Name | Last modified | Size | |
---|---|---|---|
Parent Directory | - | ||
addTranscriptRecordsToGff.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.3K | |
adjustGeneIdSpliceSiteCoords.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 280 | |
aggregate.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 828 | |
aggregateOnMetaGene.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 803 | |
anchorTranscriptsEnds.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 11K | |
average.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 153 | |
avgRevFwd.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.1K | |
bed2fa.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.1K | |
bed2gff.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 532 | |
bed12fields2gff.awk | 25-Apr-2024 18:31 | 408 | |
bed12togff | 25-Apr-2024 18:31 | 408 | |
bed12ToTranscriptLength.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 297 | |
buildLoci.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 4.5K | |
checkTmergeOutput.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 2.2K | |
check_pipe_exit.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 390 | |
chrList_Hv3v43 | 25-Apr-2024 18:31 | 0 | |
chrList_Mv2vM16 | 25-Apr-2024 18:31 | 0 | |
chrom2transcriptCoords.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.1K | |
clearTermBuffer.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 30 | |
closestTogeneType.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.1K | |
collapseSpliceSiteScoresIntoSJScore.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.6K | |
colorNovelTxBed.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 944 | |
color_merged_transcripts.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 808 | |
demultiplexFromBlastTab.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.9K | |
dos2unix | 25-Apr-2024 18:31 | 32 | |
download.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 765 | |
downloadEncode3DccCollections.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 1.7K | |
downloadEncode3DccJsonSchemas.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 464 | |
echoerr | 25-Apr-2024 18:31 | 28 | |
encode3makeIndex.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 3.2K | |
exportAllCondaEnvs.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 528 | |
extractGffAttributeValue.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 333 | |
extractLatexFrames.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 971 | |
extractTranscriptEndsFromBed12.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 792 | |
extract_5p3pUTRs_from_GTF.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 4.1K | |
extract_CDS.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 7.3K | |
extract_intron_strand_motif.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 10K | |
extract_locus_coords.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.5K | |
extract_spliced_transc_seqs.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 3.3K | |
FastaToTbl | 25-Apr-2024 18:31 | 245 | |
FastaToTsv | 25-Apr-2024 18:31 | 245 | |
fastq2fasta.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 272 | |
fastq2tsv.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 370 | |
fastqDetectQual.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 5.0K | |
fetchPubmed.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.5K | |
filter_MinION_LIMS.py | 25-Apr-2024 18:31 | 621 | |
findIntraPriming | 25-Apr-2024 18:31 | 3.9K | |
fullpath | 25-Apr-2024 18:31 | 150 | |
get_right_transcript_strand.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 831 | |
gff2bed_full.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 3.5K | |
gff2bed_simplistic | 25-Apr-2024 18:31 | 80 | |
gff2gff.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 253 | |
gff2matchedPeaks.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.9K | |
gffRankExons.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.0K | |
gffToHash.pm | 25-Apr-2024 18:31 | 6.2K | |
HashToGff.pm | 25-Apr-2024 18:31 | 3.6K | |
hashToGff.pm | 25-Apr-2024 18:31 | 1.6K | |
hist | 25-Apr-2024 18:31 | 89 | |
histgrep | 25-Apr-2024 18:31 | 29 | |
jcat | 25-Apr-2024 18:31 | 66 | |
jsonschema.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.0K | |
json_xs | 25-Apr-2024 18:31 | 6.4K | |
ks_test.r | 25-Apr-2024 18:31 | 251 | |
LICENSE | 25-Apr-2024 18:31 | 34K | |
lrseq-view | 25-Apr-2024 18:31 | 143 | |
makeBais.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 393 | |
makeBigBeds.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 1.0K | |
makeIntrons.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.1K | |
mapAA2genome.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 5.8K | |
mapIntrons2transcript_coords.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.0K | |
mapReadsToGenes.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.3K | |
matchDistribution.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 7.4K | |
matchDistributionKStest.r | 25-Apr-2024 18:31 | 164 | |
matchDistributionLoop.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 951 | |
mergeToRef.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 3.3K | |
mergeToReftest.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 3.5K | |
minMedMaxStats.r | 25-Apr-2024 18:31 | 530 | |
mountsshfsCrg.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 749 | |
now | 25-Apr-2024 18:31 | 33 | |
overlap.pm | 25-Apr-2024 18:31 | 13K | |
parse_indexFile.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 62 | |
partitionAnnotation.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 4.0K | |
primer3race2gff.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 3.3K | |
processCompmerge.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 743 | |
processJsonToHash.pm | 25-Apr-2024 18:31 | 711 | |
processLrgaspEntries.py | 25-Apr-2024 18:31 | 1.9K | |
ps2svg.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 398 | |
qs | 25-Apr-2024 18:31 | 214 | |
qualimapReportToTsv.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.1K | |
reformatGff.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 448 | |
reformatONTfastqTSV.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 380 | |
remove_terminal_introns.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 817 | |
samHQintrons.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.9K | |
samToPolyA.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 9.7K | |
ScoreSpliceCandidate.py | 25-Apr-2024 18:31 | 8.5K | |
ScoreSpliceCandidate.pyc | 25-Apr-2024 18:31 | 6.4K | |
searchMotifInChr.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 663 | |
simplifyGencodeGeneTypes.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 951 | |
simplifyGffCompareClasses.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.3K | |
sirvDetectionStats.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.0K | |
skipcomments | 25-Apr-2024 18:31 | 33 | |
snakerr | 25-Apr-2024 18:31 | 365 | |
sortbed | 25-Apr-2024 18:31 | 44 | |
sortgff | 25-Apr-2024 18:31 | 44 | |
ssv2tsv | 25-Apr-2024 18:31 | 94 | |
stats.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 200 | |
subsampleMatchDistribution.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 7.4K | |
sum.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 56 | |
summarySE.r | 25-Apr-2024 18:31 | 1.7K | |
tarInBackground.sh | 25-Apr-2024 18:31 | 99 | |
TblToFasta | 25-Apr-2024 18:31 | 302 | |
test | 25-Apr-2024 18:31 | 1.7G | |
test2 | 25-Apr-2024 18:31 | 4.3M | |
TEST_sorted14n | 25-Apr-2024 18:31 | 1.8G | |
tgrep | 25-Apr-2024 18:31 | 157 | |
tmerge | 25-Apr-2024 18:31 | 47K | |
tmergeRecoverSampleRepReadIds.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.8K | |
tmergeToBinaryMatrix.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 2.4K | |
tmergeToCoverage.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.4K | |
tmergeToQuantMatrix.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.2K | |
today | 25-Apr-2024 18:31 | 24 | |
trackingGffCompareToMatrix.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 1.1K | |
transcriptCoords2chromCoords.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 8.2K | |
tsv2fastq.pl | 25-Apr-2024 18:31 | 535 | |
TsvToFasta | 25-Apr-2024 18:31 | 302 | |
zhead | 25-Apr-2024 18:31 | 27 | |