_id "LTnewLTref_320041500.1"; gene_id "LTnewLTref_320041500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1253354 1255900 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041500.1"; gene_id "LTnewLTref_320041500"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1255953 1255961 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041500.1"; gene_id "LTnewLTref_320041500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1253354 1256469 0.31 + . transcript_id "LTnewLTref_320041500.2"; gene_id "LTnewLTref_320041500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1253354 1256260 0.39 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041500.2"; gene_id "LTnewLTref_320041500"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1256359 1256469 0.37 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041500.2"; gene_id "LTnewLTref_320041500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1255232 1256469 0.35 + . transcript_id "LTnewLTref_320041500.3"; gene_id "LTnewLTref_320041500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1255232 1256260 0.39 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041500.3"; gene_id "LTnewLTref_320041500"; CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1256359 1256469 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041500.3"; gene_id "LTnewLTref_320041500"; CM024318.1 Liftoff transcript 1257596 1257802 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041600.1"; gene_id "LTnewLTref_320041600" CM024318.1 Liftoff CDS 1257596 1257802 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041600.1"; gene_id "LTnewLTref_320041600"; CM024318.1 . transcript 1258690 1262664 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041700.1"; gene_id "LTnewLTref_320041700:pseudogene" CM024318.1 . exon 1258690 1262664 . + . transcript_id "LTnewLTref_320041700.1"; gene_id "LTnewLTref_320041700:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1263465 1264121 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320041800.1"; gene_id "LTnewLTref_320041800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1263465 1264121 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041800.1"; gene_id "LTnewLTref_320041800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1271886 1273769 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320041900.1"; gene_id "LTnewLTref_320041900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1271886 1273769 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320041900.1"; gene_id "LTnewLTref_320041900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1283030 1284307 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042000.1"; gene_id "LTnewLTref_320042000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1283030 1284307 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042000.1"; gene_id "LTnewLTref_320042000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1288669 1292247 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042100.1"; gene_id "LTnewLTref_320042100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1288669 1292247 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042100.1"; gene_id "LTnewLTref_320042100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1294565 1297885 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042200.1"; gene_id "LTnewLTref_320042200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1294565 1297885 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042200.1"; gene_id "LTnewLTref_320042200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1301141 1301980 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042300.1"; gene_id "LTnewLTref_320042300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1301141 1301980 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042300.1"; gene_id "LTnewLTref_320042300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1303682 1305322 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042400.1"; gene_id "LTnewLTref_320042400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1303682 1305322 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042400.1"; gene_id "LTnewLTref_320042400"; CM024318.1 . transcript 1313074 1315565 . + . transcript_id "LTnewLTref_320042500.1"; gene_id "LTnewLTref_320042500:pseudogene" CM024318.1 . exon 1313074 1315565 . + . transcript_id "LTnewLTref_320042500.1"; gene_id "LTnewLTref_320042500:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1317865 1318587 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042600.1"; gene_id "LTnewLTref_320042600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1317865 1318587 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042600.1"; gene_id "LTnewLTref_320042600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1320118 1321326 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042700.1"; gene_id "LTnewLTref_320042700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1320118 1321326 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042700.1"; gene_id "LTnewLTref_320042700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1322218 1323648 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042800.1"; gene_id "LTnewLTref_320042800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1322218 1323648 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042800.1"; gene_id "LTnewLTref_320042800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1327157 1328455 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320042900.1"; gene_id "LTnewLTref_320042900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1327157 1328455 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320042900.1"; gene_id "LTnewLTref_320042900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1330605 1330949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043000.1"; gene_id "LTnewLTref_320043000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1330605 1330949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043000.1"; gene_id "LTnewLTref_320043000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1331864 1335199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043100.1"; gene_id "LTnewLTref_320043100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1331864 1335199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043100.1"; gene_id "LTnewLTref_320043100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1338557 1342513 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043200.1"; gene_id "LTnewLTref_320043200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1338557 1342513 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043200.1"; gene_id "LTnewLTref_320043200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1344696 1347125 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043300.1"; gene_id "LTnewLTref_320043300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1344696 1347125 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043300.1"; gene_id "LTnewLTref_320043300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1348429 1351086 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043400.1"; gene_id "LTnewLTref_320043400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1348429 1351086 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043400.1"; gene_id "LTnewLTref_320043400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1351867 1354683 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043500.1"; gene_id "LTnewLTref_320043500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1351867 1354683 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043500.1"; gene_id "LTnewLTref_320043500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1355939 1357741 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043600.1"; gene_id "LTnewLTref_320043600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1355939 1357741 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043600.1"; gene_id "LTnewLTref_320043600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1361027 1362841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043700.1"; gene_id "LTnewLTref_320043700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1361027 1362841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043700.1"; gene_id "LTnewLTref_320043700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1363958 1372405 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043800.1"; gene_id "LTnewLTref_320043800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1363958 1372405 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043800.1"; gene_id "LTnewLTref_320043800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1371845 1372405 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043800.2"; gene_id "LTnewLTref_320043800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1371845 1372405 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043800.2"; gene_id "LTnewLTref_320043800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1373438 1375732 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320043900.1"; gene_id "LTnewLTref_320043900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1373438 1375732 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320043900.1"; gene_id "LTnewLTref_320043900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1377722 1380550 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044000.1"; gene_id "LTnewLTref_320044000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1377722 1380550 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044000.1"; gene_id "LTnewLTref_320044000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1381585 1383912 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044100.1"; gene_id "LTnewLTref_320044100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1381585 1383912 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044100.1"; gene_id "LTnewLTref_320044100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1384630 1384899 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044200.1"; gene_id "LTnewLTref_320044200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1384630 1384899 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044200.1"; gene_id "LTnewLTref_320044200"; CM024318.1 Liftoff transcript 1386486 1388378 . + . transcript_id "LTnewLTref_320044300.1"; gene_id "LTnewLTref_320044300" CM024318.1 Liftoff CDS 1386486 1388378 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044300.1"; gene_id "LTnewLTref_320044300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1390388 1391326 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044400.1"; gene_id "LTnewLTref_320044400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1390388 1391326 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044400.1"; gene_id "LTnewLTref_320044400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1392953 1394644 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044500.1"; gene_id "LTnewLTref_320044500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1392953 1394644 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044500.1"; gene_id "LTnewLTref_320044500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1395639 1397549 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044600.1"; gene_id "LTnewLTref_320044600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1395639 1397549 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044600.1"; gene_id "LTnewLTref_320044600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1399092 1399316 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044700.1"; gene_id "LTnewLTref_320044700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1399092 1399316 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044700.1"; gene_id "LTnewLTref_320044700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1400476 1402533 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044800.1"; gene_id "LTnewLTref_320044800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1400476 1402533 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044800.1"; gene_id "LTnewLTref_320044800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1404148 1405050 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320044900.1"; gene_id "LTnewLTref_320044900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1404148 1405050 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320044900.1"; gene_id "LTnewLTref_320044900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1407058 1408383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045000.1"; gene_id "LTnewLTref_320045000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1407058 1408383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045000.1"; gene_id "LTnewLTref_320045000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1409345 1409728 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045100.1"; gene_id "LTnewLTref_320045100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1409345 1409728 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045100.1"; gene_id "LTnewLTref_320045100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1410566 1412287 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045200.1"; gene_id "LTnewLTref_320045200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1410566 1412287 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045200.1"; gene_id "LTnewLTref_320045200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1413183 1416866 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045300.1"; gene_id "LTnewLTref_320045300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1413183 1416866 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045300.1"; gene_id "LTnewLTref_320045300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1417594 1417947 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045400.1"; gene_id "LTnewLTref_320045400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1417594 1417947 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045400.1"; gene_id "LTnewLTref_320045400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1418785 1419387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045500.1"; gene_id "LTnewLTref_320045500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1418785 1419387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045500.1"; gene_id "LTnewLTref_320045500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1420152 1420595 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045600.1"; gene_id "LTnewLTref_320045600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1420152 1420595 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045600.1"; gene_id "LTnewLTref_320045600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1421818 1422672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045700.1"; gene_id "LTnewLTref_320045700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1421818 1422672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045700.1"; gene_id "LTnewLTref_320045700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1423321 1424634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045800.1"; gene_id "LTnewLTref_320045800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1423321 1424634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045800.1"; gene_id "LTnewLTref_320045800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1425106 1426377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320045900.1"; gene_id "LTnewLTref_320045900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1425106 1426377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320045900.1"; gene_id "LTnewLTref_320045900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1426905 1427993 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046000.1"; gene_id "LTnewLTref_320046000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1426905 1427993 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046000.1"; gene_id "LTnewLTref_320046000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1431395 1432498 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046100.1"; gene_id "LTnewLTref_320046100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1431395 1432498 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046100.1"; gene_id "LTnewLTref_320046100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1433485 1434600 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046200.1"; gene_id "LTnewLTref_320046200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1433485 1434600 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046200.1"; gene_id "LTnewLTref_320046200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1437932 1440901 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046300.1"; gene_id "LTnewLTref_320046300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1437932 1440901 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046300.1"; gene_id "LTnewLTref_320046300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1442081 1444537 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046400.1"; gene_id "LTnewLTref_320046400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1442081 1444537 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046400.1"; gene_id "LTnewLTref_320046400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1445170 1445577 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046500.1"; gene_id "LTnewLTref_320046500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1445170 1445577 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046500.1"; gene_id "LTnewLTref_320046500"; CM024318.1 . transcript 1446647 1448698 . + . transcript_id "LTnewLTref_320046600.1"; gene_id "LTnewLTref_320046600:pseudogene" CM024318.1 . exon 1446647 1448698 . + . transcript_id "LTnewLTref_320046600.1"; gene_id "LTnewLTref_320046600:pseudogene"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1449161 1449778 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046700.1"; gene_id "LTnewLTref_320046700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1449161 1449778 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046700.1"; gene_id "LTnewLTref_320046700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1450602 1451069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046800.1"; gene_id "LTnewLTref_320046800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1450602 1451069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046800.1"; gene_id "LTnewLTref_320046800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1451892 1452773 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320046900.1"; gene_id "LTnewLTref_320046900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1451892 1452773 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320046900.1"; gene_id "LTnewLTref_320046900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1453588 1455414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047000.1"; gene_id "LTnewLTref_320047000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1453588 1455414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047000.1"; gene_id "LTnewLTref_320047000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1456513 1456911 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047100.1"; gene_id "LTnewLTref_320047100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1456513 1456911 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047100.1"; gene_id "LTnewLTref_320047100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1458917 1459327 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047200.1"; gene_id "LTnewLTref_320047200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1458917 1459327 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047200.1"; gene_id "LTnewLTref_320047200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1461074 1461373 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047300.1"; gene_id "LTnewLTref_320047300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1461074 1461373 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047300.1"; gene_id "LTnewLTref_320047300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1462738 1463412 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047400.1"; gene_id "LTnewLTref_320047400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1462738 1463412 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047400.1"; gene_id "LTnewLTref_320047400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1464071 1465804 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047500.1"; gene_id "LTnewLTref_320047500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1464071 1465804 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047500.1"; gene_id "LTnewLTref_320047500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1466645 1467820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047600.1"; gene_id "LTnewLTref_320047600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1466645 1467820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047600.1"; gene_id "LTnewLTref_320047600"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1468844 1469395 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047700.1"; gene_id "LTnewLTref_320047700" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1468844 1469395 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047700.1"; gene_id "LTnewLTref_320047700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1470521 1471087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047800.1"; gene_id "LTnewLTref_320047800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1470521 1471087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047800.1"; gene_id "LTnewLTref_320047800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1472026 1473006 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320047900.1"; gene_id "LTnewLTref_320047900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1472026 1473006 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320047900.1"; gene_id "LTnewLTref_320047900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1474671 1477547 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048000.1"; gene_id "LTnewLTref_320048000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1474671 1477547 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048000.1"; gene_id "LTnewLTref_320048000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1479786 1482938 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048100.1"; gene_id "LTnewLTref_320048100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1479786 1482938 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048100.1"; gene_id "LTnewLTref_320048100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1486634 1487707 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048200.1"; gene_id "LTnewLTref_320048200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1486634 1487707 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048200.1"; gene_id "LTnewLTref_320048200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1489286 1490452 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048300.1"; gene_id "LTnewLTref_320048300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1489286 1490452 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048300.1"; gene_id "LTnewLTref_320048300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1491751 1492533 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048400.1"; gene_id "LTnewLTref_320048400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1491751 1492533 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048400.1"; gene_id "LTnewLTref_320048400"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1493603 1494532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048500.1"; gene_id "LTnewLTref_320048500" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1493603 1494532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048500.1"; gene_id "LTnewLTref_320048500"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1496025 1498445 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048600.1"; gene_id "LTnewLTref_320048600" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1496025 1498445 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048600.1"; gene_id "LTnewLTref_320048600"; CM024318.1 Liftoff transcript 1503270 1515716 . + . transcript_id "LTnewLTref_320048700.1"; gene_id "LTnewLTref_320048700" CM024318.1 Liftoff CDS 1503270 1515716 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048700.1"; gene_id "LTnewLTref_320048700"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1517002 1518672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048800.1"; gene_id "LTnewLTref_320048800" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1517002 1518672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048800.1"; gene_id "LTnewLTref_320048800"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1519570 1522554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320048900.1"; gene_id "LTnewLTref_320048900" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1519570 1522554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320048900.1"; gene_id "LTnewLTref_320048900"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1523365 1523922 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320049000.1"; gene_id "LTnewLTref_320049000" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1523365 1523922 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320049000.1"; gene_id "LTnewLTref_320049000"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1525045 1527144 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320049100.1"; gene_id "LTnewLTref_320049100" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1525045 1527144 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320049100.1"; gene_id "LTnewLTref_320049100"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1528201 1529016 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_320049200.1"; gene_id "LTnewLTref_320049200" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1528201 1529016 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320049200.1"; gene_id "LTnewLTref_320049200"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1532837 1533601 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320049300.1"; gene_id "LTnewLTref_320049300" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1532837 1533601 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320049300.1"; gene_id "LTnewLTref_320049300"; CM024318.1 AUGUSTUS transcript 1534527 1536317 1 + . transcript_id "LTnewLTref_320049400.1"; gene_id "LTnewLTref_320049400" CM024318.1 AUGUSTUS CDS 1534527 1536317 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_320049400.1"; gene_id "LTnewLTref_320049400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 8308 9757 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_330005000.1"; gene_id "LTnewLTref_330005000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 8308 8596 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330005000.1"; gene_id "LTnewLTref_330005000"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 9303 9757 0.81 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330005000.1"; gene_id "LTnewLTref_330005000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 10673 11251 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005100.1"; gene_id "LTnewLTref_330005100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 10673 11251 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005100.1"; gene_id "LTnewLTref_330005100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 11616 14084 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005200.1"; gene_id "LTnewLTref_330005200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 11616 14084 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005200.1"; gene_id "LTnewLTref_330005200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 14619 14948 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005300.1"; gene_id "LTnewLTref_330005300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 14619 14948 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005300.1"; gene_id "LTnewLTref_330005300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 15510 17180 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005400.1"; gene_id "LTnewLTref_330005400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 15510 17180 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005400.1"; gene_id "LTnewLTref_330005400"; CM024319.1 . transcript 17672 17978 . + . transcript_id "LTnewLTref_330005500.1"; gene_id "LTnewLTref_330005500:pseudogene" CM024319.1 . exon 17672 17884 . + . transcript_id "LTnewLTref_330005500.1"; gene_id "LTnewLTref_330005500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 17886 17978 . + . transcript_id "LTnewLTref_330005500.1"; gene_id "LTnewLTref_330005500:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 18305 19867 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005600.1"; gene_id "LTnewLTref_330005600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 18305 19867 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005600.1"; gene_id "LTnewLTref_330005600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 20596 21294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005700.1"; gene_id "LTnewLTref_330005700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 20596 21294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005700.1"; gene_id "LTnewLTref_330005700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 21884 23194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005800.1"; gene_id "LTnewLTref_330005800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 21884 23194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005800.1"; gene_id "LTnewLTref_330005800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 23856 25943 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330005900.1"; gene_id "LTnewLTref_330005900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 23856 25943 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330005900.1"; gene_id "LTnewLTref_330005900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 26746 27288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006000.1"; gene_id "LTnewLTref_330006000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 26746 27288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006000.1"; gene_id "LTnewLTref_330006000"; CM024319.1 Liftoff transcript 27831 29783 . - . transcript_id "LTnewLTref_330006100.1"; gene_id "LTnewLTref_330006100" CM024319.1 Liftoff CDS 27831 29783 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006100.1"; gene_id "LTnewLTref_330006100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 30888 31928 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006200.1"; gene_id "LTnewLTref_330006200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 30888 31928 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006200.1"; gene_id "LTnewLTref_330006200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 34538 35596 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006300.1"; gene_id "LTnewLTref_330006300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 34538 35596 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006300.1"; gene_id "LTnewLTref_330006300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 36251 37162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006400.1"; gene_id "LTnewLTref_330006400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 36251 37162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006400.1"; gene_id "LTnewLTref_330006400"; CM024319.1 Liftoff transcript 37910 39016 . - . transcript_id "LTnewLTref_330006500.1"; gene_id "LTnewLTref_330006500" CM024319.1 Liftoff CDS 37910 39016 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006500.1"; gene_id "LTnewLTref_330006500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 39607 40632 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006600.1"; gene_id "LTnewLTref_330006600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 39607 40632 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006600.1"; gene_id "LTnewLTref_330006600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 41458 42684 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006700.1"; gene_id "LTnewLTref_330006700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 41458 42684 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006700.1"; gene_id "LTnewLTref_330006700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 43455 44435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330006800.1"; gene_id "LTnewLTref_330006800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 43455 44435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330006800.1"; gene_id "LTnewLTref_330006800"; CM024319.1 . transcript 45397 45701 . - . transcript_id "LTnewLTref_330006900.1"; gene_id "LTnewLTref_330006900:pseudogene" CM024319.1 . exon 45397 45453 . - . transcript_id "LTnewLTref_330006900.1"; gene_id "LTnewLTref_330006900:pseudogene"; CM024319.1 . exon 45456 45701 . - . transcript_id "LTnewLTref_330006900.1"; gene_id "LTnewLTref_330006900:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 46220 47563 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330007000.1"; gene_id "LTnewLTref_330007000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 46220 47563 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007000.1"; gene_id "LTnewLTref_330007000"; CM024319.1 Liftoff transcript 49110 49310 . - . transcript_id "LTnewLTref_330007100.1"; gene_id "LTnewLTref_330007100" CM024319.1 Liftoff CDS 49110 49310 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007100.1"; gene_id "LTnewLTref_330007100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 49763 50686 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330007200.1"; gene_id "LTnewLTref_330007200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 49763 50686 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007200.1"; gene_id "LTnewLTref_330007200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 52297 52777 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330007300.1"; gene_id "LTnewLTref_330007300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 52297 52502 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_330007300.1"; gene_id "LTnewLTref_330007300"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 52720 52777 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007300.1"; gene_id "LTnewLTref_330007300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 53788 55001 0.59 - . transcript_id "LTnewLTref_330007400.1"; gene_id "LTnewLTref_330007400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 53788 53965 0.7 - 1 transcript_id "LTnewLTref_330007400.1"; gene_id "LTnewLTref_330007400"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 54910 55001 0.6 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007400.1"; gene_id "LTnewLTref_330007400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 55339 57003 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330007500.1"; gene_id "LTnewLTref_330007500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 55339 57003 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007500.1"; gene_id "LTnewLTref_330007500"; CM024319.1 . transcript 57364 57669 . - . transcript_id "LTnewLTref_330007600.1"; gene_id "LTnewLTref_330007600:pseudogene" CM024319.1 . exon 57364 57402 . - . transcript_id "LTnewLTref_330007600.1"; gene_id "LTnewLTref_330007600:pseudogene"; CM024319.1 . exon 57404 57421 . - . transcript_id "LTnewLTref_330007600.1"; gene_id "LTnewLTref_330007600:pseudogene"; CM024319.1 . exon 57424 57669 . - . transcript_id "LTnewLTref_330007600.1"; gene_id "LTnewLTref_330007600:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 58643 63679 0.87 - . transcript_id "LTnewLTref_330007700.1"; gene_id "LTnewLTref_330007700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 58643 63679 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007700.1"; gene_id "LTnewLTref_330007700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 67042 67530 0.93 - . transcript_id "LTnewLTref_330007800.1"; gene_id "LTnewLTref_330007800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 67042 67530 0.93 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007800.1"; gene_id "LTnewLTref_330007800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 69393 72137 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330007900.1"; gene_id "LTnewLTref_330007900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 69393 72137 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330007900.1"; gene_id "LTnewLTref_330007900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 73958 74569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008000.1"; gene_id "LTnewLTref_330008000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 73958 74569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008000.1"; gene_id "LTnewLTref_330008000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 76034 77752 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008100.1"; gene_id "LTnewLTref_330008100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 76034 77752 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008100.1"; gene_id "LTnewLTref_330008100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 81026 82831 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008200.1"; gene_id "LTnewLTref_330008200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 81026 82831 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008200.1"; gene_id "LTnewLTref_330008200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 84582 85934 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008300.1"; gene_id "LTnewLTref_330008300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 84582 85934 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008300.1"; gene_id "LTnewLTref_330008300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 86631 87647 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008400.1"; gene_id "LTnewLTref_330008400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 86631 87647 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008400.1"; gene_id "LTnewLTref_330008400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 89176 90231 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008500.1"; gene_id "LTnewLTref_330008500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 89176 90231 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008500.1"; gene_id "LTnewLTref_330008500"; CM024319.1 . transcript 92358 92671 . - . transcript_id "LTnewLTref_330008600.1"; gene_id "LTnewLTref_330008600:pseudogene" CM024319.1 . exon 92358 92417 . - . transcript_id "LTnewLTref_330008600.1"; gene_id "LTnewLTref_330008600:pseudogene"; CM024319.1 . exon 92425 92457 . - . transcript_id "LTnewLTref_330008600.1"; gene_id "LTnewLTref_330008600:pseudogene"; CM024319.1 . exon 92459 92671 . - . transcript_id "LTnewLTref_330008600.1"; gene_id "LTnewLTref_330008600:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 93920 94987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008700.1"; gene_id "LTnewLTref_330008700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 93920 94987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008700.1"; gene_id "LTnewLTref_330008700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 96141 97784 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330008800.1"; gene_id "LTnewLTref_330008800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 96141 97784 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008800.1"; gene_id "LTnewLTref_330008800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 102068 102514 0.78 - . transcript_id "LTnewLTref_330008900.1"; gene_id "LTnewLTref_330008900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 102068 102514 0.78 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330008900.1"; gene_id "LTnewLTref_330008900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 102571 102971 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_330009000.1"; gene_id "LTnewLTref_330009000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 102571 102918 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009000.1"; gene_id "LTnewLTref_330009000"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 102966 102971 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009000.1"; gene_id "LTnewLTref_330009000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 106349 108229 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330009100.1"; gene_id "LTnewLTref_330009100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 106349 108229 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009100.1"; gene_id "LTnewLTref_330009100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 115454 116281 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330009200.1"; gene_id "LTnewLTref_330009200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 115454 116281 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009200.1"; gene_id "LTnewLTref_330009200"; CM024319.1 . transcript 116875 117181 . + . transcript_id "LTnewLTref_330009300.1"; gene_id "LTnewLTref_330009300:pseudogene" CM024319.1 . exon 116875 117120 . + . transcript_id "LTnewLTref_330009300.1"; gene_id "LTnewLTref_330009300:pseudogene"; CM024319.1 . exon 117122 117181 . + . transcript_id "LTnewLTref_330009300.1"; gene_id "LTnewLTref_330009300:pseudogene"; CM024319.1 Aragorn_1.2.36 transcript 117397 117470 . - . transcript_id "LTnewLTref_330009400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330009400" CM024319.1 Aragorn_1.2.36 exon 117397 117470 . - . transcript_id "LTnewLTref_330009400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330009400"; CM024319.1 Aragorn_1.2.36 transcript 117529 117602 . - . transcript_id "LTnewLTref_330009500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330009500" CM024319.1 Aragorn_1.2.36 exon 117529 117602 . - . transcript_id "LTnewLTref_330009500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330009500"; CM024319.1 Aragorn_1.2.36 transcript 117677 117750 . + . transcript_id "LTnewLTref_330009600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330009600" CM024319.1 Aragorn_1.2.36 exon 117677 117750 . + . transcript_id "LTnewLTref_330009600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330009600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 118194 119576 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330009700.1"; gene_id "LTnewLTref_330009700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 118194 119576 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009700.1"; gene_id "LTnewLTref_330009700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 120416 122422 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330009800.1"; gene_id "LTnewLTref_330009800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 120416 122422 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009800.1"; gene_id "LTnewLTref_330009800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 124567 126672 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330009900.1"; gene_id "LTnewLTref_330009900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 124567 126672 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330009900.1"; gene_id "LTnewLTref_330009900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 128155 130260 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010000.1"; gene_id "LTnewLTref_330010000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 128155 130260 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010000.1"; gene_id "LTnewLTref_330010000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 131742 133849 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_330010100.1"; gene_id "LTnewLTref_330010100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 131742 131780 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010100.1"; gene_id "LTnewLTref_330010100"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 131825 133849 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010100.1"; gene_id "LTnewLTref_330010100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 135330 137435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010200.1"; gene_id "LTnewLTref_330010200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 135330 137435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010200.1"; gene_id "LTnewLTref_330010200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 138918 141023 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010300.1"; gene_id "LTnewLTref_330010300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 138918 141023 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010300.1"; gene_id "LTnewLTref_330010300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 142507 144612 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010400.1"; gene_id "LTnewLTref_330010400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 142507 144612 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010400.1"; gene_id "LTnewLTref_330010400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 145678 147864 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010500.1"; gene_id "LTnewLTref_330010500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 145678 147864 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010500.1"; gene_id "LTnewLTref_330010500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 149843 151156 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010600.1"; gene_id "LTnewLTref_330010600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 149843 151156 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010600.1"; gene_id "LTnewLTref_330010600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 152628 153734 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010700.1"; gene_id "LTnewLTref_330010700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 152628 153734 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010700.1"; gene_id "LTnewLTref_330010700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 154674 155894 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010800.1"; gene_id "LTnewLTref_330010800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 154674 155894 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010800.1"; gene_id "LTnewLTref_330010800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 157467 160286 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330010900.1"; gene_id "LTnewLTref_330010900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 157467 160286 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330010900.1"; gene_id "LTnewLTref_330010900"; CM024319.1 Liftoff transcript 162432 163166 . - . transcript_id "LTnewLTref_330011000.1"; gene_id "LTnewLTref_330011000" CM024319.1 Liftoff CDS 162432 163166 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011000.1"; gene_id "LTnewLTref_330011000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 166115 166414 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011100.1"; gene_id "LTnewLTref_330011100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 166115 166414 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011100.1"; gene_id "LTnewLTref_330011100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 167244 170384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011200.1"; gene_id "LTnewLTref_330011200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 167244 170384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011200.1"; gene_id "LTnewLTref_330011200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 171045 171950 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011300.1"; gene_id "LTnewLTref_330011300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 171045 171950 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011300.1"; gene_id "LTnewLTref_330011300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 172568 173218 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011400.1"; gene_id "LTnewLTref_330011400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 172568 173218 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011400.1"; gene_id "LTnewLTref_330011400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 174391 175257 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011500.1"; gene_id "LTnewLTref_330011500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 174391 175257 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011500.1"; gene_id "LTnewLTref_330011500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 177241 178866 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011600.1"; gene_id "LTnewLTref_330011600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 177241 178866 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011600.1"; gene_id "LTnewLTref_330011600"; CM024319.1 Liftoff transcript 179908 182001 . - . transcript_id "LTnewLTref_330011700.1"; gene_id "LTnewLTref_330011700" CM024319.1 Liftoff CDS 179908 182001 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011700.1"; gene_id "LTnewLTref_330011700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 182728 185970 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_330011800.1"; gene_id "LTnewLTref_330011800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 182728 185970 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011800.1"; gene_id "LTnewLTref_330011800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 186442 187362 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330011900.1"; gene_id "LTnewLTref_330011900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 186442 187362 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330011900.1"; gene_id "LTnewLTref_330011900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 188113 191127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012000.1"; gene_id "LTnewLTref_330012000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 188113 191127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012000.1"; gene_id "LTnewLTref_330012000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 193271 194320 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012100.1"; gene_id "LTnewLTref_330012100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 193271 194320 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012100.1"; gene_id "LTnewLTref_330012100"; CM024319.1 Liftoff transcript 194962 199887 . - . transcript_id "LTnewLTref_330012200.1"; gene_id "LTnewLTref_330012200" CM024319.1 Liftoff CDS 194962 199887 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012200.1"; gene_id "LTnewLTref_330012200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 201243 201851 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012300.1"; gene_id "LTnewLTref_330012300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 201243 201851 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012300.1"; gene_id "LTnewLTref_330012300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 204227 205573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012400.1"; gene_id "LTnewLTref_330012400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 204227 205573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012400.1"; gene_id "LTnewLTref_330012400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 206568 212921 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012500.1"; gene_id "LTnewLTref_330012500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 206568 212921 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012500.1"; gene_id "LTnewLTref_330012500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 215089 216459 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012600.1"; gene_id "LTnewLTref_330012600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 215089 216459 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012600.1"; gene_id "LTnewLTref_330012600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 218447 218881 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012700.1"; gene_id "LTnewLTref_330012700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 218447 218881 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012700.1"; gene_id "LTnewLTref_330012700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 220732 222471 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012800.1"; gene_id "LTnewLTref_330012800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 220732 222471 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012800.1"; gene_id "LTnewLTref_330012800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 223384 224592 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330012900.1"; gene_id "LTnewLTref_330012900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 223384 224592 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330012900.1"; gene_id "LTnewLTref_330012900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 225540 227573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330013000.1"; gene_id "LTnewLTref_330013000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 225540 227573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330013000.1"; gene_id "LTnewLTref_330013000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 228946 231573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330013100.1"; gene_id "LTnewLTref_330013100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 228946 231573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330013100.1"; gene_id "LTnewLTref_330013100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 232063 232635 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330013200.1"; gene_id "LTnewLTref_330013200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 232063 232635 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330013200.1"; gene_id "LTnewLTref_330013200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 235632 236915 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_330013300.1"; gene_id "LTnewLTref_330013300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 235632 236915 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013300.1"; gene_id "LTnewLTref_330013300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 237336 237716 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330013400.1"; gene_id "LTnewLTref_330013400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 237336 237716 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013400.1"; gene_id "LTnewLTref_330013400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 238318 239571 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330013500.1"; gene_id "LTnewLTref_330013500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 238318 239571 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013500.1"; gene_id "LTnewLTref_330013500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 240548 242083 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330013600.1"; gene_id "LTnewLTref_330013600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 240548 242083 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013600.1"; gene_id "LTnewLTref_330013600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 242918 243754 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330013700.1"; gene_id "LTnewLTref_330013700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 242918 243754 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013700.1"; gene_id "LTnewLTref_330013700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 245553 249761 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330013800.1"; gene_id "LTnewLTref_330013800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 245553 249761 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013800.1"; gene_id "LTnewLTref_330013800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 251461 251919 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330013900.1"; gene_id "LTnewLTref_330013900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 251461 251919 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330013900.1"; gene_id "LTnewLTref_330013900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 252912 255254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014000.1"; gene_id "LTnewLTref_330014000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 252912 255254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014000.1"; gene_id "LTnewLTref_330014000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 256340 257830 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014100.1"; gene_id "LTnewLTref_330014100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 256340 257830 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014100.1"; gene_id "LTnewLTref_330014100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 261279 261743 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014200.1"; gene_id "LTnewLTref_330014200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 261279 261743 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014200.1"; gene_id "LTnewLTref_330014200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 262599 263768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014300.1"; gene_id "LTnewLTref_330014300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 262599 263768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014300.1"; gene_id "LTnewLTref_330014300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 264673 266562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014400.1"; gene_id "LTnewLTref_330014400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 264673 266562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014400.1"; gene_id "LTnewLTref_330014400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 267603 268190 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014500.1"; gene_id "LTnewLTref_330014500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 267603 268190 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014500.1"; gene_id "LTnewLTref_330014500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 268917 270464 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014600.1"; gene_id "LTnewLTref_330014600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 268917 270464 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014600.1"; gene_id "LTnewLTref_330014600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 271277 272401 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014700.1"; gene_id "LTnewLTref_330014700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 271277 272401 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014700.1"; gene_id "LTnewLTref_330014700"; CM024319.1 Liftoff transcript 273481 275991 . + . transcript_id "LTnewLTref_330014800.1"; gene_id "LTnewLTref_330014800" CM024319.1 Liftoff CDS 273481 275991 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014800.1"; gene_id "LTnewLTref_330014800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 279744 280934 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330014900.1"; gene_id "LTnewLTref_330014900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 279744 280934 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330014900.1"; gene_id "LTnewLTref_330014900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 282356 283618 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330015000.1"; gene_id "LTnewLTref_330015000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 282356 283618 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015000.1"; gene_id "LTnewLTref_330015000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 285581 286271 0.81 + . transcript_id "LTnewLTref_330015100.1"; gene_id "LTnewLTref_330015100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 285581 285731 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015100.1"; gene_id "LTnewLTref_330015100"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 286084 286271 0.81 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330015100.1"; gene_id "LTnewLTref_330015100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 290111 293461 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_330015200.1"; gene_id "LTnewLTref_330015200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 290111 293461 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015200.1"; gene_id "LTnewLTref_330015200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 297696 302705 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330015300.1"; gene_id "LTnewLTref_330015300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 297696 302705 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015300.1"; gene_id "LTnewLTref_330015300"; CM024319.1 Liftoff transcript 304569 309854 . + . transcript_id "LTnewLTref_330015400.1"; gene_id "LTnewLTref_330015400" CM024319.1 Liftoff CDS 304569 309854 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015400.1"; gene_id "LTnewLTref_330015400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 311294 312625 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330015500.1"; gene_id "LTnewLTref_330015500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 311294 312625 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015500.1"; gene_id "LTnewLTref_330015500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 314876 316207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330015600.1"; gene_id "LTnewLTref_330015600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 314876 316207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015600.1"; gene_id "LTnewLTref_330015600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 318454 319785 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330015700.1"; gene_id "LTnewLTref_330015700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 318454 319785 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015700.1"; gene_id "LTnewLTref_330015700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 322039 323371 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_330015800.1"; gene_id "LTnewLTref_330015800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 322039 322443 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015800.1"; gene_id "LTnewLTref_330015800"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 322511 323371 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015800.1"; gene_id "LTnewLTref_330015800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 325631 326962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330015900.1"; gene_id "LTnewLTref_330015900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 325631 326962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330015900.1"; gene_id "LTnewLTref_330015900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 329222 330553 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016000.1"; gene_id "LTnewLTref_330016000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 329222 330553 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016000.1"; gene_id "LTnewLTref_330016000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 332770 334962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016100.1"; gene_id "LTnewLTref_330016100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 332770 334962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016100.1"; gene_id "LTnewLTref_330016100"; CM024319.1 Liftoff transcript 336173 336427 . + . transcript_id "LTnewLTref_330016200.1"; gene_id "LTnewLTref_330016200" CM024319.1 Liftoff CDS 336173 336427 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016200.1"; gene_id "LTnewLTref_330016200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 337438 339567 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016300.1"; gene_id "LTnewLTref_330016300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 337438 339567 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016300.1"; gene_id "LTnewLTref_330016300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 340154 342904 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016400.1"; gene_id "LTnewLTref_330016400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 340154 342904 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016400.1"; gene_id "LTnewLTref_330016400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 343581 344956 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_330016500.1"; gene_id "LTnewLTref_330016500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 343581 343609 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016500.1"; gene_id "LTnewLTref_330016500"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 343723 344956 0.71 + 1 transcript_id "LTnewLTref_330016500.1"; gene_id "LTnewLTref_330016500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 345771 347246 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016600.1"; gene_id "LTnewLTref_330016600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 345771 347246 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016600.1"; gene_id "LTnewLTref_330016600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 348699 349724 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016700.1"; gene_id "LTnewLTref_330016700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 348699 349724 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016700.1"; gene_id "LTnewLTref_330016700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 351032 351376 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016800.1"; gene_id "LTnewLTref_330016800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 351032 351376 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016800.1"; gene_id "LTnewLTref_330016800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 353167 354912 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330016900.1"; gene_id "LTnewLTref_330016900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 353167 354912 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330016900.1"; gene_id "LTnewLTref_330016900"; CM024319.1 . transcript 355690 355961 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017000.1"; gene_id "LTnewLTref_330017000:pseudogene" CM024319.1 . exon 355690 355851 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017000.1"; gene_id "LTnewLTref_330017000:pseudogene"; CM024319.1 . exon 355869 355961 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017000.1"; gene_id "LTnewLTref_330017000:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 356435 356788 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017100.1"; gene_id "LTnewLTref_330017100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 356435 356788 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017100.1"; gene_id "LTnewLTref_330017100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 357835 358494 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017200.1"; gene_id "LTnewLTref_330017200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 357835 358494 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017200.1"; gene_id "LTnewLTref_330017200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 359350 362001 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017300.1"; gene_id "LTnewLTref_330017300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 359350 362001 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017300.1"; gene_id "LTnewLTref_330017300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 362835 364484 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017400.1"; gene_id "LTnewLTref_330017400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 362835 364484 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017400.1"; gene_id "LTnewLTref_330017400"; CM024319.1 . transcript 364846 365100 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017500.1"; gene_id "LTnewLTref_330017500:pseudogene" CM024319.1 . exon 364846 365100 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017500.1"; gene_id "LTnewLTref_330017500:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 366082 369612 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017600.1"; gene_id "LTnewLTref_330017600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 366082 369612 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017600.1"; gene_id "LTnewLTref_330017600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 370329 375551 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017700.1"; gene_id "LTnewLTref_330017700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 370329 375551 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017700.1"; gene_id "LTnewLTref_330017700"; CM024319.1 . transcript 375571 375921 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017800.1"; gene_id "LTnewLTref_330017800:pseudogene" CM024319.1 . exon 375571 375921 . + . transcript_id "LTnewLTref_330017800.1"; gene_id "LTnewLTref_330017800:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 379653 380897 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330017900.1"; gene_id "LTnewLTref_330017900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 379653 380897 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330017900.1"; gene_id "LTnewLTref_330017900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 385033 386814 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018000.1"; gene_id "LTnewLTref_330018000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 385033 386814 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018000.1"; gene_id "LTnewLTref_330018000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 389970 391025 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018100.1"; gene_id "LTnewLTref_330018100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 389970 391025 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018100.1"; gene_id "LTnewLTref_330018100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 392439 392867 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018200.1"; gene_id "LTnewLTref_330018200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 392439 392867 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018200.1"; gene_id "LTnewLTref_330018200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 395635 398991 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018300.1"; gene_id "LTnewLTref_330018300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 395635 398991 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018300.1"; gene_id "LTnewLTref_330018300"; CM024319.1 . transcript 399801 400043 . + . transcript_id "LTnewLTref_330018400.1"; gene_id "LTnewLTref_330018400:pseudogene" CM024319.1 . exon 399801 400043 . + . transcript_id "LTnewLTref_330018400.1"; gene_id "LTnewLTref_330018400:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 402147 405775 0.73 + . transcript_id "LTnewLTref_330018500.1"; gene_id "LTnewLTref_330018500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 402147 405421 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018500.1"; gene_id "LTnewLTref_330018500"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 405472 405775 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_330018500.1"; gene_id "LTnewLTref_330018500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 414590 417460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018600.1"; gene_id "LTnewLTref_330018600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 414590 417460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018600.1"; gene_id "LTnewLTref_330018600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 420281 421768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018700.1"; gene_id "LTnewLTref_330018700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 420281 421768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018700.1"; gene_id "LTnewLTref_330018700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 422442 422975 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018800.1"; gene_id "LTnewLTref_330018800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 422442 422975 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018800.1"; gene_id "LTnewLTref_330018800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 426622 427974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330018900.1"; gene_id "LTnewLTref_330018900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 426622 427974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330018900.1"; gene_id "LTnewLTref_330018900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 428558 429844 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019000.1"; gene_id "LTnewLTref_330019000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 428558 429844 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019000.1"; gene_id "LTnewLTref_330019000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 431369 434680 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019100.1"; gene_id "LTnewLTref_330019100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 431369 434680 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019100.1"; gene_id "LTnewLTref_330019100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 435515 436246 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019200.1"; gene_id "LTnewLTref_330019200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 435515 436246 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019200.1"; gene_id "LTnewLTref_330019200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 438621 439958 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019300.1"; gene_id "LTnewLTref_330019300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 438621 439958 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019300.1"; gene_id "LTnewLTref_330019300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 442588 443199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019400.1"; gene_id "LTnewLTref_330019400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 442588 443199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019400.1"; gene_id "LTnewLTref_330019400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 446150 449035 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019500.1"; gene_id "LTnewLTref_330019500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 446150 449035 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019500.1"; gene_id "LTnewLTref_330019500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 450400 452751 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019600.1"; gene_id "LTnewLTref_330019600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 450400 452751 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019600.1"; gene_id "LTnewLTref_330019600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 453710 454711 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019700.1"; gene_id "LTnewLTref_330019700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 453710 454711 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019700.1"; gene_id "LTnewLTref_330019700"; CM024319.1 . transcript 455370 455621 . + . transcript_id "LTnewLTref_330019800.1"; gene_id "LTnewLTref_330019800:pseudogene" CM024319.1 . exon 455370 455621 . + . transcript_id "LTnewLTref_330019800.1"; gene_id "LTnewLTref_330019800:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 457599 459641 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330019900.1"; gene_id "LTnewLTref_330019900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 457599 459641 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330019900.1"; gene_id "LTnewLTref_330019900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 463666 465078 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020000.1"; gene_id "LTnewLTref_330020000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 463666 465078 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020000.1"; gene_id "LTnewLTref_330020000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 466951 469485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020100.1"; gene_id "LTnewLTref_330020100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 466951 469485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020100.1"; gene_id "LTnewLTref_330020100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 478254 478724 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020200.1"; gene_id "LTnewLTref_330020200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 478254 478724 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020200.1"; gene_id "LTnewLTref_330020200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 480974 485128 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020300.1"; gene_id "LTnewLTref_330020300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 480974 485128 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020300.1"; gene_id "LTnewLTref_330020300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 486189 487496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020400.1"; gene_id "LTnewLTref_330020400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 486189 487496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020400.1"; gene_id "LTnewLTref_330020400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 488853 491516 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020500.1"; gene_id "LTnewLTref_330020500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 488853 491516 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020500.1"; gene_id "LTnewLTref_330020500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 492263 494233 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020600.1"; gene_id "LTnewLTref_330020600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 492263 494233 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020600.1"; gene_id "LTnewLTref_330020600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 495345 496439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020700.1"; gene_id "LTnewLTref_330020700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 495345 496439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020700.1"; gene_id "LTnewLTref_330020700"; CM024319.1 . transcript 497626 500049 . + . transcript_id "LTnewLTref_330020800.1"; gene_id "LTnewLTref_330020800:pseudogene" CM024319.1 . exon 497626 500049 . + . transcript_id "LTnewLTref_330020800.1"; gene_id "LTnewLTref_330020800:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 501113 502978 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330020900.1"; gene_id "LTnewLTref_330020900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 501113 502978 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330020900.1"; gene_id "LTnewLTref_330020900"; CM024319.1 . transcript 503997 506688 . + . transcript_id "LTnewLTref_330021000.1"; gene_id "LTnewLTref_330021000:pseudogene" CM024319.1 . exon 503997 506688 . + . transcript_id "LTnewLTref_330021000.1"; gene_id "LTnewLTref_330021000:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 507565 508782 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330021100.1"; gene_id "LTnewLTref_330021100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 507565 508782 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330021100.1"; gene_id "LTnewLTref_330021100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 509590 510573 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330021200.1"; gene_id "LTnewLTref_330021200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 509590 510573 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330021200.1"; gene_id "LTnewLTref_330021200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 511712 514642 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330021300.1"; gene_id "LTnewLTref_330021300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 511712 514642 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330021300.1"; gene_id "LTnewLTref_330021300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 515461 516453 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330021400.1"; gene_id "LTnewLTref_330021400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 515461 516453 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330021400.1"; gene_id "LTnewLTref_330021400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 517096 517599 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330021500.1"; gene_id "LTnewLTref_330021500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 517096 517599 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330021500.1"; gene_id "LTnewLTref_330021500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 519761 521536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330021600.1"; gene_id "LTnewLTref_330021600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 519761 521536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330021600.1"; gene_id "LTnewLTref_330021600"; CM024319.1 . transcript 521843 522118 . - . transcript_id "LTnewLTref_330021700.1"; gene_id "LTnewLTref_330021700:pseudogene" CM024319.1 . exon 521843 522118 . - . transcript_id "LTnewLTref_330021700.1"; gene_id "LTnewLTref_330021700:pseudogene"; CM024319.1 . transcript 522758 522955 . + . transcript_id "LTnewLTref_330021800.1"; gene_id "LTnewLTref_330021800:pseudogene" CM024319.1 . exon 522758 522955 . + . transcript_id "LTnewLTref_330021800.1"; gene_id "LTnewLTref_330021800:pseudogene"; CM024319.1 . transcript 523075 523386 . + . transcript_id "LTnewLTref_330021900.1"; gene_id "LTnewLTref_330021900:pseudogene" CM024319.1 . exon 523075 523386 . + . transcript_id "LTnewLTref_330021900.1"; gene_id "LTnewLTref_330021900:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 523803 524189 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022000.1"; gene_id "LTnewLTref_330022000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 523803 524189 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022000.1"; gene_id "LTnewLTref_330022000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 525716 527677 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022100.1"; gene_id "LTnewLTref_330022100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 525716 527677 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022100.1"; gene_id "LTnewLTref_330022100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 529530 530165 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022200.1"; gene_id "LTnewLTref_330022200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 529530 530165 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022200.1"; gene_id "LTnewLTref_330022200"; CM024319.1 Liftoff transcript 530673 530951 . + . transcript_id "LTnewLTref_330022300.1"; gene_id "LTnewLTref_330022300" CM024319.1 Liftoff CDS 530673 530951 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022300.1"; gene_id "LTnewLTref_330022300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 531487 533499 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022400.1"; gene_id "LTnewLTref_330022400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 531487 533499 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022400.1"; gene_id "LTnewLTref_330022400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 534693 535490 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022500.1"; gene_id "LTnewLTref_330022500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 534693 535490 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022500.1"; gene_id "LTnewLTref_330022500"; CM024319.1 Aragorn_1.2.36 transcript 535802 535875 . - . transcript_id "LTnewLTref_330022600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330022600" CM024319.1 Aragorn_1.2.36 exon 535802 535875 . - . transcript_id "LTnewLTref_330022600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_330022600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 537641 538885 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022700.1"; gene_id "LTnewLTref_330022700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 537641 538885 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022700.1"; gene_id "LTnewLTref_330022700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 539635 540462 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022800.1"; gene_id "LTnewLTref_330022800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 539635 540462 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022800.1"; gene_id "LTnewLTref_330022800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 540840 541385 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330022900.1"; gene_id "LTnewLTref_330022900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 540840 541385 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330022900.1"; gene_id "LTnewLTref_330022900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 541868 542359 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023000.1"; gene_id "LTnewLTref_330023000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 541868 542359 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023000.1"; gene_id "LTnewLTref_330023000"; CM024319.1 . transcript 543760 544189 . + . transcript_id "LTnewLTref_330023100.1"; gene_id "LTnewLTref_330023100:pseudogene" CM024319.1 . exon 543760 544189 . + . transcript_id "LTnewLTref_330023100.1"; gene_id "LTnewLTref_330023100:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 545832 546248 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_330023200.1"; gene_id "LTnewLTref_330023200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 545832 546038 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023200.1"; gene_id "LTnewLTref_330023200"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 546084 546248 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023200.1"; gene_id "LTnewLTref_330023200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 546807 547352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023300.1"; gene_id "LTnewLTref_330023300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 546807 547352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023300.1"; gene_id "LTnewLTref_330023300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 547976 548578 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023400.1"; gene_id "LTnewLTref_330023400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 547976 548578 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023400.1"; gene_id "LTnewLTref_330023400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 549472 551163 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023500.1"; gene_id "LTnewLTref_330023500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 549472 551163 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023500.1"; gene_id "LTnewLTref_330023500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 551808 553082 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023600.1"; gene_id "LTnewLTref_330023600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 551808 553082 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023600.1"; gene_id "LTnewLTref_330023600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 554979 556205 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023700.1"; gene_id "LTnewLTref_330023700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 554979 556205 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023700.1"; gene_id "LTnewLTref_330023700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 560578 561459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023800.1"; gene_id "LTnewLTref_330023800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 560578 561459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023800.1"; gene_id "LTnewLTref_330023800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 563455 569400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330023900.1"; gene_id "LTnewLTref_330023900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 563455 569400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330023900.1"; gene_id "LTnewLTref_330023900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 570201 571970 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024000.1"; gene_id "LTnewLTref_330024000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 570201 571970 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024000.1"; gene_id "LTnewLTref_330024000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 576442 577908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024100.1"; gene_id "LTnewLTref_330024100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 576442 577908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024100.1"; gene_id "LTnewLTref_330024100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 584286 586037 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024200.1"; gene_id "LTnewLTref_330024200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 584286 586037 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024200.1"; gene_id "LTnewLTref_330024200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 591224 593251 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024300.1"; gene_id "LTnewLTref_330024300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 591224 593251 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024300.1"; gene_id "LTnewLTref_330024300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 599180 599590 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_330024400.1"; gene_id "LTnewLTref_330024400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 599180 599462 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024400.1"; gene_id "LTnewLTref_330024400"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 599577 599590 0.42 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330024400.1"; gene_id "LTnewLTref_330024400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 599244 599506 0.72 + . transcript_id "LTnewLTref_330024400.2"; gene_id "LTnewLTref_330024400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 599244 599246 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024400.2"; gene_id "LTnewLTref_330024400"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 599306 599506 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024400.2"; gene_id "LTnewLTref_330024400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 600253 600882 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024500.1"; gene_id "LTnewLTref_330024500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 600253 600882 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024500.1"; gene_id "LTnewLTref_330024500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 619748 620731 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024600.1"; gene_id "LTnewLTref_330024600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 619748 620731 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024600.1"; gene_id "LTnewLTref_330024600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 641688 642074 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024700.1"; gene_id "LTnewLTref_330024700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 641688 642074 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024700.1"; gene_id "LTnewLTref_330024700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 649979 660295 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024800.1"; gene_id "LTnewLTref_330024800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 649979 652349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024800.1"; gene_id "LTnewLTref_330024800"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 652443 660295 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330024800.1"; gene_id "LTnewLTref_330024800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 662348 664906 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330024900.1"; gene_id "LTnewLTref_330024900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 662348 664906 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330024900.1"; gene_id "LTnewLTref_330024900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 666436 668334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025000.1"; gene_id "LTnewLTref_330025000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 666436 668334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025000.1"; gene_id "LTnewLTref_330025000"; CM024319.1 Liftoff transcript 669128 670303 . + . transcript_id "LTnewLTref_330025100.1"; gene_id "LTnewLTref_330025100" CM024319.1 Liftoff CDS 669128 670303 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025100.1"; gene_id "LTnewLTref_330025100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 672721 673437 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025200.1"; gene_id "LTnewLTref_330025200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 672721 673437 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025200.1"; gene_id "LTnewLTref_330025200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 675838 676500 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025300.1"; gene_id "LTnewLTref_330025300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 675838 676500 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025300.1"; gene_id "LTnewLTref_330025300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 677813 678796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025400.1"; gene_id "LTnewLTref_330025400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 677813 678796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025400.1"; gene_id "LTnewLTref_330025400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 680264 682276 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025500.1"; gene_id "LTnewLTref_330025500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 680264 682276 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025500.1"; gene_id "LTnewLTref_330025500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 683577 684368 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025600.1"; gene_id "LTnewLTref_330025600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 683577 684368 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025600.1"; gene_id "LTnewLTref_330025600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 686092 687630 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025700.1"; gene_id "LTnewLTref_330025700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 686092 687630 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025700.1"; gene_id "LTnewLTref_330025700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 688418 690208 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025800.1"; gene_id "LTnewLTref_330025800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 688418 690208 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025800.1"; gene_id "LTnewLTref_330025800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 691359 692339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330025900.1"; gene_id "LTnewLTref_330025900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 691359 692339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330025900.1"; gene_id "LTnewLTref_330025900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 693286 695988 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026000.1"; gene_id "LTnewLTref_330026000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 693286 695988 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026000.1"; gene_id "LTnewLTref_330026000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 696460 697878 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026100.1"; gene_id "LTnewLTref_330026100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 696460 697878 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026100.1"; gene_id "LTnewLTref_330026100"; CM024319.1 . transcript 701285 701555 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026200.1"; gene_id "LTnewLTref_330026200:pseudogene" CM024319.1 . exon 701285 701555 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026200.1"; gene_id "LTnewLTref_330026200:pseudogene"; CM024319.1 . transcript 702470 703585 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene" CM024319.1 . exon 702470 702532 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene"; CM024319.1 . exon 702535 702924 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene"; CM024319.1 . exon 702927 703022 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene"; CM024319.1 . exon 703025 703312 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene"; CM024319.1 . exon 703315 703515 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene"; CM024319.1 . exon 703517 703585 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026300.1"; gene_id "LTnewLTref_330026300:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 704164 706881 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026400.1"; gene_id "LTnewLTref_330026400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 704164 706881 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026400.1"; gene_id "LTnewLTref_330026400"; CM024319.1 . transcript 707151 707452 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026500.1"; gene_id "LTnewLTref_330026500:pseudogene" CM024319.1 . exon 707151 707201 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026500.1"; gene_id "LTnewLTref_330026500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 707203 707280 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026500.1"; gene_id "LTnewLTref_330026500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 707282 707452 . + . transcript_id "LTnewLTref_330026500.1"; gene_id "LTnewLTref_330026500:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 707848 708438 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026600.1"; gene_id "LTnewLTref_330026600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 707848 708438 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026600.1"; gene_id "LTnewLTref_330026600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 708885 709256 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026700.1"; gene_id "LTnewLTref_330026700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 708885 709256 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026700.1"; gene_id "LTnewLTref_330026700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 709593 710390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026800.1"; gene_id "LTnewLTref_330026800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 709593 710390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026800.1"; gene_id "LTnewLTref_330026800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 710740 711354 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330026900.1"; gene_id "LTnewLTref_330026900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 710740 711354 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330026900.1"; gene_id "LTnewLTref_330026900"; CM024319.1 Liftoff transcript 711748 713115 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027000.1"; gene_id "LTnewLTref_330027000" CM024319.1 Liftoff CDS 711748 713115 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027000.1"; gene_id "LTnewLTref_330027000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 713664 716051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027100.1"; gene_id "LTnewLTref_330027100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 713664 716051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027100.1"; gene_id "LTnewLTref_330027100"; CM024319.1 . transcript 717733 718046 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027200.1"; gene_id "LTnewLTref_330027200:pseudogene" CM024319.1 . exon 717733 717795 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027200.1"; gene_id "LTnewLTref_330027200:pseudogene"; CM024319.1 . exon 717797 717874 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027200.1"; gene_id "LTnewLTref_330027200:pseudogene"; CM024319.1 . exon 717876 718046 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027200.1"; gene_id "LTnewLTref_330027200:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 718625 718987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027300.1"; gene_id "LTnewLTref_330027300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 718625 718987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027300.1"; gene_id "LTnewLTref_330027300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 719502 722600 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027400.1"; gene_id "LTnewLTref_330027400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 719502 722600 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027400.1"; gene_id "LTnewLTref_330027400"; CM024319.1 . transcript 722707 722992 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027500.1"; gene_id "LTnewLTref_330027500:pseudogene" CM024319.1 . exon 722707 722748 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027500.1"; gene_id "LTnewLTref_330027500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 722750 722992 . + . transcript_id "LTnewLTref_330027500.1"; gene_id "LTnewLTref_330027500:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 724278 727589 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027600.1"; gene_id "LTnewLTref_330027600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 724278 727589 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027600.1"; gene_id "LTnewLTref_330027600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 730853 732775 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027700.1"; gene_id "LTnewLTref_330027700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 730853 732775 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027700.1"; gene_id "LTnewLTref_330027700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 733159 733470 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027800.1"; gene_id "LTnewLTref_330027800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 733159 733470 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027800.1"; gene_id "LTnewLTref_330027800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 735393 736619 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330027900.1"; gene_id "LTnewLTref_330027900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 735393 736619 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330027900.1"; gene_id "LTnewLTref_330027900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 737810 740458 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028000.1"; gene_id "LTnewLTref_330028000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 737810 740458 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028000.1"; gene_id "LTnewLTref_330028000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 741047 741388 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028100.1"; gene_id "LTnewLTref_330028100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 741047 741388 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028100.1"; gene_id "LTnewLTref_330028100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 741810 742151 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028200.1"; gene_id "LTnewLTref_330028200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 741810 742151 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028200.1"; gene_id "LTnewLTref_330028200"; CM024319.1 Liftoff transcript 742590 743687 . - . transcript_id "LTnewLTref_330028300.1"; gene_id "LTnewLTref_330028300" CM024319.1 Liftoff CDS 742590 743687 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330028300.1"; gene_id "LTnewLTref_330028300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 745239 750134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_330028400.1"; gene_id "LTnewLTref_330028400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 745239 750134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330028400.1"; gene_id "LTnewLTref_330028400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 750700 751602 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_330028500.1"; gene_id "LTnewLTref_330028500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 750700 751602 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_330028500.1"; gene_id "LTnewLTref_330028500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 752610 753257 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028600.1"; gene_id "LTnewLTref_330028600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 752610 753257 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028600.1"; gene_id "LTnewLTref_330028600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 753553 754719 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028700.1"; gene_id "LTnewLTref_330028700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 753553 754719 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028700.1"; gene_id "LTnewLTref_330028700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 755042 756334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028800.1"; gene_id "LTnewLTref_330028800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 755042 756334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028800.1"; gene_id "LTnewLTref_330028800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 756997 759873 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330028900.1"; gene_id "LTnewLTref_330028900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 756997 759873 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330028900.1"; gene_id "LTnewLTref_330028900"; CM024319.1 . transcript 761756 762069 . - . transcript_id "LTnewLTref_330029000.1"; gene_id "LTnewLTref_330029000:pseudogene" CM024319.1 . exon 761756 761926 . - . transcript_id "LTnewLTref_330029000.1"; gene_id "LTnewLTref_330029000:pseudogene"; CM024319.1 . exon 761928 762005 . - . transcript_id "LTnewLTref_330029000.1"; gene_id "LTnewLTref_330029000:pseudogene"; CM024319.1 . exon 762007 762069 . - . transcript_id "LTnewLTref_330029000.1"; gene_id "LTnewLTref_330029000:pseudogene"; CM024319.1 . transcript 764452 764764 . + . transcript_id "LTnewLTref_330029100.1"; gene_id "LTnewLTref_330029100:pseudogene" CM024319.1 . exon 764452 764514 . + . transcript_id "LTnewLTref_330029100.1"; gene_id "LTnewLTref_330029100:pseudogene"; CM024319.1 . exon 764516 764764 . + . transcript_id "LTnewLTref_330029100.1"; gene_id "LTnewLTref_330029100:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 767171 767452 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029200.1"; gene_id "LTnewLTref_330029200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 767171 767452 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029200.1"; gene_id "LTnewLTref_330029200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 768558 769211 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029300.1"; gene_id "LTnewLTref_330029300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 768558 769211 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029300.1"; gene_id "LTnewLTref_330029300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 770387 771157 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029400.1"; gene_id "LTnewLTref_330029400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 770387 771157 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029400.1"; gene_id "LTnewLTref_330029400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 771285 771635 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029500.1"; gene_id "LTnewLTref_330029500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 771285 771635 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029500.1"; gene_id "LTnewLTref_330029500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 772858 774780 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029600.1"; gene_id "LTnewLTref_330029600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 772858 774780 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029600.1"; gene_id "LTnewLTref_330029600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 777061 779019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029700.1"; gene_id "LTnewLTref_330029700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 777061 779019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029700.1"; gene_id "LTnewLTref_330029700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 780974 781792 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029800.1"; gene_id "LTnewLTref_330029800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 780974 781792 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029800.1"; gene_id "LTnewLTref_330029800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 782661 784562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330029900.1"; gene_id "LTnewLTref_330029900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 782661 784562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330029900.1"; gene_id "LTnewLTref_330029900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 785208 785591 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030000.1"; gene_id "LTnewLTref_330030000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 785208 785591 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030000.1"; gene_id "LTnewLTref_330030000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 786419 787033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030100.1"; gene_id "LTnewLTref_330030100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 786419 787033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030100.1"; gene_id "LTnewLTref_330030100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 789090 790844 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030200.1"; gene_id "LTnewLTref_330030200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 789090 790844 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030200.1"; gene_id "LTnewLTref_330030200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 792032 792601 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030300.1"; gene_id "LTnewLTref_330030300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 792032 792601 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030300.1"; gene_id "LTnewLTref_330030300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 793348 793872 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030400.1"; gene_id "LTnewLTref_330030400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 793348 793872 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030400.1"; gene_id "LTnewLTref_330030400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 794739 795809 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030500.1"; gene_id "LTnewLTref_330030500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 794739 795809 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030500.1"; gene_id "LTnewLTref_330030500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 798736 801708 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030600.1"; gene_id "LTnewLTref_330030600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 798736 801708 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030600.1"; gene_id "LTnewLTref_330030600"; CM024319.1 Liftoff transcript 802980 805196 . + . transcript_id "LTnewLTref_330030700.1"; gene_id "LTnewLTref_330030700" CM024319.1 Liftoff CDS 802980 805196 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030700.1"; gene_id "LTnewLTref_330030700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 806038 806289 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030800.1"; gene_id "LTnewLTref_330030800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 806038 806289 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030800.1"; gene_id "LTnewLTref_330030800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 807890 809761 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330030900.1"; gene_id "LTnewLTref_330030900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 807890 809761 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330030900.1"; gene_id "LTnewLTref_330030900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 810919 812625 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031000.1"; gene_id "LTnewLTref_330031000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 810919 812625 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031000.1"; gene_id "LTnewLTref_330031000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 814348 815694 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031100.1"; gene_id "LTnewLTref_330031100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 814348 815694 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031100.1"; gene_id "LTnewLTref_330031100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 821502 823442 0.92 + . transcript_id "LTnewLTref_330031200.1"; gene_id "LTnewLTref_330031200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 821502 823442 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031200.1"; gene_id "LTnewLTref_330031200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 824512 824859 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031300.1"; gene_id "LTnewLTref_330031300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 824512 824859 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031300.1"; gene_id "LTnewLTref_330031300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 827513 831652 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031400.1"; gene_id "LTnewLTref_330031400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 827513 831652 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031400.1"; gene_id "LTnewLTref_330031400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 836284 838908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031500.1"; gene_id "LTnewLTref_330031500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 836284 838908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031500.1"; gene_id "LTnewLTref_330031500"; CM024319.1 Liftoff transcript 842840 843152 . + . transcript_id "LTnewLTref_330031600.1"; gene_id "LTnewLTref_330031600" CM024319.1 Liftoff CDS 842840 843152 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031600.1"; gene_id "LTnewLTref_330031600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 844522 847854 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031700.1"; gene_id "LTnewLTref_330031700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 844522 847854 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031700.1"; gene_id "LTnewLTref_330031700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 848915 849466 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330031800.1"; gene_id "LTnewLTref_330031800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 848915 849466 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330031800.1"; gene_id "LTnewLTref_330031800"; CM024319.1 . transcript 850217 852943 . + . transcript_id "LTnewLTref_330031900.1"; gene_id "LTnewLTref_330031900:pseudogene" CM024319.1 . exon 850217 852943 . + . transcript_id "LTnewLTref_330031900.1"; gene_id "LTnewLTref_330031900:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 854191 855426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032000.1"; gene_id "LTnewLTref_330032000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 854191 855426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032000.1"; gene_id "LTnewLTref_330032000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 856120 856470 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032100.1"; gene_id "LTnewLTref_330032100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 856120 856470 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032100.1"; gene_id "LTnewLTref_330032100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 860892 863903 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032200.1"; gene_id "LTnewLTref_330032200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 860892 863903 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032200.1"; gene_id "LTnewLTref_330032200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 865539 869288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032300.1"; gene_id "LTnewLTref_330032300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 865539 869288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032300.1"; gene_id "LTnewLTref_330032300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 870761 874252 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032400.1"; gene_id "LTnewLTref_330032400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 870761 874252 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032400.1"; gene_id "LTnewLTref_330032400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 875571 877079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032500.1"; gene_id "LTnewLTref_330032500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 875571 877079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032500.1"; gene_id "LTnewLTref_330032500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 878694 879295 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_330032600.1"; gene_id "LTnewLTref_330032600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 878694 879234 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032600.1"; gene_id "LTnewLTref_330032600"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 879288 879295 0.69 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330032600.1"; gene_id "LTnewLTref_330032600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 878694 880556 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032600.2"; gene_id "LTnewLTref_330032600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 878694 880556 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032600.2"; gene_id "LTnewLTref_330032600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 882100 882759 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032700.1"; gene_id "LTnewLTref_330032700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 882100 882759 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032700.1"; gene_id "LTnewLTref_330032700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 888003 890765 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032800.1"; gene_id "LTnewLTref_330032800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 888003 890765 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032800.1"; gene_id "LTnewLTref_330032800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 892771 895644 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330032900.1"; gene_id "LTnewLTref_330032900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 892771 895644 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330032900.1"; gene_id "LTnewLTref_330032900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 899304 901926 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_330033000.1"; gene_id "LTnewLTref_330033000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 899304 901523 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033000.1"; gene_id "LTnewLTref_330033000"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 901624 901926 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033000.1"; gene_id "LTnewLTref_330033000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 906560 907165 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033100.1"; gene_id "LTnewLTref_330033100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 906560 907165 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033100.1"; gene_id "LTnewLTref_330033100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 908154 912575 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033200.1"; gene_id "LTnewLTref_330033200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 908154 912575 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033200.1"; gene_id "LTnewLTref_330033200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 918062 922318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033300.1"; gene_id "LTnewLTref_330033300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 918062 922318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033300.1"; gene_id "LTnewLTref_330033300"; CM024319.1 . transcript 928046 931371 . + . transcript_id "LTnewLTref_330033400.1"; gene_id "LTnewLTref_330033400:pseudogene" CM024319.1 . exon 928046 931371 . + . transcript_id "LTnewLTref_330033400.1"; gene_id "LTnewLTref_330033400:pseudogene"; CM024319.1 Liftoff transcript 932838 934187 . + . transcript_id "LTnewLTref_330033500.1"; gene_id "LTnewLTref_330033500" CM024319.1 Liftoff CDS 932838 934187 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033500.1"; gene_id "LTnewLTref_330033500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 936997 937923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033600.1"; gene_id "LTnewLTref_330033600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 936997 937923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033600.1"; gene_id "LTnewLTref_330033600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 938659 939513 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033700.1"; gene_id "LTnewLTref_330033700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 938659 939513 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033700.1"; gene_id "LTnewLTref_330033700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 940780 943047 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033800.1"; gene_id "LTnewLTref_330033800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 940780 943047 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033800.1"; gene_id "LTnewLTref_330033800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 944541 946478 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330033900.1"; gene_id "LTnewLTref_330033900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 944541 946478 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330033900.1"; gene_id "LTnewLTref_330033900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 947125 948060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034000.1"; gene_id "LTnewLTref_330034000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 947125 948060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034000.1"; gene_id "LTnewLTref_330034000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 948979 950337 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034100.1"; gene_id "LTnewLTref_330034100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 948979 950337 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034100.1"; gene_id "LTnewLTref_330034100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 951422 955711 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034200.1"; gene_id "LTnewLTref_330034200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 951422 955711 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034200.1"; gene_id "LTnewLTref_330034200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 957808 961419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034300.1"; gene_id "LTnewLTref_330034300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 957808 961419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034300.1"; gene_id "LTnewLTref_330034300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 961057 961419 0.92 + . transcript_id "LTnewLTref_330034300.2"; gene_id "LTnewLTref_330034300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 961057 961419 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034300.2"; gene_id "LTnewLTref_330034300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 962910 965996 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034400.1"; gene_id "LTnewLTref_330034400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 962910 965996 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034400.1"; gene_id "LTnewLTref_330034400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 968321 974287 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034500.1"; gene_id "LTnewLTref_330034500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 968321 974287 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034500.1"; gene_id "LTnewLTref_330034500"; CM024319.1 Liftoff transcript 975636 975830 . + . transcript_id "LTnewLTref_330034600.1"; gene_id "LTnewLTref_330034600" CM024319.1 Liftoff CDS 975636 975830 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034600.1"; gene_id "LTnewLTref_330034600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 977416 978591 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034700.1"; gene_id "LTnewLTref_330034700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 977416 978591 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034700.1"; gene_id "LTnewLTref_330034700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 981181 982758 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034800.1"; gene_id "LTnewLTref_330034800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 981181 982758 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034800.1"; gene_id "LTnewLTref_330034800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 983992 986349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330034900.1"; gene_id "LTnewLTref_330034900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 983992 986349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330034900.1"; gene_id "LTnewLTref_330034900"; CM024319.1 . transcript 988313 991992 . + . transcript_id "LTnewLTref_330035000.1"; gene_id "LTnewLTref_330035000:pseudogene" CM024319.1 . exon 988313 991992 . + . transcript_id "LTnewLTref_330035000.1"; gene_id "LTnewLTref_330035000:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 993249 994718 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035100.1"; gene_id "LTnewLTref_330035100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 993249 994718 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035100.1"; gene_id "LTnewLTref_330035100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 996480 999060 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_330035200.1"; gene_id "LTnewLTref_330035200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 996480 998360 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035200.1"; gene_id "LTnewLTref_330035200"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 998416 999060 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035200.1"; gene_id "LTnewLTref_330035200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1001770 1005831 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035300.1"; gene_id "LTnewLTref_330035300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1001770 1005831 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035300.1"; gene_id "LTnewLTref_330035300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1006692 1008383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035400.1"; gene_id "LTnewLTref_330035400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1006692 1008383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035400.1"; gene_id "LTnewLTref_330035400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1009063 1009956 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_330035500.1"; gene_id "LTnewLTref_330035500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1009063 1009882 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035500.1"; gene_id "LTnewLTref_330035500"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1009925 1009956 0.6 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330035500.1"; gene_id "LTnewLTref_330035500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1009636 1009956 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_330035500.2"; gene_id "LTnewLTref_330035500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1009636 1009882 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035500.2"; gene_id "LTnewLTref_330035500"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1009925 1009956 0.58 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330035500.2"; gene_id "LTnewLTref_330035500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1013162 1014790 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035600.1"; gene_id "LTnewLTref_330035600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1013162 1014790 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035600.1"; gene_id "LTnewLTref_330035600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1016940 1019222 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035700.1"; gene_id "LTnewLTref_330035700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1016940 1019222 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035700.1"; gene_id "LTnewLTref_330035700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1020679 1022382 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035800.1"; gene_id "LTnewLTref_330035800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1020679 1022382 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035800.1"; gene_id "LTnewLTref_330035800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1023559 1025856 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330035900.1"; gene_id "LTnewLTref_330035900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1023559 1025856 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330035900.1"; gene_id "LTnewLTref_330035900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1026833 1028974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036000.1"; gene_id "LTnewLTref_330036000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1026833 1028974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036000.1"; gene_id "LTnewLTref_330036000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1030169 1032121 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036100.1"; gene_id "LTnewLTref_330036100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1030169 1032121 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036100.1"; gene_id "LTnewLTref_330036100"; CM024319.1 Liftoff transcript 1033453 1034976 . + . transcript_id "LTnewLTref_330036200.1"; gene_id "LTnewLTref_330036200" CM024319.1 Liftoff CDS 1033453 1034976 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036200.1"; gene_id "LTnewLTref_330036200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1036709 1041610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036300.1"; gene_id "LTnewLTref_330036300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1036709 1041610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036300.1"; gene_id "LTnewLTref_330036300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1042309 1045464 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036400.1"; gene_id "LTnewLTref_330036400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1042309 1045464 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036400.1"; gene_id "LTnewLTref_330036400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1047780 1048979 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036500.1"; gene_id "LTnewLTref_330036500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1047780 1048979 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036500.1"; gene_id "LTnewLTref_330036500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1051395 1053152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036600.1"; gene_id "LTnewLTref_330036600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1051395 1053152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036600.1"; gene_id "LTnewLTref_330036600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1053963 1056026 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036700.1"; gene_id "LTnewLTref_330036700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1053963 1056026 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036700.1"; gene_id "LTnewLTref_330036700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1058865 1059824 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036800.1"; gene_id "LTnewLTref_330036800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1058865 1059824 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036800.1"; gene_id "LTnewLTref_330036800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1060877 1063105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330036900.1"; gene_id "LTnewLTref_330036900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1060877 1063105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330036900.1"; gene_id "LTnewLTref_330036900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1064694 1066409 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037000.1"; gene_id "LTnewLTref_330037000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1064694 1066409 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037000.1"; gene_id "LTnewLTref_330037000"; CM024319.1 Liftoff transcript 1067287 1067481 . + . transcript_id "LTnewLTref_330037100.1"; gene_id "LTnewLTref_330037100" CM024319.1 Liftoff CDS 1067287 1067481 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037100.1"; gene_id "LTnewLTref_330037100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1068644 1072531 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037200.1"; gene_id "LTnewLTref_330037200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1068644 1072531 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037200.1"; gene_id "LTnewLTref_330037200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1073806 1075305 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037300.1"; gene_id "LTnewLTref_330037300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1073806 1075305 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037300.1"; gene_id "LTnewLTref_330037300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1076990 1078267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037400.1"; gene_id "LTnewLTref_330037400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1076990 1078267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037400.1"; gene_id "LTnewLTref_330037400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1084800 1091024 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037500.1"; gene_id "LTnewLTref_330037500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1084800 1091024 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037500.1"; gene_id "LTnewLTref_330037500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1092171 1093754 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037600.1"; gene_id "LTnewLTref_330037600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1092171 1093754 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037600.1"; gene_id "LTnewLTref_330037600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1094806 1095105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037700.1"; gene_id "LTnewLTref_330037700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1094806 1095105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037700.1"; gene_id "LTnewLTref_330037700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1095841 1097580 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_330037800.1"; gene_id "LTnewLTref_330037800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1095841 1097580 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037800.1"; gene_id "LTnewLTref_330037800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1098250 1101714 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330037900.1"; gene_id "LTnewLTref_330037900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1098250 1101714 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330037900.1"; gene_id "LTnewLTref_330037900"; CM024319.1 Liftoff transcript 1102558 1105584 . + . transcript_id "LTnewLTref_330038000.1"; gene_id "LTnewLTref_330038000" CM024319.1 Liftoff CDS 1102558 1105584 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038000.1"; gene_id "LTnewLTref_330038000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1106763 1108214 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038100.1"; gene_id "LTnewLTref_330038100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1106763 1108214 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038100.1"; gene_id "LTnewLTref_330038100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1109089 1110567 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038200.1"; gene_id "LTnewLTref_330038200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1109089 1110567 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038200.1"; gene_id "LTnewLTref_330038200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1112405 1115650 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038300.1"; gene_id "LTnewLTref_330038300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1112405 1115650 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038300.1"; gene_id "LTnewLTref_330038300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1117271 1118560 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038400.1"; gene_id "LTnewLTref_330038400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1117271 1118560 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038400.1"; gene_id "LTnewLTref_330038400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1120350 1122749 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038500.1"; gene_id "LTnewLTref_330038500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1120350 1122749 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038500.1"; gene_id "LTnewLTref_330038500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1123293 1126793 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038600.1"; gene_id "LTnewLTref_330038600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1123293 1126793 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038600.1"; gene_id "LTnewLTref_330038600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1127603 1131277 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038700.1"; gene_id "LTnewLTref_330038700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1127603 1131277 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038700.1"; gene_id "LTnewLTref_330038700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1133208 1135709 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038800.1"; gene_id "LTnewLTref_330038800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1133208 1135709 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038800.1"; gene_id "LTnewLTref_330038800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1136485 1137285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330038900.1"; gene_id "LTnewLTref_330038900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1136485 1137285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330038900.1"; gene_id "LTnewLTref_330038900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1138130 1140775 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039000.1"; gene_id "LTnewLTref_330039000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1138130 1140775 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039000.1"; gene_id "LTnewLTref_330039000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1142122 1142622 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039100.1"; gene_id "LTnewLTref_330039100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1142122 1142622 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039100.1"; gene_id "LTnewLTref_330039100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1143651 1145090 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039200.1"; gene_id "LTnewLTref_330039200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1143651 1145090 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039200.1"; gene_id "LTnewLTref_330039200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1154457 1155893 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039300.1"; gene_id "LTnewLTref_330039300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1154457 1155893 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039300.1"; gene_id "LTnewLTref_330039300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1165224 1166831 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039400.1"; gene_id "LTnewLTref_330039400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1165224 1166831 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039400.1"; gene_id "LTnewLTref_330039400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1168825 1171278 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039500.1"; gene_id "LTnewLTref_330039500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1168825 1171278 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039500.1"; gene_id "LTnewLTref_330039500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1173533 1176949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039600.1"; gene_id "LTnewLTref_330039600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1173533 1176949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039600.1"; gene_id "LTnewLTref_330039600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1178010 1180691 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039700.1"; gene_id "LTnewLTref_330039700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1178010 1180691 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039700.1"; gene_id "LTnewLTref_330039700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1181913 1182638 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330039800.1"; gene_id "LTnewLTref_330039800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1181913 1182638 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039800.1"; gene_id "LTnewLTref_330039800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1186192 1201450 0.7 + . transcript_id "LTnewLTref_330039900.1"; gene_id "LTnewLTref_330039900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1186192 1194841 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330039900.1"; gene_id "LTnewLTref_330039900"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1194894 1201450 0.7 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330039900.1"; gene_id "LTnewLTref_330039900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1202515 1205034 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040000.1"; gene_id "LTnewLTref_330040000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1202515 1205034 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040000.1"; gene_id "LTnewLTref_330040000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1207089 1207544 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040100.1"; gene_id "LTnewLTref_330040100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1207089 1207544 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040100.1"; gene_id "LTnewLTref_330040100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1209222 1210643 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040200.1"; gene_id "LTnewLTref_330040200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1209222 1210643 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040200.1"; gene_id "LTnewLTref_330040200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1212223 1214004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040300.1"; gene_id "LTnewLTref_330040300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1212223 1214004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040300.1"; gene_id "LTnewLTref_330040300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1215742 1216773 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040400.1"; gene_id "LTnewLTref_330040400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1215742 1216773 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040400.1"; gene_id "LTnewLTref_330040400"; CM024319.1 . transcript 1217037 1217372 . + . transcript_id "LTnewLTref_330040500.1"; gene_id "LTnewLTref_330040500:pseudogene" CM024319.1 . exon 1217037 1217117 . + . transcript_id "LTnewLTref_330040500.1"; gene_id "LTnewLTref_330040500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 1217126 1217254 . + . transcript_id "LTnewLTref_330040500.1"; gene_id "LTnewLTref_330040500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 1217257 1217337 . + . transcript_id "LTnewLTref_330040500.1"; gene_id "LTnewLTref_330040500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 1217340 1217372 . + . transcript_id "LTnewLTref_330040500.1"; gene_id "LTnewLTref_330040500:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1219646 1220962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040600.1"; gene_id "LTnewLTref_330040600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1219646 1220962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040600.1"; gene_id "LTnewLTref_330040600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1223549 1224010 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040700.1"; gene_id "LTnewLTref_330040700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1223549 1224010 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040700.1"; gene_id "LTnewLTref_330040700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1224858 1225634 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_330040800.1"; gene_id "LTnewLTref_330040800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1224858 1225424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040800.1"; gene_id "LTnewLTref_330040800"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1225566 1225634 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040800.1"; gene_id "LTnewLTref_330040800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1227006 1228220 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330040900.1"; gene_id "LTnewLTref_330040900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1227006 1228220 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330040900.1"; gene_id "LTnewLTref_330040900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1229646 1231097 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041000.1"; gene_id "LTnewLTref_330041000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1229646 1231097 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041000.1"; gene_id "LTnewLTref_330041000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1232421 1232768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041100.1"; gene_id "LTnewLTref_330041100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1232421 1232768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041100.1"; gene_id "LTnewLTref_330041100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1233469 1234713 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041200.1"; gene_id "LTnewLTref_330041200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1233469 1234713 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041200.1"; gene_id "LTnewLTref_330041200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1235481 1235786 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041300.1"; gene_id "LTnewLTref_330041300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1235481 1235786 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041300.1"; gene_id "LTnewLTref_330041300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1241001 1241654 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041400.1"; gene_id "LTnewLTref_330041400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1241001 1241654 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041400.1"; gene_id "LTnewLTref_330041400"; CM024319.1 . transcript 1247881 1248186 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041500.1"; gene_id "LTnewLTref_330041500:pseudogene" CM024319.1 . exon 1247881 1248096 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041500.1"; gene_id "LTnewLTref_330041500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 1248099 1248137 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041500.1"; gene_id "LTnewLTref_330041500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 1248140 1248151 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041500.1"; gene_id "LTnewLTref_330041500:pseudogene"; CM024319.1 . exon 1248154 1248186 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041500.1"; gene_id "LTnewLTref_330041500:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1252187 1252864 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041600.1"; gene_id "LTnewLTref_330041600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1252187 1252864 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041600.1"; gene_id "LTnewLTref_330041600"; CM024319.1 . transcript 1253436 1253810 . - . transcript_id "LTnewLTref_330041700.1"; gene_id "LTnewLTref_330041700:pseudogene" CM024319.1 . exon 1253436 1253810 . - . transcript_id "LTnewLTref_330041700.1"; gene_id "LTnewLTref_330041700:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1260060 1260713 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330041800.1"; gene_id "LTnewLTref_330041800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1260060 1260713 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330041800.1"; gene_id "LTnewLTref_330041800"; CM024319.1 . transcript 1266908 1267243 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041900.1"; gene_id "LTnewLTref_330041900:pseudogene" CM024319.1 . exon 1266908 1267243 . + . transcript_id "LTnewLTref_330041900.1"; gene_id "LTnewLTref_330041900:pseudogene"; CM024319.1 Liftoff transcript 1268136 1268312 . + . transcript_id "LTnewLTref_330042000.1"; gene_id "LTnewLTref_330042000" CM024319.1 Liftoff CDS 1268136 1268312 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042000.1"; gene_id "LTnewLTref_330042000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1276657 1284879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042100.1"; gene_id "LTnewLTref_330042100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1276657 1284879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042100.1"; gene_id "LTnewLTref_330042100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1290381 1298474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042200.1"; gene_id "LTnewLTref_330042200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1290381 1298474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042200.1"; gene_id "LTnewLTref_330042200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1301518 1306299 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042300.1"; gene_id "LTnewLTref_330042300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1301518 1306299 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042300.1"; gene_id "LTnewLTref_330042300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1311091 1316910 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042400.1"; gene_id "LTnewLTref_330042400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1311091 1316910 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042400.1"; gene_id "LTnewLTref_330042400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1322230 1323150 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042500.1"; gene_id "LTnewLTref_330042500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1322230 1323150 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042500.1"; gene_id "LTnewLTref_330042500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1330317 1334795 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042600.1"; gene_id "LTnewLTref_330042600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1330317 1334795 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042600.1"; gene_id "LTnewLTref_330042600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1338057 1340429 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330042700.1"; gene_id "LTnewLTref_330042700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1338057 1340429 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042700.1"; gene_id "LTnewLTref_330042700"; CM024319.1 Liftoff transcript 1346978 1347799 . + . transcript_id "LTnewLTref_330042800.1"; gene_id "LTnewLTref_330042800" CM024319.1 Liftoff CDS 1346978 1347799 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042800.1"; gene_id "LTnewLTref_330042800"; CM024319.1 Liftoff transcript 1347991 1349430 . + . transcript_id "LTnewLTref_330042900.1"; gene_id "LTnewLTref_330042900" CM024319.1 Liftoff CDS 1347991 1349430 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330042900.1"; gene_id "LTnewLTref_330042900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1355852 1360585 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043000.1"; gene_id "LTnewLTref_330043000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1355852 1360585 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043000.1"; gene_id "LTnewLTref_330043000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1361833 1365456 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043100.1"; gene_id "LTnewLTref_330043100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1361833 1365456 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043100.1"; gene_id "LTnewLTref_330043100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1371969 1372970 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043200.1"; gene_id "LTnewLTref_330043200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1371969 1372970 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043200.1"; gene_id "LTnewLTref_330043200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1377787 1380945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043300.1"; gene_id "LTnewLTref_330043300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1377787 1380945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043300.1"; gene_id "LTnewLTref_330043300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1387111 1390449 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043400.1"; gene_id "LTnewLTref_330043400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1387111 1390449 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043400.1"; gene_id "LTnewLTref_330043400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1396110 1399019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043500.1"; gene_id "LTnewLTref_330043500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1396110 1399019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043500.1"; gene_id "LTnewLTref_330043500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1407298 1410525 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043600.1"; gene_id "LTnewLTref_330043600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1407298 1410525 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043600.1"; gene_id "LTnewLTref_330043600"; CM024319.1 Liftoff transcript 1411315 1415619 . + . transcript_id "LTnewLTref_330043700.1"; gene_id "LTnewLTref_330043700" CM024319.1 Liftoff CDS 1411315 1415619 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043700.1"; gene_id "LTnewLTref_330043700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1416444 1418492 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043800.1"; gene_id "LTnewLTref_330043800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1416444 1418492 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043800.1"; gene_id "LTnewLTref_330043800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1420196 1420420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330043900.1"; gene_id "LTnewLTref_330043900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1420196 1420420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330043900.1"; gene_id "LTnewLTref_330043900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1421352 1422160 0.46 + . transcript_id "LTnewLTref_330044000.1"; gene_id "LTnewLTref_330044000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1421352 1421469 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044000.1"; gene_id "LTnewLTref_330044000"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1421517 1422160 0.46 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330044000.1"; gene_id "LTnewLTref_330044000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1421699 1422812 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_330044000.2"; gene_id "LTnewLTref_330044000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1421699 1422140 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044000.2"; gene_id "LTnewLTref_330044000"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1422445 1422812 0.69 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330044000.2"; gene_id "LTnewLTref_330044000"; CM024319.1 . transcript 1423095 1423693 . + . transcript_id "LTnewLTref_330044100.1"; gene_id "LTnewLTref_330044100:pseudogene" CM024319.1 . exon 1423095 1423693 . + . transcript_id "LTnewLTref_330044100.1"; gene_id "LTnewLTref_330044100:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1424467 1431103 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_330044200.1"; gene_id "LTnewLTref_330044200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1424467 1429904 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044200.1"; gene_id "LTnewLTref_330044200"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1429951 1431103 0.95 + 1 transcript_id "LTnewLTref_330044200.1"; gene_id "LTnewLTref_330044200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1427998 1431103 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_330044200.2"; gene_id "LTnewLTref_330044200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1427998 1429904 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044200.2"; gene_id "LTnewLTref_330044200"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1429951 1431103 0.9 + 1 transcript_id "LTnewLTref_330044200.2"; gene_id "LTnewLTref_330044200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1435023 1438537 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_330044300.1"; gene_id "LTnewLTref_330044300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1435023 1437725 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044300.1"; gene_id "LTnewLTref_330044300"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1437779 1438537 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044300.1"; gene_id "LTnewLTref_330044300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1438682 1439458 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_330044400.1"; gene_id "LTnewLTref_330044400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1438682 1439285 0.42 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044400.1"; gene_id "LTnewLTref_330044400"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1439451 1439458 0.68 + 2 transcript_id "LTnewLTref_330044400.1"; gene_id "LTnewLTref_330044400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1438682 1439745 0.33 + . transcript_id "LTnewLTref_330044400.2"; gene_id "LTnewLTref_330044400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1438682 1439064 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044400.2"; gene_id "LTnewLTref_330044400"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1439199 1439745 0.39 + 1 transcript_id "LTnewLTref_330044400.2"; gene_id "LTnewLTref_330044400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1439500 1439745 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330044400.3"; gene_id "LTnewLTref_330044400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1439500 1439745 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044400.3"; gene_id "LTnewLTref_330044400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1440517 1445734 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_330044500.1"; gene_id "LTnewLTref_330044500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1440517 1442036 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044500.1"; gene_id "LTnewLTref_330044500"; CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1442080 1445734 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_330044500.1"; gene_id "LTnewLTref_330044500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1444601 1445734 0.68 + . transcript_id "LTnewLTref_330044500.2"; gene_id "LTnewLTref_330044500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1444601 1445734 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044500.2"; gene_id "LTnewLTref_330044500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1447675 1454226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330044600.1"; gene_id "LTnewLTref_330044600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1447675 1454226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044600.1"; gene_id "LTnewLTref_330044600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1456919 1461292 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330044700.1"; gene_id "LTnewLTref_330044700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1456919 1461292 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044700.1"; gene_id "LTnewLTref_330044700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1462410 1463807 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330044800.1"; gene_id "LTnewLTref_330044800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1462410 1463807 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330044800.1"; gene_id "LTnewLTref_330044800"; CM024319.1 . transcript 1464645 1467697 . + . transcript_id "LTnewLTref_330044900.1"; gene_id "LTnewLTref_330044900:pseudogene" CM024319.1 . exon 1464645 1467697 . + . transcript_id "LTnewLTref_330044900.1"; gene_id "LTnewLTref_330044900:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1468444 1469361 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045000.1"; gene_id "LTnewLTref_330045000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1468444 1469361 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045000.1"; gene_id "LTnewLTref_330045000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1469899 1472916 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045100.1"; gene_id "LTnewLTref_330045100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1469899 1472916 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045100.1"; gene_id "LTnewLTref_330045100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1473476 1473931 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045200.1"; gene_id "LTnewLTref_330045200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1473476 1473931 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045200.1"; gene_id "LTnewLTref_330045200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1474583 1476052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045300.1"; gene_id "LTnewLTref_330045300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1474583 1476052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045300.1"; gene_id "LTnewLTref_330045300"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1476698 1478287 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045400.1"; gene_id "LTnewLTref_330045400" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1476698 1478287 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045400.1"; gene_id "LTnewLTref_330045400"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1479247 1481085 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045500.1"; gene_id "LTnewLTref_330045500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1479247 1481085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045500.1"; gene_id "LTnewLTref_330045500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1481920 1482231 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045600.1"; gene_id "LTnewLTref_330045600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1481920 1482231 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045600.1"; gene_id "LTnewLTref_330045600"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1483133 1484137 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045700.1"; gene_id "LTnewLTref_330045700" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1483133 1484137 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045700.1"; gene_id "LTnewLTref_330045700"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1486859 1489513 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045800.1"; gene_id "LTnewLTref_330045800" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1486859 1489513 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045800.1"; gene_id "LTnewLTref_330045800"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1490671 1491585 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330045900.1"; gene_id "LTnewLTref_330045900" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1490671 1491585 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330045900.1"; gene_id "LTnewLTref_330045900"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1493166 1494770 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330046000.1"; gene_id "LTnewLTref_330046000" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1493166 1494770 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330046000.1"; gene_id "LTnewLTref_330046000"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1495419 1495739 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330046100.1"; gene_id "LTnewLTref_330046100" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1495419 1495739 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330046100.1"; gene_id "LTnewLTref_330046100"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1496310 1496720 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330046200.1"; gene_id "LTnewLTref_330046200" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1496310 1496720 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330046200.1"; gene_id "LTnewLTref_330046200"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1498283 1499656 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330046300.1"; gene_id "LTnewLTref_330046300" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1498283 1499656 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330046300.1"; gene_id "LTnewLTref_330046300"; CM024319.1 . transcript 1500796 1503675 . + . transcript_id "LTnewLTref_330046400.1"; gene_id "LTnewLTref_330046400:pseudogene" CM024319.1 . exon 1500796 1503675 . + . transcript_id "LTnewLTref_330046400.1"; gene_id "LTnewLTref_330046400:pseudogene"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1504136 1505320 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330046500.1"; gene_id "LTnewLTref_330046500" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1504136 1505320 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330046500.1"; gene_id "LTnewLTref_330046500"; CM024319.1 AUGUSTUS transcript 1507819 1508028 1 + . transcript_id "LTnewLTref_330046600.1"; gene_id "LTnewLTref_330046600" CM024319.1 AUGUSTUS CDS 1507819 1508028 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_330046600.1"; gene_id "LTnewLTref_330046600"; CM024319.1 . transcript 1509015 1509340 . - . transcript_id "LTnewLTref_330046700.1"; gene_id "LTnewLTref_330046700:pseudogene" CM024319.1 . exon 1509015 1509340 . - . transcript_id "LTnewLTref_330046700.1"; gene_id "LTnewLTref_330046700:pseudogene"; CM024319.1 Liftoff transcript 1510804 1511034 . - . transcript_id "LTnewLTref_330046800.1"; gene_id "LTnewLTref_330046800" CM024319.1 Liftoff CDS 1510804 1511034 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_330046800.1"; gene_id "LTnewLTref_330046800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 520 713 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005000.1"; gene_id "LTnewLTref_340005000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 520 713 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_340005000.1"; gene_id "LTnewLTref_340005000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 10032 10952 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340005100.1"; gene_id "LTnewLTref_340005100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 10032 10952 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340005100.1"; gene_id "LTnewLTref_340005100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 12578 13927 0.46 + . transcript_id "LTnewLTref_340005200.1"; gene_id "LTnewLTref_340005200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 12578 12629 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005200.1"; gene_id "LTnewLTref_340005200"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 13200 13927 0.48 + 2 transcript_id "LTnewLTref_340005200.1"; gene_id "LTnewLTref_340005200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 13184 13927 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_340005200.2"; gene_id "LTnewLTref_340005200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 13184 13927 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005200.2"; gene_id "LTnewLTref_340005200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 14653 15675 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005300.1"; gene_id "LTnewLTref_340005300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 14653 15675 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005300.1"; gene_id "LTnewLTref_340005300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 16655 18781 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005400.1"; gene_id "LTnewLTref_340005400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 16655 18781 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005400.1"; gene_id "LTnewLTref_340005400"; CM024320.1 . transcript 19291 21047 . + . transcript_id "LTnewLTref_340005500.1"; gene_id "LTnewLTref_340005500:pseudogene" CM024320.1 . exon 19291 21047 . + . transcript_id "LTnewLTref_340005500.1"; gene_id "LTnewLTref_340005500:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 23296 26496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005600.1"; gene_id "LTnewLTref_340005600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 23296 26496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005600.1"; gene_id "LTnewLTref_340005600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 27669 28640 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005700.1"; gene_id "LTnewLTref_340005700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 27669 28640 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005700.1"; gene_id "LTnewLTref_340005700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 31146 32834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005800.1"; gene_id "LTnewLTref_340005800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 31146 32834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005800.1"; gene_id "LTnewLTref_340005800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 37362 39152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340005900.1"; gene_id "LTnewLTref_340005900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 37362 39152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340005900.1"; gene_id "LTnewLTref_340005900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 40133 42418 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006000.1"; gene_id "LTnewLTref_340006000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 40133 42418 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006000.1"; gene_id "LTnewLTref_340006000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 43290 43946 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006100.1"; gene_id "LTnewLTref_340006100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 43290 43946 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006100.1"; gene_id "LTnewLTref_340006100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 48185 48874 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006200.1"; gene_id "LTnewLTref_340006200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 48185 48874 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006200.1"; gene_id "LTnewLTref_340006200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 49976 51004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006300.1"; gene_id "LTnewLTref_340006300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 49976 51004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006300.1"; gene_id "LTnewLTref_340006300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 51721 52674 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006400.1"; gene_id "LTnewLTref_340006400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 51721 52674 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006400.1"; gene_id "LTnewLTref_340006400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 55905 56900 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006500.1"; gene_id "LTnewLTref_340006500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 55905 56900 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006500.1"; gene_id "LTnewLTref_340006500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 59074 60051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006600.1"; gene_id "LTnewLTref_340006600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 59074 60051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006600.1"; gene_id "LTnewLTref_340006600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 60682 61133 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_340006700.1"; gene_id "LTnewLTref_340006700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 60682 60712 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006700.1"; gene_id "LTnewLTref_340006700"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 60889 61133 0.77 + 2 transcript_id "LTnewLTref_340006700.1"; gene_id "LTnewLTref_340006700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 62069 63028 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006800.1"; gene_id "LTnewLTref_340006800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 62069 63028 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006800.1"; gene_id "LTnewLTref_340006800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 63958 65826 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340006900.1"; gene_id "LTnewLTref_340006900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 63958 65826 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340006900.1"; gene_id "LTnewLTref_340006900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 69836 72133 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007000.1"; gene_id "LTnewLTref_340007000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 69836 72133 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007000.1"; gene_id "LTnewLTref_340007000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 72964 74439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007100.1"; gene_id "LTnewLTref_340007100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 72964 74439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007100.1"; gene_id "LTnewLTref_340007100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 77794 79347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007200.1"; gene_id "LTnewLTref_340007200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 77794 79347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007200.1"; gene_id "LTnewLTref_340007200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 81817 82446 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007300.1"; gene_id "LTnewLTref_340007300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 81817 82446 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007300.1"; gene_id "LTnewLTref_340007300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 83201 84208 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007400.1"; gene_id "LTnewLTref_340007400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 83201 84208 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007400.1"; gene_id "LTnewLTref_340007400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 85322 87481 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007500.1"; gene_id "LTnewLTref_340007500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 85322 87481 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007500.1"; gene_id "LTnewLTref_340007500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 88764 92897 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007600.1"; gene_id "LTnewLTref_340007600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 88764 92897 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007600.1"; gene_id "LTnewLTref_340007600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 93869 95122 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007700.1"; gene_id "LTnewLTref_340007700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 93869 95122 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007700.1"; gene_id "LTnewLTref_340007700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 96577 96939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007800.1"; gene_id "LTnewLTref_340007800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 96577 96939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007800.1"; gene_id "LTnewLTref_340007800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 97772 100153 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340007900.1"; gene_id "LTnewLTref_340007900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 97772 100153 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340007900.1"; gene_id "LTnewLTref_340007900"; CM024320.1 Liftoff transcript 102407 107248 . + . transcript_id "LTnewLTref_340008000.1"; gene_id "LTnewLTref_340008000" CM024320.1 Liftoff CDS 102407 107248 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008000.1"; gene_id "LTnewLTref_340008000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 109418 111457 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008100.1"; gene_id "LTnewLTref_340008100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 109418 111457 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008100.1"; gene_id "LTnewLTref_340008100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 112777 115044 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008200.1"; gene_id "LTnewLTref_340008200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 112777 115044 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008200.1"; gene_id "LTnewLTref_340008200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 116337 118442 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008300.1"; gene_id "LTnewLTref_340008300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 116337 118442 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008300.1"; gene_id "LTnewLTref_340008300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 120367 121443 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008400.1"; gene_id "LTnewLTref_340008400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 120367 121443 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008400.1"; gene_id "LTnewLTref_340008400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 123270 123608 0.73 + . transcript_id "LTnewLTref_340008500.1"; gene_id "LTnewLTref_340008500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 123270 123529 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008500.1"; gene_id "LTnewLTref_340008500"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 123599 123608 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_340008500.1"; gene_id "LTnewLTref_340008500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 124772 126577 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008600.1"; gene_id "LTnewLTref_340008600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 124772 126577 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008600.1"; gene_id "LTnewLTref_340008600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 127735 130137 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008700.1"; gene_id "LTnewLTref_340008700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 127735 130137 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008700.1"; gene_id "LTnewLTref_340008700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 131504 132640 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008800.1"; gene_id "LTnewLTref_340008800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 131504 132640 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008800.1"; gene_id "LTnewLTref_340008800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 133769 138541 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340008900.1"; gene_id "LTnewLTref_340008900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 133769 138541 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340008900.1"; gene_id "LTnewLTref_340008900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 139282 142734 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009000.1"; gene_id "LTnewLTref_340009000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 139282 142734 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009000.1"; gene_id "LTnewLTref_340009000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 143745 145463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009100.1"; gene_id "LTnewLTref_340009100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 143745 145463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009100.1"; gene_id "LTnewLTref_340009100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 146018 147736 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009200.1"; gene_id "LTnewLTref_340009200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 146018 147736 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009200.1"; gene_id "LTnewLTref_340009200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 148357 148836 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009300.1"; gene_id "LTnewLTref_340009300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 148357 148836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009300.1"; gene_id "LTnewLTref_340009300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 149497 150759 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009400.1"; gene_id "LTnewLTref_340009400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 149497 150759 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009400.1"; gene_id "LTnewLTref_340009400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 152363 154057 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009500.1"; gene_id "LTnewLTref_340009500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 152363 154057 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009500.1"; gene_id "LTnewLTref_340009500"; CM024320.1 . transcript 154856 156206 . + . transcript_id "LTnewLTref_340009600.1"; gene_id "LTnewLTref_340009600:pseudogene" CM024320.1 . exon 154856 156206 . + . transcript_id "LTnewLTref_340009600.1"; gene_id "LTnewLTref_340009600:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 156864 157226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009700.1"; gene_id "LTnewLTref_340009700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 156864 157226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009700.1"; gene_id "LTnewLTref_340009700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 159615 162497 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009800.1"; gene_id "LTnewLTref_340009800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 159615 162497 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009800.1"; gene_id "LTnewLTref_340009800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 164019 171233 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340009900.1"; gene_id "LTnewLTref_340009900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 164019 171233 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340009900.1"; gene_id "LTnewLTref_340009900"; CM024320.1 Liftoff transcript 174029 174242 . + . transcript_id "LTnewLTref_340010000.1"; gene_id "LTnewLTref_340010000" CM024320.1 Liftoff CDS 174029 174242 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010000.1"; gene_id "LTnewLTref_340010000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 175882 178035 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340010100.1"; gene_id "LTnewLTref_340010100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 175882 178035 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010100.1"; gene_id "LTnewLTref_340010100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 178961 179519 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340010200.1"; gene_id "LTnewLTref_340010200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 178961 179404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010200.1"; gene_id "LTnewLTref_340010200"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 179508 179519 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010200.1"; gene_id "LTnewLTref_340010200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 182056 190365 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_340010300.1"; gene_id "LTnewLTref_340010300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 182056 190365 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010300.1"; gene_id "LTnewLTref_340010300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 192209 194821 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340010400.1"; gene_id "LTnewLTref_340010400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 192209 194821 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010400.1"; gene_id "LTnewLTref_340010400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 196253 196663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340010500.1"; gene_id "LTnewLTref_340010500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 196253 196663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010500.1"; gene_id "LTnewLTref_340010500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 196705 197094 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_340010600.1"; gene_id "LTnewLTref_340010600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 196705 197094 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010600.1"; gene_id "LTnewLTref_340010600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 199507 200280 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340010700.1"; gene_id "LTnewLTref_340010700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 199507 200280 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010700.1"; gene_id "LTnewLTref_340010700"; CM024320.1 . transcript 201812 202251 . + . transcript_id "LTnewLTref_340010800.1"; gene_id "LTnewLTref_340010800:pseudogene" CM024320.1 . exon 201812 202251 . + . transcript_id "LTnewLTref_340010800.1"; gene_id "LTnewLTref_340010800:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 202555 202842 0.71 + . transcript_id "LTnewLTref_340010900.1"; gene_id "LTnewLTref_340010900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 202555 202842 0.71 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340010900.1"; gene_id "LTnewLTref_340010900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 211221 213929 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011000.1"; gene_id "LTnewLTref_340011000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 211221 213929 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011000.1"; gene_id "LTnewLTref_340011000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 215480 220387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011100.1"; gene_id "LTnewLTref_340011100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 215480 220387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011100.1"; gene_id "LTnewLTref_340011100"; CM024320.1 Liftoff transcript 221675 223690 . + . transcript_id "LTnewLTref_340011200.1"; gene_id "LTnewLTref_340011200" CM024320.1 Liftoff CDS 221675 223690 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011200.1"; gene_id "LTnewLTref_340011200"; CM024320.1 Liftoff transcript 225309 225510 . + . transcript_id "LTnewLTref_340011300.1"; gene_id "LTnewLTref_340011300" CM024320.1 Liftoff CDS 225309 225510 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011300.1"; gene_id "LTnewLTref_340011300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 226748 227917 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011400.1"; gene_id "LTnewLTref_340011400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 226748 227917 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011400.1"; gene_id "LTnewLTref_340011400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 230072 231937 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011500.1"; gene_id "LTnewLTref_340011500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 230072 231937 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011500.1"; gene_id "LTnewLTref_340011500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 239973 245612 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011600.1"; gene_id "LTnewLTref_340011600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 239973 245612 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011600.1"; gene_id "LTnewLTref_340011600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 247232 249736 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011700.1"; gene_id "LTnewLTref_340011700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 247232 249736 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011700.1"; gene_id "LTnewLTref_340011700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 250570 250938 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340011800.1"; gene_id "LTnewLTref_340011800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 250570 250938 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011800.1"; gene_id "LTnewLTref_340011800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 252034 255770 0.49 + . transcript_id "LTnewLTref_340011900.1"; gene_id "LTnewLTref_340011900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 252034 252814 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340011900.1"; gene_id "LTnewLTref_340011900"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 252883 255770 0.64 + 2 transcript_id "LTnewLTref_340011900.1"; gene_id "LTnewLTref_340011900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 256791 259328 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012000.1"; gene_id "LTnewLTref_340012000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 256791 259328 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012000.1"; gene_id "LTnewLTref_340012000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 261008 261961 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012100.1"; gene_id "LTnewLTref_340012100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 261008 261961 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012100.1"; gene_id "LTnewLTref_340012100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 262813 263049 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_340012200.1"; gene_id "LTnewLTref_340012200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 262813 263049 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012200.1"; gene_id "LTnewLTref_340012200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 263973 264551 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012300.1"; gene_id "LTnewLTref_340012300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 263973 264551 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012300.1"; gene_id "LTnewLTref_340012300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 269575 276753 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012400.1"; gene_id "LTnewLTref_340012400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 269575 276753 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012400.1"; gene_id "LTnewLTref_340012400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 278168 281161 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012500.1"; gene_id "LTnewLTref_340012500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 278168 281161 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012500.1"; gene_id "LTnewLTref_340012500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 282228 285362 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012600.1"; gene_id "LTnewLTref_340012600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 282228 285362 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012600.1"; gene_id "LTnewLTref_340012600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 287436 288365 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012700.1"; gene_id "LTnewLTref_340012700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 287436 288365 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012700.1"; gene_id "LTnewLTref_340012700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 290568 293879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012800.1"; gene_id "LTnewLTref_340012800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 290568 293879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012800.1"; gene_id "LTnewLTref_340012800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 296231 302497 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340012900.1"; gene_id "LTnewLTref_340012900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 296231 302497 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340012900.1"; gene_id "LTnewLTref_340012900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 308697 313339 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_340013000.1"; gene_id "LTnewLTref_340013000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 308697 310946 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013000.1"; gene_id "LTnewLTref_340013000"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 311000 313339 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013000.1"; gene_id "LTnewLTref_340013000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 310693 313339 0.24 - . transcript_id "LTnewLTref_340013000.2"; gene_id "LTnewLTref_340013000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 310693 310705 0.98 - 1 transcript_id "LTnewLTref_340013000.2"; gene_id "LTnewLTref_340013000"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 310749 313339 0.24 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013000.2"; gene_id "LTnewLTref_340013000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 313956 315362 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340013100.1"; gene_id "LTnewLTref_340013100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 313956 315362 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013100.1"; gene_id "LTnewLTref_340013100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 317620 318255 0.93 - . transcript_id "LTnewLTref_340013200.1"; gene_id "LTnewLTref_340013200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 317620 318255 0.93 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013200.1"; gene_id "LTnewLTref_340013200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 318318 324618 0.79 - . transcript_id "LTnewLTref_340013300.1"; gene_id "LTnewLTref_340013300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 318318 319643 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013300.1"; gene_id "LTnewLTref_340013300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 319744 324618 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340013300.1"; gene_id "LTnewLTref_340013300"; CM024320.1 . transcript 325633 329160 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene" CM024320.1 . exon 325633 325719 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 325722 325844 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 325846 326037 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 326040 326249 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 326291 326392 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 326395 326415 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 326532 326930 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 . exon 326932 329160 . - . transcript_id "LTnewLTref_340013400.1"; gene_id "LTnewLTref_340013400:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 332624 333167 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_340013500.1"; gene_id "LTnewLTref_340013500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 332624 332804 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340013500.1"; gene_id "LTnewLTref_340013500"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 333133 333167 0.56 + 2 transcript_id "LTnewLTref_340013500.1"; gene_id "LTnewLTref_340013500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 332624 333253 0.49 + . transcript_id "LTnewLTref_340013500.2"; gene_id "LTnewLTref_340013500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 332624 333253 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340013500.2"; gene_id "LTnewLTref_340013500"; CM024320.1 . transcript 334570 336942 . + . transcript_id "LTnewLTref_340013600.1"; gene_id "LTnewLTref_340013600:pseudogene" CM024320.1 . exon 334570 336942 . + . transcript_id "LTnewLTref_340013600.1"; gene_id "LTnewLTref_340013600:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 337428 338918 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340013700.1"; gene_id "LTnewLTref_340013700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 337428 338918 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340013700.1"; gene_id "LTnewLTref_340013700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 340342 341184 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340013800.1"; gene_id "LTnewLTref_340013800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 340342 341184 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340013800.1"; gene_id "LTnewLTref_340013800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 342264 343670 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340013900.1"; gene_id "LTnewLTref_340013900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 342264 343670 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340013900.1"; gene_id "LTnewLTref_340013900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 344715 346241 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014000.1"; gene_id "LTnewLTref_340014000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 344715 346241 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014000.1"; gene_id "LTnewLTref_340014000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 348160 349569 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014100.1"; gene_id "LTnewLTref_340014100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 348160 349569 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014100.1"; gene_id "LTnewLTref_340014100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 350520 351158 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014200.1"; gene_id "LTnewLTref_340014200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 350520 351158 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014200.1"; gene_id "LTnewLTref_340014200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 355340 356191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014300.1"; gene_id "LTnewLTref_340014300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 355340 356191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014300.1"; gene_id "LTnewLTref_340014300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 360284 361198 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014400.1"; gene_id "LTnewLTref_340014400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 360284 361198 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014400.1"; gene_id "LTnewLTref_340014400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 364328 365230 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014500.1"; gene_id "LTnewLTref_340014500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 364328 365230 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014500.1"; gene_id "LTnewLTref_340014500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 367916 368821 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014600.1"; gene_id "LTnewLTref_340014600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 367916 368821 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014600.1"; gene_id "LTnewLTref_340014600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 374090 374467 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014700.1"; gene_id "LTnewLTref_340014700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 374090 374467 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014700.1"; gene_id "LTnewLTref_340014700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 375255 375968 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014800.1"; gene_id "LTnewLTref_340014800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 375255 375968 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014800.1"; gene_id "LTnewLTref_340014800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 378147 378380 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340014900.1"; gene_id "LTnewLTref_340014900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 378147 378380 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340014900.1"; gene_id "LTnewLTref_340014900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 381476 382189 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340015000.1"; gene_id "LTnewLTref_340015000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 381476 382189 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015000.1"; gene_id "LTnewLTref_340015000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 384857 386128 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340015100.1"; gene_id "LTnewLTref_340015100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 384857 386128 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015100.1"; gene_id "LTnewLTref_340015100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 387737 388405 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340015200.1"; gene_id "LTnewLTref_340015200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 387737 388405 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015200.1"; gene_id "LTnewLTref_340015200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 389326 391008 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340015300.1"; gene_id "LTnewLTref_340015300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 389326 391008 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015300.1"; gene_id "LTnewLTref_340015300"; CM024320.1 Liftoff transcript 392313 395108 . + . transcript_id "LTnewLTref_340015400.1"; gene_id "LTnewLTref_340015400" CM024320.1 Liftoff CDS 392313 395108 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015400.1"; gene_id "LTnewLTref_340015400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 396130 396609 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340015500.1"; gene_id "LTnewLTref_340015500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 396130 396609 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015500.1"; gene_id "LTnewLTref_340015500"; CM024320.1 Liftoff transcript 398274 398831 . + . transcript_id "LTnewLTref_340015600.1"; gene_id "LTnewLTref_340015600" CM024320.1 Liftoff CDS 398274 398831 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015600.1"; gene_id "LTnewLTref_340015600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 400915 401784 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340015700.1"; gene_id "LTnewLTref_340015700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 400915 401784 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015700.1"; gene_id "LTnewLTref_340015700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 402661 403164 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_340015800.1"; gene_id "LTnewLTref_340015800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 402661 403164 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015800.1"; gene_id "LTnewLTref_340015800"; CM024320.1 Liftoff transcript 404879 407185 . + . transcript_id "LTnewLTref_340015900.1"; gene_id "LTnewLTref_340015900" CM024320.1 Liftoff CDS 404879 407185 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340015900.1"; gene_id "LTnewLTref_340015900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 408248 408571 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016000.1"; gene_id "LTnewLTref_340016000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 408248 408571 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016000.1"; gene_id "LTnewLTref_340016000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 410523 413525 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016100.1"; gene_id "LTnewLTref_340016100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 410523 413525 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016100.1"; gene_id "LTnewLTref_340016100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 415694 418399 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016200.1"; gene_id "LTnewLTref_340016200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 415694 418399 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016200.1"; gene_id "LTnewLTref_340016200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 422172 422691 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_340016300.1"; gene_id "LTnewLTref_340016300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 422172 422458 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016300.1"; gene_id "LTnewLTref_340016300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 422505 422691 0.99 + 1 transcript_id "LTnewLTref_340016300.1"; gene_id "LTnewLTref_340016300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 426359 426958 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016400.1"; gene_id "LTnewLTref_340016400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 426359 426958 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016400.1"; gene_id "LTnewLTref_340016400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 431152 431763 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016500.1"; gene_id "LTnewLTref_340016500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 431152 431763 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016500.1"; gene_id "LTnewLTref_340016500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 438264 438845 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016600.1"; gene_id "LTnewLTref_340016600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 438264 438845 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016600.1"; gene_id "LTnewLTref_340016600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 447757 451782 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016700.1"; gene_id "LTnewLTref_340016700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 447757 451782 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016700.1"; gene_id "LTnewLTref_340016700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 455418 459536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016800.1"; gene_id "LTnewLTref_340016800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 455418 459536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016800.1"; gene_id "LTnewLTref_340016800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 460247 462097 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340016900.1"; gene_id "LTnewLTref_340016900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 460247 462097 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340016900.1"; gene_id "LTnewLTref_340016900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 462962 464332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340017000.1"; gene_id "LTnewLTref_340017000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 462962 464332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340017000.1"; gene_id "LTnewLTref_340017000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 468480 469637 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340017100.1"; gene_id "LTnewLTref_340017100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 468480 469637 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340017100.1"; gene_id "LTnewLTref_340017100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 471056 471784 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340017200.1"; gene_id "LTnewLTref_340017200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 471056 471784 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340017200.1"; gene_id "LTnewLTref_340017200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 474153 476255 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340017300.1"; gene_id "LTnewLTref_340017300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 474153 476255 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340017300.1"; gene_id "LTnewLTref_340017300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 479924 482290 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340017400.1"; gene_id "LTnewLTref_340017400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 479924 482290 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340017400.1"; gene_id "LTnewLTref_340017400"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 482652 482726 . - . transcript_id "LTnewLTref_340017500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017500" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 482652 482726 . - . transcript_id "LTnewLTref_340017500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017500"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 482966 483040 . + . transcript_id "LTnewLTref_340017600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017600" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 482966 483040 . + . transcript_id "LTnewLTref_340017600:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017600"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 483095 483167 . + . transcript_id "LTnewLTref_340017700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017700" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 483095 483167 . + . transcript_id "LTnewLTref_340017700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017700"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 483198 483279 . - . transcript_id "LTnewLTref_340017800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017800" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 483198 483279 . - . transcript_id "LTnewLTref_340017800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017800"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 483354 483434 . + . transcript_id "LTnewLTref_340017900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017900" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 483354 483434 . + . transcript_id "LTnewLTref_340017900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340017900"; CM024320.1 . transcript 484379 487456 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018000.1"; gene_id "LTnewLTref_340018000" CM024320.1 . CDS 484379 487456 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018000.1"; gene_id "LTnewLTref_340018000"; CM024320.1 Liftoff transcript 489862 490263 . + . transcript_id "LTnewLTref_340018100.1"; gene_id "LTnewLTref_340018100" CM024320.1 Liftoff CDS 489862 490263 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340018100.1"; gene_id "LTnewLTref_340018100"; CM024320.1 . transcript 490197 491199 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene" CM024320.1 . exon 490197 490367 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 490370 490465 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 490468 490734 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 490737 490787 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 490790 490792 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 490795 490902 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 490904 491119 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . exon 491122 491199 . - . transcript_id "LTnewLTref_340018200.1"; gene_id "LTnewLTref_340018200:pseudogene"; CM024320.1 . transcript 491864 492425 . + . transcript_id "LTnewLTref_340018300.1"; gene_id "LTnewLTref_340018300:pseudogene" CM024320.1 . exon 491864 492425 . + . transcript_id "LTnewLTref_340018300.1"; gene_id "LTnewLTref_340018300:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 492440 492832 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340018400.1"; gene_id "LTnewLTref_340018400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 492440 492832 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340018400.1"; gene_id "LTnewLTref_340018400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 495804 496439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340018500.1"; gene_id "LTnewLTref_340018500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 495804 496439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018500.1"; gene_id "LTnewLTref_340018500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 497610 499370 0.55 - . transcript_id "LTnewLTref_340018600.1"; gene_id "LTnewLTref_340018600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 497610 497898 0.98 - 1 transcript_id "LTnewLTref_340018600.1"; gene_id "LTnewLTref_340018600"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 499027 499370 0.55 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018600.1"; gene_id "LTnewLTref_340018600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 500965 501605 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_340018700.1"; gene_id "LTnewLTref_340018700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 500965 501051 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018700.1"; gene_id "LTnewLTref_340018700"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 501465 501605 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018700.1"; gene_id "LTnewLTref_340018700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 504131 504559 0.52 - . transcript_id "LTnewLTref_340018800.1"; gene_id "LTnewLTref_340018800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 504131 504559 0.52 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018800.1"; gene_id "LTnewLTref_340018800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 506201 506899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340018900.1"; gene_id "LTnewLTref_340018900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 506201 506899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340018900.1"; gene_id "LTnewLTref_340018900"; CM024320.1 Liftoff transcript 507965 508144 . - . transcript_id "LTnewLTref_340019000.1"; gene_id "LTnewLTref_340019000" CM024320.1 Liftoff CDS 507965 508144 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019000.1"; gene_id "LTnewLTref_340019000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 508159 508362 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340019100.1"; gene_id "LTnewLTref_340019100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 508159 508362 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019100.1"; gene_id "LTnewLTref_340019100"; CM024320.1 . transcript 508581 508937 . + . transcript_id "LTnewLTref_340019200.1"; gene_id "LTnewLTref_340019200" CM024320.1 . CDS 508581 508937 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340019200.1"; gene_id "LTnewLTref_340019200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 508695 509479 0.67 - . transcript_id "LTnewLTref_340019300.1"; gene_id "LTnewLTref_340019300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 508695 508833 0.67 - 1 transcript_id "LTnewLTref_340019300.1"; gene_id "LTnewLTref_340019300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 509349 509479 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019300.1"; gene_id "LTnewLTref_340019300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 511832 516127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340019400.1"; gene_id "LTnewLTref_340019400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 511832 516127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019400.1"; gene_id "LTnewLTref_340019400"; CM024320.1 . transcript 518651 518890 . - . transcript_id "LTnewLTref_340019500.1"; gene_id "LTnewLTref_340019500:pseudogene" CM024320.1 . exon 518651 518890 . - . transcript_id "LTnewLTref_340019500.1"; gene_id "LTnewLTref_340019500:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 520203 521873 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340019600.1"; gene_id "LTnewLTref_340019600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 520203 521873 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019600.1"; gene_id "LTnewLTref_340019600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 523063 524670 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340019700.1"; gene_id "LTnewLTref_340019700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 523063 524670 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019700.1"; gene_id "LTnewLTref_340019700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 526028 526825 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340019800.1"; gene_id "LTnewLTref_340019800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 526028 526825 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019800.1"; gene_id "LTnewLTref_340019800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 527962 528743 0.28 - . transcript_id "LTnewLTref_340019900.1"; gene_id "LTnewLTref_340019900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 527962 528566 0.51 - 2 transcript_id "LTnewLTref_340019900.1"; gene_id "LTnewLTref_340019900"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 528701 528743 0.28 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019900.1"; gene_id "LTnewLTref_340019900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 527962 535593 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340019900.2"; gene_id "LTnewLTref_340019900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 527962 535593 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340019900.2"; gene_id "LTnewLTref_340019900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 536385 537866 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020000.1"; gene_id "LTnewLTref_340020000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 536385 537866 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020000.1"; gene_id "LTnewLTref_340020000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 538587 540026 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020100.1"; gene_id "LTnewLTref_340020100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 538587 540026 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020100.1"; gene_id "LTnewLTref_340020100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 541257 541871 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020200.1"; gene_id "LTnewLTref_340020200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 541257 541871 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020200.1"; gene_id "LTnewLTref_340020200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 543209 544561 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020300.1"; gene_id "LTnewLTref_340020300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 543209 544561 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020300.1"; gene_id "LTnewLTref_340020300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 546711 547250 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020400.1"; gene_id "LTnewLTref_340020400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 546711 547250 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020400.1"; gene_id "LTnewLTref_340020400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 549959 551956 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020500.1"; gene_id "LTnewLTref_340020500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 549959 551956 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020500.1"; gene_id "LTnewLTref_340020500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 554537 555367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020600.1"; gene_id "LTnewLTref_340020600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 554537 555367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020600.1"; gene_id "LTnewLTref_340020600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 555826 557793 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020700.1"; gene_id "LTnewLTref_340020700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 555826 557793 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020700.1"; gene_id "LTnewLTref_340020700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 558652 564126 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020800.1"; gene_id "LTnewLTref_340020800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 558652 564126 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020800.1"; gene_id "LTnewLTref_340020800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 565166 565912 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340020900.1"; gene_id "LTnewLTref_340020900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 565166 565912 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340020900.1"; gene_id "LTnewLTref_340020900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 566762 568465 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021000.1"; gene_id "LTnewLTref_340021000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 566762 568465 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021000.1"; gene_id "LTnewLTref_340021000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 570738 573032 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021100.1"; gene_id "LTnewLTref_340021100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 570738 573032 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021100.1"; gene_id "LTnewLTref_340021100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 576238 580998 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021200.1"; gene_id "LTnewLTref_340021200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 576238 580998 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021200.1"; gene_id "LTnewLTref_340021200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 581350 583098 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021300.1"; gene_id "LTnewLTref_340021300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 581350 583098 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021300.1"; gene_id "LTnewLTref_340021300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 584435 584713 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021400.1"; gene_id "LTnewLTref_340021400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 584435 584713 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021400.1"; gene_id "LTnewLTref_340021400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 585191 586267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021500.1"; gene_id "LTnewLTref_340021500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 585191 586267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021500.1"; gene_id "LTnewLTref_340021500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 587007 590768 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021600.1"; gene_id "LTnewLTref_340021600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 587007 590768 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021600.1"; gene_id "LTnewLTref_340021600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 592621 598215 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021700.1"; gene_id "LTnewLTref_340021700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 592621 598215 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021700.1"; gene_id "LTnewLTref_340021700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 598690 599730 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340021800.1"; gene_id "LTnewLTref_340021800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 598690 599730 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021800.1"; gene_id "LTnewLTref_340021800"; CM024320.1 Liftoff transcript 601114 603372 . - . transcript_id "LTnewLTref_340021900.1"; gene_id "LTnewLTref_340021900" CM024320.1 Liftoff CDS 601114 603372 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340021900.1"; gene_id "LTnewLTref_340021900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 604953 606032 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022000.1"; gene_id "LTnewLTref_340022000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 604953 606032 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022000.1"; gene_id "LTnewLTref_340022000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 608220 611084 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022100.1"; gene_id "LTnewLTref_340022100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 608220 611084 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022100.1"; gene_id "LTnewLTref_340022100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 613223 615577 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022200.1"; gene_id "LTnewLTref_340022200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 613223 615577 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022200.1"; gene_id "LTnewLTref_340022200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 617867 619348 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022300.1"; gene_id "LTnewLTref_340022300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 617867 619348 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022300.1"; gene_id "LTnewLTref_340022300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 619821 623786 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022400.1"; gene_id "LTnewLTref_340022400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 619821 623786 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022400.1"; gene_id "LTnewLTref_340022400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 625167 626888 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022500.1"; gene_id "LTnewLTref_340022500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 625167 626888 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022500.1"; gene_id "LTnewLTref_340022500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 627992 635827 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022600.1"; gene_id "LTnewLTref_340022600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 627992 635827 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022600.1"; gene_id "LTnewLTref_340022600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 627992 636157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022600.2"; gene_id "LTnewLTref_340022600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 627992 636157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022600.2"; gene_id "LTnewLTref_340022600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 637931 638911 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022700.1"; gene_id "LTnewLTref_340022700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 637931 638911 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022700.1"; gene_id "LTnewLTref_340022700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 639998 643906 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022800.1"; gene_id "LTnewLTref_340022800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 639998 643906 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022800.1"; gene_id "LTnewLTref_340022800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 647321 661711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340022900.1"; gene_id "LTnewLTref_340022900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 647321 661711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340022900.1"; gene_id "LTnewLTref_340022900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 664137 665117 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023000.1"; gene_id "LTnewLTref_340023000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 664137 665117 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023000.1"; gene_id "LTnewLTref_340023000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 666923 667930 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023100.1"; gene_id "LTnewLTref_340023100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 666923 667930 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023100.1"; gene_id "LTnewLTref_340023100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 668926 669933 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023200.1"; gene_id "LTnewLTref_340023200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 668926 669933 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023200.1"; gene_id "LTnewLTref_340023200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 671291 672124 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023300.1"; gene_id "LTnewLTref_340023300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 671291 672124 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023300.1"; gene_id "LTnewLTref_340023300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 673096 674826 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023400.1"; gene_id "LTnewLTref_340023400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 673096 674826 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023400.1"; gene_id "LTnewLTref_340023400"; CM024320.1 Liftoff transcript 676705 676899 . - . transcript_id "LTnewLTref_340023500.1"; gene_id "LTnewLTref_340023500" CM024320.1 Liftoff CDS 676705 676899 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023500.1"; gene_id "LTnewLTref_340023500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 678273 681260 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023600.1"; gene_id "LTnewLTref_340023600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 678273 681260 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023600.1"; gene_id "LTnewLTref_340023600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 684281 686314 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023700.1"; gene_id "LTnewLTref_340023700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 684281 686314 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023700.1"; gene_id "LTnewLTref_340023700"; CM024320.1 Liftoff transcript 687452 689686 . - . transcript_id "LTnewLTref_340023800.1"; gene_id "LTnewLTref_340023800" CM024320.1 Liftoff CDS 687452 689686 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023800.1"; gene_id "LTnewLTref_340023800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 690402 691586 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340023900.1"; gene_id "LTnewLTref_340023900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 690402 691586 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340023900.1"; gene_id "LTnewLTref_340023900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 692422 695427 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024000.1"; gene_id "LTnewLTref_340024000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 692422 695427 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024000.1"; gene_id "LTnewLTref_340024000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 697498 698556 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024100.1"; gene_id "LTnewLTref_340024100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 697498 698556 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024100.1"; gene_id "LTnewLTref_340024100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 700124 700603 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_340024200.1"; gene_id "LTnewLTref_340024200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 700124 700603 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024200.1"; gene_id "LTnewLTref_340024200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 704295 706706 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024300.1"; gene_id "LTnewLTref_340024300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 704295 706706 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024300.1"; gene_id "LTnewLTref_340024300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 709330 711027 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024400.1"; gene_id "LTnewLTref_340024400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 709330 711027 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024400.1"; gene_id "LTnewLTref_340024400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 713344 713805 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024500.1"; gene_id "LTnewLTref_340024500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 713344 713805 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024500.1"; gene_id "LTnewLTref_340024500"; CM024320.1 . transcript 715276 715704 . - . transcript_id "LTnewLTref_340024600.1"; gene_id "LTnewLTref_340024600:pseudogene" CM024320.1 . exon 715276 715704 . - . transcript_id "LTnewLTref_340024600.1"; gene_id "LTnewLTref_340024600:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 716479 719685 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024700.1"; gene_id "LTnewLTref_340024700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 716479 719685 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024700.1"; gene_id "LTnewLTref_340024700"; CM024320.1 . transcript 720548 722881 . - . transcript_id "LTnewLTref_340024800.1"; gene_id "LTnewLTref_340024800:pseudogene" CM024320.1 . exon 720548 722881 . - . transcript_id "LTnewLTref_340024800.1"; gene_id "LTnewLTref_340024800:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 723948 724448 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340024900.1"; gene_id "LTnewLTref_340024900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 723948 724448 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340024900.1"; gene_id "LTnewLTref_340024900"; CM024320.1 . transcript 726836 727492 . - . transcript_id "LTnewLTref_340025000.1"; gene_id "LTnewLTref_340025000:pseudogene" CM024320.1 . exon 726836 727492 . - . transcript_id "LTnewLTref_340025000.1"; gene_id "LTnewLTref_340025000:pseudogene"; CM024320.1 . transcript 727986 728673 . - . transcript_id "LTnewLTref_340025100.1"; gene_id "LTnewLTref_340025100:pseudogene" CM024320.1 . exon 727986 728673 . - . transcript_id "LTnewLTref_340025100.1"; gene_id "LTnewLTref_340025100:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 728708 730094 0.56 - . transcript_id "LTnewLTref_340025200.1"; gene_id "LTnewLTref_340025200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 728708 729019 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025200.1"; gene_id "LTnewLTref_340025200"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 729981 730094 0.57 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025200.1"; gene_id "LTnewLTref_340025200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 732536 732865 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340025300.1"; gene_id "LTnewLTref_340025300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 732536 732865 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025300.1"; gene_id "LTnewLTref_340025300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 734008 735938 0.53 - . transcript_id "LTnewLTref_340025400.1"; gene_id "LTnewLTref_340025400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 734008 735707 0.91 - 2 transcript_id "LTnewLTref_340025400.1"; gene_id "LTnewLTref_340025400"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 735797 735938 0.53 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025400.1"; gene_id "LTnewLTref_340025400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 738592 738852 0.94 - . transcript_id "LTnewLTref_340025500.1"; gene_id "LTnewLTref_340025500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 738592 738852 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025500.1"; gene_id "LTnewLTref_340025500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 738891 739190 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_340025600.1"; gene_id "LTnewLTref_340025600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 738891 739190 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025600.1"; gene_id "LTnewLTref_340025600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 743104 743694 0.67 - . transcript_id "LTnewLTref_340025700.1"; gene_id "LTnewLTref_340025700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 743104 743252 0.94 - 2 transcript_id "LTnewLTref_340025700.1"; gene_id "LTnewLTref_340025700"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 743547 743694 0.69 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025700.1"; gene_id "LTnewLTref_340025700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 744965 748084 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340025800.1"; gene_id "LTnewLTref_340025800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 744965 748084 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025800.1"; gene_id "LTnewLTref_340025800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 751223 752056 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340025900.1"; gene_id "LTnewLTref_340025900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 751223 752056 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340025900.1"; gene_id "LTnewLTref_340025900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 753982 754461 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026000.1"; gene_id "LTnewLTref_340026000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 753982 754461 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026000.1"; gene_id "LTnewLTref_340026000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 756261 758150 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026100.1"; gene_id "LTnewLTref_340026100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 756261 758150 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026100.1"; gene_id "LTnewLTref_340026100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 759746 763480 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026200.1"; gene_id "LTnewLTref_340026200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 759746 763480 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026200.1"; gene_id "LTnewLTref_340026200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 771297 772607 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026300.1"; gene_id "LTnewLTref_340026300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 771297 772607 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026300.1"; gene_id "LTnewLTref_340026300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 777688 780099 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026400.1"; gene_id "LTnewLTref_340026400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 777688 780099 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026400.1"; gene_id "LTnewLTref_340026400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 780935 781882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026500.1"; gene_id "LTnewLTref_340026500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 780935 781882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026500.1"; gene_id "LTnewLTref_340026500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 783550 786936 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026600.1"; gene_id "LTnewLTref_340026600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 783550 786936 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026600.1"; gene_id "LTnewLTref_340026600"; CM024320.1 . transcript 789114 789405 . - . transcript_id "LTnewLTref_340026700.1"; gene_id "LTnewLTref_340026700:pseudogene" CM024320.1 . exon 789114 789405 . - . transcript_id "LTnewLTref_340026700.1"; gene_id "LTnewLTref_340026700:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 790931 791881 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026800.1"; gene_id "LTnewLTref_340026800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 790931 791881 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026800.1"; gene_id "LTnewLTref_340026800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 793445 799321 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340026900.1"; gene_id "LTnewLTref_340026900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 793445 799321 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340026900.1"; gene_id "LTnewLTref_340026900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 800778 801935 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027000.1"; gene_id "LTnewLTref_340027000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 800778 801935 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027000.1"; gene_id "LTnewLTref_340027000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 804387 807428 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027100.1"; gene_id "LTnewLTref_340027100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 804387 807428 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027100.1"; gene_id "LTnewLTref_340027100"; CM024320.1 Liftoff transcript 808934 809119 . - . transcript_id "LTnewLTref_340027200.1"; gene_id "LTnewLTref_340027200" CM024320.1 Liftoff CDS 808934 809119 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027200.1"; gene_id "LTnewLTref_340027200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 810487 812976 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027300.1"; gene_id "LTnewLTref_340027300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 810487 812976 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027300.1"; gene_id "LTnewLTref_340027300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 814489 815409 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027400.1"; gene_id "LTnewLTref_340027400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 814489 815409 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027400.1"; gene_id "LTnewLTref_340027400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 816759 817001 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027500.1"; gene_id "LTnewLTref_340027500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 816759 817001 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027500.1"; gene_id "LTnewLTref_340027500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 818429 818899 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027600.1"; gene_id "LTnewLTref_340027600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 818429 818899 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027600.1"; gene_id "LTnewLTref_340027600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 820075 820806 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027700.1"; gene_id "LTnewLTref_340027700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 820075 820806 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027700.1"; gene_id "LTnewLTref_340027700"; CM024320.1 Liftoff transcript 822771 822956 . - . transcript_id "LTnewLTref_340027800.1"; gene_id "LTnewLTref_340027800" CM024320.1 Liftoff CDS 822771 822956 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027800.1"; gene_id "LTnewLTref_340027800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 824967 829367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340027900.1"; gene_id "LTnewLTref_340027900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 824967 829367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340027900.1"; gene_id "LTnewLTref_340027900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 831177 832652 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028000.1"; gene_id "LTnewLTref_340028000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 831177 832652 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028000.1"; gene_id "LTnewLTref_340028000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 833981 835687 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028100.1"; gene_id "LTnewLTref_340028100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 833981 835687 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028100.1"; gene_id "LTnewLTref_340028100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 836568 841205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028200.1"; gene_id "LTnewLTref_340028200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 836568 841205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028200.1"; gene_id "LTnewLTref_340028200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 848997 853742 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028300.1"; gene_id "LTnewLTref_340028300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 848997 853742 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028300.1"; gene_id "LTnewLTref_340028300"; CM024320.1 . transcript 857028 857245 . - . transcript_id "LTnewLTref_340028400.1"; gene_id "LTnewLTref_340028400:pseudogene" CM024320.1 . exon 857028 857245 . - . transcript_id "LTnewLTref_340028400.1"; gene_id "LTnewLTref_340028400:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 858622 859923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028500.1"; gene_id "LTnewLTref_340028500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 858622 859923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028500.1"; gene_id "LTnewLTref_340028500"; CM024320.1 . transcript 861362 861771 . - . transcript_id "LTnewLTref_340028600.1"; gene_id "LTnewLTref_340028600:pseudogene" CM024320.1 . exon 861362 861771 . - . transcript_id "LTnewLTref_340028600.1"; gene_id "LTnewLTref_340028600:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 861885 862691 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028700.1"; gene_id "LTnewLTref_340028700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 861885 862691 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028700.1"; gene_id "LTnewLTref_340028700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 865112 868351 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028800.1"; gene_id "LTnewLTref_340028800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 865112 868351 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028800.1"; gene_id "LTnewLTref_340028800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 869338 871836 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340028900.1"; gene_id "LTnewLTref_340028900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 869338 871836 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340028900.1"; gene_id "LTnewLTref_340028900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 872789 873262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029000.1"; gene_id "LTnewLTref_340029000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 872789 873262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029000.1"; gene_id "LTnewLTref_340029000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 874237 877785 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029100.1"; gene_id "LTnewLTref_340029100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 874237 877785 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029100.1"; gene_id "LTnewLTref_340029100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 881776 887547 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029200.1"; gene_id "LTnewLTref_340029200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 881776 887547 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029200.1"; gene_id "LTnewLTref_340029200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 888542 890848 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029300.1"; gene_id "LTnewLTref_340029300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 888542 890848 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029300.1"; gene_id "LTnewLTref_340029300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 891987 893612 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029400.1"; gene_id "LTnewLTref_340029400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 891987 893612 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029400.1"; gene_id "LTnewLTref_340029400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 895374 897653 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029500.1"; gene_id "LTnewLTref_340029500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 895374 897653 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029500.1"; gene_id "LTnewLTref_340029500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 899579 900574 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029600.1"; gene_id "LTnewLTref_340029600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 899579 900574 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029600.1"; gene_id "LTnewLTref_340029600"; CM024320.1 . transcript 901438 903345 . - . transcript_id "LTnewLTref_340029700.1"; gene_id "LTnewLTref_340029700:pseudogene" CM024320.1 . exon 901438 903345 . - . transcript_id "LTnewLTref_340029700.1"; gene_id "LTnewLTref_340029700:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 904400 904651 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029800.1"; gene_id "LTnewLTref_340029800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 904400 904651 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029800.1"; gene_id "LTnewLTref_340029800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 905734 906132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340029900.1"; gene_id "LTnewLTref_340029900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 905734 906132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340029900.1"; gene_id "LTnewLTref_340029900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 907080 907511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030000.1"; gene_id "LTnewLTref_340030000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 907080 907511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030000.1"; gene_id "LTnewLTref_340030000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 908758 911430 0.6 - . transcript_id "LTnewLTref_340030100.1"; gene_id "LTnewLTref_340030100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 908758 911430 0.6 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030100.1"; gene_id "LTnewLTref_340030100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 912562 913182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030200.1"; gene_id "LTnewLTref_340030200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 912562 913182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030200.1"; gene_id "LTnewLTref_340030200"; CM024320.1 Liftoff transcript 914596 914831 . - . transcript_id "LTnewLTref_340030300.1"; gene_id "LTnewLTref_340030300" CM024320.1 Liftoff CDS 914596 914831 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030300.1"; gene_id "LTnewLTref_340030300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 915303 916598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030400.1"; gene_id "LTnewLTref_340030400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 915303 916598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030400.1"; gene_id "LTnewLTref_340030400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 918414 919511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030500.1"; gene_id "LTnewLTref_340030500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 918414 919511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030500.1"; gene_id "LTnewLTref_340030500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 927908 928996 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030600.1"; gene_id "LTnewLTref_340030600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 927908 928996 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030600.1"; gene_id "LTnewLTref_340030600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 934241 934786 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030700.1"; gene_id "LTnewLTref_340030700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 934241 934786 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030700.1"; gene_id "LTnewLTref_340030700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 935922 936926 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340030800.1"; gene_id "LTnewLTref_340030800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 935922 936926 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340030800.1"; gene_id "LTnewLTref_340030800"; CM024320.1 . transcript 938671 939938 . - . transcript_id "LTnewLTref_340030900.1"; gene_id "LTnewLTref_340030900:pseudogene" CM024320.1 . exon 938671 939938 . - . transcript_id "LTnewLTref_340030900.1"; gene_id "LTnewLTref_340030900:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 940547 942199 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031000.1"; gene_id "LTnewLTref_340031000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 940547 942199 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031000.1"; gene_id "LTnewLTref_340031000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 944843 947269 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031100.1"; gene_id "LTnewLTref_340031100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 944843 947269 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031100.1"; gene_id "LTnewLTref_340031100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 949850 950416 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031200.1"; gene_id "LTnewLTref_340031200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 949850 950416 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031200.1"; gene_id "LTnewLTref_340031200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 952358 957979 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031300.1"; gene_id "LTnewLTref_340031300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 952358 957979 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031300.1"; gene_id "LTnewLTref_340031300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 962905 965532 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031400.1"; gene_id "LTnewLTref_340031400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 962905 965532 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031400.1"; gene_id "LTnewLTref_340031400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 967172 967606 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031500.1"; gene_id "LTnewLTref_340031500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 967172 967606 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031500.1"; gene_id "LTnewLTref_340031500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 968608 969024 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031600.1"; gene_id "LTnewLTref_340031600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 968608 969024 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031600.1"; gene_id "LTnewLTref_340031600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 971395 972528 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031700.1"; gene_id "LTnewLTref_340031700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 971395 972528 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031700.1"; gene_id "LTnewLTref_340031700"; CM024320.1 . transcript 973961 974196 . - . transcript_id "LTnewLTref_340031800.1"; gene_id "LTnewLTref_340031800:pseudogene" CM024320.1 . exon 973961 974196 . - . transcript_id "LTnewLTref_340031800.1"; gene_id "LTnewLTref_340031800:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 974706 975923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340031900.1"; gene_id "LTnewLTref_340031900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 974706 975923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340031900.1"; gene_id "LTnewLTref_340031900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 977430 980654 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340032000.1"; gene_id "LTnewLTref_340032000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 977430 980654 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032000.1"; gene_id "LTnewLTref_340032000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 981686 982765 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340032100.1"; gene_id "LTnewLTref_340032100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 981686 982765 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032100.1"; gene_id "LTnewLTref_340032100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 983658 985391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340032200.1"; gene_id "LTnewLTref_340032200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 983658 985391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032200.1"; gene_id "LTnewLTref_340032200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 994518 995693 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340032300.1"; gene_id "LTnewLTref_340032300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 994518 995693 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032300.1"; gene_id "LTnewLTref_340032300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 999613 1000968 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340032400.1"; gene_id "LTnewLTref_340032400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 999613 1000968 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032400.1"; gene_id "LTnewLTref_340032400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1003670 1010941 1 - . transcript_id "LTnewLTref_340032500.1"; gene_id "LTnewLTref_340032500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1003670 1010941 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032500.1"; gene_id "LTnewLTref_340032500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1012643 1024060 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_340032600.1"; gene_id "LTnewLTref_340032600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1012643 1018511 0.77 - 1 transcript_id "LTnewLTref_340032600.1"; gene_id "LTnewLTref_340032600"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1018623 1024060 0.61 - 0 transcript_id "LTnewLTref_340032600.1"; gene_id "LTnewLTref_340032600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1030332 1032944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340032700.1"; gene_id "LTnewLTref_340032700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1030332 1032944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340032700.1"; gene_id "LTnewLTref_340032700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1036190 1038043 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340032800.1"; gene_id "LTnewLTref_340032800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1036190 1038043 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340032800.1"; gene_id "LTnewLTref_340032800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1042712 1045725 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_340032900.1"; gene_id "LTnewLTref_340032900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1042712 1044424 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340032900.1"; gene_id "LTnewLTref_340032900"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1044502 1045725 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340032900.1"; gene_id "LTnewLTref_340032900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1044835 1045725 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_340032900.2"; gene_id "LTnewLTref_340032900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1044835 1045725 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340032900.2"; gene_id "LTnewLTref_340032900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1045926 1047662 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033000.1"; gene_id "LTnewLTref_340033000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1045926 1047662 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033000.1"; gene_id "LTnewLTref_340033000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1045926 1048129 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_340033000.2"; gene_id "LTnewLTref_340033000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1045926 1047494 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033000.2"; gene_id "LTnewLTref_340033000"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1047545 1048129 0.58 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033000.2"; gene_id "LTnewLTref_340033000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1048498 1049077 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033100.1"; gene_id "LTnewLTref_340033100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1048498 1048655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033100.1"; gene_id "LTnewLTref_340033100"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1049029 1049077 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_340033100.1"; gene_id "LTnewLTref_340033100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1049127 1050262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033200.1"; gene_id "LTnewLTref_340033200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1049127 1049362 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033200.1"; gene_id "LTnewLTref_340033200"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1049731 1050262 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_340033200.1"; gene_id "LTnewLTref_340033200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1050284 1052165 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_340033300.1"; gene_id "LTnewLTref_340033300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1050284 1050532 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033300.1"; gene_id "LTnewLTref_340033300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1050576 1052165 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033300.1"; gene_id "LTnewLTref_340033300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1050525 1051315 0.35 + . transcript_id "LTnewLTref_340033300.2"; gene_id "LTnewLTref_340033300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1050525 1051163 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033300.2"; gene_id "LTnewLTref_340033300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1051274 1051315 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033300.2"; gene_id "LTnewLTref_340033300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1053645 1055318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033400.1"; gene_id "LTnewLTref_340033400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1053645 1055318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033400.1"; gene_id "LTnewLTref_340033400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1058705 1059322 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033500.1"; gene_id "LTnewLTref_340033500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1058705 1059322 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033500.1"; gene_id "LTnewLTref_340033500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1064821 1066227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033600.1"; gene_id "LTnewLTref_340033600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1064821 1066227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033600.1"; gene_id "LTnewLTref_340033600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1067229 1067498 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033700.1"; gene_id "LTnewLTref_340033700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1067229 1067498 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033700.1"; gene_id "LTnewLTref_340033700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1071055 1072506 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033800.1"; gene_id "LTnewLTref_340033800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1071055 1072506 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033800.1"; gene_id "LTnewLTref_340033800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1073532 1075595 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340033900.1"; gene_id "LTnewLTref_340033900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1073532 1075595 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340033900.1"; gene_id "LTnewLTref_340033900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1076896 1081371 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034000.1"; gene_id "LTnewLTref_340034000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1076896 1081371 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034000.1"; gene_id "LTnewLTref_340034000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1082464 1086564 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034100.1"; gene_id "LTnewLTref_340034100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1082464 1086564 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034100.1"; gene_id "LTnewLTref_340034100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1087314 1089140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034200.1"; gene_id "LTnewLTref_340034200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1087314 1089140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034200.1"; gene_id "LTnewLTref_340034200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1091232 1093952 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034300.1"; gene_id "LTnewLTref_340034300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1091232 1093952 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034300.1"; gene_id "LTnewLTref_340034300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1095548 1097422 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034400.1"; gene_id "LTnewLTref_340034400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1095548 1097422 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034400.1"; gene_id "LTnewLTref_340034400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1098389 1100032 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034500.1"; gene_id "LTnewLTref_340034500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1098389 1100032 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034500.1"; gene_id "LTnewLTref_340034500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1101230 1102948 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034600.1"; gene_id "LTnewLTref_340034600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1101230 1102948 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034600.1"; gene_id "LTnewLTref_340034600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1103707 1104474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034700.1"; gene_id "LTnewLTref_340034700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1103707 1104474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034700.1"; gene_id "LTnewLTref_340034700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1106233 1107588 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034800.1"; gene_id "LTnewLTref_340034800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1106233 1107588 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034800.1"; gene_id "LTnewLTref_340034800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1109035 1111056 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340034900.1"; gene_id "LTnewLTref_340034900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1109035 1111056 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340034900.1"; gene_id "LTnewLTref_340034900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1112275 1114506 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035000.1"; gene_id "LTnewLTref_340035000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1112275 1114506 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035000.1"; gene_id "LTnewLTref_340035000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1116962 1117810 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035100.1"; gene_id "LTnewLTref_340035100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1116962 1117810 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035100.1"; gene_id "LTnewLTref_340035100"; CM024320.1 . transcript 1127842 1128137 . + . transcript_id "LTnewLTref_340035200.1"; gene_id "LTnewLTref_340035200:pseudogene" CM024320.1 . exon 1127842 1128137 . + . transcript_id "LTnewLTref_340035200.1"; gene_id "LTnewLTref_340035200:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1131866 1133149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035300.1"; gene_id "LTnewLTref_340035300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1131866 1133149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035300.1"; gene_id "LTnewLTref_340035300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1134180 1135085 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035400.1"; gene_id "LTnewLTref_340035400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1134180 1135085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035400.1"; gene_id "LTnewLTref_340035400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1137682 1138713 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035500.1"; gene_id "LTnewLTref_340035500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1137682 1138713 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035500.1"; gene_id "LTnewLTref_340035500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1142530 1144413 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035600.1"; gene_id "LTnewLTref_340035600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1142530 1144413 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035600.1"; gene_id "LTnewLTref_340035600"; CM024320.1 . transcript 1145105 1145549 . + . transcript_id "LTnewLTref_340035700.1"; gene_id "LTnewLTref_340035700:pseudogene" CM024320.1 . exon 1145105 1145347 . + . transcript_id "LTnewLTref_340035700.1"; gene_id "LTnewLTref_340035700:pseudogene"; CM024320.1 . exon 1145349 1145549 . + . transcript_id "LTnewLTref_340035700.1"; gene_id "LTnewLTref_340035700:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1146693 1147232 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035800.1"; gene_id "LTnewLTref_340035800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1146693 1147232 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035800.1"; gene_id "LTnewLTref_340035800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1148348 1150156 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340035900.1"; gene_id "LTnewLTref_340035900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1148348 1150156 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340035900.1"; gene_id "LTnewLTref_340035900"; CM024320.1 . transcript 1152161 1153288 . + . transcript_id "LTnewLTref_340036000.1"; gene_id "LTnewLTref_340036000:pseudogene" CM024320.1 . exon 1152161 1153288 . + . transcript_id "LTnewLTref_340036000.1"; gene_id "LTnewLTref_340036000:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1154462 1156141 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340036100.1"; gene_id "LTnewLTref_340036100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1154462 1156141 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036100.1"; gene_id "LTnewLTref_340036100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1157248 1162364 0.86 + . transcript_id "LTnewLTref_340036200.1"; gene_id "LTnewLTref_340036200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1157248 1157927 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036200.1"; gene_id "LTnewLTref_340036200"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1161719 1162364 0.86 + 1 transcript_id "LTnewLTref_340036200.1"; gene_id "LTnewLTref_340036200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1163461 1164049 0.46 + . transcript_id "LTnewLTref_340036300.1"; gene_id "LTnewLTref_340036300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1163461 1163829 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036300.1"; gene_id "LTnewLTref_340036300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1163873 1164049 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036300.1"; gene_id "LTnewLTref_340036300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1170184 1172841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340036400.1"; gene_id "LTnewLTref_340036400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1170184 1172841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036400.1"; gene_id "LTnewLTref_340036400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1175237 1177180 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340036500.1"; gene_id "LTnewLTref_340036500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1175237 1177180 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036500.1"; gene_id "LTnewLTref_340036500"; CM024320.1 Liftoff transcript 1179484 1179693 . + . transcript_id "LTnewLTref_340036600.1"; gene_id "LTnewLTref_340036600" CM024320.1 Liftoff CDS 1179484 1179693 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036600.1"; gene_id "LTnewLTref_340036600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1180634 1180945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340036700.1"; gene_id "LTnewLTref_340036700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1180634 1180945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036700.1"; gene_id "LTnewLTref_340036700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1181548 1183584 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340036800.1"; gene_id "LTnewLTref_340036800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1181548 1183584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036800.1"; gene_id "LTnewLTref_340036800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1185023 1186258 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340036900.1"; gene_id "LTnewLTref_340036900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1185023 1186258 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340036900.1"; gene_id "LTnewLTref_340036900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1187998 1188354 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037000.1"; gene_id "LTnewLTref_340037000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1187998 1188354 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037000.1"; gene_id "LTnewLTref_340037000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1189145 1190406 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_340037100.1"; gene_id "LTnewLTref_340037100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1189145 1189948 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037100.1"; gene_id "LTnewLTref_340037100"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1190005 1190406 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037100.1"; gene_id "LTnewLTref_340037100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1191277 1192536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037200.1"; gene_id "LTnewLTref_340037200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1191277 1192536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037200.1"; gene_id "LTnewLTref_340037200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1194543 1195841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037300.1"; gene_id "LTnewLTref_340037300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1194543 1195841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037300.1"; gene_id "LTnewLTref_340037300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1201847 1202116 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037400.1"; gene_id "LTnewLTref_340037400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1201847 1202116 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037400.1"; gene_id "LTnewLTref_340037400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1202927 1203499 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037500.1"; gene_id "LTnewLTref_340037500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1202927 1203499 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037500.1"; gene_id "LTnewLTref_340037500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1206471 1206680 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037600.1"; gene_id "LTnewLTref_340037600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1206471 1206680 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037600.1"; gene_id "LTnewLTref_340037600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1207400 1208320 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037700.1"; gene_id "LTnewLTref_340037700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1207400 1208320 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037700.1"; gene_id "LTnewLTref_340037700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1209148 1210416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037800.1"; gene_id "LTnewLTref_340037800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1209148 1210416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037800.1"; gene_id "LTnewLTref_340037800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1211235 1211927 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340037900.1"; gene_id "LTnewLTref_340037900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1211235 1211927 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340037900.1"; gene_id "LTnewLTref_340037900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1212732 1213280 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038000.1"; gene_id "LTnewLTref_340038000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1212732 1213280 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038000.1"; gene_id "LTnewLTref_340038000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1214388 1215419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038100.1"; gene_id "LTnewLTref_340038100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1214388 1215419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038100.1"; gene_id "LTnewLTref_340038100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1217249 1218505 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038200.1"; gene_id "LTnewLTref_340038200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1217249 1218505 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038200.1"; gene_id "LTnewLTref_340038200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1220471 1222357 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038300.1"; gene_id "LTnewLTref_340038300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1220471 1222357 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038300.1"; gene_id "LTnewLTref_340038300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1223477 1224226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038400.1"; gene_id "LTnewLTref_340038400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1223477 1224226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038400.1"; gene_id "LTnewLTref_340038400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1227095 1229920 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038500.1"; gene_id "LTnewLTref_340038500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1227095 1229920 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038500.1"; gene_id "LTnewLTref_340038500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1232810 1233862 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038600.1"; gene_id "LTnewLTref_340038600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1232810 1233862 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038600.1"; gene_id "LTnewLTref_340038600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1234883 1236682 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038700.1"; gene_id "LTnewLTref_340038700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1234883 1236682 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038700.1"; gene_id "LTnewLTref_340038700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1237935 1238471 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038800.1"; gene_id "LTnewLTref_340038800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1237935 1238471 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038800.1"; gene_id "LTnewLTref_340038800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1241870 1243429 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340038900.1"; gene_id "LTnewLTref_340038900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1241870 1243429 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340038900.1"; gene_id "LTnewLTref_340038900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1246271 1248181 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039000.1"; gene_id "LTnewLTref_340039000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1246271 1248181 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039000.1"; gene_id "LTnewLTref_340039000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1253711 1255942 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039100.1"; gene_id "LTnewLTref_340039100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1253711 1255942 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039100.1"; gene_id "LTnewLTref_340039100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1257577 1259217 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039200.1"; gene_id "LTnewLTref_340039200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1257577 1259217 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039200.1"; gene_id "LTnewLTref_340039200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1260657 1261850 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039300.1"; gene_id "LTnewLTref_340039300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1260657 1261850 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039300.1"; gene_id "LTnewLTref_340039300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1263043 1263771 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_340039400.1"; gene_id "LTnewLTref_340039400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1263043 1263771 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039400.1"; gene_id "LTnewLTref_340039400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1264995 1265768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039500.1"; gene_id "LTnewLTref_340039500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1264995 1265768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039500.1"; gene_id "LTnewLTref_340039500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1267580 1268605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039600.1"; gene_id "LTnewLTref_340039600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1267580 1268605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039600.1"; gene_id "LTnewLTref_340039600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1270475 1270708 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_340039700.1"; gene_id "LTnewLTref_340039700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1270475 1270708 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039700.1"; gene_id "LTnewLTref_340039700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1272364 1273668 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039800.1"; gene_id "LTnewLTref_340039800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1272364 1273668 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039800.1"; gene_id "LTnewLTref_340039800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1274536 1275300 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340039900.1"; gene_id "LTnewLTref_340039900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1274536 1275300 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340039900.1"; gene_id "LTnewLTref_340039900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1276421 1277698 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040000.1"; gene_id "LTnewLTref_340040000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1276421 1277698 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040000.1"; gene_id "LTnewLTref_340040000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1278796 1280562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040100.1"; gene_id "LTnewLTref_340040100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1278796 1280562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040100.1"; gene_id "LTnewLTref_340040100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1282272 1283978 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040200.1"; gene_id "LTnewLTref_340040200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1282272 1283978 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040200.1"; gene_id "LTnewLTref_340040200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1285054 1286913 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040300.1"; gene_id "LTnewLTref_340040300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1285054 1286913 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040300.1"; gene_id "LTnewLTref_340040300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1289581 1291113 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040400.1"; gene_id "LTnewLTref_340040400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1289581 1291113 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040400.1"; gene_id "LTnewLTref_340040400"; CM024320.1 . transcript 1292607 1292848 . + . transcript_id "LTnewLTref_340040500.1"; gene_id "LTnewLTref_340040500:pseudogene" CM024320.1 . exon 1292607 1292848 . + . transcript_id "LTnewLTref_340040500.1"; gene_id "LTnewLTref_340040500:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1296609 1299812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040600.1"; gene_id "LTnewLTref_340040600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1296609 1299812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040600.1"; gene_id "LTnewLTref_340040600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1300374 1301009 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040700.1"; gene_id "LTnewLTref_340040700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1300374 1301009 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040700.1"; gene_id "LTnewLTref_340040700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1302045 1305518 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040800.1"; gene_id "LTnewLTref_340040800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1302045 1305518 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040800.1"; gene_id "LTnewLTref_340040800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1307147 1314481 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340040900.1"; gene_id "LTnewLTref_340040900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1307147 1314481 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340040900.1"; gene_id "LTnewLTref_340040900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1315768 1317681 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041000.1"; gene_id "LTnewLTref_340041000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1315768 1317681 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041000.1"; gene_id "LTnewLTref_340041000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1318920 1320671 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041100.1"; gene_id "LTnewLTref_340041100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1318920 1320671 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041100.1"; gene_id "LTnewLTref_340041100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1324643 1327081 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041200.1"; gene_id "LTnewLTref_340041200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1324643 1327081 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041200.1"; gene_id "LTnewLTref_340041200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1326194 1327081 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_340041200.2"; gene_id "LTnewLTref_340041200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1326194 1327081 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041200.2"; gene_id "LTnewLTref_340041200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1327950 1328334 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_340041300.1"; gene_id "LTnewLTref_340041300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1327950 1327976 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041300.1"; gene_id "LTnewLTref_340041300"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1328020 1328334 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041300.1"; gene_id "LTnewLTref_340041300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1329864 1330463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041400.1"; gene_id "LTnewLTref_340041400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1329864 1330463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041400.1"; gene_id "LTnewLTref_340041400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1331662 1333410 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041500.1"; gene_id "LTnewLTref_340041500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1331662 1333410 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041500.1"; gene_id "LTnewLTref_340041500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1334871 1336307 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041600.1"; gene_id "LTnewLTref_340041600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1334871 1336307 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041600.1"; gene_id "LTnewLTref_340041600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1337046 1337687 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041700.1"; gene_id "LTnewLTref_340041700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1337046 1337687 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041700.1"; gene_id "LTnewLTref_340041700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1338152 1339723 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041800.1"; gene_id "LTnewLTref_340041800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1338152 1339723 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041800.1"; gene_id "LTnewLTref_340041800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1340907 1341482 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340041900.1"; gene_id "LTnewLTref_340041900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1340907 1341482 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340041900.1"; gene_id "LTnewLTref_340041900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1342730 1344382 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042000.1"; gene_id "LTnewLTref_340042000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1342730 1344382 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042000.1"; gene_id "LTnewLTref_340042000"; CM024320.1 Liftoff transcript 1348429 1350888 . + . transcript_id "LTnewLTref_340042100.1"; gene_id "LTnewLTref_340042100" CM024320.1 Liftoff CDS 1348429 1350888 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042100.1"; gene_id "LTnewLTref_340042100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1351369 1352976 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_340042200.1"; gene_id "LTnewLTref_340042200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1351369 1352976 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042200.1"; gene_id "LTnewLTref_340042200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1353590 1354225 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042300.1"; gene_id "LTnewLTref_340042300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1353590 1354225 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042300.1"; gene_id "LTnewLTref_340042300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1355040 1355492 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042400.1"; gene_id "LTnewLTref_340042400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1355040 1355492 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042400.1"; gene_id "LTnewLTref_340042400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1356640 1357545 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042500.1"; gene_id "LTnewLTref_340042500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1356640 1357545 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042500.1"; gene_id "LTnewLTref_340042500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1363967 1366156 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042600.1"; gene_id "LTnewLTref_340042600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1363967 1366156 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042600.1"; gene_id "LTnewLTref_340042600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1369013 1369975 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042700.1"; gene_id "LTnewLTref_340042700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1369013 1369975 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042700.1"; gene_id "LTnewLTref_340042700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1375234 1376781 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042800.1"; gene_id "LTnewLTref_340042800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1375234 1376781 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042800.1"; gene_id "LTnewLTref_340042800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1378069 1380339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340042900.1"; gene_id "LTnewLTref_340042900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1378069 1380339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340042900.1"; gene_id "LTnewLTref_340042900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1383610 1385517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043000.1"; gene_id "LTnewLTref_340043000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1383610 1385517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043000.1"; gene_id "LTnewLTref_340043000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1387190 1390819 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043100.1"; gene_id "LTnewLTref_340043100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1387190 1390819 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043100.1"; gene_id "LTnewLTref_340043100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1391433 1392860 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043200.1"; gene_id "LTnewLTref_340043200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1391433 1392860 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043200.1"; gene_id "LTnewLTref_340043200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1394030 1395106 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043300.1"; gene_id "LTnewLTref_340043300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1394030 1395106 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043300.1"; gene_id "LTnewLTref_340043300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1397408 1398121 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043400.1"; gene_id "LTnewLTref_340043400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1397408 1398121 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043400.1"; gene_id "LTnewLTref_340043400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1398888 1400165 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043500.1"; gene_id "LTnewLTref_340043500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1398888 1400165 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043500.1"; gene_id "LTnewLTref_340043500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1401080 1402459 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043600.1"; gene_id "LTnewLTref_340043600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1401080 1402459 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043600.1"; gene_id "LTnewLTref_340043600"; CM024320.1 . transcript 1403592 1404632 . + . transcript_id "LTnewLTref_340043700.1"; gene_id "LTnewLTref_340043700:pseudogene" CM024320.1 . exon 1403592 1404632 . + . transcript_id "LTnewLTref_340043700.1"; gene_id "LTnewLTref_340043700:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1405528 1408392 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340043800.1"; gene_id "LTnewLTref_340043800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1405528 1408392 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340043800.1"; gene_id "LTnewLTref_340043800"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1408636 1408709 . - . transcript_id "LTnewLTref_340043900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340043900" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 1408636 1408709 . - . transcript_id "LTnewLTref_340043900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340043900"; CM024320.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1409181 1409254 . + . transcript_id "LTnewLTref_340044000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340044000" CM024320.1 Aragorn_1.2.36 exon 1409181 1409254 . + . transcript_id "LTnewLTref_340044000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_340044000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1409855 1415692 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_340044100.1"; gene_id "LTnewLTref_340044100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1409855 1411678 0.4 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044100.1"; gene_id "LTnewLTref_340044100"; CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1412684 1415692 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044100.1"; gene_id "LTnewLTref_340044100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1416389 1417063 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044200.1"; gene_id "LTnewLTref_340044200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1416389 1417063 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044200.1"; gene_id "LTnewLTref_340044200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1418023 1419249 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044300.1"; gene_id "LTnewLTref_340044300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1418023 1419249 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044300.1"; gene_id "LTnewLTref_340044300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1419838 1420863 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044400.1"; gene_id "LTnewLTref_340044400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1419838 1420863 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044400.1"; gene_id "LTnewLTref_340044400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1422530 1425352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044500.1"; gene_id "LTnewLTref_340044500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1422530 1425352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044500.1"; gene_id "LTnewLTref_340044500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1426136 1428748 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044600.1"; gene_id "LTnewLTref_340044600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1426136 1428748 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044600.1"; gene_id "LTnewLTref_340044600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1429585 1431420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044700.1"; gene_id "LTnewLTref_340044700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1429585 1431420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044700.1"; gene_id "LTnewLTref_340044700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1433654 1434820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044800.1"; gene_id "LTnewLTref_340044800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1433654 1434820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044800.1"; gene_id "LTnewLTref_340044800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1438824 1439345 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340044900.1"; gene_id "LTnewLTref_340044900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1438824 1439345 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340044900.1"; gene_id "LTnewLTref_340044900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1440666 1442378 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045000.1"; gene_id "LTnewLTref_340045000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1440666 1442378 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045000.1"; gene_id "LTnewLTref_340045000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1443480 1445015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045100.1"; gene_id "LTnewLTref_340045100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1443480 1445015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045100.1"; gene_id "LTnewLTref_340045100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1447316 1447804 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045200.1"; gene_id "LTnewLTref_340045200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1447316 1447804 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045200.1"; gene_id "LTnewLTref_340045200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1451665 1452153 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045300.1"; gene_id "LTnewLTref_340045300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1451665 1452153 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045300.1"; gene_id "LTnewLTref_340045300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1455990 1456313 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045400.1"; gene_id "LTnewLTref_340045400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1455990 1456313 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045400.1"; gene_id "LTnewLTref_340045400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1460174 1460653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045500.1"; gene_id "LTnewLTref_340045500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1460174 1460653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045500.1"; gene_id "LTnewLTref_340045500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1462012 1463925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045600.1"; gene_id "LTnewLTref_340045600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1462012 1463925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045600.1"; gene_id "LTnewLTref_340045600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1467777 1469609 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045700.1"; gene_id "LTnewLTref_340045700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1467777 1469609 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045700.1"; gene_id "LTnewLTref_340045700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1471587 1472195 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045800.1"; gene_id "LTnewLTref_340045800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1471587 1472195 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045800.1"; gene_id "LTnewLTref_340045800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1473194 1477318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340045900.1"; gene_id "LTnewLTref_340045900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1473194 1477318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340045900.1"; gene_id "LTnewLTref_340045900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1478024 1479400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046000.1"; gene_id "LTnewLTref_340046000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1478024 1479400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046000.1"; gene_id "LTnewLTref_340046000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1480776 1481327 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046100.1"; gene_id "LTnewLTref_340046100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1480776 1481327 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046100.1"; gene_id "LTnewLTref_340046100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1482254 1483162 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046200.1"; gene_id "LTnewLTref_340046200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1482254 1483162 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046200.1"; gene_id "LTnewLTref_340046200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1483929 1484975 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046300.1"; gene_id "LTnewLTref_340046300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1483929 1484975 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046300.1"; gene_id "LTnewLTref_340046300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1485670 1487136 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046400.1"; gene_id "LTnewLTref_340046400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1485670 1487136 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046400.1"; gene_id "LTnewLTref_340046400"; CM024320.1 . transcript 1490119 1491618 . + . transcript_id "LTnewLTref_340046500.1"; gene_id "LTnewLTref_340046500:pseudogene" CM024320.1 . exon 1490119 1491618 . + . transcript_id "LTnewLTref_340046500.1"; gene_id "LTnewLTref_340046500:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1494323 1495984 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046600.1"; gene_id "LTnewLTref_340046600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1494323 1495984 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046600.1"; gene_id "LTnewLTref_340046600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1496881 1498149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046700.1"; gene_id "LTnewLTref_340046700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1496881 1498149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046700.1"; gene_id "LTnewLTref_340046700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1499303 1500193 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046800.1"; gene_id "LTnewLTref_340046800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1499303 1500193 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046800.1"; gene_id "LTnewLTref_340046800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1500997 1502778 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340046900.1"; gene_id "LTnewLTref_340046900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1500997 1502778 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340046900.1"; gene_id "LTnewLTref_340046900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1504603 1508517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047000.1"; gene_id "LTnewLTref_340047000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1504603 1508517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047000.1"; gene_id "LTnewLTref_340047000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1509450 1510517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047100.1"; gene_id "LTnewLTref_340047100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1509450 1510517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047100.1"; gene_id "LTnewLTref_340047100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1511272 1511865 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047200.1"; gene_id "LTnewLTref_340047200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1511272 1511865 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047200.1"; gene_id "LTnewLTref_340047200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1512821 1513393 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047300.1"; gene_id "LTnewLTref_340047300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1512821 1513393 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047300.1"; gene_id "LTnewLTref_340047300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1514261 1515130 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047400.1"; gene_id "LTnewLTref_340047400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1514261 1515130 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047400.1"; gene_id "LTnewLTref_340047400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1515897 1516598 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047500.1"; gene_id "LTnewLTref_340047500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1515897 1516598 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047500.1"; gene_id "LTnewLTref_340047500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1517461 1518240 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047600.1"; gene_id "LTnewLTref_340047600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1517461 1518240 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047600.1"; gene_id "LTnewLTref_340047600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1519214 1519906 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047700.1"; gene_id "LTnewLTref_340047700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1519214 1519906 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047700.1"; gene_id "LTnewLTref_340047700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1521349 1521690 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047800.1"; gene_id "LTnewLTref_340047800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1521349 1521690 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047800.1"; gene_id "LTnewLTref_340047800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1522529 1524601 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340047900.1"; gene_id "LTnewLTref_340047900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1522529 1524601 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340047900.1"; gene_id "LTnewLTref_340047900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1526395 1540332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048000.1"; gene_id "LTnewLTref_340048000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1526395 1540332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048000.1"; gene_id "LTnewLTref_340048000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1541821 1542735 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048100.1"; gene_id "LTnewLTref_340048100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1541821 1542735 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048100.1"; gene_id "LTnewLTref_340048100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1545819 1547324 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048200.1"; gene_id "LTnewLTref_340048200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1545819 1547324 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048200.1"; gene_id "LTnewLTref_340048200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1548181 1548474 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048300.1"; gene_id "LTnewLTref_340048300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1548181 1548474 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048300.1"; gene_id "LTnewLTref_340048300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1549841 1551421 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048400.1"; gene_id "LTnewLTref_340048400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1549841 1551421 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048400.1"; gene_id "LTnewLTref_340048400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1552396 1554042 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048500.1"; gene_id "LTnewLTref_340048500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1552396 1554042 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048500.1"; gene_id "LTnewLTref_340048500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1558253 1566139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048600.1"; gene_id "LTnewLTref_340048600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1558253 1566139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048600.1"; gene_id "LTnewLTref_340048600"; CM024320.1 . transcript 1567585 1567939 . + . transcript_id "LTnewLTref_340048700.1"; gene_id "LTnewLTref_340048700:pseudogene" CM024320.1 . exon 1567585 1567939 . + . transcript_id "LTnewLTref_340048700.1"; gene_id "LTnewLTref_340048700:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1570537 1571349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048800.1"; gene_id "LTnewLTref_340048800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1570537 1571349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048800.1"; gene_id "LTnewLTref_340048800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1574251 1574586 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340048900.1"; gene_id "LTnewLTref_340048900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1574251 1574586 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340048900.1"; gene_id "LTnewLTref_340048900"; CM024320.1 Liftoff transcript 1577334 1577618 . + . transcript_id "LTnewLTref_340049000.1"; gene_id "LTnewLTref_340049000" CM024320.1 Liftoff CDS 1577334 1577618 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049000.1"; gene_id "LTnewLTref_340049000"; CM024320.1 . transcript 1579892 1580143 . + . transcript_id "LTnewLTref_340049100.1"; gene_id "LTnewLTref_340049100:pseudogene" CM024320.1 . exon 1579892 1580143 . + . transcript_id "LTnewLTref_340049100.1"; gene_id "LTnewLTref_340049100:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1581039 1585148 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049200.1"; gene_id "LTnewLTref_340049200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1581039 1585148 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049200.1"; gene_id "LTnewLTref_340049200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1586113 1588551 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049300.1"; gene_id "LTnewLTref_340049300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1586113 1588551 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049300.1"; gene_id "LTnewLTref_340049300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1589723 1590169 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049400.1"; gene_id "LTnewLTref_340049400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1589723 1590169 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049400.1"; gene_id "LTnewLTref_340049400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1591527 1592963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049500.1"; gene_id "LTnewLTref_340049500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1591527 1592963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049500.1"; gene_id "LTnewLTref_340049500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1593414 1594934 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049600.1"; gene_id "LTnewLTref_340049600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1593414 1594934 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049600.1"; gene_id "LTnewLTref_340049600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1595524 1595838 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049700.1"; gene_id "LTnewLTref_340049700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1595524 1595838 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049700.1"; gene_id "LTnewLTref_340049700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1597083 1598072 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049800.1"; gene_id "LTnewLTref_340049800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1597083 1598072 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049800.1"; gene_id "LTnewLTref_340049800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1598953 1599945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340049900.1"; gene_id "LTnewLTref_340049900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1598953 1599945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340049900.1"; gene_id "LTnewLTref_340049900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1600580 1601836 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050000.1"; gene_id "LTnewLTref_340050000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1600580 1601836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050000.1"; gene_id "LTnewLTref_340050000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1602676 1604673 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050100.1"; gene_id "LTnewLTref_340050100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1602676 1604673 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050100.1"; gene_id "LTnewLTref_340050100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1606295 1609015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050200.1"; gene_id "LTnewLTref_340050200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1606295 1609015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050200.1"; gene_id "LTnewLTref_340050200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1610498 1612567 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050300.1"; gene_id "LTnewLTref_340050300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1610498 1612567 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050300.1"; gene_id "LTnewLTref_340050300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1613920 1614720 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050400.1"; gene_id "LTnewLTref_340050400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1613920 1614720 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050400.1"; gene_id "LTnewLTref_340050400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1616090 1617556 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050500.1"; gene_id "LTnewLTref_340050500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1616090 1617556 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050500.1"; gene_id "LTnewLTref_340050500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1619067 1619993 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050600.1"; gene_id "LTnewLTref_340050600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1619067 1619993 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050600.1"; gene_id "LTnewLTref_340050600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1620591 1628390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050700.1"; gene_id "LTnewLTref_340050700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1620591 1628390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050700.1"; gene_id "LTnewLTref_340050700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1629314 1630138 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050800.1"; gene_id "LTnewLTref_340050800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1629314 1630138 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050800.1"; gene_id "LTnewLTref_340050800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1631135 1633582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340050900.1"; gene_id "LTnewLTref_340050900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1631135 1633582 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340050900.1"; gene_id "LTnewLTref_340050900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1634831 1636228 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051000.1"; gene_id "LTnewLTref_340051000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1634831 1636228 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051000.1"; gene_id "LTnewLTref_340051000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1637218 1639194 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051100.1"; gene_id "LTnewLTref_340051100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1637218 1639194 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051100.1"; gene_id "LTnewLTref_340051100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1640321 1653046 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051200.1"; gene_id "LTnewLTref_340051200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1640321 1653046 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051200.1"; gene_id "LTnewLTref_340051200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1654214 1654663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051300.1"; gene_id "LTnewLTref_340051300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1654214 1654663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051300.1"; gene_id "LTnewLTref_340051300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1655434 1657188 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051400.1"; gene_id "LTnewLTref_340051400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1655434 1657188 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051400.1"; gene_id "LTnewLTref_340051400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1658394 1659323 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051500.1"; gene_id "LTnewLTref_340051500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1658394 1659323 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051500.1"; gene_id "LTnewLTref_340051500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1660185 1660850 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051600.1"; gene_id "LTnewLTref_340051600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1660185 1660850 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051600.1"; gene_id "LTnewLTref_340051600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1661391 1662857 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051700.1"; gene_id "LTnewLTref_340051700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1661391 1662857 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051700.1"; gene_id "LTnewLTref_340051700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1663997 1664608 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051800.1"; gene_id "LTnewLTref_340051800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1663997 1664608 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051800.1"; gene_id "LTnewLTref_340051800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1665399 1665695 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340051900.1"; gene_id "LTnewLTref_340051900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1665399 1665695 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340051900.1"; gene_id "LTnewLTref_340051900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1666478 1667710 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052000.1"; gene_id "LTnewLTref_340052000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1666478 1667710 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052000.1"; gene_id "LTnewLTref_340052000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1668334 1670112 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052100.1"; gene_id "LTnewLTref_340052100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1668334 1670112 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052100.1"; gene_id "LTnewLTref_340052100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1670586 1675052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052200.1"; gene_id "LTnewLTref_340052200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1670586 1675052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052200.1"; gene_id "LTnewLTref_340052200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1676169 1676879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052300.1"; gene_id "LTnewLTref_340052300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1676169 1676879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052300.1"; gene_id "LTnewLTref_340052300"; CM024320.1 . transcript 1678352 1679568 . + . transcript_id "LTnewLTref_340052400.1"; gene_id "LTnewLTref_340052400:pseudogene" CM024320.1 . exon 1678352 1679568 . + . transcript_id "LTnewLTref_340052400.1"; gene_id "LTnewLTref_340052400:pseudogene"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1680752 1681390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052500.1"; gene_id "LTnewLTref_340052500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1680752 1681390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052500.1"; gene_id "LTnewLTref_340052500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1682407 1683207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052600.1"; gene_id "LTnewLTref_340052600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1682407 1683207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052600.1"; gene_id "LTnewLTref_340052600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1684637 1688227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052700.1"; gene_id "LTnewLTref_340052700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1684637 1688227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052700.1"; gene_id "LTnewLTref_340052700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1689278 1689616 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052800.1"; gene_id "LTnewLTref_340052800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1689278 1689616 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052800.1"; gene_id "LTnewLTref_340052800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1690197 1690859 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340052900.1"; gene_id "LTnewLTref_340052900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1690197 1690859 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340052900.1"; gene_id "LTnewLTref_340052900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1691566 1691904 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053000.1"; gene_id "LTnewLTref_340053000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1691566 1691904 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053000.1"; gene_id "LTnewLTref_340053000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1692470 1693159 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053100.1"; gene_id "LTnewLTref_340053100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1692470 1693159 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053100.1"; gene_id "LTnewLTref_340053100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1693688 1694350 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053200.1"; gene_id "LTnewLTref_340053200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1693688 1694350 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053200.1"; gene_id "LTnewLTref_340053200"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1695863 1703179 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053300.1"; gene_id "LTnewLTref_340053300" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1695863 1703179 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053300.1"; gene_id "LTnewLTref_340053300"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1704128 1704454 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053400.1"; gene_id "LTnewLTref_340053400" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1704128 1704454 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053400.1"; gene_id "LTnewLTref_340053400"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1704999 1706075 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053500.1"; gene_id "LTnewLTref_340053500" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1704999 1706075 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053500.1"; gene_id "LTnewLTref_340053500"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1707167 1708339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053600.1"; gene_id "LTnewLTref_340053600" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1707167 1708339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053600.1"; gene_id "LTnewLTref_340053600"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1709893 1710252 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053700.1"; gene_id "LTnewLTref_340053700" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1709893 1710252 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053700.1"; gene_id "LTnewLTref_340053700"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1711277 1712254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053800.1"; gene_id "LTnewLTref_340053800" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1711277 1712254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053800.1"; gene_id "LTnewLTref_340053800"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1713914 1714990 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340053900.1"; gene_id "LTnewLTref_340053900" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1713914 1714990 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340053900.1"; gene_id "LTnewLTref_340053900"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1715687 1716526 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340054000.1"; gene_id "LTnewLTref_340054000" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1715687 1716526 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340054000.1"; gene_id "LTnewLTref_340054000"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1717283 1718950 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340054100.1"; gene_id "LTnewLTref_340054100" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1717283 1718950 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340054100.1"; gene_id "LTnewLTref_340054100"; CM024320.1 AUGUSTUS transcript 1720072 1722477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_340054200.1"; gene_id "LTnewLTref_340054200" CM024320.1 AUGUSTUS CDS 1720072 1722477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_340054200.1"; gene_id "LTnewLTref_340054200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 546 889 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_350005000.1"; gene_id "LTnewLTref_350005000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 546 889 0.59 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350005000.1"; gene_id "LTnewLTref_350005000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 7563 10013 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005100.1"; gene_id "LTnewLTref_350005100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 7563 10013 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005100.1"; gene_id "LTnewLTref_350005100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 11821 12123 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005200.1"; gene_id "LTnewLTref_350005200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 11821 12123 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005200.1"; gene_id "LTnewLTref_350005200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 12588 14111 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005300.1"; gene_id "LTnewLTref_350005300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 12588 14111 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005300.1"; gene_id "LTnewLTref_350005300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 15934 17433 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005400.1"; gene_id "LTnewLTref_350005400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 15934 17433 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005400.1"; gene_id "LTnewLTref_350005400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 18091 20280 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005500.1"; gene_id "LTnewLTref_350005500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 18091 20280 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005500.1"; gene_id "LTnewLTref_350005500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 21549 22649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005600.1"; gene_id "LTnewLTref_350005600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 21549 22649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005600.1"; gene_id "LTnewLTref_350005600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 23653 24357 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005700.1"; gene_id "LTnewLTref_350005700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 23653 24357 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005700.1"; gene_id "LTnewLTref_350005700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 25146 27158 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005800.1"; gene_id "LTnewLTref_350005800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 25146 27158 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005800.1"; gene_id "LTnewLTref_350005800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 28105 29022 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350005900.1"; gene_id "LTnewLTref_350005900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 28105 29022 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350005900.1"; gene_id "LTnewLTref_350005900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 30011 31750 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006000.1"; gene_id "LTnewLTref_350006000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 30011 31750 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006000.1"; gene_id "LTnewLTref_350006000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 32701 33606 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006100.1"; gene_id "LTnewLTref_350006100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 32701 33606 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006100.1"; gene_id "LTnewLTref_350006100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 34681 35289 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006200.1"; gene_id "LTnewLTref_350006200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 34681 35289 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006200.1"; gene_id "LTnewLTref_350006200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 36166 36720 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006300.1"; gene_id "LTnewLTref_350006300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 36166 36720 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006300.1"; gene_id "LTnewLTref_350006300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 37430 38776 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006400.1"; gene_id "LTnewLTref_350006400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 37430 38776 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006400.1"; gene_id "LTnewLTref_350006400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 39470 40030 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006500.1"; gene_id "LTnewLTref_350006500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 39470 40030 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006500.1"; gene_id "LTnewLTref_350006500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 40891 41250 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006600.1"; gene_id "LTnewLTref_350006600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 40891 41250 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006600.1"; gene_id "LTnewLTref_350006600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 41908 42780 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006700.1"; gene_id "LTnewLTref_350006700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 41908 42780 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006700.1"; gene_id "LTnewLTref_350006700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 43601 44548 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006800.1"; gene_id "LTnewLTref_350006800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 43601 44548 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006800.1"; gene_id "LTnewLTref_350006800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 45020 46045 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350006900.1"; gene_id "LTnewLTref_350006900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 45020 46045 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350006900.1"; gene_id "LTnewLTref_350006900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 46823 49411 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350007000.1"; gene_id "LTnewLTref_350007000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 46823 49411 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350007000.1"; gene_id "LTnewLTref_350007000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 51810 52532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007100.1"; gene_id "LTnewLTref_350007100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 51810 52532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007100.1"; gene_id "LTnewLTref_350007100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 54246 60653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007200.1"; gene_id "LTnewLTref_350007200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 54246 60653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007200.1"; gene_id "LTnewLTref_350007200"; CM024321.1 Liftoff transcript 61605 61826 . + . transcript_id "LTnewLTref_350007300.1"; gene_id "LTnewLTref_350007300" CM024321.1 Liftoff CDS 61605 61826 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007300.1"; gene_id "LTnewLTref_350007300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 62790 63581 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007400.1"; gene_id "LTnewLTref_350007400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 62790 63581 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007400.1"; gene_id "LTnewLTref_350007400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 64557 65663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007500.1"; gene_id "LTnewLTref_350007500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 64557 65663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007500.1"; gene_id "LTnewLTref_350007500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 68588 68902 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007600.1"; gene_id "LTnewLTref_350007600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 68588 68902 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007600.1"; gene_id "LTnewLTref_350007600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 69731 71872 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007700.1"; gene_id "LTnewLTref_350007700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 69731 71872 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007700.1"; gene_id "LTnewLTref_350007700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 72303 74183 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007800.1"; gene_id "LTnewLTref_350007800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 72303 74183 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007800.1"; gene_id "LTnewLTref_350007800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 75043 75276 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350007900.1"; gene_id "LTnewLTref_350007900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 75043 75276 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350007900.1"; gene_id "LTnewLTref_350007900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 76991 77408 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_350008000.1"; gene_id "LTnewLTref_350008000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 76991 77098 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008000.1"; gene_id "LTnewLTref_350008000"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 77226 77408 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008000.1"; gene_id "LTnewLTref_350008000"; CM024321.1 Liftoff transcript 77867 78288 . + . transcript_id "LTnewLTref_350008100.1"; gene_id "LTnewLTref_350008100" CM024321.1 Liftoff CDS 77867 78288 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008100.1"; gene_id "LTnewLTref_350008100"; CM024321.1 . transcript 81814 85318 . + . transcript_id "LTnewLTref_350008200.1"; gene_id "LTnewLTref_350008200:pseudogene" CM024321.1 . exon 81814 85318 . + . transcript_id "LTnewLTref_350008200.1"; gene_id "LTnewLTref_350008200:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 86211 87209 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350008300.1"; gene_id "LTnewLTref_350008300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 86211 87209 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008300.1"; gene_id "LTnewLTref_350008300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 88396 89679 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350008400.1"; gene_id "LTnewLTref_350008400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 88396 89679 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008400.1"; gene_id "LTnewLTref_350008400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 91061 92692 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350008500.1"; gene_id "LTnewLTref_350008500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 91061 92692 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008500.1"; gene_id "LTnewLTref_350008500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 96138 97154 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350008600.1"; gene_id "LTnewLTref_350008600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 96138 97154 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008600.1"; gene_id "LTnewLTref_350008600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 97911 99406 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_350008700.1"; gene_id "LTnewLTref_350008700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 97911 98235 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008700.1"; gene_id "LTnewLTref_350008700"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 98319 99406 0.59 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350008700.1"; gene_id "LTnewLTref_350008700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 100140 102251 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350008800.1"; gene_id "LTnewLTref_350008800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 100140 102251 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008800.1"; gene_id "LTnewLTref_350008800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 103327 104220 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350008900.1"; gene_id "LTnewLTref_350008900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 103327 104220 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350008900.1"; gene_id "LTnewLTref_350008900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 104897 106114 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009000.1"; gene_id "LTnewLTref_350009000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 104897 106114 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009000.1"; gene_id "LTnewLTref_350009000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 111196 113043 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009100.1"; gene_id "LTnewLTref_350009100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 111196 113043 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009100.1"; gene_id "LTnewLTref_350009100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 116679 117602 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009200.1"; gene_id "LTnewLTref_350009200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 116679 117602 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009200.1"; gene_id "LTnewLTref_350009200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 122534 124180 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009300.1"; gene_id "LTnewLTref_350009300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 122534 124180 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009300.1"; gene_id "LTnewLTref_350009300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 125039 125830 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009400.1"; gene_id "LTnewLTref_350009400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 125039 125830 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009400.1"; gene_id "LTnewLTref_350009400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 126905 127696 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009500.1"; gene_id "LTnewLTref_350009500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 126905 127696 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009500.1"; gene_id "LTnewLTref_350009500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 128771 129565 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009600.1"; gene_id "LTnewLTref_350009600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 128771 129565 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009600.1"; gene_id "LTnewLTref_350009600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 130388 132091 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009700.1"; gene_id "LTnewLTref_350009700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 130388 132091 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009700.1"; gene_id "LTnewLTref_350009700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 133923 135836 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009800.1"; gene_id "LTnewLTref_350009800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 133923 135836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009800.1"; gene_id "LTnewLTref_350009800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 136992 138803 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350009900.1"; gene_id "LTnewLTref_350009900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 136992 138803 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350009900.1"; gene_id "LTnewLTref_350009900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 139943 142696 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350010000.1"; gene_id "LTnewLTref_350010000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 139943 142696 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010000.1"; gene_id "LTnewLTref_350010000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 145135 146106 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350010100.1"; gene_id "LTnewLTref_350010100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 145135 146106 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010100.1"; gene_id "LTnewLTref_350010100"; CM024321.1 . transcript 147140 147811 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010200.1"; gene_id "LTnewLTref_350010200:pseudogene" CM024321.1 . exon 147140 147811 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010200.1"; gene_id "LTnewLTref_350010200:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 148171 148596 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350010300.1"; gene_id "LTnewLTref_350010300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 148171 148596 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010300.1"; gene_id "LTnewLTref_350010300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 152749 156890 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_350010400.1"; gene_id "LTnewLTref_350010400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 152749 156771 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010400.1"; gene_id "LTnewLTref_350010400"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 156831 156890 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010400.1"; gene_id "LTnewLTref_350010400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 152749 157586 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_350010400.2"; gene_id "LTnewLTref_350010400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 152749 157473 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010400.2"; gene_id "LTnewLTref_350010400"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 157518 157586 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010400.2"; gene_id "LTnewLTref_350010400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 152749 157794 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350010400.3"; gene_id "LTnewLTref_350010400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 152749 157794 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010400.3"; gene_id "LTnewLTref_350010400"; CM024321.1 Liftoff transcript 163441 165880 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010500.1"; gene_id "LTnewLTref_350010500" CM024321.1 Liftoff exon 163441 165880 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010500.1"; gene_id "LTnewLTref_350010500"; CM024321.1 Liftoff CDS 163441 165879 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010500.1"; gene_id "LTnewLTref_350010500"; CM024321.1 . transcript 193428 193928 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010600.1"; gene_id "LTnewLTref_350010600" CM024321.1 . CDS 193428 193928 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350010600.1"; gene_id "LTnewLTref_350010600"; CM024321.1 . transcript 202247 204427 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010700.1"; gene_id "LTnewLTref_350010700:pseudogene" CM024321.1 . exon 202247 204427 . + . transcript_id "LTnewLTref_350010700.1"; gene_id "LTnewLTref_350010700:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 204046 205647 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_350010800.1"; gene_id "LTnewLTref_350010800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 204046 205647 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350010800.1"; gene_id "LTnewLTref_350010800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 205840 207378 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_350010900.1"; gene_id "LTnewLTref_350010900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 205840 207378 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350010900.1"; gene_id "LTnewLTref_350010900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 207434 209725 0.81 - . transcript_id "LTnewLTref_350011000.1"; gene_id "LTnewLTref_350011000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 207434 209725 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350011000.1"; gene_id "LTnewLTref_350011000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 209827 211001 0.75 - . transcript_id "LTnewLTref_350011100.1"; gene_id "LTnewLTref_350011100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 209827 210918 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350011100.1"; gene_id "LTnewLTref_350011100"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 210969 211001 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350011100.1"; gene_id "LTnewLTref_350011100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 211083 211394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011200.1"; gene_id "LTnewLTref_350011200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 211083 211394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011200.1"; gene_id "LTnewLTref_350011200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 218686 220147 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011300.1"; gene_id "LTnewLTref_350011300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 218686 220085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011300.1"; gene_id "LTnewLTref_350011300"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 220141 220147 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350011300.1"; gene_id "LTnewLTref_350011300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 218686 221925 0.81 + . transcript_id "LTnewLTref_350011300.2"; gene_id "LTnewLTref_350011300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 218686 221925 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011300.2"; gene_id "LTnewLTref_350011300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 222961 229329 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011400.1"; gene_id "LTnewLTref_350011400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 222961 229329 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011400.1"; gene_id "LTnewLTref_350011400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 231209 231883 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011500.1"; gene_id "LTnewLTref_350011500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 231209 231883 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011500.1"; gene_id "LTnewLTref_350011500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 233273 235414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011600.1"; gene_id "LTnewLTref_350011600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 233273 235414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011600.1"; gene_id "LTnewLTref_350011600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 236046 236585 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011700.1"; gene_id "LTnewLTref_350011700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 236046 236585 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011700.1"; gene_id "LTnewLTref_350011700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 237754 245262 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011800.1"; gene_id "LTnewLTref_350011800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 237754 245262 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011800.1"; gene_id "LTnewLTref_350011800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 246097 247236 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350011900.1"; gene_id "LTnewLTref_350011900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 246097 247236 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350011900.1"; gene_id "LTnewLTref_350011900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 247841 249634 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012000.1"; gene_id "LTnewLTref_350012000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 247841 249634 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012000.1"; gene_id "LTnewLTref_350012000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 251539 254817 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012100.1"; gene_id "LTnewLTref_350012100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 251539 254817 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012100.1"; gene_id "LTnewLTref_350012100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 256838 260680 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012200.1"; gene_id "LTnewLTref_350012200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 256838 260680 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012200.1"; gene_id "LTnewLTref_350012200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 261392 263080 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012300.1"; gene_id "LTnewLTref_350012300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 261392 263080 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012300.1"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 261392 273932 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_350012300.2"; gene_id "LTnewLTref_350012300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 261392 262965 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012300.2"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 263036 273932 0.59 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350012300.2"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 263106 263973 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_350012300.3"; gene_id "LTnewLTref_350012300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 263106 263912 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012300.3"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 263971 263973 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012300.3"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 263106 269778 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012300.4"; gene_id "LTnewLTref_350012300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 263106 269713 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012300.4"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 269772 269778 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350012300.4"; gene_id "LTnewLTref_350012300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 275393 280033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012400.1"; gene_id "LTnewLTref_350012400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 275393 280033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012400.1"; gene_id "LTnewLTref_350012400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 280568 282670 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012500.1"; gene_id "LTnewLTref_350012500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 280568 282670 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012500.1"; gene_id "LTnewLTref_350012500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 283294 284124 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012600.1"; gene_id "LTnewLTref_350012600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 283294 284124 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012600.1"; gene_id "LTnewLTref_350012600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 286282 287877 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012700.1"; gene_id "LTnewLTref_350012700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 286282 287877 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012700.1"; gene_id "LTnewLTref_350012700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 290461 291996 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012800.1"; gene_id "LTnewLTref_350012800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 290461 291996 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012800.1"; gene_id "LTnewLTref_350012800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 292631 294820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350012900.1"; gene_id "LTnewLTref_350012900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 292631 294820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350012900.1"; gene_id "LTnewLTref_350012900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 297007 299784 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013000.1"; gene_id "LTnewLTref_350013000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 297007 299784 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013000.1"; gene_id "LTnewLTref_350013000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 300353 301045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013100.1"; gene_id "LTnewLTref_350013100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 300353 301045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013100.1"; gene_id "LTnewLTref_350013100"; CM024321.1 Liftoff transcript 301693 301878 . + . transcript_id "LTnewLTref_350013200.1"; gene_id "LTnewLTref_350013200" CM024321.1 Liftoff CDS 301693 301878 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013200.1"; gene_id "LTnewLTref_350013200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 302939 304384 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013300.1"; gene_id "LTnewLTref_350013300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 302939 304384 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013300.1"; gene_id "LTnewLTref_350013300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 306472 308088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013400.1"; gene_id "LTnewLTref_350013400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 306472 308088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013400.1"; gene_id "LTnewLTref_350013400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 309874 310121 0.76 + . transcript_id "LTnewLTref_350013500.1"; gene_id "LTnewLTref_350013500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 309874 310005 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013500.1"; gene_id "LTnewLTref_350013500"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 310050 310121 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013500.1"; gene_id "LTnewLTref_350013500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 309874 312249 0.68 + . transcript_id "LTnewLTref_350013500.2"; gene_id "LTnewLTref_350013500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 309874 310589 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013500.2"; gene_id "LTnewLTref_350013500"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 310671 312249 0.68 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350013500.2"; gene_id "LTnewLTref_350013500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 313085 314644 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013600.1"; gene_id "LTnewLTref_350013600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 313085 314644 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013600.1"; gene_id "LTnewLTref_350013600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 317440 320466 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013700.1"; gene_id "LTnewLTref_350013700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 317440 320466 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013700.1"; gene_id "LTnewLTref_350013700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 323155 328125 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013800.1"; gene_id "LTnewLTref_350013800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 323155 328125 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013800.1"; gene_id "LTnewLTref_350013800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 328758 329996 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350013900.1"; gene_id "LTnewLTref_350013900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 328758 329996 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350013900.1"; gene_id "LTnewLTref_350013900"; CM024321.1 Liftoff transcript 331821 332009 . + . transcript_id "LTnewLTref_350014000.1"; gene_id "LTnewLTref_350014000" CM024321.1 Liftoff CDS 331821 332009 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014000.1"; gene_id "LTnewLTref_350014000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 334626 337186 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_350014100.1"; gene_id "LTnewLTref_350014100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 334626 337035 0.81 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014100.1"; gene_id "LTnewLTref_350014100"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 337155 337186 0.43 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350014100.1"; gene_id "LTnewLTref_350014100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 334626 338342 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014100.2"; gene_id "LTnewLTref_350014100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 334626 338342 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014100.2"; gene_id "LTnewLTref_350014100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 339210 340487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014200.1"; gene_id "LTnewLTref_350014200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 339210 340487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014200.1"; gene_id "LTnewLTref_350014200"; CM024321.1 . transcript 341255 343087 . + . transcript_id "LTnewLTref_350014300.1"; gene_id "LTnewLTref_350014300:pseudogene" CM024321.1 . exon 341255 343087 . + . transcript_id "LTnewLTref_350014300.1"; gene_id "LTnewLTref_350014300:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 343642 344925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014400.1"; gene_id "LTnewLTref_350014400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 343642 344925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014400.1"; gene_id "LTnewLTref_350014400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 345669 348443 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014500.1"; gene_id "LTnewLTref_350014500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 345669 348443 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014500.1"; gene_id "LTnewLTref_350014500"; CM024321.1 Liftoff transcript 349066 350685 . + . transcript_id "LTnewLTref_350014600.1"; gene_id "LTnewLTref_350014600" CM024321.1 Liftoff CDS 349066 350685 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014600.1"; gene_id "LTnewLTref_350014600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 351181 351678 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014700.1"; gene_id "LTnewLTref_350014700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 351181 351678 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014700.1"; gene_id "LTnewLTref_350014700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 352961 353668 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014800.1"; gene_id "LTnewLTref_350014800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 352961 353668 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014800.1"; gene_id "LTnewLTref_350014800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 355243 361173 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350014900.1"; gene_id "LTnewLTref_350014900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 355243 361173 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014900.1"; gene_id "LTnewLTref_350014900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 360607 361173 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_350014900.2"; gene_id "LTnewLTref_350014900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 360607 361173 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350014900.2"; gene_id "LTnewLTref_350014900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 362675 366727 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015000.1"; gene_id "LTnewLTref_350015000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 362675 366727 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015000.1"; gene_id "LTnewLTref_350015000"; CM024321.1 Liftoff transcript 367642 367935 . + . transcript_id "LTnewLTref_350015100.1"; gene_id "LTnewLTref_350015100" CM024321.1 Liftoff CDS 367642 367935 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015100.1"; gene_id "LTnewLTref_350015100"; CM024321.1 . transcript 368088 368282 . + . transcript_id "LTnewLTref_350015200.1"; gene_id "LTnewLTref_350015200:pseudogene" CM024321.1 . exon 368088 368282 . + . transcript_id "LTnewLTref_350015200.1"; gene_id "LTnewLTref_350015200:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 369743 370471 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015300.1"; gene_id "LTnewLTref_350015300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 369743 370471 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015300.1"; gene_id "LTnewLTref_350015300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 371540 372289 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015400.1"; gene_id "LTnewLTref_350015400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 371540 372289 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015400.1"; gene_id "LTnewLTref_350015400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 373691 374932 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015500.1"; gene_id "LTnewLTref_350015500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 373691 374932 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015500.1"; gene_id "LTnewLTref_350015500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 378504 380882 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015600.1"; gene_id "LTnewLTref_350015600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 378504 380882 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015600.1"; gene_id "LTnewLTref_350015600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 382138 383253 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015700.1"; gene_id "LTnewLTref_350015700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 382138 383253 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015700.1"; gene_id "LTnewLTref_350015700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 386581 387714 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350015800.1"; gene_id "LTnewLTref_350015800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 386581 387714 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350015800.1"; gene_id "LTnewLTref_350015800"; CM024321.1 . transcript 390237 392771 . + . transcript_id "LTnewLTref_350015900.1"; gene_id "LTnewLTref_350015900:pseudogene" CM024321.1 . exon 390237 392771 . + . transcript_id "LTnewLTref_350015900.1"; gene_id "LTnewLTref_350015900:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 393865 394857 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016000.1"; gene_id "LTnewLTref_350016000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 393865 394857 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016000.1"; gene_id "LTnewLTref_350016000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 397366 398427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016100.1"; gene_id "LTnewLTref_350016100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 397366 398427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016100.1"; gene_id "LTnewLTref_350016100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 406720 408018 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016200.1"; gene_id "LTnewLTref_350016200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 406720 408018 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016200.1"; gene_id "LTnewLTref_350016200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 420912 421565 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016300.1"; gene_id "LTnewLTref_350016300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 420912 421565 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016300.1"; gene_id "LTnewLTref_350016300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 422364 423305 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016400.1"; gene_id "LTnewLTref_350016400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 422364 423305 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016400.1"; gene_id "LTnewLTref_350016400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 436606 438072 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016500.1"; gene_id "LTnewLTref_350016500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 436606 438072 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016500.1"; gene_id "LTnewLTref_350016500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 440546 442288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016600.1"; gene_id "LTnewLTref_350016600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 440546 442288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016600.1"; gene_id "LTnewLTref_350016600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 443733 446267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016700.1"; gene_id "LTnewLTref_350016700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 443733 446267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016700.1"; gene_id "LTnewLTref_350016700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 447490 450687 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016800.1"; gene_id "LTnewLTref_350016800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 447490 450687 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016800.1"; gene_id "LTnewLTref_350016800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 452015 454060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350016900.1"; gene_id "LTnewLTref_350016900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 452015 454060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350016900.1"; gene_id "LTnewLTref_350016900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 455527 456167 0.7 + . transcript_id "LTnewLTref_350017000.1"; gene_id "LTnewLTref_350017000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 455527 456080 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017000.1"; gene_id "LTnewLTref_350017000"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 456146 456167 0.7 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350017000.1"; gene_id "LTnewLTref_350017000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 455527 456714 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350017000.2"; gene_id "LTnewLTref_350017000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 455527 456714 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017000.2"; gene_id "LTnewLTref_350017000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 457788 458462 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_350017100.1"; gene_id "LTnewLTref_350017100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 457788 458462 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017100.1"; gene_id "LTnewLTref_350017100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 458487 458894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350017200.1"; gene_id "LTnewLTref_350017200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 458487 458894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017200.1"; gene_id "LTnewLTref_350017200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 461746 464337 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350017300.1"; gene_id "LTnewLTref_350017300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 461746 464337 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017300.1"; gene_id "LTnewLTref_350017300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 466895 469414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350017400.1"; gene_id "LTnewLTref_350017400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 466895 469414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017400.1"; gene_id "LTnewLTref_350017400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 471262 471972 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_350017500.1"; gene_id "LTnewLTref_350017500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 471262 471972 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017500.1"; gene_id "LTnewLTref_350017500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 473955 474808 0.73 + . transcript_id "LTnewLTref_350017600.1"; gene_id "LTnewLTref_350017600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 473955 474669 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017600.1"; gene_id "LTnewLTref_350017600"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 474798 474808 0.73 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350017600.1"; gene_id "LTnewLTref_350017600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 473955 476331 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_350017600.2"; gene_id "LTnewLTref_350017600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 473955 476206 0.73 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017600.2"; gene_id "LTnewLTref_350017600"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 476253 476331 0.8 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350017600.2"; gene_id "LTnewLTref_350017600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 477958 480522 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350017700.1"; gene_id "LTnewLTref_350017700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 477958 480522 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017700.1"; gene_id "LTnewLTref_350017700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 481528 483357 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350017800.1"; gene_id "LTnewLTref_350017800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 481528 483357 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350017800.1"; gene_id "LTnewLTref_350017800"; CM024321.1 . transcript 484216 487650 . + . transcript_id "LTnewLTref_350017900.1"; gene_id "LTnewLTref_350017900:pseudogene" CM024321.1 . exon 484216 487650 . + . transcript_id "LTnewLTref_350017900.1"; gene_id "LTnewLTref_350017900:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 492289 493776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018000.1"; gene_id "LTnewLTref_350018000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 492289 493776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018000.1"; gene_id "LTnewLTref_350018000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 498433 500547 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018100.1"; gene_id "LTnewLTref_350018100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 498433 500547 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018100.1"; gene_id "LTnewLTref_350018100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 500982 501641 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018200.1"; gene_id "LTnewLTref_350018200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 500982 501641 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018200.1"; gene_id "LTnewLTref_350018200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 502222 502923 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018300.1"; gene_id "LTnewLTref_350018300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 502222 502923 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018300.1"; gene_id "LTnewLTref_350018300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 503544 504308 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018400.1"; gene_id "LTnewLTref_350018400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 503544 504308 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018400.1"; gene_id "LTnewLTref_350018400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 505056 505607 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018500.1"; gene_id "LTnewLTref_350018500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 505056 505607 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018500.1"; gene_id "LTnewLTref_350018500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 506555 509098 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018600.1"; gene_id "LTnewLTref_350018600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 506555 509098 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018600.1"; gene_id "LTnewLTref_350018600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 509918 510604 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018700.1"; gene_id "LTnewLTref_350018700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 509918 510604 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018700.1"; gene_id "LTnewLTref_350018700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 511821 512906 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018800.1"; gene_id "LTnewLTref_350018800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 511821 512906 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018800.1"; gene_id "LTnewLTref_350018800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 514073 515149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350018900.1"; gene_id "LTnewLTref_350018900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 514073 515149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350018900.1"; gene_id "LTnewLTref_350018900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 515800 516756 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019000.1"; gene_id "LTnewLTref_350019000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 515800 516756 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019000.1"; gene_id "LTnewLTref_350019000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 517629 518378 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019100.1"; gene_id "LTnewLTref_350019100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 517629 518378 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019100.1"; gene_id "LTnewLTref_350019100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 520829 521275 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019200.1"; gene_id "LTnewLTref_350019200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 520829 521275 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019200.1"; gene_id "LTnewLTref_350019200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 523748 524050 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019300.1"; gene_id "LTnewLTref_350019300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 523748 524050 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019300.1"; gene_id "LTnewLTref_350019300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 525184 530253 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019400.1"; gene_id "LTnewLTref_350019400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 525184 530253 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019400.1"; gene_id "LTnewLTref_350019400"; CM024321.1 Liftoff transcript 531238 532929 . + . transcript_id "LTnewLTref_350019500.1"; gene_id "LTnewLTref_350019500" CM024321.1 Liftoff CDS 531238 532929 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019500.1"; gene_id "LTnewLTref_350019500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 533922 534584 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019600.1"; gene_id "LTnewLTref_350019600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 533922 534584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019600.1"; gene_id "LTnewLTref_350019600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 535364 536353 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019700.1"; gene_id "LTnewLTref_350019700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 535364 536353 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019700.1"; gene_id "LTnewLTref_350019700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 538155 539699 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_350019800.1"; gene_id "LTnewLTref_350019800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 538155 539699 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019800.1"; gene_id "LTnewLTref_350019800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 542501 542863 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350019900.1"; gene_id "LTnewLTref_350019900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 542501 542863 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350019900.1"; gene_id "LTnewLTref_350019900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 543850 545322 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020000.1"; gene_id "LTnewLTref_350020000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 543850 545322 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020000.1"; gene_id "LTnewLTref_350020000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 548624 550666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020100.1"; gene_id "LTnewLTref_350020100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 548624 550666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020100.1"; gene_id "LTnewLTref_350020100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 553247 553945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020200.1"; gene_id "LTnewLTref_350020200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 553247 553945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020200.1"; gene_id "LTnewLTref_350020200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 555216 557582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020300.1"; gene_id "LTnewLTref_350020300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 555216 557582 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020300.1"; gene_id "LTnewLTref_350020300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 559243 561120 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020400.1"; gene_id "LTnewLTref_350020400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 559243 561120 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020400.1"; gene_id "LTnewLTref_350020400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 564251 565033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020500.1"; gene_id "LTnewLTref_350020500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 564251 565033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020500.1"; gene_id "LTnewLTref_350020500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 566640 567422 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020600.1"; gene_id "LTnewLTref_350020600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 566640 567422 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020600.1"; gene_id "LTnewLTref_350020600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 570788 580007 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_350020700.1"; gene_id "LTnewLTref_350020700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 570788 579514 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020700.1"; gene_id "LTnewLTref_350020700"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 579573 580007 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020700.1"; gene_id "LTnewLTref_350020700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 580896 581885 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020800.1"; gene_id "LTnewLTref_350020800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 580896 581885 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020800.1"; gene_id "LTnewLTref_350020800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 586104 588110 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350020900.1"; gene_id "LTnewLTref_350020900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 586104 588110 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350020900.1"; gene_id "LTnewLTref_350020900"; CM024321.1 Liftoff transcript 589104 589297 . - . transcript_id "LTnewLTref_350021000.1"; gene_id "LTnewLTref_350021000" CM024321.1 Liftoff CDS 589104 589297 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021000.1"; gene_id "LTnewLTref_350021000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 594141 595130 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350021100.1"; gene_id "LTnewLTref_350021100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 594141 595130 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021100.1"; gene_id "LTnewLTref_350021100"; CM024321.1 . transcript 597065 597418 . - . transcript_id "LTnewLTref_350021200.1"; gene_id "LTnewLTref_350021200:pseudogene" CM024321.1 . exon 597065 597418 . - . transcript_id "LTnewLTref_350021200.1"; gene_id "LTnewLTref_350021200:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 598879 599769 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_350021300.1"; gene_id "LTnewLTref_350021300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 598879 599769 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021300.1"; gene_id "LTnewLTref_350021300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 603141 604940 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350021400.1"; gene_id "LTnewLTref_350021400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 603141 604940 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021400.1"; gene_id "LTnewLTref_350021400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 607403 609589 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_350021500.1"; gene_id "LTnewLTref_350021500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 607403 609589 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021500.1"; gene_id "LTnewLTref_350021500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 610337 611458 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350021600.1"; gene_id "LTnewLTref_350021600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 610337 611458 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021600.1"; gene_id "LTnewLTref_350021600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 614016 614909 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350021700.1"; gene_id "LTnewLTref_350021700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 614016 614909 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021700.1"; gene_id "LTnewLTref_350021700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 615766 617943 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350021800.1"; gene_id "LTnewLTref_350021800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 615766 617943 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021800.1"; gene_id "LTnewLTref_350021800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 618513 624092 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350021900.1"; gene_id "LTnewLTref_350021900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 618513 624092 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350021900.1"; gene_id "LTnewLTref_350021900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 626128 627360 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022000.1"; gene_id "LTnewLTref_350022000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 626128 627360 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022000.1"; gene_id "LTnewLTref_350022000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 628687 630009 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022100.1"; gene_id "LTnewLTref_350022100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 628687 630009 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022100.1"; gene_id "LTnewLTref_350022100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 631216 632850 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_350022200.1"; gene_id "LTnewLTref_350022200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 631216 632560 0.8 - 1 transcript_id "LTnewLTref_350022200.1"; gene_id "LTnewLTref_350022200"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 632624 632850 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022200.1"; gene_id "LTnewLTref_350022200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 631216 632952 0.72 - . transcript_id "LTnewLTref_350022200.2"; gene_id "LTnewLTref_350022200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 631216 632560 0.72 - 1 transcript_id "LTnewLTref_350022200.2"; gene_id "LTnewLTref_350022200"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 632624 632952 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022200.2"; gene_id "LTnewLTref_350022200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 634656 636998 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022300.1"; gene_id "LTnewLTref_350022300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 634656 636998 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022300.1"; gene_id "LTnewLTref_350022300"; CM024321.1 Liftoff transcript 637860 640694 . - . transcript_id "LTnewLTref_350022400.1"; gene_id "LTnewLTref_350022400" CM024321.1 Liftoff CDS 637860 640694 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022400.1"; gene_id "LTnewLTref_350022400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 643184 649039 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022500.1"; gene_id "LTnewLTref_350022500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 643184 649039 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022500.1"; gene_id "LTnewLTref_350022500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 651483 652919 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022600.1"; gene_id "LTnewLTref_350022600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 651483 652919 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022600.1"; gene_id "LTnewLTref_350022600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 653968 655038 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022700.1"; gene_id "LTnewLTref_350022700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 653968 655038 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022700.1"; gene_id "LTnewLTref_350022700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 656334 658325 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022800.1"; gene_id "LTnewLTref_350022800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 656334 658325 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022800.1"; gene_id "LTnewLTref_350022800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 659503 662025 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350022900.1"; gene_id "LTnewLTref_350022900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 659503 662025 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350022900.1"; gene_id "LTnewLTref_350022900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 663167 663598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023000.1"; gene_id "LTnewLTref_350023000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 663167 663598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023000.1"; gene_id "LTnewLTref_350023000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 664523 665359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023100.1"; gene_id "LTnewLTref_350023100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 664523 665359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023100.1"; gene_id "LTnewLTref_350023100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 666082 667323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023200.1"; gene_id "LTnewLTref_350023200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 666082 667323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023200.1"; gene_id "LTnewLTref_350023200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 668335 669423 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023300.1"; gene_id "LTnewLTref_350023300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 668335 669423 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023300.1"; gene_id "LTnewLTref_350023300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 671715 673049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023400.1"; gene_id "LTnewLTref_350023400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 671715 673049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023400.1"; gene_id "LTnewLTref_350023400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 674785 675903 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023500.1"; gene_id "LTnewLTref_350023500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 674785 675903 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023500.1"; gene_id "LTnewLTref_350023500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 678163 681657 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350023600.1"; gene_id "LTnewLTref_350023600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 678163 681657 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023600.1"; gene_id "LTnewLTref_350023600"; CM024321.1 Liftoff transcript 682198 682557 . - . transcript_id "LTnewLTref_350023700.1"; gene_id "LTnewLTref_350023700" CM024321.1 Liftoff CDS 682198 682557 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350023700.1"; gene_id "LTnewLTref_350023700"; CM024321.1 . transcript 683201 684231 . - . transcript_id "LTnewLTref_350023800.1"; gene_id "LTnewLTref_350023800:pseudogene" CM024321.1 . exon 683201 684231 . - . transcript_id "LTnewLTref_350023800.1"; gene_id "LTnewLTref_350023800:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 685578 686000 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350023900.1"; gene_id "LTnewLTref_350023900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 685578 686000 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350023900.1"; gene_id "LTnewLTref_350023900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 686714 687454 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024000.1"; gene_id "LTnewLTref_350024000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 686714 687454 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024000.1"; gene_id "LTnewLTref_350024000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 687918 688553 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024100.1"; gene_id "LTnewLTref_350024100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 687918 688553 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024100.1"; gene_id "LTnewLTref_350024100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 688989 690647 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024200.1"; gene_id "LTnewLTref_350024200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 688989 690647 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024200.1"; gene_id "LTnewLTref_350024200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 692099 693094 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024300.1"; gene_id "LTnewLTref_350024300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 692099 693094 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024300.1"; gene_id "LTnewLTref_350024300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 694119 695564 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024400.1"; gene_id "LTnewLTref_350024400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 694119 695564 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024400.1"; gene_id "LTnewLTref_350024400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 696957 697781 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024500.1"; gene_id "LTnewLTref_350024500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 696957 697781 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024500.1"; gene_id "LTnewLTref_350024500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 699615 701834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024600.1"; gene_id "LTnewLTref_350024600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 699615 701834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024600.1"; gene_id "LTnewLTref_350024600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 703152 703604 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024700.1"; gene_id "LTnewLTref_350024700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 703152 703604 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024700.1"; gene_id "LTnewLTref_350024700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 704893 705537 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350024800.1"; gene_id "LTnewLTref_350024800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 704893 705537 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024800.1"; gene_id "LTnewLTref_350024800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 708949 711084 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_350024900.1"; gene_id "LTnewLTref_350024900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 708949 711084 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350024900.1"; gene_id "LTnewLTref_350024900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 717629 719848 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350025000.1"; gene_id "LTnewLTref_350025000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 717629 719848 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025000.1"; gene_id "LTnewLTref_350025000"; CM024321.1 . transcript 721697 722635 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025100.1"; gene_id "LTnewLTref_350025100:pseudogene" CM024321.1 . exon 721697 722635 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025100.1"; gene_id "LTnewLTref_350025100:pseudogene"; CM024321.1 . transcript 723583 724518 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025200.1"; gene_id "LTnewLTref_350025200:pseudogene" CM024321.1 . exon 723583 724518 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025200.1"; gene_id "LTnewLTref_350025200:pseudogene"; CM024321.1 Liftoff transcript 725681 726679 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025300.1"; gene_id "LTnewLTref_350025300" CM024321.1 Liftoff CDS 725681 726679 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025300.1"; gene_id "LTnewLTref_350025300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 727525 728139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350025400.1"; gene_id "LTnewLTref_350025400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 727525 728139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025400.1"; gene_id "LTnewLTref_350025400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 729152 729469 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350025500.1"; gene_id "LTnewLTref_350025500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 729152 729469 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025500.1"; gene_id "LTnewLTref_350025500"; CM024321.1 . transcript 730158 731138 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025600.1"; gene_id "LTnewLTref_350025600:pseudogene" CM024321.1 . exon 730158 731138 . + . transcript_id "LTnewLTref_350025600.1"; gene_id "LTnewLTref_350025600:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 731960 733347 0.46 + . transcript_id "LTnewLTref_350025700.1"; gene_id "LTnewLTref_350025700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 731960 732895 0.5 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025700.1"; gene_id "LTnewLTref_350025700"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 732949 733347 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025700.1"; gene_id "LTnewLTref_350025700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 734055 735914 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350025800.1"; gene_id "LTnewLTref_350025800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 734055 735914 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025800.1"; gene_id "LTnewLTref_350025800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 736640 737347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350025900.1"; gene_id "LTnewLTref_350025900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 736640 737347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350025900.1"; gene_id "LTnewLTref_350025900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 738875 739510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026000.1"; gene_id "LTnewLTref_350026000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 738875 739510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026000.1"; gene_id "LTnewLTref_350026000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 742308 743306 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026100.1"; gene_id "LTnewLTref_350026100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 742308 743306 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026100.1"; gene_id "LTnewLTref_350026100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 744154 745926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026200.1"; gene_id "LTnewLTref_350026200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 744154 745926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026200.1"; gene_id "LTnewLTref_350026200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 747072 750257 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026300.1"; gene_id "LTnewLTref_350026300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 747072 750257 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026300.1"; gene_id "LTnewLTref_350026300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 751401 754145 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026400.1"; gene_id "LTnewLTref_350026400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 751401 754145 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026400.1"; gene_id "LTnewLTref_350026400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 755563 756312 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026500.1"; gene_id "LTnewLTref_350026500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 755563 756312 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026500.1"; gene_id "LTnewLTref_350026500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 758160 759281 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026600.1"; gene_id "LTnewLTref_350026600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 758160 759281 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026600.1"; gene_id "LTnewLTref_350026600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 761155 765419 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_350026700.1"; gene_id "LTnewLTref_350026700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 761155 762622 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026700.1"; gene_id "LTnewLTref_350026700"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 762685 765419 0.45 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350026700.1"; gene_id "LTnewLTref_350026700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 766728 778052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026800.1"; gene_id "LTnewLTref_350026800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 766728 778052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026800.1"; gene_id "LTnewLTref_350026800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 779036 779437 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350026900.1"; gene_id "LTnewLTref_350026900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 779036 779437 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350026900.1"; gene_id "LTnewLTref_350026900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 780753 782201 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027000.1"; gene_id "LTnewLTref_350027000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 780753 782201 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027000.1"; gene_id "LTnewLTref_350027000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 783150 785264 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027100.1"; gene_id "LTnewLTref_350027100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 783150 785264 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027100.1"; gene_id "LTnewLTref_350027100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 791852 795529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027200.1"; gene_id "LTnewLTref_350027200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 791852 795529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027200.1"; gene_id "LTnewLTref_350027200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 798549 800645 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027300.1"; gene_id "LTnewLTref_350027300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 798549 800645 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027300.1"; gene_id "LTnewLTref_350027300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 803530 804321 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_350027400.1"; gene_id "LTnewLTref_350027400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 803530 804321 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027400.1"; gene_id "LTnewLTref_350027400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 804951 807122 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027500.1"; gene_id "LTnewLTref_350027500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 804951 807122 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027500.1"; gene_id "LTnewLTref_350027500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 808711 810930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027600.1"; gene_id "LTnewLTref_350027600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 808711 810930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027600.1"; gene_id "LTnewLTref_350027600"; CM024321.1 Liftoff transcript 813163 813377 . + . transcript_id "LTnewLTref_350027700.1"; gene_id "LTnewLTref_350027700" CM024321.1 Liftoff CDS 813163 813377 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027700.1"; gene_id "LTnewLTref_350027700"; CM024321.1 . transcript 815248 815641 . + . transcript_id "LTnewLTref_350027800.1"; gene_id "LTnewLTref_350027800:pseudogene" CM024321.1 . exon 815248 815508 . + . transcript_id "LTnewLTref_350027800.1"; gene_id "LTnewLTref_350027800:pseudogene"; CM024321.1 . exon 815510 815641 . + . transcript_id "LTnewLTref_350027800.1"; gene_id "LTnewLTref_350027800:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 816282 816899 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350027900.1"; gene_id "LTnewLTref_350027900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 816282 816899 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350027900.1"; gene_id "LTnewLTref_350027900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 818361 819167 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028000.1"; gene_id "LTnewLTref_350028000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 818361 819167 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028000.1"; gene_id "LTnewLTref_350028000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 820230 821744 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028100.1"; gene_id "LTnewLTref_350028100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 820230 821129 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028100.1"; gene_id "LTnewLTref_350028100"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 821199 821744 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028100.1"; gene_id "LTnewLTref_350028100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 825766 827403 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028200.1"; gene_id "LTnewLTref_350028200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 825766 827403 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028200.1"; gene_id "LTnewLTref_350028200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 828102 829424 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028300.1"; gene_id "LTnewLTref_350028300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 828102 829424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028300.1"; gene_id "LTnewLTref_350028300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 830609 831698 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_350028400.1"; gene_id "LTnewLTref_350028400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 830609 831404 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028400.1"; gene_id "LTnewLTref_350028400"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 831499 831698 0.85 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350028400.1"; gene_id "LTnewLTref_350028400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 833830 835284 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028500.1"; gene_id "LTnewLTref_350028500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 833830 835284 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028500.1"; gene_id "LTnewLTref_350028500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 836375 839584 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028600.1"; gene_id "LTnewLTref_350028600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 836375 839584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028600.1"; gene_id "LTnewLTref_350028600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 840261 840755 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028700.1"; gene_id "LTnewLTref_350028700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 840261 840755 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028700.1"; gene_id "LTnewLTref_350028700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 842172 842996 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028800.1"; gene_id "LTnewLTref_350028800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 842172 842996 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028800.1"; gene_id "LTnewLTref_350028800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 849405 849683 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350028900.1"; gene_id "LTnewLTref_350028900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 849405 849683 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350028900.1"; gene_id "LTnewLTref_350028900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 852404 852682 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029000.1"; gene_id "LTnewLTref_350029000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 852404 852682 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029000.1"; gene_id "LTnewLTref_350029000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 854349 854627 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029100.1"; gene_id "LTnewLTref_350029100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 854349 854627 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029100.1"; gene_id "LTnewLTref_350029100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 856204 857079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029200.1"; gene_id "LTnewLTref_350029200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 856204 857079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029200.1"; gene_id "LTnewLTref_350029200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 858259 859863 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029300.1"; gene_id "LTnewLTref_350029300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 858259 859863 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029300.1"; gene_id "LTnewLTref_350029300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 861710 870583 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029400.1"; gene_id "LTnewLTref_350029400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 861710 870583 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029400.1"; gene_id "LTnewLTref_350029400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 872235 873817 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_350029500.1"; gene_id "LTnewLTref_350029500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 872235 872627 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029500.1"; gene_id "LTnewLTref_350029500"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 872675 873817 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029500.1"; gene_id "LTnewLTref_350029500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 875437 880329 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_350029600.1"; gene_id "LTnewLTref_350029600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 875437 880329 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029600.1"; gene_id "LTnewLTref_350029600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 882248 883645 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029700.1"; gene_id "LTnewLTref_350029700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 882248 883645 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029700.1"; gene_id "LTnewLTref_350029700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 884563 889110 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350029800.1"; gene_id "LTnewLTref_350029800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 884563 889110 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029800.1"; gene_id "LTnewLTref_350029800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 890244 891464 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_350029900.1"; gene_id "LTnewLTref_350029900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 890244 891464 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350029900.1"; gene_id "LTnewLTref_350029900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 892584 893330 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030000.1"; gene_id "LTnewLTref_350030000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 892584 893330 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030000.1"; gene_id "LTnewLTref_350030000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 896302 899688 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030100.1"; gene_id "LTnewLTref_350030100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 896302 899688 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030100.1"; gene_id "LTnewLTref_350030100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 902917 905676 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030200.1"; gene_id "LTnewLTref_350030200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 902917 905676 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030200.1"; gene_id "LTnewLTref_350030200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 908891 910924 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030300.1"; gene_id "LTnewLTref_350030300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 908891 910924 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030300.1"; gene_id "LTnewLTref_350030300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 912057 913511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030400.1"; gene_id "LTnewLTref_350030400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 912057 913511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030400.1"; gene_id "LTnewLTref_350030400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 915353 915952 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030500.1"; gene_id "LTnewLTref_350030500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 915353 915952 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030500.1"; gene_id "LTnewLTref_350030500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 916884 919589 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030600.1"; gene_id "LTnewLTref_350030600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 916884 919589 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030600.1"; gene_id "LTnewLTref_350030600"; CM024321.1 Liftoff transcript 921926 926101 . + . transcript_id "LTnewLTref_350030700.1"; gene_id "LTnewLTref_350030700" CM024321.1 Liftoff CDS 921926 926101 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030700.1"; gene_id "LTnewLTref_350030700"; CM024321.1 . transcript 929208 929607 . + . transcript_id "LTnewLTref_350030800.1"; gene_id "LTnewLTref_350030800:pseudogene" CM024321.1 . exon 929208 929366 . + . transcript_id "LTnewLTref_350030800.1"; gene_id "LTnewLTref_350030800:pseudogene"; CM024321.1 . exon 929369 929536 . + . transcript_id "LTnewLTref_350030800.1"; gene_id "LTnewLTref_350030800:pseudogene"; CM024321.1 . exon 929539 929607 . + . transcript_id "LTnewLTref_350030800.1"; gene_id "LTnewLTref_350030800:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 932833 933291 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350030900.1"; gene_id "LTnewLTref_350030900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 932833 933291 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350030900.1"; gene_id "LTnewLTref_350030900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 934612 939990 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031000.1"; gene_id "LTnewLTref_350031000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 934612 939990 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031000.1"; gene_id "LTnewLTref_350031000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 942425 945196 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031100.1"; gene_id "LTnewLTref_350031100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 942425 945196 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031100.1"; gene_id "LTnewLTref_350031100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 948405 949658 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031200.1"; gene_id "LTnewLTref_350031200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 948405 949658 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031200.1"; gene_id "LTnewLTref_350031200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 959820 962171 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031300.1"; gene_id "LTnewLTref_350031300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 959820 962171 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031300.1"; gene_id "LTnewLTref_350031300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 964310 965134 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031400.1"; gene_id "LTnewLTref_350031400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 964310 965134 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031400.1"; gene_id "LTnewLTref_350031400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 971866 978798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031500.1"; gene_id "LTnewLTref_350031500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 971866 978798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031500.1"; gene_id "LTnewLTref_350031500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 980851 982026 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031600.1"; gene_id "LTnewLTref_350031600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 980851 982026 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031600.1"; gene_id "LTnewLTref_350031600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 983405 984421 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031700.1"; gene_id "LTnewLTref_350031700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 983405 984421 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031700.1"; gene_id "LTnewLTref_350031700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 985461 990416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031800.1"; gene_id "LTnewLTref_350031800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 985461 990416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031800.1"; gene_id "LTnewLTref_350031800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 992268 993935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350031900.1"; gene_id "LTnewLTref_350031900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 992268 993935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350031900.1"; gene_id "LTnewLTref_350031900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 995267 995602 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032000.1"; gene_id "LTnewLTref_350032000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 995267 995602 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032000.1"; gene_id "LTnewLTref_350032000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 996015 997700 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032100.1"; gene_id "LTnewLTref_350032100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 996015 997700 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032100.1"; gene_id "LTnewLTref_350032100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 998504 999520 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032200.1"; gene_id "LTnewLTref_350032200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 998504 999520 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032200.1"; gene_id "LTnewLTref_350032200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1000215 1000862 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032300.1"; gene_id "LTnewLTref_350032300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1000215 1000862 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032300.1"; gene_id "LTnewLTref_350032300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1003579 1004949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032400.1"; gene_id "LTnewLTref_350032400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1003579 1004949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032400.1"; gene_id "LTnewLTref_350032400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1007599 1010097 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032500.1"; gene_id "LTnewLTref_350032500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1007599 1010097 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032500.1"; gene_id "LTnewLTref_350032500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1013021 1013677 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032600.1"; gene_id "LTnewLTref_350032600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1013021 1013677 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032600.1"; gene_id "LTnewLTref_350032600"; CM024321.1 . transcript 1015111 1015686 . + . transcript_id "LTnewLTref_350032700.1"; gene_id "LTnewLTref_350032700:pseudogene" CM024321.1 . exon 1015111 1015686 . + . transcript_id "LTnewLTref_350032700.1"; gene_id "LTnewLTref_350032700:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1016273 1017511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032800.1"; gene_id "LTnewLTref_350032800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1016273 1017511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032800.1"; gene_id "LTnewLTref_350032800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1018206 1018505 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350032900.1"; gene_id "LTnewLTref_350032900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1018206 1018505 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350032900.1"; gene_id "LTnewLTref_350032900"; CM024321.1 . transcript 1018680 1018990 . + . transcript_id "LTnewLTref_350033000.1"; gene_id "LTnewLTref_350033000:pseudogene" CM024321.1 . exon 1018680 1018990 . + . transcript_id "LTnewLTref_350033000.1"; gene_id "LTnewLTref_350033000:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1019049 1019450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033100.1"; gene_id "LTnewLTref_350033100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1019049 1019450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033100.1"; gene_id "LTnewLTref_350033100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1020025 1021005 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033200.1"; gene_id "LTnewLTref_350033200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1020025 1021005 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033200.1"; gene_id "LTnewLTref_350033200"; CM024321.1 Liftoff transcript 1021186 1021410 . - . transcript_id "LTnewLTref_350033300.1"; gene_id "LTnewLTref_350033300" CM024321.1 Liftoff CDS 1021186 1021410 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033300.1"; gene_id "LTnewLTref_350033300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1021623 1022828 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033400.1"; gene_id "LTnewLTref_350033400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1021623 1022828 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033400.1"; gene_id "LTnewLTref_350033400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1023328 1025559 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033500.1"; gene_id "LTnewLTref_350033500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1023328 1025559 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033500.1"; gene_id "LTnewLTref_350033500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1026351 1028189 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033600.1"; gene_id "LTnewLTref_350033600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1026351 1028189 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033600.1"; gene_id "LTnewLTref_350033600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1028857 1029660 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033700.1"; gene_id "LTnewLTref_350033700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1028857 1029660 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033700.1"; gene_id "LTnewLTref_350033700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1030542 1032572 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033800.1"; gene_id "LTnewLTref_350033800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1030542 1032572 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033800.1"; gene_id "LTnewLTref_350033800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1033362 1033883 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350033900.1"; gene_id "LTnewLTref_350033900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1033362 1033883 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350033900.1"; gene_id "LTnewLTref_350033900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1036316 1036648 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034000.1"; gene_id "LTnewLTref_350034000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1036316 1036648 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034000.1"; gene_id "LTnewLTref_350034000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1039162 1040577 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034100.1"; gene_id "LTnewLTref_350034100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1039162 1040577 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034100.1"; gene_id "LTnewLTref_350034100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1041910 1044876 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_350034200.1"; gene_id "LTnewLTref_350034200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1041910 1044876 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034200.1"; gene_id "LTnewLTref_350034200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1041910 1046502 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034200.2"; gene_id "LTnewLTref_350034200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1041910 1046502 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034200.2"; gene_id "LTnewLTref_350034200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1047570 1049108 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034300.1"; gene_id "LTnewLTref_350034300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1047570 1049108 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034300.1"; gene_id "LTnewLTref_350034300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1050579 1051487 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034400.1"; gene_id "LTnewLTref_350034400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1050579 1051487 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034400.1"; gene_id "LTnewLTref_350034400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1053598 1055910 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034500.1"; gene_id "LTnewLTref_350034500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1053598 1055910 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034500.1"; gene_id "LTnewLTref_350034500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1058658 1059923 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034600.1"; gene_id "LTnewLTref_350034600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1058658 1059923 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034600.1"; gene_id "LTnewLTref_350034600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1064961 1066391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034700.1"; gene_id "LTnewLTref_350034700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1064961 1066391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034700.1"; gene_id "LTnewLTref_350034700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1067483 1069258 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034800.1"; gene_id "LTnewLTref_350034800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1067483 1069258 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034800.1"; gene_id "LTnewLTref_350034800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1070051 1071994 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350034900.1"; gene_id "LTnewLTref_350034900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1070051 1071994 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350034900.1"; gene_id "LTnewLTref_350034900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1073096 1077097 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350035000.1"; gene_id "LTnewLTref_350035000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1073096 1077097 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035000.1"; gene_id "LTnewLTref_350035000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1080998 1083094 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350035100.1"; gene_id "LTnewLTref_350035100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1080998 1083094 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035100.1"; gene_id "LTnewLTref_350035100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1086218 1086718 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350035200.1"; gene_id "LTnewLTref_350035200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1086218 1086718 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035200.1"; gene_id "LTnewLTref_350035200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1091811 1093013 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350035300.1"; gene_id "LTnewLTref_350035300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1091811 1093013 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035300.1"; gene_id "LTnewLTref_350035300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1094014 1094343 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_350035400.1"; gene_id "LTnewLTref_350035400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1094014 1094343 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035400.1"; gene_id "LTnewLTref_350035400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1094014 1094693 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_350035400.2"; gene_id "LTnewLTref_350035400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1094014 1094409 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035400.2"; gene_id "LTnewLTref_350035400"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1094529 1094693 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035400.2"; gene_id "LTnewLTref_350035400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1097948 1099150 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350035500.1"; gene_id "LTnewLTref_350035500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1097948 1099150 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035500.1"; gene_id "LTnewLTref_350035500"; CM024321.1 . transcript 1101854 1103969 . - . transcript_id "LTnewLTref_350035600.1"; gene_id "LTnewLTref_350035600:pseudogene" CM024321.1 . exon 1101854 1103969 . - . transcript_id "LTnewLTref_350035600.1"; gene_id "LTnewLTref_350035600:pseudogene"; CM024321.1 Liftoff transcript 1108672 1109096 . - . transcript_id "LTnewLTref_350035700.1"; gene_id "LTnewLTref_350035700" CM024321.1 Liftoff CDS 1108672 1109096 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035700.1"; gene_id "LTnewLTref_350035700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1110685 1112628 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350035800.1"; gene_id "LTnewLTref_350035800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1110685 1112628 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350035800.1"; gene_id "LTnewLTref_350035800"; CM024321.1 . transcript 1114278 1116048 . - . transcript_id "LTnewLTref_350035900.1"; gene_id "LTnewLTref_350035900:pseudogene" CM024321.1 . exon 1114278 1116048 . - . transcript_id "LTnewLTref_350035900.1"; gene_id "LTnewLTref_350035900:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1116419 1117786 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036000.1"; gene_id "LTnewLTref_350036000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1116419 1117786 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036000.1"; gene_id "LTnewLTref_350036000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1119623 1121323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036100.1"; gene_id "LTnewLTref_350036100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1119623 1121323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036100.1"; gene_id "LTnewLTref_350036100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1122750 1123205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036200.1"; gene_id "LTnewLTref_350036200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1122750 1123205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036200.1"; gene_id "LTnewLTref_350036200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1123754 1125976 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036300.1"; gene_id "LTnewLTref_350036300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1123754 1125976 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036300.1"; gene_id "LTnewLTref_350036300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1126801 1127226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036400.1"; gene_id "LTnewLTref_350036400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1126801 1127226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036400.1"; gene_id "LTnewLTref_350036400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1128081 1129904 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036500.1"; gene_id "LTnewLTref_350036500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1128081 1129904 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036500.1"; gene_id "LTnewLTref_350036500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1130850 1133033 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036600.1"; gene_id "LTnewLTref_350036600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1130850 1133033 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036600.1"; gene_id "LTnewLTref_350036600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1133916 1134287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036700.1"; gene_id "LTnewLTref_350036700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1133916 1134287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036700.1"; gene_id "LTnewLTref_350036700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1139281 1139673 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_350036800.1"; gene_id "LTnewLTref_350036800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1139281 1139673 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036800.1"; gene_id "LTnewLTref_350036800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1140248 1143679 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350036900.1"; gene_id "LTnewLTref_350036900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1140248 1143679 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350036900.1"; gene_id "LTnewLTref_350036900"; CM024321.1 Liftoff transcript 1144244 1146100 . - . transcript_id "LTnewLTref_350037000.1"; gene_id "LTnewLTref_350037000" CM024321.1 Liftoff CDS 1144244 1146100 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037000.1"; gene_id "LTnewLTref_350037000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1149461 1153129 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037100.1"; gene_id "LTnewLTref_350037100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1149461 1153129 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037100.1"; gene_id "LTnewLTref_350037100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1153965 1157255 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037200.1"; gene_id "LTnewLTref_350037200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1153965 1157255 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037200.1"; gene_id "LTnewLTref_350037200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1158644 1160323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037300.1"; gene_id "LTnewLTref_350037300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1158644 1160323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037300.1"; gene_id "LTnewLTref_350037300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1161558 1162703 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037400.1"; gene_id "LTnewLTref_350037400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1161558 1162703 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037400.1"; gene_id "LTnewLTref_350037400"; CM024321.1 . transcript 1163525 1163813 . - . transcript_id "LTnewLTref_350037500.1"; gene_id "LTnewLTref_350037500:pseudogene" CM024321.1 . exon 1163525 1163813 . - . transcript_id "LTnewLTref_350037500.1"; gene_id "LTnewLTref_350037500:pseudogene"; CM024321.1 . transcript 1164598 1165262 . - . transcript_id "LTnewLTref_350037600.1"; gene_id "LTnewLTref_350037600:pseudogene" CM024321.1 . exon 1164598 1165262 . - . transcript_id "LTnewLTref_350037600.1"; gene_id "LTnewLTref_350037600:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1166906 1168342 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037700.1"; gene_id "LTnewLTref_350037700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1166906 1168342 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037700.1"; gene_id "LTnewLTref_350037700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1170767 1172005 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037800.1"; gene_id "LTnewLTref_350037800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1170767 1172005 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037800.1"; gene_id "LTnewLTref_350037800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1174173 1175555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350037900.1"; gene_id "LTnewLTref_350037900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1174173 1175555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350037900.1"; gene_id "LTnewLTref_350037900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1179340 1179765 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038000.1"; gene_id "LTnewLTref_350038000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1179340 1179765 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038000.1"; gene_id "LTnewLTref_350038000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1181353 1182714 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038100.1"; gene_id "LTnewLTref_350038100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1181353 1182714 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038100.1"; gene_id "LTnewLTref_350038100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1183449 1184249 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038200.1"; gene_id "LTnewLTref_350038200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1183449 1184249 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038200.1"; gene_id "LTnewLTref_350038200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1185286 1186101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038300.1"; gene_id "LTnewLTref_350038300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1185286 1186101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038300.1"; gene_id "LTnewLTref_350038300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1187644 1188867 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038400.1"; gene_id "LTnewLTref_350038400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1187644 1188867 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038400.1"; gene_id "LTnewLTref_350038400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1192200 1195664 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038500.1"; gene_id "LTnewLTref_350038500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1192200 1195664 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038500.1"; gene_id "LTnewLTref_350038500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1197478 1199946 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038600.1"; gene_id "LTnewLTref_350038600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1197478 1199946 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038600.1"; gene_id "LTnewLTref_350038600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1205805 1207343 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038700.1"; gene_id "LTnewLTref_350038700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1205805 1207343 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038700.1"; gene_id "LTnewLTref_350038700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1210675 1211961 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038800.1"; gene_id "LTnewLTref_350038800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1210675 1211961 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038800.1"; gene_id "LTnewLTref_350038800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1216779 1219541 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350038900.1"; gene_id "LTnewLTref_350038900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1216779 1219541 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350038900.1"; gene_id "LTnewLTref_350038900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1221174 1222982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039000.1"; gene_id "LTnewLTref_350039000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1221174 1222982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039000.1"; gene_id "LTnewLTref_350039000"; CM024321.1 Liftoff transcript 1225534 1230834 . - . transcript_id "LTnewLTref_350039100.1"; gene_id "LTnewLTref_350039100" CM024321.1 Liftoff CDS 1225534 1230834 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039100.1"; gene_id "LTnewLTref_350039100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1231655 1232176 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039200.1"; gene_id "LTnewLTref_350039200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1231655 1232176 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039200.1"; gene_id "LTnewLTref_350039200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1234049 1235179 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039300.1"; gene_id "LTnewLTref_350039300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1234049 1235179 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039300.1"; gene_id "LTnewLTref_350039300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1236168 1237712 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039400.1"; gene_id "LTnewLTref_350039400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1236168 1237712 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039400.1"; gene_id "LTnewLTref_350039400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1238355 1239161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039500.1"; gene_id "LTnewLTref_350039500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1238355 1239161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039500.1"; gene_id "LTnewLTref_350039500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1240024 1240575 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039600.1"; gene_id "LTnewLTref_350039600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1240024 1240575 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039600.1"; gene_id "LTnewLTref_350039600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1242972 1248599 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039700.1"; gene_id "LTnewLTref_350039700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1242972 1248599 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039700.1"; gene_id "LTnewLTref_350039700"; CM024321.1 Liftoff transcript 1253181 1253903 . - . transcript_id "LTnewLTref_350039800.1"; gene_id "LTnewLTref_350039800" CM024321.1 Liftoff CDS 1253181 1253903 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039800.1"; gene_id "LTnewLTref_350039800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1256533 1259226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350039900.1"; gene_id "LTnewLTref_350039900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1256533 1259226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350039900.1"; gene_id "LTnewLTref_350039900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1261133 1263247 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040000.1"; gene_id "LTnewLTref_350040000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1261133 1263247 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040000.1"; gene_id "LTnewLTref_350040000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1266445 1268439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040100.1"; gene_id "LTnewLTref_350040100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1266445 1268439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040100.1"; gene_id "LTnewLTref_350040100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1270401 1270913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040200.1"; gene_id "LTnewLTref_350040200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1270401 1270913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040200.1"; gene_id "LTnewLTref_350040200"; CM024321.1 . transcript 1273503 1274735 . - . transcript_id "LTnewLTref_350040300.1"; gene_id "LTnewLTref_350040300:pseudogene" CM024321.1 . exon 1273503 1274735 . - . transcript_id "LTnewLTref_350040300.1"; gene_id "LTnewLTref_350040300:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1277642 1280524 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040400.1"; gene_id "LTnewLTref_350040400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1277642 1280524 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040400.1"; gene_id "LTnewLTref_350040400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1281408 1282502 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040500.1"; gene_id "LTnewLTref_350040500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1281408 1282502 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040500.1"; gene_id "LTnewLTref_350040500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1283922 1284851 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040600.1"; gene_id "LTnewLTref_350040600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1283922 1284851 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040600.1"; gene_id "LTnewLTref_350040600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1285765 1286331 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040700.1"; gene_id "LTnewLTref_350040700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1285765 1286331 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040700.1"; gene_id "LTnewLTref_350040700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1287190 1287879 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040800.1"; gene_id "LTnewLTref_350040800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1287190 1287879 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040800.1"; gene_id "LTnewLTref_350040800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1288693 1289259 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350040900.1"; gene_id "LTnewLTref_350040900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1288693 1289259 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350040900.1"; gene_id "LTnewLTref_350040900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1289941 1291845 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041000.1"; gene_id "LTnewLTref_350041000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1289941 1291845 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041000.1"; gene_id "LTnewLTref_350041000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1293852 1294763 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041100.1"; gene_id "LTnewLTref_350041100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1293852 1294763 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041100.1"; gene_id "LTnewLTref_350041100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1295958 1296587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041200.1"; gene_id "LTnewLTref_350041200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1295958 1296587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041200.1"; gene_id "LTnewLTref_350041200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1302548 1303636 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041300.1"; gene_id "LTnewLTref_350041300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1302548 1303636 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041300.1"; gene_id "LTnewLTref_350041300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1308338 1309777 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041400.1"; gene_id "LTnewLTref_350041400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1308338 1309777 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041400.1"; gene_id "LTnewLTref_350041400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1310948 1312336 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041500.1"; gene_id "LTnewLTref_350041500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1310948 1312336 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041500.1"; gene_id "LTnewLTref_350041500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1313116 1320009 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041600.1"; gene_id "LTnewLTref_350041600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1313116 1320009 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041600.1"; gene_id "LTnewLTref_350041600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1322685 1325939 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041700.1"; gene_id "LTnewLTref_350041700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1322685 1325939 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041700.1"; gene_id "LTnewLTref_350041700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1326877 1328520 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041800.1"; gene_id "LTnewLTref_350041800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1326877 1328520 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041800.1"; gene_id "LTnewLTref_350041800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1329348 1330136 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350041900.1"; gene_id "LTnewLTref_350041900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1329348 1330136 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350041900.1"; gene_id "LTnewLTref_350041900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1331014 1332279 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350042000.1"; gene_id "LTnewLTref_350042000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1331014 1332279 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042000.1"; gene_id "LTnewLTref_350042000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1333410 1335440 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350042100.1"; gene_id "LTnewLTref_350042100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1333410 1335440 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042100.1"; gene_id "LTnewLTref_350042100"; CM024321.1 Liftoff transcript 1336101 1336679 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042200.1"; gene_id "LTnewLTref_350042200" CM024321.1 Liftoff CDS 1336101 1336679 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042200.1"; gene_id "LTnewLTref_350042200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1337433 1339193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350042300.1"; gene_id "LTnewLTref_350042300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1337433 1339193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042300.1"; gene_id "LTnewLTref_350042300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1340592 1340945 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350042400.1"; gene_id "LTnewLTref_350042400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1340592 1340945 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042400.1"; gene_id "LTnewLTref_350042400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1342369 1345026 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350042500.1"; gene_id "LTnewLTref_350042500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1342369 1345026 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042500.1"; gene_id "LTnewLTref_350042500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1345853 1346962 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_350042600.1"; gene_id "LTnewLTref_350042600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1345853 1346962 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042600.1"; gene_id "LTnewLTref_350042600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1347846 1349444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350042700.1"; gene_id "LTnewLTref_350042700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1347846 1349444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350042700.1"; gene_id "LTnewLTref_350042700"; CM024321.1 . transcript 1349990 1350198 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042800.1"; gene_id "LTnewLTref_350042800:pseudogene" CM024321.1 . exon 1349990 1350198 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042800.1"; gene_id "LTnewLTref_350042800:pseudogene"; CM024321.1 . transcript 1350239 1350818 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042900.1"; gene_id "LTnewLTref_350042900:pseudogene" CM024321.1 . exon 1350239 1350592 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042900.1"; gene_id "LTnewLTref_350042900:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1350595 1350774 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042900.1"; gene_id "LTnewLTref_350042900:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1350777 1350818 . - . transcript_id "LTnewLTref_350042900.1"; gene_id "LTnewLTref_350042900:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1351077 1351384 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_350043000.1"; gene_id "LTnewLTref_350043000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1351077 1351084 0.7 - 2 transcript_id "LTnewLTref_350043000.1"; gene_id "LTnewLTref_350043000"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1351135 1351384 0.4 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043000.1"; gene_id "LTnewLTref_350043000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1352958 1355147 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043100.1"; gene_id "LTnewLTref_350043100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1352958 1355147 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043100.1"; gene_id "LTnewLTref_350043100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1356200 1357480 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043200.1"; gene_id "LTnewLTref_350043200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1356200 1357480 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043200.1"; gene_id "LTnewLTref_350043200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1358332 1359228 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043300.1"; gene_id "LTnewLTref_350043300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1358332 1359228 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043300.1"; gene_id "LTnewLTref_350043300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1360867 1364835 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043400.1"; gene_id "LTnewLTref_350043400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1360867 1364835 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043400.1"; gene_id "LTnewLTref_350043400"; CM024321.1 . transcript 1367748 1368350 . - . transcript_id "LTnewLTref_350043500.1"; gene_id "LTnewLTref_350043500:pseudogene" CM024321.1 . exon 1367748 1367972 . - . transcript_id "LTnewLTref_350043500.1"; gene_id "LTnewLTref_350043500:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1367975 1368082 . - . transcript_id "LTnewLTref_350043500.1"; gene_id "LTnewLTref_350043500:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1368085 1368231 . - . transcript_id "LTnewLTref_350043500.1"; gene_id "LTnewLTref_350043500:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1368234 1368350 . - . transcript_id "LTnewLTref_350043500.1"; gene_id "LTnewLTref_350043500:pseudogene"; CM024321.1 . transcript 1368720 1369019 . + . transcript_id "LTnewLTref_350043600.1"; gene_id "LTnewLTref_350043600" CM024321.1 . CDS 1368720 1369019 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350043600.1"; gene_id "LTnewLTref_350043600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1373172 1374857 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043700.1"; gene_id "LTnewLTref_350043700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1373172 1374857 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043700.1"; gene_id "LTnewLTref_350043700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1379464 1380744 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043800.1"; gene_id "LTnewLTref_350043800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1379464 1380744 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043800.1"; gene_id "LTnewLTref_350043800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1381613 1382278 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350043900.1"; gene_id "LTnewLTref_350043900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1381613 1382278 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350043900.1"; gene_id "LTnewLTref_350043900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1383213 1385465 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044000.1"; gene_id "LTnewLTref_350044000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1383213 1385465 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044000.1"; gene_id "LTnewLTref_350044000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1387192 1388310 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044100.1"; gene_id "LTnewLTref_350044100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1387192 1388310 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044100.1"; gene_id "LTnewLTref_350044100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1392271 1395843 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044200.1"; gene_id "LTnewLTref_350044200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1392271 1395843 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044200.1"; gene_id "LTnewLTref_350044200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1397377 1397676 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044300.1"; gene_id "LTnewLTref_350044300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1397377 1397676 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044300.1"; gene_id "LTnewLTref_350044300"; CM024321.1 . transcript 1398049 1398655 . + . transcript_id "LTnewLTref_350044400.1"; gene_id "LTnewLTref_350044400:pseudogene" CM024321.1 . exon 1398049 1398237 . + . transcript_id "LTnewLTref_350044400.1"; gene_id "LTnewLTref_350044400:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1398239 1398655 . + . transcript_id "LTnewLTref_350044400.1"; gene_id "LTnewLTref_350044400:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1399411 1401543 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044500.1"; gene_id "LTnewLTref_350044500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1399411 1401543 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044500.1"; gene_id "LTnewLTref_350044500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1403380 1406169 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044600.1"; gene_id "LTnewLTref_350044600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1403380 1406169 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044600.1"; gene_id "LTnewLTref_350044600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1406937 1408100 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044700.1"; gene_id "LTnewLTref_350044700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1406937 1408100 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044700.1"; gene_id "LTnewLTref_350044700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1408782 1409525 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044800.1"; gene_id "LTnewLTref_350044800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1408782 1409525 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044800.1"; gene_id "LTnewLTref_350044800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1412144 1412653 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350044900.1"; gene_id "LTnewLTref_350044900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1412144 1412653 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350044900.1"; gene_id "LTnewLTref_350044900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1413330 1415192 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045000.1"; gene_id "LTnewLTref_350045000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1413330 1415192 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045000.1"; gene_id "LTnewLTref_350045000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1416791 1417396 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045100.1"; gene_id "LTnewLTref_350045100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1416791 1417396 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045100.1"; gene_id "LTnewLTref_350045100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1418333 1420915 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045200.1"; gene_id "LTnewLTref_350045200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1418333 1420915 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045200.1"; gene_id "LTnewLTref_350045200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1421677 1426020 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045300.1"; gene_id "LTnewLTref_350045300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1421677 1426020 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045300.1"; gene_id "LTnewLTref_350045300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1427899 1428576 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045400.1"; gene_id "LTnewLTref_350045400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1427899 1428576 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045400.1"; gene_id "LTnewLTref_350045400"; CM024321.1 . transcript 1432079 1432314 . - . transcript_id "LTnewLTref_350045500.1"; gene_id "LTnewLTref_350045500:pseudogene" CM024321.1 . exon 1432079 1432314 . - . transcript_id "LTnewLTref_350045500.1"; gene_id "LTnewLTref_350045500:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1433260 1433558 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_350045600.1"; gene_id "LTnewLTref_350045600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1433260 1433281 0.65 - 1 transcript_id "LTnewLTref_350045600.1"; gene_id "LTnewLTref_350045600"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1433329 1433558 0.51 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045600.1"; gene_id "LTnewLTref_350045600"; CM024321.1 . transcript 1433928 1434560 . + . transcript_id "LTnewLTref_350045700.1"; gene_id "LTnewLTref_350045700:pseudogene" CM024321.1 . exon 1433928 1434086 . + . transcript_id "LTnewLTref_350045700.1"; gene_id "LTnewLTref_350045700:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1434089 1434211 . + . transcript_id "LTnewLTref_350045700.1"; gene_id "LTnewLTref_350045700:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1434213 1434383 . + . transcript_id "LTnewLTref_350045700.1"; gene_id "LTnewLTref_350045700:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1434385 1434426 . + . transcript_id "LTnewLTref_350045700.1"; gene_id "LTnewLTref_350045700:pseudogene"; CM024321.1 . exon 1434429 1434560 . + . transcript_id "LTnewLTref_350045700.1"; gene_id "LTnewLTref_350045700:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1434855 1435616 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045800.1"; gene_id "LTnewLTref_350045800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1434855 1435616 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045800.1"; gene_id "LTnewLTref_350045800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1439330 1440091 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350045900.1"; gene_id "LTnewLTref_350045900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1439330 1440091 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350045900.1"; gene_id "LTnewLTref_350045900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1442744 1443421 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046000.1"; gene_id "LTnewLTref_350046000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1442744 1443421 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046000.1"; gene_id "LTnewLTref_350046000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1444181 1445206 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046100.1"; gene_id "LTnewLTref_350046100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1444181 1445206 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046100.1"; gene_id "LTnewLTref_350046100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1447111 1448433 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046200.1"; gene_id "LTnewLTref_350046200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1447111 1448433 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046200.1"; gene_id "LTnewLTref_350046200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1449725 1452256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046300.1"; gene_id "LTnewLTref_350046300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1449725 1452256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046300.1"; gene_id "LTnewLTref_350046300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1453330 1454496 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046400.1"; gene_id "LTnewLTref_350046400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1453330 1454496 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046400.1"; gene_id "LTnewLTref_350046400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1454913 1457615 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046500.1"; gene_id "LTnewLTref_350046500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1454913 1457615 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046500.1"; gene_id "LTnewLTref_350046500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1458556 1458993 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046600.1"; gene_id "LTnewLTref_350046600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1458556 1458993 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046600.1"; gene_id "LTnewLTref_350046600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1459965 1461920 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046700.1"; gene_id "LTnewLTref_350046700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1459965 1461920 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046700.1"; gene_id "LTnewLTref_350046700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1463505 1463942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046800.1"; gene_id "LTnewLTref_350046800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1463505 1463942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046800.1"; gene_id "LTnewLTref_350046800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1464539 1464958 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350046900.1"; gene_id "LTnewLTref_350046900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1464539 1464958 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350046900.1"; gene_id "LTnewLTref_350046900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1465904 1466323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047000.1"; gene_id "LTnewLTref_350047000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1465904 1466323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047000.1"; gene_id "LTnewLTref_350047000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1466992 1467435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047100.1"; gene_id "LTnewLTref_350047100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1466992 1467435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047100.1"; gene_id "LTnewLTref_350047100"; CM024321.1 Liftoff transcript 1468179 1469219 . - . transcript_id "LTnewLTref_350047200.1"; gene_id "LTnewLTref_350047200" CM024321.1 Liftoff CDS 1468179 1469219 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047200.1"; gene_id "LTnewLTref_350047200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1470415 1471365 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047300.1"; gene_id "LTnewLTref_350047300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1470415 1471365 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047300.1"; gene_id "LTnewLTref_350047300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1472640 1473404 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047400.1"; gene_id "LTnewLTref_350047400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1472640 1473404 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047400.1"; gene_id "LTnewLTref_350047400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1474544 1475482 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047500.1"; gene_id "LTnewLTref_350047500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1474544 1475482 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047500.1"; gene_id "LTnewLTref_350047500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1477512 1479224 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047600.1"; gene_id "LTnewLTref_350047600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1477512 1479224 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047600.1"; gene_id "LTnewLTref_350047600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1480347 1481360 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047700.1"; gene_id "LTnewLTref_350047700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1480347 1481360 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047700.1"; gene_id "LTnewLTref_350047700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1482176 1483510 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047800.1"; gene_id "LTnewLTref_350047800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1482176 1483510 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047800.1"; gene_id "LTnewLTref_350047800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1484010 1484447 1 - . transcript_id "LTnewLTref_350047900.1"; gene_id "LTnewLTref_350047900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1484010 1484447 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350047900.1"; gene_id "LTnewLTref_350047900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1484963 1486039 0.62 - . transcript_id "LTnewLTref_350048000.1"; gene_id "LTnewLTref_350048000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1484963 1486039 0.62 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350048000.1"; gene_id "LTnewLTref_350048000"; CM024321.1 . transcript 1486591 1487171 . - . transcript_id "LTnewLTref_350048100.1"; gene_id "LTnewLTref_350048100:pseudogene" CM024321.1 . exon 1486591 1487171 . - . transcript_id "LTnewLTref_350048100.1"; gene_id "LTnewLTref_350048100:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1488762 1491176 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_350048200.1"; gene_id "LTnewLTref_350048200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1488762 1491176 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048200.1"; gene_id "LTnewLTref_350048200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1492112 1493542 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350048300.1"; gene_id "LTnewLTref_350048300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1492112 1493542 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048300.1"; gene_id "LTnewLTref_350048300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1494567 1495337 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350048400.1"; gene_id "LTnewLTref_350048400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1494567 1495337 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048400.1"; gene_id "LTnewLTref_350048400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1496391 1498205 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350048500.1"; gene_id "LTnewLTref_350048500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1496391 1498205 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048500.1"; gene_id "LTnewLTref_350048500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1499747 1507030 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350048600.1"; gene_id "LTnewLTref_350048600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1499747 1507030 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048600.1"; gene_id "LTnewLTref_350048600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1508562 1509711 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350048700.1"; gene_id "LTnewLTref_350048700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1508562 1509430 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048700.1"; gene_id "LTnewLTref_350048700"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1509507 1509711 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350048700.1"; gene_id "LTnewLTref_350048700"; CM024321.1 Liftoff transcript 1513714 1515870 . + . transcript_id "LTnewLTref_350048800.1"; gene_id "LTnewLTref_350048800" CM024321.1 Liftoff CDS 1513714 1515870 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048800.1"; gene_id "LTnewLTref_350048800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1523282 1525657 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350048900.1"; gene_id "LTnewLTref_350048900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1523282 1525657 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350048900.1"; gene_id "LTnewLTref_350048900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1533682 1534764 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049000.1"; gene_id "LTnewLTref_350049000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1533682 1534764 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049000.1"; gene_id "LTnewLTref_350049000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1536996 1538329 0.69 + . transcript_id "LTnewLTref_350049100.1"; gene_id "LTnewLTref_350049100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1536996 1538263 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049100.1"; gene_id "LTnewLTref_350049100"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1538326 1538329 0.69 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350049100.1"; gene_id "LTnewLTref_350049100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1536996 1541273 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049100.2"; gene_id "LTnewLTref_350049100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1536996 1541273 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049100.2"; gene_id "LTnewLTref_350049100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1542955 1544070 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049200.1"; gene_id "LTnewLTref_350049200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1542955 1544070 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049200.1"; gene_id "LTnewLTref_350049200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1545216 1545514 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_350049300.1"; gene_id "LTnewLTref_350049300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1545216 1545442 0.79 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049300.1"; gene_id "LTnewLTref_350049300"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1545490 1545514 0.77 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350049300.1"; gene_id "LTnewLTref_350049300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1550035 1551219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049400.1"; gene_id "LTnewLTref_350049400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1550035 1551219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049400.1"; gene_id "LTnewLTref_350049400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1553505 1555598 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049500.1"; gene_id "LTnewLTref_350049500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1553505 1555598 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049500.1"; gene_id "LTnewLTref_350049500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1556803 1557963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049600.1"; gene_id "LTnewLTref_350049600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1556803 1557963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049600.1"; gene_id "LTnewLTref_350049600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1559069 1559416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049700.1"; gene_id "LTnewLTref_350049700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1559069 1559416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049700.1"; gene_id "LTnewLTref_350049700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1560919 1564755 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049800.1"; gene_id "LTnewLTref_350049800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1560919 1564755 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049800.1"; gene_id "LTnewLTref_350049800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1565734 1566573 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350049900.1"; gene_id "LTnewLTref_350049900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1565734 1566573 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350049900.1"; gene_id "LTnewLTref_350049900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1567817 1568833 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050000.1"; gene_id "LTnewLTref_350050000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1567817 1568833 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050000.1"; gene_id "LTnewLTref_350050000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1570062 1573382 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050100.1"; gene_id "LTnewLTref_350050100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1570062 1573382 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050100.1"; gene_id "LTnewLTref_350050100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1574405 1574659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050200.1"; gene_id "LTnewLTref_350050200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1574405 1574659 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050200.1"; gene_id "LTnewLTref_350050200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1575984 1577429 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_350050300.1"; gene_id "LTnewLTref_350050300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1575984 1577429 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050300.1"; gene_id "LTnewLTref_350050300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1576161 1577429 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050300.2"; gene_id "LTnewLTref_350050300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1576161 1577429 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050300.2"; gene_id "LTnewLTref_350050300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1578265 1578885 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050400.1"; gene_id "LTnewLTref_350050400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1578265 1578885 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050400.1"; gene_id "LTnewLTref_350050400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1579744 1582938 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050500.1"; gene_id "LTnewLTref_350050500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1579744 1582938 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050500.1"; gene_id "LTnewLTref_350050500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1584137 1585894 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050600.1"; gene_id "LTnewLTref_350050600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1584137 1585894 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050600.1"; gene_id "LTnewLTref_350050600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1588389 1590146 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050700.1"; gene_id "LTnewLTref_350050700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1588389 1590146 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050700.1"; gene_id "LTnewLTref_350050700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1596861 1597781 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050800.1"; gene_id "LTnewLTref_350050800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1596861 1597781 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050800.1"; gene_id "LTnewLTref_350050800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1599859 1601799 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350050900.1"; gene_id "LTnewLTref_350050900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1599859 1601799 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350050900.1"; gene_id "LTnewLTref_350050900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1603539 1605017 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051000.1"; gene_id "LTnewLTref_350051000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1603539 1605017 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051000.1"; gene_id "LTnewLTref_350051000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1605845 1606939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051100.1"; gene_id "LTnewLTref_350051100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1605845 1606939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051100.1"; gene_id "LTnewLTref_350051100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1607797 1609578 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051200.1"; gene_id "LTnewLTref_350051200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1607797 1609578 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051200.1"; gene_id "LTnewLTref_350051200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1610386 1611078 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051300.1"; gene_id "LTnewLTref_350051300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1610386 1611078 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051300.1"; gene_id "LTnewLTref_350051300"; CM024321.1 . transcript 1633574 1636263 . + . transcript_id "LTnewLTref_350051400.1"; gene_id "LTnewLTref_350051400:pseudogene" CM024321.1 . exon 1633574 1636263 . + . transcript_id "LTnewLTref_350051400.1"; gene_id "LTnewLTref_350051400:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1640282 1642510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051500.1"; gene_id "LTnewLTref_350051500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1640282 1642510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051500.1"; gene_id "LTnewLTref_350051500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1645547 1647349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051600.1"; gene_id "LTnewLTref_350051600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1645547 1647349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051600.1"; gene_id "LTnewLTref_350051600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1651875 1654895 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051700.1"; gene_id "LTnewLTref_350051700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1651875 1654895 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051700.1"; gene_id "LTnewLTref_350051700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1657034 1657930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051800.1"; gene_id "LTnewLTref_350051800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1657034 1657930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051800.1"; gene_id "LTnewLTref_350051800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1667201 1668178 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350051900.1"; gene_id "LTnewLTref_350051900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1667201 1668178 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350051900.1"; gene_id "LTnewLTref_350051900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1669323 1670456 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052000.1"; gene_id "LTnewLTref_350052000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1669323 1670456 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052000.1"; gene_id "LTnewLTref_350052000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1671985 1672494 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052100.1"; gene_id "LTnewLTref_350052100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1671985 1672494 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052100.1"; gene_id "LTnewLTref_350052100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1674384 1676828 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052200.1"; gene_id "LTnewLTref_350052200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1674384 1676828 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052200.1"; gene_id "LTnewLTref_350052200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1680835 1681812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052300.1"; gene_id "LTnewLTref_350052300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1680835 1681812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052300.1"; gene_id "LTnewLTref_350052300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1689590 1690339 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052400.1"; gene_id "LTnewLTref_350052400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1689590 1690339 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052400.1"; gene_id "LTnewLTref_350052400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1691252 1691677 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052500.1"; gene_id "LTnewLTref_350052500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1691252 1691677 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052500.1"; gene_id "LTnewLTref_350052500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1692458 1694107 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052600.1"; gene_id "LTnewLTref_350052600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1692458 1694107 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052600.1"; gene_id "LTnewLTref_350052600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1694655 1696562 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052700.1"; gene_id "LTnewLTref_350052700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1694655 1696562 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052700.1"; gene_id "LTnewLTref_350052700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1697989 1699017 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052800.1"; gene_id "LTnewLTref_350052800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1697989 1699017 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052800.1"; gene_id "LTnewLTref_350052800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1700152 1704027 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350052900.1"; gene_id "LTnewLTref_350052900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1700152 1704027 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350052900.1"; gene_id "LTnewLTref_350052900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1705380 1712288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053000.1"; gene_id "LTnewLTref_350053000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1705380 1712288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053000.1"; gene_id "LTnewLTref_350053000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1713310 1713654 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053100.1"; gene_id "LTnewLTref_350053100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1713310 1713654 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053100.1"; gene_id "LTnewLTref_350053100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1714431 1715549 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053200.1"; gene_id "LTnewLTref_350053200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1714431 1714754 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053200.1"; gene_id "LTnewLTref_350053200"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1714824 1715549 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053200.1"; gene_id "LTnewLTref_350053200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1715605 1716078 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053300.1"; gene_id "LTnewLTref_350053300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1715605 1716078 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053300.1"; gene_id "LTnewLTref_350053300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1717519 1718754 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053400.1"; gene_id "LTnewLTref_350053400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1717519 1718754 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053400.1"; gene_id "LTnewLTref_350053400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1719766 1720386 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053500.1"; gene_id "LTnewLTref_350053500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1719766 1720386 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053500.1"; gene_id "LTnewLTref_350053500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1722897 1724450 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053600.1"; gene_id "LTnewLTref_350053600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1722897 1724450 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053600.1"; gene_id "LTnewLTref_350053600"; CM024321.1 . transcript 1725008 1725963 . + . transcript_id "LTnewLTref_350053700.1"; gene_id "LTnewLTref_350053700:pseudogene" CM024321.1 . exon 1725008 1725963 . + . transcript_id "LTnewLTref_350053700.1"; gene_id "LTnewLTref_350053700:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1728367 1729320 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053800.1"; gene_id "LTnewLTref_350053800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1728367 1729320 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053800.1"; gene_id "LTnewLTref_350053800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1732371 1733087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350053900.1"; gene_id "LTnewLTref_350053900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1732371 1733087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350053900.1"; gene_id "LTnewLTref_350053900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1738162 1738965 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054000.1"; gene_id "LTnewLTref_350054000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1738162 1738965 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054000.1"; gene_id "LTnewLTref_350054000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1744379 1744609 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054100.1"; gene_id "LTnewLTref_350054100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1744379 1744609 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054100.1"; gene_id "LTnewLTref_350054100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1745626 1746225 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054200.1"; gene_id "LTnewLTref_350054200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1745626 1746225 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054200.1"; gene_id "LTnewLTref_350054200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1747614 1748186 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054300.1"; gene_id "LTnewLTref_350054300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1747614 1748186 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054300.1"; gene_id "LTnewLTref_350054300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1749760 1754211 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054400.1"; gene_id "LTnewLTref_350054400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1749760 1754211 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054400.1"; gene_id "LTnewLTref_350054400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1755564 1755812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054500.1"; gene_id "LTnewLTref_350054500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1755564 1755812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054500.1"; gene_id "LTnewLTref_350054500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1756524 1757219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054600.1"; gene_id "LTnewLTref_350054600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1756524 1757219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054600.1"; gene_id "LTnewLTref_350054600"; CM024321.1 . transcript 1758165 1758957 . + . transcript_id "LTnewLTref_350054700.1"; gene_id "LTnewLTref_350054700:pseudogene" CM024321.1 . exon 1758165 1758957 . + . transcript_id "LTnewLTref_350054700.1"; gene_id "LTnewLTref_350054700:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1759898 1762054 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350054800.1"; gene_id "LTnewLTref_350054800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1759898 1762054 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054800.1"; gene_id "LTnewLTref_350054800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1763857 1766634 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_350054900.1"; gene_id "LTnewLTref_350054900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1763857 1766634 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350054900.1"; gene_id "LTnewLTref_350054900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1768189 1772628 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055000.1"; gene_id "LTnewLTref_350055000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1768189 1772628 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055000.1"; gene_id "LTnewLTref_350055000"; CM024321.1 . transcript 1773860 1775180 . + . transcript_id "LTnewLTref_350055100.1"; gene_id "LTnewLTref_350055100:pseudogene" CM024321.1 . exon 1773860 1775180 . + . transcript_id "LTnewLTref_350055100.1"; gene_id "LTnewLTref_350055100:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1775828 1776244 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055200.1"; gene_id "LTnewLTref_350055200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1775828 1776244 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055200.1"; gene_id "LTnewLTref_350055200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1776802 1778487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055300.1"; gene_id "LTnewLTref_350055300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1776802 1778487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055300.1"; gene_id "LTnewLTref_350055300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1779217 1780275 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055400.1"; gene_id "LTnewLTref_350055400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1779217 1780275 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055400.1"; gene_id "LTnewLTref_350055400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1781190 1782728 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055500.1"; gene_id "LTnewLTref_350055500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1781190 1782728 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055500.1"; gene_id "LTnewLTref_350055500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1783738 1784601 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055600.1"; gene_id "LTnewLTref_350055600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1783738 1784601 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055600.1"; gene_id "LTnewLTref_350055600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1785256 1786122 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055700.1"; gene_id "LTnewLTref_350055700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1785256 1786122 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055700.1"; gene_id "LTnewLTref_350055700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1788370 1789845 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055800.1"; gene_id "LTnewLTref_350055800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1788370 1789845 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055800.1"; gene_id "LTnewLTref_350055800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1791302 1791646 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350055900.1"; gene_id "LTnewLTref_350055900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1791302 1791646 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350055900.1"; gene_id "LTnewLTref_350055900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1793258 1794355 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056000.1"; gene_id "LTnewLTref_350056000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1793258 1794355 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056000.1"; gene_id "LTnewLTref_350056000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1795941 1797344 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056100.1"; gene_id "LTnewLTref_350056100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1795941 1797344 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056100.1"; gene_id "LTnewLTref_350056100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1798233 1800002 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056200.1"; gene_id "LTnewLTref_350056200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1798233 1800002 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056200.1"; gene_id "LTnewLTref_350056200"; CM024321.1 Liftoff transcript 1801740 1802066 . + . transcript_id "LTnewLTref_350056300.1"; gene_id "LTnewLTref_350056300" CM024321.1 Liftoff CDS 1801740 1802066 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056300.1"; gene_id "LTnewLTref_350056300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1803201 1804145 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056400.1"; gene_id "LTnewLTref_350056400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1803201 1804145 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056400.1"; gene_id "LTnewLTref_350056400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1805090 1806532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056500.1"; gene_id "LTnewLTref_350056500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1805090 1806532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056500.1"; gene_id "LTnewLTref_350056500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1807459 1809633 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056600.1"; gene_id "LTnewLTref_350056600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1807459 1809633 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056600.1"; gene_id "LTnewLTref_350056600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1810618 1811034 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056700.1"; gene_id "LTnewLTref_350056700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1810618 1811034 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056700.1"; gene_id "LTnewLTref_350056700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1812787 1813408 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_350056800.1"; gene_id "LTnewLTref_350056800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1812787 1812824 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056800.1"; gene_id "LTnewLTref_350056800"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1812877 1813408 0.79 + 1 transcript_id "LTnewLTref_350056800.1"; gene_id "LTnewLTref_350056800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1814240 1815289 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350056900.1"; gene_id "LTnewLTref_350056900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1814240 1815289 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350056900.1"; gene_id "LTnewLTref_350056900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1816569 1817015 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057000.1"; gene_id "LTnewLTref_350057000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1816569 1817015 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057000.1"; gene_id "LTnewLTref_350057000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1818801 1819865 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057100.1"; gene_id "LTnewLTref_350057100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1818801 1819865 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057100.1"; gene_id "LTnewLTref_350057100"; CM024321.1 Liftoff transcript 1821103 1821957 . + . transcript_id "LTnewLTref_350057200.1"; gene_id "LTnewLTref_350057200" CM024321.1 Liftoff CDS 1821103 1821957 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057200.1"; gene_id "LTnewLTref_350057200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1822572 1823234 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057300.1"; gene_id "LTnewLTref_350057300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1822572 1823234 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057300.1"; gene_id "LTnewLTref_350057300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1825023 1829465 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057400.1"; gene_id "LTnewLTref_350057400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1825023 1829465 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057400.1"; gene_id "LTnewLTref_350057400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1830659 1831807 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057500.1"; gene_id "LTnewLTref_350057500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1830659 1831807 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057500.1"; gene_id "LTnewLTref_350057500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1834300 1835307 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057600.1"; gene_id "LTnewLTref_350057600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1834300 1835307 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057600.1"; gene_id "LTnewLTref_350057600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1836777 1838174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057700.1"; gene_id "LTnewLTref_350057700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1836777 1838174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057700.1"; gene_id "LTnewLTref_350057700"; CM024321.1 . transcript 1839381 1839815 . + . transcript_id "LTnewLTref_350057800.1"; gene_id "LTnewLTref_350057800:pseudogene" CM024321.1 . exon 1839381 1839815 . + . transcript_id "LTnewLTref_350057800.1"; gene_id "LTnewLTref_350057800:pseudogene"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1843388 1844140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350057900.1"; gene_id "LTnewLTref_350057900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1843388 1844140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350057900.1"; gene_id "LTnewLTref_350057900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1845759 1846808 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058000.1"; gene_id "LTnewLTref_350058000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1845759 1846808 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058000.1"; gene_id "LTnewLTref_350058000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1848224 1851226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058100.1"; gene_id "LTnewLTref_350058100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1848224 1851226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058100.1"; gene_id "LTnewLTref_350058100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1852369 1853517 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058200.1"; gene_id "LTnewLTref_350058200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1852369 1853517 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058200.1"; gene_id "LTnewLTref_350058200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1854921 1856009 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058300.1"; gene_id "LTnewLTref_350058300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1854921 1856009 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058300.1"; gene_id "LTnewLTref_350058300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1857019 1857480 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058400.1"; gene_id "LTnewLTref_350058400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1857019 1857480 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058400.1"; gene_id "LTnewLTref_350058400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1858585 1861311 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058500.1"; gene_id "LTnewLTref_350058500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1858585 1861311 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058500.1"; gene_id "LTnewLTref_350058500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1862245 1862703 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058600.1"; gene_id "LTnewLTref_350058600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1862245 1862703 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058600.1"; gene_id "LTnewLTref_350058600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1865271 1867448 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058700.1"; gene_id "LTnewLTref_350058700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1865271 1867448 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058700.1"; gene_id "LTnewLTref_350058700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1868823 1869440 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058800.1"; gene_id "LTnewLTref_350058800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1868823 1869440 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058800.1"; gene_id "LTnewLTref_350058800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1875143 1878241 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350058900.1"; gene_id "LTnewLTref_350058900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1875143 1878241 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350058900.1"; gene_id "LTnewLTref_350058900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1881927 1882865 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059000.1"; gene_id "LTnewLTref_350059000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1881927 1882865 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059000.1"; gene_id "LTnewLTref_350059000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1883889 1884917 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059100.1"; gene_id "LTnewLTref_350059100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1883889 1884917 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059100.1"; gene_id "LTnewLTref_350059100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1885826 1886143 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059200.1"; gene_id "LTnewLTref_350059200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1885826 1886143 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059200.1"; gene_id "LTnewLTref_350059200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1888348 1889505 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059300.1"; gene_id "LTnewLTref_350059300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1888348 1889505 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059300.1"; gene_id "LTnewLTref_350059300"; CM024321.1 Liftoff transcript 1891654 1891926 . + . transcript_id "LTnewLTref_350059400.1"; gene_id "LTnewLTref_350059400" CM024321.1 Liftoff CDS 1891654 1891926 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059400.1"; gene_id "LTnewLTref_350059400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1893200 1894042 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059500.1"; gene_id "LTnewLTref_350059500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1893200 1894042 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059500.1"; gene_id "LTnewLTref_350059500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1906670 1907848 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059600.1"; gene_id "LTnewLTref_350059600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1906670 1907848 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059600.1"; gene_id "LTnewLTref_350059600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1911066 1914113 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_350059700.1"; gene_id "LTnewLTref_350059700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1911066 1914113 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059700.1"; gene_id "LTnewLTref_350059700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1912989 1914113 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059700.2"; gene_id "LTnewLTref_350059700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1912989 1914113 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059700.2"; gene_id "LTnewLTref_350059700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1914816 1916546 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059800.1"; gene_id "LTnewLTref_350059800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1914816 1916546 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059800.1"; gene_id "LTnewLTref_350059800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1917955 1919637 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350059900.1"; gene_id "LTnewLTref_350059900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1917955 1919637 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350059900.1"; gene_id "LTnewLTref_350059900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1922586 1924574 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060000.1"; gene_id "LTnewLTref_350060000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1922586 1924574 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060000.1"; gene_id "LTnewLTref_350060000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1926691 1928229 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060100.1"; gene_id "LTnewLTref_350060100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1926691 1928229 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060100.1"; gene_id "LTnewLTref_350060100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1930166 1930672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060200.1"; gene_id "LTnewLTref_350060200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1930166 1930672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060200.1"; gene_id "LTnewLTref_350060200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1934265 1934780 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060300.1"; gene_id "LTnewLTref_350060300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1934265 1934780 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060300.1"; gene_id "LTnewLTref_350060300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1936830 1938584 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060400.1"; gene_id "LTnewLTref_350060400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1936830 1938584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060400.1"; gene_id "LTnewLTref_350060400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1939309 1939560 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060500.1"; gene_id "LTnewLTref_350060500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1939309 1939560 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060500.1"; gene_id "LTnewLTref_350060500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1940486 1942711 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060600.1"; gene_id "LTnewLTref_350060600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1940486 1942711 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060600.1"; gene_id "LTnewLTref_350060600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1943298 1945460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060700.1"; gene_id "LTnewLTref_350060700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1943298 1945460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060700.1"; gene_id "LTnewLTref_350060700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1946384 1947496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060800.1"; gene_id "LTnewLTref_350060800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1946384 1947496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060800.1"; gene_id "LTnewLTref_350060800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1948554 1949414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350060900.1"; gene_id "LTnewLTref_350060900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1948554 1949414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350060900.1"; gene_id "LTnewLTref_350060900"; CM024321.1 Liftoff transcript 1949759 1951660 . + . transcript_id "LTnewLTref_350061000.1"; gene_id "LTnewLTref_350061000" CM024321.1 Liftoff CDS 1949759 1951660 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061000.1"; gene_id "LTnewLTref_350061000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1954552 1955472 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061100.1"; gene_id "LTnewLTref_350061100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1954552 1955472 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061100.1"; gene_id "LTnewLTref_350061100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1957184 1958434 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061200.1"; gene_id "LTnewLTref_350061200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1957184 1958434 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061200.1"; gene_id "LTnewLTref_350061200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1959311 1961224 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061300.1"; gene_id "LTnewLTref_350061300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1959311 1961224 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061300.1"; gene_id "LTnewLTref_350061300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1962125 1962659 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061400.1"; gene_id "LTnewLTref_350061400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1962125 1962254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061400.1"; gene_id "LTnewLTref_350061400"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1962454 1962659 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_350061400.1"; gene_id "LTnewLTref_350061400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1963708 1965141 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061500.1"; gene_id "LTnewLTref_350061500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1963708 1965141 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061500.1"; gene_id "LTnewLTref_350061500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1969104 1969877 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061600.1"; gene_id "LTnewLTref_350061600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1969104 1969877 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061600.1"; gene_id "LTnewLTref_350061600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1974790 1975150 0.62 + . transcript_id "LTnewLTref_350061700.1"; gene_id "LTnewLTref_350061700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1974790 1974948 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061700.1"; gene_id "LTnewLTref_350061700"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1975076 1975150 0.62 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061700.1"; gene_id "LTnewLTref_350061700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1975619 1977013 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061800.1"; gene_id "LTnewLTref_350061800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1975619 1977013 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061800.1"; gene_id "LTnewLTref_350061800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1977638 1978594 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350061900.1"; gene_id "LTnewLTref_350061900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1977638 1978594 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350061900.1"; gene_id "LTnewLTref_350061900"; CM024321.1 Liftoff transcript 1978708 1978896 . + . transcript_id "LTnewLTref_350062000.1"; gene_id "LTnewLTref_350062000" CM024321.1 Liftoff CDS 1978708 1978896 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062000.1"; gene_id "LTnewLTref_350062000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1979246 1979971 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062100.1"; gene_id "LTnewLTref_350062100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1979246 1979971 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062100.1"; gene_id "LTnewLTref_350062100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1982229 1983035 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062200.1"; gene_id "LTnewLTref_350062200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1982229 1983035 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062200.1"; gene_id "LTnewLTref_350062200"; CM024321.1 Liftoff transcript 1984729 1984989 . + . transcript_id "LTnewLTref_350062300.1"; gene_id "LTnewLTref_350062300" CM024321.1 Liftoff CDS 1984729 1984989 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062300.1"; gene_id "LTnewLTref_350062300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1985604 1987004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062400.1"; gene_id "LTnewLTref_350062400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1985604 1987004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062400.1"; gene_id "LTnewLTref_350062400"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1987598 1987855 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062500.1"; gene_id "LTnewLTref_350062500" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1987598 1987855 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062500.1"; gene_id "LTnewLTref_350062500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1988865 1989935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062600.1"; gene_id "LTnewLTref_350062600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1988865 1989935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062600.1"; gene_id "LTnewLTref_350062600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1990909 1991676 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062700.1"; gene_id "LTnewLTref_350062700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1990909 1991676 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062700.1"; gene_id "LTnewLTref_350062700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1992469 1993044 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350062800.1"; gene_id "LTnewLTref_350062800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1992469 1993044 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062800.1"; gene_id "LTnewLTref_350062800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1993810 1995045 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_350062900.1"; gene_id "LTnewLTref_350062900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1993810 1995045 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350062900.1"; gene_id "LTnewLTref_350062900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1995790 1996914 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063000.1"; gene_id "LTnewLTref_350063000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1995790 1996914 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063000.1"; gene_id "LTnewLTref_350063000"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1997538 1999331 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063100.1"; gene_id "LTnewLTref_350063100" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1997538 1999331 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063100.1"; gene_id "LTnewLTref_350063100"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 1999914 2000987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063200.1"; gene_id "LTnewLTref_350063200" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 1999914 2000987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063200.1"; gene_id "LTnewLTref_350063200"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2001901 2002941 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063300.1"; gene_id "LTnewLTref_350063300" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2001901 2002941 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063300.1"; gene_id "LTnewLTref_350063300"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2003663 2004895 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063400.1"; gene_id "LTnewLTref_350063400" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2003663 2004895 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063400.1"; gene_id "LTnewLTref_350063400"; CM024321.1 Liftoff transcript 2005764 2006166 . + . transcript_id "LTnewLTref_350063500.1"; gene_id "LTnewLTref_350063500" CM024321.1 Liftoff CDS 2005764 2006166 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063500.1"; gene_id "LTnewLTref_350063500"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2007661 2008878 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063600.1"; gene_id "LTnewLTref_350063600" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2007661 2008878 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063600.1"; gene_id "LTnewLTref_350063600"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2009614 2010777 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063700.1"; gene_id "LTnewLTref_350063700" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2009614 2010777 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063700.1"; gene_id "LTnewLTref_350063700"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2012606 2013385 1 + . transcript_id "LTnewLTref_350063800.1"; gene_id "LTnewLTref_350063800" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2012606 2013385 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063800.1"; gene_id "LTnewLTref_350063800"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2016073 2035950 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_350063900.1"; gene_id "LTnewLTref_350063900" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2016073 2027055 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063900.1"; gene_id "LTnewLTref_350063900"; CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2027209 2035950 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_350063900.1"; gene_id "LTnewLTref_350063900"; CM024321.1 AUGUSTUS transcript 2039485 2039736 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_350064000.1"; gene_id "LTnewLTref_350064000" CM024321.1 AUGUSTUS CDS 2039485 2039736 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_350064000.1"; gene_id "LTnewLTref_350064000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 10879 11732 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_360005000.1"; gene_id "LTnewLTref_360005000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 10879 11089 0.4 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360005000.1"; gene_id "LTnewLTref_360005000"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 11188 11732 0.55 + 2 transcript_id "LTnewLTref_360005000.1"; gene_id "LTnewLTref_360005000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 19483 21927 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005100.1"; gene_id "LTnewLTref_360005100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 19483 21927 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005100.1"; gene_id "LTnewLTref_360005100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 23733 24035 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005200.1"; gene_id "LTnewLTref_360005200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 23733 24035 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005200.1"; gene_id "LTnewLTref_360005200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 25978 26436 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005300.1"; gene_id "LTnewLTref_360005300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 25978 26436 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005300.1"; gene_id "LTnewLTref_360005300"; CM024322.1 Liftoff transcript 27010 27258 . - . transcript_id "LTnewLTref_360005400.1"; gene_id "LTnewLTref_360005400" CM024322.1 Liftoff CDS 27010 27258 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005400.1"; gene_id "LTnewLTref_360005400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 28569 29867 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005500.1"; gene_id "LTnewLTref_360005500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 28569 29867 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005500.1"; gene_id "LTnewLTref_360005500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 32004 33665 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005600.1"; gene_id "LTnewLTref_360005600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 32004 33665 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005600.1"; gene_id "LTnewLTref_360005600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 35399 37090 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005700.1"; gene_id "LTnewLTref_360005700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 35399 37090 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005700.1"; gene_id "LTnewLTref_360005700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 37942 38912 0.67 - . transcript_id "LTnewLTref_360005800.1"; gene_id "LTnewLTref_360005800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 37942 38847 0.67 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005800.1"; gene_id "LTnewLTref_360005800"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 38904 38912 0.67 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005800.1"; gene_id "LTnewLTref_360005800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 39856 40623 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360005900.1"; gene_id "LTnewLTref_360005900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 39856 40623 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360005900.1"; gene_id "LTnewLTref_360005900"; CM024322.1 Liftoff transcript 41236 41484 . - . transcript_id "LTnewLTref_360006000.1"; gene_id "LTnewLTref_360006000" CM024322.1 Liftoff CDS 41236 41484 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006000.1"; gene_id "LTnewLTref_360006000"; CM024322.1 Liftoff transcript 42764 43024 . - . transcript_id "LTnewLTref_360006100.1"; gene_id "LTnewLTref_360006100" CM024322.1 Liftoff CDS 42764 43024 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006100.1"; gene_id "LTnewLTref_360006100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 43621 44511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360006200.1"; gene_id "LTnewLTref_360006200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 43621 44511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006200.1"; gene_id "LTnewLTref_360006200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 45281 48451 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360006300.1"; gene_id "LTnewLTref_360006300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 45281 48451 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006300.1"; gene_id "LTnewLTref_360006300"; CM024322.1 Liftoff transcript 49174 50934 . - . transcript_id "LTnewLTref_360006400.1"; gene_id "LTnewLTref_360006400" CM024322.1 Liftoff CDS 49174 50934 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006400.1"; gene_id "LTnewLTref_360006400"; CM024322.1 Liftoff transcript 51005 51208 . - . transcript_id "LTnewLTref_360006500.1"; gene_id "LTnewLTref_360006500" CM024322.1 Liftoff CDS 51005 51208 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006500.1"; gene_id "LTnewLTref_360006500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 52203 54752 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360006600.1"; gene_id "LTnewLTref_360006600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 52203 54752 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006600.1"; gene_id "LTnewLTref_360006600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 55598 56569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360006700.1"; gene_id "LTnewLTref_360006700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 55598 56569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006700.1"; gene_id "LTnewLTref_360006700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 57453 58559 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360006800.1"; gene_id "LTnewLTref_360006800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 57453 58559 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006800.1"; gene_id "LTnewLTref_360006800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 59366 61300 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360006900.1"; gene_id "LTnewLTref_360006900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 59366 61300 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360006900.1"; gene_id "LTnewLTref_360006900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 63544 65001 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007000.1"; gene_id "LTnewLTref_360007000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 63544 65001 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007000.1"; gene_id "LTnewLTref_360007000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 65541 66398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007100.1"; gene_id "LTnewLTref_360007100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 65541 66398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007100.1"; gene_id "LTnewLTref_360007100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 67148 67417 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007200.1"; gene_id "LTnewLTref_360007200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 67148 67417 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007200.1"; gene_id "LTnewLTref_360007200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 68299 68766 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007300.1"; gene_id "LTnewLTref_360007300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 68299 68766 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007300.1"; gene_id "LTnewLTref_360007300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 69369 71906 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007400.1"; gene_id "LTnewLTref_360007400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 69369 71906 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007400.1"; gene_id "LTnewLTref_360007400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 73006 75543 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007500.1"; gene_id "LTnewLTref_360007500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 73006 75543 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007500.1"; gene_id "LTnewLTref_360007500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 76643 79180 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007600.1"; gene_id "LTnewLTref_360007600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 76643 79180 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007600.1"; gene_id "LTnewLTref_360007600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 80283 82820 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007700.1"; gene_id "LTnewLTref_360007700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 80283 82820 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007700.1"; gene_id "LTnewLTref_360007700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 83917 86455 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_360007800.1"; gene_id "LTnewLTref_360007800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 83917 84558 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007800.1"; gene_id "LTnewLTref_360007800"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 84608 86455 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007800.1"; gene_id "LTnewLTref_360007800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 87027 87704 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360007900.1"; gene_id "LTnewLTref_360007900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 87027 87704 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360007900.1"; gene_id "LTnewLTref_360007900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 90450 91871 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008000.1"; gene_id "LTnewLTref_360008000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 90450 91871 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008000.1"; gene_id "LTnewLTref_360008000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 93460 94248 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008100.1"; gene_id "LTnewLTref_360008100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 93460 94248 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008100.1"; gene_id "LTnewLTref_360008100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 95666 95995 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008200.1"; gene_id "LTnewLTref_360008200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 95666 95995 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008200.1"; gene_id "LTnewLTref_360008200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 96952 97626 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008300.1"; gene_id "LTnewLTref_360008300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 96952 97626 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008300.1"; gene_id "LTnewLTref_360008300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 98952 100586 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008400.1"; gene_id "LTnewLTref_360008400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 98952 100586 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008400.1"; gene_id "LTnewLTref_360008400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 103802 105265 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008500.1"; gene_id "LTnewLTref_360008500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 103802 105265 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008500.1"; gene_id "LTnewLTref_360008500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 106138 108588 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008600.1"; gene_id "LTnewLTref_360008600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 106138 108588 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008600.1"; gene_id "LTnewLTref_360008600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 109622 110227 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008700.1"; gene_id "LTnewLTref_360008700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 109622 110227 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008700.1"; gene_id "LTnewLTref_360008700"; CM024322.1 . transcript 110708 111812 . - . transcript_id "LTnewLTref_360008800.1"; gene_id "LTnewLTref_360008800:pseudogene" CM024322.1 . exon 110708 111812 . - . transcript_id "LTnewLTref_360008800.1"; gene_id "LTnewLTref_360008800:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 112397 113395 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360008900.1"; gene_id "LTnewLTref_360008900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 112397 113395 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360008900.1"; gene_id "LTnewLTref_360008900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 114375 115067 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009000.1"; gene_id "LTnewLTref_360009000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 114375 115067 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009000.1"; gene_id "LTnewLTref_360009000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 116307 116927 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009100.1"; gene_id "LTnewLTref_360009100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 116307 116927 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009100.1"; gene_id "LTnewLTref_360009100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 119832 121256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009200.1"; gene_id "LTnewLTref_360009200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 119832 121256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009200.1"; gene_id "LTnewLTref_360009200"; CM024322.1 Liftoff transcript 122501 122692 . - . transcript_id "LTnewLTref_360009300.1"; gene_id "LTnewLTref_360009300" CM024322.1 Liftoff CDS 122501 122692 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009300.1"; gene_id "LTnewLTref_360009300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 124696 126207 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009400.1"; gene_id "LTnewLTref_360009400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 124696 126207 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009400.1"; gene_id "LTnewLTref_360009400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 127446 128225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009500.1"; gene_id "LTnewLTref_360009500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 127446 128225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009500.1"; gene_id "LTnewLTref_360009500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 129255 130622 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009600.1"; gene_id "LTnewLTref_360009600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 129255 130622 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009600.1"; gene_id "LTnewLTref_360009600"; CM024322.1 . transcript 131189 131750 . - . transcript_id "LTnewLTref_360009700.1"; gene_id "LTnewLTref_360009700:pseudogene" CM024322.1 . exon 131189 131750 . - . transcript_id "LTnewLTref_360009700.1"; gene_id "LTnewLTref_360009700:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 135333 137324 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009800.1"; gene_id "LTnewLTref_360009800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 135333 137324 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009800.1"; gene_id "LTnewLTref_360009800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 138567 139070 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360009900.1"; gene_id "LTnewLTref_360009900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 138567 139070 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360009900.1"; gene_id "LTnewLTref_360009900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 139721 141061 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010000.1"; gene_id "LTnewLTref_360010000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 139721 141061 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010000.1"; gene_id "LTnewLTref_360010000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 142566 143162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010100.1"; gene_id "LTnewLTref_360010100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 142566 143162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010100.1"; gene_id "LTnewLTref_360010100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 144300 145784 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010200.1"; gene_id "LTnewLTref_360010200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 144300 145784 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010200.1"; gene_id "LTnewLTref_360010200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 147855 148394 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010300.1"; gene_id "LTnewLTref_360010300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 147855 148394 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010300.1"; gene_id "LTnewLTref_360010300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 150519 151967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010400.1"; gene_id "LTnewLTref_360010400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 150519 151967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010400.1"; gene_id "LTnewLTref_360010400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 154159 155745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010500.1"; gene_id "LTnewLTref_360010500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 154159 155745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010500.1"; gene_id "LTnewLTref_360010500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 157569 159422 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010600.1"; gene_id "LTnewLTref_360010600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 157569 159422 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010600.1"; gene_id "LTnewLTref_360010600"; CM024322.1 Liftoff transcript 160375 161799 . - . transcript_id "LTnewLTref_360010700.1"; gene_id "LTnewLTref_360010700" CM024322.1 Liftoff CDS 160375 161799 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010700.1"; gene_id "LTnewLTref_360010700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 163345 164022 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010800.1"; gene_id "LTnewLTref_360010800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 163345 164022 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010800.1"; gene_id "LTnewLTref_360010800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 165848 166897 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360010900.1"; gene_id "LTnewLTref_360010900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 165848 166897 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360010900.1"; gene_id "LTnewLTref_360010900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 168226 169758 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360011000.1"; gene_id "LTnewLTref_360011000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 168226 169758 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360011000.1"; gene_id "LTnewLTref_360011000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 173217 175484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360011100.1"; gene_id "LTnewLTref_360011100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 173217 175484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360011100.1"; gene_id "LTnewLTref_360011100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 176229 177563 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360011200.1"; gene_id "LTnewLTref_360011200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 176229 177563 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360011200.1"; gene_id "LTnewLTref_360011200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 178482 179378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360011300.1"; gene_id "LTnewLTref_360011300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 178482 179378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360011300.1"; gene_id "LTnewLTref_360011300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 179964 180389 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360011400.1"; gene_id "LTnewLTref_360011400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 179964 180389 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360011400.1"; gene_id "LTnewLTref_360011400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 182823 183776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360011500.1"; gene_id "LTnewLTref_360011500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 182823 183776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360011500.1"; gene_id "LTnewLTref_360011500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 184525 185460 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360011600.1"; gene_id "LTnewLTref_360011600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 184525 185460 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360011600.1"; gene_id "LTnewLTref_360011600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 186028 186954 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360011700.1"; gene_id "LTnewLTref_360011700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 186028 186954 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360011700.1"; gene_id "LTnewLTref_360011700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 187822 190062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360011800.1"; gene_id "LTnewLTref_360011800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 187822 190062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360011800.1"; gene_id "LTnewLTref_360011800"; CM024322.1 . transcript 193369 195153 . + . transcript_id "LTnewLTref_360011900.1"; gene_id "LTnewLTref_360011900:pseudogene" CM024322.1 . exon 193369 195153 . + . transcript_id "LTnewLTref_360011900.1"; gene_id "LTnewLTref_360011900:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 198713 199993 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012000.1"; gene_id "LTnewLTref_360012000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 198713 199993 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012000.1"; gene_id "LTnewLTref_360012000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 202491 203135 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012100.1"; gene_id "LTnewLTref_360012100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 202491 203135 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012100.1"; gene_id "LTnewLTref_360012100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 205269 205727 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012200.1"; gene_id "LTnewLTref_360012200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 205269 205727 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012200.1"; gene_id "LTnewLTref_360012200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 206763 207677 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012300.1"; gene_id "LTnewLTref_360012300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 206763 207677 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012300.1"; gene_id "LTnewLTref_360012300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 210047 210268 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012400.1"; gene_id "LTnewLTref_360012400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 210047 210268 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012400.1"; gene_id "LTnewLTref_360012400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 211945 212511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012500.1"; gene_id "LTnewLTref_360012500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 211945 212511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012500.1"; gene_id "LTnewLTref_360012500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 213391 214341 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012600.1"; gene_id "LTnewLTref_360012600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 213391 214341 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012600.1"; gene_id "LTnewLTref_360012600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 215703 217187 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012700.1"; gene_id "LTnewLTref_360012700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 215703 217187 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012700.1"; gene_id "LTnewLTref_360012700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 221900 222505 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360012800.1"; gene_id "LTnewLTref_360012800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 221900 222505 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360012800.1"; gene_id "LTnewLTref_360012800"; CM024322.1 . transcript 227219 228622 . + . transcript_id "LTnewLTref_360012900.1"; gene_id "LTnewLTref_360012900:pseudogene" CM024322.1 . exon 227219 228622 . + . transcript_id "LTnewLTref_360012900.1"; gene_id "LTnewLTref_360012900:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 230909 233761 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013000.1"; gene_id "LTnewLTref_360013000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 230909 233761 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013000.1"; gene_id "LTnewLTref_360013000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 234642 235448 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013100.1"; gene_id "LTnewLTref_360013100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 234642 235448 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013100.1"; gene_id "LTnewLTref_360013100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 236212 236901 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013200.1"; gene_id "LTnewLTref_360013200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 236212 236901 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013200.1"; gene_id "LTnewLTref_360013200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 239234 240013 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013300.1"; gene_id "LTnewLTref_360013300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 239234 240013 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013300.1"; gene_id "LTnewLTref_360013300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 242582 243877 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013400.1"; gene_id "LTnewLTref_360013400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 242582 243877 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013400.1"; gene_id "LTnewLTref_360013400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 247310 247752 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_360013500.1"; gene_id "LTnewLTref_360013500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 247310 247380 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013500.1"; gene_id "LTnewLTref_360013500"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 247530 247752 0.95 + 1 transcript_id "LTnewLTref_360013500.1"; gene_id "LTnewLTref_360013500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 252978 254495 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013600.1"; gene_id "LTnewLTref_360013600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 252978 254495 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013600.1"; gene_id "LTnewLTref_360013600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 264001 264450 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_360013700.1"; gene_id "LTnewLTref_360013700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 264001 264450 0.43 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013700.1"; gene_id "LTnewLTref_360013700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 270932 272560 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013800.1"; gene_id "LTnewLTref_360013800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 270932 272560 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013800.1"; gene_id "LTnewLTref_360013800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 289655 293527 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360013900.1"; gene_id "LTnewLTref_360013900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 289655 293527 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360013900.1"; gene_id "LTnewLTref_360013900"; CM024322.1 Liftoff transcript 296559 300110 . + . transcript_id "LTnewLTref_360014000.1"; gene_id "LTnewLTref_360014000" CM024322.1 Liftoff CDS 296559 300110 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014000.1"; gene_id "LTnewLTref_360014000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 301781 303097 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014100.1"; gene_id "LTnewLTref_360014100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 301781 303097 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014100.1"; gene_id "LTnewLTref_360014100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 304886 308248 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014200.1"; gene_id "LTnewLTref_360014200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 304886 308248 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014200.1"; gene_id "LTnewLTref_360014200"; CM024322.1 Liftoff transcript 309347 309559 . + . transcript_id "LTnewLTref_360014300.1"; gene_id "LTnewLTref_360014300" CM024322.1 Liftoff CDS 309347 309559 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014300.1"; gene_id "LTnewLTref_360014300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 311241 312926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014400.1"; gene_id "LTnewLTref_360014400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 311241 312926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014400.1"; gene_id "LTnewLTref_360014400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 313771 315444 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014500.1"; gene_id "LTnewLTref_360014500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 313771 315444 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014500.1"; gene_id "LTnewLTref_360014500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 316287 317666 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014600.1"; gene_id "LTnewLTref_360014600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 316287 317666 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014600.1"; gene_id "LTnewLTref_360014600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 318688 319593 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014700.1"; gene_id "LTnewLTref_360014700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 318688 319593 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014700.1"; gene_id "LTnewLTref_360014700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 322329 328139 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014800.1"; gene_id "LTnewLTref_360014800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 322329 328139 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014800.1"; gene_id "LTnewLTref_360014800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 332245 334605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360014900.1"; gene_id "LTnewLTref_360014900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 332245 334605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360014900.1"; gene_id "LTnewLTref_360014900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 340613 343279 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360015000.1"; gene_id "LTnewLTref_360015000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 340613 343279 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015000.1"; gene_id "LTnewLTref_360015000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 345349 346926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360015100.1"; gene_id "LTnewLTref_360015100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 345349 346926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015100.1"; gene_id "LTnewLTref_360015100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 350170 353004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360015200.1"; gene_id "LTnewLTref_360015200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 350170 353004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015200.1"; gene_id "LTnewLTref_360015200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 353657 354439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360015300.1"; gene_id "LTnewLTref_360015300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 353657 354439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015300.1"; gene_id "LTnewLTref_360015300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 355597 356346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360015400.1"; gene_id "LTnewLTref_360015400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 355597 356346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015400.1"; gene_id "LTnewLTref_360015400"; CM024322.1 Liftoff transcript 360401 362776 . + . transcript_id "LTnewLTref_360015500.1"; gene_id "LTnewLTref_360015500" CM024322.1 Liftoff CDS 360401 362776 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015500.1"; gene_id "LTnewLTref_360015500"; CM024322.1 . transcript 365380 365658 . + . transcript_id "LTnewLTref_360015600.1"; gene_id "LTnewLTref_360015600:pseudogene" CM024322.1 . exon 365380 365658 . + . transcript_id "LTnewLTref_360015600.1"; gene_id "LTnewLTref_360015600:pseudogene"; CM024322.1 . transcript 365754 365954 . + . transcript_id "LTnewLTref_360015700.1"; gene_id "LTnewLTref_360015700:pseudogene" CM024322.1 . exon 365754 365954 . + . transcript_id "LTnewLTref_360015700.1"; gene_id "LTnewLTref_360015700:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 371959 376650 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360015800.1"; gene_id "LTnewLTref_360015800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 371959 376650 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015800.1"; gene_id "LTnewLTref_360015800"; CM024322.1 Liftoff transcript 379310 381218 . + . transcript_id "LTnewLTref_360015900.1"; gene_id "LTnewLTref_360015900" CM024322.1 Liftoff CDS 379310 381218 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360015900.1"; gene_id "LTnewLTref_360015900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 382545 382943 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016000.1"; gene_id "LTnewLTref_360016000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 382545 382943 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016000.1"; gene_id "LTnewLTref_360016000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 386296 386796 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016100.1"; gene_id "LTnewLTref_360016100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 386296 386796 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016100.1"; gene_id "LTnewLTref_360016100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 387787 388248 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016200.1"; gene_id "LTnewLTref_360016200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 387787 388248 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016200.1"; gene_id "LTnewLTref_360016200"; CM024322.1 Liftoff transcript 389717 402538 . + . transcript_id "LTnewLTref_360016300.1"; gene_id "LTnewLTref_360016300" CM024322.1 Liftoff CDS 389717 402538 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016300.1"; gene_id "LTnewLTref_360016300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 405952 408699 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016400.1"; gene_id "LTnewLTref_360016400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 405952 408699 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016400.1"; gene_id "LTnewLTref_360016400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 412077 412763 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016500.1"; gene_id "LTnewLTref_360016500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 412077 412763 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016500.1"; gene_id "LTnewLTref_360016500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 413658 414257 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016600.1"; gene_id "LTnewLTref_360016600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 413658 414257 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016600.1"; gene_id "LTnewLTref_360016600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 414921 415427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016700.1"; gene_id "LTnewLTref_360016700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 414921 415427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016700.1"; gene_id "LTnewLTref_360016700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 416346 420236 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016800.1"; gene_id "LTnewLTref_360016800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 416346 420236 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016800.1"; gene_id "LTnewLTref_360016800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 421465 426399 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360016900.1"; gene_id "LTnewLTref_360016900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 421465 426399 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360016900.1"; gene_id "LTnewLTref_360016900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 427429 429069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017000.1"; gene_id "LTnewLTref_360017000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 427429 429069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017000.1"; gene_id "LTnewLTref_360017000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 430493 435511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017100.1"; gene_id "LTnewLTref_360017100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 430493 435511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017100.1"; gene_id "LTnewLTref_360017100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 436923 437783 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017200.1"; gene_id "LTnewLTref_360017200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 436923 437783 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017200.1"; gene_id "LTnewLTref_360017200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 438961 440724 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017300.1"; gene_id "LTnewLTref_360017300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 438961 440724 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017300.1"; gene_id "LTnewLTref_360017300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 442066 445083 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017400.1"; gene_id "LTnewLTref_360017400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 442066 445083 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017400.1"; gene_id "LTnewLTref_360017400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 445586 445960 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017500.1"; gene_id "LTnewLTref_360017500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 445586 445960 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017500.1"; gene_id "LTnewLTref_360017500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 446725 448461 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017600.1"; gene_id "LTnewLTref_360017600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 446725 448461 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017600.1"; gene_id "LTnewLTref_360017600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 449872 450333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017700.1"; gene_id "LTnewLTref_360017700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 449872 450333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017700.1"; gene_id "LTnewLTref_360017700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 451218 451592 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360017800.1"; gene_id "LTnewLTref_360017800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 451218 451592 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360017800.1"; gene_id "LTnewLTref_360017800"; CM024322.1 . transcript 452274 453935 . + . transcript_id "LTnewLTref_360017900.1"; gene_id "LTnewLTref_360017900:pseudogene" CM024322.1 . exon 452274 453935 . + . transcript_id "LTnewLTref_360017900.1"; gene_id "LTnewLTref_360017900:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 455329 456408 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018000.1"; gene_id "LTnewLTref_360018000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 455329 456408 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018000.1"; gene_id "LTnewLTref_360018000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 457395 458942 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_360018100.1"; gene_id "LTnewLTref_360018100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 457395 458942 0.51 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018100.1"; gene_id "LTnewLTref_360018100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 460062 460979 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018200.1"; gene_id "LTnewLTref_360018200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 460062 460979 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018200.1"; gene_id "LTnewLTref_360018200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 462767 465490 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_360018300.1"; gene_id "LTnewLTref_360018300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 462767 465490 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018300.1"; gene_id "LTnewLTref_360018300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 467170 468282 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018400.1"; gene_id "LTnewLTref_360018400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 467170 468282 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018400.1"; gene_id "LTnewLTref_360018400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 470066 471979 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018500.1"; gene_id "LTnewLTref_360018500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 470066 471979 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018500.1"; gene_id "LTnewLTref_360018500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 473390 474397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018600.1"; gene_id "LTnewLTref_360018600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 473390 474397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018600.1"; gene_id "LTnewLTref_360018600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 475605 476027 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018700.1"; gene_id "LTnewLTref_360018700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 475605 476027 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018700.1"; gene_id "LTnewLTref_360018700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 477460 479340 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360018800.1"; gene_id "LTnewLTref_360018800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 477460 479340 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018800.1"; gene_id "LTnewLTref_360018800"; CM024322.1 Liftoff transcript 480054 480839 . + . transcript_id "LTnewLTref_360018900.1"; gene_id "LTnewLTref_360018900" CM024322.1 Liftoff CDS 480054 480839 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360018900.1"; gene_id "LTnewLTref_360018900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 481442 482932 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019000.1"; gene_id "LTnewLTref_360019000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 481442 482932 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019000.1"; gene_id "LTnewLTref_360019000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 484775 486529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019100.1"; gene_id "LTnewLTref_360019100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 484775 486529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019100.1"; gene_id "LTnewLTref_360019100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 487069 489390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019200.1"; gene_id "LTnewLTref_360019200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 487069 489390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019200.1"; gene_id "LTnewLTref_360019200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 491152 491724 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019300.1"; gene_id "LTnewLTref_360019300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 491152 491724 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019300.1"; gene_id "LTnewLTref_360019300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 492648 493763 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019400.1"; gene_id "LTnewLTref_360019400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 492648 493763 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019400.1"; gene_id "LTnewLTref_360019400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 498027 498608 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019500.1"; gene_id "LTnewLTref_360019500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 498027 498608 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019500.1"; gene_id "LTnewLTref_360019500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 499286 500920 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019600.1"; gene_id "LTnewLTref_360019600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 499286 500920 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019600.1"; gene_id "LTnewLTref_360019600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 502476 503249 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019700.1"; gene_id "LTnewLTref_360019700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 502476 503249 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019700.1"; gene_id "LTnewLTref_360019700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 504074 505360 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360019800.1"; gene_id "LTnewLTref_360019800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 504074 505360 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019800.1"; gene_id "LTnewLTref_360019800"; CM024322.1 Liftoff transcript 506251 507201 . + . transcript_id "LTnewLTref_360019900.1"; gene_id "LTnewLTref_360019900" CM024322.1 Liftoff CDS 506251 507201 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360019900.1"; gene_id "LTnewLTref_360019900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 508161 510296 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360020000.1"; gene_id "LTnewLTref_360020000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 508161 510296 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360020000.1"; gene_id "LTnewLTref_360020000"; CM024322.1 Liftoff transcript 511164 511883 . + . transcript_id "LTnewLTref_360020100.1"; gene_id "LTnewLTref_360020100" CM024322.1 Liftoff CDS 511164 511883 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360020100.1"; gene_id "LTnewLTref_360020100"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 513848 513932 . - . transcript_id "LTnewLTref_360020200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020200" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 513848 513932 . - . transcript_id "LTnewLTref_360020200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020200"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 514009 514081 . - . transcript_id "LTnewLTref_360020300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020300" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 514009 514081 . - . transcript_id "LTnewLTref_360020300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020300"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 514902 514974 . + . transcript_id "LTnewLTref_360020400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020400" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 514902 514974 . + . transcript_id "LTnewLTref_360020400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020400"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 515052 515136 . + . transcript_id "LTnewLTref_360020500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020500" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 515052 515136 . + . transcript_id "LTnewLTref_360020500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360020500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 518107 518769 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360020600.1"; gene_id "LTnewLTref_360020600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 518107 518769 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360020600.1"; gene_id "LTnewLTref_360020600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 520241 522595 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360020700.1"; gene_id "LTnewLTref_360020700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 520241 522595 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360020700.1"; gene_id "LTnewLTref_360020700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 525644 527296 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360020800.1"; gene_id "LTnewLTref_360020800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 525644 527296 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360020800.1"; gene_id "LTnewLTref_360020800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 528124 531444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360020900.1"; gene_id "LTnewLTref_360020900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 528124 531444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360020900.1"; gene_id "LTnewLTref_360020900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 532296 532850 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021000.1"; gene_id "LTnewLTref_360021000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 532296 532850 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021000.1"; gene_id "LTnewLTref_360021000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 538352 539704 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021100.1"; gene_id "LTnewLTref_360021100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 538352 539704 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021100.1"; gene_id "LTnewLTref_360021100"; CM024322.1 Liftoff transcript 540989 543700 . - . transcript_id "LTnewLTref_360021200.1"; gene_id "LTnewLTref_360021200" CM024322.1 Liftoff CDS 540989 543700 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021200.1"; gene_id "LTnewLTref_360021200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 545037 546722 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021300.1"; gene_id "LTnewLTref_360021300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 545037 546722 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021300.1"; gene_id "LTnewLTref_360021300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 549138 549773 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021400.1"; gene_id "LTnewLTref_360021400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 549138 549773 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021400.1"; gene_id "LTnewLTref_360021400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 550691 567493 0.56 - . transcript_id "LTnewLTref_360021500.1"; gene_id "LTnewLTref_360021500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 550691 558840 0.95 - 2 transcript_id "LTnewLTref_360021500.1"; gene_id "LTnewLTref_360021500"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 558973 567493 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021500.1"; gene_id "LTnewLTref_360021500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 569484 569951 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021600.1"; gene_id "LTnewLTref_360021600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 569484 569951 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021600.1"; gene_id "LTnewLTref_360021600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 571091 573055 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021700.1"; gene_id "LTnewLTref_360021700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 571091 573055 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021700.1"; gene_id "LTnewLTref_360021700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 573900 577289 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360021800.1"; gene_id "LTnewLTref_360021800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 573900 577289 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021800.1"; gene_id "LTnewLTref_360021800"; CM024322.1 Liftoff transcript 578003 579478 . - . transcript_id "LTnewLTref_360021900.1"; gene_id "LTnewLTref_360021900" CM024322.1 Liftoff CDS 578003 579478 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360021900.1"; gene_id "LTnewLTref_360021900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 581202 584807 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022000.1"; gene_id "LTnewLTref_360022000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 581202 584807 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022000.1"; gene_id "LTnewLTref_360022000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 586442 589288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022100.1"; gene_id "LTnewLTref_360022100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 586442 589288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022100.1"; gene_id "LTnewLTref_360022100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 590196 590720 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022200.1"; gene_id "LTnewLTref_360022200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 590196 590720 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022200.1"; gene_id "LTnewLTref_360022200"; CM024322.1 Liftoff transcript 591928 592113 . - . transcript_id "LTnewLTref_360022300.1"; gene_id "LTnewLTref_360022300" CM024322.1 Liftoff CDS 591928 592113 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022300.1"; gene_id "LTnewLTref_360022300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 596044 597576 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022400.1"; gene_id "LTnewLTref_360022400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 596044 597576 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022400.1"; gene_id "LTnewLTref_360022400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 602543 604048 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022500.1"; gene_id "LTnewLTref_360022500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 602543 604048 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022500.1"; gene_id "LTnewLTref_360022500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 608933 611740 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022600.1"; gene_id "LTnewLTref_360022600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 608933 611740 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022600.1"; gene_id "LTnewLTref_360022600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 615412 617958 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022700.1"; gene_id "LTnewLTref_360022700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 615412 617958 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022700.1"; gene_id "LTnewLTref_360022700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 620178 621689 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022800.1"; gene_id "LTnewLTref_360022800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 620178 621689 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022800.1"; gene_id "LTnewLTref_360022800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 622838 624268 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360022900.1"; gene_id "LTnewLTref_360022900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 622838 624268 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360022900.1"; gene_id "LTnewLTref_360022900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 625884 631370 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023000.1"; gene_id "LTnewLTref_360023000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 625884 631370 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023000.1"; gene_id "LTnewLTref_360023000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 633930 637556 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023100.1"; gene_id "LTnewLTref_360023100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 633930 637556 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023100.1"; gene_id "LTnewLTref_360023100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 638937 639308 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023200.1"; gene_id "LTnewLTref_360023200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 638937 639308 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023200.1"; gene_id "LTnewLTref_360023200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 640376 641170 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023300.1"; gene_id "LTnewLTref_360023300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 640376 641170 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023300.1"; gene_id "LTnewLTref_360023300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 646938 647285 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023400.1"; gene_id "LTnewLTref_360023400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 646938 647285 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023400.1"; gene_id "LTnewLTref_360023400"; CM024322.1 . transcript 650690 651215 . - . transcript_id "LTnewLTref_360023500.1"; gene_id "LTnewLTref_360023500:pseudogene" CM024322.1 . exon 650690 651024 . - . transcript_id "LTnewLTref_360023500.1"; gene_id "LTnewLTref_360023500:pseudogene"; CM024322.1 . exon 651079 651215 . - . transcript_id "LTnewLTref_360023500.1"; gene_id "LTnewLTref_360023500:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 653853 658934 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023600.1"; gene_id "LTnewLTref_360023600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 653853 653876 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023600.1"; gene_id "LTnewLTref_360023600"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 653919 658934 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023600.1"; gene_id "LTnewLTref_360023600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 665786 666193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023700.1"; gene_id "LTnewLTref_360023700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 665786 666193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023700.1"; gene_id "LTnewLTref_360023700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 670772 671587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023800.1"; gene_id "LTnewLTref_360023800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 670772 671587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023800.1"; gene_id "LTnewLTref_360023800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 672670 673578 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360023900.1"; gene_id "LTnewLTref_360023900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 672670 673578 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360023900.1"; gene_id "LTnewLTref_360023900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 674553 677186 0.68 - . transcript_id "LTnewLTref_360024000.1"; gene_id "LTnewLTref_360024000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 674553 676908 0.68 - 1 transcript_id "LTnewLTref_360024000.1"; gene_id "LTnewLTref_360024000"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 677149 677186 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024000.1"; gene_id "LTnewLTref_360024000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 677961 679598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024100.1"; gene_id "LTnewLTref_360024100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 677961 679598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024100.1"; gene_id "LTnewLTref_360024100"; CM024322.1 Liftoff transcript 680301 681533 . - . transcript_id "LTnewLTref_360024200.1"; gene_id "LTnewLTref_360024200" CM024322.1 Liftoff CDS 680301 681533 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024200.1"; gene_id "LTnewLTref_360024200"; CM024322.1 Liftoff transcript 681684 683150 . - . transcript_id "LTnewLTref_360024300.1"; gene_id "LTnewLTref_360024300" CM024322.1 Liftoff CDS 681684 683150 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024300.1"; gene_id "LTnewLTref_360024300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 683763 684695 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024400.1"; gene_id "LTnewLTref_360024400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 683763 684695 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024400.1"; gene_id "LTnewLTref_360024400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 687408 689048 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024500.1"; gene_id "LTnewLTref_360024500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 687408 689048 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024500.1"; gene_id "LTnewLTref_360024500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 690820 691983 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024600.1"; gene_id "LTnewLTref_360024600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 690820 691983 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024600.1"; gene_id "LTnewLTref_360024600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 693015 706115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024700.1"; gene_id "LTnewLTref_360024700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 693015 706115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024700.1"; gene_id "LTnewLTref_360024700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 708243 711098 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024800.1"; gene_id "LTnewLTref_360024800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 708243 711098 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024800.1"; gene_id "LTnewLTref_360024800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 711935 717439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360024900.1"; gene_id "LTnewLTref_360024900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 711935 717439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360024900.1"; gene_id "LTnewLTref_360024900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 719027 720661 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025000.1"; gene_id "LTnewLTref_360025000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 719027 720661 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025000.1"; gene_id "LTnewLTref_360025000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 721971 723500 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025100.1"; gene_id "LTnewLTref_360025100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 721971 723500 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025100.1"; gene_id "LTnewLTref_360025100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 725853 726173 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025200.1"; gene_id "LTnewLTref_360025200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 725853 726173 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025200.1"; gene_id "LTnewLTref_360025200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 727179 729416 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025300.1"; gene_id "LTnewLTref_360025300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 727179 729416 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025300.1"; gene_id "LTnewLTref_360025300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 730538 733225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025400.1"; gene_id "LTnewLTref_360025400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 730538 733225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025400.1"; gene_id "LTnewLTref_360025400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 734435 735595 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025500.1"; gene_id "LTnewLTref_360025500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 734435 735595 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025500.1"; gene_id "LTnewLTref_360025500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 736715 739531 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025600.1"; gene_id "LTnewLTref_360025600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 736715 739531 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025600.1"; gene_id "LTnewLTref_360025600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 742243 744864 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025700.1"; gene_id "LTnewLTref_360025700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 742243 744864 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025700.1"; gene_id "LTnewLTref_360025700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 748641 751274 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025800.1"; gene_id "LTnewLTref_360025800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 748641 751274 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025800.1"; gene_id "LTnewLTref_360025800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 753042 755018 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360025900.1"; gene_id "LTnewLTref_360025900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 753042 755018 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360025900.1"; gene_id "LTnewLTref_360025900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 756201 757784 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026000.1"; gene_id "LTnewLTref_360026000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 756201 757784 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026000.1"; gene_id "LTnewLTref_360026000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 758656 759951 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026100.1"; gene_id "LTnewLTref_360026100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 758656 759951 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026100.1"; gene_id "LTnewLTref_360026100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 761607 764237 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026200.1"; gene_id "LTnewLTref_360026200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 761607 764237 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026200.1"; gene_id "LTnewLTref_360026200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 765766 767667 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026300.1"; gene_id "LTnewLTref_360026300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 765766 767667 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026300.1"; gene_id "LTnewLTref_360026300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 768834 769373 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026400.1"; gene_id "LTnewLTref_360026400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 768834 769373 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026400.1"; gene_id "LTnewLTref_360026400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 770881 775848 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026500.1"; gene_id "LTnewLTref_360026500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 770881 775848 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026500.1"; gene_id "LTnewLTref_360026500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 777194 778438 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026600.1"; gene_id "LTnewLTref_360026600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 777194 778438 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026600.1"; gene_id "LTnewLTref_360026600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 779456 780835 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026700.1"; gene_id "LTnewLTref_360026700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 779456 780835 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026700.1"; gene_id "LTnewLTref_360026700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 781925 783415 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026800.1"; gene_id "LTnewLTref_360026800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 781925 783415 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026800.1"; gene_id "LTnewLTref_360026800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 784883 785161 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360026900.1"; gene_id "LTnewLTref_360026900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 784883 785161 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360026900.1"; gene_id "LTnewLTref_360026900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 787649 788551 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360027000.1"; gene_id "LTnewLTref_360027000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 787649 788551 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360027000.1"; gene_id "LTnewLTref_360027000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 790354 790683 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360027100.1"; gene_id "LTnewLTref_360027100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 790354 790683 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360027100.1"; gene_id "LTnewLTref_360027100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 792541 794040 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360027200.1"; gene_id "LTnewLTref_360027200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 792541 794040 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360027200.1"; gene_id "LTnewLTref_360027200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 795069 798113 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360027300.1"; gene_id "LTnewLTref_360027300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 795069 798113 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360027300.1"; gene_id "LTnewLTref_360027300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 799710 800672 0.29 - . transcript_id "LTnewLTref_360027400.1"; gene_id "LTnewLTref_360027400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 799710 800415 0.3 - 1 transcript_id "LTnewLTref_360027400.1"; gene_id "LTnewLTref_360027400"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 800524 800672 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360027400.1"; gene_id "LTnewLTref_360027400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 800345 800672 0.32 - . transcript_id "LTnewLTref_360027400.2"; gene_id "LTnewLTref_360027400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 800345 800415 0.53 - 2 transcript_id "LTnewLTref_360027400.2"; gene_id "LTnewLTref_360027400"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 800528 800672 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360027400.2"; gene_id "LTnewLTref_360027400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 801878 802621 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360027500.1"; gene_id "LTnewLTref_360027500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 801878 802621 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360027500.1"; gene_id "LTnewLTref_360027500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 803232 804125 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360027600.1"; gene_id "LTnewLTref_360027600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 803232 804125 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360027600.1"; gene_id "LTnewLTref_360027600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 804508 805731 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360027700.1"; gene_id "LTnewLTref_360027700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 804508 805731 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360027700.1"; gene_id "LTnewLTref_360027700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 806331 806630 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360027800.1"; gene_id "LTnewLTref_360027800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 806331 806630 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360027800.1"; gene_id "LTnewLTref_360027800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 807409 808404 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_360027900.1"; gene_id "LTnewLTref_360027900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 807409 807617 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360027900.1"; gene_id "LTnewLTref_360027900"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 807672 808404 0.87 + 1 transcript_id "LTnewLTref_360027900.1"; gene_id "LTnewLTref_360027900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 808539 808931 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028000.1"; gene_id "LTnewLTref_360028000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 808539 808931 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028000.1"; gene_id "LTnewLTref_360028000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 809299 809562 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_360028100.1"; gene_id "LTnewLTref_360028100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 809299 809562 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028100.1"; gene_id "LTnewLTref_360028100"; CM024322.1 . transcript 810945 814790 . + . transcript_id "LTnewLTref_360028200.1"; gene_id "LTnewLTref_360028200:pseudogene" CM024322.1 . exon 810945 814790 . + . transcript_id "LTnewLTref_360028200.1"; gene_id "LTnewLTref_360028200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 815549 816967 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028300.1"; gene_id "LTnewLTref_360028300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 815549 816967 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028300.1"; gene_id "LTnewLTref_360028300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 817565 819265 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028400.1"; gene_id "LTnewLTref_360028400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 817565 819265 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028400.1"; gene_id "LTnewLTref_360028400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 821718 823406 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028500.1"; gene_id "LTnewLTref_360028500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 821718 823406 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028500.1"; gene_id "LTnewLTref_360028500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 827087 829327 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028600.1"; gene_id "LTnewLTref_360028600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 827087 829327 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028600.1"; gene_id "LTnewLTref_360028600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 831490 832833 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028700.1"; gene_id "LTnewLTref_360028700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 831490 832833 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028700.1"; gene_id "LTnewLTref_360028700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 835728 838472 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028800.1"; gene_id "LTnewLTref_360028800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 835728 838472 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028800.1"; gene_id "LTnewLTref_360028800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 839521 841041 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360028900.1"; gene_id "LTnewLTref_360028900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 839521 841041 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360028900.1"; gene_id "LTnewLTref_360028900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 842435 843427 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029000.1"; gene_id "LTnewLTref_360029000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 842435 843427 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029000.1"; gene_id "LTnewLTref_360029000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 848262 852127 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029100.1"; gene_id "LTnewLTref_360029100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 848262 848540 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029100.1"; gene_id "LTnewLTref_360029100"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 848603 852127 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029100.1"; gene_id "LTnewLTref_360029100"; CM024322.1 . transcript 852192 852407 . + . transcript_id "LTnewLTref_360029200.1"; gene_id "LTnewLTref_360029200:pseudogene" CM024322.1 . exon 852192 852407 . + . transcript_id "LTnewLTref_360029200.1"; gene_id "LTnewLTref_360029200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 856203 859064 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029300.1"; gene_id "LTnewLTref_360029300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 856203 859064 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029300.1"; gene_id "LTnewLTref_360029300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 859973 861088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029400.1"; gene_id "LTnewLTref_360029400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 859973 861088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029400.1"; gene_id "LTnewLTref_360029400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 862593 863453 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029500.1"; gene_id "LTnewLTref_360029500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 862593 863453 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029500.1"; gene_id "LTnewLTref_360029500"; CM024322.1 Liftoff transcript 865788 866228 . + . transcript_id "LTnewLTref_360029600.1"; gene_id "LTnewLTref_360029600" CM024322.1 Liftoff CDS 865788 866228 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029600.1"; gene_id "LTnewLTref_360029600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 866867 869191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029700.1"; gene_id "LTnewLTref_360029700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 866867 869191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029700.1"; gene_id "LTnewLTref_360029700"; CM024322.1 Liftoff transcript 870598 875169 . + . transcript_id "LTnewLTref_360029800.1"; gene_id "LTnewLTref_360029800" CM024322.1 Liftoff CDS 870598 875169 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029800.1"; gene_id "LTnewLTref_360029800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 876357 878072 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360029900.1"; gene_id "LTnewLTref_360029900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 876357 878072 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360029900.1"; gene_id "LTnewLTref_360029900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 878795 879364 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030000.1"; gene_id "LTnewLTref_360030000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 878795 879364 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030000.1"; gene_id "LTnewLTref_360030000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 881402 882472 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030100.1"; gene_id "LTnewLTref_360030100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 881402 882472 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030100.1"; gene_id "LTnewLTref_360030100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 883527 884333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030200.1"; gene_id "LTnewLTref_360030200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 883527 884333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030200.1"; gene_id "LTnewLTref_360030200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 888565 888954 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030300.1"; gene_id "LTnewLTref_360030300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 888565 888954 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030300.1"; gene_id "LTnewLTref_360030300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 890121 892424 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030400.1"; gene_id "LTnewLTref_360030400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 890121 892424 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030400.1"; gene_id "LTnewLTref_360030400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 894103 895674 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030500.1"; gene_id "LTnewLTref_360030500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 894103 895674 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030500.1"; gene_id "LTnewLTref_360030500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 897164 899953 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030600.1"; gene_id "LTnewLTref_360030600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 897164 899953 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030600.1"; gene_id "LTnewLTref_360030600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 897347 899953 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_360030600.2"; gene_id "LTnewLTref_360030600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 897347 899953 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030600.2"; gene_id "LTnewLTref_360030600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 900517 902448 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030700.1"; gene_id "LTnewLTref_360030700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 900517 902448 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030700.1"; gene_id "LTnewLTref_360030700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 903361 904896 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030800.1"; gene_id "LTnewLTref_360030800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 903361 904896 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030800.1"; gene_id "LTnewLTref_360030800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 906791 907918 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360030900.1"; gene_id "LTnewLTref_360030900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 906791 907918 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360030900.1"; gene_id "LTnewLTref_360030900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 909503 911338 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031000.1"; gene_id "LTnewLTref_360031000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 909503 911338 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031000.1"; gene_id "LTnewLTref_360031000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 913633 921447 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031100.1"; gene_id "LTnewLTref_360031100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 913633 921447 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031100.1"; gene_id "LTnewLTref_360031100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 922527 923633 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031200.1"; gene_id "LTnewLTref_360031200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 922527 923633 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031200.1"; gene_id "LTnewLTref_360031200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 926691 927614 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031300.1"; gene_id "LTnewLTref_360031300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 926691 927614 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031300.1"; gene_id "LTnewLTref_360031300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 928956 930341 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031400.1"; gene_id "LTnewLTref_360031400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 928956 930341 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031400.1"; gene_id "LTnewLTref_360031400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 931429 932916 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031500.1"; gene_id "LTnewLTref_360031500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 931429 932916 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031500.1"; gene_id "LTnewLTref_360031500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 935544 936974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031600.1"; gene_id "LTnewLTref_360031600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 935544 936974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031600.1"; gene_id "LTnewLTref_360031600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 949395 950834 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031700.1"; gene_id "LTnewLTref_360031700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 949395 950834 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031700.1"; gene_id "LTnewLTref_360031700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 951800 952777 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031800.1"; gene_id "LTnewLTref_360031800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 951800 952777 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031800.1"; gene_id "LTnewLTref_360031800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 953984 955219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360031900.1"; gene_id "LTnewLTref_360031900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 953984 955219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360031900.1"; gene_id "LTnewLTref_360031900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 957133 958317 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032000.1"; gene_id "LTnewLTref_360032000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 957133 958317 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032000.1"; gene_id "LTnewLTref_360032000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 958834 960069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032100.1"; gene_id "LTnewLTref_360032100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 958834 960069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032100.1"; gene_id "LTnewLTref_360032100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 961993 962988 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032200.1"; gene_id "LTnewLTref_360032200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 961993 962988 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032200.1"; gene_id "LTnewLTref_360032200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 975234 976580 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032300.1"; gene_id "LTnewLTref_360032300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 975234 976580 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032300.1"; gene_id "LTnewLTref_360032300"; CM024322.1 . transcript 981077 981388 . + . transcript_id "LTnewLTref_360032400.1"; gene_id "LTnewLTref_360032400:pseudogene" CM024322.1 . exon 981077 981388 . + . transcript_id "LTnewLTref_360032400.1"; gene_id "LTnewLTref_360032400:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 981487 982200 0.43 + . transcript_id "LTnewLTref_360032500.1"; gene_id "LTnewLTref_360032500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 981487 981971 0.56 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032500.1"; gene_id "LTnewLTref_360032500"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 982119 982200 0.66 + 1 transcript_id "LTnewLTref_360032500.1"; gene_id "LTnewLTref_360032500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 983280 984194 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032600.1"; gene_id "LTnewLTref_360032600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 983280 984194 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032600.1"; gene_id "LTnewLTref_360032600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 984857 985408 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032700.1"; gene_id "LTnewLTref_360032700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 984857 985408 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032700.1"; gene_id "LTnewLTref_360032700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 987335 990199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032800.1"; gene_id "LTnewLTref_360032800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 987335 990199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032800.1"; gene_id "LTnewLTref_360032800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 991477 992538 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360032900.1"; gene_id "LTnewLTref_360032900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 991477 992538 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360032900.1"; gene_id "LTnewLTref_360032900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 995302 996232 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_360033000.1"; gene_id "LTnewLTref_360033000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 995302 996149 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033000.1"; gene_id "LTnewLTref_360033000"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 996220 996232 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_360033000.1"; gene_id "LTnewLTref_360033000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 995302 996362 0.18 + . transcript_id "LTnewLTref_360033000.2"; gene_id "LTnewLTref_360033000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 995302 996288 0.43 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033000.2"; gene_id "LTnewLTref_360033000"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 996354 996362 0.38 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033000.2"; gene_id "LTnewLTref_360033000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 998370 999386 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033100.1"; gene_id "LTnewLTref_360033100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 998370 999386 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033100.1"; gene_id "LTnewLTref_360033100"; CM024322.1 . transcript 1000674 1000934 . + . transcript_id "LTnewLTref_360033200.1"; gene_id "LTnewLTref_360033200:pseudogene" CM024322.1 . exon 1000674 1000934 . + . transcript_id "LTnewLTref_360033200.1"; gene_id "LTnewLTref_360033200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1000944 1001811 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_360033300.1"; gene_id "LTnewLTref_360033300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1000944 1001198 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033300.1"; gene_id "LTnewLTref_360033300"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1001701 1001811 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033300.1"; gene_id "LTnewLTref_360033300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1004329 1010103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033400.1"; gene_id "LTnewLTref_360033400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1004329 1010103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033400.1"; gene_id "LTnewLTref_360033400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1010677 1013235 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033500.1"; gene_id "LTnewLTref_360033500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1010677 1013235 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033500.1"; gene_id "LTnewLTref_360033500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1021938 1022738 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033600.1"; gene_id "LTnewLTref_360033600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1021938 1022738 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033600.1"; gene_id "LTnewLTref_360033600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1023755 1024522 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033700.1"; gene_id "LTnewLTref_360033700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1023755 1024522 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033700.1"; gene_id "LTnewLTref_360033700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1025844 1027163 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033800.1"; gene_id "LTnewLTref_360033800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1025844 1027163 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033800.1"; gene_id "LTnewLTref_360033800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1029056 1031176 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360033900.1"; gene_id "LTnewLTref_360033900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1029056 1031176 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360033900.1"; gene_id "LTnewLTref_360033900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1032580 1034001 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034000.1"; gene_id "LTnewLTref_360034000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1032580 1034001 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034000.1"; gene_id "LTnewLTref_360034000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1036324 1037100 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034100.1"; gene_id "LTnewLTref_360034100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1036324 1037100 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034100.1"; gene_id "LTnewLTref_360034100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1038748 1040229 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034200.1"; gene_id "LTnewLTref_360034200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1038748 1040229 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034200.1"; gene_id "LTnewLTref_360034200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1041632 1043587 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034300.1"; gene_id "LTnewLTref_360034300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1041632 1043587 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034300.1"; gene_id "LTnewLTref_360034300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1044272 1046974 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034400.1"; gene_id "LTnewLTref_360034400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1044272 1046974 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034400.1"; gene_id "LTnewLTref_360034400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1048006 1049058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034500.1"; gene_id "LTnewLTref_360034500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1048006 1049058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034500.1"; gene_id "LTnewLTref_360034500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1049601 1051940 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034600.1"; gene_id "LTnewLTref_360034600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1049601 1051940 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034600.1"; gene_id "LTnewLTref_360034600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1052752 1053960 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034700.1"; gene_id "LTnewLTref_360034700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1052752 1053960 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034700.1"; gene_id "LTnewLTref_360034700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1056507 1057628 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034800.1"; gene_id "LTnewLTref_360034800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1056507 1057628 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034800.1"; gene_id "LTnewLTref_360034800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1058706 1061486 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360034900.1"; gene_id "LTnewLTref_360034900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1058706 1061486 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360034900.1"; gene_id "LTnewLTref_360034900"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1061788 1061859 . + . transcript_id "LTnewLTref_360035000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035000" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 1061788 1061859 . + . transcript_id "LTnewLTref_360035000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035000"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1062487 1062558 . - . transcript_id "LTnewLTref_360035100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035100" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 1062487 1062558 . - . transcript_id "LTnewLTref_360035100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035100"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1062621 1062691 . - . transcript_id "LTnewLTref_360035200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035200" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 1062621 1062691 . - . transcript_id "LTnewLTref_360035200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035200"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1062765 1062836 . + . transcript_id "LTnewLTref_360035300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035300" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 1062765 1062836 . + . transcript_id "LTnewLTref_360035300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360035300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1065251 1066795 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360035400.1"; gene_id "LTnewLTref_360035400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1065251 1066795 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360035400.1"; gene_id "LTnewLTref_360035400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1069566 1072541 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360035500.1"; gene_id "LTnewLTref_360035500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1069566 1072541 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360035500.1"; gene_id "LTnewLTref_360035500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1075638 1077353 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360035600.1"; gene_id "LTnewLTref_360035600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1075638 1077353 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360035600.1"; gene_id "LTnewLTref_360035600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1078650 1080809 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360035700.1"; gene_id "LTnewLTref_360035700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1078650 1080809 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360035700.1"; gene_id "LTnewLTref_360035700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1082341 1083954 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360035800.1"; gene_id "LTnewLTref_360035800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1082341 1083954 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360035800.1"; gene_id "LTnewLTref_360035800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1085381 1085596 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360035900.1"; gene_id "LTnewLTref_360035900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1085381 1085596 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360035900.1"; gene_id "LTnewLTref_360035900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1087548 1092752 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036000.1"; gene_id "LTnewLTref_360036000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1087548 1092752 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036000.1"; gene_id "LTnewLTref_360036000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1093977 1104350 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036100.1"; gene_id "LTnewLTref_360036100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1093977 1104350 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036100.1"; gene_id "LTnewLTref_360036100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1111612 1113267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036200.1"; gene_id "LTnewLTref_360036200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1111612 1113267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036200.1"; gene_id "LTnewLTref_360036200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1114094 1115116 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036300.1"; gene_id "LTnewLTref_360036300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1114094 1115116 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036300.1"; gene_id "LTnewLTref_360036300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1115998 1116222 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036400.1"; gene_id "LTnewLTref_360036400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1115998 1116222 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036400.1"; gene_id "LTnewLTref_360036400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1116342 1116665 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_360036500.1"; gene_id "LTnewLTref_360036500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1116342 1116467 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036500.1"; gene_id "LTnewLTref_360036500"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1116513 1116665 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036500.1"; gene_id "LTnewLTref_360036500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1116783 1117004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036600.1"; gene_id "LTnewLTref_360036600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1116783 1117004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036600.1"; gene_id "LTnewLTref_360036600"; CM024322.1 . transcript 1119925 1121311 . - . transcript_id "LTnewLTref_360036700.1"; gene_id "LTnewLTref_360036700:pseudogene" CM024322.1 . exon 1119925 1121311 . - . transcript_id "LTnewLTref_360036700.1"; gene_id "LTnewLTref_360036700:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1122247 1123347 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036800.1"; gene_id "LTnewLTref_360036800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1122247 1123347 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036800.1"; gene_id "LTnewLTref_360036800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1124122 1127139 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360036900.1"; gene_id "LTnewLTref_360036900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1124122 1127139 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360036900.1"; gene_id "LTnewLTref_360036900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1127975 1128943 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037000.1"; gene_id "LTnewLTref_360037000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1127975 1128943 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037000.1"; gene_id "LTnewLTref_360037000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1129523 1130542 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037100.1"; gene_id "LTnewLTref_360037100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1129523 1130542 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037100.1"; gene_id "LTnewLTref_360037100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1131456 1135784 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037200.1"; gene_id "LTnewLTref_360037200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1131456 1135784 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037200.1"; gene_id "LTnewLTref_360037200"; CM024322.1 Liftoff transcript 1136867 1138843 . - . transcript_id "LTnewLTref_360037300.1"; gene_id "LTnewLTref_360037300" CM024322.1 Liftoff CDS 1136867 1138843 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037300.1"; gene_id "LTnewLTref_360037300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1139216 1142032 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037400.1"; gene_id "LTnewLTref_360037400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1139216 1142032 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037400.1"; gene_id "LTnewLTref_360037400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1148534 1148992 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037500.1"; gene_id "LTnewLTref_360037500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1148534 1148992 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037500.1"; gene_id "LTnewLTref_360037500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1149521 1152580 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037600.1"; gene_id "LTnewLTref_360037600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1149521 1152580 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037600.1"; gene_id "LTnewLTref_360037600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1154625 1155101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037700.1"; gene_id "LTnewLTref_360037700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1154625 1155101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037700.1"; gene_id "LTnewLTref_360037700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1159175 1160983 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037800.1"; gene_id "LTnewLTref_360037800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1159175 1160983 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037800.1"; gene_id "LTnewLTref_360037800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1161687 1161944 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360037900.1"; gene_id "LTnewLTref_360037900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1161687 1161944 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360037900.1"; gene_id "LTnewLTref_360037900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1163065 1163412 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038000.1"; gene_id "LTnewLTref_360038000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1163065 1163412 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038000.1"; gene_id "LTnewLTref_360038000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1164819 1167059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038100.1"; gene_id "LTnewLTref_360038100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1164819 1167059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038100.1"; gene_id "LTnewLTref_360038100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1168639 1170120 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038200.1"; gene_id "LTnewLTref_360038200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1168639 1170120 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038200.1"; gene_id "LTnewLTref_360038200"; CM024322.1 . transcript 1170799 1178897 . - . transcript_id "LTnewLTref_360038300.1"; gene_id "LTnewLTref_360038300:pseudogene" CM024322.1 . exon 1170799 1178897 . - . transcript_id "LTnewLTref_360038300.1"; gene_id "LTnewLTref_360038300:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1180306 1182879 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038400.1"; gene_id "LTnewLTref_360038400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1180306 1182879 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038400.1"; gene_id "LTnewLTref_360038400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1183463 1185400 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038500.1"; gene_id "LTnewLTref_360038500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1183463 1185400 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038500.1"; gene_id "LTnewLTref_360038500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1186984 1188759 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038600.1"; gene_id "LTnewLTref_360038600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1186984 1188759 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038600.1"; gene_id "LTnewLTref_360038600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1189617 1192880 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038700.1"; gene_id "LTnewLTref_360038700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1189617 1192880 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038700.1"; gene_id "LTnewLTref_360038700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1194043 1197480 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038800.1"; gene_id "LTnewLTref_360038800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1194043 1197480 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038800.1"; gene_id "LTnewLTref_360038800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1198367 1198645 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360038900.1"; gene_id "LTnewLTref_360038900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1198367 1198645 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360038900.1"; gene_id "LTnewLTref_360038900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1201896 1202678 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039000.1"; gene_id "LTnewLTref_360039000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1201896 1202678 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039000.1"; gene_id "LTnewLTref_360039000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1204132 1204545 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039100.1"; gene_id "LTnewLTref_360039100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1204132 1204545 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039100.1"; gene_id "LTnewLTref_360039100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1205388 1205801 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039200.1"; gene_id "LTnewLTref_360039200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1205388 1205801 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039200.1"; gene_id "LTnewLTref_360039200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1206720 1211873 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039300.1"; gene_id "LTnewLTref_360039300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1206720 1211873 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039300.1"; gene_id "LTnewLTref_360039300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1213318 1215369 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039400.1"; gene_id "LTnewLTref_360039400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1213318 1215369 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039400.1"; gene_id "LTnewLTref_360039400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1216576 1219290 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039500.1"; gene_id "LTnewLTref_360039500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1216576 1219290 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039500.1"; gene_id "LTnewLTref_360039500"; CM024322.1 Liftoff transcript 1219658 1219900 . - . transcript_id "LTnewLTref_360039600.1"; gene_id "LTnewLTref_360039600" CM024322.1 Liftoff CDS 1219658 1219900 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039600.1"; gene_id "LTnewLTref_360039600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1220738 1221778 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039700.1"; gene_id "LTnewLTref_360039700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1220738 1221778 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039700.1"; gene_id "LTnewLTref_360039700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1222737 1223078 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039800.1"; gene_id "LTnewLTref_360039800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1222737 1223078 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039800.1"; gene_id "LTnewLTref_360039800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1224491 1226137 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360039900.1"; gene_id "LTnewLTref_360039900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1224491 1226137 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360039900.1"; gene_id "LTnewLTref_360039900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1227205 1239741 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040000.1"; gene_id "LTnewLTref_360040000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1227205 1239741 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040000.1"; gene_id "LTnewLTref_360040000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1243262 1244503 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040100.1"; gene_id "LTnewLTref_360040100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1243262 1244503 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040100.1"; gene_id "LTnewLTref_360040100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1245249 1245647 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040200.1"; gene_id "LTnewLTref_360040200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1245249 1245647 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040200.1"; gene_id "LTnewLTref_360040200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1246457 1246972 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040300.1"; gene_id "LTnewLTref_360040300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1246457 1246972 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040300.1"; gene_id "LTnewLTref_360040300"; CM024322.1 . transcript 1248238 1248432 . - . transcript_id "LTnewLTref_360040400.1"; gene_id "LTnewLTref_360040400:pseudogene" CM024322.1 . exon 1248238 1248432 . - . transcript_id "LTnewLTref_360040400.1"; gene_id "LTnewLTref_360040400:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1248569 1249163 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_360040500.1"; gene_id "LTnewLTref_360040500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1248569 1248937 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040500.1"; gene_id "LTnewLTref_360040500"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1248999 1249163 0.93 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040500.1"; gene_id "LTnewLTref_360040500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1250980 1251690 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040600.1"; gene_id "LTnewLTref_360040600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1250980 1251690 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040600.1"; gene_id "LTnewLTref_360040600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1252517 1253980 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040700.1"; gene_id "LTnewLTref_360040700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1252517 1253980 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040700.1"; gene_id "LTnewLTref_360040700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1254822 1257686 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040800.1"; gene_id "LTnewLTref_360040800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1254822 1257686 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040800.1"; gene_id "LTnewLTref_360040800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1258161 1258619 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360040900.1"; gene_id "LTnewLTref_360040900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1258161 1258619 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360040900.1"; gene_id "LTnewLTref_360040900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1259464 1260204 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041000.1"; gene_id "LTnewLTref_360041000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1259464 1260204 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041000.1"; gene_id "LTnewLTref_360041000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1260780 1261004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041100.1"; gene_id "LTnewLTref_360041100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1260780 1261004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041100.1"; gene_id "LTnewLTref_360041100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1262008 1263324 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041200.1"; gene_id "LTnewLTref_360041200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1262008 1263324 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041200.1"; gene_id "LTnewLTref_360041200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1263792 1264148 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041300.1"; gene_id "LTnewLTref_360041300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1263792 1264148 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041300.1"; gene_id "LTnewLTref_360041300"; CM024322.1 Liftoff transcript 1264732 1265403 . - . transcript_id "LTnewLTref_360041400.1"; gene_id "LTnewLTref_360041400" CM024322.1 Liftoff CDS 1264732 1265403 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041400.1"; gene_id "LTnewLTref_360041400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1265833 1267953 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041500.1"; gene_id "LTnewLTref_360041500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1265833 1267953 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041500.1"; gene_id "LTnewLTref_360041500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1268816 1269694 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041600.1"; gene_id "LTnewLTref_360041600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1268816 1269694 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041600.1"; gene_id "LTnewLTref_360041600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1270569 1271366 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041700.1"; gene_id "LTnewLTref_360041700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1270569 1271366 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041700.1"; gene_id "LTnewLTref_360041700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1271929 1274397 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360041800.1"; gene_id "LTnewLTref_360041800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1271929 1274397 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041800.1"; gene_id "LTnewLTref_360041800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1275573 1276163 0.5 - . transcript_id "LTnewLTref_360041900.1"; gene_id "LTnewLTref_360041900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1275573 1276163 0.5 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360041900.1"; gene_id "LTnewLTref_360041900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1277717 1278367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042000.1"; gene_id "LTnewLTref_360042000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1277717 1278367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042000.1"; gene_id "LTnewLTref_360042000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1279001 1279366 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042100.1"; gene_id "LTnewLTref_360042100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1279001 1279366 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042100.1"; gene_id "LTnewLTref_360042100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1279981 1281114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042200.1"; gene_id "LTnewLTref_360042200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1279981 1281114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042200.1"; gene_id "LTnewLTref_360042200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1282031 1283737 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042300.1"; gene_id "LTnewLTref_360042300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1282031 1283737 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042300.1"; gene_id "LTnewLTref_360042300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1284654 1285454 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042400.1"; gene_id "LTnewLTref_360042400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1284654 1285454 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042400.1"; gene_id "LTnewLTref_360042400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1286402 1287151 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042500.1"; gene_id "LTnewLTref_360042500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1286402 1287151 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042500.1"; gene_id "LTnewLTref_360042500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1288094 1289359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042600.1"; gene_id "LTnewLTref_360042600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1288094 1289359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042600.1"; gene_id "LTnewLTref_360042600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1290301 1291308 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042700.1"; gene_id "LTnewLTref_360042700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1290301 1291308 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042700.1"; gene_id "LTnewLTref_360042700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1292031 1293065 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042800.1"; gene_id "LTnewLTref_360042800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1292031 1293065 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042800.1"; gene_id "LTnewLTref_360042800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1296869 1301074 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360042900.1"; gene_id "LTnewLTref_360042900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1296869 1301074 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360042900.1"; gene_id "LTnewLTref_360042900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1302553 1302882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043000.1"; gene_id "LTnewLTref_360043000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1302553 1302882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043000.1"; gene_id "LTnewLTref_360043000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1304821 1306542 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043100.1"; gene_id "LTnewLTref_360043100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1304821 1306542 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043100.1"; gene_id "LTnewLTref_360043100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1307735 1310578 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043200.1"; gene_id "LTnewLTref_360043200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1307735 1310578 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043200.1"; gene_id "LTnewLTref_360043200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1314181 1314957 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043300.1"; gene_id "LTnewLTref_360043300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1314181 1314957 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043300.1"; gene_id "LTnewLTref_360043300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1315680 1317332 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043400.1"; gene_id "LTnewLTref_360043400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1315680 1317332 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043400.1"; gene_id "LTnewLTref_360043400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1318870 1320480 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043500.1"; gene_id "LTnewLTref_360043500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1318870 1320480 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043500.1"; gene_id "LTnewLTref_360043500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1321134 1322057 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043600.1"; gene_id "LTnewLTref_360043600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1321134 1322057 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043600.1"; gene_id "LTnewLTref_360043600"; CM024322.1 Liftoff transcript 1323102 1325855 . - . transcript_id "LTnewLTref_360043700.1"; gene_id "LTnewLTref_360043700" CM024322.1 Liftoff CDS 1323102 1325855 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043700.1"; gene_id "LTnewLTref_360043700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1327288 1328835 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043800.1"; gene_id "LTnewLTref_360043800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1327288 1328835 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043800.1"; gene_id "LTnewLTref_360043800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1329561 1330145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360043900.1"; gene_id "LTnewLTref_360043900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1329561 1330145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360043900.1"; gene_id "LTnewLTref_360043900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1331049 1331438 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044000.1"; gene_id "LTnewLTref_360044000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1331049 1331438 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044000.1"; gene_id "LTnewLTref_360044000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1333294 1336806 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044100.1"; gene_id "LTnewLTref_360044100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1333294 1336806 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044100.1"; gene_id "LTnewLTref_360044100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1337743 1338573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044200.1"; gene_id "LTnewLTref_360044200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1337743 1338573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044200.1"; gene_id "LTnewLTref_360044200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1339352 1339879 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044300.1"; gene_id "LTnewLTref_360044300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1339352 1339879 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044300.1"; gene_id "LTnewLTref_360044300"; CM024322.1 . transcript 1340847 1343309 . - . transcript_id "LTnewLTref_360044400.1"; gene_id "LTnewLTref_360044400:pseudogene" CM024322.1 . exon 1340847 1343309 . - . transcript_id "LTnewLTref_360044400.1"; gene_id "LTnewLTref_360044400:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1344712 1345935 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044500.1"; gene_id "LTnewLTref_360044500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1344712 1345935 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044500.1"; gene_id "LTnewLTref_360044500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1347189 1347653 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044600.1"; gene_id "LTnewLTref_360044600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1347189 1347653 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044600.1"; gene_id "LTnewLTref_360044600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1348956 1350182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044700.1"; gene_id "LTnewLTref_360044700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1348956 1350182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044700.1"; gene_id "LTnewLTref_360044700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1351434 1359029 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044800.1"; gene_id "LTnewLTref_360044800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1351434 1359029 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044800.1"; gene_id "LTnewLTref_360044800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1360210 1360797 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360044900.1"; gene_id "LTnewLTref_360044900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1360210 1360797 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360044900.1"; gene_id "LTnewLTref_360044900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1361628 1361960 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045000.1"; gene_id "LTnewLTref_360045000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1361628 1361960 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045000.1"; gene_id "LTnewLTref_360045000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1362514 1363185 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045100.1"; gene_id "LTnewLTref_360045100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1362514 1363185 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045100.1"; gene_id "LTnewLTref_360045100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1364267 1364575 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045200.1"; gene_id "LTnewLTref_360045200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1364267 1364575 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045200.1"; gene_id "LTnewLTref_360045200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1365640 1366047 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045300.1"; gene_id "LTnewLTref_360045300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1365640 1366047 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045300.1"; gene_id "LTnewLTref_360045300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1366698 1366910 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045400.1"; gene_id "LTnewLTref_360045400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1366698 1366910 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045400.1"; gene_id "LTnewLTref_360045400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1367998 1368210 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045500.1"; gene_id "LTnewLTref_360045500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1367998 1368210 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045500.1"; gene_id "LTnewLTref_360045500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1369018 1369938 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045600.1"; gene_id "LTnewLTref_360045600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1369018 1369938 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045600.1"; gene_id "LTnewLTref_360045600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1370699 1371784 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045700.1"; gene_id "LTnewLTref_360045700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1370699 1371784 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045700.1"; gene_id "LTnewLTref_360045700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1373114 1375492 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045800.1"; gene_id "LTnewLTref_360045800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1373114 1375492 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045800.1"; gene_id "LTnewLTref_360045800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1378357 1379007 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360045900.1"; gene_id "LTnewLTref_360045900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1378357 1379007 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360045900.1"; gene_id "LTnewLTref_360045900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1380090 1380947 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046000.1"; gene_id "LTnewLTref_360046000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1380090 1380947 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046000.1"; gene_id "LTnewLTref_360046000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1381947 1382549 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046100.1"; gene_id "LTnewLTref_360046100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1381947 1382549 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046100.1"; gene_id "LTnewLTref_360046100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1384850 1387888 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046200.1"; gene_id "LTnewLTref_360046200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1384850 1387888 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046200.1"; gene_id "LTnewLTref_360046200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1389409 1390038 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046300.1"; gene_id "LTnewLTref_360046300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1389409 1390038 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046300.1"; gene_id "LTnewLTref_360046300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1390946 1391965 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046400.1"; gene_id "LTnewLTref_360046400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1390946 1391965 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046400.1"; gene_id "LTnewLTref_360046400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1392736 1395198 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046500.1"; gene_id "LTnewLTref_360046500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1392736 1395198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046500.1"; gene_id "LTnewLTref_360046500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1396167 1396736 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046600.1"; gene_id "LTnewLTref_360046600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1396167 1396736 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046600.1"; gene_id "LTnewLTref_360046600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1397619 1398398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046700.1"; gene_id "LTnewLTref_360046700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1397619 1398398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046700.1"; gene_id "LTnewLTref_360046700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1401008 1407622 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046800.1"; gene_id "LTnewLTref_360046800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1401008 1407622 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046800.1"; gene_id "LTnewLTref_360046800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1408957 1410072 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360046900.1"; gene_id "LTnewLTref_360046900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1408957 1410072 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360046900.1"; gene_id "LTnewLTref_360046900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1411217 1414795 0.84 - . transcript_id "LTnewLTref_360047000.1"; gene_id "LTnewLTref_360047000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1411217 1411235 0.84 - 1 transcript_id "LTnewLTref_360047000.1"; gene_id "LTnewLTref_360047000"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1411305 1414795 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047000.1"; gene_id "LTnewLTref_360047000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1415773 1417662 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047100.1"; gene_id "LTnewLTref_360047100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1415773 1417662 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047100.1"; gene_id "LTnewLTref_360047100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1418588 1419250 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047200.1"; gene_id "LTnewLTref_360047200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1418588 1419250 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047200.1"; gene_id "LTnewLTref_360047200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1421293 1423110 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047300.1"; gene_id "LTnewLTref_360047300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1421293 1423110 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047300.1"; gene_id "LTnewLTref_360047300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1424099 1425502 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047400.1"; gene_id "LTnewLTref_360047400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1424099 1425502 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047400.1"; gene_id "LTnewLTref_360047400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1427880 1428881 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047500.1"; gene_id "LTnewLTref_360047500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1427880 1428881 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047500.1"; gene_id "LTnewLTref_360047500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1429558 1430982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047600.1"; gene_id "LTnewLTref_360047600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1429558 1430982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047600.1"; gene_id "LTnewLTref_360047600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1433317 1434930 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047700.1"; gene_id "LTnewLTref_360047700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1433317 1434930 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047700.1"; gene_id "LTnewLTref_360047700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1436832 1437143 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047800.1"; gene_id "LTnewLTref_360047800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1436832 1437143 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047800.1"; gene_id "LTnewLTref_360047800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1439650 1440531 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360047900.1"; gene_id "LTnewLTref_360047900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1439650 1440531 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360047900.1"; gene_id "LTnewLTref_360047900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1441021 1441386 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360048000.1"; gene_id "LTnewLTref_360048000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1441021 1441386 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360048000.1"; gene_id "LTnewLTref_360048000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1441894 1443075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360048100.1"; gene_id "LTnewLTref_360048100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1441894 1443075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360048100.1"; gene_id "LTnewLTref_360048100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1443549 1444145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360048200.1"; gene_id "LTnewLTref_360048200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1443549 1444145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360048200.1"; gene_id "LTnewLTref_360048200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1445043 1446800 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360048300.1"; gene_id "LTnewLTref_360048300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1445043 1446800 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360048300.1"; gene_id "LTnewLTref_360048300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1447111 1447779 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360048400.1"; gene_id "LTnewLTref_360048400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1447111 1447779 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360048400.1"; gene_id "LTnewLTref_360048400"; CM024322.1 Liftoff transcript 1448723 1449628 . + . transcript_id "LTnewLTref_360048500.1"; gene_id "LTnewLTref_360048500" CM024322.1 Liftoff CDS 1448723 1449628 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360048500.1"; gene_id "LTnewLTref_360048500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1449995 1450462 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360048600.1"; gene_id "LTnewLTref_360048600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1449995 1450462 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360048600.1"; gene_id "LTnewLTref_360048600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1451040 1453973 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360048700.1"; gene_id "LTnewLTref_360048700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1451040 1453973 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360048700.1"; gene_id "LTnewLTref_360048700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1454694 1457921 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360048800.1"; gene_id "LTnewLTref_360048800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1454694 1457921 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360048800.1"; gene_id "LTnewLTref_360048800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1459302 1459886 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360048900.1"; gene_id "LTnewLTref_360048900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1459302 1459886 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360048900.1"; gene_id "LTnewLTref_360048900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1467682 1469040 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049000.1"; gene_id "LTnewLTref_360049000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1467682 1469040 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049000.1"; gene_id "LTnewLTref_360049000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1470060 1471943 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049100.1"; gene_id "LTnewLTref_360049100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1470060 1471943 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049100.1"; gene_id "LTnewLTref_360049100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1473037 1473582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049200.1"; gene_id "LTnewLTref_360049200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1473037 1473582 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049200.1"; gene_id "LTnewLTref_360049200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1474419 1474925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049300.1"; gene_id "LTnewLTref_360049300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1474419 1474925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049300.1"; gene_id "LTnewLTref_360049300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1475645 1475905 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049400.1"; gene_id "LTnewLTref_360049400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1475645 1475905 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049400.1"; gene_id "LTnewLTref_360049400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1476610 1477254 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049500.1"; gene_id "LTnewLTref_360049500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1476610 1477254 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049500.1"; gene_id "LTnewLTref_360049500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1478212 1478523 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049600.1"; gene_id "LTnewLTref_360049600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1478212 1478523 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049600.1"; gene_id "LTnewLTref_360049600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1480273 1481223 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049700.1"; gene_id "LTnewLTref_360049700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1480273 1481223 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049700.1"; gene_id "LTnewLTref_360049700"; CM024322.1 . transcript 1483593 1486488 . + . transcript_id "LTnewLTref_360049800.1"; gene_id "LTnewLTref_360049800:pseudogene" CM024322.1 . exon 1483593 1486488 . + . transcript_id "LTnewLTref_360049800.1"; gene_id "LTnewLTref_360049800:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1487546 1488679 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360049900.1"; gene_id "LTnewLTref_360049900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1487546 1488679 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360049900.1"; gene_id "LTnewLTref_360049900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1493003 1494136 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050000.1"; gene_id "LTnewLTref_360050000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1493003 1494136 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050000.1"; gene_id "LTnewLTref_360050000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1496506 1496901 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050100.1"; gene_id "LTnewLTref_360050100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1496506 1496901 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050100.1"; gene_id "LTnewLTref_360050100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1498547 1499485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050200.1"; gene_id "LTnewLTref_360050200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1498547 1499485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050200.1"; gene_id "LTnewLTref_360050200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1502377 1502580 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050300.1"; gene_id "LTnewLTref_360050300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1502377 1502580 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050300.1"; gene_id "LTnewLTref_360050300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1503360 1505246 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050400.1"; gene_id "LTnewLTref_360050400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1503360 1505246 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050400.1"; gene_id "LTnewLTref_360050400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1507688 1508365 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050500.1"; gene_id "LTnewLTref_360050500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1507688 1508365 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050500.1"; gene_id "LTnewLTref_360050500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1511473 1513482 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050600.1"; gene_id "LTnewLTref_360050600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1511473 1513482 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050600.1"; gene_id "LTnewLTref_360050600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1514735 1517260 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050700.1"; gene_id "LTnewLTref_360050700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1514735 1517260 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050700.1"; gene_id "LTnewLTref_360050700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1517896 1518966 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050800.1"; gene_id "LTnewLTref_360050800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1517896 1518966 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050800.1"; gene_id "LTnewLTref_360050800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1520430 1521614 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360050900.1"; gene_id "LTnewLTref_360050900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1520430 1521614 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360050900.1"; gene_id "LTnewLTref_360050900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1522519 1523346 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051000.1"; gene_id "LTnewLTref_360051000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1522519 1523346 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051000.1"; gene_id "LTnewLTref_360051000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1524287 1525600 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051100.1"; gene_id "LTnewLTref_360051100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1524287 1525600 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051100.1"; gene_id "LTnewLTref_360051100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1528386 1528787 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051200.1"; gene_id "LTnewLTref_360051200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1528386 1528787 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051200.1"; gene_id "LTnewLTref_360051200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1529737 1534092 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051300.1"; gene_id "LTnewLTref_360051300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1529737 1534092 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051300.1"; gene_id "LTnewLTref_360051300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1535277 1538561 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051400.1"; gene_id "LTnewLTref_360051400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1535277 1538561 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051400.1"; gene_id "LTnewLTref_360051400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1541607 1543019 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051500.1"; gene_id "LTnewLTref_360051500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1541607 1543019 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051500.1"; gene_id "LTnewLTref_360051500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1544525 1547554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051600.1"; gene_id "LTnewLTref_360051600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1544525 1547554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051600.1"; gene_id "LTnewLTref_360051600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1548815 1552891 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051700.1"; gene_id "LTnewLTref_360051700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1548815 1552891 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051700.1"; gene_id "LTnewLTref_360051700"; CM024322.1 Liftoff transcript 1552940 1553290 . + . transcript_id "LTnewLTref_360051800.1"; gene_id "LTnewLTref_360051800" CM024322.1 Liftoff CDS 1552940 1553290 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051800.1"; gene_id "LTnewLTref_360051800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1553371 1553610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360051900.1"; gene_id "LTnewLTref_360051900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1553371 1553610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360051900.1"; gene_id "LTnewLTref_360051900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1554924 1555307 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052000.1"; gene_id "LTnewLTref_360052000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1554924 1555307 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052000.1"; gene_id "LTnewLTref_360052000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1556993 1558084 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052100.1"; gene_id "LTnewLTref_360052100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1556993 1558084 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052100.1"; gene_id "LTnewLTref_360052100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1560511 1561173 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052200.1"; gene_id "LTnewLTref_360052200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1560511 1561173 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052200.1"; gene_id "LTnewLTref_360052200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1562843 1565062 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052300.1"; gene_id "LTnewLTref_360052300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1562843 1565062 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052300.1"; gene_id "LTnewLTref_360052300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1566351 1566935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052400.1"; gene_id "LTnewLTref_360052400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1566351 1566935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052400.1"; gene_id "LTnewLTref_360052400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1568386 1569966 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052500.1"; gene_id "LTnewLTref_360052500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1568386 1569966 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052500.1"; gene_id "LTnewLTref_360052500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1570880 1571710 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052600.1"; gene_id "LTnewLTref_360052600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1570880 1571710 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052600.1"; gene_id "LTnewLTref_360052600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1573145 1577812 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052700.1"; gene_id "LTnewLTref_360052700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1573145 1577812 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052700.1"; gene_id "LTnewLTref_360052700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1578953 1580245 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052800.1"; gene_id "LTnewLTref_360052800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1578953 1580245 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052800.1"; gene_id "LTnewLTref_360052800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1581481 1582740 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360052900.1"; gene_id "LTnewLTref_360052900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1581481 1582740 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360052900.1"; gene_id "LTnewLTref_360052900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1583482 1585554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053000.1"; gene_id "LTnewLTref_360053000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1583482 1585554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053000.1"; gene_id "LTnewLTref_360053000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1587645 1588688 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053100.1"; gene_id "LTnewLTref_360053100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1587645 1588688 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053100.1"; gene_id "LTnewLTref_360053100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1591825 1593426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053200.1"; gene_id "LTnewLTref_360053200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1591825 1593426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053200.1"; gene_id "LTnewLTref_360053200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1594690 1595988 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053300.1"; gene_id "LTnewLTref_360053300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1594690 1595988 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053300.1"; gene_id "LTnewLTref_360053300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1597870 1602282 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053400.1"; gene_id "LTnewLTref_360053400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1597870 1602282 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053400.1"; gene_id "LTnewLTref_360053400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1603566 1606628 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053500.1"; gene_id "LTnewLTref_360053500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1603566 1606628 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053500.1"; gene_id "LTnewLTref_360053500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1607188 1607751 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053600.1"; gene_id "LTnewLTref_360053600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1607188 1607751 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053600.1"; gene_id "LTnewLTref_360053600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1608507 1609220 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053700.1"; gene_id "LTnewLTref_360053700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1608507 1609220 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053700.1"; gene_id "LTnewLTref_360053700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1612174 1612773 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053800.1"; gene_id "LTnewLTref_360053800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1612174 1612773 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053800.1"; gene_id "LTnewLTref_360053800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1616465 1617034 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360053900.1"; gene_id "LTnewLTref_360053900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1616465 1617034 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360053900.1"; gene_id "LTnewLTref_360053900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1617827 1619791 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054000.1"; gene_id "LTnewLTref_360054000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1617827 1619791 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054000.1"; gene_id "LTnewLTref_360054000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1620934 1621893 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054100.1"; gene_id "LTnewLTref_360054100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1620934 1621893 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054100.1"; gene_id "LTnewLTref_360054100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1622700 1623722 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054200.1"; gene_id "LTnewLTref_360054200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1622700 1623722 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054200.1"; gene_id "LTnewLTref_360054200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1626107 1627507 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054300.1"; gene_id "LTnewLTref_360054300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1626107 1627507 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054300.1"; gene_id "LTnewLTref_360054300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1628538 1629566 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054400.1"; gene_id "LTnewLTref_360054400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1628538 1629566 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054400.1"; gene_id "LTnewLTref_360054400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1631270 1633699 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054500.1"; gene_id "LTnewLTref_360054500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1631270 1633699 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054500.1"; gene_id "LTnewLTref_360054500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1635992 1638938 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_360054600.1"; gene_id "LTnewLTref_360054600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1635992 1636493 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054600.1"; gene_id "LTnewLTref_360054600"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1636540 1638938 0.56 + 2 transcript_id "LTnewLTref_360054600.1"; gene_id "LTnewLTref_360054600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1640145 1641980 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360054700.1"; gene_id "LTnewLTref_360054700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1640145 1641980 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360054700.1"; gene_id "LTnewLTref_360054700"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 1642237 1642311 . - . transcript_id "LTnewLTref_360054800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360054800" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 1642237 1642311 . - . transcript_id "LTnewLTref_360054800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360054800"; CM024322.1 . transcript 1643077 1646314 . + . transcript_id "LTnewLTref_360054900.1"; gene_id "LTnewLTref_360054900:pseudogene" CM024322.1 . exon 1643077 1643385 . + . transcript_id "LTnewLTref_360054900.1"; gene_id "LTnewLTref_360054900:pseudogene"; CM024322.1 . exon 1643387 1646314 . + . transcript_id "LTnewLTref_360054900.1"; gene_id "LTnewLTref_360054900:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1647132 1649243 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055000.1"; gene_id "LTnewLTref_360055000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1647132 1649243 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055000.1"; gene_id "LTnewLTref_360055000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1653726 1656149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055100.1"; gene_id "LTnewLTref_360055100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1653726 1656149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055100.1"; gene_id "LTnewLTref_360055100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1671352 1672647 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055200.1"; gene_id "LTnewLTref_360055200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1671352 1672647 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055200.1"; gene_id "LTnewLTref_360055200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1674092 1679152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055300.1"; gene_id "LTnewLTref_360055300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1674092 1679152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055300.1"; gene_id "LTnewLTref_360055300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1680871 1683345 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055400.1"; gene_id "LTnewLTref_360055400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1680871 1683345 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055400.1"; gene_id "LTnewLTref_360055400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1684683 1688378 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055500.1"; gene_id "LTnewLTref_360055500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1684683 1688378 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055500.1"; gene_id "LTnewLTref_360055500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1691901 1694150 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055600.1"; gene_id "LTnewLTref_360055600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1691901 1694150 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055600.1"; gene_id "LTnewLTref_360055600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1694880 1696508 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055700.1"; gene_id "LTnewLTref_360055700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1694880 1696508 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055700.1"; gene_id "LTnewLTref_360055700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1698099 1704680 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055800.1"; gene_id "LTnewLTref_360055800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1698099 1704680 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055800.1"; gene_id "LTnewLTref_360055800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1708082 1712905 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360055900.1"; gene_id "LTnewLTref_360055900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1708082 1712905 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360055900.1"; gene_id "LTnewLTref_360055900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1715128 1716783 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056000.1"; gene_id "LTnewLTref_360056000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1715128 1716783 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056000.1"; gene_id "LTnewLTref_360056000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1718242 1720911 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056100.1"; gene_id "LTnewLTref_360056100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1718242 1720911 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056100.1"; gene_id "LTnewLTref_360056100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1723274 1724503 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056200.1"; gene_id "LTnewLTref_360056200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1723274 1724503 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056200.1"; gene_id "LTnewLTref_360056200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1729198 1736859 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056300.1"; gene_id "LTnewLTref_360056300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1729198 1736859 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056300.1"; gene_id "LTnewLTref_360056300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1738554 1740014 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056400.1"; gene_id "LTnewLTref_360056400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1738554 1740014 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056400.1"; gene_id "LTnewLTref_360056400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1740950 1743547 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056500.1"; gene_id "LTnewLTref_360056500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1740950 1743547 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056500.1"; gene_id "LTnewLTref_360056500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1746522 1749419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056600.1"; gene_id "LTnewLTref_360056600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1746522 1749419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056600.1"; gene_id "LTnewLTref_360056600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1750588 1751172 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056700.1"; gene_id "LTnewLTref_360056700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1750588 1751172 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056700.1"; gene_id "LTnewLTref_360056700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1751881 1752270 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056800.1"; gene_id "LTnewLTref_360056800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1751881 1752270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056800.1"; gene_id "LTnewLTref_360056800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1753630 1754739 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360056900.1"; gene_id "LTnewLTref_360056900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1753630 1754739 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360056900.1"; gene_id "LTnewLTref_360056900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1755846 1756694 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057000.1"; gene_id "LTnewLTref_360057000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1755846 1756694 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057000.1"; gene_id "LTnewLTref_360057000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1757817 1759847 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057100.1"; gene_id "LTnewLTref_360057100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1757817 1759847 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057100.1"; gene_id "LTnewLTref_360057100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1761197 1761679 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057200.1"; gene_id "LTnewLTref_360057200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1761197 1761679 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057200.1"; gene_id "LTnewLTref_360057200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1763205 1764032 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057300.1"; gene_id "LTnewLTref_360057300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1763205 1764032 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057300.1"; gene_id "LTnewLTref_360057300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1765846 1768215 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057400.1"; gene_id "LTnewLTref_360057400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1765846 1768215 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057400.1"; gene_id "LTnewLTref_360057400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1769356 1770900 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057500.1"; gene_id "LTnewLTref_360057500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1769356 1770900 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057500.1"; gene_id "LTnewLTref_360057500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1771926 1772729 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057600.1"; gene_id "LTnewLTref_360057600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1771926 1772729 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057600.1"; gene_id "LTnewLTref_360057600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1773685 1774281 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057700.1"; gene_id "LTnewLTref_360057700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1773685 1774281 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057700.1"; gene_id "LTnewLTref_360057700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1775857 1779021 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057800.1"; gene_id "LTnewLTref_360057800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1775857 1779021 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057800.1"; gene_id "LTnewLTref_360057800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1780153 1781754 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360057900.1"; gene_id "LTnewLTref_360057900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1780153 1781754 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360057900.1"; gene_id "LTnewLTref_360057900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1784361 1786364 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_360058000.1"; gene_id "LTnewLTref_360058000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1784361 1786364 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058000.1"; gene_id "LTnewLTref_360058000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1791501 1794926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058100.1"; gene_id "LTnewLTref_360058100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1791501 1794926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058100.1"; gene_id "LTnewLTref_360058100"; CM024322.1 . transcript 1799022 1799424 . + . transcript_id "LTnewLTref_360058200.1"; gene_id "LTnewLTref_360058200:pseudogene" CM024322.1 . exon 1799022 1799135 . + . transcript_id "LTnewLTref_360058200.1"; gene_id "LTnewLTref_360058200:pseudogene"; CM024322.1 . exon 1799137 1799424 . + . transcript_id "LTnewLTref_360058200.1"; gene_id "LTnewLTref_360058200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1800465 1801472 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058300.1"; gene_id "LTnewLTref_360058300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1800465 1801472 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058300.1"; gene_id "LTnewLTref_360058300"; CM024322.1 Liftoff transcript 1801872 1802279 . + . transcript_id "LTnewLTref_360058400.1"; gene_id "LTnewLTref_360058400" CM024322.1 Liftoff CDS 1801872 1802279 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058400.1"; gene_id "LTnewLTref_360058400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1804204 1805958 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058500.1"; gene_id "LTnewLTref_360058500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1804204 1805958 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058500.1"; gene_id "LTnewLTref_360058500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1809783 1810751 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058600.1"; gene_id "LTnewLTref_360058600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1809783 1810751 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058600.1"; gene_id "LTnewLTref_360058600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1811662 1813020 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058700.1"; gene_id "LTnewLTref_360058700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1811662 1813020 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058700.1"; gene_id "LTnewLTref_360058700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1814947 1817397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058800.1"; gene_id "LTnewLTref_360058800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1814947 1817397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058800.1"; gene_id "LTnewLTref_360058800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1818479 1818958 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360058900.1"; gene_id "LTnewLTref_360058900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1818479 1818958 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360058900.1"; gene_id "LTnewLTref_360058900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1819752 1821170 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059000.1"; gene_id "LTnewLTref_360059000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1819752 1821170 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059000.1"; gene_id "LTnewLTref_360059000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1821888 1825610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059100.1"; gene_id "LTnewLTref_360059100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1821888 1825610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059100.1"; gene_id "LTnewLTref_360059100"; CM024322.1 . transcript 1828567 1829271 . + . transcript_id "LTnewLTref_360059200.1"; gene_id "LTnewLTref_360059200:pseudogene" CM024322.1 . exon 1828567 1829271 . + . transcript_id "LTnewLTref_360059200.1"; gene_id "LTnewLTref_360059200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1831869 1833626 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059300.1"; gene_id "LTnewLTref_360059300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1831869 1833626 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059300.1"; gene_id "LTnewLTref_360059300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1834980 1835663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059400.1"; gene_id "LTnewLTref_360059400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1834980 1835663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059400.1"; gene_id "LTnewLTref_360059400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1836889 1839684 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059500.1"; gene_id "LTnewLTref_360059500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1836889 1839684 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059500.1"; gene_id "LTnewLTref_360059500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1840851 1841237 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059600.1"; gene_id "LTnewLTref_360059600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1840851 1841237 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059600.1"; gene_id "LTnewLTref_360059600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1842049 1842288 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059700.1"; gene_id "LTnewLTref_360059700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1842049 1842288 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059700.1"; gene_id "LTnewLTref_360059700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1845956 1851394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059800.1"; gene_id "LTnewLTref_360059800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1845956 1851394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059800.1"; gene_id "LTnewLTref_360059800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1853172 1856147 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360059900.1"; gene_id "LTnewLTref_360059900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1853172 1856147 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360059900.1"; gene_id "LTnewLTref_360059900"; CM024322.1 Liftoff transcript 1856736 1856954 . + . transcript_id "LTnewLTref_360060000.1"; gene_id "LTnewLTref_360060000" CM024322.1 Liftoff CDS 1856736 1856954 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060000.1"; gene_id "LTnewLTref_360060000"; CM024322.1 Liftoff transcript 1857582 1859924 . + . transcript_id "LTnewLTref_360060100.1"; gene_id "LTnewLTref_360060100" CM024322.1 Liftoff CDS 1857582 1859924 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060100.1"; gene_id "LTnewLTref_360060100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1860801 1861292 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060200.1"; gene_id "LTnewLTref_360060200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1860801 1861292 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060200.1"; gene_id "LTnewLTref_360060200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1862182 1866618 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060300.1"; gene_id "LTnewLTref_360060300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1862182 1866618 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060300.1"; gene_id "LTnewLTref_360060300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1867852 1872285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060400.1"; gene_id "LTnewLTref_360060400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1867852 1872285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060400.1"; gene_id "LTnewLTref_360060400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1873555 1877715 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060500.1"; gene_id "LTnewLTref_360060500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1873555 1877715 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060500.1"; gene_id "LTnewLTref_360060500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1878492 1878962 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060600.1"; gene_id "LTnewLTref_360060600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1878492 1878962 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060600.1"; gene_id "LTnewLTref_360060600"; CM024322.1 . transcript 1879540 1881487 . + . transcript_id "LTnewLTref_360060700.1"; gene_id "LTnewLTref_360060700:pseudogene" CM024322.1 . exon 1879540 1881487 . + . transcript_id "LTnewLTref_360060700.1"; gene_id "LTnewLTref_360060700:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1882395 1884047 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060800.1"; gene_id "LTnewLTref_360060800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1882395 1884047 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060800.1"; gene_id "LTnewLTref_360060800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1884938 1885891 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360060900.1"; gene_id "LTnewLTref_360060900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1884938 1885891 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360060900.1"; gene_id "LTnewLTref_360060900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1888163 1890943 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061000.1"; gene_id "LTnewLTref_360061000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1888163 1890943 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061000.1"; gene_id "LTnewLTref_360061000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1891842 1893377 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061100.1"; gene_id "LTnewLTref_360061100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1891842 1893377 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061100.1"; gene_id "LTnewLTref_360061100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1894379 1895215 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061200.1"; gene_id "LTnewLTref_360061200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1894379 1895215 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061200.1"; gene_id "LTnewLTref_360061200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1895985 1897514 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061300.1"; gene_id "LTnewLTref_360061300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1895985 1897514 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061300.1"; gene_id "LTnewLTref_360061300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1898203 1899621 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061400.1"; gene_id "LTnewLTref_360061400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1898203 1899621 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061400.1"; gene_id "LTnewLTref_360061400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1902382 1906008 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061500.1"; gene_id "LTnewLTref_360061500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1902382 1906008 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061500.1"; gene_id "LTnewLTref_360061500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1908831 1910663 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061600.1"; gene_id "LTnewLTref_360061600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1908831 1910663 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061600.1"; gene_id "LTnewLTref_360061600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1913989 1914696 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061700.1"; gene_id "LTnewLTref_360061700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1913989 1914696 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061700.1"; gene_id "LTnewLTref_360061700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1916052 1916771 1 + . transcript_id "LTnewLTref_360061800.1"; gene_id "LTnewLTref_360061800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1916052 1916771 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_360061800.1"; gene_id "LTnewLTref_360061800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1918210 1919151 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360061900.1"; gene_id "LTnewLTref_360061900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1918210 1919151 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360061900.1"; gene_id "LTnewLTref_360061900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1919773 1920438 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062000.1"; gene_id "LTnewLTref_360062000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1919773 1920438 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062000.1"; gene_id "LTnewLTref_360062000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1920877 1927242 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062100.1"; gene_id "LTnewLTref_360062100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1920877 1927242 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062100.1"; gene_id "LTnewLTref_360062100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1928948 1930030 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062200.1"; gene_id "LTnewLTref_360062200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1928948 1930030 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062200.1"; gene_id "LTnewLTref_360062200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1931392 1931957 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_360062300.1"; gene_id "LTnewLTref_360062300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1931392 1931532 0.4 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062300.1"; gene_id "LTnewLTref_360062300"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1931676 1931957 0.7 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062300.1"; gene_id "LTnewLTref_360062300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1935047 1937137 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062400.1"; gene_id "LTnewLTref_360062400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1935047 1937137 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062400.1"; gene_id "LTnewLTref_360062400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1938998 1940125 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062500.1"; gene_id "LTnewLTref_360062500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1938998 1940125 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062500.1"; gene_id "LTnewLTref_360062500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1942268 1943095 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062600.1"; gene_id "LTnewLTref_360062600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1942268 1943095 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062600.1"; gene_id "LTnewLTref_360062600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1943710 1945857 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062700.1"; gene_id "LTnewLTref_360062700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1943710 1945857 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062700.1"; gene_id "LTnewLTref_360062700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1946980 1949910 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360062800.1"; gene_id "LTnewLTref_360062800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1946980 1949910 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360062800.1"; gene_id "LTnewLTref_360062800"; CM024322.1 . transcript 1951847 1952284 . - . transcript_id "LTnewLTref_360062900.1"; gene_id "LTnewLTref_360062900:pseudogene" CM024322.1 . exon 1951847 1952284 . - . transcript_id "LTnewLTref_360062900.1"; gene_id "LTnewLTref_360062900:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1953341 1954381 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063000.1"; gene_id "LTnewLTref_360063000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1953341 1954381 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063000.1"; gene_id "LTnewLTref_360063000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1958826 1959071 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063100.1"; gene_id "LTnewLTref_360063100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1958826 1959071 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063100.1"; gene_id "LTnewLTref_360063100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1963187 1964182 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063200.1"; gene_id "LTnewLTref_360063200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1963187 1964182 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063200.1"; gene_id "LTnewLTref_360063200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1965786 1967474 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063300.1"; gene_id "LTnewLTref_360063300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1965786 1967474 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063300.1"; gene_id "LTnewLTref_360063300"; CM024322.1 . transcript 1969044 1969290 . - . transcript_id "LTnewLTref_360063400.1"; gene_id "LTnewLTref_360063400:pseudogene" CM024322.1 . exon 1969044 1969290 . - . transcript_id "LTnewLTref_360063400.1"; gene_id "LTnewLTref_360063400:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1969992 1971050 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063500.1"; gene_id "LTnewLTref_360063500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1969992 1971050 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063500.1"; gene_id "LTnewLTref_360063500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1973091 1973831 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063600.1"; gene_id "LTnewLTref_360063600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1973091 1973831 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063600.1"; gene_id "LTnewLTref_360063600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1974824 1977361 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063700.1"; gene_id "LTnewLTref_360063700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1974824 1977361 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063700.1"; gene_id "LTnewLTref_360063700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1978303 1979469 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063800.1"; gene_id "LTnewLTref_360063800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1978303 1979469 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063800.1"; gene_id "LTnewLTref_360063800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1981251 1982546 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360063900.1"; gene_id "LTnewLTref_360063900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1981251 1982546 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360063900.1"; gene_id "LTnewLTref_360063900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1984695 1985498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064000.1"; gene_id "LTnewLTref_360064000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1984695 1985498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064000.1"; gene_id "LTnewLTref_360064000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1986843 1988165 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064100.1"; gene_id "LTnewLTref_360064100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1986843 1988165 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064100.1"; gene_id "LTnewLTref_360064100"; CM024322.1 . transcript 1989086 1990296 . - . transcript_id "LTnewLTref_360064200.1"; gene_id "LTnewLTref_360064200:pseudogene" CM024322.1 . exon 1989086 1990296 . - . transcript_id "LTnewLTref_360064200.1"; gene_id "LTnewLTref_360064200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1991397 1993259 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064300.1"; gene_id "LTnewLTref_360064300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1991397 1993259 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064300.1"; gene_id "LTnewLTref_360064300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1994797 1995624 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064400.1"; gene_id "LTnewLTref_360064400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1994797 1995624 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064400.1"; gene_id "LTnewLTref_360064400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 1998648 2001518 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064500.1"; gene_id "LTnewLTref_360064500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 1998648 2001518 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064500.1"; gene_id "LTnewLTref_360064500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2002645 2003439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064600.1"; gene_id "LTnewLTref_360064600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2002645 2003439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064600.1"; gene_id "LTnewLTref_360064600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2004475 2005215 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064700.1"; gene_id "LTnewLTref_360064700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2004475 2005215 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064700.1"; gene_id "LTnewLTref_360064700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2005805 2006086 0.58 - . transcript_id "LTnewLTref_360064800.1"; gene_id "LTnewLTref_360064800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2005805 2006086 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064800.1"; gene_id "LTnewLTref_360064800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2007942 2008778 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360064900.1"; gene_id "LTnewLTref_360064900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2007942 2008778 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360064900.1"; gene_id "LTnewLTref_360064900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2012804 2014360 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065000.1"; gene_id "LTnewLTref_360065000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2012804 2014360 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065000.1"; gene_id "LTnewLTref_360065000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2016992 2018869 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065100.1"; gene_id "LTnewLTref_360065100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2016992 2018869 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065100.1"; gene_id "LTnewLTref_360065100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2019663 2021360 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065200.1"; gene_id "LTnewLTref_360065200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2019663 2021360 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065200.1"; gene_id "LTnewLTref_360065200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2022565 2023194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065300.1"; gene_id "LTnewLTref_360065300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2022565 2023194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065300.1"; gene_id "LTnewLTref_360065300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2024922 2026520 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065400.1"; gene_id "LTnewLTref_360065400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2024922 2026520 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065400.1"; gene_id "LTnewLTref_360065400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2027321 2031178 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065500.1"; gene_id "LTnewLTref_360065500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2027321 2031178 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065500.1"; gene_id "LTnewLTref_360065500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2031888 2034851 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065600.1"; gene_id "LTnewLTref_360065600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2031888 2034851 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065600.1"; gene_id "LTnewLTref_360065600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2035703 2040310 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_360065700.1"; gene_id "LTnewLTref_360065700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2035703 2040310 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065700.1"; gene_id "LTnewLTref_360065700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2041477 2042214 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065800.1"; gene_id "LTnewLTref_360065800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2041477 2042214 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065800.1"; gene_id "LTnewLTref_360065800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2043322 2044785 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360065900.1"; gene_id "LTnewLTref_360065900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2043322 2044785 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360065900.1"; gene_id "LTnewLTref_360065900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2046643 2050107 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066000.1"; gene_id "LTnewLTref_360066000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2046643 2050107 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066000.1"; gene_id "LTnewLTref_360066000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2051219 2053951 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066100.1"; gene_id "LTnewLTref_360066100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2051219 2053951 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066100.1"; gene_id "LTnewLTref_360066100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2054023 2058827 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_360066200.1"; gene_id "LTnewLTref_360066200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2054023 2057361 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066200.1"; gene_id "LTnewLTref_360066200"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2058129 2058827 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066200.1"; gene_id "LTnewLTref_360066200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2058890 2059342 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066300.1"; gene_id "LTnewLTref_360066300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2058890 2059342 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066300.1"; gene_id "LTnewLTref_360066300"; CM024322.1 . transcript 2061663 2063681 . - . transcript_id "LTnewLTref_360066400.1"; gene_id "LTnewLTref_360066400:pseudogene" CM024322.1 . exon 2061663 2063681 . - . transcript_id "LTnewLTref_360066400.1"; gene_id "LTnewLTref_360066400:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2067520 2070057 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066500.1"; gene_id "LTnewLTref_360066500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2067520 2070057 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066500.1"; gene_id "LTnewLTref_360066500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2071444 2073642 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066600.1"; gene_id "LTnewLTref_360066600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2071444 2073642 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066600.1"; gene_id "LTnewLTref_360066600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2074452 2077607 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066700.1"; gene_id "LTnewLTref_360066700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2074452 2077607 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066700.1"; gene_id "LTnewLTref_360066700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2079193 2079780 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066800.1"; gene_id "LTnewLTref_360066800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2079193 2079780 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066800.1"; gene_id "LTnewLTref_360066800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2081805 2082068 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360066900.1"; gene_id "LTnewLTref_360066900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2081805 2082068 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360066900.1"; gene_id "LTnewLTref_360066900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2082963 2087090 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067000.1"; gene_id "LTnewLTref_360067000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2082963 2087090 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067000.1"; gene_id "LTnewLTref_360067000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2088546 2089661 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067100.1"; gene_id "LTnewLTref_360067100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2088546 2089661 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067100.1"; gene_id "LTnewLTref_360067100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2090495 2092435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067200.1"; gene_id "LTnewLTref_360067200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2090495 2092435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067200.1"; gene_id "LTnewLTref_360067200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2094005 2097226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067300.1"; gene_id "LTnewLTref_360067300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2094005 2097226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067300.1"; gene_id "LTnewLTref_360067300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2099335 2101926 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067400.1"; gene_id "LTnewLTref_360067400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2099335 2101926 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067400.1"; gene_id "LTnewLTref_360067400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2103703 2107470 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067500.1"; gene_id "LTnewLTref_360067500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2103703 2107470 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067500.1"; gene_id "LTnewLTref_360067500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2108375 2109241 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067600.1"; gene_id "LTnewLTref_360067600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2108375 2109241 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067600.1"; gene_id "LTnewLTref_360067600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2109701 2111338 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_360067700.1"; gene_id "LTnewLTref_360067700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2109701 2111338 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067700.1"; gene_id "LTnewLTref_360067700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2115309 2116790 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067800.1"; gene_id "LTnewLTref_360067800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2115309 2116790 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067800.1"; gene_id "LTnewLTref_360067800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2119453 2121036 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360067900.1"; gene_id "LTnewLTref_360067900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2119453 2121036 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360067900.1"; gene_id "LTnewLTref_360067900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2122715 2123791 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068000.1"; gene_id "LTnewLTref_360068000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2122715 2123791 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068000.1"; gene_id "LTnewLTref_360068000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2124927 2126681 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068100.1"; gene_id "LTnewLTref_360068100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2124927 2126681 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068100.1"; gene_id "LTnewLTref_360068100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2127009 2128205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068200.1"; gene_id "LTnewLTref_360068200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2127009 2128205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068200.1"; gene_id "LTnewLTref_360068200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2128710 2129579 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068300.1"; gene_id "LTnewLTref_360068300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2128710 2129579 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068300.1"; gene_id "LTnewLTref_360068300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2130075 2131235 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068400.1"; gene_id "LTnewLTref_360068400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2130075 2131235 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068400.1"; gene_id "LTnewLTref_360068400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2132035 2133882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068500.1"; gene_id "LTnewLTref_360068500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2132035 2133882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068500.1"; gene_id "LTnewLTref_360068500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2134647 2135924 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068600.1"; gene_id "LTnewLTref_360068600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2134647 2135924 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068600.1"; gene_id "LTnewLTref_360068600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2136884 2138452 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068700.1"; gene_id "LTnewLTref_360068700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2136884 2138452 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068700.1"; gene_id "LTnewLTref_360068700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2139541 2142453 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068800.1"; gene_id "LTnewLTref_360068800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2139541 2142453 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068800.1"; gene_id "LTnewLTref_360068800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2148538 2150550 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360068900.1"; gene_id "LTnewLTref_360068900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2148538 2150550 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360068900.1"; gene_id "LTnewLTref_360068900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2161306 2162193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069000.1"; gene_id "LTnewLTref_360069000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2161306 2162193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069000.1"; gene_id "LTnewLTref_360069000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2163546 2164637 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069100.1"; gene_id "LTnewLTref_360069100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2163546 2164637 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069100.1"; gene_id "LTnewLTref_360069100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2165880 2167406 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069200.1"; gene_id "LTnewLTref_360069200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2165880 2167406 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069200.1"; gene_id "LTnewLTref_360069200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2171201 2172214 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069300.1"; gene_id "LTnewLTref_360069300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2171201 2172214 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069300.1"; gene_id "LTnewLTref_360069300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2173426 2175399 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069400.1"; gene_id "LTnewLTref_360069400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2173426 2175399 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069400.1"; gene_id "LTnewLTref_360069400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2175984 2177324 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069500.1"; gene_id "LTnewLTref_360069500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2175984 2177324 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069500.1"; gene_id "LTnewLTref_360069500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2178097 2182002 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069600.1"; gene_id "LTnewLTref_360069600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2178097 2182002 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069600.1"; gene_id "LTnewLTref_360069600"; CM024322.1 . transcript 2182760 2185363 . - . transcript_id "LTnewLTref_360069700.1"; gene_id "LTnewLTref_360069700:pseudogene" CM024322.1 . exon 2182760 2185363 . - . transcript_id "LTnewLTref_360069700.1"; gene_id "LTnewLTref_360069700:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2186260 2186967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069800.1"; gene_id "LTnewLTref_360069800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2186260 2186967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069800.1"; gene_id "LTnewLTref_360069800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2188199 2189317 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360069900.1"; gene_id "LTnewLTref_360069900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2188199 2189317 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360069900.1"; gene_id "LTnewLTref_360069900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2190662 2191486 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070000.1"; gene_id "LTnewLTref_360070000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2190662 2191486 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070000.1"; gene_id "LTnewLTref_360070000"; CM024322.1 . transcript 2192369 2192977 . - . transcript_id "LTnewLTref_360070100.1"; gene_id "LTnewLTref_360070100:pseudogene" CM024322.1 . exon 2192369 2192977 . - . transcript_id "LTnewLTref_360070100.1"; gene_id "LTnewLTref_360070100:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2193851 2194183 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070200.1"; gene_id "LTnewLTref_360070200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2193851 2194183 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070200.1"; gene_id "LTnewLTref_360070200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2194864 2196561 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070300.1"; gene_id "LTnewLTref_360070300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2194864 2196561 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070300.1"; gene_id "LTnewLTref_360070300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2197250 2198569 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070400.1"; gene_id "LTnewLTref_360070400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2197250 2198569 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070400.1"; gene_id "LTnewLTref_360070400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2201142 2204441 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070500.1"; gene_id "LTnewLTref_360070500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2201142 2204441 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070500.1"; gene_id "LTnewLTref_360070500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2205972 2206679 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070600.1"; gene_id "LTnewLTref_360070600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2205972 2206679 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070600.1"; gene_id "LTnewLTref_360070600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2207534 2209021 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070700.1"; gene_id "LTnewLTref_360070700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2207534 2209021 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070700.1"; gene_id "LTnewLTref_360070700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2209785 2210768 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070800.1"; gene_id "LTnewLTref_360070800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2209785 2210768 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070800.1"; gene_id "LTnewLTref_360070800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2211629 2213782 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360070900.1"; gene_id "LTnewLTref_360070900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2211629 2213782 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360070900.1"; gene_id "LTnewLTref_360070900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2215103 2217196 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071000.1"; gene_id "LTnewLTref_360071000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2215103 2217196 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071000.1"; gene_id "LTnewLTref_360071000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2217956 2218672 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071100.1"; gene_id "LTnewLTref_360071100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2217956 2218672 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071100.1"; gene_id "LTnewLTref_360071100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2219166 2220134 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071200.1"; gene_id "LTnewLTref_360071200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2219166 2220134 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071200.1"; gene_id "LTnewLTref_360071200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2221919 2224291 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071300.1"; gene_id "LTnewLTref_360071300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2221919 2224291 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071300.1"; gene_id "LTnewLTref_360071300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2226373 2227170 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071400.1"; gene_id "LTnewLTref_360071400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2226373 2227170 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071400.1"; gene_id "LTnewLTref_360071400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2228370 2228636 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071500.1"; gene_id "LTnewLTref_360071500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2228370 2228636 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071500.1"; gene_id "LTnewLTref_360071500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2229257 2231275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071600.1"; gene_id "LTnewLTref_360071600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2229257 2231275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071600.1"; gene_id "LTnewLTref_360071600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2231831 2234014 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071700.1"; gene_id "LTnewLTref_360071700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2231831 2234014 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071700.1"; gene_id "LTnewLTref_360071700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2234703 2236745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071800.1"; gene_id "LTnewLTref_360071800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2234703 2236745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071800.1"; gene_id "LTnewLTref_360071800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2237417 2242729 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360071900.1"; gene_id "LTnewLTref_360071900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2237417 2242729 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360071900.1"; gene_id "LTnewLTref_360071900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2243668 2244183 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072000.1"; gene_id "LTnewLTref_360072000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2243668 2244183 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072000.1"; gene_id "LTnewLTref_360072000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2246227 2247621 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072100.1"; gene_id "LTnewLTref_360072100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2246227 2247621 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072100.1"; gene_id "LTnewLTref_360072100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2248454 2249209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072200.1"; gene_id "LTnewLTref_360072200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2248454 2249209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072200.1"; gene_id "LTnewLTref_360072200"; CM024322.1 Liftoff transcript 2250012 2255612 . - . transcript_id "LTnewLTref_360072300.1"; gene_id "LTnewLTref_360072300" CM024322.1 Liftoff CDS 2250012 2255612 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072300.1"; gene_id "LTnewLTref_360072300"; CM024322.1 . transcript 2256433 2257980 . - . transcript_id "LTnewLTref_360072400.1"; gene_id "LTnewLTref_360072400:pseudogene" CM024322.1 . exon 2256433 2257980 . - . transcript_id "LTnewLTref_360072400.1"; gene_id "LTnewLTref_360072400:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2260780 2262282 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072500.1"; gene_id "LTnewLTref_360072500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2260780 2262282 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072500.1"; gene_id "LTnewLTref_360072500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2265126 2265821 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072600.1"; gene_id "LTnewLTref_360072600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2265126 2265821 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072600.1"; gene_id "LTnewLTref_360072600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2266957 2268000 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072700.1"; gene_id "LTnewLTref_360072700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2266957 2268000 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072700.1"; gene_id "LTnewLTref_360072700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2270915 2271289 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072800.1"; gene_id "LTnewLTref_360072800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2270915 2271289 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072800.1"; gene_id "LTnewLTref_360072800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2275642 2277162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360072900.1"; gene_id "LTnewLTref_360072900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2275642 2277162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360072900.1"; gene_id "LTnewLTref_360072900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2280862 2283021 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073000.1"; gene_id "LTnewLTref_360073000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2280862 2283021 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073000.1"; gene_id "LTnewLTref_360073000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2284658 2287045 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073100.1"; gene_id "LTnewLTref_360073100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2284658 2287045 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073100.1"; gene_id "LTnewLTref_360073100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2287871 2288965 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073200.1"; gene_id "LTnewLTref_360073200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2287871 2288965 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073200.1"; gene_id "LTnewLTref_360073200"; CM024322.1 Liftoff transcript 2289919 2296035 . - . transcript_id "LTnewLTref_360073300.1"; gene_id "LTnewLTref_360073300" CM024322.1 Liftoff CDS 2289919 2296035 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073300.1"; gene_id "LTnewLTref_360073300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2298104 2299357 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073400.1"; gene_id "LTnewLTref_360073400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2298104 2299357 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073400.1"; gene_id "LTnewLTref_360073400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2302752 2303876 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073500.1"; gene_id "LTnewLTref_360073500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2302752 2303876 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073500.1"; gene_id "LTnewLTref_360073500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2306347 2306832 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073600.1"; gene_id "LTnewLTref_360073600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2306347 2306832 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073600.1"; gene_id "LTnewLTref_360073600"; CM024322.1 Liftoff transcript 2307948 2308181 . - . transcript_id "LTnewLTref_360073700.1"; gene_id "LTnewLTref_360073700" CM024322.1 Liftoff CDS 2307948 2308181 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073700.1"; gene_id "LTnewLTref_360073700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2309307 2310185 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073800.1"; gene_id "LTnewLTref_360073800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2309307 2310185 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073800.1"; gene_id "LTnewLTref_360073800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2311592 2313466 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360073900.1"; gene_id "LTnewLTref_360073900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2311592 2313466 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360073900.1"; gene_id "LTnewLTref_360073900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2314017 2314220 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074000.1"; gene_id "LTnewLTref_360074000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2314017 2314220 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074000.1"; gene_id "LTnewLTref_360074000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2315966 2317135 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074100.1"; gene_id "LTnewLTref_360074100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2315966 2317135 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074100.1"; gene_id "LTnewLTref_360074100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2324993 2325943 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074200.1"; gene_id "LTnewLTref_360074200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2324993 2325943 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074200.1"; gene_id "LTnewLTref_360074200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2328068 2329939 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074300.1"; gene_id "LTnewLTref_360074300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2328068 2329939 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074300.1"; gene_id "LTnewLTref_360074300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2331433 2333289 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074400.1"; gene_id "LTnewLTref_360074400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2331433 2333289 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074400.1"; gene_id "LTnewLTref_360074400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2334265 2336238 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074500.1"; gene_id "LTnewLTref_360074500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2334265 2336238 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074500.1"; gene_id "LTnewLTref_360074500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2336791 2339793 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074600.1"; gene_id "LTnewLTref_360074600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2336791 2339793 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074600.1"; gene_id "LTnewLTref_360074600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2341203 2343215 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074700.1"; gene_id "LTnewLTref_360074700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2341203 2343215 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074700.1"; gene_id "LTnewLTref_360074700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2344311 2345117 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074800.1"; gene_id "LTnewLTref_360074800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2344311 2345117 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074800.1"; gene_id "LTnewLTref_360074800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2346225 2353235 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360074900.1"; gene_id "LTnewLTref_360074900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2346225 2353235 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360074900.1"; gene_id "LTnewLTref_360074900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2354363 2357293 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075000.1"; gene_id "LTnewLTref_360075000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2354363 2357293 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075000.1"; gene_id "LTnewLTref_360075000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2358438 2359433 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075100.1"; gene_id "LTnewLTref_360075100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2358438 2359433 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075100.1"; gene_id "LTnewLTref_360075100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2360910 2363207 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075200.1"; gene_id "LTnewLTref_360075200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2360910 2363207 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075200.1"; gene_id "LTnewLTref_360075200"; CM024322.1 Liftoff transcript 2364652 2365092 . - . transcript_id "LTnewLTref_360075300.1"; gene_id "LTnewLTref_360075300" CM024322.1 Liftoff CDS 2364652 2365092 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075300.1"; gene_id "LTnewLTref_360075300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2366151 2367833 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075400.1"; gene_id "LTnewLTref_360075400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2366151 2367833 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075400.1"; gene_id "LTnewLTref_360075400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2369676 2370917 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075500.1"; gene_id "LTnewLTref_360075500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2369676 2370917 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075500.1"; gene_id "LTnewLTref_360075500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2373703 2375301 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075600.1"; gene_id "LTnewLTref_360075600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2373703 2375301 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075600.1"; gene_id "LTnewLTref_360075600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2378644 2380317 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075700.1"; gene_id "LTnewLTref_360075700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2378644 2380317 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075700.1"; gene_id "LTnewLTref_360075700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2381975 2382472 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075800.1"; gene_id "LTnewLTref_360075800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2381975 2382472 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075800.1"; gene_id "LTnewLTref_360075800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2384749 2385102 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360075900.1"; gene_id "LTnewLTref_360075900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2384749 2385102 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360075900.1"; gene_id "LTnewLTref_360075900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2385827 2386795 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076000.1"; gene_id "LTnewLTref_360076000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2385827 2386795 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076000.1"; gene_id "LTnewLTref_360076000"; CM024322.1 Liftoff transcript 2387360 2389219 . - . transcript_id "LTnewLTref_360076100.1"; gene_id "LTnewLTref_360076100" CM024322.1 Liftoff CDS 2387360 2389219 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076100.1"; gene_id "LTnewLTref_360076100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2389912 2392209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076200.1"; gene_id "LTnewLTref_360076200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2389912 2392209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076200.1"; gene_id "LTnewLTref_360076200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2394453 2394980 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076300.1"; gene_id "LTnewLTref_360076300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2394453 2394980 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076300.1"; gene_id "LTnewLTref_360076300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2396178 2397266 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076400.1"; gene_id "LTnewLTref_360076400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2396178 2397266 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076400.1"; gene_id "LTnewLTref_360076400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2398499 2399719 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076500.1"; gene_id "LTnewLTref_360076500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2398499 2399719 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076500.1"; gene_id "LTnewLTref_360076500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2401720 2403177 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076600.1"; gene_id "LTnewLTref_360076600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2401720 2403177 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076600.1"; gene_id "LTnewLTref_360076600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2405487 2406303 0.86 - . transcript_id "LTnewLTref_360076700.1"; gene_id "LTnewLTref_360076700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2405487 2405927 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076700.1"; gene_id "LTnewLTref_360076700"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2405977 2406303 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076700.1"; gene_id "LTnewLTref_360076700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2407196 2407753 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360076800.1"; gene_id "LTnewLTref_360076800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2407196 2407753 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076800.1"; gene_id "LTnewLTref_360076800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2408598 2409986 0.8 - . transcript_id "LTnewLTref_360076900.1"; gene_id "LTnewLTref_360076900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2408598 2409986 0.8 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076900.1"; gene_id "LTnewLTref_360076900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2408598 2411858 0.82 - . transcript_id "LTnewLTref_360076900.2"; gene_id "LTnewLTref_360076900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2408598 2411858 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360076900.2"; gene_id "LTnewLTref_360076900"; CM024322.1 Liftoff transcript 2412563 2416282 . - . transcript_id "LTnewLTref_360077000.1"; gene_id "LTnewLTref_360077000" CM024322.1 Liftoff CDS 2412563 2416282 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077000.1"; gene_id "LTnewLTref_360077000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2417542 2421933 0.46 - . transcript_id "LTnewLTref_360077100.1"; gene_id "LTnewLTref_360077100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2417542 2417672 0.46 - 2 transcript_id "LTnewLTref_360077100.1"; gene_id "LTnewLTref_360077100"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2417757 2421933 0.46 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077100.1"; gene_id "LTnewLTref_360077100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2424356 2424892 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077200.1"; gene_id "LTnewLTref_360077200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2424356 2424892 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077200.1"; gene_id "LTnewLTref_360077200"; CM024322.1 . transcript 2425850 2428118 . - . transcript_id "LTnewLTref_360077300.1"; gene_id "LTnewLTref_360077300:pseudogene" CM024322.1 . exon 2425850 2428118 . - . transcript_id "LTnewLTref_360077300.1"; gene_id "LTnewLTref_360077300:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2432494 2433384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077400.1"; gene_id "LTnewLTref_360077400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2432494 2433384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077400.1"; gene_id "LTnewLTref_360077400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2435447 2436808 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077500.1"; gene_id "LTnewLTref_360077500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2435447 2436808 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077500.1"; gene_id "LTnewLTref_360077500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2437746 2438783 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077600.1"; gene_id "LTnewLTref_360077600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2437746 2438783 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077600.1"; gene_id "LTnewLTref_360077600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2445500 2447206 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077700.1"; gene_id "LTnewLTref_360077700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2445500 2447206 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077700.1"; gene_id "LTnewLTref_360077700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2449057 2450760 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077800.1"; gene_id "LTnewLTref_360077800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2449057 2450760 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077800.1"; gene_id "LTnewLTref_360077800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2452611 2454572 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360077900.1"; gene_id "LTnewLTref_360077900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2452611 2454572 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360077900.1"; gene_id "LTnewLTref_360077900"; CM024322.1 . transcript 2455635 2456769 . - . transcript_id "LTnewLTref_360078000.1"; gene_id "LTnewLTref_360078000:pseudogene" CM024322.1 . exon 2455635 2456769 . - . transcript_id "LTnewLTref_360078000.1"; gene_id "LTnewLTref_360078000:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2457518 2465359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078100.1"; gene_id "LTnewLTref_360078100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2457518 2465359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078100.1"; gene_id "LTnewLTref_360078100"; CM024322.1 Liftoff transcript 2467487 2467774 . - . transcript_id "LTnewLTref_360078200.1"; gene_id "LTnewLTref_360078200" CM024322.1 Liftoff CDS 2467487 2467774 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078200.1"; gene_id "LTnewLTref_360078200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2475792 2476628 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078300.1"; gene_id "LTnewLTref_360078300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2475792 2476628 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078300.1"; gene_id "LTnewLTref_360078300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2478225 2490719 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078400.1"; gene_id "LTnewLTref_360078400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2478225 2490719 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078400.1"; gene_id "LTnewLTref_360078400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2492542 2492772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078500.1"; gene_id "LTnewLTref_360078500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2492542 2492772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078500.1"; gene_id "LTnewLTref_360078500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2493337 2493909 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078600.1"; gene_id "LTnewLTref_360078600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2493337 2493909 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078600.1"; gene_id "LTnewLTref_360078600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2495073 2495378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078700.1"; gene_id "LTnewLTref_360078700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2495073 2495378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078700.1"; gene_id "LTnewLTref_360078700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2497006 2498538 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360078800.1"; gene_id "LTnewLTref_360078800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2497006 2498538 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360078800.1"; gene_id "LTnewLTref_360078800"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 2499116 2499187 . + . transcript_id "LTnewLTref_360078900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360078900" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 2499116 2499187 . + . transcript_id "LTnewLTref_360078900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360078900"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 2499976 2500057 . - . transcript_id "LTnewLTref_360079000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360079000" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 2499976 2500057 . - . transcript_id "LTnewLTref_360079000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360079000"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 2500120 2500191 . - . transcript_id "LTnewLTref_360079100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360079100" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 2500120 2500191 . - . transcript_id "LTnewLTref_360079100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360079100"; CM024322.1 Aragorn_1.2.36 transcript 2500265 2500336 . + . transcript_id "LTnewLTref_360079200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360079200" CM024322.1 Aragorn_1.2.36 exon 2500265 2500336 . + . transcript_id "LTnewLTref_360079200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_360079200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2500629 2501423 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360079300.1"; gene_id "LTnewLTref_360079300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2500629 2501423 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079300.1"; gene_id "LTnewLTref_360079300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2502604 2503033 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_360079400.1"; gene_id "LTnewLTref_360079400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2502604 2502903 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079400.1"; gene_id "LTnewLTref_360079400"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2502962 2503033 0.43 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079400.1"; gene_id "LTnewLTref_360079400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2504684 2506357 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360079500.1"; gene_id "LTnewLTref_360079500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2504684 2506357 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079500.1"; gene_id "LTnewLTref_360079500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2507245 2509470 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360079600.1"; gene_id "LTnewLTref_360079600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2507245 2509470 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079600.1"; gene_id "LTnewLTref_360079600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2510803 2511732 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360079700.1"; gene_id "LTnewLTref_360079700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2510803 2511732 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079700.1"; gene_id "LTnewLTref_360079700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2513145 2513927 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360079800.1"; gene_id "LTnewLTref_360079800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2513145 2513927 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079800.1"; gene_id "LTnewLTref_360079800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2514708 2515160 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360079900.1"; gene_id "LTnewLTref_360079900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2514708 2515160 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360079900.1"; gene_id "LTnewLTref_360079900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2516081 2517679 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080000.1"; gene_id "LTnewLTref_360080000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2516081 2517679 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080000.1"; gene_id "LTnewLTref_360080000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2518674 2519294 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080100.1"; gene_id "LTnewLTref_360080100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2518674 2519294 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080100.1"; gene_id "LTnewLTref_360080100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2520522 2523074 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080200.1"; gene_id "LTnewLTref_360080200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2520522 2523074 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080200.1"; gene_id "LTnewLTref_360080200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2524313 2525239 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080300.1"; gene_id "LTnewLTref_360080300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2524313 2525239 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080300.1"; gene_id "LTnewLTref_360080300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2525727 2526320 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080400.1"; gene_id "LTnewLTref_360080400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2525727 2526320 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080400.1"; gene_id "LTnewLTref_360080400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2527749 2528696 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080500.1"; gene_id "LTnewLTref_360080500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2527749 2528696 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080500.1"; gene_id "LTnewLTref_360080500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2529539 2530789 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080600.1"; gene_id "LTnewLTref_360080600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2529539 2530789 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080600.1"; gene_id "LTnewLTref_360080600"; CM024322.1 . transcript 2532235 2533399 . - . transcript_id "LTnewLTref_360080700.1"; gene_id "LTnewLTref_360080700:pseudogene" CM024322.1 . exon 2532235 2532327 . - . transcript_id "LTnewLTref_360080700.1"; gene_id "LTnewLTref_360080700:pseudogene"; CM024322.1 . exon 2532329 2533399 . - . transcript_id "LTnewLTref_360080700.1"; gene_id "LTnewLTref_360080700:pseudogene"; CM024322.1 . transcript 2540549 2542000 . - . transcript_id "LTnewLTref_360080800.1"; gene_id "LTnewLTref_360080800:pseudogene" CM024322.1 . exon 2540549 2542000 . - . transcript_id "LTnewLTref_360080800.1"; gene_id "LTnewLTref_360080800:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2542720 2543697 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360080900.1"; gene_id "LTnewLTref_360080900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2542720 2543697 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360080900.1"; gene_id "LTnewLTref_360080900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2545429 2545831 0.67 - . transcript_id "LTnewLTref_360081000.1"; gene_id "LTnewLTref_360081000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2545429 2545644 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081000.1"; gene_id "LTnewLTref_360081000"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2545757 2545831 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081000.1"; gene_id "LTnewLTref_360081000"; CM024322.1 . transcript 2547881 2550090 . - . transcript_id "LTnewLTref_360081100.1"; gene_id "LTnewLTref_360081100:pseudogene" CM024322.1 . exon 2547881 2550090 . - . transcript_id "LTnewLTref_360081100.1"; gene_id "LTnewLTref_360081100:pseudogene"; CM024322.1 . transcript 2551089 2552312 . - . transcript_id "LTnewLTref_360081200.1"; gene_id "LTnewLTref_360081200:pseudogene" CM024322.1 . exon 2551089 2552312 . - . transcript_id "LTnewLTref_360081200.1"; gene_id "LTnewLTref_360081200:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2553084 2555249 0.91 - . transcript_id "LTnewLTref_360081300.1"; gene_id "LTnewLTref_360081300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2553084 2555249 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081300.1"; gene_id "LTnewLTref_360081300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2557109 2557540 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360081400.1"; gene_id "LTnewLTref_360081400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2557109 2557540 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081400.1"; gene_id "LTnewLTref_360081400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2558437 2560209 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360081500.1"; gene_id "LTnewLTref_360081500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2558437 2560209 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081500.1"; gene_id "LTnewLTref_360081500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2561631 2562824 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360081600.1"; gene_id "LTnewLTref_360081600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2561631 2562824 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081600.1"; gene_id "LTnewLTref_360081600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2565032 2565754 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360081700.1"; gene_id "LTnewLTref_360081700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2565032 2565754 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081700.1"; gene_id "LTnewLTref_360081700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2567602 2568381 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360081800.1"; gene_id "LTnewLTref_360081800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2567602 2568381 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081800.1"; gene_id "LTnewLTref_360081800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2570689 2571663 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360081900.1"; gene_id "LTnewLTref_360081900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2570689 2571663 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360081900.1"; gene_id "LTnewLTref_360081900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2575083 2576171 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082000.1"; gene_id "LTnewLTref_360082000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2575083 2576171 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082000.1"; gene_id "LTnewLTref_360082000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2576995 2577576 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082100.1"; gene_id "LTnewLTref_360082100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2576995 2577576 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082100.1"; gene_id "LTnewLTref_360082100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2578825 2580771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082200.1"; gene_id "LTnewLTref_360082200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2578825 2580771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082200.1"; gene_id "LTnewLTref_360082200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2583228 2585483 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082300.1"; gene_id "LTnewLTref_360082300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2583228 2585483 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082300.1"; gene_id "LTnewLTref_360082300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2588652 2589761 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082400.1"; gene_id "LTnewLTref_360082400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2588652 2589761 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082400.1"; gene_id "LTnewLTref_360082400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2591630 2592856 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082500.1"; gene_id "LTnewLTref_360082500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2591630 2592856 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082500.1"; gene_id "LTnewLTref_360082500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2593775 2594338 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082600.1"; gene_id "LTnewLTref_360082600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2593775 2594338 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082600.1"; gene_id "LTnewLTref_360082600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2596081 2596674 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082700.1"; gene_id "LTnewLTref_360082700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2596081 2596674 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082700.1"; gene_id "LTnewLTref_360082700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2597867 2598148 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082800.1"; gene_id "LTnewLTref_360082800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2597867 2598148 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082800.1"; gene_id "LTnewLTref_360082800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2599927 2601588 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360082900.1"; gene_id "LTnewLTref_360082900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2599927 2601588 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360082900.1"; gene_id "LTnewLTref_360082900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2603045 2604247 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083000.1"; gene_id "LTnewLTref_360083000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2603045 2604247 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083000.1"; gene_id "LTnewLTref_360083000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2605709 2606149 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083100.1"; gene_id "LTnewLTref_360083100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2605709 2606149 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083100.1"; gene_id "LTnewLTref_360083100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2607372 2607860 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083200.1"; gene_id "LTnewLTref_360083200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2607372 2607860 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083200.1"; gene_id "LTnewLTref_360083200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2609195 2610313 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083300.1"; gene_id "LTnewLTref_360083300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2609195 2610313 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083300.1"; gene_id "LTnewLTref_360083300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2611608 2613029 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083400.1"; gene_id "LTnewLTref_360083400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2611608 2613029 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083400.1"; gene_id "LTnewLTref_360083400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2613911 2614168 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083500.1"; gene_id "LTnewLTref_360083500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2613911 2614168 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083500.1"; gene_id "LTnewLTref_360083500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2614825 2615880 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083600.1"; gene_id "LTnewLTref_360083600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2614825 2615880 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083600.1"; gene_id "LTnewLTref_360083600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2617748 2618665 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_360083700.1"; gene_id "LTnewLTref_360083700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2617748 2618467 0.57 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083700.1"; gene_id "LTnewLTref_360083700"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2618522 2618665 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083700.1"; gene_id "LTnewLTref_360083700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2619900 2623985 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083800.1"; gene_id "LTnewLTref_360083800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2619900 2623985 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083800.1"; gene_id "LTnewLTref_360083800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2624734 2625555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360083900.1"; gene_id "LTnewLTref_360083900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2624734 2625555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360083900.1"; gene_id "LTnewLTref_360083900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2628291 2630384 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084000.1"; gene_id "LTnewLTref_360084000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2628291 2630384 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084000.1"; gene_id "LTnewLTref_360084000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2631642 2632418 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084100.1"; gene_id "LTnewLTref_360084100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2631642 2632418 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084100.1"; gene_id "LTnewLTref_360084100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2634163 2636403 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084200.1"; gene_id "LTnewLTref_360084200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2634163 2636403 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084200.1"; gene_id "LTnewLTref_360084200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2645914 2646792 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084300.1"; gene_id "LTnewLTref_360084300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2645914 2646792 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084300.1"; gene_id "LTnewLTref_360084300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2650399 2650966 0.56 - . transcript_id "LTnewLTref_360084400.1"; gene_id "LTnewLTref_360084400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2650399 2650476 0.58 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084400.1"; gene_id "LTnewLTref_360084400"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2650658 2650966 0.56 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084400.1"; gene_id "LTnewLTref_360084400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2651232 2651550 0.7 - . transcript_id "LTnewLTref_360084500.1"; gene_id "LTnewLTref_360084500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2651232 2651286 0.77 - 1 transcript_id "LTnewLTref_360084500.1"; gene_id "LTnewLTref_360084500"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2651399 2651550 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084500.1"; gene_id "LTnewLTref_360084500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2652287 2653882 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084600.1"; gene_id "LTnewLTref_360084600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2652287 2653882 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084600.1"; gene_id "LTnewLTref_360084600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2654876 2657089 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084700.1"; gene_id "LTnewLTref_360084700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2654876 2657089 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084700.1"; gene_id "LTnewLTref_360084700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2657765 2658244 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084800.1"; gene_id "LTnewLTref_360084800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2657765 2658244 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084800.1"; gene_id "LTnewLTref_360084800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2658988 2660061 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360084900.1"; gene_id "LTnewLTref_360084900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2658988 2660061 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360084900.1"; gene_id "LTnewLTref_360084900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2661447 2662877 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085000.1"; gene_id "LTnewLTref_360085000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2661447 2662877 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085000.1"; gene_id "LTnewLTref_360085000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2663994 2665103 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085100.1"; gene_id "LTnewLTref_360085100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2663994 2665103 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085100.1"; gene_id "LTnewLTref_360085100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2666113 2666346 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085200.1"; gene_id "LTnewLTref_360085200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2666113 2666346 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085200.1"; gene_id "LTnewLTref_360085200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2666932 2669649 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085300.1"; gene_id "LTnewLTref_360085300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2666932 2669649 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085300.1"; gene_id "LTnewLTref_360085300"; CM024322.1 Liftoff transcript 2670292 2672196 . - . transcript_id "LTnewLTref_360085400.1"; gene_id "LTnewLTref_360085400" CM024322.1 Liftoff CDS 2670292 2672196 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085400.1"; gene_id "LTnewLTref_360085400"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2672619 2673233 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085500.1"; gene_id "LTnewLTref_360085500" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2672619 2673233 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085500.1"; gene_id "LTnewLTref_360085500"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2673720 2674580 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085600.1"; gene_id "LTnewLTref_360085600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2673720 2674580 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085600.1"; gene_id "LTnewLTref_360085600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2675831 2676175 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085700.1"; gene_id "LTnewLTref_360085700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2675831 2676175 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085700.1"; gene_id "LTnewLTref_360085700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2676944 2680864 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085800.1"; gene_id "LTnewLTref_360085800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2676944 2680864 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085800.1"; gene_id "LTnewLTref_360085800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2681734 2683857 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360085900.1"; gene_id "LTnewLTref_360085900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2681734 2683857 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360085900.1"; gene_id "LTnewLTref_360085900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2685102 2686715 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086000.1"; gene_id "LTnewLTref_360086000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2685102 2686715 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086000.1"; gene_id "LTnewLTref_360086000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2687585 2688391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086100.1"; gene_id "LTnewLTref_360086100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2687585 2688391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086100.1"; gene_id "LTnewLTref_360086100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2689150 2691030 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086200.1"; gene_id "LTnewLTref_360086200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2689150 2691030 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086200.1"; gene_id "LTnewLTref_360086200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2691471 2691878 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086300.1"; gene_id "LTnewLTref_360086300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2691471 2691878 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086300.1"; gene_id "LTnewLTref_360086300"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2692680 2694113 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086400.1"; gene_id "LTnewLTref_360086400" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2692680 2694113 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086400.1"; gene_id "LTnewLTref_360086400"; CM024322.1 . transcript 2695352 2696554 . - . transcript_id "LTnewLTref_360086500.1"; gene_id "LTnewLTref_360086500:pseudogene" CM024322.1 . exon 2695352 2696554 . - . transcript_id "LTnewLTref_360086500.1"; gene_id "LTnewLTref_360086500:pseudogene"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2697134 2698242 0.69 - . transcript_id "LTnewLTref_360086600.1"; gene_id "LTnewLTref_360086600" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2697134 2697952 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086600.1"; gene_id "LTnewLTref_360086600"; CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2698009 2698242 0.69 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086600.1"; gene_id "LTnewLTref_360086600"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2698849 2699745 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086700.1"; gene_id "LTnewLTref_360086700" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2698849 2699745 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086700.1"; gene_id "LTnewLTref_360086700"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2700553 2702748 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086800.1"; gene_id "LTnewLTref_360086800" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2700553 2702748 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086800.1"; gene_id "LTnewLTref_360086800"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2703173 2703670 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360086900.1"; gene_id "LTnewLTref_360086900" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2703173 2703670 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360086900.1"; gene_id "LTnewLTref_360086900"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2703822 2704316 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360087000.1"; gene_id "LTnewLTref_360087000" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2703822 2704316 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360087000.1"; gene_id "LTnewLTref_360087000"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2704748 2705587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360087100.1"; gene_id "LTnewLTref_360087100" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2704748 2705587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360087100.1"; gene_id "LTnewLTref_360087100"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2706144 2706518 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360087200.1"; gene_id "LTnewLTref_360087200" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2706144 2706518 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360087200.1"; gene_id "LTnewLTref_360087200"; CM024322.1 AUGUSTUS transcript 2707759 2708484 1 - . transcript_id "LTnewLTref_360087300.1"; gene_id "LTnewLTref_360087300" CM024322.1 AUGUSTUS CDS 2707759 2708484 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_360087300.1"; gene_id "LTnewLTref_360087300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 7056 8057 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005000.1"; gene_id "LTnewLTref_010005000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 7056 8057 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005000.1"; gene_id "LTnewLTref_010005000"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 9140 10801 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005100.1"; gene_id "LTnewLTref_010005100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 9140 10801 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005100.1"; gene_id "LTnewLTref_010005100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 12393 14414 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005200.1"; gene_id "LTnewLTref_010005200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 12393 14414 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005200.1"; gene_id "LTnewLTref_010005200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 15408 15968 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005300.1"; gene_id "LTnewLTref_010005300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 15408 15968 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005300.1"; gene_id "LTnewLTref_010005300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 18301 20298 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005400.1"; gene_id "LTnewLTref_010005400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 18301 20298 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005400.1"; gene_id "LTnewLTref_010005400"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 21414 22163 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005500.1"; gene_id "LTnewLTref_010005500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 21414 22163 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005500.1"; gene_id "LTnewLTref_010005500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 23243 25003 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005600.1"; gene_id "LTnewLTref_010005600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 23243 25003 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005600.1"; gene_id "LTnewLTref_010005600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 25843 26556 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005700.1"; gene_id "LTnewLTref_010005700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 25843 26556 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005700.1"; gene_id "LTnewLTref_010005700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 28039 28857 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005800.1"; gene_id "LTnewLTref_010005800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 28039 28857 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005800.1"; gene_id "LTnewLTref_010005800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 29541 30587 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010005900.1"; gene_id "LTnewLTref_010005900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 29541 30587 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010005900.1"; gene_id "LTnewLTref_010005900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 31597 32184 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006000.1"; gene_id "LTnewLTref_010006000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 31597 32184 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006000.1"; gene_id "LTnewLTref_010006000"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 33380 35356 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006100.1"; gene_id "LTnewLTref_010006100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 33380 35356 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006100.1"; gene_id "LTnewLTref_010006100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 36636 37832 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006200.1"; gene_id "LTnewLTref_010006200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 36636 37832 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006200.1"; gene_id "LTnewLTref_010006200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 39982 40230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006300.1"; gene_id "LTnewLTref_010006300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 39982 40230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006300.1"; gene_id "LTnewLTref_010006300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 40822 41172 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006400.1"; gene_id "LTnewLTref_010006400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 40822 41172 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006400.1"; gene_id "LTnewLTref_010006400"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 42046 42288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006500.1"; gene_id "LTnewLTref_010006500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 42046 42288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006500.1"; gene_id "LTnewLTref_010006500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 44338 45711 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006600.1"; gene_id "LTnewLTref_010006600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 44338 45711 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006600.1"; gene_id "LTnewLTref_010006600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 47132 49444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006700.1"; gene_id "LTnewLTref_010006700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 47132 49444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006700.1"; gene_id "LTnewLTref_010006700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 50894 51487 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006800.1"; gene_id "LTnewLTref_010006800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 50894 51487 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006800.1"; gene_id "LTnewLTref_010006800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 52185 52832 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_010006900.1"; gene_id "LTnewLTref_010006900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 52185 52832 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006900.1"; gene_id "LTnewLTref_010006900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 52185 53096 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010006900.2"; gene_id "LTnewLTref_010006900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 52185 53096 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010006900.2"; gene_id "LTnewLTref_010006900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 53963 56656 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007000.1"; gene_id "LTnewLTref_010007000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 53963 56656 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007000.1"; gene_id "LTnewLTref_010007000"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 60423 61427 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007100.1"; gene_id "LTnewLTref_010007100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 60423 61427 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007100.1"; gene_id "LTnewLTref_010007100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 62323 62538 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007200.1"; gene_id "LTnewLTref_010007200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 62323 62538 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007200.1"; gene_id "LTnewLTref_010007200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 62590 63015 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007300.1"; gene_id "LTnewLTref_010007300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 62590 63015 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007300.1"; gene_id "LTnewLTref_010007300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 64607 65023 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007400.1"; gene_id "LTnewLTref_010007400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 64607 65023 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007400.1"; gene_id "LTnewLTref_010007400"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 65786 68554 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007500.1"; gene_id "LTnewLTref_010007500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 65786 68554 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007500.1"; gene_id "LTnewLTref_010007500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 69358 71844 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007600.1"; gene_id "LTnewLTref_010007600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 69358 71844 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007600.1"; gene_id "LTnewLTref_010007600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 73186 74031 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007700.1"; gene_id "LTnewLTref_010007700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 73186 74031 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007700.1"; gene_id "LTnewLTref_010007700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 75232 75555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007800.1"; gene_id "LTnewLTref_010007800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 75232 75555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007800.1"; gene_id "LTnewLTref_010007800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 77062 78303 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010007900.1"; gene_id "LTnewLTref_010007900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 77062 78303 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010007900.1"; gene_id "LTnewLTref_010007900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 79531 80049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010008000.1"; gene_id "LTnewLTref_010008000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 79531 80049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010008000.1"; gene_id "LTnewLTref_010008000"; CM024323.1 Liftoff transcript 80958 81137 . - . transcript_id "LTnewLTref_010008100.1"; gene_id "LTnewLTref_010008100" CM024323.1 Liftoff CDS 80958 81137 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_010008100.1"; gene_id "LTnewLTref_010008100"; CM024323.1 . transcript 81682 82849 . - . transcript_id "LTnewLTref_010008200.1"; gene_id "LTnewLTref_010008200:pseudogene" CM024323.1 . exon 81682 82849 . - . transcript_id "LTnewLTref_010008200.1"; gene_id "LTnewLTref_010008200:pseudogene"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 83209 83640 1 - . transcript_id "LTnewLTref_010008300.1"; gene_id "LTnewLTref_010008300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 83209 83640 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_010008300.1"; gene_id "LTnewLTref_010008300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 84516 85535 0.75 + . transcript_id "LTnewLTref_010008400.1"; gene_id "LTnewLTref_010008400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 84516 85535 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010008400.1"; gene_id "LTnewLTref_010008400"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 86015 86647 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_010008500.1"; gene_id "LTnewLTref_010008500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 86015 86647 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010008500.1"; gene_id "LTnewLTref_010008500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 87228 87521 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010008600.1"; gene_id "LTnewLTref_010008600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 87228 87521 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010008600.1"; gene_id "LTnewLTref_010008600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 88641 89417 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010008700.1"; gene_id "LTnewLTref_010008700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 88641 89417 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010008700.1"; gene_id "LTnewLTref_010008700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 91109 93352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010008800.1"; gene_id "LTnewLTref_010008800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 91109 93352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010008800.1"; gene_id "LTnewLTref_010008800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 94189 94758 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010008900.1"; gene_id "LTnewLTref_010008900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 94189 94758 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010008900.1"; gene_id "LTnewLTref_010008900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 95379 95945 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009000.1"; gene_id "LTnewLTref_010009000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 95379 95945 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009000.1"; gene_id "LTnewLTref_010009000"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 96760 99210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009100.1"; gene_id "LTnewLTref_010009100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 96760 99210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009100.1"; gene_id "LTnewLTref_010009100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 100092 102554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009200.1"; gene_id "LTnewLTref_010009200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 100092 102554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009200.1"; gene_id "LTnewLTref_010009200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 103422 105101 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009300.1"; gene_id "LTnewLTref_010009300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 103422 105101 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009300.1"; gene_id "LTnewLTref_010009300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 105644 106246 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009400.1"; gene_id "LTnewLTref_010009400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 105644 106246 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009400.1"; gene_id "LTnewLTref_010009400"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 107415 108017 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009500.1"; gene_id "LTnewLTref_010009500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 107415 108017 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009500.1"; gene_id "LTnewLTref_010009500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 108893 111133 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009600.1"; gene_id "LTnewLTref_010009600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 108893 111133 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009600.1"; gene_id "LTnewLTref_010009600"; CM024323.1 . transcript 112483 114251 . + . transcript_id "LTnewLTref_010009700.1"; gene_id "LTnewLTref_010009700:pseudogene" CM024323.1 . exon 112483 114251 . + . transcript_id "LTnewLTref_010009700.1"; gene_id "LTnewLTref_010009700:pseudogene"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 117108 117764 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010009800.1"; gene_id "LTnewLTref_010009800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 117108 117764 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009800.1"; gene_id "LTnewLTref_010009800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 119871 124468 0.86 + . transcript_id "LTnewLTref_010009900.1"; gene_id "LTnewLTref_010009900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 119871 120367 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010009900.1"; gene_id "LTnewLTref_010009900"; CM024323.1 AUGUSTUS CDS 120412 124468 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_010009900.1"; gene_id "LTnewLTref_010009900"; CM024323.1 . transcript 128142 128435 . + . transcript_id "LTnewLTref_010010000.1"; gene_id "LTnewLTref_010010000:pseudogene" CM024323.1 . exon 128142 128435 . + . transcript_id "LTnewLTref_010010000.1"; gene_id "LTnewLTref_010010000:pseudogene"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 128465 130555 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010100.1"; gene_id "LTnewLTref_010010100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 128465 130555 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010100.1"; gene_id "LTnewLTref_010010100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 131418 132497 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010200.1"; gene_id "LTnewLTref_010010200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 131418 132497 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010200.1"; gene_id "LTnewLTref_010010200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 134306 136402 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010300.1"; gene_id "LTnewLTref_010010300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 134306 136402 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010300.1"; gene_id "LTnewLTref_010010300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 137513 139636 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010400.1"; gene_id "LTnewLTref_010010400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 137513 139636 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010400.1"; gene_id "LTnewLTref_010010400"; CM024323.1 . transcript 141600 141788 . + . transcript_id "LTnewLTref_010010500.1"; gene_id "LTnewLTref_010010500:pseudogene" CM024323.1 . exon 141600 141788 . + . transcript_id "LTnewLTref_010010500.1"; gene_id "LTnewLTref_010010500:pseudogene"; CM024323.1 . transcript 142853 143257 . + . transcript_id "LTnewLTref_010010600.1"; gene_id "LTnewLTref_010010600:pseudogene" CM024323.1 . exon 142853 143257 . + . transcript_id "LTnewLTref_010010600.1"; gene_id "LTnewLTref_010010600:pseudogene"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 144089 146236 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010700.1"; gene_id "LTnewLTref_010010700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 144089 146236 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010700.1"; gene_id "LTnewLTref_010010700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 150361 155154 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010800.1"; gene_id "LTnewLTref_010010800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 150361 155154 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010800.1"; gene_id "LTnewLTref_010010800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 156286 158283 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010010900.1"; gene_id "LTnewLTref_010010900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 156286 158283 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010010900.1"; gene_id "LTnewLTref_010010900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 159766 161058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011000.1"; gene_id "LTnewLTref_010011000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 159766 161058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011000.1"; gene_id "LTnewLTref_010011000"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 162149 164032 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011100.1"; gene_id "LTnewLTref_010011100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 162149 164032 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011100.1"; gene_id "LTnewLTref_010011100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 164649 165629 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011200.1"; gene_id "LTnewLTref_010011200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 164649 165629 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011200.1"; gene_id "LTnewLTref_010011200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 166346 169234 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011300.1"; gene_id "LTnewLTref_010011300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 166346 169234 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011300.1"; gene_id "LTnewLTref_010011300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 170076 171542 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011400.1"; gene_id "LTnewLTref_010011400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 170076 171542 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011400.1"; gene_id "LTnewLTref_010011400"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 172589 178060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011500.1"; gene_id "LTnewLTref_010011500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 172589 178060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011500.1"; gene_id "LTnewLTref_010011500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 178584 179747 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011600.1"; gene_id "LTnewLTref_010011600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 178584 179747 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011600.1"; gene_id "LTnewLTref_010011600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 180270 182111 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011700.1"; gene_id "LTnewLTref_010011700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 180270 182111 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011700.1"; gene_id "LTnewLTref_010011700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 183893 186685 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011800.1"; gene_id "LTnewLTref_010011800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 183893 186685 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011800.1"; gene_id "LTnewLTref_010011800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 188256 191585 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010011900.1"; gene_id "LTnewLTref_010011900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 188256 191585 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010011900.1"; gene_id "LTnewLTref_010011900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 192479 193963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012000.1"; gene_id "LTnewLTref_010012000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 192479 193963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012000.1"; gene_id "LTnewLTref_010012000"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 195065 199675 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012100.1"; gene_id "LTnewLTref_010012100" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 195065 199675 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012100.1"; gene_id "LTnewLTref_010012100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 200676 201593 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012200.1"; gene_id "LTnewLTref_010012200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 200676 201593 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012200.1"; gene_id "LTnewLTref_010012200"; CM024323.1 . transcript 205183 207569 . + . transcript_id "LTnewLTref_010012300.1"; gene_id "LTnewLTref_010012300:pseudogene" CM024323.1 . exon 205183 207569 . + . transcript_id "LTnewLTref_010012300.1"; gene_id "LTnewLTref_010012300:pseudogene"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 209635 210324 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012400.1"; gene_id "LTnewLTref_010012400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 209635 210324 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012400.1"; gene_id "LTnewLTref_010012400"; CM024323.1 Liftoff transcript 212510 214162 . + . transcript_id "LTnewLTref_010012500.1"; gene_id "LTnewLTref_010012500" CM024323.1 Liftoff CDS 212510 214162 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012500.1"; gene_id "LTnewLTref_010012500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 216462 218087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012600.1"; gene_id "LTnewLTref_010012600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 216462 218087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012600.1"; gene_id "LTnewLTref_010012600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 218625 223553 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012700.1"; gene_id "LTnewLTref_010012700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 218625 223553 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012700.1"; gene_id "LTnewLTref_010012700"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 224516 231529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012800.1"; gene_id "LTnewLTref_010012800" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 224516 231529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012800.1"; gene_id "LTnewLTref_010012800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 232345 234600 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010012900.1"; gene_id "LTnewLTref_010012900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 232345 234600 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010012900.1"; gene_id "LTnewLTref_010012900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 235935 240204 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_010013000.1"; gene_id "LTnewLTref_010013000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 235935 236630 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013000.1"; gene_id "LTnewLTref_010013000"; CM024323.1 AUGUSTUS CDS 236698 240204 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013000.1"; gene_id "LTnewLTref_010013000"; CM024323.1 Liftoff transcript 240795 241811 . + . transcript_id "LTnewLTref_010013100.1"; gene_id "LTnewLTref_010013100" CM024323.1 Liftoff CDS 240795 241811 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013100.1"; gene_id "LTnewLTref_010013100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 242664 243875 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010013200.1"; gene_id "LTnewLTref_010013200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 242664 243875 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013200.1"; gene_id "LTnewLTref_010013200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 246168 247379 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010013300.1"; gene_id "LTnewLTref_010013300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 246168 247379 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013300.1"; gene_id "LTnewLTref_010013300"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 249485 251077 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010013400.1"; gene_id "LTnewLTref_010013400" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 249485 251077 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013400.1"; gene_id "LTnewLTref_010013400"; CM024323.1 Liftoff transcript 251891 252073 . + . transcript_id "LTnewLTref_010013500.1"; gene_id "LTnewLTref_010013500" CM024323.1 Liftoff CDS 251891 252073 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013500.1"; gene_id "LTnewLTref_010013500"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 253071 254543 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010013600.1"; gene_id "LTnewLTref_010013600" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 253071 254543 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013600.1"; gene_id "LTnewLTref_010013600"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 255902 258955 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010013700.1"; gene_id "LTnewLTref_010013700" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 255902 258955 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013700.1"; gene_id "LTnewLTref_010013700"; CM024323.1 Liftoff transcript 259089 259397 . + . transcript_id "LTnewLTref_010013800.1"; gene_id "LTnewLTref_010013800" CM024323.1 Liftoff CDS 259089 259397 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013800.1"; gene_id "LTnewLTref_010013800"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 259442 259660 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010013900.1"; gene_id "LTnewLTref_010013900" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 259442 259660 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010013900.1"; gene_id "LTnewLTref_010013900"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 260568 264050 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010014000.1"; gene_id "LTnewLTref_010014000" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 260568 264050 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010014000.1"; gene_id "LTnewLTref_010014000"; CM024323.1 Liftoff transcript 264632 264965 . + . transcript_id "LTnewLTref_010014100.1"; gene_id "LTnewLTref_010014100" CM024323.1 Liftoff CDS 264632 264965 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_010014100.1"; gene_id "LTnewLTref_010014100"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 267128 268460 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_010014200.1"; gene_id "LTnewLTref_010014200" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 267128 267230 0.88 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010014200.1"; gene_id "LTnewLTref_010014200"; CM024323.1 AUGUSTUS CDS 267796 268460 0.8 + 2 transcript_id "LTnewLTref_010014200.1"; gene_id "LTnewLTref_010014200"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 268514 269128 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010014300.1"; gene_id "LTnewLTref_010014300" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 268514 269128 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010014300.1"; gene_id "LTnewLTref_010014300"; CM024323.1 . transcript 271185 271837 . - . transcript_id "LTnewLTref_010014400.1"; gene_id "LTnewLTref_010014400:pseudogene" CM024323.1 . exon 271185 271505 . - . transcript_id "LTnewLTref_010014400.1"; gene_id "LTnewLTref_010014400:pseudogene"; CM024323.1 . exon 271507 271680 . - . transcript_id "LTnewLTref_010014400.1"; gene_id "LTnewLTref_010014400:pseudogene"; CM024323.1 . exon 271682 271837 . - . transcript_id "LTnewLTref_010014400.1"; gene_id "LTnewLTref_010014400:pseudogene"; CM024323.1 AUGUSTUS transcript 273755 274186 1 + . transcript_id "LTnewLTref_010014500.1"; gene_id "LTnewLTref_010014500" CM024323.1 AUGUSTUS CDS 273755 274186 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_010014500.1"; gene_id "LTnewLTref_010014500"; CM024323.1 Liftoff transcript 273825 274210 . - . transcript_id "LTnewLTref_010014600.1"; gene_id "LTnewLTref_010014600" CM024323.1 Liftoff CDS 273825 274210 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_010014600.1"; gene_id "LTnewLTref_010014600"; CM024323.1 . transcript 274295 274738 . + . transcript_id "LTnewLTref_010014700.1"; gene_id "LTnewLTref_010014700:pseudogene" CM024323.1 . exon 274295 274546 . + . transcript_id "LTnewLTref_010014700.1"; gene_id "LTnewLTref_010014700:pseudogene"; CM024323.1 . exon 274549 274638 . + . transcript_id "LTnewLTref_010014700.1"; gene_id "LTnewLTref_010014700:pseudogene"; CM024323.1 . exon 274641 274679 . + . transcript_id "LTnewLTref_010014700.1"; gene_id "LTnewLTref_010014700:pseudogene"; CM024323.1 . exon 274682 274738 . + . transcript_id "LTnewLTref_010014700.1"; gene_id "LTnewLTref_010014700:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 453 676 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_020005000.1"; gene_id "LTnewLTref_020005000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 453 676 0.52 + 2 transcript_id "LTnewLTref_020005000.1"; gene_id "LTnewLTref_020005000"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 6195 8639 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005100.1"; gene_id "LTnewLTref_020005100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 6195 8639 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005100.1"; gene_id "LTnewLTref_020005100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 10478 10780 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005200.1"; gene_id "LTnewLTref_020005200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 10478 10780 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005200.1"; gene_id "LTnewLTref_020005200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 13415 15274 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005300.1"; gene_id "LTnewLTref_020005300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 13415 15274 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005300.1"; gene_id "LTnewLTref_020005300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 20514 21170 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005400.1"; gene_id "LTnewLTref_020005400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 20514 21170 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005400.1"; gene_id "LTnewLTref_020005400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 21875 22453 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005500.1"; gene_id "LTnewLTref_020005500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 21875 22453 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005500.1"; gene_id "LTnewLTref_020005500"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 23069 24262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005600.1"; gene_id "LTnewLTref_020005600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 23069 24262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005600.1"; gene_id "LTnewLTref_020005600"; CM024324.1 Liftoff transcript 26507 29569 . - . transcript_id "LTnewLTref_020005700.1"; gene_id "LTnewLTref_020005700" CM024324.1 Liftoff CDS 26507 29569 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005700.1"; gene_id "LTnewLTref_020005700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 31201 32145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005800.1"; gene_id "LTnewLTref_020005800" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 31201 32145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005800.1"; gene_id "LTnewLTref_020005800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 33188 34252 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020005900.1"; gene_id "LTnewLTref_020005900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 33188 34252 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020005900.1"; gene_id "LTnewLTref_020005900"; CM024324.1 . transcript 35627 38553 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006000.1"; gene_id "LTnewLTref_020006000:pseudogene" CM024324.1 . exon 35627 38553 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006000.1"; gene_id "LTnewLTref_020006000:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 40562 44062 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006100.1"; gene_id "LTnewLTref_020006100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 40562 44062 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006100.1"; gene_id "LTnewLTref_020006100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 45847 60549 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006200.1"; gene_id "LTnewLTref_020006200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 45847 60549 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006200.1"; gene_id "LTnewLTref_020006200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 62149 62868 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006300.1"; gene_id "LTnewLTref_020006300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 62149 62868 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006300.1"; gene_id "LTnewLTref_020006300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 63824 66511 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006400.1"; gene_id "LTnewLTref_020006400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 63824 66511 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006400.1"; gene_id "LTnewLTref_020006400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 67800 73715 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006500.1"; gene_id "LTnewLTref_020006500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 67800 73715 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006500.1"; gene_id "LTnewLTref_020006500"; CM024324.1 . transcript 76170 76554 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006600.1"; gene_id "LTnewLTref_020006600:pseudogene" CM024324.1 . exon 76170 76554 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006600.1"; gene_id "LTnewLTref_020006600:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 80828 83281 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006700.1"; gene_id "LTnewLTref_020006700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 80828 83281 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006700.1"; gene_id "LTnewLTref_020006700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 87621 90044 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020006800.1"; gene_id "LTnewLTref_020006800" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 87621 90044 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020006800.1"; gene_id "LTnewLTref_020006800"; CM024324.1 . transcript 91976 94026 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006900.1"; gene_id "LTnewLTref_020006900:pseudogene" CM024324.1 . exon 91976 92962 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006900.1"; gene_id "LTnewLTref_020006900:pseudogene"; CM024324.1 . exon 92965 94026 . - . transcript_id "LTnewLTref_020006900.1"; gene_id "LTnewLTref_020006900:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 95014 95310 0.82 - . transcript_id "LTnewLTref_020007000.1"; gene_id "LTnewLTref_020007000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 95014 95310 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007000.1"; gene_id "LTnewLTref_020007000"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 98012 98248 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020007100.1"; gene_id "LTnewLTref_020007100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 98012 98248 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007100.1"; gene_id "LTnewLTref_020007100"; CM024324.1 Liftoff transcript 99323 99526 . - . transcript_id "LTnewLTref_020007200.1"; gene_id "LTnewLTref_020007200" CM024324.1 Liftoff CDS 99323 99526 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007200.1"; gene_id "LTnewLTref_020007200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 100813 103350 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020007300.1"; gene_id "LTnewLTref_020007300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 100813 103350 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007300.1"; gene_id "LTnewLTref_020007300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 105302 107893 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020007400.1"; gene_id "LTnewLTref_020007400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 105302 107893 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007400.1"; gene_id "LTnewLTref_020007400"; CM024324.1 . transcript 111227 113571 . - . transcript_id "LTnewLTref_020007500.1"; gene_id "LTnewLTref_020007500:pseudogene" CM024324.1 . exon 111227 113571 . - . transcript_id "LTnewLTref_020007500.1"; gene_id "LTnewLTref_020007500:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 115033 117990 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020007600.1"; gene_id "LTnewLTref_020007600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 115033 117990 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007600.1"; gene_id "LTnewLTref_020007600"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 120133 123162 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020007700.1"; gene_id "LTnewLTref_020007700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 120133 123162 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007700.1"; gene_id "LTnewLTref_020007700"; CM024324.1 Liftoff transcript 123792 123975 . - . transcript_id "LTnewLTref_020007800.1"; gene_id "LTnewLTref_020007800" CM024324.1 Liftoff CDS 123792 123975 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007800.1"; gene_id "LTnewLTref_020007800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 124453 127893 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020007900.1"; gene_id "LTnewLTref_020007900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 124453 127893 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020007900.1"; gene_id "LTnewLTref_020007900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 129401 130225 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008000.1"; gene_id "LTnewLTref_020008000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 129401 130225 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008000.1"; gene_id "LTnewLTref_020008000"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 131703 132197 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008100.1"; gene_id "LTnewLTref_020008100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 131703 132197 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008100.1"; gene_id "LTnewLTref_020008100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 133977 134486 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008200.1"; gene_id "LTnewLTref_020008200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 133977 134486 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008200.1"; gene_id "LTnewLTref_020008200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 135371 136963 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008300.1"; gene_id "LTnewLTref_020008300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 135371 136963 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008300.1"; gene_id "LTnewLTref_020008300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 141392 149389 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008400.1"; gene_id "LTnewLTref_020008400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 141392 149389 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008400.1"; gene_id "LTnewLTref_020008400"; CM024324.1 . transcript 150927 151555 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008500.1"; gene_id "LTnewLTref_020008500:pseudogene" CM024324.1 . exon 150927 150977 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008500.1"; gene_id "LTnewLTref_020008500:pseudogene"; CM024324.1 . exon 150979 151101 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008500.1"; gene_id "LTnewLTref_020008500:pseudogene"; CM024324.1 . exon 151103 151273 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008500.1"; gene_id "LTnewLTref_020008500:pseudogene"; CM024324.1 . exon 151276 151491 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008500.1"; gene_id "LTnewLTref_020008500:pseudogene"; CM024324.1 . exon 151493 151555 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008500.1"; gene_id "LTnewLTref_020008500:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 153590 155662 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008600.1"; gene_id "LTnewLTref_020008600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 153590 155662 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008600.1"; gene_id "LTnewLTref_020008600"; CM024324.1 Liftoff transcript 156814 157842 . - . transcript_id "LTnewLTref_020008700.1"; gene_id "LTnewLTref_020008700" CM024324.1 Liftoff CDS 156814 157842 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008700.1"; gene_id "LTnewLTref_020008700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 158424 163043 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008800.1"; gene_id "LTnewLTref_020008800" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 158424 163043 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008800.1"; gene_id "LTnewLTref_020008800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 164173 167091 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020008900.1"; gene_id "LTnewLTref_020008900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 164173 167091 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020008900.1"; gene_id "LTnewLTref_020008900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 168253 171432 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009000.1"; gene_id "LTnewLTref_020009000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 168253 171432 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009000.1"; gene_id "LTnewLTref_020009000"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 173172 174317 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009100.1"; gene_id "LTnewLTref_020009100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 173172 174317 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009100.1"; gene_id "LTnewLTref_020009100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 175920 177509 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009200.1"; gene_id "LTnewLTref_020009200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 175920 177509 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009200.1"; gene_id "LTnewLTref_020009200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 178579 179952 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009300.1"; gene_id "LTnewLTref_020009300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 178579 179952 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009300.1"; gene_id "LTnewLTref_020009300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 181266 181937 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009400.1"; gene_id "LTnewLTref_020009400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 181266 181937 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009400.1"; gene_id "LTnewLTref_020009400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 183160 186240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009500.1"; gene_id "LTnewLTref_020009500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 183160 186240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009500.1"; gene_id "LTnewLTref_020009500"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 188928 191987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009600.1"; gene_id "LTnewLTref_020009600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 188928 191987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009600.1"; gene_id "LTnewLTref_020009600"; CM024324.1 Liftoff transcript 193677 193916 . - . transcript_id "LTnewLTref_020009700.1"; gene_id "LTnewLTref_020009700" CM024324.1 Liftoff CDS 193677 193916 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009700.1"; gene_id "LTnewLTref_020009700"; CM024324.1 . transcript 194046 194948 . - . transcript_id "LTnewLTref_020009800.1"; gene_id "LTnewLTref_020009800:pseudogene" CM024324.1 . exon 194046 194948 . - . transcript_id "LTnewLTref_020009800.1"; gene_id "LTnewLTref_020009800:pseudogene"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 195855 196967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020009900.1"; gene_id "LTnewLTref_020009900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 195855 196967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020009900.1"; gene_id "LTnewLTref_020009900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 198547 199121 0.75 - . transcript_id "LTnewLTref_020010000.1"; gene_id "LTnewLTref_020010000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 198547 198813 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010000.1"; gene_id "LTnewLTref_020010000"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 198948 199121 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010000.1"; gene_id "LTnewLTref_020010000"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 199498 200682 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_020010100.1"; gene_id "LTnewLTref_020010100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 199498 200385 0.92 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010100.1"; gene_id "LTnewLTref_020010100"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 200434 200682 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010100.1"; gene_id "LTnewLTref_020010100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 199498 200739 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_020010100.2"; gene_id "LTnewLTref_020010100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 199498 200385 0.94 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010100.2"; gene_id "LTnewLTref_020010100"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 200434 200739 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010100.2"; gene_id "LTnewLTref_020010100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 200794 201270 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010200.1"; gene_id "LTnewLTref_020010200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 200794 201270 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010200.1"; gene_id "LTnewLTref_020010200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 203570 204403 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010300.1"; gene_id "LTnewLTref_020010300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 203570 204403 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010300.1"; gene_id "LTnewLTref_020010300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 208361 209236 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010400.1"; gene_id "LTnewLTref_020010400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 208361 209236 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010400.1"; gene_id "LTnewLTref_020010400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 210606 221288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010500.1"; gene_id "LTnewLTref_020010500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 210606 221288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010500.1"; gene_id "LTnewLTref_020010500"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 222935 223540 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010600.1"; gene_id "LTnewLTref_020010600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 222935 223540 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010600.1"; gene_id "LTnewLTref_020010600"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 224394 227771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010700.1"; gene_id "LTnewLTref_020010700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 224394 227771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010700.1"; gene_id "LTnewLTref_020010700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 228336 231185 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010800.1"; gene_id "LTnewLTref_020010800" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 228336 231185 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010800.1"; gene_id "LTnewLTref_020010800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 232296 232808 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020010900.1"; gene_id "LTnewLTref_020010900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 232296 232808 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020010900.1"; gene_id "LTnewLTref_020010900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 234416 240688 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020011000.1"; gene_id "LTnewLTref_020011000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 234416 240688 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020011000.1"; gene_id "LTnewLTref_020011000"; CM024324.1 Aragorn_1.2.36 transcript 235648 235739 . + . transcript_id "LTnewLTref_020011100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_020011100" CM024324.1 Aragorn_1.2.36 exon 235648 235739 . + . transcript_id "LTnewLTref_020011100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_020011100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 246716 249250 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020011200.1"; gene_id "LTnewLTref_020011200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 246716 249250 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020011200.1"; gene_id "LTnewLTref_020011200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 250974 252470 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020011300.1"; gene_id "LTnewLTref_020011300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 250974 252470 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020011300.1"; gene_id "LTnewLTref_020011300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 254499 254990 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020011400.1"; gene_id "LTnewLTref_020011400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 254499 254990 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020011400.1"; gene_id "LTnewLTref_020011400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 256095 258638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_020011500.1"; gene_id "LTnewLTref_020011500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 256095 258638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020011500.1"; gene_id "LTnewLTref_020011500"; CM024324.1 Liftoff transcript 262146 266036 . - . transcript_id "LTnewLTref_020011600.1"; gene_id "LTnewLTref_020011600" CM024324.1 Liftoff CDS 262146 266036 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020011600.1"; gene_id "LTnewLTref_020011600"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 296402 307768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020011700.1"; gene_id "LTnewLTref_020011700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 296402 307768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020011700.1"; gene_id "LTnewLTref_020011700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 308531 310105 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020011800.1"; gene_id "LTnewLTref_020011800" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 308531 310105 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020011800.1"; gene_id "LTnewLTref_020011800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 311156 311788 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020011900.1"; gene_id "LTnewLTref_020011900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 311156 311788 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020011900.1"; gene_id "LTnewLTref_020011900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 313332 314297 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012000.1"; gene_id "LTnewLTref_020012000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 313332 314297 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012000.1"; gene_id "LTnewLTref_020012000"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 315426 317129 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012100.1"; gene_id "LTnewLTref_020012100" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 315426 317129 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012100.1"; gene_id "LTnewLTref_020012100"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 318084 320063 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012200.1"; gene_id "LTnewLTref_020012200" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 318084 320063 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012200.1"; gene_id "LTnewLTref_020012200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 321543 325772 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012300.1"; gene_id "LTnewLTref_020012300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 321543 325772 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012300.1"; gene_id "LTnewLTref_020012300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 326302 327249 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012400.1"; gene_id "LTnewLTref_020012400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 326302 327249 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012400.1"; gene_id "LTnewLTref_020012400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 328147 330879 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012500.1"; gene_id "LTnewLTref_020012500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 328147 330879 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012500.1"; gene_id "LTnewLTref_020012500"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 331746 332687 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012600.1"; gene_id "LTnewLTref_020012600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 331746 332687 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012600.1"; gene_id "LTnewLTref_020012600"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 334160 334615 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_020012700.1"; gene_id "LTnewLTref_020012700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 334160 334615 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012700.1"; gene_id "LTnewLTref_020012700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 334160 334758 0.32 + . transcript_id "LTnewLTref_020012700.2"; gene_id "LTnewLTref_020012700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 334160 334270 0.41 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012700.2"; gene_id "LTnewLTref_020012700"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 334546 334758 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012700.2"; gene_id "LTnewLTref_020012700"; CM024324.1 Liftoff transcript 334778 335470 . + . transcript_id "LTnewLTref_020012800.1"; gene_id "LTnewLTref_020012800" CM024324.1 Liftoff CDS 334778 335470 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012800.1"; gene_id "LTnewLTref_020012800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 336253 337617 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020012900.1"; gene_id "LTnewLTref_020012900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 336253 337617 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020012900.1"; gene_id "LTnewLTref_020012900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 338405 341209 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020013000.1"; gene_id "LTnewLTref_020013000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 338405 341209 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013000.1"; gene_id "LTnewLTref_020013000"; CM024324.1 . transcript 338990 339742 . - . transcript_id "LTnewLTref_020013100.1"; gene_id "LTnewLTref_020013100" CM024324.1 . CDS 338990 339742 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_020013100.1"; gene_id "LTnewLTref_020013100"; CM024324.1 Liftoff transcript 340456 341209 . + . transcript_id "LTnewLTref_020013200.1"; gene_id "LTnewLTref_020013200" CM024324.1 Liftoff exon 340456 341209 . + . transcript_id "LTnewLTref_020013200.1"; gene_id "LTnewLTref_020013200"; CM024324.1 Liftoff CDS 340457 341209 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013200.1"; gene_id "LTnewLTref_020013200"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 342898 345351 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020013300.1"; gene_id "LTnewLTref_020013300" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 342898 345351 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013300.1"; gene_id "LTnewLTref_020013300"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 347855 348398 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_020013400.1"; gene_id "LTnewLTref_020013400" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 347855 348138 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013400.1"; gene_id "LTnewLTref_020013400"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 348293 348398 0.98 + 1 transcript_id "LTnewLTref_020013400.1"; gene_id "LTnewLTref_020013400"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 348814 349308 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020013500.1"; gene_id "LTnewLTref_020013500" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 348814 349308 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013500.1"; gene_id "LTnewLTref_020013500"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 349909 350172 1 + . transcript_id "LTnewLTref_020013600.1"; gene_id "LTnewLTref_020013600" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 349909 350172 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013600.1"; gene_id "LTnewLTref_020013600"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 351205 351672 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_020013700.1"; gene_id "LTnewLTref_020013700" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 351205 351672 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013700.1"; gene_id "LTnewLTref_020013700"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 351725 353240 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_020013800.1"; gene_id "LTnewLTref_020013800" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 351725 352118 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013800.1"; gene_id "LTnewLTref_020013800"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 352168 353240 0.74 + 2 transcript_id "LTnewLTref_020013800.1"; gene_id "LTnewLTref_020013800"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 355069 355865 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_020013900.1"; gene_id "LTnewLTref_020013900" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 355069 355501 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_020013900.1"; gene_id "LTnewLTref_020013900"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 355774 355865 0.78 + 2 transcript_id "LTnewLTref_020013900.1"; gene_id "LTnewLTref_020013900"; CM024324.1 AUGUSTUS transcript 356912 357444 0.69 - . transcript_id "LTnewLTref_020014000.1"; gene_id "LTnewLTref_020014000" CM024324.1 AUGUSTUS CDS 356912 357090 0.69 - 2 transcript_id "LTnewLTref_020014000.1"; gene_id "LTnewLTref_020014000"; CM024324.1 AUGUSTUS CDS 357264 357444 0.69 - 0 transcript_id "LTnewLTref_020014000.1"; gene_id "LTnewLTref_020014000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 313 512 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_030005000.1"; gene_id "LTnewLTref_030005000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 313 512 0.91 + 2 transcript_id "LTnewLTref_030005000.1"; gene_id "LTnewLTref_030005000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 1643 4672 0.86 - . transcript_id "LTnewLTref_030005100.1"; gene_id "LTnewLTref_030005100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 1643 4672 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030005100.1"; gene_id "LTnewLTref_030005100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 5954 6760 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005200.1"; gene_id "LTnewLTref_030005200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 5954 6760 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005200.1"; gene_id "LTnewLTref_030005200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 7491 8714 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005300.1"; gene_id "LTnewLTref_030005300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 7491 8714 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005300.1"; gene_id "LTnewLTref_030005300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 9649 10794 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005400.1"; gene_id "LTnewLTref_030005400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 9649 10794 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005400.1"; gene_id "LTnewLTref_030005400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 13954 15126 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005500.1"; gene_id "LTnewLTref_030005500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 13954 15126 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005500.1"; gene_id "LTnewLTref_030005500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 15994 18495 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005600.1"; gene_id "LTnewLTref_030005600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 15994 18495 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005600.1"; gene_id "LTnewLTref_030005600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 18958 21111 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005700.1"; gene_id "LTnewLTref_030005700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 18958 21111 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005700.1"; gene_id "LTnewLTref_030005700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 22362 24065 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005800.1"; gene_id "LTnewLTref_030005800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 22362 24065 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005800.1"; gene_id "LTnewLTref_030005800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 25256 26017 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030005900.1"; gene_id "LTnewLTref_030005900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 25256 26017 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030005900.1"; gene_id "LTnewLTref_030005900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 27255 29930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006000.1"; gene_id "LTnewLTref_030006000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 27255 29930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006000.1"; gene_id "LTnewLTref_030006000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 30678 33455 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006100.1"; gene_id "LTnewLTref_030006100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 30678 33455 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006100.1"; gene_id "LTnewLTref_030006100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 34401 34949 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006200.1"; gene_id "LTnewLTref_030006200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 34401 34949 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006200.1"; gene_id "LTnewLTref_030006200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 35823 36242 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006300.1"; gene_id "LTnewLTref_030006300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 35823 36242 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006300.1"; gene_id "LTnewLTref_030006300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 37461 38396 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006400.1"; gene_id "LTnewLTref_030006400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 37461 38396 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006400.1"; gene_id "LTnewLTref_030006400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 39254 41425 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006500.1"; gene_id "LTnewLTref_030006500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 39254 41425 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006500.1"; gene_id "LTnewLTref_030006500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 42420 42998 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006600.1"; gene_id "LTnewLTref_030006600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 42420 42998 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006600.1"; gene_id "LTnewLTref_030006600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 43288 45471 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006700.1"; gene_id "LTnewLTref_030006700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 43288 45471 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006700.1"; gene_id "LTnewLTref_030006700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 46333 46965 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006800.1"; gene_id "LTnewLTref_030006800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 46333 46965 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006800.1"; gene_id "LTnewLTref_030006800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 48509 50191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030006900.1"; gene_id "LTnewLTref_030006900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 48509 50191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030006900.1"; gene_id "LTnewLTref_030006900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 52062 53201 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007000.1"; gene_id "LTnewLTref_030007000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 52062 53201 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007000.1"; gene_id "LTnewLTref_030007000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 54217 55158 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007100.1"; gene_id "LTnewLTref_030007100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 54217 55158 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007100.1"; gene_id "LTnewLTref_030007100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 56112 58226 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007200.1"; gene_id "LTnewLTref_030007200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 56112 58226 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007200.1"; gene_id "LTnewLTref_030007200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 61008 61472 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007300.1"; gene_id "LTnewLTref_030007300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 61008 61472 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007300.1"; gene_id "LTnewLTref_030007300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 62096 62347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007400.1"; gene_id "LTnewLTref_030007400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 62096 62347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007400.1"; gene_id "LTnewLTref_030007400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 63506 64549 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007500.1"; gene_id "LTnewLTref_030007500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 63506 64549 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007500.1"; gene_id "LTnewLTref_030007500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 65986 73328 0.71 + . transcript_id "LTnewLTref_030007600.1"; gene_id "LTnewLTref_030007600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 65986 66999 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007600.1"; gene_id "LTnewLTref_030007600"; CM024325.1 AUGUSTUS CDS 67098 73328 0.71 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007600.1"; gene_id "LTnewLTref_030007600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 74234 77185 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030007700.1"; gene_id "LTnewLTref_030007700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 74234 77185 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007700.1"; gene_id "LTnewLTref_030007700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 77978 78424 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_030007800.1"; gene_id "LTnewLTref_030007800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 77978 78424 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007800.1"; gene_id "LTnewLTref_030007800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 78526 79164 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_030007900.1"; gene_id "LTnewLTref_030007900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 78526 78695 0.58 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030007900.1"; gene_id "LTnewLTref_030007900"; CM024325.1 AUGUSTUS CDS 78870 79164 0.53 + 1 transcript_id "LTnewLTref_030007900.1"; gene_id "LTnewLTref_030007900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 83525 89824 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008000.1"; gene_id "LTnewLTref_030008000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 83525 89824 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008000.1"; gene_id "LTnewLTref_030008000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 90837 93896 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008100.1"; gene_id "LTnewLTref_030008100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 90837 93896 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008100.1"; gene_id "LTnewLTref_030008100"; CM024325.1 Liftoff transcript 94880 97009 . + . transcript_id "LTnewLTref_030008200.1"; gene_id "LTnewLTref_030008200" CM024325.1 Liftoff CDS 94880 97009 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008200.1"; gene_id "LTnewLTref_030008200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 97892 98922 0.66 + . transcript_id "LTnewLTref_030008300.1"; gene_id "LTnewLTref_030008300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 97892 98515 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008300.1"; gene_id "LTnewLTref_030008300"; CM024325.1 AUGUSTUS CDS 98623 98922 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008300.1"; gene_id "LTnewLTref_030008300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 100085 104626 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008400.1"; gene_id "LTnewLTref_030008400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 100085 104626 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008400.1"; gene_id "LTnewLTref_030008400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 108487 113415 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008500.1"; gene_id "LTnewLTref_030008500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 108487 113415 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008500.1"; gene_id "LTnewLTref_030008500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 116849 117781 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008600.1"; gene_id "LTnewLTref_030008600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 116849 117781 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008600.1"; gene_id "LTnewLTref_030008600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 121323 122435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008700.1"; gene_id "LTnewLTref_030008700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 121323 122435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008700.1"; gene_id "LTnewLTref_030008700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 127356 128267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008800.1"; gene_id "LTnewLTref_030008800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 127356 128267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008800.1"; gene_id "LTnewLTref_030008800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 131994 134036 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030008900.1"; gene_id "LTnewLTref_030008900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 131994 134036 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030008900.1"; gene_id "LTnewLTref_030008900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 136882 142059 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009000.1"; gene_id "LTnewLTref_030009000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 136882 142059 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009000.1"; gene_id "LTnewLTref_030009000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 143076 143411 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009100.1"; gene_id "LTnewLTref_030009100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 143076 143411 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009100.1"; gene_id "LTnewLTref_030009100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 144241 144576 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009200.1"; gene_id "LTnewLTref_030009200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 144241 144576 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009200.1"; gene_id "LTnewLTref_030009200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 145404 150479 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009300.1"; gene_id "LTnewLTref_030009300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 145404 150479 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009300.1"; gene_id "LTnewLTref_030009300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 156559 159738 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009400.1"; gene_id "LTnewLTref_030009400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 156559 159738 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009400.1"; gene_id "LTnewLTref_030009400"; CM024325.1 . transcript 161979 162279 . + . transcript_id "LTnewLTref_030009500.1"; gene_id "LTnewLTref_030009500:pseudogene" CM024325.1 . exon 161979 162279 . + . transcript_id "LTnewLTref_030009500.1"; gene_id "LTnewLTref_030009500:pseudogene"; CM024325.1 . transcript 162393 163205 . + . transcript_id "LTnewLTref_030009600.1"; gene_id "LTnewLTref_030009600:pseudogene" CM024325.1 . exon 162393 163205 . + . transcript_id "LTnewLTref_030009600.1"; gene_id "LTnewLTref_030009600:pseudogene"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 164641 167514 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009700.1"; gene_id "LTnewLTref_030009700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 164641 167514 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009700.1"; gene_id "LTnewLTref_030009700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 169011 172022 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009800.1"; gene_id "LTnewLTref_030009800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 169011 172022 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009800.1"; gene_id "LTnewLTref_030009800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 173692 176877 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030009900.1"; gene_id "LTnewLTref_030009900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 173692 176877 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030009900.1"; gene_id "LTnewLTref_030009900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 178208 179926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010000.1"; gene_id "LTnewLTref_030010000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 178208 179926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010000.1"; gene_id "LTnewLTref_030010000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 182424 190007 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010100.1"; gene_id "LTnewLTref_030010100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 182424 190007 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010100.1"; gene_id "LTnewLTref_030010100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 190647 193202 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010200.1"; gene_id "LTnewLTref_030010200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 190647 193202 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010200.1"; gene_id "LTnewLTref_030010200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 194771 201319 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010300.1"; gene_id "LTnewLTref_030010300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 194771 201319 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010300.1"; gene_id "LTnewLTref_030010300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 202896 204086 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010400.1"; gene_id "LTnewLTref_030010400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 202896 204086 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010400.1"; gene_id "LTnewLTref_030010400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 205465 209709 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010500.1"; gene_id "LTnewLTref_030010500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 205465 209709 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010500.1"; gene_id "LTnewLTref_030010500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 211226 213373 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010600.1"; gene_id "LTnewLTref_030010600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 211226 213373 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010600.1"; gene_id "LTnewLTref_030010600"; CM024325.1 Liftoff transcript 214795 214974 . + . transcript_id "LTnewLTref_030010700.1"; gene_id "LTnewLTref_030010700" CM024325.1 Liftoff CDS 214795 214974 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010700.1"; gene_id "LTnewLTref_030010700"; CM024325.1 . transcript 215125 215830 . + . transcript_id "LTnewLTref_030010800.1"; gene_id "LTnewLTref_030010800:pseudogene" CM024325.1 . exon 215125 215265 . + . transcript_id "LTnewLTref_030010800.1"; gene_id "LTnewLTref_030010800:pseudogene"; CM024325.1 . exon 215267 215482 . + . transcript_id "LTnewLTref_030010800.1"; gene_id "LTnewLTref_030010800:pseudogene"; CM024325.1 . exon 215485 215658 . + . transcript_id "LTnewLTref_030010800.1"; gene_id "LTnewLTref_030010800:pseudogene"; CM024325.1 . exon 215660 215830 . + . transcript_id "LTnewLTref_030010800.1"; gene_id "LTnewLTref_030010800:pseudogene"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 216266 217264 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030010900.1"; gene_id "LTnewLTref_030010900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 216266 217264 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030010900.1"; gene_id "LTnewLTref_030010900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 217656 218192 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011000.1"; gene_id "LTnewLTref_030011000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 217656 218192 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011000.1"; gene_id "LTnewLTref_030011000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 219724 224040 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011100.1"; gene_id "LTnewLTref_030011100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 219724 224040 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011100.1"; gene_id "LTnewLTref_030011100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 224679 225896 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011200.1"; gene_id "LTnewLTref_030011200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 224679 225896 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011200.1"; gene_id "LTnewLTref_030011200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 227530 228579 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011300.1"; gene_id "LTnewLTref_030011300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 227530 228579 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011300.1"; gene_id "LTnewLTref_030011300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 229788 231815 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011400.1"; gene_id "LTnewLTref_030011400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 229788 231815 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011400.1"; gene_id "LTnewLTref_030011400"; CM024325.1 . transcript 231825 232456 . + . transcript_id "LTnewLTref_030011500.1"; gene_id "LTnewLTref_030011500:pseudogene" CM024325.1 . exon 231825 232456 . + . transcript_id "LTnewLTref_030011500.1"; gene_id "LTnewLTref_030011500:pseudogene"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 233439 234425 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011600.1"; gene_id "LTnewLTref_030011600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 233439 234425 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011600.1"; gene_id "LTnewLTref_030011600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 235245 237071 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011700.1"; gene_id "LTnewLTref_030011700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 235245 237071 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011700.1"; gene_id "LTnewLTref_030011700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 239595 242273 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011800.1"; gene_id "LTnewLTref_030011800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 239595 242273 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011800.1"; gene_id "LTnewLTref_030011800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 243208 245607 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030011900.1"; gene_id "LTnewLTref_030011900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 243208 245607 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030011900.1"; gene_id "LTnewLTref_030011900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 246519 248219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030012000.1"; gene_id "LTnewLTref_030012000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 246519 248219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030012000.1"; gene_id "LTnewLTref_030012000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 257904 258764 1 + . transcript_id "LTnewLTref_030012100.1"; gene_id "LTnewLTref_030012100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 257904 258764 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_030012100.1"; gene_id "LTnewLTref_030012100"; CM024325.1 Aragorn_1.2.36 transcript 260172 260244 . + . transcript_id "LTnewLTref_030012200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_030012200" CM024325.1 Aragorn_1.2.36 exon 260172 260244 . + . transcript_id "LTnewLTref_030012200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_030012200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 261042 267674 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012300.1"; gene_id "LTnewLTref_030012300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 261042 267674 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012300.1"; gene_id "LTnewLTref_030012300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 268469 277006 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012400.1"; gene_id "LTnewLTref_030012400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 268469 277006 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012400.1"; gene_id "LTnewLTref_030012400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 277796 278482 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012500.1"; gene_id "LTnewLTref_030012500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 277796 278482 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012500.1"; gene_id "LTnewLTref_030012500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 279040 281427 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_030012600.1"; gene_id "LTnewLTref_030012600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 279040 281427 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012600.1"; gene_id "LTnewLTref_030012600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 279040 282339 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012600.2"; gene_id "LTnewLTref_030012600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 279040 282339 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012600.2"; gene_id "LTnewLTref_030012600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 283924 285138 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012700.1"; gene_id "LTnewLTref_030012700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 283924 285138 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012700.1"; gene_id "LTnewLTref_030012700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 286036 286290 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012800.1"; gene_id "LTnewLTref_030012800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 286036 286290 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012800.1"; gene_id "LTnewLTref_030012800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 286968 289259 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030012900.1"; gene_id "LTnewLTref_030012900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 286968 289259 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030012900.1"; gene_id "LTnewLTref_030012900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 290096 291049 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013000.1"; gene_id "LTnewLTref_030013000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 290096 291049 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013000.1"; gene_id "LTnewLTref_030013000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 291798 293444 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013100.1"; gene_id "LTnewLTref_030013100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 291798 293444 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013100.1"; gene_id "LTnewLTref_030013100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 294319 303462 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013200.1"; gene_id "LTnewLTref_030013200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 294319 303462 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013200.1"; gene_id "LTnewLTref_030013200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 305146 306453 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013300.1"; gene_id "LTnewLTref_030013300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 305146 306453 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013300.1"; gene_id "LTnewLTref_030013300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 307311 314552 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013400.1"; gene_id "LTnewLTref_030013400" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 307311 314552 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013400.1"; gene_id "LTnewLTref_030013400"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 315747 318917 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013500.1"; gene_id "LTnewLTref_030013500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 315747 318917 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013500.1"; gene_id "LTnewLTref_030013500"; CM024325.1 . transcript 319629 328378 . - . transcript_id "LTnewLTref_030013600.1"; gene_id "LTnewLTref_030013600:pseudogene" CM024325.1 . exon 319629 328378 . - . transcript_id "LTnewLTref_030013600.1"; gene_id "LTnewLTref_030013600:pseudogene"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 329432 331288 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013700.1"; gene_id "LTnewLTref_030013700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 329432 331288 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013700.1"; gene_id "LTnewLTref_030013700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 333621 334808 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013800.1"; gene_id "LTnewLTref_030013800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 333621 334808 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013800.1"; gene_id "LTnewLTref_030013800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 335881 338790 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030013900.1"; gene_id "LTnewLTref_030013900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 335881 338790 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030013900.1"; gene_id "LTnewLTref_030013900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 339564 346682 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014000.1"; gene_id "LTnewLTref_030014000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 339564 346682 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014000.1"; gene_id "LTnewLTref_030014000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 347714 352339 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014100.1"; gene_id "LTnewLTref_030014100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 347714 352339 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014100.1"; gene_id "LTnewLTref_030014100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 353068 357228 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014200.1"; gene_id "LTnewLTref_030014200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 353068 357228 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014200.1"; gene_id "LTnewLTref_030014200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 358127 361636 0.87 - . transcript_id "LTnewLTref_030014300.1"; gene_id "LTnewLTref_030014300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 358127 361636 0.87 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014300.1"; gene_id "LTnewLTref_030014300"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 358127 364132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014300.2"; gene_id "LTnewLTref_030014300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 358127 364132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014300.2"; gene_id "LTnewLTref_030014300"; CM024325.1 . transcript 364884 367104 . - . transcript_id "LTnewLTref_030014400.1"; gene_id "LTnewLTref_030014400:pseudogene" CM024325.1 . exon 364884 367104 . - . transcript_id "LTnewLTref_030014400.1"; gene_id "LTnewLTref_030014400:pseudogene"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 369315 370439 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014500.1"; gene_id "LTnewLTref_030014500" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 369315 370439 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014500.1"; gene_id "LTnewLTref_030014500"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 371587 372378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014600.1"; gene_id "LTnewLTref_030014600" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 371587 372378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014600.1"; gene_id "LTnewLTref_030014600"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 373113 373769 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014700.1"; gene_id "LTnewLTref_030014700" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 373113 373769 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014700.1"; gene_id "LTnewLTref_030014700"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 374834 376927 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014800.1"; gene_id "LTnewLTref_030014800" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 374834 376927 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014800.1"; gene_id "LTnewLTref_030014800"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 377524 378510 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030014900.1"; gene_id "LTnewLTref_030014900" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 377524 378510 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030014900.1"; gene_id "LTnewLTref_030014900"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 380000 381907 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030015000.1"; gene_id "LTnewLTref_030015000" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 380000 381907 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030015000.1"; gene_id "LTnewLTref_030015000"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 382526 382840 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030015100.1"; gene_id "LTnewLTref_030015100" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 382526 382840 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030015100.1"; gene_id "LTnewLTref_030015100"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 383379 384443 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030015200.1"; gene_id "LTnewLTref_030015200" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 383379 384443 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030015200.1"; gene_id "LTnewLTref_030015200"; CM024325.1 AUGUSTUS transcript 385084 386325 1 - . transcript_id "LTnewLTref_030015300.1"; gene_id "LTnewLTref_030015300" CM024325.1 AUGUSTUS CDS 385084 386325 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_030015300.1"; gene_id "LTnewLTref_030015300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 645 845 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_040005000.1"; gene_id "LTnewLTref_040005000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 645 845 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005000.1"; gene_id "LTnewLTref_040005000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 5169 8240 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040005100.1"; gene_id "LTnewLTref_040005100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 5169 8240 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005100.1"; gene_id "LTnewLTref_040005100"; CM024326.1 . transcript 9355 11105 . + . transcript_id "LTnewLTref_040005200.1"; gene_id "LTnewLTref_040005200:pseudogene" CM024326.1 . exon 9355 9381 . + . transcript_id "LTnewLTref_040005200.1"; gene_id "LTnewLTref_040005200:pseudogene"; CM024326.1 . exon 9383 9601 . + . transcript_id "LTnewLTref_040005200.1"; gene_id "LTnewLTref_040005200:pseudogene"; CM024326.1 . exon 9604 9693 . + . transcript_id "LTnewLTref_040005200.1"; gene_id "LTnewLTref_040005200:pseudogene"; CM024326.1 . exon 9695 9808 . + . transcript_id "LTnewLTref_040005200.1"; gene_id "LTnewLTref_040005200:pseudogene"; CM024326.1 . exon 9810 11105 . + . transcript_id "LTnewLTref_040005200.1"; gene_id "LTnewLTref_040005200:pseudogene"; CM024326.1 . transcript 9827 10318 . - . transcript_id "LTnewLTref_040005300.1"; gene_id "LTnewLTref_040005300:pseudogene" CM024326.1 . exon 9827 10318 . - . transcript_id "LTnewLTref_040005300.1"; gene_id "LTnewLTref_040005300:pseudogene"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 10017 10217 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_040005400.1"; gene_id "LTnewLTref_040005400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 10017 10217 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005400.1"; gene_id "LTnewLTref_040005400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 10017 11258 0.38 + . transcript_id "LTnewLTref_040005400.2"; gene_id "LTnewLTref_040005400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 10017 10113 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005400.2"; gene_id "LTnewLTref_040005400"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 10219 11258 0.38 + 2 transcript_id "LTnewLTref_040005400.2"; gene_id "LTnewLTref_040005400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 10344 11258 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_040005400.3"; gene_id "LTnewLTref_040005400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 10344 11258 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005400.3"; gene_id "LTnewLTref_040005400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 13179 15422 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040005500.1"; gene_id "LTnewLTref_040005500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 13179 15422 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005500.1"; gene_id "LTnewLTref_040005500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 16410 16631 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040005600.1"; gene_id "LTnewLTref_040005600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 16410 16631 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005600.1"; gene_id "LTnewLTref_040005600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 17135 18454 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040005700.1"; gene_id "LTnewLTref_040005700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 17135 18454 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005700.1"; gene_id "LTnewLTref_040005700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 22565 23068 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040005800.1"; gene_id "LTnewLTref_040005800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 22565 23068 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005800.1"; gene_id "LTnewLTref_040005800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 24215 25804 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040005900.1"; gene_id "LTnewLTref_040005900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 24215 25804 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040005900.1"; gene_id "LTnewLTref_040005900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 27917 28705 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006000.1"; gene_id "LTnewLTref_040006000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 27917 28705 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006000.1"; gene_id "LTnewLTref_040006000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 29450 30187 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006100.1"; gene_id "LTnewLTref_040006100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 29450 30187 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006100.1"; gene_id "LTnewLTref_040006100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 30882 31358 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006200.1"; gene_id "LTnewLTref_040006200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 30882 31358 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006200.1"; gene_id "LTnewLTref_040006200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 32435 38053 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006300.1"; gene_id "LTnewLTref_040006300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 32435 38053 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006300.1"; gene_id "LTnewLTref_040006300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 39193 40926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006400.1"; gene_id "LTnewLTref_040006400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 39193 40926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006400.1"; gene_id "LTnewLTref_040006400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 42008 43051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006500.1"; gene_id "LTnewLTref_040006500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 42008 43051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006500.1"; gene_id "LTnewLTref_040006500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 43708 44706 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006600.1"; gene_id "LTnewLTref_040006600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 43708 44706 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006600.1"; gene_id "LTnewLTref_040006600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 45602 46078 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006700.1"; gene_id "LTnewLTref_040006700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 45602 46078 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006700.1"; gene_id "LTnewLTref_040006700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 47043 48347 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006800.1"; gene_id "LTnewLTref_040006800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 47043 48347 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006800.1"; gene_id "LTnewLTref_040006800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 48843 50420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040006900.1"; gene_id "LTnewLTref_040006900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 48843 50420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040006900.1"; gene_id "LTnewLTref_040006900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 52492 54006 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007000.1"; gene_id "LTnewLTref_040007000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 52492 54006 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007000.1"; gene_id "LTnewLTref_040007000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 54955 57084 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007100.1"; gene_id "LTnewLTref_040007100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 54955 57084 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007100.1"; gene_id "LTnewLTref_040007100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 58177 58725 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007200.1"; gene_id "LTnewLTref_040007200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 58177 58725 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007200.1"; gene_id "LTnewLTref_040007200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 60809 61672 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007300.1"; gene_id "LTnewLTref_040007300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 60809 61672 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007300.1"; gene_id "LTnewLTref_040007300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 64461 65525 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007400.1"; gene_id "LTnewLTref_040007400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 64461 65525 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007400.1"; gene_id "LTnewLTref_040007400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 67165 67935 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007500.1"; gene_id "LTnewLTref_040007500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 67165 67935 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007500.1"; gene_id "LTnewLTref_040007500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 69312 70184 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007600.1"; gene_id "LTnewLTref_040007600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 69312 70184 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007600.1"; gene_id "LTnewLTref_040007600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 72020 76420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007700.1"; gene_id "LTnewLTref_040007700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 72020 76420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007700.1"; gene_id "LTnewLTref_040007700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 77093 77899 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007800.1"; gene_id "LTnewLTref_040007800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 77093 77899 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007800.1"; gene_id "LTnewLTref_040007800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 78539 79981 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040007900.1"; gene_id "LTnewLTref_040007900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 78539 79981 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040007900.1"; gene_id "LTnewLTref_040007900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 80740 86622 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008000.1"; gene_id "LTnewLTref_040008000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 80740 86622 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008000.1"; gene_id "LTnewLTref_040008000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 88121 89464 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008100.1"; gene_id "LTnewLTref_040008100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 88121 89464 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008100.1"; gene_id "LTnewLTref_040008100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 90873 91847 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008200.1"; gene_id "LTnewLTref_040008200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 90873 91847 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008200.1"; gene_id "LTnewLTref_040008200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 92452 94383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008300.1"; gene_id "LTnewLTref_040008300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 92452 94383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008300.1"; gene_id "LTnewLTref_040008300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 95789 97219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008400.1"; gene_id "LTnewLTref_040008400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 95789 97219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008400.1"; gene_id "LTnewLTref_040008400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 98422 100986 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008500.1"; gene_id "LTnewLTref_040008500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 98422 100986 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008500.1"; gene_id "LTnewLTref_040008500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 101637 102191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008600.1"; gene_id "LTnewLTref_040008600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 101637 102191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008600.1"; gene_id "LTnewLTref_040008600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 104175 110582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008700.1"; gene_id "LTnewLTref_040008700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 104175 105660 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008700.1"; gene_id "LTnewLTref_040008700"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 105736 110582 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_040008700.1"; gene_id "LTnewLTref_040008700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 112255 112827 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008800.1"; gene_id "LTnewLTref_040008800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 112255 112827 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008800.1"; gene_id "LTnewLTref_040008800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 113893 114954 1 + . transcript_id "LTnewLTref_040008900.1"; gene_id "LTnewLTref_040008900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 113893 114954 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_040008900.1"; gene_id "LTnewLTref_040008900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 123963 124733 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009000.1"; gene_id "LTnewLTref_040009000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 123963 124733 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009000.1"; gene_id "LTnewLTref_040009000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 125918 126631 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_040009100.1"; gene_id "LTnewLTref_040009100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 125918 126216 0.97 - 2 transcript_id "LTnewLTref_040009100.1"; gene_id "LTnewLTref_040009100"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 126406 126631 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009100.1"; gene_id "LTnewLTref_040009100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 127673 128695 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009200.1"; gene_id "LTnewLTref_040009200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 127673 128695 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009200.1"; gene_id "LTnewLTref_040009200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 130198 133551 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009300.1"; gene_id "LTnewLTref_040009300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 130198 133551 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009300.1"; gene_id "LTnewLTref_040009300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 135857 136942 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009400.1"; gene_id "LTnewLTref_040009400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 135857 136942 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009400.1"; gene_id "LTnewLTref_040009400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 138242 150589 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009500.1"; gene_id "LTnewLTref_040009500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 138242 150589 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009500.1"; gene_id "LTnewLTref_040009500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 154096 158112 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009600.1"; gene_id "LTnewLTref_040009600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 154096 158112 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009600.1"; gene_id "LTnewLTref_040009600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 162686 165253 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009700.1"; gene_id "LTnewLTref_040009700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 162686 165253 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009700.1"; gene_id "LTnewLTref_040009700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 166911 167670 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009800.1"; gene_id "LTnewLTref_040009800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 166911 167524 1 - 2 transcript_id "LTnewLTref_040009800.1"; gene_id "LTnewLTref_040009800"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 167619 167670 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009800.1"; gene_id "LTnewLTref_040009800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 169236 170675 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040009900.1"; gene_id "LTnewLTref_040009900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 169236 170675 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040009900.1"; gene_id "LTnewLTref_040009900"; CM024326.1 . transcript 171421 174245 . - . transcript_id "LTnewLTref_040010000.1"; gene_id "LTnewLTref_040010000:pseudogene" CM024326.1 . exon 171421 174245 . - . transcript_id "LTnewLTref_040010000.1"; gene_id "LTnewLTref_040010000:pseudogene"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 175386 175952 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010100.1"; gene_id "LTnewLTref_040010100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 175386 175952 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010100.1"; gene_id "LTnewLTref_040010100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 176569 177141 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010200.1"; gene_id "LTnewLTref_040010200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 176569 177141 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010200.1"; gene_id "LTnewLTref_040010200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 178977 179933 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010300.1"; gene_id "LTnewLTref_040010300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 178977 179933 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010300.1"; gene_id "LTnewLTref_040010300"; CM024326.1 Liftoff transcript 180617 180859 . - . transcript_id "LTnewLTref_040010400.1"; gene_id "LTnewLTref_040010400" CM024326.1 Liftoff CDS 180617 180859 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010400.1"; gene_id "LTnewLTref_040010400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 180888 189929 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010500.1"; gene_id "LTnewLTref_040010500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 180888 189929 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010500.1"; gene_id "LTnewLTref_040010500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 193151 197890 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010600.1"; gene_id "LTnewLTref_040010600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 193151 197890 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010600.1"; gene_id "LTnewLTref_040010600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 199259 202462 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010700.1"; gene_id "LTnewLTref_040010700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 199259 202462 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010700.1"; gene_id "LTnewLTref_040010700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 203823 204866 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010800.1"; gene_id "LTnewLTref_040010800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 203823 204866 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010800.1"; gene_id "LTnewLTref_040010800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 207224 208990 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040010900.1"; gene_id "LTnewLTref_040010900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 207224 208990 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040010900.1"; gene_id "LTnewLTref_040010900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 210643 215295 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011000.1"; gene_id "LTnewLTref_040011000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 210643 215295 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011000.1"; gene_id "LTnewLTref_040011000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 221696 222625 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011100.1"; gene_id "LTnewLTref_040011100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 221696 222625 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011100.1"; gene_id "LTnewLTref_040011100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 223143 227849 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011200.1"; gene_id "LTnewLTref_040011200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 223143 227849 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011200.1"; gene_id "LTnewLTref_040011200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 229869 230771 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011300.1"; gene_id "LTnewLTref_040011300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 229869 230771 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011300.1"; gene_id "LTnewLTref_040011300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 232425 233228 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011400.1"; gene_id "LTnewLTref_040011400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 232425 233228 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011400.1"; gene_id "LTnewLTref_040011400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 234007 243339 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011500.1"; gene_id "LTnewLTref_040011500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 234007 243339 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011500.1"; gene_id "LTnewLTref_040011500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 245070 245573 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011600.1"; gene_id "LTnewLTref_040011600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 245070 245573 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011600.1"; gene_id "LTnewLTref_040011600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 246333 250199 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040011700.1"; gene_id "LTnewLTref_040011700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 246333 250199 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011700.1"; gene_id "LTnewLTref_040011700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 252649 252870 0.74 - . transcript_id "LTnewLTref_040011800.1"; gene_id "LTnewLTref_040011800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 252649 252870 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011800.1"; gene_id "LTnewLTref_040011800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 253480 254496 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_040011900.1"; gene_id "LTnewLTref_040011900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 253480 254496 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040011900.1"; gene_id "LTnewLTref_040011900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 255179 255781 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012000.1"; gene_id "LTnewLTref_040012000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 255179 255781 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012000.1"; gene_id "LTnewLTref_040012000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 257209 258195 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012100.1"; gene_id "LTnewLTref_040012100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 257209 258195 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012100.1"; gene_id "LTnewLTref_040012100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 259977 260489 0.4 - . transcript_id "LTnewLTref_040012200.1"; gene_id "LTnewLTref_040012200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 259977 260489 0.4 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012200.1"; gene_id "LTnewLTref_040012200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 259977 263702 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012200.2"; gene_id "LTnewLTref_040012200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 259977 263702 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012200.2"; gene_id "LTnewLTref_040012200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 264398 264847 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012300.1"; gene_id "LTnewLTref_040012300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 264398 264847 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012300.1"; gene_id "LTnewLTref_040012300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 266524 266982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012400.1"; gene_id "LTnewLTref_040012400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 266524 266982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012400.1"; gene_id "LTnewLTref_040012400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 268304 268750 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012500.1"; gene_id "LTnewLTref_040012500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 268304 268750 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012500.1"; gene_id "LTnewLTref_040012500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 270654 272912 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012600.1"; gene_id "LTnewLTref_040012600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 270654 272912 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012600.1"; gene_id "LTnewLTref_040012600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 274026 277301 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_040012700.1"; gene_id "LTnewLTref_040012700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 274026 277301 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012700.1"; gene_id "LTnewLTref_040012700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 278307 280691 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012800.1"; gene_id "LTnewLTref_040012800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 278307 280691 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012800.1"; gene_id "LTnewLTref_040012800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 284293 286461 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040012900.1"; gene_id "LTnewLTref_040012900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 284293 286461 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040012900.1"; gene_id "LTnewLTref_040012900"; CM024326.1 Liftoff transcript 286496 286784 . - . transcript_id "LTnewLTref_040013000.1"; gene_id "LTnewLTref_040013000" CM024326.1 Liftoff CDS 286496 286784 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013000.1"; gene_id "LTnewLTref_040013000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 287547 289457 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013100.1"; gene_id "LTnewLTref_040013100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 287547 289457 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013100.1"; gene_id "LTnewLTref_040013100"; CM024326.1 Liftoff transcript 290068 292515 . - . transcript_id "LTnewLTref_040013200.1"; gene_id "LTnewLTref_040013200" CM024326.1 Liftoff CDS 290068 292515 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013200.1"; gene_id "LTnewLTref_040013200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 293376 294017 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013300.1"; gene_id "LTnewLTref_040013300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 293376 294017 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013300.1"; gene_id "LTnewLTref_040013300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 295075 295593 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013400.1"; gene_id "LTnewLTref_040013400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 295075 295593 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013400.1"; gene_id "LTnewLTref_040013400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 295075 295806 0.82 - . transcript_id "LTnewLTref_040013400.2"; gene_id "LTnewLTref_040013400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 295075 295572 0.82 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013400.2"; gene_id "LTnewLTref_040013400"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 295798 295806 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013400.2"; gene_id "LTnewLTref_040013400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 296856 297374 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013500.1"; gene_id "LTnewLTref_040013500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 296856 297374 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013500.1"; gene_id "LTnewLTref_040013500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 298066 299787 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013600.1"; gene_id "LTnewLTref_040013600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 298066 299787 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013600.1"; gene_id "LTnewLTref_040013600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 300789 304193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013700.1"; gene_id "LTnewLTref_040013700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 300789 304193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013700.1"; gene_id "LTnewLTref_040013700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 305630 306550 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013800.1"; gene_id "LTnewLTref_040013800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 305630 306550 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013800.1"; gene_id "LTnewLTref_040013800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 307630 309645 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040013900.1"; gene_id "LTnewLTref_040013900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 307630 309645 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040013900.1"; gene_id "LTnewLTref_040013900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 310348 311574 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014000.1"; gene_id "LTnewLTref_040014000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 310348 311574 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014000.1"; gene_id "LTnewLTref_040014000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 312494 316669 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014100.1"; gene_id "LTnewLTref_040014100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 312494 316669 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014100.1"; gene_id "LTnewLTref_040014100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 317949 320585 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014200.1"; gene_id "LTnewLTref_040014200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 317949 320585 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014200.1"; gene_id "LTnewLTref_040014200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 322050 323240 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014300.1"; gene_id "LTnewLTref_040014300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 322050 323240 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014300.1"; gene_id "LTnewLTref_040014300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 323985 324647 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014400.1"; gene_id "LTnewLTref_040014400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 323985 324647 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014400.1"; gene_id "LTnewLTref_040014400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 328305 332021 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014500.1"; gene_id "LTnewLTref_040014500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 328305 332021 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014500.1"; gene_id "LTnewLTref_040014500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 333803 334327 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014600.1"; gene_id "LTnewLTref_040014600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 333803 334327 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014600.1"; gene_id "LTnewLTref_040014600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 336210 340037 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014700.1"; gene_id "LTnewLTref_040014700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 336210 340037 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014700.1"; gene_id "LTnewLTref_040014700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 341441 347065 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014800.1"; gene_id "LTnewLTref_040014800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 341441 347065 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014800.1"; gene_id "LTnewLTref_040014800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 349295 350041 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040014900.1"; gene_id "LTnewLTref_040014900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 349295 350041 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040014900.1"; gene_id "LTnewLTref_040014900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 351615 353404 0.42 - . transcript_id "LTnewLTref_040015000.1"; gene_id "LTnewLTref_040015000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 351615 352287 0.49 - 1 transcript_id "LTnewLTref_040015000.1"; gene_id "LTnewLTref_040015000"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 352338 353404 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015000.1"; gene_id "LTnewLTref_040015000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 355775 356221 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015100.1"; gene_id "LTnewLTref_040015100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 355775 356221 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015100.1"; gene_id "LTnewLTref_040015100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 358085 359566 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015200.1"; gene_id "LTnewLTref_040015200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 358085 359566 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015200.1"; gene_id "LTnewLTref_040015200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 361046 361687 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015300.1"; gene_id "LTnewLTref_040015300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 361046 361687 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015300.1"; gene_id "LTnewLTref_040015300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 362590 363219 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015400.1"; gene_id "LTnewLTref_040015400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 362590 363219 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015400.1"; gene_id "LTnewLTref_040015400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 364138 365703 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015500.1"; gene_id "LTnewLTref_040015500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 364138 365703 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015500.1"; gene_id "LTnewLTref_040015500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 366491 367936 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015600.1"; gene_id "LTnewLTref_040015600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 366491 367936 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015600.1"; gene_id "LTnewLTref_040015600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 368468 372193 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015700.1"; gene_id "LTnewLTref_040015700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 368468 372193 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015700.1"; gene_id "LTnewLTref_040015700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 372868 373725 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015800.1"; gene_id "LTnewLTref_040015800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 372868 373725 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015800.1"; gene_id "LTnewLTref_040015800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 374669 378205 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040015900.1"; gene_id "LTnewLTref_040015900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 374669 378205 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040015900.1"; gene_id "LTnewLTref_040015900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 379786 380454 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016000.1"; gene_id "LTnewLTref_040016000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 379786 380454 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016000.1"; gene_id "LTnewLTref_040016000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 381880 382464 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016100.1"; gene_id "LTnewLTref_040016100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 381880 382464 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016100.1"; gene_id "LTnewLTref_040016100"; CM024326.1 . transcript 384601 385560 . - . transcript_id "LTnewLTref_040016200.1"; gene_id "LTnewLTref_040016200:pseudogene" CM024326.1 . exon 384601 385560 . - . transcript_id "LTnewLTref_040016200.1"; gene_id "LTnewLTref_040016200:pseudogene"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 387516 388586 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016300.1"; gene_id "LTnewLTref_040016300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 387516 388586 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016300.1"; gene_id "LTnewLTref_040016300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 389754 391211 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016400.1"; gene_id "LTnewLTref_040016400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 389754 391211 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016400.1"; gene_id "LTnewLTref_040016400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 391683 392072 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016500.1"; gene_id "LTnewLTref_040016500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 391683 392072 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016500.1"; gene_id "LTnewLTref_040016500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 392836 395466 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016600.1"; gene_id "LTnewLTref_040016600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 392836 395466 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016600.1"; gene_id "LTnewLTref_040016600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 396292 397245 0.67 - . transcript_id "LTnewLTref_040016700.1"; gene_id "LTnewLTref_040016700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 396292 397245 0.67 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016700.1"; gene_id "LTnewLTref_040016700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 396292 400707 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016700.2"; gene_id "LTnewLTref_040016700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 396292 400707 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016700.2"; gene_id "LTnewLTref_040016700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 402248 402577 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016800.1"; gene_id "LTnewLTref_040016800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 402248 402577 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016800.1"; gene_id "LTnewLTref_040016800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 403187 406060 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040016900.1"; gene_id "LTnewLTref_040016900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 403187 406060 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040016900.1"; gene_id "LTnewLTref_040016900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 407965 410145 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017000.1"; gene_id "LTnewLTref_040017000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 407965 410145 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017000.1"; gene_id "LTnewLTref_040017000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 411149 412081 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017100.1"; gene_id "LTnewLTref_040017100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 411149 412081 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017100.1"; gene_id "LTnewLTref_040017100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 412900 413802 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017200.1"; gene_id "LTnewLTref_040017200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 412900 413802 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017200.1"; gene_id "LTnewLTref_040017200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 414506 415012 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017300.1"; gene_id "LTnewLTref_040017300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 414506 415012 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017300.1"; gene_id "LTnewLTref_040017300"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 417196 418251 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017400.1"; gene_id "LTnewLTref_040017400" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 417196 418251 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017400.1"; gene_id "LTnewLTref_040017400"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 419007 419721 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_040017500.1"; gene_id "LTnewLTref_040017500" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 419007 419085 0.97 - 1 transcript_id "LTnewLTref_040017500.1"; gene_id "LTnewLTref_040017500"; CM024326.1 AUGUSTUS CDS 419168 419721 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017500.1"; gene_id "LTnewLTref_040017500"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 429721 430656 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017600.1"; gene_id "LTnewLTref_040017600" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 429721 430656 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017600.1"; gene_id "LTnewLTref_040017600"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 433499 441283 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017700.1"; gene_id "LTnewLTref_040017700" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 433499 441283 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017700.1"; gene_id "LTnewLTref_040017700"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 442544 444115 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017800.1"; gene_id "LTnewLTref_040017800" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 442544 444115 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017800.1"; gene_id "LTnewLTref_040017800"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 444952 445515 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040017900.1"; gene_id "LTnewLTref_040017900" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 444952 445515 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040017900.1"; gene_id "LTnewLTref_040017900"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 446481 446741 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040018000.1"; gene_id "LTnewLTref_040018000" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 446481 446741 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040018000.1"; gene_id "LTnewLTref_040018000"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 450292 451398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040018100.1"; gene_id "LTnewLTref_040018100" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 450292 451398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040018100.1"; gene_id "LTnewLTref_040018100"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 452375 455560 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040018200.1"; gene_id "LTnewLTref_040018200" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 452375 455560 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040018200.1"; gene_id "LTnewLTref_040018200"; CM024326.1 AUGUSTUS transcript 456744 457874 1 - . transcript_id "LTnewLTref_040018300.1"; gene_id "LTnewLTref_040018300" CM024326.1 AUGUSTUS CDS 456744 457874 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_040018300.1"; gene_id "LTnewLTref_040018300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 7204 9951 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005000.1"; gene_id "LTnewLTref_050005000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 7204 9951 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005000.1"; gene_id "LTnewLTref_050005000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 10410 10829 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005100.1"; gene_id "LTnewLTref_050005100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 10410 10829 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005100.1"; gene_id "LTnewLTref_050005100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 11357 11944 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005200.1"; gene_id "LTnewLTref_050005200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 11357 11944 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005200.1"; gene_id "LTnewLTref_050005200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 13052 14797 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005300.1"; gene_id "LTnewLTref_050005300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 13052 14797 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005300.1"; gene_id "LTnewLTref_050005300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 15980 18481 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005400.1"; gene_id "LTnewLTref_050005400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 15980 18481 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005400.1"; gene_id "LTnewLTref_050005400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 19709 22210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005500.1"; gene_id "LTnewLTref_050005500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 19709 22210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005500.1"; gene_id "LTnewLTref_050005500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 24285 24560 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005600.1"; gene_id "LTnewLTref_050005600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 24285 24560 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005600.1"; gene_id "LTnewLTref_050005600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 25496 26101 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005700.1"; gene_id "LTnewLTref_050005700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 25496 26101 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005700.1"; gene_id "LTnewLTref_050005700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 27424 27963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005800.1"; gene_id "LTnewLTref_050005800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 27424 27963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005800.1"; gene_id "LTnewLTref_050005800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 29812 31725 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050005900.1"; gene_id "LTnewLTref_050005900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 29812 31725 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050005900.1"; gene_id "LTnewLTref_050005900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 35242 35613 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006000.1"; gene_id "LTnewLTref_050006000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 35242 35613 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006000.1"; gene_id "LTnewLTref_050006000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 36616 37632 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006100.1"; gene_id "LTnewLTref_050006100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 36616 37632 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006100.1"; gene_id "LTnewLTref_050006100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 39272 40570 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006200.1"; gene_id "LTnewLTref_050006200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 39272 40570 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006200.1"; gene_id "LTnewLTref_050006200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 43403 45439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006300.1"; gene_id "LTnewLTref_050006300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 43403 45439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006300.1"; gene_id "LTnewLTref_050006300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 47069 48394 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006400.1"; gene_id "LTnewLTref_050006400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 47069 48394 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006400.1"; gene_id "LTnewLTref_050006400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 49467 51008 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006500.1"; gene_id "LTnewLTref_050006500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 49467 51008 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006500.1"; gene_id "LTnewLTref_050006500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 51523 53793 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006600.1"; gene_id "LTnewLTref_050006600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 51523 53793 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006600.1"; gene_id "LTnewLTref_050006600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 55206 56639 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006700.1"; gene_id "LTnewLTref_050006700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 55206 56639 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006700.1"; gene_id "LTnewLTref_050006700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 58180 59253 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006800.1"; gene_id "LTnewLTref_050006800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 58180 59253 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006800.1"; gene_id "LTnewLTref_050006800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 60149 62509 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050006900.1"; gene_id "LTnewLTref_050006900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 60149 62509 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050006900.1"; gene_id "LTnewLTref_050006900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 63715 68202 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050007000.1"; gene_id "LTnewLTref_050007000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 63715 68202 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007000.1"; gene_id "LTnewLTref_050007000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 69137 71800 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050007100.1"; gene_id "LTnewLTref_050007100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 69137 71800 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007100.1"; gene_id "LTnewLTref_050007100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 76104 78053 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050007200.1"; gene_id "LTnewLTref_050007200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 76104 78053 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007200.1"; gene_id "LTnewLTref_050007200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 79440 80595 0.76 + . transcript_id "LTnewLTref_050007300.1"; gene_id "LTnewLTref_050007300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 79440 80379 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007300.1"; gene_id "LTnewLTref_050007300"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 80501 80595 0.76 + 2 transcript_id "LTnewLTref_050007300.1"; gene_id "LTnewLTref_050007300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 79749 80595 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_050007300.2"; gene_id "LTnewLTref_050007300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 79749 80379 0.84 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007300.2"; gene_id "LTnewLTref_050007300"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 80501 80595 0.75 + 2 transcript_id "LTnewLTref_050007300.2"; gene_id "LTnewLTref_050007300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 82571 83544 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_050007400.1"; gene_id "LTnewLTref_050007400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 82571 83432 0.78 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007400.1"; gene_id "LTnewLTref_050007400"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 83501 83544 0.62 + 2 transcript_id "LTnewLTref_050007400.1"; gene_id "LTnewLTref_050007400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 82670 83544 0.41 + . transcript_id "LTnewLTref_050007400.2"; gene_id "LTnewLTref_050007400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 82670 83432 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007400.2"; gene_id "LTnewLTref_050007400"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 83501 83544 0.57 + 2 transcript_id "LTnewLTref_050007400.2"; gene_id "LTnewLTref_050007400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 83586 86641 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_050007500.1"; gene_id "LTnewLTref_050007500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 83586 85784 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007500.1"; gene_id "LTnewLTref_050007500"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 85829 86641 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007500.1"; gene_id "LTnewLTref_050007500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 86694 87883 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_050007600.1"; gene_id "LTnewLTref_050007600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 86694 86837 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007600.1"; gene_id "LTnewLTref_050007600"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 86924 87883 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007600.1"; gene_id "LTnewLTref_050007600"; CM024327.1 Liftoff transcript 89662 91804 . + . transcript_id "LTnewLTref_050007700.1"; gene_id "LTnewLTref_050007700" CM024327.1 Liftoff CDS 89662 89906 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007700.1"; gene_id "LTnewLTref_050007700"; CM024327.1 Liftoff CDS 90649 91804 . + 1 transcript_id "LTnewLTref_050007700.1"; gene_id "LTnewLTref_050007700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 92812 93774 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050007800.1"; gene_id "LTnewLTref_050007800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 92812 93774 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007800.1"; gene_id "LTnewLTref_050007800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 94397 95071 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050007900.1"; gene_id "LTnewLTref_050007900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 94397 95071 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050007900.1"; gene_id "LTnewLTref_050007900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 96891 97412 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008000.1"; gene_id "LTnewLTref_050008000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 96891 97412 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008000.1"; gene_id "LTnewLTref_050008000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 98916 100373 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008100.1"; gene_id "LTnewLTref_050008100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 98916 100373 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008100.1"; gene_id "LTnewLTref_050008100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 101211 103256 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008200.1"; gene_id "LTnewLTref_050008200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 101211 103256 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008200.1"; gene_id "LTnewLTref_050008200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 103935 104477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008300.1"; gene_id "LTnewLTref_050008300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 103935 104477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008300.1"; gene_id "LTnewLTref_050008300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 105835 108819 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008400.1"; gene_id "LTnewLTref_050008400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 105835 108819 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008400.1"; gene_id "LTnewLTref_050008400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 109622 110737 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008500.1"; gene_id "LTnewLTref_050008500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 109622 110737 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008500.1"; gene_id "LTnewLTref_050008500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 112135 113610 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008600.1"; gene_id "LTnewLTref_050008600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 112135 113610 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008600.1"; gene_id "LTnewLTref_050008600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 114552 116429 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008700.1"; gene_id "LTnewLTref_050008700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 114552 116429 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008700.1"; gene_id "LTnewLTref_050008700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 117308 118294 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050008800.1"; gene_id "LTnewLTref_050008800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 117308 118294 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008800.1"; gene_id "LTnewLTref_050008800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 120508 123170 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_050008900.1"; gene_id "LTnewLTref_050008900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 120508 123003 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008900.1"; gene_id "LTnewLTref_050008900"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 123072 123170 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050008900.1"; gene_id "LTnewLTref_050008900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 123928 125833 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_050009000.1"; gene_id "LTnewLTref_050009000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 123928 124143 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009000.1"; gene_id "LTnewLTref_050009000"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 124190 125833 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009000.1"; gene_id "LTnewLTref_050009000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 125866 126597 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009100.1"; gene_id "LTnewLTref_050009100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 125866 126597 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009100.1"; gene_id "LTnewLTref_050009100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 134588 136957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009200.1"; gene_id "LTnewLTref_050009200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 134588 136957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009200.1"; gene_id "LTnewLTref_050009200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 138990 142619 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009300.1"; gene_id "LTnewLTref_050009300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 138990 142619 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009300.1"; gene_id "LTnewLTref_050009300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 143608 146349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009400.1"; gene_id "LTnewLTref_050009400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 143608 146349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009400.1"; gene_id "LTnewLTref_050009400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 147383 147718 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009500.1"; gene_id "LTnewLTref_050009500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 147383 147718 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009500.1"; gene_id "LTnewLTref_050009500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 149790 150126 0.79 + . transcript_id "LTnewLTref_050009600.1"; gene_id "LTnewLTref_050009600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 149790 149922 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009600.1"; gene_id "LTnewLTref_050009600"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 149969 150126 0.79 + 2 transcript_id "LTnewLTref_050009600.1"; gene_id "LTnewLTref_050009600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 150417 152435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009700.1"; gene_id "LTnewLTref_050009700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 150417 152435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009700.1"; gene_id "LTnewLTref_050009700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 152982 155537 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009800.1"; gene_id "LTnewLTref_050009800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 152982 155537 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009800.1"; gene_id "LTnewLTref_050009800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 156829 157419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050009900.1"; gene_id "LTnewLTref_050009900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 156829 157419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050009900.1"; gene_id "LTnewLTref_050009900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 158285 160168 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010000.1"; gene_id "LTnewLTref_050010000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 158285 160168 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010000.1"; gene_id "LTnewLTref_050010000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 161664 162392 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010100.1"; gene_id "LTnewLTref_050010100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 161664 162392 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010100.1"; gene_id "LTnewLTref_050010100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 163394 165109 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010200.1"; gene_id "LTnewLTref_050010200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 163394 165109 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010200.1"; gene_id "LTnewLTref_050010200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 169576 170079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010300.1"; gene_id "LTnewLTref_050010300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 169576 170079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010300.1"; gene_id "LTnewLTref_050010300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 171896 173620 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010400.1"; gene_id "LTnewLTref_050010400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 171896 173620 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010400.1"; gene_id "LTnewLTref_050010400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 175032 176756 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010500.1"; gene_id "LTnewLTref_050010500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 175032 176756 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010500.1"; gene_id "LTnewLTref_050010500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 178142 179952 0.86 + . transcript_id "LTnewLTref_050010600.1"; gene_id "LTnewLTref_050010600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 178142 178328 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010600.1"; gene_id "LTnewLTref_050010600"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 178415 179952 0.86 + 2 transcript_id "LTnewLTref_050010600.1"; gene_id "LTnewLTref_050010600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 182547 183569 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010700.1"; gene_id "LTnewLTref_050010700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 182547 183569 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010700.1"; gene_id "LTnewLTref_050010700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 184383 190664 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010800.1"; gene_id "LTnewLTref_050010800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 184383 190664 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010800.1"; gene_id "LTnewLTref_050010800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 191293 191700 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050010900.1"; gene_id "LTnewLTref_050010900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 191293 191700 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050010900.1"; gene_id "LTnewLTref_050010900"; CM024327.1 . transcript 193067 194082 . + . transcript_id "LTnewLTref_050011000.1"; gene_id "LTnewLTref_050011000:pseudogene" CM024327.1 . exon 193067 194082 . + . transcript_id "LTnewLTref_050011000.1"; gene_id "LTnewLTref_050011000:pseudogene"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 195396 196655 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011100.1"; gene_id "LTnewLTref_050011100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 195396 196655 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011100.1"; gene_id "LTnewLTref_050011100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 198319 199551 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011200.1"; gene_id "LTnewLTref_050011200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 198319 199551 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011200.1"; gene_id "LTnewLTref_050011200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 200684 203023 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011300.1"; gene_id "LTnewLTref_050011300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 200684 203023 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011300.1"; gene_id "LTnewLTref_050011300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 205461 208481 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011400.1"; gene_id "LTnewLTref_050011400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 205461 208481 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011400.1"; gene_id "LTnewLTref_050011400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 209127 211841 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011500.1"; gene_id "LTnewLTref_050011500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 209127 211841 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011500.1"; gene_id "LTnewLTref_050011500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 212609 215536 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011600.1"; gene_id "LTnewLTref_050011600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 212609 215536 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011600.1"; gene_id "LTnewLTref_050011600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 216484 219162 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011700.1"; gene_id "LTnewLTref_050011700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 216484 219162 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011700.1"; gene_id "LTnewLTref_050011700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 220078 223755 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050011800.1"; gene_id "LTnewLTref_050011800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 220078 223755 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011800.1"; gene_id "LTnewLTref_050011800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 224637 230353 0.58 + . transcript_id "LTnewLTref_050011900.1"; gene_id "LTnewLTref_050011900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 224637 224705 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011900.1"; gene_id "LTnewLTref_050011900"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 224759 230353 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050011900.1"; gene_id "LTnewLTref_050011900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 231649 234366 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012000.1"; gene_id "LTnewLTref_050012000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 231649 234366 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012000.1"; gene_id "LTnewLTref_050012000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 236963 237934 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012100.1"; gene_id "LTnewLTref_050012100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 236963 237934 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012100.1"; gene_id "LTnewLTref_050012100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 238947 246422 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012200.1"; gene_id "LTnewLTref_050012200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 238947 246422 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012200.1"; gene_id "LTnewLTref_050012200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 248415 249455 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012300.1"; gene_id "LTnewLTref_050012300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 248415 249455 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012300.1"; gene_id "LTnewLTref_050012300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 250432 258624 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012400.1"; gene_id "LTnewLTref_050012400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 250432 258624 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012400.1"; gene_id "LTnewLTref_050012400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 257266 258624 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_050012400.2"; gene_id "LTnewLTref_050012400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 257266 258624 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012400.2"; gene_id "LTnewLTref_050012400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 261280 266577 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012500.1"; gene_id "LTnewLTref_050012500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 261280 266577 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012500.1"; gene_id "LTnewLTref_050012500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 269835 273986 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012600.1"; gene_id "LTnewLTref_050012600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 269835 273986 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012600.1"; gene_id "LTnewLTref_050012600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 276194 280252 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012700.1"; gene_id "LTnewLTref_050012700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 276194 280252 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012700.1"; gene_id "LTnewLTref_050012700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 281898 284114 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012800.1"; gene_id "LTnewLTref_050012800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 281898 284114 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012800.1"; gene_id "LTnewLTref_050012800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 285955 287049 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050012900.1"; gene_id "LTnewLTref_050012900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 285955 287049 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050012900.1"; gene_id "LTnewLTref_050012900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 288295 290769 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013000.1"; gene_id "LTnewLTref_050013000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 288295 290769 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013000.1"; gene_id "LTnewLTref_050013000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 291808 296400 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013100.1"; gene_id "LTnewLTref_050013100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 291808 296400 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013100.1"; gene_id "LTnewLTref_050013100"; CM024327.1 Liftoff transcript 296665 296843 . + . transcript_id "LTnewLTref_050013200.1"; gene_id "LTnewLTref_050013200" CM024327.1 Liftoff CDS 296665 296843 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013200.1"; gene_id "LTnewLTref_050013200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 298240 302385 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013300.1"; gene_id "LTnewLTref_050013300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 298240 302385 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013300.1"; gene_id "LTnewLTref_050013300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 303838 304281 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013400.1"; gene_id "LTnewLTref_050013400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 303838 304281 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013400.1"; gene_id "LTnewLTref_050013400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 306326 307489 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013500.1"; gene_id "LTnewLTref_050013500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 306326 307489 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013500.1"; gene_id "LTnewLTref_050013500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 308119 309450 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013600.1"; gene_id "LTnewLTref_050013600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 308119 309450 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013600.1"; gene_id "LTnewLTref_050013600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 310246 310737 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013700.1"; gene_id "LTnewLTref_050013700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 310246 310737 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013700.1"; gene_id "LTnewLTref_050013700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 311614 314439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013800.1"; gene_id "LTnewLTref_050013800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 311614 314439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013800.1"; gene_id "LTnewLTref_050013800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 315516 316436 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050013900.1"; gene_id "LTnewLTref_050013900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 315516 316436 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050013900.1"; gene_id "LTnewLTref_050013900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 319489 323757 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014000.1"; gene_id "LTnewLTref_050014000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 319489 323757 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014000.1"; gene_id "LTnewLTref_050014000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 325093 327073 0.65 + . transcript_id "LTnewLTref_050014100.1"; gene_id "LTnewLTref_050014100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 325093 325226 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014100.1"; gene_id "LTnewLTref_050014100"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 325297 327073 0.84 + 1 transcript_id "LTnewLTref_050014100.1"; gene_id "LTnewLTref_050014100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 328150 328617 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014200.1"; gene_id "LTnewLTref_050014200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 328150 328617 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014200.1"; gene_id "LTnewLTref_050014200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 329712 335525 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014300.1"; gene_id "LTnewLTref_050014300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 329712 335525 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014300.1"; gene_id "LTnewLTref_050014300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 334380 335525 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050014300.2"; gene_id "LTnewLTref_050014300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 334380 335525 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014300.2"; gene_id "LTnewLTref_050014300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 336470 337087 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014400.1"; gene_id "LTnewLTref_050014400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 336470 337087 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014400.1"; gene_id "LTnewLTref_050014400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 338296 344235 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014500.1"; gene_id "LTnewLTref_050014500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 338296 344235 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014500.1"; gene_id "LTnewLTref_050014500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 345331 346191 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014600.1"; gene_id "LTnewLTref_050014600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 345331 346191 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014600.1"; gene_id "LTnewLTref_050014600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 348004 351303 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014700.1"; gene_id "LTnewLTref_050014700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 348004 351303 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014700.1"; gene_id "LTnewLTref_050014700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 351819 355085 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014800.1"; gene_id "LTnewLTref_050014800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 351819 355085 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014800.1"; gene_id "LTnewLTref_050014800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 357223 358605 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050014900.1"; gene_id "LTnewLTref_050014900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 357223 358605 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050014900.1"; gene_id "LTnewLTref_050014900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 359581 363534 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050015000.1"; gene_id "LTnewLTref_050015000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 359581 363534 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050015000.1"; gene_id "LTnewLTref_050015000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 365878 368601 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050015100.1"; gene_id "LTnewLTref_050015100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 365878 368601 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050015100.1"; gene_id "LTnewLTref_050015100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 369851 371890 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050015200.1"; gene_id "LTnewLTref_050015200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 369851 371890 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050015200.1"; gene_id "LTnewLTref_050015200"; CM024327.1 Aragorn_1.2.36 transcript 374011 374082 . + . transcript_id "LTnewLTref_050015300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_050015300" CM024327.1 Aragorn_1.2.36 exon 374011 374082 . + . transcript_id "LTnewLTref_050015300:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_050015300"; CM024327.1 INFERNAL transcript 374143 374249 55.1 + . transcript_id "LTnewLTref_050015400:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_050015400" CM024327.1 INFERNAL exon 374143 374249 . + . transcript_id "LTnewLTref_050015400:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_050015400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 376959 377297 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_050015500.1"; gene_id "LTnewLTref_050015500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 376959 377297 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050015500.1"; gene_id "LTnewLTref_050015500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 382758 383870 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050015600.1"; gene_id "LTnewLTref_050015600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 382758 383870 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050015600.1"; gene_id "LTnewLTref_050015600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 385365 386819 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050015700.1"; gene_id "LTnewLTref_050015700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 385365 386819 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050015700.1"; gene_id "LTnewLTref_050015700"; CM024327.1 . transcript 387503 387775 . - . transcript_id "LTnewLTref_050015800.1"; gene_id "LTnewLTref_050015800:pseudogene" CM024327.1 . exon 387503 387775 . - . transcript_id "LTnewLTref_050015800.1"; gene_id "LTnewLTref_050015800:pseudogene"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 389532 389843 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050015900.1"; gene_id "LTnewLTref_050015900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 389532 389843 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050015900.1"; gene_id "LTnewLTref_050015900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 390690 392534 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050016000.1"; gene_id "LTnewLTref_050016000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 390690 392534 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050016000.1"; gene_id "LTnewLTref_050016000"; CM024327.1 Liftoff transcript 393513 396332 . - . transcript_id "LTnewLTref_050016100.1"; gene_id "LTnewLTref_050016100" CM024327.1 Liftoff CDS 393513 396332 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_050016100.1"; gene_id "LTnewLTref_050016100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 396794 397231 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050016200.1"; gene_id "LTnewLTref_050016200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 396794 397231 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050016200.1"; gene_id "LTnewLTref_050016200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 397726 398799 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050016300.1"; gene_id "LTnewLTref_050016300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 397726 398799 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050016300.1"; gene_id "LTnewLTref_050016300"; CM024327.1 . transcript 400259 401590 . + . transcript_id "LTnewLTref_050016400.1"; gene_id "LTnewLTref_050016400" CM024327.1 . CDS 400259 401590 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_050016400.1"; gene_id "LTnewLTref_050016400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 402533 403969 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050016500.1"; gene_id "LTnewLTref_050016500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 402533 403969 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050016500.1"; gene_id "LTnewLTref_050016500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 404782 406332 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050016600.1"; gene_id "LTnewLTref_050016600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 404782 406332 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050016600.1"; gene_id "LTnewLTref_050016600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 407687 409867 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050016700.1"; gene_id "LTnewLTref_050016700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 407687 409867 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050016700.1"; gene_id "LTnewLTref_050016700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 412422 414146 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050016800.1"; gene_id "LTnewLTref_050016800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 412422 414146 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050016800.1"; gene_id "LTnewLTref_050016800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 416677 417414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050016900.1"; gene_id "LTnewLTref_050016900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 416677 417414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050016900.1"; gene_id "LTnewLTref_050016900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 421329 425060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050017000.1"; gene_id "LTnewLTref_050017000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 421329 425060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050017000.1"; gene_id "LTnewLTref_050017000"; CM024327.1 . transcript 426974 427329 . + . transcript_id "LTnewLTref_050017100.1"; gene_id "LTnewLTref_050017100:pseudogene" CM024327.1 . exon 426974 427329 . + . transcript_id "LTnewLTref_050017100.1"; gene_id "LTnewLTref_050017100:pseudogene"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 428344 428682 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050017200.1"; gene_id "LTnewLTref_050017200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 428344 428682 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050017200.1"; gene_id "LTnewLTref_050017200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 429756 429986 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_050017300.1"; gene_id "LTnewLTref_050017300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 429756 429986 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017300.1"; gene_id "LTnewLTref_050017300"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 431594 433120 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050017400.1"; gene_id "LTnewLTref_050017400" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 431594 433120 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017400.1"; gene_id "LTnewLTref_050017400"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 433910 434983 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050017500.1"; gene_id "LTnewLTref_050017500" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 433910 434983 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017500.1"; gene_id "LTnewLTref_050017500"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 435748 438499 0.46 - . transcript_id "LTnewLTref_050017600.1"; gene_id "LTnewLTref_050017600" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 435748 437316 0.46 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017600.1"; gene_id "LTnewLTref_050017600"; CM024327.1 AUGUSTUS CDS 437450 438499 0.49 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017600.1"; gene_id "LTnewLTref_050017600"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 439528 440022 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050017700.1"; gene_id "LTnewLTref_050017700" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 439528 440022 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017700.1"; gene_id "LTnewLTref_050017700"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 440939 441688 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050017800.1"; gene_id "LTnewLTref_050017800" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 440939 441688 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017800.1"; gene_id "LTnewLTref_050017800"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 442247 443818 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050017900.1"; gene_id "LTnewLTref_050017900" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 442247 443818 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050017900.1"; gene_id "LTnewLTref_050017900"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 445627 451479 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050018000.1"; gene_id "LTnewLTref_050018000" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 445627 451479 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050018000.1"; gene_id "LTnewLTref_050018000"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 451866 452264 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050018100.1"; gene_id "LTnewLTref_050018100" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 451866 452264 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050018100.1"; gene_id "LTnewLTref_050018100"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 453256 454446 1 - . transcript_id "LTnewLTref_050018200.1"; gene_id "LTnewLTref_050018200" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 453256 454446 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_050018200.1"; gene_id "LTnewLTref_050018200"; CM024327.1 AUGUSTUS transcript 456841 457695 1 + . transcript_id "LTnewLTref_050018300.1"; gene_id "LTnewLTref_050018300" CM024327.1 AUGUSTUS CDS 456841 457695 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_050018300.1"; gene_id "LTnewLTref_050018300"; CM024327.1 INFERNAL transcript 463450 463522 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050018400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018400" CM024327.1 INFERNAL exon 463450 463522 . + . transcript_id "LTnewLTref_050018400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018400"; CM024327.1 INFERNAL transcript 463621 463709 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050018500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018500" CM024327.1 INFERNAL exon 463621 463709 . + . transcript_id "LTnewLTref_050018500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018500"; CM024327.1 INFERNAL transcript 463806 464091 83.3 + . transcript_id "LTnewLTref_050018600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018600" CM024327.1 INFERNAL exon 463806 464091 . + . transcript_id "LTnewLTref_050018600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018600"; CM024327.1 INFERNAL transcript 464908 464980 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050018700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018700" CM024327.1 INFERNAL exon 464908 464980 . + . transcript_id "LTnewLTref_050018700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018700"; CM024327.1 INFERNAL transcript 465079 465167 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050018800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018800" CM024327.1 INFERNAL exon 465079 465167 . + . transcript_id "LTnewLTref_050018800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018800"; CM024327.1 INFERNAL transcript 465264 465549 84.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050018900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018900" CM024327.1 INFERNAL exon 465264 465549 . + . transcript_id "LTnewLTref_050018900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050018900"; CM024327.1 INFERNAL transcript 466366 466438 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050019000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019000" CM024327.1 INFERNAL exon 466366 466438 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019000"; CM024327.1 INFERNAL transcript 466537 466625 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050019100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019100" CM024327.1 INFERNAL exon 466537 466625 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019100"; CM024327.1 INFERNAL transcript 466722 467006 87 + . transcript_id "LTnewLTref_050019200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019200" CM024327.1 INFERNAL exon 466722 467006 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019200"; CM024327.1 INFERNAL transcript 467820 467892 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050019300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019300" CM024327.1 INFERNAL exon 467820 467892 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019300"; CM024327.1 INFERNAL transcript 467991 468079 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050019400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019400" CM024327.1 INFERNAL exon 467991 468079 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019400"; CM024327.1 INFERNAL transcript 468176 468461 83.3 + . transcript_id "LTnewLTref_050019500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019500" CM024327.1 INFERNAL exon 468176 468461 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019500"; CM024327.1 INFERNAL transcript 469277 469349 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050019600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019600" CM024327.1 INFERNAL exon 469277 469349 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019600"; CM024327.1 INFERNAL transcript 469448 469536 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050019700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019700" CM024327.1 INFERNAL exon 469448 469536 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019700"; CM024327.1 INFERNAL transcript 469633 469918 83.3 + . transcript_id "LTnewLTref_050019800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019800" CM024327.1 INFERNAL exon 469633 469918 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019800"; CM024327.1 INFERNAL transcript 470740 470812 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050019900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019900" CM024327.1 INFERNAL exon 470740 470812 . + . transcript_id "LTnewLTref_050019900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050019900"; CM024327.1 INFERNAL transcript 470911 470999 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050020000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020000" CM024327.1 INFERNAL exon 470911 470999 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020000"; CM024327.1 INFERNAL transcript 471096 471381 83.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050020100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020100" CM024327.1 INFERNAL exon 471096 471381 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020100"; CM024327.1 INFERNAL transcript 472198 472270 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050020200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020200" CM024327.1 INFERNAL exon 472198 472270 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020200"; CM024327.1 INFERNAL transcript 472369 472457 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050020300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020300" CM024327.1 INFERNAL exon 472369 472457 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020300"; CM024327.1 INFERNAL transcript 472554 472838 85.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050020400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020400" CM024327.1 INFERNAL exon 472554 472838 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020400"; CM024327.1 INFERNAL transcript 473653 473725 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050020500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020500" CM024327.1 INFERNAL exon 473653 473725 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020500"; CM024327.1 INFERNAL transcript 473824 473912 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050020600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020600" CM024327.1 INFERNAL exon 473824 473912 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020600"; CM024327.1 INFERNAL transcript 474009 474294 83.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050020700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020700" CM024327.1 INFERNAL exon 474009 474294 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020700"; CM024327.1 INFERNAL transcript 475110 475182 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050020800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020800" CM024327.1 INFERNAL exon 475110 475182 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020800"; CM024327.1 INFERNAL transcript 475281 475369 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050020900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020900" CM024327.1 INFERNAL exon 475281 475369 . + . transcript_id "LTnewLTref_050020900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050020900"; CM024327.1 INFERNAL transcript 475466 475752 82.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050021000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021000" CM024327.1 INFERNAL exon 475466 475752 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021000"; CM024327.1 INFERNAL transcript 476570 476642 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050021100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021100" CM024327.1 INFERNAL exon 476570 476642 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021100"; CM024327.1 INFERNAL transcript 476741 476829 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050021200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021200" CM024327.1 INFERNAL exon 476741 476829 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021200"; CM024327.1 INFERNAL transcript 476926 477211 83.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050021300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021300" CM024327.1 INFERNAL exon 476926 477211 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021300"; CM024327.1 INFERNAL transcript 478033 478105 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050021400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021400" CM024327.1 INFERNAL exon 478033 478105 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021400"; CM024327.1 INFERNAL transcript 478204 478292 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050021500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021500" CM024327.1 INFERNAL exon 478204 478292 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021500:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021500"; CM024327.1 INFERNAL transcript 478389 478674 83.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050021600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021600" CM024327.1 INFERNAL exon 478389 478674 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021600:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021600"; CM024327.1 INFERNAL transcript 479495 479567 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050021700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021700" CM024327.1 INFERNAL exon 479495 479567 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021700:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021700"; CM024327.1 INFERNAL transcript 479666 479754 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050021800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021800" CM024327.1 INFERNAL exon 479666 479754 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021800:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021800"; CM024327.1 INFERNAL transcript 479851 480136 83.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050021900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021900" CM024327.1 INFERNAL exon 479851 480136 . + . transcript_id "LTnewLTref_050021900:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050021900"; CM024327.1 INFERNAL transcript 480957 481029 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050022000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022000" CM024327.1 INFERNAL exon 480957 481029 . + . transcript_id "LTnewLTref_050022000:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022000"; CM024327.1 INFERNAL transcript 481128 481216 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050022100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022100" CM024327.1 INFERNAL exon 481128 481216 . + . transcript_id "LTnewLTref_050022100:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022100"; CM024327.1 INFERNAL transcript 481313 481598 83.6 + . transcript_id "LTnewLTref_050022200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022200" CM024327.1 INFERNAL exon 481313 481598 . + . transcript_id "LTnewLTref_050022200:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022200"; CM024327.1 INFERNAL transcript 482416 482488 49.8 + . transcript_id "LTnewLTref_050022300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022300" CM024327.1 INFERNAL exon 482416 482488 . + . transcript_id "LTnewLTref_050022300:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022300"; CM024327.1 INFERNAL transcript 482587 482675 106 + . transcript_id "LTnewLTref_050022400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022400" CM024327.1 INFERNAL exon 482587 482675 . + . transcript_id "LTnewLTref_050022400:snoRNA"; gene_id "LTnewLTref_050022400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 49 403 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_060005000.1"; gene_id "LTnewLTref_060005000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 49 403 0.42 + 1 transcript_id "LTnewLTref_060005000.1"; gene_id "LTnewLTref_060005000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 4847 5149 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060005100.1"; gene_id "LTnewLTref_060005100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 4847 5149 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005100.1"; gene_id "LTnewLTref_060005100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 7330 8937 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060005200.1"; gene_id "LTnewLTref_060005200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 7330 8937 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005200.1"; gene_id "LTnewLTref_060005200"; CM024328.1 . transcript 14627 16656 . - . transcript_id "LTnewLTref_060005300.1"; gene_id "LTnewLTref_060005300:pseudogene" CM024328.1 . exon 14627 16656 . - . transcript_id "LTnewLTref_060005300.1"; gene_id "LTnewLTref_060005300:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 17516 18391 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060005400.1"; gene_id "LTnewLTref_060005400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 17516 18391 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005400.1"; gene_id "LTnewLTref_060005400"; CM024328.1 . transcript 19245 19497 . - . transcript_id "LTnewLTref_060005500.1"; gene_id "LTnewLTref_060005500:pseudogene" CM024328.1 . exon 19245 19497 . - . transcript_id "LTnewLTref_060005500.1"; gene_id "LTnewLTref_060005500:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 23913 25358 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060005600.1"; gene_id "LTnewLTref_060005600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 23913 25358 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005600.1"; gene_id "LTnewLTref_060005600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 29575 30543 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060005700.1"; gene_id "LTnewLTref_060005700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 29575 30543 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005700.1"; gene_id "LTnewLTref_060005700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 32156 32673 0.9 - . transcript_id "LTnewLTref_060005800.1"; gene_id "LTnewLTref_060005800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 32156 32498 0.9 - 1 transcript_id "LTnewLTref_060005800.1"; gene_id "LTnewLTref_060005800"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 32564 32673 0.9 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005800.1"; gene_id "LTnewLTref_060005800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 32156 33522 0.55 - . transcript_id "LTnewLTref_060005800.2"; gene_id "LTnewLTref_060005800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 32156 32625 0.69 - 2 transcript_id "LTnewLTref_060005800.2"; gene_id "LTnewLTref_060005800"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 32760 33522 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005800.2"; gene_id "LTnewLTref_060005800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 32704 33522 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_060005800.3"; gene_id "LTnewLTref_060005800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 32704 33522 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005800.3"; gene_id "LTnewLTref_060005800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 37284 39258 0.78 - . transcript_id "LTnewLTref_060005900.1"; gene_id "LTnewLTref_060005900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 37284 37814 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005900.1"; gene_id "LTnewLTref_060005900"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 37900 39258 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060005900.1"; gene_id "LTnewLTref_060005900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 42902 44894 0.88 - . transcript_id "LTnewLTref_060006000.1"; gene_id "LTnewLTref_060006000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 42902 44251 0.88 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006000.1"; gene_id "LTnewLTref_060006000"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 44295 44894 0.91 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006000.1"; gene_id "LTnewLTref_060006000"; CM024328.1 . transcript 48730 50550 . - . transcript_id "LTnewLTref_060006100.1"; gene_id "LTnewLTref_060006100:pseudogene" CM024328.1 . exon 48730 50550 . - . transcript_id "LTnewLTref_060006100.1"; gene_id "LTnewLTref_060006100:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 51935 52498 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060006200.1"; gene_id "LTnewLTref_060006200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 51935 52498 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006200.1"; gene_id "LTnewLTref_060006200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 53444 54004 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060006300.1"; gene_id "LTnewLTref_060006300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 53444 54004 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006300.1"; gene_id "LTnewLTref_060006300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 55524 56267 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060006400.1"; gene_id "LTnewLTref_060006400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 55524 56267 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006400.1"; gene_id "LTnewLTref_060006400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 57092 57421 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060006500.1"; gene_id "LTnewLTref_060006500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 57092 57421 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006500.1"; gene_id "LTnewLTref_060006500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 58035 59399 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060006600.1"; gene_id "LTnewLTref_060006600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 58035 59399 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006600.1"; gene_id "LTnewLTref_060006600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 60746 61171 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060006700.1"; gene_id "LTnewLTref_060006700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 60746 61171 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006700.1"; gene_id "LTnewLTref_060006700"; CM024328.1 Liftoff transcript 61662 63821 . - . transcript_id "LTnewLTref_060006800.1"; gene_id "LTnewLTref_060006800" CM024328.1 Liftoff CDS 61662 63821 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006800.1"; gene_id "LTnewLTref_060006800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 65228 67410 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_060006900.1"; gene_id "LTnewLTref_060006900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 65228 66479 0.72 - 1 transcript_id "LTnewLTref_060006900.1"; gene_id "LTnewLTref_060006900"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 66557 67410 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060006900.1"; gene_id "LTnewLTref_060006900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 68874 70364 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007000.1"; gene_id "LTnewLTref_060007000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 68874 70364 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007000.1"; gene_id "LTnewLTref_060007000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 71323 71559 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007100.1"; gene_id "LTnewLTref_060007100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 71323 71559 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007100.1"; gene_id "LTnewLTref_060007100"; CM024328.1 Aragorn_1.2.36 transcript 71919 72006 . - . transcript_id "LTnewLTref_060007200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_060007200" CM024328.1 Aragorn_1.2.36 exon 71919 72006 . - . transcript_id "LTnewLTref_060007200:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_060007200"; CM024328.1 . transcript 72921 74933 . - . transcript_id "LTnewLTref_060007300.1"; gene_id "LTnewLTref_060007300:pseudogene" CM024328.1 . exon 72921 74933 . - . transcript_id "LTnewLTref_060007300.1"; gene_id "LTnewLTref_060007300:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 75798 76658 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007400.1"; gene_id "LTnewLTref_060007400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 75798 76658 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007400.1"; gene_id "LTnewLTref_060007400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 77346 77987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007500.1"; gene_id "LTnewLTref_060007500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 77346 77987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007500.1"; gene_id "LTnewLTref_060007500"; CM024328.1 . transcript 79088 82050 . - . transcript_id "LTnewLTref_060007600.1"; gene_id "LTnewLTref_060007600:pseudogene" CM024328.1 . exon 79088 82050 . - . transcript_id "LTnewLTref_060007600.1"; gene_id "LTnewLTref_060007600:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 83522 84358 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007700.1"; gene_id "LTnewLTref_060007700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 83522 84358 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007700.1"; gene_id "LTnewLTref_060007700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 86184 90683 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007800.1"; gene_id "LTnewLTref_060007800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 86184 90683 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007800.1"; gene_id "LTnewLTref_060007800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 92940 93878 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060007900.1"; gene_id "LTnewLTref_060007900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 92940 93878 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060007900.1"; gene_id "LTnewLTref_060007900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 94584 97157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008000.1"; gene_id "LTnewLTref_060008000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 94584 97157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008000.1"; gene_id "LTnewLTref_060008000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 97891 98571 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008100.1"; gene_id "LTnewLTref_060008100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 97891 98571 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008100.1"; gene_id "LTnewLTref_060008100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 99272 100417 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008200.1"; gene_id "LTnewLTref_060008200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 99272 100417 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008200.1"; gene_id "LTnewLTref_060008200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 102073 102582 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008300.1"; gene_id "LTnewLTref_060008300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 102073 102582 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008300.1"; gene_id "LTnewLTref_060008300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 106393 108426 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008400.1"; gene_id "LTnewLTref_060008400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 106393 108426 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008400.1"; gene_id "LTnewLTref_060008400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 109324 112398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008500.1"; gene_id "LTnewLTref_060008500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 109324 112398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008500.1"; gene_id "LTnewLTref_060008500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 113832 117386 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008600.1"; gene_id "LTnewLTref_060008600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 113832 117386 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008600.1"; gene_id "LTnewLTref_060008600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 118120 120837 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008700.1"; gene_id "LTnewLTref_060008700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 118120 120837 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008700.1"; gene_id "LTnewLTref_060008700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 121591 122814 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060008800.1"; gene_id "LTnewLTref_060008800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 121591 122814 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008800.1"; gene_id "LTnewLTref_060008800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 123396 124751 0.99 - . transcript_id "LTnewLTref_060008900.1"; gene_id "LTnewLTref_060008900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 123396 124751 0.99 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060008900.1"; gene_id "LTnewLTref_060008900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 131575 132714 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009000.1"; gene_id "LTnewLTref_060009000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 131575 132714 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009000.1"; gene_id "LTnewLTref_060009000"; CM024328.1 Liftoff transcript 133525 134730 . + . transcript_id "LTnewLTref_060009100.1"; gene_id "LTnewLTref_060009100" CM024328.1 Liftoff CDS 133525 134730 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009100.1"; gene_id "LTnewLTref_060009100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 135680 138403 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009200.1"; gene_id "LTnewLTref_060009200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 135680 138403 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009200.1"; gene_id "LTnewLTref_060009200"; CM024328.1 Liftoff transcript 138640 138862 . + . transcript_id "LTnewLTref_060009300.1"; gene_id "LTnewLTref_060009300" CM024328.1 Liftoff CDS 138640 138862 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009300.1"; gene_id "LTnewLTref_060009300"; CM024328.1 Liftoff transcript 138879 139181 . + . transcript_id "LTnewLTref_060009400.1"; gene_id "LTnewLTref_060009400" CM024328.1 Liftoff CDS 138879 139181 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009400.1"; gene_id "LTnewLTref_060009400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 141677 142435 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009500.1"; gene_id "LTnewLTref_060009500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 141677 142435 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009500.1"; gene_id "LTnewLTref_060009500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 143755 144324 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009600.1"; gene_id "LTnewLTref_060009600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 143755 144324 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009600.1"; gene_id "LTnewLTref_060009600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 145129 145908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009700.1"; gene_id "LTnewLTref_060009700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 145129 145908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009700.1"; gene_id "LTnewLTref_060009700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 148003 149721 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009800.1"; gene_id "LTnewLTref_060009800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 148003 149721 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009800.1"; gene_id "LTnewLTref_060009800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 151366 153441 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060009900.1"; gene_id "LTnewLTref_060009900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 151366 153441 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060009900.1"; gene_id "LTnewLTref_060009900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 154675 157653 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010000.1"; gene_id "LTnewLTref_060010000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 154675 157653 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010000.1"; gene_id "LTnewLTref_060010000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 159573 160946 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010100.1"; gene_id "LTnewLTref_060010100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 159573 160946 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010100.1"; gene_id "LTnewLTref_060010100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 163315 167145 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010200.1"; gene_id "LTnewLTref_060010200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 163315 167145 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010200.1"; gene_id "LTnewLTref_060010200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 168436 171906 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010300.1"; gene_id "LTnewLTref_060010300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 168436 171906 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010300.1"; gene_id "LTnewLTref_060010300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 172915 173892 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010400.1"; gene_id "LTnewLTref_060010400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 172915 173892 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010400.1"; gene_id "LTnewLTref_060010400"; CM024328.1 Liftoff transcript 174702 176507 . + . transcript_id "LTnewLTref_060010500.1"; gene_id "LTnewLTref_060010500" CM024328.1 Liftoff CDS 174702 176507 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010500.1"; gene_id "LTnewLTref_060010500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 177646 179283 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010600.1"; gene_id "LTnewLTref_060010600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 177646 179283 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010600.1"; gene_id "LTnewLTref_060010600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 180022 182004 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010700.1"; gene_id "LTnewLTref_060010700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 180022 182004 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010700.1"; gene_id "LTnewLTref_060010700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 184487 190129 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010800.1"; gene_id "LTnewLTref_060010800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 184487 190129 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010800.1"; gene_id "LTnewLTref_060010800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 190813 191694 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060010900.1"; gene_id "LTnewLTref_060010900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 190813 191694 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060010900.1"; gene_id "LTnewLTref_060010900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 193104 195713 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011000.1"; gene_id "LTnewLTref_060011000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 193104 195713 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011000.1"; gene_id "LTnewLTref_060011000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 196573 201798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011100.1"; gene_id "LTnewLTref_060011100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 196573 201798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011100.1"; gene_id "LTnewLTref_060011100"; CM024328.1 Liftoff transcript 202728 203537 . + . transcript_id "LTnewLTref_060011200.1"; gene_id "LTnewLTref_060011200" CM024328.1 Liftoff CDS 202728 203537 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011200.1"; gene_id "LTnewLTref_060011200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 204887 205324 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_060011300.1"; gene_id "LTnewLTref_060011300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 204887 205324 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011300.1"; gene_id "LTnewLTref_060011300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 205782 206219 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011400.1"; gene_id "LTnewLTref_060011400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 205782 206219 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011400.1"; gene_id "LTnewLTref_060011400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 207895 212397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011500.1"; gene_id "LTnewLTref_060011500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 207895 212397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011500.1"; gene_id "LTnewLTref_060011500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 213036 217370 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011600.1"; gene_id "LTnewLTref_060011600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 213036 217370 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011600.1"; gene_id "LTnewLTref_060011600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 218363 219523 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011700.1"; gene_id "LTnewLTref_060011700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 218363 219523 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011700.1"; gene_id "LTnewLTref_060011700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 221294 224326 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060011800.1"; gene_id "LTnewLTref_060011800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 221294 224326 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011800.1"; gene_id "LTnewLTref_060011800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 226009 231951 0.95 + . transcript_id "LTnewLTref_060011900.1"; gene_id "LTnewLTref_060011900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 226009 231951 0.95 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060011900.1"; gene_id "LTnewLTref_060011900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 231990 232715 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_060012000.1"; gene_id "LTnewLTref_060012000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 231990 232715 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012000.1"; gene_id "LTnewLTref_060012000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 234062 243487 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012100.1"; gene_id "LTnewLTref_060012100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 234062 243487 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012100.1"; gene_id "LTnewLTref_060012100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 245108 248131 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012200.1"; gene_id "LTnewLTref_060012200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 245108 248131 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012200.1"; gene_id "LTnewLTref_060012200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 250313 252352 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012300.1"; gene_id "LTnewLTref_060012300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 250313 252352 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012300.1"; gene_id "LTnewLTref_060012300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 254811 258712 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_060012400.1"; gene_id "LTnewLTref_060012400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 254811 258128 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012400.1"; gene_id "LTnewLTref_060012400"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 258209 258712 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012400.1"; gene_id "LTnewLTref_060012400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 260111 260842 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012500.1"; gene_id "LTnewLTref_060012500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 260111 260842 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012500.1"; gene_id "LTnewLTref_060012500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 261573 262769 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012600.1"; gene_id "LTnewLTref_060012600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 261573 262769 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012600.1"; gene_id "LTnewLTref_060012600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 263877 271751 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012700.1"; gene_id "LTnewLTref_060012700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 263877 271751 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012700.1"; gene_id "LTnewLTref_060012700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 272832 275051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060012800.1"; gene_id "LTnewLTref_060012800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 272832 275051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060012800.1"; gene_id "LTnewLTref_060012800"; CM024328.1 . transcript 280882 281725 . + . transcript_id "LTnewLTref_060012900.1"; gene_id "LTnewLTref_060012900:pseudogene" CM024328.1 . exon 280882 281725 . + . transcript_id "LTnewLTref_060012900.1"; gene_id "LTnewLTref_060012900:pseudogene"; CM024328.1 Liftoff transcript 282050 282392 . + . transcript_id "LTnewLTref_060013000.1"; gene_id "LTnewLTref_060013000" CM024328.1 Liftoff CDS 282050 282392 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013000.1"; gene_id "LTnewLTref_060013000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 283791 289088 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060013100.1"; gene_id "LTnewLTref_060013100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 283791 289088 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013100.1"; gene_id "LTnewLTref_060013100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 290367 291383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060013200.1"; gene_id "LTnewLTref_060013200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 290367 291383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013200.1"; gene_id "LTnewLTref_060013200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 293600 296404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060013300.1"; gene_id "LTnewLTref_060013300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 293600 296404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013300.1"; gene_id "LTnewLTref_060013300"; CM024328.1 . transcript 297257 299223 . + . transcript_id "LTnewLTref_060013400.1"; gene_id "LTnewLTref_060013400:pseudogene" CM024328.1 . exon 297257 299223 . + . transcript_id "LTnewLTref_060013400.1"; gene_id "LTnewLTref_060013400:pseudogene"; CM024328.1 . transcript 299603 300026 . + . transcript_id "LTnewLTref_060013500.1"; gene_id "LTnewLTref_060013500:pseudogene" CM024328.1 . exon 299603 300026 . + . transcript_id "LTnewLTref_060013500.1"; gene_id "LTnewLTref_060013500:pseudogene"; CM024328.1 Liftoff transcript 300321 303857 . + . transcript_id "LTnewLTref_060013600.1"; gene_id "LTnewLTref_060013600" CM024328.1 Liftoff CDS 300321 303857 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013600.1"; gene_id "LTnewLTref_060013600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 307973 313942 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060013700.1"; gene_id "LTnewLTref_060013700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 307973 313942 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013700.1"; gene_id "LTnewLTref_060013700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 319210 327861 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060013800.1"; gene_id "LTnewLTref_060013800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 319210 327861 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013800.1"; gene_id "LTnewLTref_060013800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 330500 333623 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_060013900.1"; gene_id "LTnewLTref_060013900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 330500 333420 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060013900.1"; gene_id "LTnewLTref_060013900"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 333536 333623 0.54 + 1 transcript_id "LTnewLTref_060013900.1"; gene_id "LTnewLTref_060013900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 334702 339495 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014000.1"; gene_id "LTnewLTref_060014000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 334702 339495 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014000.1"; gene_id "LTnewLTref_060014000"; CM024328.1 . transcript 341371 352102 . + . transcript_id "LTnewLTref_060014100.1"; gene_id "LTnewLTref_060014100:pseudogene" CM024328.1 . exon 341371 352102 . + . transcript_id "LTnewLTref_060014100.1"; gene_id "LTnewLTref_060014100:pseudogene"; CM024328.1 . transcript 352532 354082 . + . transcript_id "LTnewLTref_060014200.1"; gene_id "LTnewLTref_060014200:pseudogene" CM024328.1 . exon 352532 352784 . + . transcript_id "LTnewLTref_060014200.1"; gene_id "LTnewLTref_060014200:pseudogene"; CM024328.1 . exon 352871 354082 . + . transcript_id "LTnewLTref_060014200.1"; gene_id "LTnewLTref_060014200:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 356382 360539 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014300.1"; gene_id "LTnewLTref_060014300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 356382 360539 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014300.1"; gene_id "LTnewLTref_060014300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 361959 362657 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014400.1"; gene_id "LTnewLTref_060014400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 361959 362657 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014400.1"; gene_id "LTnewLTref_060014400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 364803 375548 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014500.1"; gene_id "LTnewLTref_060014500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 364803 375548 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014500.1"; gene_id "LTnewLTref_060014500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 376626 378188 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014600.1"; gene_id "LTnewLTref_060014600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 376626 378188 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014600.1"; gene_id "LTnewLTref_060014600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 379934 381250 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014700.1"; gene_id "LTnewLTref_060014700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 379934 381250 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014700.1"; gene_id "LTnewLTref_060014700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 382737 383987 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014800.1"; gene_id "LTnewLTref_060014800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 382737 383987 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014800.1"; gene_id "LTnewLTref_060014800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 385729 388065 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060014900.1"; gene_id "LTnewLTref_060014900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 385729 388065 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060014900.1"; gene_id "LTnewLTref_060014900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 389195 394732 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015000.1"; gene_id "LTnewLTref_060015000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 389195 394732 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015000.1"; gene_id "LTnewLTref_060015000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 395606 396271 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015100.1"; gene_id "LTnewLTref_060015100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 395606 396271 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015100.1"; gene_id "LTnewLTref_060015100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 396959 398267 0.55 + . transcript_id "LTnewLTref_060015200.1"; gene_id "LTnewLTref_060015200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 396959 397737 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015200.1"; gene_id "LTnewLTref_060015200"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 397817 398267 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_060015200.1"; gene_id "LTnewLTref_060015200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 400304 402496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015300.1"; gene_id "LTnewLTref_060015300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 400304 402496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015300.1"; gene_id "LTnewLTref_060015300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 404046 405953 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015400.1"; gene_id "LTnewLTref_060015400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 404046 405953 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015400.1"; gene_id "LTnewLTref_060015400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 407040 409052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015500.1"; gene_id "LTnewLTref_060015500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 407040 409052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015500.1"; gene_id "LTnewLTref_060015500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 410596 411267 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015600.1"; gene_id "LTnewLTref_060015600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 410596 411267 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015600.1"; gene_id "LTnewLTref_060015600"; CM024328.1 Liftoff transcript 412402 417372 . + . transcript_id "LTnewLTref_060015700.1"; gene_id "LTnewLTref_060015700" CM024328.1 Liftoff CDS 412402 417372 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015700.1"; gene_id "LTnewLTref_060015700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 418433 421522 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060015800.1"; gene_id "LTnewLTref_060015800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 418433 421522 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015800.1"; gene_id "LTnewLTref_060015800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 423842 427481 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_060015900.1"; gene_id "LTnewLTref_060015900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 423842 426698 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060015900.1"; gene_id "LTnewLTref_060015900"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 426763 427481 0.54 + 2 transcript_id "LTnewLTref_060015900.1"; gene_id "LTnewLTref_060015900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 428385 428852 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016000.1"; gene_id "LTnewLTref_060016000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 428385 428852 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016000.1"; gene_id "LTnewLTref_060016000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 429414 430919 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016100.1"; gene_id "LTnewLTref_060016100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 429414 430919 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016100.1"; gene_id "LTnewLTref_060016100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 431830 434134 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_060016200.1"; gene_id "LTnewLTref_060016200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 431830 433438 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016200.1"; gene_id "LTnewLTref_060016200"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 433512 434134 0.85 + 2 transcript_id "LTnewLTref_060016200.1"; gene_id "LTnewLTref_060016200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 434863 435555 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016300.1"; gene_id "LTnewLTref_060016300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 434863 435555 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016300.1"; gene_id "LTnewLTref_060016300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 436838 439519 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016400.1"; gene_id "LTnewLTref_060016400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 436838 439519 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016400.1"; gene_id "LTnewLTref_060016400"; CM024328.1 Liftoff transcript 439978 442164 . + . transcript_id "LTnewLTref_060016500.1"; gene_id "LTnewLTref_060016500" CM024328.1 Liftoff CDS 439978 442164 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016500.1"; gene_id "LTnewLTref_060016500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 443191 443592 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016600.1"; gene_id "LTnewLTref_060016600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 443191 443592 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016600.1"; gene_id "LTnewLTref_060016600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 445716 446750 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016700.1"; gene_id "LTnewLTref_060016700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 445716 446750 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016700.1"; gene_id "LTnewLTref_060016700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 448154 448999 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060016800.1"; gene_id "LTnewLTref_060016800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 448154 448999 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060016800.1"; gene_id "LTnewLTref_060016800"; CM024328.1 . transcript 449236 449669 . + . transcript_id "LTnewLTref_060016900.1"; gene_id "LTnewLTref_060016900:pseudogene" CM024328.1 . exon 449236 449669 . + . transcript_id "LTnewLTref_060016900.1"; gene_id "LTnewLTref_060016900:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 450746 451420 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017000.1"; gene_id "LTnewLTref_060017000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 450746 451420 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017000.1"; gene_id "LTnewLTref_060017000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 452950 454737 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017100.1"; gene_id "LTnewLTref_060017100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 452950 454737 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017100.1"; gene_id "LTnewLTref_060017100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 455877 456785 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017200.1"; gene_id "LTnewLTref_060017200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 455877 456785 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017200.1"; gene_id "LTnewLTref_060017200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 459127 462390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017300.1"; gene_id "LTnewLTref_060017300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 459127 462390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017300.1"; gene_id "LTnewLTref_060017300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 464948 465769 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017400.1"; gene_id "LTnewLTref_060017400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 464948 465769 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017400.1"; gene_id "LTnewLTref_060017400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 466623 467612 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017500.1"; gene_id "LTnewLTref_060017500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 466623 467612 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017500.1"; gene_id "LTnewLTref_060017500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 468037 470280 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017600.1"; gene_id "LTnewLTref_060017600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 468037 470280 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017600.1"; gene_id "LTnewLTref_060017600"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 470726 472291 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017700.1"; gene_id "LTnewLTref_060017700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 470726 472291 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017700.1"; gene_id "LTnewLTref_060017700"; CM024328.1 . transcript 472836 476126 . + . transcript_id "LTnewLTref_060017800.1"; gene_id "LTnewLTref_060017800:pseudogene" CM024328.1 . exon 472836 476126 . + . transcript_id "LTnewLTref_060017800.1"; gene_id "LTnewLTref_060017800:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 476779 477186 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060017900.1"; gene_id "LTnewLTref_060017900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 476779 477186 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060017900.1"; gene_id "LTnewLTref_060017900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 478319 479686 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018000.1"; gene_id "LTnewLTref_060018000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 478319 479686 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018000.1"; gene_id "LTnewLTref_060018000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 480643 481086 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018100.1"; gene_id "LTnewLTref_060018100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 480643 481086 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018100.1"; gene_id "LTnewLTref_060018100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 481719 482060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018200.1"; gene_id "LTnewLTref_060018200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 481719 482060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018200.1"; gene_id "LTnewLTref_060018200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 482274 482534 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018300.1"; gene_id "LTnewLTref_060018300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 482274 482534 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018300.1"; gene_id "LTnewLTref_060018300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 484310 485494 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018400.1"; gene_id "LTnewLTref_060018400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 484310 485494 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018400.1"; gene_id "LTnewLTref_060018400"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 486054 487820 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018500.1"; gene_id "LTnewLTref_060018500" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 486054 487820 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018500.1"; gene_id "LTnewLTref_060018500"; CM024328.1 . transcript 489556 491927 . + . transcript_id "LTnewLTref_060018600.1"; gene_id "LTnewLTref_060018600:pseudogene" CM024328.1 . exon 489556 491927 . + . transcript_id "LTnewLTref_060018600.1"; gene_id "LTnewLTref_060018600:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 492953 493890 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018700.1"; gene_id "LTnewLTref_060018700" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 492953 492991 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018700.1"; gene_id "LTnewLTref_060018700"; CM024328.1 AUGUSTUS CDS 493090 493890 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018700.1"; gene_id "LTnewLTref_060018700"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 494665 496149 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060018800.1"; gene_id "LTnewLTref_060018800" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 494665 496149 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018800.1"; gene_id "LTnewLTref_060018800"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 496408 496668 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_060018900.1"; gene_id "LTnewLTref_060018900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 496408 496668 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060018900.1"; gene_id "LTnewLTref_060018900"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 497274 497645 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060019000.1"; gene_id "LTnewLTref_060019000" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 497274 497645 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060019000.1"; gene_id "LTnewLTref_060019000"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 498345 499061 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060019100.1"; gene_id "LTnewLTref_060019100" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 498345 499061 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060019100.1"; gene_id "LTnewLTref_060019100"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 499809 500333 1 + . transcript_id "LTnewLTref_060019200.1"; gene_id "LTnewLTref_060019200" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 499809 500333 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_060019200.1"; gene_id "LTnewLTref_060019200"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 501820 503781 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060019300.1"; gene_id "LTnewLTref_060019300" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 501820 503781 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060019300.1"; gene_id "LTnewLTref_060019300"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 505510 506415 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060019400.1"; gene_id "LTnewLTref_060019400" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 505510 506415 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060019400.1"; gene_id "LTnewLTref_060019400"; CM024328.1 Liftoff transcript 507440 508136 . - . transcript_id "LTnewLTref_060019500.1"; gene_id "LTnewLTref_060019500" CM024328.1 Liftoff CDS 507440 508136 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_060019500.1"; gene_id "LTnewLTref_060019500"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 509329 509700 1 - . transcript_id "LTnewLTref_060019600.1"; gene_id "LTnewLTref_060019600" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 509329 509700 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060019600.1"; gene_id "LTnewLTref_060019600"; CM024328.1 . transcript 514478 516405 . + . transcript_id "LTnewLTref_060019700.1"; gene_id "LTnewLTref_060019700:pseudogene" CM024328.1 . exon 514478 516013 . + . transcript_id "LTnewLTref_060019700.1"; gene_id "LTnewLTref_060019700:pseudogene"; CM024328.1 . exon 516016 516405 . + . transcript_id "LTnewLTref_060019700.1"; gene_id "LTnewLTref_060019700:pseudogene"; CM024328.1 . transcript 518338 518546 . + . transcript_id "LTnewLTref_060019800.1"; gene_id "LTnewLTref_060019800:pseudogene" CM024328.1 . exon 518338 518546 . + . transcript_id "LTnewLTref_060019800.1"; gene_id "LTnewLTref_060019800:pseudogene"; CM024328.1 AUGUSTUS transcript 518884 519015 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_060019900.1"; gene_id "LTnewLTref_060019900" CM024328.1 AUGUSTUS CDS 518884 519015 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_060019900.1"; gene_id "LTnewLTref_060019900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 2461 4638 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070005000.1"; gene_id "LTnewLTref_070005000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 2461 4638 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070005000.1"; gene_id "LTnewLTref_070005000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 9836 10645 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005100.1"; gene_id "LTnewLTref_070005100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 9836 10645 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005100.1"; gene_id "LTnewLTref_070005100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 11231 12130 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005200.1"; gene_id "LTnewLTref_070005200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 11231 12130 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005200.1"; gene_id "LTnewLTref_070005200"; CM024329.1 . transcript 13116 13389 . + . transcript_id "LTnewLTref_070005300.1"; gene_id "LTnewLTref_070005300:pseudogene" CM024329.1 . exon 13116 13389 . + . transcript_id "LTnewLTref_070005300.1"; gene_id "LTnewLTref_070005300:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 13646 14311 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005400.1"; gene_id "LTnewLTref_070005400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 13646 14311 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005400.1"; gene_id "LTnewLTref_070005400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 14916 15860 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005500.1"; gene_id "LTnewLTref_070005500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 14916 15860 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005500.1"; gene_id "LTnewLTref_070005500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 16459 19344 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005600.1"; gene_id "LTnewLTref_070005600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 16459 19344 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005600.1"; gene_id "LTnewLTref_070005600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 21090 21866 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005700.1"; gene_id "LTnewLTref_070005700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 21090 21866 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005700.1"; gene_id "LTnewLTref_070005700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 22900 23478 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005800.1"; gene_id "LTnewLTref_070005800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 22900 23478 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005800.1"; gene_id "LTnewLTref_070005800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 24444 26318 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070005900.1"; gene_id "LTnewLTref_070005900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 24444 26318 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070005900.1"; gene_id "LTnewLTref_070005900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 27880 31638 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006000.1"; gene_id "LTnewLTref_070006000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 27880 31638 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006000.1"; gene_id "LTnewLTref_070006000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 33721 36819 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006100.1"; gene_id "LTnewLTref_070006100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 33721 36819 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006100.1"; gene_id "LTnewLTref_070006100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 37761 38033 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006200.1"; gene_id "LTnewLTref_070006200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 37761 38033 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006200.1"; gene_id "LTnewLTref_070006200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 37761 38518 0.24 + . transcript_id "LTnewLTref_070006200.2"; gene_id "LTnewLTref_070006200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 37761 37945 0.26 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006200.2"; gene_id "LTnewLTref_070006200"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 38074 38518 0.78 + 1 transcript_id "LTnewLTref_070006200.2"; gene_id "LTnewLTref_070006200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 38228 38518 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006200.3"; gene_id "LTnewLTref_070006200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 38228 38518 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006200.3"; gene_id "LTnewLTref_070006200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 39473 40822 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006300.1"; gene_id "LTnewLTref_070006300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 39473 40822 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006300.1"; gene_id "LTnewLTref_070006300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 42194 48868 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006400.1"; gene_id "LTnewLTref_070006400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 42194 48868 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006400.1"; gene_id "LTnewLTref_070006400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 49635 51482 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006500.1"; gene_id "LTnewLTref_070006500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 49635 51482 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006500.1"; gene_id "LTnewLTref_070006500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 52032 53090 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006600.1"; gene_id "LTnewLTref_070006600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 52032 53090 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006600.1"; gene_id "LTnewLTref_070006600"; CM024329.1 Aragorn_1.2.36 transcript 52961 53056 . - . transcript_id "LTnewLTref_070006700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_070006700" CM024329.1 Aragorn_1.2.36 exon 52961 53056 . - . transcript_id "LTnewLTref_070006700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_070006700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 53913 55766 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006800.1"; gene_id "LTnewLTref_070006800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 53913 55766 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006800.1"; gene_id "LTnewLTref_070006800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 56429 56698 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070006900.1"; gene_id "LTnewLTref_070006900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 56429 56698 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070006900.1"; gene_id "LTnewLTref_070006900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 56808 57180 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_070007000.1"; gene_id "LTnewLTref_070007000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 56808 57056 0.57 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070007000.1"; gene_id "LTnewLTref_070007000"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 57124 57180 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070007000.1"; gene_id "LTnewLTref_070007000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 59186 59629 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_070007100.1"; gene_id "LTnewLTref_070007100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 59186 59382 0.86 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070007100.1"; gene_id "LTnewLTref_070007100"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 59545 59629 0.8 + 1 transcript_id "LTnewLTref_070007100.1"; gene_id "LTnewLTref_070007100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 60157 62700 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007200.1"; gene_id "LTnewLTref_070007200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 60157 62700 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007200.1"; gene_id "LTnewLTref_070007200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 66166 66778 0.47 - . transcript_id "LTnewLTref_070007300.1"; gene_id "LTnewLTref_070007300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 66166 66264 0.56 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007300.1"; gene_id "LTnewLTref_070007300"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 66647 66778 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007300.1"; gene_id "LTnewLTref_070007300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 67008 67367 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007400.1"; gene_id "LTnewLTref_070007400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 67008 67367 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007400.1"; gene_id "LTnewLTref_070007400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 67920 71114 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007500.1"; gene_id "LTnewLTref_070007500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 67920 71114 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007500.1"; gene_id "LTnewLTref_070007500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 71885 78238 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007600.1"; gene_id "LTnewLTref_070007600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 71885 78238 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007600.1"; gene_id "LTnewLTref_070007600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 80410 81591 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007700.1"; gene_id "LTnewLTref_070007700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 80410 81591 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007700.1"; gene_id "LTnewLTref_070007700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 82792 85059 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007800.1"; gene_id "LTnewLTref_070007800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 82792 85059 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007800.1"; gene_id "LTnewLTref_070007800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 85611 86372 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070007900.1"; gene_id "LTnewLTref_070007900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 85611 86372 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070007900.1"; gene_id "LTnewLTref_070007900"; CM024329.1 . transcript 87013 87291 . - . transcript_id "LTnewLTref_070008000.1"; gene_id "LTnewLTref_070008000:pseudogene" CM024329.1 . exon 87013 87291 . - . transcript_id "LTnewLTref_070008000.1"; gene_id "LTnewLTref_070008000:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 87301 89208 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008100.1"; gene_id "LTnewLTref_070008100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 87301 89208 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008100.1"; gene_id "LTnewLTref_070008100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 89885 90244 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008200.1"; gene_id "LTnewLTref_070008200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 89885 90244 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008200.1"; gene_id "LTnewLTref_070008200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 90913 92736 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008300.1"; gene_id "LTnewLTref_070008300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 90913 92736 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008300.1"; gene_id "LTnewLTref_070008300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 93998 99598 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008400.1"; gene_id "LTnewLTref_070008400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 93998 99598 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008400.1"; gene_id "LTnewLTref_070008400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 102259 103359 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008500.1"; gene_id "LTnewLTref_070008500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 102259 103359 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008500.1"; gene_id "LTnewLTref_070008500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 105636 106829 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008600.1"; gene_id "LTnewLTref_070008600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 105636 106829 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008600.1"; gene_id "LTnewLTref_070008600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 107392 108624 0.98 - . transcript_id "LTnewLTref_070008700.1"; gene_id "LTnewLTref_070008700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 107392 108624 0.98 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008700.1"; gene_id "LTnewLTref_070008700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 107392 126150 0.35 - . transcript_id "LTnewLTref_070008700.2"; gene_id "LTnewLTref_070008700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 107392 115628 0.6 - 2 transcript_id "LTnewLTref_070008700.2"; gene_id "LTnewLTref_070008700"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 115683 126150 0.35 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008700.2"; gene_id "LTnewLTref_070008700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 129430 130194 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008800.1"; gene_id "LTnewLTref_070008800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 129430 130194 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008800.1"; gene_id "LTnewLTref_070008800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 131655 134204 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070008900.1"; gene_id "LTnewLTref_070008900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 131655 134204 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070008900.1"; gene_id "LTnewLTref_070008900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 135463 137892 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009000.1"; gene_id "LTnewLTref_070009000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 135463 137892 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009000.1"; gene_id "LTnewLTref_070009000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 139388 142810 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009100.1"; gene_id "LTnewLTref_070009100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 139388 142810 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009100.1"; gene_id "LTnewLTref_070009100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 143682 146189 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009200.1"; gene_id "LTnewLTref_070009200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 143682 146189 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009200.1"; gene_id "LTnewLTref_070009200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 147309 149654 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009300.1"; gene_id "LTnewLTref_070009300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 147309 149654 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009300.1"; gene_id "LTnewLTref_070009300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 150975 151340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009400.1"; gene_id "LTnewLTref_070009400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 150975 151340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009400.1"; gene_id "LTnewLTref_070009400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 155658 157139 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009500.1"; gene_id "LTnewLTref_070009500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 155658 157139 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009500.1"; gene_id "LTnewLTref_070009500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 157989 159959 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009600.1"; gene_id "LTnewLTref_070009600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 157989 159959 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009600.1"; gene_id "LTnewLTref_070009600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 161138 161461 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009700.1"; gene_id "LTnewLTref_070009700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 161138 161461 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009700.1"; gene_id "LTnewLTref_070009700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 166301 169069 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009800.1"; gene_id "LTnewLTref_070009800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 166301 169069 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009800.1"; gene_id "LTnewLTref_070009800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 170661 178157 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009900.1"; gene_id "LTnewLTref_070009900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 170661 178157 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009900.1"; gene_id "LTnewLTref_070009900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 170661 181463 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070009900.2"; gene_id "LTnewLTref_070009900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 170661 181463 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070009900.2"; gene_id "LTnewLTref_070009900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 182302 185088 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010000.1"; gene_id "LTnewLTref_070010000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 182302 185088 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010000.1"; gene_id "LTnewLTref_070010000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 186042 187874 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010100.1"; gene_id "LTnewLTref_070010100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 186042 187874 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010100.1"; gene_id "LTnewLTref_070010100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 192513 194051 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010200.1"; gene_id "LTnewLTref_070010200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 192513 194051 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010200.1"; gene_id "LTnewLTref_070010200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 196380 196709 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010300.1"; gene_id "LTnewLTref_070010300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 196380 196709 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010300.1"; gene_id "LTnewLTref_070010300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 197696 198256 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010400.1"; gene_id "LTnewLTref_070010400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 197696 198256 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010400.1"; gene_id "LTnewLTref_070010400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 199213 199686 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010500.1"; gene_id "LTnewLTref_070010500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 199213 199686 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010500.1"; gene_id "LTnewLTref_070010500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 200203 200703 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010600.1"; gene_id "LTnewLTref_070010600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 200203 200703 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010600.1"; gene_id "LTnewLTref_070010600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 201516 203075 1 - . transcript_id "LTnewLTref_070010700.1"; gene_id "LTnewLTref_070010700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 201516 203075 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010700.1"; gene_id "LTnewLTref_070010700"; CM024329.1 . transcript 203587 206010 . - . transcript_id "LTnewLTref_070010800.1"; gene_id "LTnewLTref_070010800:pseudogene" CM024329.1 . exon 203587 206010 . - . transcript_id "LTnewLTref_070010800.1"; gene_id "LTnewLTref_070010800:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 207456 208715 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_070010900.1"; gene_id "LTnewLTref_070010900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 207456 207715 0.7 - 2 transcript_id "LTnewLTref_070010900.1"; gene_id "LTnewLTref_070010900"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 208184 208715 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070010900.1"; gene_id "LTnewLTref_070010900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 209216 209485 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070011000.1"; gene_id "LTnewLTref_070011000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 209216 209485 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011000.1"; gene_id "LTnewLTref_070011000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 210116 210411 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_070011100.1"; gene_id "LTnewLTref_070011100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 210116 210187 0.52 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011100.1"; gene_id "LTnewLTref_070011100"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 210244 210411 0.54 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011100.1"; gene_id "LTnewLTref_070011100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 211035 211349 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_070011200.1"; gene_id "LTnewLTref_070011200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 211035 211349 0.5 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011200.1"; gene_id "LTnewLTref_070011200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 213481 213960 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070011300.1"; gene_id "LTnewLTref_070011300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 213481 213960 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011300.1"; gene_id "LTnewLTref_070011300"; CM024329.1 Liftoff transcript 214642 228783 . + . transcript_id "LTnewLTref_070011400.1"; gene_id "LTnewLTref_070011400" CM024329.1 Liftoff CDS 214642 228783 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011400.1"; gene_id "LTnewLTref_070011400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 230314 231510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070011500.1"; gene_id "LTnewLTref_070011500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 230314 231510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011500.1"; gene_id "LTnewLTref_070011500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 233745 234541 0.74 + . transcript_id "LTnewLTref_070011600.1"; gene_id "LTnewLTref_070011600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 233745 234116 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011600.1"; gene_id "LTnewLTref_070011600"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 234182 234541 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011600.1"; gene_id "LTnewLTref_070011600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 235695 236489 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070011700.1"; gene_id "LTnewLTref_070011700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 235695 236489 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011700.1"; gene_id "LTnewLTref_070011700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 237702 238412 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070011800.1"; gene_id "LTnewLTref_070011800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 237702 238412 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011800.1"; gene_id "LTnewLTref_070011800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 241549 242643 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070011900.1"; gene_id "LTnewLTref_070011900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 241549 242643 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070011900.1"; gene_id "LTnewLTref_070011900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 244971 247946 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012000.1"; gene_id "LTnewLTref_070012000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 244971 247946 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012000.1"; gene_id "LTnewLTref_070012000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 245145 247946 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_070012000.2"; gene_id "LTnewLTref_070012000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 245145 247946 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012000.2"; gene_id "LTnewLTref_070012000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 254211 259925 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012100.1"; gene_id "LTnewLTref_070012100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 254211 259925 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012100.1"; gene_id "LTnewLTref_070012100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 261277 261954 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012200.1"; gene_id "LTnewLTref_070012200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 261277 261954 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012200.1"; gene_id "LTnewLTref_070012200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 263673 265070 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012300.1"; gene_id "LTnewLTref_070012300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 263673 265070 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012300.1"; gene_id "LTnewLTref_070012300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 266080 268093 0.9 + . transcript_id "LTnewLTref_070012400.1"; gene_id "LTnewLTref_070012400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 266080 267983 0.9 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012400.1"; gene_id "LTnewLTref_070012400"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 268087 268093 0.9 + 1 transcript_id "LTnewLTref_070012400.1"; gene_id "LTnewLTref_070012400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 266080 270185 0.57 + . transcript_id "LTnewLTref_070012400.2"; gene_id "LTnewLTref_070012400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 266080 268100 0.68 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012400.2"; gene_id "LTnewLTref_070012400"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 268166 270185 0.68 + 1 transcript_id "LTnewLTref_070012400.2"; gene_id "LTnewLTref_070012400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 268233 268866 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_070012400.3"; gene_id "LTnewLTref_070012400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 268233 268776 0.45 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012400.3"; gene_id "LTnewLTref_070012400"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 268844 268866 0.68 + 2 transcript_id "LTnewLTref_070012400.3"; gene_id "LTnewLTref_070012400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 271329 276140 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012500.1"; gene_id "LTnewLTref_070012500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 271329 276140 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012500.1"; gene_id "LTnewLTref_070012500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 274527 276140 0.89 + . transcript_id "LTnewLTref_070012500.2"; gene_id "LTnewLTref_070012500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 274527 276140 0.89 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012500.2"; gene_id "LTnewLTref_070012500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 277317 279044 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012600.1"; gene_id "LTnewLTref_070012600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 277317 279044 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012600.1"; gene_id "LTnewLTref_070012600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 280401 280988 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012700.1"; gene_id "LTnewLTref_070012700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 280401 280988 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012700.1"; gene_id "LTnewLTref_070012700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 281805 282554 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012800.1"; gene_id "LTnewLTref_070012800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 281805 282554 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012800.1"; gene_id "LTnewLTref_070012800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 283619 285204 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_070012900.1"; gene_id "LTnewLTref_070012900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 283619 285116 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012900.1"; gene_id "LTnewLTref_070012900"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 285173 285204 0.68 + 2 transcript_id "LTnewLTref_070012900.1"; gene_id "LTnewLTref_070012900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 283619 285508 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070012900.2"; gene_id "LTnewLTref_070012900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 283619 285508 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070012900.2"; gene_id "LTnewLTref_070012900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 287305 290620 0.92 + . transcript_id "LTnewLTref_070013000.1"; gene_id "LTnewLTref_070013000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 287305 287811 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013000.1"; gene_id "LTnewLTref_070013000"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 287855 290620 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013000.1"; gene_id "LTnewLTref_070013000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 292101 293108 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070013100.1"; gene_id "LTnewLTref_070013100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 292101 293108 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013100.1"; gene_id "LTnewLTref_070013100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 294769 298128 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070013200.1"; gene_id "LTnewLTref_070013200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 294769 298128 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013200.1"; gene_id "LTnewLTref_070013200"; CM024329.1 . transcript 298589 299133 . - . transcript_id "LTnewLTref_070013300.1"; gene_id "LTnewLTref_070013300:pseudogene" CM024329.1 . exon 298589 298642 . - . transcript_id "LTnewLTref_070013300.1"; gene_id "LTnewLTref_070013300:pseudogene"; CM024329.1 . exon 298645 299133 . - . transcript_id "LTnewLTref_070013300.1"; gene_id "LTnewLTref_070013300:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 299677 299964 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_070013400.1"; gene_id "LTnewLTref_070013400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 299677 299964 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013400.1"; gene_id "LTnewLTref_070013400"; CM024329.1 Liftoff transcript 301590 301826 . + . transcript_id "LTnewLTref_070013500.1"; gene_id "LTnewLTref_070013500" CM024329.1 Liftoff CDS 301590 301826 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013500.1"; gene_id "LTnewLTref_070013500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 304078 305637 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070013600.1"; gene_id "LTnewLTref_070013600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 304078 305637 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013600.1"; gene_id "LTnewLTref_070013600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 306905 307411 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070013700.1"; gene_id "LTnewLTref_070013700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 306905 307411 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013700.1"; gene_id "LTnewLTref_070013700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 308599 309171 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070013800.1"; gene_id "LTnewLTref_070013800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 308599 309171 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013800.1"; gene_id "LTnewLTref_070013800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 311148 316779 0.85 + . transcript_id "LTnewLTref_070013900.1"; gene_id "LTnewLTref_070013900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 311148 313117 0.85 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070013900.1"; gene_id "LTnewLTref_070013900"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 313161 316779 0.95 + 1 transcript_id "LTnewLTref_070013900.1"; gene_id "LTnewLTref_070013900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 318777 321527 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014000.1"; gene_id "LTnewLTref_070014000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 318777 321527 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014000.1"; gene_id "LTnewLTref_070014000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 322444 323007 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014100.1"; gene_id "LTnewLTref_070014100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 322444 323007 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014100.1"; gene_id "LTnewLTref_070014100"; CM024329.1 . transcript 324363 326135 . + . transcript_id "LTnewLTref_070014200.1"; gene_id "LTnewLTref_070014200:pseudogene" CM024329.1 . exon 324363 326135 . + . transcript_id "LTnewLTref_070014200.1"; gene_id "LTnewLTref_070014200:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 327448 331227 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014300.1"; gene_id "LTnewLTref_070014300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 327448 331227 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014300.1"; gene_id "LTnewLTref_070014300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 332273 334657 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014400.1"; gene_id "LTnewLTref_070014400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 332273 334657 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014400.1"; gene_id "LTnewLTref_070014400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 338200 349608 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014500.1"; gene_id "LTnewLTref_070014500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 338200 349608 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014500.1"; gene_id "LTnewLTref_070014500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 350505 350957 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014600.1"; gene_id "LTnewLTref_070014600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 350505 350957 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014600.1"; gene_id "LTnewLTref_070014600"; CM024329.1 . transcript 352292 352595 . + . transcript_id "LTnewLTref_070014700.1"; gene_id "LTnewLTref_070014700:pseudogene" CM024329.1 . exon 352292 352595 . + . transcript_id "LTnewLTref_070014700.1"; gene_id "LTnewLTref_070014700:pseudogene"; CM024329.1 . transcript 354623 355936 . + . transcript_id "LTnewLTref_070014800.1"; gene_id "LTnewLTref_070014800:pseudogene" CM024329.1 . exon 354623 355936 . + . transcript_id "LTnewLTref_070014800.1"; gene_id "LTnewLTref_070014800:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 357161 361084 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070014900.1"; gene_id "LTnewLTref_070014900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 357161 361084 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070014900.1"; gene_id "LTnewLTref_070014900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 364051 365868 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070015000.1"; gene_id "LTnewLTref_070015000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 364051 365868 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015000.1"; gene_id "LTnewLTref_070015000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 368746 370428 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070015100.1"; gene_id "LTnewLTref_070015100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 368746 370428 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015100.1"; gene_id "LTnewLTref_070015100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 371180 372157 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070015200.1"; gene_id "LTnewLTref_070015200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 371180 372157 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015200.1"; gene_id "LTnewLTref_070015200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 373683 375698 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070015300.1"; gene_id "LTnewLTref_070015300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 373683 375698 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015300.1"; gene_id "LTnewLTref_070015300"; CM024329.1 Aragorn_1.2.36 transcript 379201 379272 . - . transcript_id "LTnewLTref_070015400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_070015400" CM024329.1 Aragorn_1.2.36 exon 379201 379272 . - . transcript_id "LTnewLTref_070015400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_070015400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 379727 380785 0.87 + . transcript_id "LTnewLTref_070015500.1"; gene_id "LTnewLTref_070015500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 379727 380785 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015500.1"; gene_id "LTnewLTref_070015500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 381701 383494 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070015600.1"; gene_id "LTnewLTref_070015600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 381701 383494 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015600.1"; gene_id "LTnewLTref_070015600"; CM024329.1 . transcript 384995 385306 . + . transcript_id "LTnewLTref_070015700.1"; gene_id "LTnewLTref_070015700:pseudogene" CM024329.1 . exon 384995 385306 . + . transcript_id "LTnewLTref_070015700.1"; gene_id "LTnewLTref_070015700:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 388746 395984 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070015800.1"; gene_id "LTnewLTref_070015800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 388746 395984 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015800.1"; gene_id "LTnewLTref_070015800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 403262 409192 0.99 + . transcript_id "LTnewLTref_070015900.1"; gene_id "LTnewLTref_070015900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 403262 409192 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070015900.1"; gene_id "LTnewLTref_070015900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 413178 420212 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070016000.1"; gene_id "LTnewLTref_070016000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 413178 420212 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016000.1"; gene_id "LTnewLTref_070016000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 423498 424046 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070016100.1"; gene_id "LTnewLTref_070016100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 423498 424046 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016100.1"; gene_id "LTnewLTref_070016100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 433478 437871 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_070016200.1"; gene_id "LTnewLTref_070016200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 433478 436761 0.51 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016200.1"; gene_id "LTnewLTref_070016200"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 436845 437871 0.55 + 1 transcript_id "LTnewLTref_070016200.1"; gene_id "LTnewLTref_070016200"; CM024329.1 . transcript 436480 436746 . - . transcript_id "LTnewLTref_070016300.1"; gene_id "LTnewLTref_070016300:pseudogene" CM024329.1 . exon 436480 436746 . - . transcript_id "LTnewLTref_070016300.1"; gene_id "LTnewLTref_070016300:pseudogene"; CM024329.1 Liftoff transcript 437476 437871 . + . transcript_id "LTnewLTref_070016400.1"; gene_id "LTnewLTref_070016400" CM024329.1 Liftoff CDS 437476 437871 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016400.1"; gene_id "LTnewLTref_070016400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 439182 440309 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070016500.1"; gene_id "LTnewLTref_070016500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 439182 440309 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016500.1"; gene_id "LTnewLTref_070016500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 445292 449359 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070016600.1"; gene_id "LTnewLTref_070016600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 445292 449359 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016600.1"; gene_id "LTnewLTref_070016600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 454978 456873 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070016700.1"; gene_id "LTnewLTref_070016700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 454978 456873 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016700.1"; gene_id "LTnewLTref_070016700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 457650 458303 0.44 + . transcript_id "LTnewLTref_070016800.1"; gene_id "LTnewLTref_070016800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 457650 458303 0.44 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016800.1"; gene_id "LTnewLTref_070016800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 460388 461278 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070016900.1"; gene_id "LTnewLTref_070016900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 460388 461278 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070016900.1"; gene_id "LTnewLTref_070016900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 464948 470431 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017000.1"; gene_id "LTnewLTref_070017000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 464948 470431 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017000.1"; gene_id "LTnewLTref_070017000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 471046 472059 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017100.1"; gene_id "LTnewLTref_070017100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 471046 472059 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017100.1"; gene_id "LTnewLTref_070017100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 473456 481174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017200.1"; gene_id "LTnewLTref_070017200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 473456 477836 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017200.1"; gene_id "LTnewLTref_070017200"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 477945 481174 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_070017200.1"; gene_id "LTnewLTref_070017200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 481911 482915 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017300.1"; gene_id "LTnewLTref_070017300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 481911 482915 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017300.1"; gene_id "LTnewLTref_070017300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 485068 492414 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017400.1"; gene_id "LTnewLTref_070017400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 485068 492414 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017400.1"; gene_id "LTnewLTref_070017400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 495017 502297 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017500.1"; gene_id "LTnewLTref_070017500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 495017 502297 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017500.1"; gene_id "LTnewLTref_070017500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 500171 502297 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017500.2"; gene_id "LTnewLTref_070017500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 500171 502297 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017500.2"; gene_id "LTnewLTref_070017500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 503824 507285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017600.1"; gene_id "LTnewLTref_070017600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 503824 507285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017600.1"; gene_id "LTnewLTref_070017600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 508872 511496 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017700.1"; gene_id "LTnewLTref_070017700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 508872 511496 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017700.1"; gene_id "LTnewLTref_070017700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 512411 512767 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070017800.1"; gene_id "LTnewLTref_070017800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 512411 512767 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017800.1"; gene_id "LTnewLTref_070017800"; CM024329.1 Liftoff transcript 514067 515125 . + . transcript_id "LTnewLTref_070017900.1"; gene_id "LTnewLTref_070017900" CM024329.1 Liftoff CDS 514067 515125 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_070017900.1"; gene_id "LTnewLTref_070017900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 517782 518786 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018000.1"; gene_id "LTnewLTref_070018000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 517782 518786 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018000.1"; gene_id "LTnewLTref_070018000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 520310 520798 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018100.1"; gene_id "LTnewLTref_070018100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 520310 520798 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018100.1"; gene_id "LTnewLTref_070018100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 521809 525837 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018200.1"; gene_id "LTnewLTref_070018200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 521809 525837 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018200.1"; gene_id "LTnewLTref_070018200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 525427 525837 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018200.2"; gene_id "LTnewLTref_070018200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 525427 525837 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018200.2"; gene_id "LTnewLTref_070018200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 526824 527171 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018300.1"; gene_id "LTnewLTref_070018300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 526824 527171 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018300.1"; gene_id "LTnewLTref_070018300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 528918 530042 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018400.1"; gene_id "LTnewLTref_070018400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 528918 530042 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018400.1"; gene_id "LTnewLTref_070018400"; CM024329.1 . transcript 530446 531079 . + . transcript_id "LTnewLTref_070018500.1"; gene_id "LTnewLTref_070018500:pseudogene" CM024329.1 . exon 530446 531079 . + . transcript_id "LTnewLTref_070018500.1"; gene_id "LTnewLTref_070018500:pseudogene"; CM024329.1 Liftoff transcript 531946 533280 . + . transcript_id "LTnewLTref_070018600.1"; gene_id "LTnewLTref_070018600" CM024329.1 Liftoff CDS 531946 533280 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018600.1"; gene_id "LTnewLTref_070018600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 534317 538048 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018700.1"; gene_id "LTnewLTref_070018700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 534317 538048 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018700.1"; gene_id "LTnewLTref_070018700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 539892 540242 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018800.1"; gene_id "LTnewLTref_070018800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 539892 540242 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018800.1"; gene_id "LTnewLTref_070018800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 541124 542668 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070018900.1"; gene_id "LTnewLTref_070018900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 541124 542668 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070018900.1"; gene_id "LTnewLTref_070018900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 543221 544573 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019000.1"; gene_id "LTnewLTref_070019000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 543221 544573 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019000.1"; gene_id "LTnewLTref_070019000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 546076 548595 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019100.1"; gene_id "LTnewLTref_070019100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 546076 548595 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019100.1"; gene_id "LTnewLTref_070019100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 550081 551334 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019200.1"; gene_id "LTnewLTref_070019200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 550081 551334 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019200.1"; gene_id "LTnewLTref_070019200"; CM024329.1 . transcript 552874 553794 . + . transcript_id "LTnewLTref_070019300.1"; gene_id "LTnewLTref_070019300:pseudogene" CM024329.1 . exon 552874 553794 . + . transcript_id "LTnewLTref_070019300.1"; gene_id "LTnewLTref_070019300:pseudogene"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 554448 554759 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019400.1"; gene_id "LTnewLTref_070019400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 554448 554759 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019400.1"; gene_id "LTnewLTref_070019400"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 555299 555619 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019500.1"; gene_id "LTnewLTref_070019500" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 555299 555619 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019500.1"; gene_id "LTnewLTref_070019500"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 556963 558051 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019600.1"; gene_id "LTnewLTref_070019600" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 556963 558051 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019600.1"; gene_id "LTnewLTref_070019600"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 559740 560777 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019700.1"; gene_id "LTnewLTref_070019700" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 559740 560777 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019700.1"; gene_id "LTnewLTref_070019700"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 562873 564603 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019800.1"; gene_id "LTnewLTref_070019800" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 562873 564603 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019800.1"; gene_id "LTnewLTref_070019800"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 565445 565975 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070019900.1"; gene_id "LTnewLTref_070019900" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 565445 565975 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070019900.1"; gene_id "LTnewLTref_070019900"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 568148 575776 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070020000.1"; gene_id "LTnewLTref_070020000" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 568148 575776 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070020000.1"; gene_id "LTnewLTref_070020000"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 576626 578101 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070020100.1"; gene_id "LTnewLTref_070020100" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 576626 578101 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070020100.1"; gene_id "LTnewLTref_070020100"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 583446 583670 1 + . transcript_id "LTnewLTref_070020200.1"; gene_id "LTnewLTref_070020200" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 583446 583670 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070020200.1"; gene_id "LTnewLTref_070020200"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 583806 585891 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_070020300.1"; gene_id "LTnewLTref_070020300" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 583806 585107 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070020300.1"; gene_id "LTnewLTref_070020300"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 585163 585891 0.64 + 0 transcript_id "LTnewLTref_070020300.1"; gene_id "LTnewLTref_070020300"; CM024329.1 AUGUSTUS transcript 590697 591727 0.48 - . transcript_id "LTnewLTref_070020400.1"; gene_id "LTnewLTref_070020400" CM024329.1 AUGUSTUS CDS 590697 591061 0.99 - 2 transcript_id "LTnewLTref_070020400.1"; gene_id "LTnewLTref_070020400"; CM024329.1 AUGUSTUS CDS 591622 591727 0.48 - 0 transcript_id "LTnewLTref_070020400.1"; gene_id "LTnewLTref_070020400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 1 488 0.97 + . transcript_id "LTnewLTref_080005000.1"; gene_id "LTnewLTref_080005000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 1 488 0.97 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080005000.1"; gene_id "LTnewLTref_080005000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 549 1089 0.72 + . transcript_id "LTnewLTref_080005100.1"; gene_id "LTnewLTref_080005100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 549 660 0.72 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005100.1"; gene_id "LTnewLTref_080005100"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 767 1089 0.85 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080005100.1"; gene_id "LTnewLTref_080005100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 4507 8103 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005200.1"; gene_id "LTnewLTref_080005200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 4507 8103 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005200.1"; gene_id "LTnewLTref_080005200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 9109 9930 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005300.1"; gene_id "LTnewLTref_080005300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 9109 9930 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005300.1"; gene_id "LTnewLTref_080005300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 10969 11616 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005400.1"; gene_id "LTnewLTref_080005400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 10969 11616 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005400.1"; gene_id "LTnewLTref_080005400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 13369 14058 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005500.1"; gene_id "LTnewLTref_080005500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 13369 14058 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005500.1"; gene_id "LTnewLTref_080005500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 15139 15366 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005600.1"; gene_id "LTnewLTref_080005600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 15139 15366 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005600.1"; gene_id "LTnewLTref_080005600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 16924 17481 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005700.1"; gene_id "LTnewLTref_080005700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 16924 17481 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005700.1"; gene_id "LTnewLTref_080005700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 18084 19973 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005800.1"; gene_id "LTnewLTref_080005800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 18084 19973 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005800.1"; gene_id "LTnewLTref_080005800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 20867 23467 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080005900.1"; gene_id "LTnewLTref_080005900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 20867 23467 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080005900.1"; gene_id "LTnewLTref_080005900"; CM024330.1 . transcript 24079 24257 . + . transcript_id "LTnewLTref_080006000.1"; gene_id "LTnewLTref_080006000:pseudogene" CM024330.1 . exon 24079 24257 . + . transcript_id "LTnewLTref_080006000.1"; gene_id "LTnewLTref_080006000:pseudogene"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 24712 28113 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006100.1"; gene_id "LTnewLTref_080006100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 24712 28113 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006100.1"; gene_id "LTnewLTref_080006100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 29721 30433 0.82 + . transcript_id "LTnewLTref_080006200.1"; gene_id "LTnewLTref_080006200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 29721 30332 0.83 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006200.1"; gene_id "LTnewLTref_080006200"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 30428 30433 0.97 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006200.1"; gene_id "LTnewLTref_080006200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 29721 31385 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_080006200.2"; gene_id "LTnewLTref_080006200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 29721 31385 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006200.2"; gene_id "LTnewLTref_080006200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 32456 34726 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006300.1"; gene_id "LTnewLTref_080006300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 32456 34726 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006300.1"; gene_id "LTnewLTref_080006300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 36571 37383 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006400.1"; gene_id "LTnewLTref_080006400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 36571 37383 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006400.1"; gene_id "LTnewLTref_080006400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 38786 42238 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006500.1"; gene_id "LTnewLTref_080006500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 38786 42238 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006500.1"; gene_id "LTnewLTref_080006500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 45026 46783 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006600.1"; gene_id "LTnewLTref_080006600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 45026 46783 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006600.1"; gene_id "LTnewLTref_080006600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 47685 51467 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006700.1"; gene_id "LTnewLTref_080006700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 47685 51467 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006700.1"; gene_id "LTnewLTref_080006700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 52467 54026 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006800.1"; gene_id "LTnewLTref_080006800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 52467 54026 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006800.1"; gene_id "LTnewLTref_080006800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 55225 55926 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080006900.1"; gene_id "LTnewLTref_080006900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 55225 55926 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080006900.1"; gene_id "LTnewLTref_080006900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 62103 64052 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007000.1"; gene_id "LTnewLTref_080007000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 62103 64052 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007000.1"; gene_id "LTnewLTref_080007000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 70035 70919 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007100.1"; gene_id "LTnewLTref_080007100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 70035 70919 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007100.1"; gene_id "LTnewLTref_080007100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 72024 74816 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007200.1"; gene_id "LTnewLTref_080007200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 72024 74816 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007200.1"; gene_id "LTnewLTref_080007200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 76318 78279 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007300.1"; gene_id "LTnewLTref_080007300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 76318 78279 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007300.1"; gene_id "LTnewLTref_080007300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 80081 81586 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007400.1"; gene_id "LTnewLTref_080007400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 80081 81586 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007400.1"; gene_id "LTnewLTref_080007400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 82148 85426 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007500.1"; gene_id "LTnewLTref_080007500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 82148 85426 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007500.1"; gene_id "LTnewLTref_080007500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 86452 88020 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007600.1"; gene_id "LTnewLTref_080007600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 86452 88020 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007600.1"; gene_id "LTnewLTref_080007600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 89375 90163 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007700.1"; gene_id "LTnewLTref_080007700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 89375 90163 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007700.1"; gene_id "LTnewLTref_080007700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 91147 91488 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007800.1"; gene_id "LTnewLTref_080007800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 91147 91488 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007800.1"; gene_id "LTnewLTref_080007800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 92447 94477 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080007900.1"; gene_id "LTnewLTref_080007900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 92447 94477 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080007900.1"; gene_id "LTnewLTref_080007900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 95822 98389 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080008000.1"; gene_id "LTnewLTref_080008000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 95822 98389 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008000.1"; gene_id "LTnewLTref_080008000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 101436 102716 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080008100.1"; gene_id "LTnewLTref_080008100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 101436 102716 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008100.1"; gene_id "LTnewLTref_080008100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 103452 104144 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080008200.1"; gene_id "LTnewLTref_080008200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 103452 104144 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008200.1"; gene_id "LTnewLTref_080008200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 106053 106811 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080008300.1"; gene_id "LTnewLTref_080008300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 106053 106811 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008300.1"; gene_id "LTnewLTref_080008300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 107896 108811 0.98 + . transcript_id "LTnewLTref_080008400.1"; gene_id "LTnewLTref_080008400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 107896 108689 0.98 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008400.1"; gene_id "LTnewLTref_080008400"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 108799 108811 1 + 1 transcript_id "LTnewLTref_080008400.1"; gene_id "LTnewLTref_080008400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 109676 110353 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080008500.1"; gene_id "LTnewLTref_080008500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 109676 110353 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008500.1"; gene_id "LTnewLTref_080008500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 111401 111688 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080008600.1"; gene_id "LTnewLTref_080008600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 111401 111688 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008600.1"; gene_id "LTnewLTref_080008600"; CM024330.1 Liftoff transcript 112404 121055 . + . transcript_id "LTnewLTref_080008700.1"; gene_id "LTnewLTref_080008700" CM024330.1 Liftoff CDS 112404 121055 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008700.1"; gene_id "LTnewLTref_080008700"; CM024330.1 Liftoff transcript 121095 127337 . + . transcript_id "LTnewLTref_080008800.1"; gene_id "LTnewLTref_080008800" CM024330.1 Liftoff CDS 121095 127337 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080008800.1"; gene_id "LTnewLTref_080008800"; CM024330.1 . transcript 128589 133455 . + . transcript_id "LTnewLTref_080008900.1"; gene_id "LTnewLTref_080008900:pseudogene" CM024330.1 . exon 128589 133455 . + . transcript_id "LTnewLTref_080008900.1"; gene_id "LTnewLTref_080008900:pseudogene"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 136088 137818 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009000.1"; gene_id "LTnewLTref_080009000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 136088 137818 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009000.1"; gene_id "LTnewLTref_080009000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 139274 139936 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009100.1"; gene_id "LTnewLTref_080009100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 139274 139936 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009100.1"; gene_id "LTnewLTref_080009100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 141036 146768 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009200.1"; gene_id "LTnewLTref_080009200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 141036 146768 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009200.1"; gene_id "LTnewLTref_080009200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 147961 154182 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009300.1"; gene_id "LTnewLTref_080009300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 147961 148302 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009300.1"; gene_id "LTnewLTref_080009300"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 148396 154182 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009300.1"; gene_id "LTnewLTref_080009300"; CM024330.1 . transcript 155145 158713 . + . transcript_id "LTnewLTref_080009400.1"; gene_id "LTnewLTref_080009400:pseudogene" CM024330.1 . exon 155145 158713 . + . transcript_id "LTnewLTref_080009400.1"; gene_id "LTnewLTref_080009400:pseudogene"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 160087 164298 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009500.1"; gene_id "LTnewLTref_080009500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 160087 164298 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009500.1"; gene_id "LTnewLTref_080009500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 166931 172869 0.49 + . transcript_id "LTnewLTref_080009600.1"; gene_id "LTnewLTref_080009600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 166931 169647 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009600.1"; gene_id "LTnewLTref_080009600"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 169698 172869 0.49 + 1 transcript_id "LTnewLTref_080009600.1"; gene_id "LTnewLTref_080009600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 174250 177024 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009700.1"; gene_id "LTnewLTref_080009700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 174250 177024 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009700.1"; gene_id "LTnewLTref_080009700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 178311 185660 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080009800.1"; gene_id "LTnewLTref_080009800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 178311 185660 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009800.1"; gene_id "LTnewLTref_080009800"; CM024330.1 Liftoff transcript 186214 186535 . + . transcript_id "LTnewLTref_080009900.1"; gene_id "LTnewLTref_080009900" CM024330.1 Liftoff exon 186214 186535 . + . transcript_id "LTnewLTref_080009900.1"; gene_id "LTnewLTref_080009900"; CM024330.1 Liftoff CDS 186215 186535 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080009900.1"; gene_id "LTnewLTref_080009900"; CM024330.1 Liftoff transcript 186681 187061 . + . transcript_id "LTnewLTref_080010000.1"; gene_id "LTnewLTref_080010000" CM024330.1 Liftoff CDS 186681 187061 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010000.1"; gene_id "LTnewLTref_080010000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 188093 188980 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010100.1"; gene_id "LTnewLTref_080010100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 188093 188980 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010100.1"; gene_id "LTnewLTref_080010100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 191948 192301 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010200.1"; gene_id "LTnewLTref_080010200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 191948 192301 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010200.1"; gene_id "LTnewLTref_080010200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 194966 195814 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010300.1"; gene_id "LTnewLTref_080010300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 194966 195814 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010300.1"; gene_id "LTnewLTref_080010300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 196746 198245 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010400.1"; gene_id "LTnewLTref_080010400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 196746 198245 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010400.1"; gene_id "LTnewLTref_080010400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 199076 200101 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010500.1"; gene_id "LTnewLTref_080010500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 199076 200101 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010500.1"; gene_id "LTnewLTref_080010500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 200781 203303 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010600.1"; gene_id "LTnewLTref_080010600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 200781 203303 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010600.1"; gene_id "LTnewLTref_080010600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 205336 212307 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010700.1"; gene_id "LTnewLTref_080010700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 205336 212307 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010700.1"; gene_id "LTnewLTref_080010700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 212818 218737 0.46 + . transcript_id "LTnewLTref_080010800.1"; gene_id "LTnewLTref_080010800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 212818 214369 0.46 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010800.1"; gene_id "LTnewLTref_080010800"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 214443 218737 0.59 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080010800.1"; gene_id "LTnewLTref_080010800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 219339 220397 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080010900.1"; gene_id "LTnewLTref_080010900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 219339 220397 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080010900.1"; gene_id "LTnewLTref_080010900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 222901 224367 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011000.1"; gene_id "LTnewLTref_080011000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 222901 224367 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011000.1"; gene_id "LTnewLTref_080011000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 226206 227243 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011100.1"; gene_id "LTnewLTref_080011100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 226206 227243 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011100.1"; gene_id "LTnewLTref_080011100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 229104 229934 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011200.1"; gene_id "LTnewLTref_080011200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 229104 229934 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011200.1"; gene_id "LTnewLTref_080011200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 231083 231718 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011300.1"; gene_id "LTnewLTref_080011300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 231083 231718 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011300.1"; gene_id "LTnewLTref_080011300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 234303 235016 0.93 + . transcript_id "LTnewLTref_080011400.1"; gene_id "LTnewLTref_080011400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 234303 235016 0.93 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011400.1"; gene_id "LTnewLTref_080011400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 237325 238875 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011500.1"; gene_id "LTnewLTref_080011500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 237325 238875 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011500.1"; gene_id "LTnewLTref_080011500"; CM024330.1 Liftoff transcript 239450 239746 . + . transcript_id "LTnewLTref_080011600.1"; gene_id "LTnewLTref_080011600" CM024330.1 Liftoff CDS 239450 239746 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011600.1"; gene_id "LTnewLTref_080011600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 245161 245592 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011700.1"; gene_id "LTnewLTref_080011700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 245161 245592 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011700.1"; gene_id "LTnewLTref_080011700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 252562 261210 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011800.1"; gene_id "LTnewLTref_080011800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 252562 261210 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011800.1"; gene_id "LTnewLTref_080011800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 264549 268153 0.54 + . transcript_id "LTnewLTref_080011900.1"; gene_id "LTnewLTref_080011900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 264549 268044 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011900.1"; gene_id "LTnewLTref_080011900"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 268110 268153 0.54 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080011900.1"; gene_id "LTnewLTref_080011900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 264549 271199 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080011900.2"; gene_id "LTnewLTref_080011900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 264549 271199 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080011900.2"; gene_id "LTnewLTref_080011900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 272961 273863 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080012000.1"; gene_id "LTnewLTref_080012000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 272961 273863 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012000.1"; gene_id "LTnewLTref_080012000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 276679 277072 0.45 + . transcript_id "LTnewLTref_080012100.1"; gene_id "LTnewLTref_080012100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 276679 276780 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012100.1"; gene_id "LTnewLTref_080012100"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 276890 277072 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012100.1"; gene_id "LTnewLTref_080012100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 279571 280416 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080012200.1"; gene_id "LTnewLTref_080012200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 279571 280416 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012200.1"; gene_id "LTnewLTref_080012200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 282505 286584 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080012300.1"; gene_id "LTnewLTref_080012300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 282505 286584 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012300.1"; gene_id "LTnewLTref_080012300"; CM024330.1 . transcript 292386 293029 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012400.1"; gene_id "LTnewLTref_080012400:pseudogene" CM024330.1 . exon 292386 292970 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012400.1"; gene_id "LTnewLTref_080012400:pseudogene"; CM024330.1 . exon 292973 293029 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012400.1"; gene_id "LTnewLTref_080012400:pseudogene"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 297111 298618 0.8 + . transcript_id "LTnewLTref_080012500.1"; gene_id "LTnewLTref_080012500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 297111 298020 0.92 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012500.1"; gene_id "LTnewLTref_080012500"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 298590 298618 0.8 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080012500.1"; gene_id "LTnewLTref_080012500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 299486 301300 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080012600.1"; gene_id "LTnewLTref_080012600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 299486 301300 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012600.1"; gene_id "LTnewLTref_080012600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 302620 304527 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080012700.1"; gene_id "LTnewLTref_080012700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 302620 304527 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012700.1"; gene_id "LTnewLTref_080012700"; CM024330.1 . transcript 305626 306673 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012800.1"; gene_id "LTnewLTref_080012800:pseudogene" CM024330.1 . exon 305626 306549 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012800.1"; gene_id "LTnewLTref_080012800:pseudogene"; CM024330.1 . exon 306552 306587 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012800.1"; gene_id "LTnewLTref_080012800:pseudogene"; CM024330.1 . exon 306590 306673 . + . transcript_id "LTnewLTref_080012800.1"; gene_id "LTnewLTref_080012800:pseudogene"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 307814 309738 0.56 + . transcript_id "LTnewLTref_080012900.1"; gene_id "LTnewLTref_080012900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 307814 308345 0.8 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080012900.1"; gene_id "LTnewLTref_080012900"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 309629 309738 0.59 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080012900.1"; gene_id "LTnewLTref_080012900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 310393 311605 0.74 - . transcript_id "LTnewLTref_080013000.1"; gene_id "LTnewLTref_080013000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 310393 310589 0.74 - 2 transcript_id "LTnewLTref_080013000.1"; gene_id "LTnewLTref_080013000"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 310699 311605 0.75 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013000.1"; gene_id "LTnewLTref_080013000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 314819 316757 0.92 - . transcript_id "LTnewLTref_080013100.1"; gene_id "LTnewLTref_080013100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 314819 314860 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013100.1"; gene_id "LTnewLTref_080013100"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 315699 316757 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013100.1"; gene_id "LTnewLTref_080013100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 321355 321900 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_080013200.1"; gene_id "LTnewLTref_080013200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 321355 321900 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013200.1"; gene_id "LTnewLTref_080013200"; CM024330.1 . transcript 323478 324350 . + . transcript_id "LTnewLTref_080013300.1"; gene_id "LTnewLTref_080013300" CM024330.1 . CDS 323478 324350 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080013300.1"; gene_id "LTnewLTref_080013300"; CM024330.1 Liftoff transcript 327714 327908 . - . transcript_id "LTnewLTref_080013400.1"; gene_id "LTnewLTref_080013400" CM024330.1 Liftoff CDS 327714 327908 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013400.1"; gene_id "LTnewLTref_080013400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 327931 329190 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080013500.1"; gene_id "LTnewLTref_080013500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 327931 329190 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013500.1"; gene_id "LTnewLTref_080013500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 330866 332398 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080013600.1"; gene_id "LTnewLTref_080013600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 330866 332398 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013600.1"; gene_id "LTnewLTref_080013600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 333811 334941 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080013700.1"; gene_id "LTnewLTref_080013700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 333811 334941 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013700.1"; gene_id "LTnewLTref_080013700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 336445 340871 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_080013800.1"; gene_id "LTnewLTref_080013800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 336445 336489 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013800.1"; gene_id "LTnewLTref_080013800"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 336540 340871 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013800.1"; gene_id "LTnewLTref_080013800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 342945 349283 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080013900.1"; gene_id "LTnewLTref_080013900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 342945 349283 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080013900.1"; gene_id "LTnewLTref_080013900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 350441 351055 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014000.1"; gene_id "LTnewLTref_080014000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 350441 351055 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014000.1"; gene_id "LTnewLTref_080014000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 351835 352188 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014100.1"; gene_id "LTnewLTref_080014100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 351835 352188 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014100.1"; gene_id "LTnewLTref_080014100"; CM024330.1 Liftoff transcript 352282 352470 . - . transcript_id "LTnewLTref_080014200.1"; gene_id "LTnewLTref_080014200" CM024330.1 Liftoff CDS 352282 352470 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014200.1"; gene_id "LTnewLTref_080014200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 355374 358826 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014300.1"; gene_id "LTnewLTref_080014300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 355374 358826 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014300.1"; gene_id "LTnewLTref_080014300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 359752 360642 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014400.1"; gene_id "LTnewLTref_080014400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 359752 360642 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014400.1"; gene_id "LTnewLTref_080014400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 361355 361795 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014500.1"; gene_id "LTnewLTref_080014500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 361355 361795 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014500.1"; gene_id "LTnewLTref_080014500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 363216 364913 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014600.1"; gene_id "LTnewLTref_080014600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 363216 364913 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014600.1"; gene_id "LTnewLTref_080014600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 366789 369287 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014700.1"; gene_id "LTnewLTref_080014700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 366789 369287 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014700.1"; gene_id "LTnewLTref_080014700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 374145 374585 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014800.1"; gene_id "LTnewLTref_080014800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 374145 374585 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014800.1"; gene_id "LTnewLTref_080014800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 374861 377974 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080014900.1"; gene_id "LTnewLTref_080014900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 374861 377974 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080014900.1"; gene_id "LTnewLTref_080014900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 379140 380120 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015000.1"; gene_id "LTnewLTref_080015000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 379140 380120 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015000.1"; gene_id "LTnewLTref_080015000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 380825 388198 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015100.1"; gene_id "LTnewLTref_080015100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 380825 388198 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015100.1"; gene_id "LTnewLTref_080015100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 390706 390930 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015200.1"; gene_id "LTnewLTref_080015200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 390706 390930 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015200.1"; gene_id "LTnewLTref_080015200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 390961 392037 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015300.1"; gene_id "LTnewLTref_080015300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 390961 392037 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015300.1"; gene_id "LTnewLTref_080015300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 393443 394774 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015400.1"; gene_id "LTnewLTref_080015400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 393443 394774 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015400.1"; gene_id "LTnewLTref_080015400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 396180 397512 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015500.1"; gene_id "LTnewLTref_080015500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 396180 396878 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015500.1"; gene_id "LTnewLTref_080015500"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 396925 397512 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015500.1"; gene_id "LTnewLTref_080015500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 398916 400249 0.49 - . transcript_id "LTnewLTref_080015600.1"; gene_id "LTnewLTref_080015600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 398916 399774 0.7 - 1 transcript_id "LTnewLTref_080015600.1"; gene_id "LTnewLTref_080015600"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 399873 400249 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015600.1"; gene_id "LTnewLTref_080015600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 401652 402983 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015700.1"; gene_id "LTnewLTref_080015700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 401652 402983 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015700.1"; gene_id "LTnewLTref_080015700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 404368 405717 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015800.1"; gene_id "LTnewLTref_080015800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 404368 405717 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015800.1"; gene_id "LTnewLTref_080015800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 406573 408402 1 - . transcript_id "LTnewLTref_080015900.1"; gene_id "LTnewLTref_080015900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 406573 408402 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_080015900.1"; gene_id "LTnewLTref_080015900"; CM024330.1 . transcript 414784 415222 . + . transcript_id "LTnewLTref_080016000.1"; gene_id "LTnewLTref_080016000:pseudogene" CM024330.1 . exon 414784 415176 . + . transcript_id "LTnewLTref_080016000.1"; gene_id "LTnewLTref_080016000:pseudogene"; CM024330.1 . exon 415178 415222 . + . transcript_id "LTnewLTref_080016000.1"; gene_id "LTnewLTref_080016000:pseudogene"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 422688 423785 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016100.1"; gene_id "LTnewLTref_080016100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 422688 423785 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016100.1"; gene_id "LTnewLTref_080016100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 424793 426433 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016200.1"; gene_id "LTnewLTref_080016200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 424793 426433 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016200.1"; gene_id "LTnewLTref_080016200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 428117 430726 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016300.1"; gene_id "LTnewLTref_080016300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 428117 430726 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016300.1"; gene_id "LTnewLTref_080016300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 432543 433658 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016400.1"; gene_id "LTnewLTref_080016400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 432543 433658 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016400.1"; gene_id "LTnewLTref_080016400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 435196 438036 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016500.1"; gene_id "LTnewLTref_080016500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 435196 438036 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016500.1"; gene_id "LTnewLTref_080016500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 438970 442404 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016600.1"; gene_id "LTnewLTref_080016600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 438970 442404 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016600.1"; gene_id "LTnewLTref_080016600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 443573 444853 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016700.1"; gene_id "LTnewLTref_080016700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 443573 444853 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016700.1"; gene_id "LTnewLTref_080016700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 445906 447573 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080016800.1"; gene_id "LTnewLTref_080016800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 445906 447573 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016800.1"; gene_id "LTnewLTref_080016800"; CM024330.1 Liftoff transcript 448746 450008 . + . transcript_id "LTnewLTref_080016900.1"; gene_id "LTnewLTref_080016900" CM024330.1 Liftoff CDS 448746 450008 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_080016900.1"; gene_id "LTnewLTref_080016900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 450800 454543 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017000.1"; gene_id "LTnewLTref_080017000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 450800 454543 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017000.1"; gene_id "LTnewLTref_080017000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 455718 456305 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017100.1"; gene_id "LTnewLTref_080017100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 455718 456305 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017100.1"; gene_id "LTnewLTref_080017100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 458697 459881 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017200.1"; gene_id "LTnewLTref_080017200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 458697 459881 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017200.1"; gene_id "LTnewLTref_080017200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 461477 463207 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017300.1"; gene_id "LTnewLTref_080017300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 461477 463207 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017300.1"; gene_id "LTnewLTref_080017300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 464524 466072 0.41 + . transcript_id "LTnewLTref_080017400.1"; gene_id "LTnewLTref_080017400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 464524 465990 0.65 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017400.1"; gene_id "LTnewLTref_080017400"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 466070 466072 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017400.1"; gene_id "LTnewLTref_080017400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 467340 467639 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017500.1"; gene_id "LTnewLTref_080017500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 467340 467639 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017500.1"; gene_id "LTnewLTref_080017500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 469258 470565 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017600.1"; gene_id "LTnewLTref_080017600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 469258 470565 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017600.1"; gene_id "LTnewLTref_080017600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 470980 471840 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017700.1"; gene_id "LTnewLTref_080017700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 470980 471840 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017700.1"; gene_id "LTnewLTref_080017700"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 475155 477712 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_080017800.1"; gene_id "LTnewLTref_080017800" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 475155 477149 0.75 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017800.1"; gene_id "LTnewLTref_080017800"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 477269 477712 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017800.1"; gene_id "LTnewLTref_080017800"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 478981 480312 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080017900.1"; gene_id "LTnewLTref_080017900" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 478981 480312 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080017900.1"; gene_id "LTnewLTref_080017900"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 484671 486401 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080018000.1"; gene_id "LTnewLTref_080018000" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 484671 486401 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018000.1"; gene_id "LTnewLTref_080018000"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 487709 489253 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080018100.1"; gene_id "LTnewLTref_080018100" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 487709 489253 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018100.1"; gene_id "LTnewLTref_080018100"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 490525 490824 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080018200.1"; gene_id "LTnewLTref_080018200" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 490525 490824 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018200.1"; gene_id "LTnewLTref_080018200"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 492381 493688 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080018300.1"; gene_id "LTnewLTref_080018300" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 492381 493688 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018300.1"; gene_id "LTnewLTref_080018300"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 494103 494963 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080018400.1"; gene_id "LTnewLTref_080018400" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 494103 494963 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018400.1"; gene_id "LTnewLTref_080018400"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 498259 500817 1 + . transcript_id "LTnewLTref_080018500.1"; gene_id "LTnewLTref_080018500" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 498259 500817 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018500.1"; gene_id "LTnewLTref_080018500"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 501278 502114 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_080018600.1"; gene_id "LTnewLTref_080018600" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 501278 501284 0.42 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018600.1"; gene_id "LTnewLTref_080018600"; CM024330.1 AUGUSTUS CDS 501870 502114 1 + 2 transcript_id "LTnewLTref_080018600.1"; gene_id "LTnewLTref_080018600"; CM024330.1 AUGUSTUS transcript 502202 502484 0.48 + . transcript_id "LTnewLTref_080018700.1"; gene_id "LTnewLTref_080018700" CM024330.1 AUGUSTUS CDS 502202 502484 0.48 + 0 transcript_id "LTnewLTref_080018700.1"; gene_id "LTnewLTref_080018700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 246 320 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_090005000.1"; gene_id "LTnewLTref_090005000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 246 320 0.51 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005000.1"; gene_id "LTnewLTref_090005000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 2076 2510 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005100.1"; gene_id "LTnewLTref_090005100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 2076 2510 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005100.1"; gene_id "LTnewLTref_090005100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 3107 4228 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005200.1"; gene_id "LTnewLTref_090005200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 3107 4228 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005200.1"; gene_id "LTnewLTref_090005200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 4882 5205 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005300.1"; gene_id "LTnewLTref_090005300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 4882 5205 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005300.1"; gene_id "LTnewLTref_090005300"; CM024331.1 Liftoff transcript 5857 6042 . + . transcript_id "LTnewLTref_090005400.1"; gene_id "LTnewLTref_090005400" CM024331.1 Liftoff CDS 5857 6042 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005400.1"; gene_id "LTnewLTref_090005400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 6426 8285 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005500.1"; gene_id "LTnewLTref_090005500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 6426 8285 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005500.1"; gene_id "LTnewLTref_090005500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 8730 9692 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005600.1"; gene_id "LTnewLTref_090005600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 8730 9692 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005600.1"; gene_id "LTnewLTref_090005600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 10385 11134 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005700.1"; gene_id "LTnewLTref_090005700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 10385 11134 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005700.1"; gene_id "LTnewLTref_090005700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 12900 13676 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005800.1"; gene_id "LTnewLTref_090005800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 12900 13676 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005800.1"; gene_id "LTnewLTref_090005800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 14334 14729 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090005900.1"; gene_id "LTnewLTref_090005900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 14334 14729 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090005900.1"; gene_id "LTnewLTref_090005900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 16570 20511 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006000.1"; gene_id "LTnewLTref_090006000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 16570 20511 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006000.1"; gene_id "LTnewLTref_090006000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 21889 22626 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006100.1"; gene_id "LTnewLTref_090006100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 21889 22626 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006100.1"; gene_id "LTnewLTref_090006100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 33535 34434 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006200.1"; gene_id "LTnewLTref_090006200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 33535 34434 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006200.1"; gene_id "LTnewLTref_090006200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 46716 48464 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006300.1"; gene_id "LTnewLTref_090006300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 46716 48464 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006300.1"; gene_id "LTnewLTref_090006300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 50910 51575 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006400.1"; gene_id "LTnewLTref_090006400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 50910 51575 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006400.1"; gene_id "LTnewLTref_090006400"; CM024331.1 . transcript 52595 54732 . + . transcript_id "LTnewLTref_090006500.1"; gene_id "LTnewLTref_090006500:pseudogene" CM024331.1 . exon 52595 54732 . + . transcript_id "LTnewLTref_090006500.1"; gene_id "LTnewLTref_090006500:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 55657 58911 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006600.1"; gene_id "LTnewLTref_090006600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 55657 58911 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006600.1"; gene_id "LTnewLTref_090006600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 61008 62582 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006700.1"; gene_id "LTnewLTref_090006700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 61008 62582 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006700.1"; gene_id "LTnewLTref_090006700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 63476 63850 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006800.1"; gene_id "LTnewLTref_090006800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 63476 63850 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006800.1"; gene_id "LTnewLTref_090006800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 65045 65419 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090006900.1"; gene_id "LTnewLTref_090006900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 65045 65419 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090006900.1"; gene_id "LTnewLTref_090006900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 66610 67014 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007000.1"; gene_id "LTnewLTref_090007000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 66610 67014 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007000.1"; gene_id "LTnewLTref_090007000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 68112 68486 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007100.1"; gene_id "LTnewLTref_090007100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 68112 68486 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007100.1"; gene_id "LTnewLTref_090007100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 69675 70079 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007200.1"; gene_id "LTnewLTref_090007200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 69675 70079 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007200.1"; gene_id "LTnewLTref_090007200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 71176 71550 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007300.1"; gene_id "LTnewLTref_090007300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 71176 71550 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007300.1"; gene_id "LTnewLTref_090007300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 72577 72939 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007400.1"; gene_id "LTnewLTref_090007400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 72577 72939 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007400.1"; gene_id "LTnewLTref_090007400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 74139 75650 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007500.1"; gene_id "LTnewLTref_090007500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 74139 75650 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007500.1"; gene_id "LTnewLTref_090007500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 76152 77069 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007600.1"; gene_id "LTnewLTref_090007600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 76152 77069 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007600.1"; gene_id "LTnewLTref_090007600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 79253 81694 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007700.1"; gene_id "LTnewLTref_090007700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 79253 81694 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007700.1"; gene_id "LTnewLTref_090007700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 82759 84270 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007800.1"; gene_id "LTnewLTref_090007800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 82759 84270 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007800.1"; gene_id "LTnewLTref_090007800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 85872 88721 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090007900.1"; gene_id "LTnewLTref_090007900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 85872 88721 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090007900.1"; gene_id "LTnewLTref_090007900"; CM024331.1 Liftoff transcript 89488 92445 . + . transcript_id "LTnewLTref_090008000.1"; gene_id "LTnewLTref_090008000" CM024331.1 Liftoff CDS 89488 92445 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008000.1"; gene_id "LTnewLTref_090008000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 92807 93625 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008100.1"; gene_id "LTnewLTref_090008100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 92807 93625 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008100.1"; gene_id "LTnewLTref_090008100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 95968 97833 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008200.1"; gene_id "LTnewLTref_090008200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 95968 97833 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008200.1"; gene_id "LTnewLTref_090008200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 100411 102735 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008300.1"; gene_id "LTnewLTref_090008300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 100411 102735 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008300.1"; gene_id "LTnewLTref_090008300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 103631 107500 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008400.1"; gene_id "LTnewLTref_090008400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 103631 107500 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008400.1"; gene_id "LTnewLTref_090008400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 108332 109039 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008500.1"; gene_id "LTnewLTref_090008500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 108332 109039 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008500.1"; gene_id "LTnewLTref_090008500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 109884 112529 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008600.1"; gene_id "LTnewLTref_090008600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 109884 112529 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008600.1"; gene_id "LTnewLTref_090008600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 114025 116784 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090008700.1"; gene_id "LTnewLTref_090008700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 114025 116784 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090008700.1"; gene_id "LTnewLTref_090008700"; CM024331.1 . transcript 119293 121869 . + . transcript_id "LTnewLTref_090008800.1"; gene_id "LTnewLTref_090008800:pseudogene" CM024331.1 . exon 119293 121869 . + . transcript_id "LTnewLTref_090008800.1"; gene_id "LTnewLTref_090008800:pseudogene"; CM024331.1 . transcript 124050 127241 . + . transcript_id "LTnewLTref_090008900.1"; gene_id "LTnewLTref_090008900:pseudogene" CM024331.1 . exon 124050 127241 . + . transcript_id "LTnewLTref_090008900.1"; gene_id "LTnewLTref_090008900:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 128386 129148 0.96 + . transcript_id "LTnewLTref_090009000.1"; gene_id "LTnewLTref_090009000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 128386 128721 0.99 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009000.1"; gene_id "LTnewLTref_090009000"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 128795 129148 0.96 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009000.1"; gene_id "LTnewLTref_090009000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 129938 132532 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009100.1"; gene_id "LTnewLTref_090009100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 129938 132532 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009100.1"; gene_id "LTnewLTref_090009100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 133331 134975 0.52 + . transcript_id "LTnewLTref_090009200.1"; gene_id "LTnewLTref_090009200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 133331 134823 0.55 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009200.1"; gene_id "LTnewLTref_090009200"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 134870 134975 0.67 + 1 transcript_id "LTnewLTref_090009200.1"; gene_id "LTnewLTref_090009200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 133331 136561 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009200.2"; gene_id "LTnewLTref_090009200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 133331 136561 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009200.2"; gene_id "LTnewLTref_090009200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 137270 137902 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009300.1"; gene_id "LTnewLTref_090009300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 137270 137902 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009300.1"; gene_id "LTnewLTref_090009300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 139124 139387 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009400.1"; gene_id "LTnewLTref_090009400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 139124 139387 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009400.1"; gene_id "LTnewLTref_090009400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 140601 141326 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009500.1"; gene_id "LTnewLTref_090009500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 140601 141326 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009500.1"; gene_id "LTnewLTref_090009500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 141997 143385 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009600.1"; gene_id "LTnewLTref_090009600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 141997 143385 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009600.1"; gene_id "LTnewLTref_090009600"; CM024331.1 . transcript 144985 151224 . + . transcript_id "LTnewLTref_090009700.1"; gene_id "LTnewLTref_090009700:pseudogene" CM024331.1 . exon 144985 151224 . + . transcript_id "LTnewLTref_090009700.1"; gene_id "LTnewLTref_090009700:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 152369 153778 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009800.1"; gene_id "LTnewLTref_090009800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 152369 153778 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009800.1"; gene_id "LTnewLTref_090009800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 156482 157909 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090009900.1"; gene_id "LTnewLTref_090009900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 156482 157909 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090009900.1"; gene_id "LTnewLTref_090009900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 159794 163045 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010000.1"; gene_id "LTnewLTref_090010000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 159794 163045 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010000.1"; gene_id "LTnewLTref_090010000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 165180 166583 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010100.1"; gene_id "LTnewLTref_090010100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 165180 166583 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010100.1"; gene_id "LTnewLTref_090010100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 168254 170161 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010200.1"; gene_id "LTnewLTref_090010200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 168254 170161 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010200.1"; gene_id "LTnewLTref_090010200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 171088 174174 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010300.1"; gene_id "LTnewLTref_090010300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 171088 174174 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010300.1"; gene_id "LTnewLTref_090010300"; CM024331.1 . transcript 175203 184408 . + . transcript_id "LTnewLTref_090010400.1"; gene_id "LTnewLTref_090010400:pseudogene" CM024331.1 . exon 175203 184408 . + . transcript_id "LTnewLTref_090010400.1"; gene_id "LTnewLTref_090010400:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 185362 187320 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010500.1"; gene_id "LTnewLTref_090010500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 185362 187320 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010500.1"; gene_id "LTnewLTref_090010500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 189917 192151 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010600.1"; gene_id "LTnewLTref_090010600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 189917 192151 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010600.1"; gene_id "LTnewLTref_090010600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 193069 194304 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010700.1"; gene_id "LTnewLTref_090010700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 193069 194304 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010700.1"; gene_id "LTnewLTref_090010700"; CM024331.1 Liftoff transcript 195056 200038 . + . transcript_id "LTnewLTref_090010800.1"; gene_id "LTnewLTref_090010800" CM024331.1 Liftoff CDS 195056 200038 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010800.1"; gene_id "LTnewLTref_090010800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 200860 202107 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090010900.1"; gene_id "LTnewLTref_090010900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 200860 202107 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090010900.1"; gene_id "LTnewLTref_090010900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 203018 205330 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011000.1"; gene_id "LTnewLTref_090011000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 203018 205330 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011000.1"; gene_id "LTnewLTref_090011000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 208915 211908 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011100.1"; gene_id "LTnewLTref_090011100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 208915 211908 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011100.1"; gene_id "LTnewLTref_090011100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 214219 217545 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011200.1"; gene_id "LTnewLTref_090011200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 214219 217545 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011200.1"; gene_id "LTnewLTref_090011200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 219453 221228 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011300.1"; gene_id "LTnewLTref_090011300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 219453 221228 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011300.1"; gene_id "LTnewLTref_090011300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 222244 223032 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011400.1"; gene_id "LTnewLTref_090011400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 222244 223032 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011400.1"; gene_id "LTnewLTref_090011400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 223905 225374 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011500.1"; gene_id "LTnewLTref_090011500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 223905 225374 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011500.1"; gene_id "LTnewLTref_090011500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 228606 229463 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011600.1"; gene_id "LTnewLTref_090011600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 228606 229463 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011600.1"; gene_id "LTnewLTref_090011600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 231451 233336 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_090011700.1"; gene_id "LTnewLTref_090011700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 231451 233171 0.42 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011700.1"; gene_id "LTnewLTref_090011700"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 233270 233336 0.66 + 1 transcript_id "LTnewLTref_090011700.1"; gene_id "LTnewLTref_090011700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 231451 234948 0.76 + . transcript_id "LTnewLTref_090011700.2"; gene_id "LTnewLTref_090011700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 231451 234948 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011700.2"; gene_id "LTnewLTref_090011700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 235921 236928 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090011800.1"; gene_id "LTnewLTref_090011800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 235921 236928 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090011800.1"; gene_id "LTnewLTref_090011800"; CM024331.1 . transcript 237718 240639 . + . transcript_id "LTnewLTref_090011900.1"; gene_id "LTnewLTref_090011900:pseudogene" CM024331.1 . exon 237718 240639 . + . transcript_id "LTnewLTref_090011900.1"; gene_id "LTnewLTref_090011900:pseudogene"; CM024331.1 Liftoff transcript 241685 243943 . + . transcript_id "LTnewLTref_090012000.1"; gene_id "LTnewLTref_090012000" CM024331.1 Liftoff CDS 241685 243943 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012000.1"; gene_id "LTnewLTref_090012000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 245399 248875 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090012100.1"; gene_id "LTnewLTref_090012100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 245399 248875 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012100.1"; gene_id "LTnewLTref_090012100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 249937 251439 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090012200.1"; gene_id "LTnewLTref_090012200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 249937 251439 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012200.1"; gene_id "LTnewLTref_090012200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 252436 254349 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090012300.1"; gene_id "LTnewLTref_090012300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 252436 254349 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012300.1"; gene_id "LTnewLTref_090012300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 255002 256060 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090012400.1"; gene_id "LTnewLTref_090012400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 255002 256060 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012400.1"; gene_id "LTnewLTref_090012400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 256742 257158 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090012500.1"; gene_id "LTnewLTref_090012500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 256742 257158 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012500.1"; gene_id "LTnewLTref_090012500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 257694 258806 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090012600.1"; gene_id "LTnewLTref_090012600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 257694 258806 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090012600.1"; gene_id "LTnewLTref_090012600"; CM024331.1 . transcript 258919 260019 . + . transcript_id "LTnewLTref_090012700.1"; gene_id "LTnewLTref_090012700:pseudogene" CM024331.1 . exon 258919 260019 . + . transcript_id "LTnewLTref_090012700.1"; gene_id "LTnewLTref_090012700:pseudogene"; CM024331.1 INFERNAL transcript 265339 265457 93.1 - . transcript_id "LTnewLTref_090012800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090012800" CM024331.1 INFERNAL exon 265339 265457 . - . transcript_id "LTnewLTref_090012800:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090012800"; CM024331.1 Liftoff transcript 265339 265457 . - . transcript_id "LTnewLTref_090012900:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090012900" CM024331.1 Liftoff exon 265339 265457 . - . transcript_id "LTnewLTref_090012900:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090012900"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 265532 265603 . + . transcript_id "LTnewLTref_090013000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090013000" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 265532 265603 . + . transcript_id "LTnewLTref_090013000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090013000"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 265662 265745 . + . transcript_id "LTnewLTref_090013100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090013100" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 265662 265745 . + . transcript_id "LTnewLTref_090013100:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090013100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 266826 268373 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090013200.1"; gene_id "LTnewLTref_090013200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 266826 268373 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013200.1"; gene_id "LTnewLTref_090013200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 269834 271435 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090013300.1"; gene_id "LTnewLTref_090013300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 269834 271435 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013300.1"; gene_id "LTnewLTref_090013300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 272899 273909 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090013400.1"; gene_id "LTnewLTref_090013400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 272899 273909 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013400.1"; gene_id "LTnewLTref_090013400"; CM024331.1 . transcript 274564 276462 . - . transcript_id "LTnewLTref_090013500.1"; gene_id "LTnewLTref_090013500:pseudogene" CM024331.1 . exon 274564 276462 . - . transcript_id "LTnewLTref_090013500.1"; gene_id "LTnewLTref_090013500:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 277221 283908 0.74 - . transcript_id "LTnewLTref_090013600.1"; gene_id "LTnewLTref_090013600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 277221 281027 0.74 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013600.1"; gene_id "LTnewLTref_090013600"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 281086 283908 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013600.1"; gene_id "LTnewLTref_090013600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 285559 288555 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090013700.1"; gene_id "LTnewLTref_090013700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 285559 288555 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013700.1"; gene_id "LTnewLTref_090013700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 289612 291699 0.45 - . transcript_id "LTnewLTref_090013800.1"; gene_id "LTnewLTref_090013800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 289612 291699 0.45 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013800.1"; gene_id "LTnewLTref_090013800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 289612 305988 0.25 - . transcript_id "LTnewLTref_090013800.2"; gene_id "LTnewLTref_090013800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 289612 291051 0.25 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013800.2"; gene_id "LTnewLTref_090013800"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 291175 305988 0.63 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013800.2"; gene_id "LTnewLTref_090013800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 307792 309987 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090013900.1"; gene_id "LTnewLTref_090013900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 307792 309987 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090013900.1"; gene_id "LTnewLTref_090013900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 311367 312158 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014000.1"; gene_id "LTnewLTref_090014000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 311367 312158 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014000.1"; gene_id "LTnewLTref_090014000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 312759 316502 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014100.1"; gene_id "LTnewLTref_090014100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 312759 316502 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014100.1"; gene_id "LTnewLTref_090014100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 317343 321214 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_090014200.1"; gene_id "LTnewLTref_090014200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 317343 320903 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014200.1"; gene_id "LTnewLTref_090014200"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 321017 321214 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014200.1"; gene_id "LTnewLTref_090014200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 317343 321538 0.68 - . transcript_id "LTnewLTref_090014200.2"; gene_id "LTnewLTref_090014200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 317343 320903 0.68 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014200.2"; gene_id "LTnewLTref_090014200"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 321017 321538 0.81 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014200.2"; gene_id "LTnewLTref_090014200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 322618 323262 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014300.1"; gene_id "LTnewLTref_090014300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 322618 323262 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014300.1"; gene_id "LTnewLTref_090014300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 323771 325450 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014400.1"; gene_id "LTnewLTref_090014400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 323771 325450 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014400.1"; gene_id "LTnewLTref_090014400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 326391 328721 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014500.1"; gene_id "LTnewLTref_090014500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 326391 328721 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014500.1"; gene_id "LTnewLTref_090014500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 329386 330582 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014600.1"; gene_id "LTnewLTref_090014600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 329386 330582 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014600.1"; gene_id "LTnewLTref_090014600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 331466 332275 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014700.1"; gene_id "LTnewLTref_090014700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 331466 332275 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014700.1"; gene_id "LTnewLTref_090014700"; CM024331.1 . transcript 333352 333701 . - . transcript_id "LTnewLTref_090014800.1"; gene_id "LTnewLTref_090014800:pseudogene" CM024331.1 . exon 333352 333701 . - . transcript_id "LTnewLTref_090014800.1"; gene_id "LTnewLTref_090014800:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 334530 336101 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090014900.1"; gene_id "LTnewLTref_090014900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 334530 336101 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090014900.1"; gene_id "LTnewLTref_090014900"; CM024331.1 . transcript 337066 338605 . - . transcript_id "LTnewLTref_090015000.1"; gene_id "LTnewLTref_090015000:pseudogene" CM024331.1 . exon 337066 338605 . - . transcript_id "LTnewLTref_090015000.1"; gene_id "LTnewLTref_090015000:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 340483 348012 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015100.1"; gene_id "LTnewLTref_090015100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 340483 348012 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015100.1"; gene_id "LTnewLTref_090015100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 350770 351156 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015200.1"; gene_id "LTnewLTref_090015200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 350770 351156 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015200.1"; gene_id "LTnewLTref_090015200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 352006 352566 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015300.1"; gene_id "LTnewLTref_090015300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 352006 352566 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015300.1"; gene_id "LTnewLTref_090015300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 354232 354681 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015400.1"; gene_id "LTnewLTref_090015400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 354232 354681 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015400.1"; gene_id "LTnewLTref_090015400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 355982 356431 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015500.1"; gene_id "LTnewLTref_090015500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 355982 356431 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015500.1"; gene_id "LTnewLTref_090015500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 357799 358248 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015600.1"; gene_id "LTnewLTref_090015600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 357799 358248 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015600.1"; gene_id "LTnewLTref_090015600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 359217 362897 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015700.1"; gene_id "LTnewLTref_090015700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 359217 362897 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015700.1"; gene_id "LTnewLTref_090015700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 363338 365125 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090015800.1"; gene_id "LTnewLTref_090015800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 363338 365125 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015800.1"; gene_id "LTnewLTref_090015800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 365956 368067 0.97 - . transcript_id "LTnewLTref_090015900.1"; gene_id "LTnewLTref_090015900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 365956 368067 0.97 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090015900.1"; gene_id "LTnewLTref_090015900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 369649 370863 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090016000.1"; gene_id "LTnewLTref_090016000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 369649 370863 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090016000.1"; gene_id "LTnewLTref_090016000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 371123 372340 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090016100.1"; gene_id "LTnewLTref_090016100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 371123 372340 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090016100.1"; gene_id "LTnewLTref_090016100"; CM024331.1 . transcript 374250 377613 . - . transcript_id "LTnewLTref_090016200.1"; gene_id "LTnewLTref_090016200:pseudogene" CM024331.1 . exon 374250 375746 . - . transcript_id "LTnewLTref_090016200.1"; gene_id "LTnewLTref_090016200:pseudogene"; CM024331.1 . exon 375748 377613 . - . transcript_id "LTnewLTref_090016200.1"; gene_id "LTnewLTref_090016200:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 379406 385099 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_090016300.1"; gene_id "LTnewLTref_090016300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 379406 385099 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090016300.1"; gene_id "LTnewLTref_090016300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 379406 395488 0.89 - . transcript_id "LTnewLTref_090016300.2"; gene_id "LTnewLTref_090016300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 379406 384568 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090016300.2"; gene_id "LTnewLTref_090016300"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 384632 395488 0.89 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090016300.2"; gene_id "LTnewLTref_090016300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 395972 396910 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090016400.1"; gene_id "LTnewLTref_090016400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 395972 396910 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090016400.1"; gene_id "LTnewLTref_090016400"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 397417 397490 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016500" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 397417 397490 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016500:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016500"; CM024331.1 INFERNAL transcript 397555 397673 93 + . transcript_id "LTnewLTref_090016600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016600" CM024331.1 INFERNAL exon 397555 397673 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016600"; CM024331.1 Liftoff transcript 397555 397673 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016700" CM024331.1 Liftoff exon 397555 397673 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016700:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016700"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 397736 397806 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016800" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 397736 397806 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090016800"; CM024331.1 Liftoff transcript 397922 398188 . + . transcript_id "LTnewLTref_090016900.1"; gene_id "LTnewLTref_090016900" CM024331.1 Liftoff CDS 397922 398188 . + 0 transcript_id "LTnewLTref_090016900.1"; gene_id "LTnewLTref_090016900"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 397987 398059 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017000" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 397987 398059 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017000:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 399069 399830 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090017100.1"; gene_id "LTnewLTref_090017100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 399069 399830 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090017100.1"; gene_id "LTnewLTref_090017100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 400543 402390 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090017200.1"; gene_id "LTnewLTref_090017200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 400543 402390 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090017200.1"; gene_id "LTnewLTref_090017200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 407883 408152 1 + . transcript_id "LTnewLTref_090017300.1"; gene_id "LTnewLTref_090017300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 407883 408152 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_090017300.1"; gene_id "LTnewLTref_090017300"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 410215 410286 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017400" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 410215 410286 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017400:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017400"; CM024331.1 INFERNAL transcript 410345 410463 93 - . transcript_id "LTnewLTref_090017500:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017500" CM024331.1 INFERNAL exon 410345 410463 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017500:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017500"; CM024331.1 Liftoff transcript 410345 410463 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017600" CM024331.1 Liftoff exon 410345 410463 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017600:rRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017600"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 410525 410601 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017700" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 410525 410601 . - . transcript_id "LTnewLTref_090017700:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017700"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 410675 410747 . + . transcript_id "LTnewLTref_090017800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017800" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 410675 410747 . + . transcript_id "LTnewLTref_090017800:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017800"; CM024331.1 Aragorn_1.2.36 transcript 410813 410883 . + . transcript_id "LTnewLTref_090017900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017900" CM024331.1 Aragorn_1.2.36 exon 410813 410883 . + . transcript_id "LTnewLTref_090017900:tRNA"; gene_id "LTnewLTref_090017900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 411848 413635 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018000.1"; gene_id "LTnewLTref_090018000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 411848 413635 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018000.1"; gene_id "LTnewLTref_090018000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 414749 415870 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018100.1"; gene_id "LTnewLTref_090018100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 414749 415870 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018100.1"; gene_id "LTnewLTref_090018100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 417712 419982 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018200.1"; gene_id "LTnewLTref_090018200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 417712 419982 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018200.1"; gene_id "LTnewLTref_090018200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 422789 423529 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018300.1"; gene_id "LTnewLTref_090018300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 422789 423529 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018300.1"; gene_id "LTnewLTref_090018300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 424732 425625 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018400.1"; gene_id "LTnewLTref_090018400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 424732 425625 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018400.1"; gene_id "LTnewLTref_090018400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 427220 428659 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018500.1"; gene_id "LTnewLTref_090018500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 427220 428659 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018500.1"; gene_id "LTnewLTref_090018500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 429654 431459 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018600.1"; gene_id "LTnewLTref_090018600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 429654 431459 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018600.1"; gene_id "LTnewLTref_090018600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 432748 433596 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018700.1"; gene_id "LTnewLTref_090018700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 432748 433596 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018700.1"; gene_id "LTnewLTref_090018700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 436591 437967 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018800.1"; gene_id "LTnewLTref_090018800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 436591 437967 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018800.1"; gene_id "LTnewLTref_090018800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 438965 439693 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090018900.1"; gene_id "LTnewLTref_090018900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 438965 439693 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090018900.1"; gene_id "LTnewLTref_090018900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 440669 441127 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019000.1"; gene_id "LTnewLTref_090019000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 440669 441127 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019000.1"; gene_id "LTnewLTref_090019000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 442161 442856 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019100.1"; gene_id "LTnewLTref_090019100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 442161 442856 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019100.1"; gene_id "LTnewLTref_090019100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 443373 444230 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019200.1"; gene_id "LTnewLTref_090019200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 443373 444230 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019200.1"; gene_id "LTnewLTref_090019200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 445226 447445 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019300.1"; gene_id "LTnewLTref_090019300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 445226 447445 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019300.1"; gene_id "LTnewLTref_090019300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 449174 449764 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019400.1"; gene_id "LTnewLTref_090019400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 449174 449764 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019400.1"; gene_id "LTnewLTref_090019400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 451018 454032 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019500.1"; gene_id "LTnewLTref_090019500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 451018 454032 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019500.1"; gene_id "LTnewLTref_090019500"; CM024331.1 . transcript 457013 458802 . - . transcript_id "LTnewLTref_090019600.1"; gene_id "LTnewLTref_090019600:pseudogene" CM024331.1 . exon 457013 458802 . - . transcript_id "LTnewLTref_090019600.1"; gene_id "LTnewLTref_090019600:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 459354 463979 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019700.1"; gene_id "LTnewLTref_090019700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 459354 463979 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019700.1"; gene_id "LTnewLTref_090019700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 465081 466343 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090019800.1"; gene_id "LTnewLTref_090019800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 465081 466343 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019800.1"; gene_id "LTnewLTref_090019800"; CM024331.1 Liftoff transcript 467573 471688 . - . transcript_id "LTnewLTref_090019900.1"; gene_id "LTnewLTref_090019900" CM024331.1 Liftoff CDS 467573 471688 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_090019900.1"; gene_id "LTnewLTref_090019900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 472635 473960 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020000.1"; gene_id "LTnewLTref_090020000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 472635 473960 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020000.1"; gene_id "LTnewLTref_090020000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 474748 482286 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020100.1"; gene_id "LTnewLTref_090020100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 474748 482286 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020100.1"; gene_id "LTnewLTref_090020100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 483127 483792 0.51 - . transcript_id "LTnewLTref_090020200.1"; gene_id "LTnewLTref_090020200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 483127 483480 0.54 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020200.1"; gene_id "LTnewLTref_090020200"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 483712 483792 0.86 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020200.1"; gene_id "LTnewLTref_090020200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 484536 485090 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020300.1"; gene_id "LTnewLTref_090020300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 484536 485090 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020300.1"; gene_id "LTnewLTref_090020300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 485900 487837 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020400.1"; gene_id "LTnewLTref_090020400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 485900 487837 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020400.1"; gene_id "LTnewLTref_090020400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 489347 490375 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020500.1"; gene_id "LTnewLTref_090020500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 489347 490375 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020500.1"; gene_id "LTnewLTref_090020500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 491930 493033 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020600.1"; gene_id "LTnewLTref_090020600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 491930 493033 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020600.1"; gene_id "LTnewLTref_090020600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 493977 495707 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020700.1"; gene_id "LTnewLTref_090020700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 493977 495707 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020700.1"; gene_id "LTnewLTref_090020700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 496531 497187 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020800.1"; gene_id "LTnewLTref_090020800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 496531 497187 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020800.1"; gene_id "LTnewLTref_090020800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 499095 499859 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090020900.1"; gene_id "LTnewLTref_090020900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 499095 499859 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090020900.1"; gene_id "LTnewLTref_090020900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 501174 502226 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090021000.1"; gene_id "LTnewLTref_090021000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 501174 502226 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021000.1"; gene_id "LTnewLTref_090021000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 504067 505887 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090021100.1"; gene_id "LTnewLTref_090021100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 504067 505887 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021100.1"; gene_id "LTnewLTref_090021100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 507490 509313 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090021200.1"; gene_id "LTnewLTref_090021200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 507490 509313 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021200.1"; gene_id "LTnewLTref_090021200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 511043 511378 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090021300.1"; gene_id "LTnewLTref_090021300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 511043 511378 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021300.1"; gene_id "LTnewLTref_090021300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 512509 513087 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090021400.1"; gene_id "LTnewLTref_090021400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 512509 513087 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021400.1"; gene_id "LTnewLTref_090021400"; CM024331.1 Liftoff transcript 513892 514118 . - . transcript_id "LTnewLTref_090021500.1"; gene_id "LTnewLTref_090021500" CM024331.1 Liftoff CDS 513892 514118 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021500.1"; gene_id "LTnewLTref_090021500"; CM024331.1 Liftoff transcript 514131 514316 . - . transcript_id "LTnewLTref_090021600.1"; gene_id "LTnewLTref_090021600" CM024331.1 Liftoff CDS 514131 514316 . - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021600.1"; gene_id "LTnewLTref_090021600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 514320 514650 0.43 - . transcript_id "LTnewLTref_090021700.1"; gene_id "LTnewLTref_090021700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 514320 514470 0.43 - 1 transcript_id "LTnewLTref_090021700.1"; gene_id "LTnewLTref_090021700"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 514523 514650 0.72 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021700.1"; gene_id "LTnewLTref_090021700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 516647 517453 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090021800.1"; gene_id "LTnewLTref_090021800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 516647 517453 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090021800.1"; gene_id "LTnewLTref_090021800"; CM024331.1 . transcript 519638 521423 . - . transcript_id "LTnewLTref_090021900.1"; gene_id "LTnewLTref_090021900:pseudogene" CM024331.1 . exon 519638 521423 . - . transcript_id "LTnewLTref_090021900.1"; gene_id "LTnewLTref_090021900:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 522845 524830 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090022000.1"; gene_id "LTnewLTref_090022000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 522845 524830 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022000.1"; gene_id "LTnewLTref_090022000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 525602 527212 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090022100.1"; gene_id "LTnewLTref_090022100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 525602 527212 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022100.1"; gene_id "LTnewLTref_090022100"; CM024331.1 . transcript 527931 528238 . - . transcript_id "LTnewLTref_090022200.1"; gene_id "LTnewLTref_090022200:pseudogene" CM024331.1 . exon 527931 528238 . - . transcript_id "LTnewLTref_090022200.1"; gene_id "LTnewLTref_090022200:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 528945 530666 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090022300.1"; gene_id "LTnewLTref_090022300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 528945 530666 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022300.1"; gene_id "LTnewLTref_090022300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 531835 532254 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090022400.1"; gene_id "LTnewLTref_090022400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 531835 532254 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022400.1"; gene_id "LTnewLTref_090022400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 533014 533730 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090022500.1"; gene_id "LTnewLTref_090022500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 533014 533730 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022500.1"; gene_id "LTnewLTref_090022500"; CM024331.1 . transcript 536270 536535 . - . transcript_id "LTnewLTref_090022600.1"; gene_id "LTnewLTref_090022600:pseudogene" CM024331.1 . exon 536270 536535 . - . transcript_id "LTnewLTref_090022600.1"; gene_id "LTnewLTref_090022600:pseudogene"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 536579 537184 0.22 - . transcript_id "LTnewLTref_090022700.1"; gene_id "LTnewLTref_090022700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 536579 536605 0.46 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022700.1"; gene_id "LTnewLTref_090022700"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 536720 537184 0.41 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022700.1"; gene_id "LTnewLTref_090022700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 536579 537256 0.33 - . transcript_id "LTnewLTref_090022700.2"; gene_id "LTnewLTref_090022700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 536579 536605 0.48 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022700.2"; gene_id "LTnewLTref_090022700"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 536720 537256 0.55 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022700.2"; gene_id "LTnewLTref_090022700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 537333 537539 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_090022800.1"; gene_id "LTnewLTref_090022800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 537333 537539 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022800.1"; gene_id "LTnewLTref_090022800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 537573 537845 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_090022900.1"; gene_id "LTnewLTref_090022900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 537573 537689 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022900.1"; gene_id "LTnewLTref_090022900"; CM024331.1 AUGUSTUS CDS 537744 537845 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090022900.1"; gene_id "LTnewLTref_090022900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 539372 540613 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023000.1"; gene_id "LTnewLTref_090023000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 539372 540613 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023000.1"; gene_id "LTnewLTref_090023000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 541544 541939 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023100.1"; gene_id "LTnewLTref_090023100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 541544 541939 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023100.1"; gene_id "LTnewLTref_090023100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 542592 543044 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023200.1"; gene_id "LTnewLTref_090023200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 542592 543044 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023200.1"; gene_id "LTnewLTref_090023200"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 543992 544351 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023300.1"; gene_id "LTnewLTref_090023300" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 543992 544351 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023300.1"; gene_id "LTnewLTref_090023300"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 545924 548368 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023400.1"; gene_id "LTnewLTref_090023400" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 545924 548368 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023400.1"; gene_id "LTnewLTref_090023400"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 549487 549840 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023500.1"; gene_id "LTnewLTref_090023500" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 549487 549840 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023500.1"; gene_id "LTnewLTref_090023500"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 551060 551482 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023600.1"; gene_id "LTnewLTref_090023600" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 551060 551482 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023600.1"; gene_id "LTnewLTref_090023600"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 551958 552323 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023700.1"; gene_id "LTnewLTref_090023700" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 551958 552323 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023700.1"; gene_id "LTnewLTref_090023700"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 553204 558132 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023800.1"; gene_id "LTnewLTref_090023800" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 553204 558132 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023800.1"; gene_id "LTnewLTref_090023800"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 558756 559772 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090023900.1"; gene_id "LTnewLTref_090023900" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 558756 559772 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090023900.1"; gene_id "LTnewLTref_090023900"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 560272 560757 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090024000.1"; gene_id "LTnewLTref_090024000" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 560272 560757 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090024000.1"; gene_id "LTnewLTref_090024000"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 561244 563235 0.95 - . transcript_id "LTnewLTref_090024100.1"; gene_id "LTnewLTref_090024100" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 561244 563235 0.95 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090024100.1"; gene_id "LTnewLTref_090024100"; CM024331.1 AUGUSTUS transcript 563724 564269 1 - . transcript_id "LTnewLTref_090024200.1"; gene_id "LTnewLTref_090024200" CM024331.1 AUGUSTUS CDS 563724 564269 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_090024200.1"; gene_id "LTnewLTref_090024200"; CM024331.1 . transcript 565416 565783 . + . transcript_id "LTnewLTref_090024300.1"; gene_id "LTnewLTref_090024300:pseudogene" CM024331.1 . exon 565416 565783 . + . transcript_id "LTnewLTref_090024300.1"; gene_id "LTnewLTref_090024300:pseudogene"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS transcript 113 1674 0.4 + . transcript_id "LTnewLTref_000005000.1"; gene_id "LTnewLTref_000005000" JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 113 819 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005000.1"; gene_id "LTnewLTref_000005000"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 1518 1674 0.58 + 1 transcript_id "LTnewLTref_000005000.1"; gene_id "LTnewLTref_000005000"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS transcript 3688 4161 0.64 + . transcript_id "LTnewLTref_000005100.1"; gene_id "LTnewLTref_000005100" JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 3688 3725 0.66 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005100.1"; gene_id "LTnewLTref_000005100"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 3921 4161 0.85 + 1 transcript_id "LTnewLTref_000005100.1"; gene_id "LTnewLTref_000005100"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS transcript 4277 4838 0.91 + . transcript_id "LTnewLTref_000005200.1"; gene_id "LTnewLTref_000005200" JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 4277 4291 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005200.1"; gene_id "LTnewLTref_000005200"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 4365 4838 0.91 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005200.1"; gene_id "LTnewLTref_000005200"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS transcript 5540 5953 0.3 + . transcript_id "LTnewLTref_000005300.1"; gene_id "LTnewLTref_000005300" JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 5540 5818 0.3 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005300.1"; gene_id "LTnewLTref_000005300"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 5861 5953 0.49 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005300.1"; gene_id "LTnewLTref_000005300"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS transcript 5561 5953 0.49 + . transcript_id "LTnewLTref_000005300.2"; gene_id "LTnewLTref_000005300" JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 5561 5818 0.5 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005300.2"; gene_id "LTnewLTref_000005300"; JACCHM010000002.1 AUGUSTUS CDS 5861 5953 0.51 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005300.2"; gene_id "LTnewLTref_000005300"; JACCHM010000003.1 AUGUSTUS transcript 3169 4307 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_000006400.1"; gene_id "LTnewLTref_000006400" JACCHM010000003.1 AUGUSTUS CDS 3169 3256 0.52 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000006400.1"; gene_id "LTnewLTref_000006400"; JACCHM010000003.1 AUGUSTUS CDS 3364 4307 0.97 + 2 transcript_id "LTnewLTref_000006400.1"; gene_id "LTnewLTref_000006400"; JACCHM010000003.1 . transcript 5370 6937 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006500.1"; gene_id "LTnewLTref_000006500:pseudogene" JACCHM010000003.1 . exon 5370 5564 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006500.1"; gene_id "LTnewLTref_000006500:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 5566 5610 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006500.1"; gene_id "LTnewLTref_000006500:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 5612 5674 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006500.1"; gene_id "LTnewLTref_000006500:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 5677 6651 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006500.1"; gene_id "LTnewLTref_000006500:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 6653 6937 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006500.1"; gene_id "LTnewLTref_000006500:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . transcript 12665 13567 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006600.1"; gene_id "LTnewLTref_000006600:pseudogene" JACCHM010000003.1 . exon 12665 12724 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006600.1"; gene_id "LTnewLTref_000006600:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 12726 12773 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006600.1"; gene_id "LTnewLTref_000006600:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 12776 12922 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006600.1"; gene_id "LTnewLTref_000006600:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 12924 13352 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006600.1"; gene_id "LTnewLTref_000006600:pseudogene"; JACCHM010000003.1 . exon 13355 13567 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006600.1"; gene_id "LTnewLTref_000006600:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . transcript 762 1661 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene" JACCHM010000005.1 . exon 762 779 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 781 804 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 806 931 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 933 941 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 943 972 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 975 1019 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1022 1057 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1060 1074 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1077 1106 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1109 1135 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1138 1230 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1233 1283 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1285 1359 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1361 1423 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1426 1455 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1457 1504 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1506 1535 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1538 1567 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 1569 1661 . + . transcript_id "LTnewLTref_000007000.1"; gene_id "LTnewLTref_000007000:pseudogene"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 1945 3248 0.84 - . transcript_id "LTnewLTref_000007100.1"; gene_id "LTnewLTref_000007100" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 1945 2635 0.96 - 1 transcript_id "LTnewLTref_000007100.1"; gene_id "LTnewLTref_000007100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 2767 3248 0.85 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007100.1"; gene_id "LTnewLTref_000007100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 1945 3248 0.35 - . transcript_id "LTnewLTref_000007100.2"; gene_id "LTnewLTref_000007100" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 1945 2583 0.47 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007100.2"; gene_id "LTnewLTref_000007100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 2742 3248 0.65 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007100.2"; gene_id "LTnewLTref_000007100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 3278 3526 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_000007200.1"; gene_id "LTnewLTref_000007200" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 3278 3526 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007200.1"; gene_id "LTnewLTref_000007200"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 4220 4492 1 - . transcript_id "LTnewLTref_000007300.1"; gene_id "LTnewLTref_000007300" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 4220 4492 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007300.1"; gene_id "LTnewLTref_000007300"; JACCHM010000005.1 . transcript 5649 8126 . - . transcript_id "LTnewLTref_000007400.1"; gene_id "LTnewLTref_000007400:pseudogene" JACCHM010000005.1 . exon 5649 5987 . - . transcript_id "LTnewLTref_000007400.1"; gene_id "LTnewLTref_000007400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 5989 6792 . - . transcript_id "LTnewLTref_000007400.1"; gene_id "LTnewLTref_000007400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 6795 6929 . - . transcript_id "LTnewLTref_000007400.1"; gene_id "LTnewLTref_000007400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 6932 7942 . - . transcript_id "LTnewLTref_000007400.1"; gene_id "LTnewLTref_000007400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 7944 8126 . - . transcript_id "LTnewLTref_000007400.1"; gene_id "LTnewLTref_000007400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 9194 10011 0.66 - . transcript_id "LTnewLTref_000007500.1"; gene_id "LTnewLTref_000007500" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 9194 9262 0.66 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007500.1"; gene_id "LTnewLTref_000007500"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 9325 10011 0.79 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007500.1"; gene_id "LTnewLTref_000007500"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 10064 10994 0.54 - . transcript_id "LTnewLTref_000007600.1"; gene_id "LTnewLTref_000007600" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 10064 10654 0.73 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007600.1"; gene_id "LTnewLTref_000007600"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 10737 10994 0.7 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000007600.1"; gene_id "LTnewLTref_000007600"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 13059 15906 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_000007700.1"; gene_id "LTnewLTref_000007700" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 13059 14612 0.7 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000007700.1"; gene_id "LTnewLTref_000007700"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 14674 15906 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000007700.1"; gene_id "LTnewLTref_000007700"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 15942 31281 0.42 + . transcript_id "LTnewLTref_000007800.1"; gene_id "LTnewLTref_000007800" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 15942 24094 0.74 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000007800.1"; gene_id "LTnewLTref_000007800"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 24153 31281 0.55 + 1 transcript_id "LTnewLTref_000007800.1"; gene_id "LTnewLTref_000007800"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 36485 37354 0.47 + . transcript_id "LTnewLTref_000007900.1"; gene_id "LTnewLTref_000007900" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 36485 37354 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000007900.1"; gene_id "LTnewLTref_000007900"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 40497 41558 0.67 + . transcript_id "LTnewLTref_000008000.1"; gene_id "LTnewLTref_000008000" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 40497 41558 0.67 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008000.1"; gene_id "LTnewLTref_000008000"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 41707 43165 0.51 + . transcript_id "LTnewLTref_000008100.1"; gene_id "LTnewLTref_000008100" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 41707 42859 0.69 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008100.1"; gene_id "LTnewLTref_000008100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 42948 43165 0.51 + 2 transcript_id "LTnewLTref_000008100.1"; gene_id "LTnewLTref_000008100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 41797 43165 0.33 + . transcript_id "LTnewLTref_000008100.2"; gene_id "LTnewLTref_000008100" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 41797 42859 0.47 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008100.2"; gene_id "LTnewLTref_000008100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 42948 43165 0.48 + 2 transcript_id "LTnewLTref_000008100.2"; gene_id "LTnewLTref_000008100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 94651 96219 0.87 + . transcript_id "LTnewLTref_000008200.1"; gene_id "LTnewLTref_000008200" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 94651 96219 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008200.1"; gene_id "LTnewLTref_000008200"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 96319 106791 0.76 + . transcript_id "LTnewLTref_000008300.1"; gene_id "LTnewLTref_000008300" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 96319 106791 0.76 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008300.1"; gene_id "LTnewLTref_000008300"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 106833 107555 0.94 + . transcript_id "LTnewLTref_000008400.1"; gene_id "LTnewLTref_000008400" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 106833 107555 0.94 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008400.1"; gene_id "LTnewLTref_000008400"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 107611 110394 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_000008500.1"; gene_id "LTnewLTref_000008500" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 107611 110394 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008500.1"; gene_id "LTnewLTref_000008500"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 110450 113691 0.77 + . transcript_id "LTnewLTref_000008600.1"; gene_id "LTnewLTref_000008600" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 110450 112354 0.77 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008600.1"; gene_id "LTnewLTref_000008600"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 112576 113691 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008600.1"; gene_id "LTnewLTref_000008600"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 115956 116839 0.96 - . transcript_id "LTnewLTref_000008700.1"; gene_id "LTnewLTref_000008700" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 115956 115989 0.96 - 1 transcript_id "LTnewLTref_000008700.1"; gene_id "LTnewLTref_000008700"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 116058 116839 0.96 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000008700.1"; gene_id "LTnewLTref_000008700"; JACCHM010000005.1 . transcript 122093 124580 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene" JACCHM010000005.1 . exon 122093 122173 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122176 122187 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122189 122212 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122215 122241 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122243 122281 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122283 122360 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122362 122469 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122472 122513 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122519 122560 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122563 122565 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122568 122696 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122698 122715 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122718 122804 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122806 122826 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122829 122891 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122893 122907 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 122910 123044 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123046 123078 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123080 123103 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123105 123125 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123131 123469 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123471 123503 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123506 123601 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123603 123761 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123763 123936 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 123938 124261 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 124263 124580 . + . transcript_id "LTnewLTref_000008800.1"; gene_id "LTnewLTref_000008800:pseudogene"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 125360 126458 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_000008900.1"; gene_id "LTnewLTref_000008900" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 125360 126121 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008900.1"; gene_id "LTnewLTref_000008900"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 126165 126458 0.59 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000008900.1"; gene_id "LTnewLTref_000008900"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 127402 128787 1 + . transcript_id "LTnewLTref_000009000.1"; gene_id "LTnewLTref_000009000" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 127402 128787 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000009000.1"; gene_id "LTnewLTref_000009000"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 132019 132321 1 + . transcript_id "LTnewLTref_000009100.1"; gene_id "LTnewLTref_000009100" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 132019 132321 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000009100.1"; gene_id "LTnewLTref_000009100"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 132441 132665 1 + . transcript_id "LTnewLTref_000009200.1"; gene_id "LTnewLTref_000009200" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 132441 132665 1 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000009200.1"; gene_id "LTnewLTref_000009200"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 133544 134567 0.59 + . transcript_id "LTnewLTref_000009300.1"; gene_id "LTnewLTref_000009300" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 133544 133610 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000009300.1"; gene_id "LTnewLTref_000009300"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 133705 134567 0.72 + 2 transcript_id "LTnewLTref_000009300.1"; gene_id "LTnewLTref_000009300"; JACCHM010000005.1 . transcript 135365 137022 . + . transcript_id "LTnewLTref_000009400.1"; gene_id "LTnewLTref_000009400:pseudogene" JACCHM010000005.1 . exon 135365 136354 . + . transcript_id "LTnewLTref_000009400.1"; gene_id "LTnewLTref_000009400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 136356 136472 . + . transcript_id "LTnewLTref_000009400.1"; gene_id "LTnewLTref_000009400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 . exon 136474 137022 . + . transcript_id "LTnewLTref_000009400.1"; gene_id "LTnewLTref_000009400:pseudogene"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 147651 148185 0.61 + . transcript_id "LTnewLTref_000009500.1"; gene_id "LTnewLTref_000009500" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 147651 147913 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000009500.1"; gene_id "LTnewLTref_000009500"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 147987 148185 0.61 + 1 transcript_id "LTnewLTref_000009500.1"; gene_id "LTnewLTref_000009500"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS transcript 148310 148702 0.5 + . transcript_id "LTnewLTref_000009600.1"; gene_id "LTnewLTref_000009600" JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 148310 148487 0.53 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000009600.1"; gene_id "LTnewLTref_000009600"; JACCHM010000005.1 AUGUSTUS CDS 148530 148702 0.93 + 2 transcript_id "LTnewLTref_000009600.1"; gene_id "LTnewLTref_000009600"; JACCHM010000006.1 AUGUSTUS transcript 12165 12514 0.49 - . transcript_id "LTnewLTref_000005400.1"; gene_id "LTnewLTref_000005400" JACCHM010000006.1 AUGUSTUS CDS 12165 12267 0.69 - 1 transcript_id "LTnewLTref_000005400.1"; gene_id "LTnewLTref_000005400"; JACCHM010000006.1 AUGUSTUS CDS 12387 12514 0.6 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000005400.1"; gene_id "LTnewLTref_000005400"; JACCHM010000006.1 AUGUSTUS transcript 12550 13035 0.83 - . transcript_id "LTnewLTref_000005500.1"; gene_id "LTnewLTref_000005500" JACCHM010000006.1 AUGUSTUS CDS 12550 13035 0.83 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000005500.1"; gene_id "LTnewLTref_000005500"; JACCHM010000006.1 AUGUSTUS transcript 15989 17101 0.77 - . transcript_id "LTnewLTref_000005600.1"; gene_id "LTnewLTref_000005600" JACCHM010000006.1 AUGUSTUS CDS 15989 17101 0.77 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000005600.1"; gene_id "LTnewLTref_000005600"; JACCHM010000006.1 . transcript 18531 19128 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene" JACCHM010000006.1 . exon 18531 18578 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18580 18672 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18675 18686 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18688 18723 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18725 18733 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18735 18761 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18767 18787 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18789 18803 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18805 18867 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18869 18934 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18936 18941 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 18943 19020 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 19023 19082 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 19084 19128 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005700.1"; gene_id "LTnewLTref_000005700:pseudogene"; JACCHM010000006.1 AUGUSTUS transcript 20327 20716 0.87 + . transcript_id "LTnewLTref_000005800.1"; gene_id "LTnewLTref_000005800" JACCHM010000006.1 AUGUSTUS CDS 20327 20716 0.87 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000005800.1"; gene_id "LTnewLTref_000005800"; JACCHM010000006.1 . transcript 22897 23550 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005900.1"; gene_id "LTnewLTref_000005900:pseudogene" JACCHM010000006.1 . exon 22897 23004 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005900.1"; gene_id "LTnewLTref_000005900:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 23007 23207 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005900.1"; gene_id "LTnewLTref_000005900:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 23210 23335 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005900.1"; gene_id "LTnewLTref_000005900:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 23337 23372 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005900.1"; gene_id "LTnewLTref_000005900:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 23374 23550 . + . transcript_id "LTnewLTref_000005900.1"; gene_id "LTnewLTref_000005900:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . transcript 28380 29598 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006000.1"; gene_id "LTnewLTref_000006000:pseudogene" JACCHM010000006.1 . exon 28380 29598 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006000.1"; gene_id "LTnewLTref_000006000:pseudogene"; JACCHM010000006.1 AUGUSTUS transcript 32294 34411 1 - . transcript_id "LTnewLTref_000006100.1"; gene_id "LTnewLTref_000006100" JACCHM010000006.1 AUGUSTUS CDS 32294 34411 1 - 0 transcript_id "LTnewLTref_000006100.1"; gene_id "LTnewLTref_000006100"; JACCHM010000006.1 . transcript 46246 47861 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006200.1"; gene_id "LTnewLTref_000006200:pseudogene" JACCHM010000006.1 . exon 46246 47619 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006200.1"; gene_id "LTnewLTref_000006200:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 47622 47861 . - . transcript_id "LTnewLTref_000006200.1"; gene_id "LTnewLTref_000006200:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . transcript 48344 48964 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006300.1"; gene_id "LTnewLTref_000006300:pseudogene" JACCHM010000006.1 . exon 48344 48823 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006300.1"; gene_id "LTnewLTref_000006300:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 48825 48896 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006300.1"; gene_id "LTnewLTref_000006300:pseudogene"; JACCHM010000006.1 . exon 48899 48964 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006300.1"; gene_id "LTnewLTref_000006300:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . transcript 1118 3607 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene" JACCHM010000007.1 . exon 1118 1132 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 1134 1169 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 1172 1246 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 1248 1355 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 1357 1422 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 1424 1486 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 1488 2153 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2155 2241 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2244 2498 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2501 2599 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2602 2739 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2741 2776 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2778 2912 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2915 2926 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2928 2981 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 2984 3166 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 3169 3249 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 3251 3331 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 3334 3411 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 3414 3569 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 . exon 3572 3607 . + . transcript_id "LTnewLTref_000006700.1"; gene_id "LTnewLTref_000006700:pseudogene"; JACCHM010000007.1 AUGUSTUS transcript 4750 5298 0.6 + . transcript_id "LTnewLTref_000006800.1"; gene_id "LTnewLTref_000006800" JACCHM010000007.1 AUGUSTUS CDS 4750 4866 0.61 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000006800.1"; gene_id "LTnewLTref_000006800"; JACCHM010000007.1 AUGUSTUS CDS 5158 5298 0.6 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000006800.1"; gene_id "LTnewLTref_000006800"; JACCHM010000007.1 AUGUSTUS transcript 6421 7043 0.63 + . transcript_id "LTnewLTref_000006900.1"; gene_id "LTnewLTref_000006900" JACCHM010000007.1 AUGUSTUS CDS 6421 6622 0.63 + 0 transcript_id "LTnewLTref_000006900.1"; gene_id "LTnewLTref_000006900"; JACCHM010000007.1 AUGUSTUS CDS 6766 7043 0.9 + 2 transcript_id "LTnewLTref_000006900.1"; gene_id "LTnewLTref_000006900";